The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVQMKQHSSLTTGNFEKLFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| publication title |
A unique role for the distal histidine observed in carbonmonoxy dehaloperoxidase-hemoglobin A structures
rcsb |
| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
55
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| structure length |
137
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.11.-.-: |
| pdb deposition date | 2012-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5D1V A; 1NS6 A; 3FH9 B; 1Y85 A; 2BNL A; 2RI4 B; 4ROL A; 1O1M B; 3LQD A; 1VHB A; 1BZZ B; 2DC3 A; 4ZVA A; 3QM9 A; 1G09 B; 1J41 B; 2MYE A; 3WCU C; 5ILE A; 2ZSP A; 4AVD A; 2V1K A; 3IC0 B; 1HAB B; 1Y7D A; 2CMM A; 1GZX B; 3UGY A; 1J7S B; 2MGK A; 1JF4 A; 1YCA A; 1MKO B; 3WCT B; 3OZV A; 1CMY A; 5EQM A; 7HBI A; 2FRK X; 1VXC A; 1Y31 A; 1B0B A; 5AB8 A; 5F2A A; 1YEO B; 3D1K A; 1HBR A; 3CIU A; 3V2Z A; 1MNH A; 1VWT B; 2HBE B; 2NRL A; 1YGF A; 3CIU B; 1DTI A; 1HHO B; 4IRO A; 2HBF A; 3UHU A; 3K9Z A; 5EOH A; 1YGF B; 3WCU A; 1DXC A; 5MBN A; 2HBF B; 1X9F D; 1DUO A; 4MQK A; 1HAC A; 2V1I A; 4JYQ A; 2H35 A; 2VLZ A; 1S5Y A; 2HHD A; 4MQK B; 1A9W E; 2GNW A; 1FDH A; 2D2M D; 4NXC A; 3WR1 B; 3PI8 B; 5JDO E; 3VRG A; 3HHB A; 3EU1 B; 1Y7Z A; 3ARL A; 2HCO A; 1GCW A; 3VRG B; 1MWB A; 4ROM B; 1SI4 A; 1IBE A; 1YOI A; 4NI0 A; 1C40 A; 1O1I B; 1FHJ A; 1N9X A; 2DXM A; 1IBE B; 1NEJ B; 1XZV A; 2DHB B; 1NWI A; 2IG3 A; 4H2L B; 1O16 A; 1O1J B; 1CP0 A; 3GQG A; 4MXK A; 1JZL A; 1XZV B; 1J40 B; 1UFP A; 3UHW A; 2O5L X; 1O1L A; 1SDL B; 1X46 A; 2ZFB A; 2ZLX B; 4QAU A; 3RGK A; 3S65 A; 1GBV A; 2QMB B; 2OHB A; 1QXE A; 6HBW B; 2NSR A; 1MLK A; 1Y0D B; 1R1Y B; 3D7O A; 2D2N D; 1IRC A; 5EE4 D; 1MLU A; 2O5B X; 2ZSN A; 1GBU B; 1A3N A; 1XXT A; 4HSW A; 3UHS A; 3AQ7 A; 1CP5 A; 1Z8U B; 1SDK A; 4ILZ A; 1FAW A; 1BIJ B; 1RQ4 A; 3ODQ B; 1CH9 A; 3PI9 B; 4KMV A; 1RTX A; 1Y0A B; 1MOH A; 1VXD A; 1Y46 A; 1K1K B; 3GYS B; 2ZLU B; 3GQR B; 1C7C A; 1FN3 A; 1HBG A; 4XDI A; 1S69 A; 3ONZ A; 1G0A A; 2ZFO C; 1I3E A; 2H8D A; 4HRR B; 2V1J A; 4FC3 A; 1MBS A; 1FN3 B; 2MGF A; 3ONZ B; 1G0A B; 1URV A; 3BJ3 B; 2EF2 A; 3VRF A; 3G4Q A; 1LFL A; 3MVC A; 1A0U A; 3VHB A; 3HRW A; 2MBW A; 1EBT A; 1GDJ A; 3VRF B; 2ZS1 D; 3NML A; 2W31 A; 1MYJ A; 1Y0W B; 5KDQ B; 1MNO A; 1XZ5 B; 2OLP A; 3PT8 B; 1NPG A; 1THB A; 4L7Y A; 4OF9 A; 4F6I A; 1UX9 A; 5E29 B; 1RVW B; 2ZFO A; 1HBB B; 1A0Z A; 2G0X A; 2R80 A; 3K3U A; 1JY7 A; 1GCV A; 2GLN A; 3FS4 B; 3QM5 A; 1ECA A; 1MYT A; 1A0Z B; 4AVE A; 5EUI A; 3M3B A; 4NXA A; 1JY7 B; 1HBS B; 1BBB B; 2MGM A; 1NS9 A; 2RAO A; 1Y4P B; 5IKS A; 3LR9 A; 1UIW A; 1YDZ B; 3UI0 A; 1RPS B; 3D4X A; 1DXV A; 1YVQ A; 3BJ1 A; 3ECX A; 1LA6 B; 3A59 A; 1LFZ B; 1UIW B; 3UHX A; 1WVP A; 2MHB B; 2EVK A; 3DHR B; 1O1P B; 2NX0 A; 4B3W A; 1JF3 A; 1O1O B; 1MZ0 A; 3B75 A; 1DLY A; 3HEN A; 4YU4 A; 2LH1 A; 1YHU D; 3ED9 A; 1N9I A; 1Y8W B; 1YE0 A; 1YH9 A; 1MYF A; 1QSH A; 1QSI B; 4YU4 B; 1OBM A; 1J7W A; 3WTG A; 3H58 A; 1IRD A; 1ABS A; 1YH9 B; 2VLY A; 1JL7 A; 1WMU B; 2XKI A; 5HY8 B; 1COH B; 5CN6 A; 1J7W B; 1CH2 A; 4MQJ B; 1A4F A; 2D60 A; 3GQP B; 1M9P A; 3ZJO A; 3A5A A; 2GTL D; 2D60 B; 2O5S X; 2W6V B; 1Q1F A; 5E83 A; 1HCO A; 2ZLT A; 4PQB A; 2BMM A; 2MGL A; 4PNJ A; 1C7D A; 2HBS A; 3MJU A; 1HV4 A; 3BCQ A; 1YHE B; 3TLD A; 5D5R A; 1V4W A; 1YHR A; 2HBS B; 5HBI A; 1Y8H B; 1NGK A; 2QSP B; 102M A; 1Y5F A; 2ZSY A; 1Y5K A; 3EDB A; 1R1X A; 1UFJ A; 3S1I A; 3OO5 A; 1Y5F B; 1Y5K B; 3ZJR A; 5JDO D; 1HDB B; 1YEU A; 1Y35 A; 3SZK B; 1R1X B; 1JP6 A; 3ECZ A; 1GLI B; 4ODC B; 1PMB A; 3UHV A; 3UH5 A; 3QQQ A; 3S66 B; 2LH6 A; 1A3O B; 5SW7 B; 1OFJ A; 1IT2 A; 1HBA B; 1G9V A; 1MYG A; 4X0L A; 1ABW B; 1BZ6 A; 1YEV A; 3G4U A; 3GKV B; 1YOG A; 2LH7 A; 1YFF A; 3EOK A; 3QJC B; 1MLO A; 3M39 A; 1DO7 A; 1RTE A; 1MOC A; 2O5T X; 4WJG 1; 4U8U D; 1NZ5 A; 1GDI A; 4N7P A; 2LH2 A; 3WCV C; 2MYB A; 3GOU A; 1Y09 A; 2HZ1 A; 2AA1 A; 1QPW B; 3W4U A; 5KER A; 2VYW A; 1EW6 A; 5CNG A; 1ECN A; 1HLM A; 2AA1 B; 5ILR A; 5JGG A; 2MGE A; 2OH9 A; 1CPW A; 1JEB B; 3WCW C; 2G0S A; 3UHG A; 3RJ6 A; 3ZHW A; 4F68 A; 2KSC A; 1XZU B; 5EU2 A; 1J3Y A; 1A00 B; 3UHC A; 3QJD B; 2ZS0 C; 3WCV A; 3D17 B; 2MGD A; 2ZT4 A; 1MBA A; 104M A; 3AT6 B; 2GKN A; 1V07 A; 1VXF A; 2D5X A; 1V4U A; 4O2G A; 5JOM A; 2Z6N B; 1DO4 A; 2H8F B; 1Y22 A; 2D5X B; 5EYS A; 1Y4V B; 2QLS B; 3HEO A; 3WCW A; 2DN1 A; 1Y0T A; 1O1N B; 1OUU A; 1B86 B; 1HGC A; 1Y0T B; 1JW8 A; 4N8T B; 1CG8 A; 1FSL A; 1BVC A; 1NQP A; 3ECL A; 1HGC B; 3WCU D; 5CND A; 1G0B A; 1CG8 B; 1NQP B; 2ZS0 A; 1Y4R B; 5CNF A; 3UGZ A; 3A0G B; 1V75 B; 3WCT C; 2ZST A; 1B86 A; 1T1N B; 2R1H B; 3U3E A; 3FH9 A; 5CN4 A; 2RI4 A; 2R4W A; 1YIE B; 3ASE A; 1I3D A; 1O1M A; 1BZZ A; 2W6W A; 3MYM A; 1JPB A; 2R50 A; 1CH1 A; 1LJW B; 2LHB A; 2R4Z A; 3CY5 B; 4F6B A; 1G09 A; 1J41 A; 5HLQ A; 2G14 A; 3MBA A; 2FRJ X; 3WFW A; 1NPF A; 3IC0 A; 3SDN A; 1HAB A; 3ZH0 A; 4MQG B; 2MGG A; 3G53 A; 1GZX A; 5CN7 A; 1J7S A; 1MKO A; 3WCT A; 1MOB A; 1CQX A; 1MLQ A; 1O1K B; 4NK1 A; 4GZG A; 1Y4G A; 1YEO A; 1MDN A; 4DWT A; 1SPE A; 2ZLV B; 4JAC A; 1VWT A; 2HBE A; 1Y4G B; 1D8U A; 1AJH A; 1HHO A; 4TWU A; 3UHR A; 1MCY A; 3A2G A; 3G4W A; 1Y7G B; 5C6E B; 1CQ2 A; 2VM0 A; 1S0H B; 3V2V A; 3A5G A; 1DXT B; 1DXU B; 1J3F A; 3WR1 A; 3PI8 A; 2W72 A; 1QI8 B; 3EU1 A; 3ZOM A; 1LH6 A; 1LH1 A; 2NRM A; 1VRE A; 1MWD A; 101M A; 2W72 B; 2GL3 A; 1G08 B; 4ROM A; 3AG0 A; 2DN3 B; 1MBO A; 2W6X A; 1YMA A; 3UHE A; 1O1I A; 4UZV A; 2DN2 B; 1NEJ A; 1XYE B; 1EBC A; 1U7R A; 2HBD A; 2DHB A; 1V5H A; 3ZJS A; 4H2L A; 3TM3 A; 1O1J A; 3NL7 B; 1FDH G; 2HBD B; 1J40 A; 4F6G A; 1KD2 B; 1MNJ A; 1U7S A; 2AV0 A; 1ITH A; 3LB1 A; 4MBA A; 1S56 A; 4PQ6 A; 1OR4 A; 1SDL A; 4XS0 B; 2ZLX A; 4FWZ A; 2BLH A; 1URY A; 2QMB A; 2VRY A; 1UT0 A; 6HBW A; 2XYK A; 2ZFO D; 1Y0D A; 1R1Y A; 1UC3 A; 1GBU A; 1DXD A; 1C7B B; 2GNV A; 4F69 A; 3NG6 B; 1BIJ A; 3ODQ A; 3PI9 A; 2SPN A; 1CLS B; 1HGB A; 1Y0A A; 1K1K A; 2JHO A; 3GYS A; 3PI2 A; 2ZLU A; 3GQR A; 5CN8 A; 1BAB B; 1HGB B; 1S6A A; 1LHS A; 2M6Z A; 4HRR A; 3VRE A; 1LFY A; 1W92 A; 1SHR B; 4UIQ A; 1YCB A; 3UH3 A; 1FSX B; 3BJ3 A; 3HYU B; 2M6Z B; 4O35 A; 3VRE B; 5B85 A; 1LFY B; 1BVD A; 1J3Z A; 2QSS B; 1X9F B; 1Y8K B; 2AUR A; 1MYH A; 2HHB B; 3LB3 A; 1J3Z B; 3UHY A; 1Y2Z B; 1VXE A; 1Y0W A; 1YIH B; 5KDQ A; 1XZ5 A; 4BJA A; 2D2M B; 1JP9 A; 1SWM A; 3PT8 A; 3UHQ A; 2FRF A; 5E29 A; 2MYC A; 1F5P A; 1RVW A; 1HBB A; 1YVT B; 107M A; 1BUW B; 3QQR A; 3PEL B; 3FS4 A; 1DLW A; 1ECO A; 2R4Y A; 5EYJ A; 3OZU A; 1HBS A; 1BBB A; 1Y83 B; 3MJP B; 1Y4P A; 2G3H A; 5CNB A; 1YDZ A; 1V4X A; 1MLG A; 1RPS A; 3UHT A; 1LA6 A; 1LFZ A; 1EMY A; 1V4X B; 1S5X B; 2MHB A; 1VXB A; 3DHR A; 1O1P A; 1O1O A; 1HSY A; 2ZWJ A; 1YGD A; 5E6E B; 1EWA A; 5CHR A; 4L2M A; 2D2N B; 1TES A; 1Y8W A; 3AQ5 A; 2G0V A; 1CBL A; 1LHT A; 1YGD B; 1QSI A; 3QJB B; 1NIH B; 1CO9 A; 2O5M X; 3UHN A; 3HEP A; 1RQA B; 4HRT B; 1WMU A; 2Z6T A; 1CG5 B; 5HY8 A; 1COH A; 1AJ9 A; 4C44 A; 3ARK A; 3UHK A; 4ESA B; 4MQJ A; 3GQP A; 2AUP A; 1AJ9 B; 2SPO A; 1XY0 B; 3OVU C; 1Y01 B; 111M A; 2W6V A; 1XZ7 A; 2HZ2 A; 4DWU A; 5CMV A; 5CHQ A; 3DHT B; 4O4Z A; 1XZ7 B; 1MGN A; 105M A; 2V1H A; 1YHE A; 3UH6 A; 1OR6 A; 4FWY A; 1J52 A; 3BA2 A; 1OJ6 A; 2Z6S A; 1HDS B; 1Y8H A; 1IWH A; 2ZS1 B; 1BZP A; 2QSP A; 4HHB B; 3UHD A; 3WFX A; 1MTK A; 1HDA B; 2OIF A; 3QJE B; 3KUN A; 1WLA A; 1J7Y B; 2ZT1 A; 2ZLW B; 1IWH B; 1UVX A; 1DKE B; 1LFQ B; 4NI1 B; 4M4B B; 1HDB A; 1BZ1 B; 2XKG A; 4G51 B; 3WI8 A; 4FWX A; 3SZK A; 3ZJI A; 4KN3 A; 1GLI A; 4ODC A; 3WCV D; 1MBC A; 1DUK A; 4F4O B; 3S66 A; 1A3O A; 5SW7 A; 1CH7 A; 1HBA A; 1KFR A; 3QMA A; 1DTM A; 3G46 A; 1A01 B; 4LPI A; 1HBH B; 1DO3 A; 2AUQ A; 3IC2 B; 3LB2 A; 1ABW A; 1Y4Q B; 2ZSQ A; 3GKV A; 3R5I B; 2MGA A; 2ZSR A; 5AZQ A; 3WCW D; 3QJC A; 4G1B A; 3PI1 A; 3BJ2 A; 1YEQ B; 5AZR A; 1NZ4 A; 1VRF A; 3E55 A; 1YHU A; 3BJ2 B; 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1CIO A; 4TYX A; 1LJW A; 1YG5 B; 4F6D A; 2FAM A; 3CY5 A; 2IN4 A; 1VXH A; 1VXA A; 2O5O X; 4U8U B; 2ZSS A; 4MPM A; 3D1A B; 1LFT B; 4MQG A; 1PBX B; 4VHB A; 2BLJ M; 1XQ5 A; 2QU0 B; 3GK9 A; 1YEN A; 1O1K A; 1Y45 B; 1Y0C B; 1NS6 B; 2ZT0 A; 1XQ5 B; 1YMB A; 1Y85 B; 2ZLV A; 2W72 C; 2WTH A; 1YEN B; 1MTJ A; 4ROL B; 1MTI A; 2LH5 A; 4H0B A; 4MQC A; 2HBG A; 3LQD B; 3OK5 A; 1DM1 A; 4G1V A; 1CIK A; 1XZ4 A; 3MYN A; 2SPL A; 4MQC B; 3GDJ A; 1Y7G A; 1XZ4 B; 5C6E A; 3PI3 A; 1Y7D B; 3GDJ B; 1S0H A; 3O7N A; 2QRW A; 1DXT A; 1DXU A; 4MQH A; 3E5I A; 1CMY B; 3UBC A; 1QI8 A; 1Y7C A; 1Y31 B; 3ZJH A; 3D1K B; 4MQH B; 1HBR B; 1G08 A; 2O58 X; 1Y7C B; 3PT7 A; 3M38 A; 2DN3 A; 2D5Z A; 4ZVB A; 4IRO B; 3S48 C; 3G52 A; 3PT7 B; 2DN2 A; 1XYE A; 2D5Z B; 4O4T A; 3WCU B; 1AZI A; 1HLB A; 3NL7 A; 1HAC B; 3KUO A; 3LB4 A; 1KD2 A; 1UX8 A; 2H35 B; 5CNC A; 1S5Y B; 2BKM A; 2HHD B; 2GKM A; 4XS0 A; 2XKH A; 4NS2 A; 3UHB A; 1MLL A; 1HJT A; 3HHB B; 1Y7Z B; 1ASH A; 2HCO B; 1GCW B; 2G0R A; 1SI4 B; 2EKT A; 4MXL A; 4NI0 B; 1LH3 A; 1C40 B; 1X9F C; 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