The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFFQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTLAGKVVDYINAWIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGHAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Carbonmonoxy structure of Tyr11Phe/Gln44Leu/Thr48Val/Ala55Trp Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
45
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WCU A; 2ZT1 A; 2CMM A; 4YU4 B; 1XZU A; 4VHB A; 2XYK A; 2EKU A; 1IWH A; 3E5I A; 3MJU B; 3S48 C; 1S6A A; 2D2M A; 5ILP A; 1CLS B; 2D2N D; 1LFZ B; 2EVP A; 1FSX B; 3AQ5 A; 1JW8 A; 3ZJP A; 2VYY A; 1BZR A; 4F6J A; 1QSI B; 2R4W A; 4N7O B; 1Y4P B; 1RVW B; 1VRF A; 1Y22 A; 1KFR A; 3A5G A; 1LH7 A; 1Y4V B; 3WCV B; 3IC0 B; 1FHJ B; 3ONZ A; 1RTE A; 2VRY A; 5CNC A; 1X3K A; 102M A; 1Y4G A; 1HDS A; 6HBW B; 3VRF A; 2ZSN A; 2RI4 B; 2LH3 A; 3D1A A; 4NZI A; 1Y8I A; 3ECL A; 2SPO A; 5HAV A; 1LHT A; 1SHR B; 1QXD B; 1BJE A; 1X46 A; 2G12 A; 2XKG A; 2DHB B; 1N9H A; 1MNO A; 1Y35 B; 2JHO A; 5EQM A; 1Y83 B; 2W72 B; 1J7W A; 3S66 B; 1GLI A; 2DXM A; 1ABS A; 1LA6 B; 3M3A A; 1XYE A; 3NFE B; 4X0L A; 1ABY A; 3LR9 A; 3CY5 A; 1BZ0 B; 1J40 A; 1LFV B; 4MQG B; 3PT8 A; 2ZSS A; 3UH3 A; 1Y2Z B; 2HCO A; 1BZ1 B; 1H97 A; 1LJW A; 3G4V A; 4F6F A; 2H8D B; 2EB9 A; 5KDQ A; 3A9M A; 1HLM A; 1HDA B; 1VXD A; 2EB8 A; 4H2L A; 1VXG A; 3SDH A; 3WCU B; 2DN2 A; 3UHH A; 1XZU B; 5EYJ A; 1K1K A; 1IWH B; 1AJ9 A; 2R4Y A; 3RJN B; 3ZJS A; 1OR4 A; 2D2M B; 1DXV B; 1FDH A; 1Y22 B; 1RQA A; 1MKO A; 1Y7D A; 2EKT A; 4ESA A; 3SDN A; 2FAL A; 5C6Y A; 2ZS1 C; 107M A; 1DKE A; 1Y4G B; 1HDS B; 1RPS A; 3VRF B; 3G4U A; 3AQ7 A; 3D1A B; 1CIO A; 3W4U A; 4O4T A; 3NL7 A; 106M A; 1CQX A; 1Y8I B; 1R1X A; 3V2V A; 3P5Q A; 3UBC A; 3D17 A; 3VRE A; 1JY7 A; 3LQD A; 2O5S X; 1KR7 A; 1YGF A; 1RQ4 A; 4G1B A; 3HEO A; 2NRM A; 1O1N A; 2HHD A; 2ZLV A; 3R0G A; 4C44 A; 1S69 A; 1AJG A; 1J7W B; 1HCO A; 1GLI B; 2DXM B; 5MBN A; 1Y7G A; 1XYE B; 3OJ1 A; 4X0L B; 1ABY B; 1YHR A; 1YH9 A; 3CY5 B; 6HBI A; 1J40 B; 3PT8 B; 4XDI A; 3WHM A; 2HCO B; 1NS9 A; 1JZK A; 2D5X A; 3UHR A; 1LJW B; 1BIN A; 1CH1 A; 4MQH A; 1WMU A; 1QPW B; 1U7S A; 4HRR A; 2WY4 A; 3WCT D; 5KDQ B; 104M A; 1XXT A; 3NML A; 1Y0W A; 2GKN A; 1MYH A; 1MBD A; 2SPN A; 1NGK A; 4H2L B; 2C0K A; 5F2A A; 3HYU A; 1AJ9 B; 2MGB A; 1MLU A; 2BLI A; 1MLF A; 1JPB A; 2ZFB A; 2V1E A; 1IRD A; 101M A; 1GBU A; 1COH A; 3WCV C; 4L7Y A; 2ZSR A; 1IOP A; 1GBV A; 1RQA B; 1MKO B; 4HHB A; 1Y7D B; 4ESA B; 3UGZ A; 3PIA A; 1YG5 B; 3AT5 A; 1HDB A; 3EDA A; 3WI8 A; 2VLY A; 2ZT0 A; 1O1K A; 1DKE B; 1FDH G; 1SPG A; 3ZJM A; 1RPS B; 1O1M A; 3RGK A; 3WCT B; 3E5O A; 1X9F A; 1YEV A; 1Y01 B; 2MGK A; 3W4U B; 1OJ6 A; 3NL7 B; 2FAM A; 2ZS0 A; 2OHA A; 1R1X B; 2V1H A; 3P5Q B; 3GDJ A; 4O35 A; 3D17 B; 3VRE B; 1JY7 B; 2W72 C; 3LQD B; 1BVD A; 1YGF B; 3ZJJ A; 1O1N B; 2HHD B; 2ZLV B; 2LH1 A; 3QJE A; 1J3Y A; 1YHU A; 1HCO B; 1ASH A; 1Y7C A; 1CH3 A; 1Y8K A; 4F4O A; 1MYF A; 1Y7G B; 1YHR B; 1YH9 B; 2O5B X; 3BJ3 A; 3BCQ A; 2HZ2 A; 3A5B A; 3UHE A; 4O2G A; 3WHM B; 1NS9 B; 3GYS A; 2D5X B; 1DO3 A; 4HSW A; 4MQH B; 1WMU B; 3VAU A; 3BA2 A; 4FH6 A; 3U3E A; 1QXE A; 1O16 A; 1EBC A; 4HRR B; 1XQ5 A; 2FRI X; 1UIW A; 4F6G A; 1MYT A; 3BOM A; 3WCU C; 1LH1 A; 1NAZ A; 1XXT B; 1Y0W B; 1HBB A; 4H0B A; 1HBR B; 3UH5 A; 1BUW A; 2MYC A; 5EV5 A; 4L2M A; 1BZP A; 1YIE A; 3IA3 B; 2D2M C; 3TLD A; 3HYU B; 2ZT2 A; 4MQJ A; 4F6B A; 2D60 A; 1MNK A; 3UHT A; 111M A; 2ZFB B; 4WJG 1; 3S65 B; 1IRD B; 1ECO A; 5CN7 A; 3PEL A; 1CH2 A; 1GBU B; 1UFP A; 5MBA A; 1COH B; 1DWS A; 2GTL D; 1HBS A; 4L7Y B; 4HHB B; 1UFJ A; 4MQI A; 1YHE B; 3PIA B; 3AT5 B; 1HDB B; 1Y8H A; 1O1K B; 3OZV A; 1I3E A; 4F69 A; 1S0H A; 1SPG B; 1S61 A; 2G0X A; 1C7C A; 2VEE A; 1O1M B; 2W6X A; 1X9F B; 1YEV B; 3UHK A; 1A4F A; 3QM8 A; 1MBI A; 3QMA A; 4KMV A; 1JDO A; 3EU1 A; 2OLP A; 3EDB A; 1EWA A; 3GDJ B; 110M A; 4NK1 A; 2ZSX A; 4JAC A; 5CNE A; 3MBA A; 1UVX A; 4ODC A; 3QJE B; 1J3Y B; 1YHU B; 1Y7C B; 2MGD A; 1Y8K B; 2ZSQ A; 5CHR A; 4F4O B; 1Y4P A; 1DLY A; 2XKI A; 2E2Y A; 2MGL A; 3BCQ B; 1OUU A; 1Y0T A; 1Y4V A; 1VXC A; 4MQK B; 3HHB A; 3IC0 A; 1FHJ A; 3ZOL A; 2FRJ X; 1MWC A; 1F5O A; 5CN4 A; 3GYS B; 2AV3 A; 1DO7 A; 5EET A; 1DWT A; 2RI4 A; 1QXE B; 3OK5 A; 1XQ5 B; 1EW6 A; 1T1N A; 1THB A; 1UIW B; 3HEN A; 3BOM B; 2LH2 A; 1G0A A; 1DUO A; 2ZSZ A; 5F0B A; 1HBB B; 1V9Q A; 1C40 A; 1BUW B; 1RSE A; 2QU0 A; 1CH5 A; 1YIE B; 3QJD A; 1MDN A; 1Y83 A; 4FC3 A; 3UI0 A; 2Z6N A; 3WFX A; 2D2N A; 1A9W A; 4MQJ B; 1JF4 A; 2D60 B; 3ARJ A; 1WLA A; 2G10 A; 5HLU A; 2BKM A; 1O1P A; 3PEL B; 1SDL A; 3GKV B; 5JDO C; 3K8B A; 4M4A A; 3UHG A; 3A5A A; 3ZJH A; 2VLZ A; 3UGY A; 4MQI B; 1MYI A; 1YEU A; 2IG3 A; 1Y8H B; 1S0H B; 1C7C B; 1HAB A; 1MCY A; 1CQ2 A; 3EU1 B; 4B3W A; 3LB4 A; 3WCW D; 1VXB A; 5IKS A; 5JGG A; 1MLK A; 1L2K A; 2G0V A; 3QM5 A; 5EOH A; 1DXV A; 1Y46 A; 4ODC B; 4N7P B; 2ZT4 A; 1A6N A; 1VXF A; 3PI8 A; 1MOB A; 2AV0 A; 1HAC A; 4FWX A; 1OUU B; 1Y0T B; 4JYQ A; 3HHB B; 1S56 A; 4UIQ A; 1GCW A; 2ZWJ A; 2WTG A; 4BJA A; 4ROL A; 2MGF A; 2G0S A; 1MLH A; 5HY8 A; 2QLS A; 1T1N B; 1G09 A; 1THB B; 3GK9 A; 1BIJ A; 2V1F A; 1CPW A; 1MYM A; 2XKH A; 1G0A B; 1YE0 A; 1MBS A; 3BJ2 A; 2O5Q X; 1F65 A; 1NPG A; 1NQP A; 4U8U D; 1C40 B; 2QU0 B; 1YEQ A; 1Y4R A; 3QJD B; 4FC3 B; 2Z6N B; 2R4Z A; 2D2N B; 3K9Z A; 3DHR A; 1LH5 A; 2W6V A; 1J7Y A; 5JDO F; 3VHB A; 4O1T A; 4SDH A; 3UHW A; 1O1P B; 1SDL B; 2Z85 A; 3K8B B; 4M4A B; 1GDK A; 1CP5 A; 1HV4 A; 3WTG A; 1QPW A; 2BNL A; 1TES A; 1YEU B; 1X9F C; 3AQ6 A; 1MOC A; 1NXF A; 2R80 A; 3GQG A; 3MVC A; 3QM6 A; 1GDI A; 1DWR A; 2ZS0 C; 2R50 A; 1XCH A; 1HAB B; 3MOU A; 3H58 A; 3ECZ A; 4N8T A; 1IT3 A; 1NS6 A; 1TU9 A; 1UT0 A; 1Y4F A; 1URY A; 2Z6T A; 1V4W A; 3G46 A; 2KSC A; 4GZG A; 4IRO A; 1NZ2 A; 2MGM A; 5JGG B; 4H07 A; 1Y46 B; 3OGB A; 2EVK A; 1V07 A; 3PI8 B; 2B7H A; 1J7S A; 5KKK A; 1MLR A; 1HAC B; 1YG5 A; 4KJT A; 1A3N A; 3DHT A; 1J41 A; 3OVU C; 1GCW B; 3HXN B; 4HRT A; 1O1I A; 4ROL B; 1XZ4 B; 2FRF A; 1VRE A; 1UVY A; 3WCT A; 1JP6 A; 4ZVB A; 2H8F A; 1ECA A; 2GKM A; 3ECX A; 5HY8 B; 2QLS B; 1LUE A; 1YGD A; 1G09 B; 5CNB A; 1BIJ B; 2V1G A; 1YE0 B; 3K3U A; 3M3B A; 1Y7Z A; 3MKB B; 4C0N A; 2VYW A; 5C6E A; 1N9X A; 4MAX A; 3BJ2 B; 4NI0 A; 1HGC A; 2WTH A; 1NQP B; 3PI3 A; 4NK2 A; 4KN3 A; 4KMW A; 1YEQ B; 1Y4R B; 2R1H A; 1A6M A; 3UHU A; 3RJ6 A; 3DHR B; 2W6V B; 1J7Y B; 1DTI A; 3PT7 A; 1MOH A; 1MLO A; 5EE4 C; 3ZJN A; 3QQQ A; 1YZI A; 1EMY A; 5CND A; 4YU3 A; 2NX0 A; 1HV4 B; 3WTG B; 1HBA A; 1O1O A; 3WFU A; 3FH9 A; 1MBC A; 3AT6 A; 1YMA A; 2R80 B; 3GQG B; 4F68 A; 1RTX A; 1CG5 A; 4NXA A; 4N8T B; 4DC8 A; 1HBR A; 3G4Q A; 3SZK A; 2ZFO D; 1NS6 B; 4WCH D; 1Y8W A; 1MBO A; 1Y4F B; 1V4W B; 2AA1 A; 1CMY A; 4IRO B; 2HBC A; 2HBF A; 5M3S A; 2O5M X; 1XZ2 A; 1MWD A; 2MYB A; 1Y45 A; 3S65 A; 1LTW A; 1VXA A; 4G1V A; 3UHI A; 2HHB A; 3HF4 A; 2YRS A; 2B7H B; 1NIH A; 1J7S B; 2BLH A; 2OHB A; 1OR6 A; 4MQC A; 1YHE A; 3UHV A; 4DWT A; 1A3N B; 3DHT B; 1J41 B; 1MLS A; 4HRT B; 1O1I B; 4MBA A; 4HSX A; 2H8F B; 1C7D A; 2VHB A; 4NI1 A; 1YGD B; 3HRW A; 2BK9 A; 1AJH A; 2W31 A; 1Y7Z B; 1NZ3 A; 3ZH0 A; 5C6E B; 4NI0 B; 1HGC B; 1NWN A; 2ZLX A; 5E83 A; 1HLB A; 1FLP A; 2QSS A; 2R1H B; 1LFT A; 1QI8 A; 3PT7 B; 2MB5 A; 3QZZ A; 2GTL A; 3GQP A; 4MQK A; 5E6E A; 112M A; 2BLJ M; 3D4X A; 3AQ8 A; 1A3O A; 4AVD A; 1YMC A; 1HBH A; 1YZI B; 4YU3 B; 2MYD A; 4UZV A; 1EBT A; 1HBA B; 1O1O B; 5AB8 A; 3FH9 B; 3AT6 B; 1CG5 B; 1Y4B A; 3S1I A; 1A01 A; 1NPF A; 2G3H A; 3SZK B; 1Y8W B; 105M A; 1R1Y B; 3LB3 A; 3E55 A; 3O7N A; 2AA1 B; 1CMY B; 2HBC B; 1PBX A; 1N9I A; 1W92 A; 2HBF B; 2VEB A; 1YCA A; 1XZ2 B; 2DN3 B; 1Y45 B; 3M39 A; 2ZS0 D; 1JZM A; 3QQR A; 3GKV A; 2HHB B; 3HF4 B; 2YRS B; 2W6W A; 3ORD A; 7HBI A; 1NIH B; 4MQC B; 3DR9 A; 3G4Y A; 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2DC3 A; 2AUO A; 2ZLT A; 2LHB A; 1A00 A; 3NMM B; 3WFT A; 3CIU A; 1G0B A; 1FAW B; 1RQ3 B; 1CIK A; 4MBN A; 2GLN A; 3QJB B; 1MLL A; 3M38 A; 1JZL A; 1MLJ A; 2W6Y A; 3GQR A; 2G0R A; 1Y5F B; 5KER A; 3HXN A; 1CH7 A; 1DXT A; 1XZV B; 3MN0 A; 3MYM A; 3G53 A; 1HSY A; 1XZ4 A; 4ROM A; 3WCP A; 1KD2 B; 5EUI B; 2ZLU B; 1JWN A; 1YIH B; 1O1J A; 1Y85 B; 5D5R A; 3UHZ A; 1ABW A; 1CP0 A; 3MKB A; 2HZ1 A; 4HBI A; 4XS0 A; 3FS4 A; 2HBG A; 1JL6 A; 3WCW B; 3PI9 A; 4TYX A; 1MWB A; 2EF2 A; 1VXH A; 1VWT B; 1Y0A B; 2PGH B; 1V5H A; 2QFK A; 2ZT3 A; 1Y4Q A; 5CN6 A; 1MYJ A; 5CMV A; 1I3D A; 3WCU D; 1MLQ A; 2HHE A; 2G11 A; 1YFF B; 1A0U A; 3EOK B; 1HBI A; 1BVC A; 1UX8 A; 3MYN A; 1YEO A; 5E29 A; 4G51 A; 3UHQ A; 1O1L B; 1Y5K B; 2D2M D; 2OIF A; 3D7O A; 4AVE A; 4TWV A; 1V4X B; 2O58 X; 4MXK A; 1LFY A; 3QZX A; 5HBI A; 5CHQ A; 1GZX B; 1XZ7 A; 2HBD A; 1HBG A; 1JF3 A; 1YVQ A; 1HGB B; 2MGA A; 1B86 B; 1NWI A; 1J52 A; 4U8U B; 3V2Z A; 1OUT B; 1DXU B; 2BWH A; 5HLQ A; 5JDO E; 1F63 A; 5HU6 B; 2ZLT B; 1YHU C; 1A00 B; 1MTJ A; 2SPL A; 3CIU B; 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