The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Distal pocket control of nitrite binding in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QJE B; 4DC8 A; 1A3N A; 1BZ0 A; 2LH6 A; 3A5B A; 1VXD A; 1IRD A; 3QM9 A; 1HDB B; 1Y45 A; 4HRR B; 1HCO B; 2WTG A; 3ZJJ A; 5CN4 A; 1QXE B; 1UMO A; 1OUT B; 4ZVA A; 2QSS B; 3B75 B; 1Y31 B; 3HC9 A; 1ABS A; 3VRG A; 2EKU A; 1V4U B; 2BWH A; 3HEP A; 1HDA B; 1URV A; 1NIH B; 2GL3 A; 1QPW A; 2QU0 B; 4HRT A; 1MOB A; 3PI8 A; 1KR7 A; 1J3Y A; 3PI4 A; 5E29 B; 1DUK A; 1YEN B; 2FRK X; 3ECZ A; 3HHB B; 1HGB A; 1YVQ A; 3OO4 A; 4MQH A; 2ZLX B; 2D5X A; 5E83 B; 2VM0 A; 4XS0 A; 1J41 B; 2DXM B; 1Z8U B; 3MN0 A; 2PEG A; 1VXA A; 1YHU A; 4OOD A; 1N9F A; 1Y2Z B; 1HBS A; 3WCT A; 1BZZ A; 3QM7 A; 5SW7 A; 4NZI A; 2QRW A; 3P5Q B; 4GZG A; 3ZJM A; 3QQQ A; 4N7O B; 3LHB A; 3ORD A; 1XQ5 A; 3FS4 A; 1C7B A; 1BIJ A; 4MQJ B; 1BAB B; 1HBR A; 1J3Z B; 2AA1 A; 3GYS B; 5HAV A; 1A6N A; 1O1P A; 3FH9 A; 4WCH D; 3K8B B; 4MQG A; 3BJ3 B; 3HXN B; 1O1M B; 1JZM A; 1S0H B; 3D17 A; 1LA6 A; 1Y0T B; 1S61 A; 1AJ9 A; 1LH1 A; 4ODC B; 4O4Z A; 1X9F D; 1UFP A; 4B3W A; 4H2L A; 1YHR B; 1GCV B; 3HRW A; 1MWD A; 4F6I A; 2GTL B; 1Y8K A; 2GTL C; 1V4W A; 1LFL B; 2CMM A; 1XZV B; 4YU3 A; 1QI8 B; 2RI4 A; 2LH5 A; 5B85 A; 3RJN B; 3DR9 A; 2RAO B; 3V2Z A; 1IWH A; 2D2M D; 3OZW A; 5JDO D; 2ZLW A; 4G51 B; 1Y4Q B; 3NFE B; 1MKO A; 1MBA A; 2ZLU B; 3WHM B; 3EOK A; 4FH7 A; 1MNI A; 3AT6 A; 1Y0A A; 3ECL A; 1XZ5 B; 1YIE B; 2ZS1 B; 1XZU A; 1XZ7 A; 4U8U D; 1MBC A; 4MQK A; 1J7Y B; 3WCW A; 106M A; 2YRS B; 1VWT B; 1DXU B; 1YG5 B; 4UZV A; 1VHB A; 2AUP A; 3WCU D; 1YZI B; 111M A; 4VHB A; 3UHV A; 3MKB B; 1SDL A; 4N7N B; 1G0B B; 1MYI A; 1WLA A; 4ESA A; 5CNE A; 2DN3 B; 1XZ4 A; 1LFQ A; 1B86 A; 5HLQ A; 2B7H A; 1Y4V B; 1Y4G A; 1MNK A; 3E5O A; 1T1N B; 1O1K B; 1HBB A; 1MLK A; 1GDJ A; 3KUN A; 1CPW A; 1N9H A; 2FAL A; 1GDL A; 3UH5 A; 1JEB A; 2O5Q X; 1OJ6 A; 2MGA A; 4M4A A; 1CLS A; 1G9V B; 3WFU A; 1TES A; 3NL7 A; 1J40 B; 3ZH0 A; 1GDK A; 2DN2 A; 3PI2 A; 1B0B A; 1UIW A; 1FAW B; 2QLS B; 3WR1 B; 1QSI A; 1DO1 A; 3UHI A; 1XXT A; 3GQG B; 1K1K B; 1CO8 A; 3M3A A; 2EKT A; 3BJ2 B; 1Y0C B; 1J7W A; 5CNG A; 3QJB B; 1DXT B; 1EWA A; 1ECA A; 1YEU A; 2QFN A; 1G09 A; 4QAU A; 1CG5 A; 1CIO A; 2G10 A; 1MBS A; 3GKT A; 3WTG B; 4X0L A; 1DO7 A; 3OK5 A; 1FHJ A; 3BJ1 A; 1O1I A; 3GQR A; 1A9W E; 3PEL A; 4DWU A; 3ASE A; 5E6E A; 3G46 A; 1MDN A; 1I3E A; 3OJ1 A; 2KSC A; 1XZ2 A; 3AQ7 A; 1DLW A; 1MOA A; 1YOG A; 1J52 A; 2ZSS A; 1PMB A; 3SDH A; 4KJT A; 1UVY A; 5D5R A; 1SPG A; 4U8U A; 1CG8 A; 1S56 A; 3LQD B; 1COH A; 3QJD B; 2ZWJ A; 3NMM A; 2ZFO A; 1UC3 A; 1LFZ B; 2O58 X; 3PT8 B; 2W6Y A; 3SZK B; 1GBV A; 2D2N D; 2HCO B; 3ZJP A; 1ABY B; 1CQX A; 1JF4 A; 1VXE A; 2GRF A; 5AZR A; 2Z6T A; 1NGK A; 2MGK A; 2MGL A; 2W72 B; 1SDK B; 4G1V A; 1BZ1 A; 1Y35 B; 3AQ6 A; 1G0A A; 1MBN A; 3UHW A; 1Y0D A; 3PT7 B; 5CND A; 2W6V B; 2ZT1 A; 1XYE A; 4C0N A; 1MWB A; 1ECD A; 2ZSN A; 1X9F C; 1R1Y A; 2H8D B; 1MNJ A; 5JOM A; 3WFW A; 2O5O X; 1YH9 A; 1IRC A; 2D5Z B; 5CN8 A; 1C40 A; 1CO9 A; 3A5G A; 2VYY A; 1Y5J B; 4FWX A; 2W6X A; 2MYB A; 5EUI B; 1YOH A; 4C44 A; 2AV0 A; 3LB2 A; 1RVW B; 1UVX A; 4ROM B; 105M A; 3QJE A; 3MOU A; 3PI9 B; 4MU5 A; 1ASH A; 1K0Y B; 1HDB A; 3VRF B; 2D2M C; 4HRR A; 1HCO A; 3A0G A; 5JDO C; 3UHS A; 2EF2 A; 2MYC A; 2SPN A; 2QSS A; 2GNV A; 1GBU B; 3B75 A; 1Y31 A; 2HBC A; 3DHT B; 4ROL B; 107M A; 1A0Z A; 102M A; 3DHR B; 2R4X A; 3ED9 A; 2BLI A; 5CHR A; 1NS9 B; 2W6W A; 1NIH A; 2HHD B; 2QU0 A; 4U8U C; 3E55 A; 109M A; 1MYF A; 1IT2 A; 1Y8H B; 5E29 A; 1YHU D; 1HAB B; 1YEN A; 1C7C A; 1YCB A; 3WCU C; 1NPG A; 3GQP B; 3MJP B; 2ZLX A; 3WCT D; 1HBH B; 1VRF A; 1JL6 A; 3UHR A; 3UHC A; 3K3U A; 3PI1 A; 1VRE A; 1J41 A; 2AV3 A; 2G0V A; 2EVK A; 2QMB B; 1YEV A; 4TWU A; 1Y01 B; 3G52 A; 4SDH A; 3SDN A; 3AQ5 A; 1Y2Z A; 1GDI A; 1O1N B; 1R1X B; 1UT0 A; 3ARK A; 1MCY A; 1V75 B; 1NEJ B; 2HHB B; 1YMA A; 1LFT B; 4MQI B; 2ZSZ A; 1NQP A; 2MGJ A; 1LH6 A; 2MGE A; 5ILE A; 4N7O A; 3GKV A; 1J7S B; 4O35 A; 1CH5 A; 2SPO A; 3A59 B; 4TWV A; 4MQJ A; 1BAB A; 1GZX A; 1RPS B; 4F6D A; 3S1J A; 3BJ3 A; 3HXN A; 1O1M A; 1S0H A; 5C6E B; 1Y0T A; 1SI4 B; 1Y46 B; 1U7S A; 4ODC A; 5C6Y A; 1A3O A; 2GRZ A; 1Y7C A; 1MOH A; 1JZK A; 2MYA A; 1YHR A; 1HBG A; 1Y8W A; 1KFR A; 3ZJO A; 5CN7 A; 2HBS A; 1JZL A; 3LR9 A; 5F2A A; 2V1K A; 2EB9 A; 5CN5 A; 3UHY A; 1LFL A; 2W31 A; 1EMY A; 1XZV A; 2HBF A; 1ITH A; 1QI8 A; 4MAX A; 2HBE B; 4YU4 B; 1Y7G B; 3HEN A; 2ZLT A; 5EET A; 3G4R A; 4BJA A; 2IG3 A; 3WCW D; 3W4U B; 1Y4Q A; 3NFE A; 1NZ4 A; 1ECO A; 4IT8 A; 2ZLU A; 3WHM A; 3GOU A; 1XZ5 A; 1YIE A; 1YFF B; 2ZS1 A; 1MYT A; 2M6Z B; 2D2N C; 2D60 B; 4PQ6 A; 1HDS B; 1DXC A; 3G53 A; 3RJ6 A; 1GCW B; 2YRS A; 1VWT A; 3UHN A; 1KD2 B; 3UHX A; 2G12 A; 1NS6 B; 3HYU A; 1YG5 A; 1M9P B; 4F6G A; 1A00 B; 1F5O A; 3MKB A; 1LFY A; 1RQ4 B; 2EVP A; 2ZS0 A; 3DUT B; 1G0B A; 1Q1F A; 4DWT A; 2O5B X; 2DHB B; 1FLP A; 2DN3 A; 4HBI A; 1HBI A; 3S65 B; 1Y4R B; 1YDZ B; 1Y5K A; 3LR7 A; 1V07 A; 3UHE A; 1Y4V A; 3D7O B; 2MHB B; 1DLY A; 1O1L B; 3NML A; 3U3E A; 1BZ0 B; 3IC0 B; 1S5Y B; 1YCA A; 1BZ6 A; 2R4Y A; 1CH7 A; 1S69 A; 1JP6 A; 1YE2 B; 1NAZ A; 2ZT3 A; 2HZ2 A; 1G9V A; 3AG0 A; 2GKM A; 2OLP A; 1NZ5 A; 1UFJ A; 1FAW A; 5JDO F; 3WR1 A; 3VRG B; 1FN3 A; 1MBD A; 1NZ2 A; 3GQG A; 1K1K A; 1Y22 B; 1YMB A; 1Y0C A; 2LH3 A; 4HRT B; 3D1A B; 1H1X A; 1V4X B; 1HHO B; 1NWI A; 1DXT A; 2MGB A; 3O7N A; 1AZI A; 1IDR A; 3WTG A; 3PI3 A; 2Z8A A; 3BOM A; 1RQ3 B; 1Y4F B; 1NZ3 A; 3H58 A; 1HGB B; 2OHA A; 1YVQ B; 3UHB A; 4MQH B; 1BBB B; 4XS0 B; 1I3D A; 1Y83 B; 3NG6 A; 2VEE A; 104M A; 2PEG B; 1A6G A; 1RQA B; 2IN4 A; 1JW8 A; 2ZFO D; 1MYJ A; 1YHU C; 3WFT A; 3QQR A; 4NXA A; 2GRH A; 3QJC B; 4M4B B; 1HBA B; 1RTE A; 1M6M A; 1YGF B; 2ZFB B; 3WCT C; 6HBW A; 2ZT0 A; 2HZ3 A; 1OFK A; 1V5H A; 4MXL A; 3LQD A; 3ZJN A; 1JP9 A; 2MYD A; 3PIA B; 3UGY A; 1CP5 A; 2DN1 B; 3D1K B; 3MYM A; 3MYN A; 3FH9 B; 1LFZ A; 1LJW A; 3UHG A; 1MLU A; 3WFX A; 1GJN A; 3PT8 A; 3SZK A; 1BJE A; 2HCO A; 3ARJ A; 1YEQ A; 2V1I A; 5KDQ A; 3D17 B; 2R80 B; 4O4T A; 1CH1 A; 5CMV A; 3EDA A; 2MGC A; 108M A; 1VXC A; 4HHB B; 2R50 A; 1N9X A; 2W72 A; 3ARL A; 2D6C A; 3ZJR A; 3E4N A; 1SDK A; 3EDB A; 1Y35 A; 3V2V A; 1MLO A; 3UHZ A; 1A0U A; 2E2Y A; 1HRM A; 5EU2 A; 3PT7 A; 1A9W A; 3WCV A; 2H8F B; 5CNB A; 1EBT A; 2O5T X; 1S5X A; 1ABW B; 2W6V A; 1IT3 A; 1Y8K B; 2SPL A; 1V4W B; 1XY0 A; 3UHT A; 2O5L X; 1OBM A; 1A4F B; 2LH1 A; 1Y4P B; 1Y5F B; 2RI4 B; 2H8D A; 3ZHW A; 1RSE A; 5JGG B; 1N9I A; 1BZR A; 1OFJ A; 1Y85 B; 3HF4 B; 2DC3 A; 2QSP B; 1MNH A; 2OHB A; 1GLI B; 1Y5J A; 3GLN A; 4L7Y B; 5EUI A; 6HBI A; 4O2G A; 1Y7D A; 1MKO B; 5EV5 A; 5HLX A; 2G11 A; 3UBV A; 1Y0A B; 1HAC A; 2R4W A; 2Z85 A; 3LB4 A; 4ROM A; 2R1H A; 1JL7 A; 3G4U A; 2ZSO A; 1C7D B; 3BA2 A; 3PI9 A; 3UI0 A; 1K0Y A; 3VRF A; 3CY5 A; 3AT5 B; 1HGC B; 3WCW C; 3M38 A; 4MPM A; 3ZJI A; 3OGB A; 3G4V A; 3DHT A; 4ROL A; 1EW6 A; 3EU1 B; 1OUU B; 3TM3 A; 3DHR A; 1LH5 A; 3OZV A; 2ZST A; 2LH2 A; 1HGA B; 1Y8I A; 3G4Q A; 2HHE B; 4ESA B; 1YHE B; 5JDO E; 5MBA A; 1Y8H A; 2B7H B; 5EOH A; 1FCS A; 1HAB A; 4FC3 B; 1VXG A; 1G08 B; 1HBB B; 1F63 A; 5EE4 D; 2Z6N A; 1IBE B; 3GQP A; 3MJP A; 4F68 A; 3AQ8 A; 1O1J A; 1WVP A; 1O1O B; 2ZSX A; 1A6M A; 2MGI A; 5EYJ A; 2BNL A; 4MQC A; 1X9F B; 4AVE A; 1CMY B; 3ODQ B; 2SPM A; 4F6J A; 1XXT B; 1NPF A; 1BZP A; 1YVT B; 1V75 A; 1NEJ A; 2HHB A; 3G4W A; 3CIU B; 4B4Y A; 1CBM A; 1YEO B; 5M3S A; 2FRF A; 5AZQ A; 1MLM A; 5CNC A; 1J7S A; 4WJG 1; 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1LFV B; 4PQB A; 2MGF A; 2DHB A; 5ILM A; 1F65 A; 1YMC A; 3S65 A; 110M A; 1CP0 A; 3QM5 A; 1FDH G; 2MHB A; 1O1L A; 5EYS A; 1XCH A; 1GCV A; 1H97 A; 3IC0 A; 4JYQ A; 3MBA A; 1S5Y A; 1THB B; 1TU9 A; 2HZ1 A; 1AJG A; 3A0G B; 1Y09 B; 3IA3 B; 1YE2 A; 2GTL A; 4DC7 A; 4NI1 B; 3MJU B; 3IC2 B; 2XKH A; 2HBC B; 4UUR A; 1A0Z B; 2NRM A; 1M6C A; 2G3H A; 1Y22 A; 1VXB A; 2RAO A; 2VLZ A; 4L2M A; 2BLJ M; 3D1A A; 1V4X A; 1HHO A; 1QSH B; 4F69 A; 3TLD A; 2V1F A; 4G51 A; 3RGK A; 3WCP B; 1MLJ A; 1DKE B; 3ECX A; 1LHT A; 5CHQ A; 1RQ3 A; 1Y4F A; 5KER B; 1C7C B; 2O5M X; 2ZLV B; 1MLF A; 1BIN A; 3O89 A; 1BBB A; 2D2N B; 4N7P B; 2LHB A; 1CIK A; 2HBG A; 4FH6 A; 2V1J A; 1Y83 A; 1CBL A; 1MYH A; 4O1T A; 3R5I B; 2XKI A; 1J7Y A; 1YEV B; 4IRO B; 1YE0 B; 1RQA A; 4WJG A; 1DXU A; 1Y4B B; 3BCQ B; 1YZI A; 1Y0W B; 4PNJ A; 1CH4 A; 3QJC A; 3QZX A; 4M4B A; 1HBA A; 5EE4 C; 2AUQ A; 1D8U A; 1YGF A; 5HU6 B; 2ZFB A; 4FWZ A; 1FDH A; 4N7N A; 1V9Q A; 3ZJQ A; 1NQP B; 4H07 A; 2FAM A; 1PBX B; 4MBN A; 3GKV B; 3E5I A; 101M A; 1LHS A; 3PIA A; 3M39 A; 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