The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
46
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGFAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Carbonmonoxy structure of His100Phe Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
46
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FS4 A; 1CG5 B; 3NL7 B; 3BOM A; 5EYS A; 4MQC A; 3VRE A; 1QI8 B; 1NS9 A; 1Y8K B; 3ECL A; 1MBN A; 2ZSS A; 4WJG 1; 3WCW C; 1MKO A; 1C7D A; 3BJ1 A; 1V4U A; 2MGE A; 3VHB A; 1UIW A; 5EV5 A; 2VHB A; 1G0B B; 3NMM B; 1HGA A; 1Y0C A; 1MOH A; 4MXL A; 4DWU A; 1T1N A; 1DXT A; 1JL7 A; 5HLQ A; 2SPL A; 2ZFB A; 3BCQ B; 5CHR A; 3NFE B; 4F69 A; 2YRS B; 2R1H B; 6HBW B; 2R80 A; 1Y7D B; 4NXA A; 2GL3 A; 4MQI A; 1HAC A; 2D2M C; 1Y4V B; 4B4Y A; 2WTH A; 1LFQ A; 2MGF A; 1IBE B; 2W72 A; 1Y46 A; 1UFJ A; 1QXD B; 3WCV D; 1HBR A; 5E6E A; 1N9H A; 3IXF A; 1O1P A; 4DWT A; 3UHZ A; 1CIK A; 1JP8 A; 1Y8I B; 3UI0 A; 5E29 B; 1XZ5 A; 2QFN A; 2DC3 A; 4MBN A; 1S6A A; 1YHU A; 1FN3 A; 1MNK A; 2QSS B; 3UBV A; 5IKS A; 2ZSO A; 1K1K A; 2MGC A; 1LA6 A; 5CN5 A; 3S65 A; 1MYT A; 2ZS0 D; 2V1F A; 5JGG A; 1XXT A; 1UX9 A; 3E4N A; 3FS4 B; 1NIH B; 1BZ0 A; 1YH9 A; 1UVY A; 3VRE B; 1A3O A; 1NS9 B; 2V1I A; 2GTL B; 5HLU A; 1Y8H A; 1LFL A; 1C7D B; 4NI0 B; 3PI9 B; 1V4U B; 1MLN A; 1R1Y A; 2ZT0 A; 1V07 A; 1ABS A; 1ECO A; 1GBV B; 1ABY B; 2HHE A; 1A3N A; 2ZLU A; 1HGA B; 1LH5 A; 1Y0C B; 1WMU A; 1Y35 A; 2B7H A; 1T1N B; 1DXT B; 1FDH G; 3UHU A; 3EU1 A; 2EB8 A; 2O5Q X; 5JDO C; 2MHB B; 5EU2 A; 3S1J A; 3AT6 A; 2JHO A; 5MBA A; 2R80 B; 2C0K A; 3ARL A; 1DXU A; 1DO4 A; 2QRW A; 4MQI B; 4H2L A; 4WJG A; 1YE2 B; 3PT7 A; 5ILM A; 4TWV A; 1Y0T A; 1GBU B; 1Y46 B; 3WCT D; 3OZV A; 5E6E B; 1O1P B; 1GDL A; 1DXV A; 1FAW B; 1XZ5 B; 3MN0 A; 1CQ2 A; 1KR7 A; 3HYU B; 3LQD A; 1J3Z B; 1YHU B; 3D1A A; 5CNG A; 1MYH A; 1YHR A; 3G4V A; 1PMB A; 5E83 A; 1HLB A; 3ZJL A; 1K1K B; 3A59 B; 1O16 A; 3SZK A; 1C40 B; 3G53 A; 1VWT A; 3A0G A; 1SI4 A; 2ZFO D; 1X46 A; 1BIJ A; 1K0Y B; 2G0S A; 4U8U D; 3GQG A; 5CNB A; 3A9M A; 1JEB B; 3AT5 B; 3ONZ A; 2ZSX A; 2Z6N B; 1CLS A; 1DUK A; 1LFL B; 1ECN A; 2HHE B; 2ZLU B; 4MQJ A; 1BAB B; 2BWH A; 1QSI A; 1YIE B; 1FSL A; 3ECX A; 3WCV A; 1YCA A; 1CH4 A; 3NML A; 1G9V A; 3AT6 B; 1DUO A; 2Z6T A; 1DXU B; 4H2L B; 1Y7Z A; 3QJC A; 5CMV A; 2KSC A; 2ZLW B; 1Y0T B; 3A2G A; 4F4O A; 4O4Z A; 1DXV B; 2ZS0 A; 1UMO A; 3LQD B; 5HAV A; 2O5O X; 3D1A B; 2NSS A; 2D5Z B; 2OH8 A; 2Z6S A; 1YHR B; 4N7N B; 1GCW A; 2ZSN A; 1J41 A; 1QXE B; 2ZWJ A; 1IWH A; 1XZ2 B; 1N9F A; 3SZK B; 3VRG A; 3BJ2 B; 3QM9 A; 2HBC A; 1VXE A; 1BZP A; 1UC3 A; 1G08 A; 1HBB A; 2ZLX A; 1DXC A; 1MLL A; 3A0G B; 2V1J A; 1SI4 B; 3R5I B; 2VEB A; 1NZ2 A; 4O35 A; 1B86 B; 1HCO A; 1BIJ B; 1HDS A; 2G10 A; 3GQG B; 4PNJ A; 1MYI A; 2GKN A; 2MYE A; 3ONZ B; 1A6N A; 1CLS B; 1Y0A A; 1Y4B A; 2VYY A; 1CG8 B; 5CN8 A; 1H97 A; 1YEV A; 1PBX A; 2FRF A; 1HBA B; 1Y5K A; 2QLS A; 2PEG A; 2LH6 A; 1TES A; 3MOU A; 1A00 A; 4MQJ B; 1QSI B; 2MGH A; 3QJE B; 3WCT A; 2AUR A; 2W72 C; 2VM0 A; 3OVU C; 3GYS B; 3M3B A; 1G9V B; 1A0U B; 1CH9 A; 1YFF A; 3CY5 A; 2EKU A; 4FH6 A; 1HRM A; 3G46 A; 3G4W A; 2RI4 A; 1BZ6 A; 1MLF A; 1YHU C; 1HBH A; 2BK9 A; 1A6G A; 102M A; 2NRM A; 4H0B A; 2R4X A; 4NK1 A; 4F4O B; 1V9Q A; 1O1I A; 2ZS0 B; 3VRF A; 1A6M A; 1RTX A; 2ZSZ A; 3OO5 A; 1O1M A; 2RAO B; 1Y4G A; 2V1H A; 2ZFO A; 1LHS A; 1GCV A; 1VXF A; 4U8U A; 1GCW B; 2BKM A; 3WCP A; 1J41 B; 3MJU B; 2BMM A; 4XS0 B; 1IWH B; 1J7W A; 2BLI A; 3QM6 A; 2GTL D; 2HCO B; 1EW6 A; 1RTE A; 111M A; 3QJD A; 2ZSQ A; 105M A; 1S69 A; 1HBB B; 1RQ4 A; 2ZLX B; 1F5P A; 1Q1F A; 1GVH A; 1HCO B; 1HDS B; 4MQK B; 1UVX A; 3RJN B; 1BZR A; 2ZSR A; 1YEV B; 4X0L A; 2V1K A; 3IC2 A; 2H8D A; 3UH6 A; 1Y5K B; 2QLS B; 2PEG B; 1A00 B; 3PEL A; 1HDB A; 3WCT B; 1SPG B; 3HHB A; 1Y7C A; 2O5B X; 1AJG A; 1MCY A; 3DHT A; 1EBC A; 2PGH A; 1MBI A; 1I3D A; 1A6K A; 3ARK A; 1O1J A; 1YFF B; 3CY5 B; 2VRY A; 2W31 A; 1XY0 A; 3AQ5 A; 3ZJH A; 5SW7 B; 1Y8K A; 1HDA B; 1NZ5 A; 1O1I B; 1ITH A; 2AUP A; 1MOD A; 4MU5 A; 4O1T A; 3OO5 B; 3V2V A; 1DTM A; 1G0B A; 3OZW A; 1RVW A; 3NMM A; 2QFK A; 2HBE A; 4U8U B; 3MVC A; 2CMM A; 2BLJ M; 1H1X A; 1SHR A; 3WCP B; 2HBS A; 5C6Y A; 1MNJ A; 3QJD B; 2YRS A; 1O1O A; 3WCU D; 3MKB A; 2R1H A; 6HBW A; 1HBS B; 2HHB A; 1MNI A; 3IC0 B; 1IBE A; 2MGM A; 1YOI A; 1LJW B; 1JW8 A; 5HU6 A; 1QXD A; 3WCV C; 2QSP A; 1JY7 B; 4PQC A; 5KKK A; 2QMB A; 1JZM A; 2MGB A; 1NEJ B; 3IC2 B; 2H8D B; 1BJE A; 4YU3 A; 4FWX A; 1GDK A; 1VXG A; 3UHD A; 2R4W A; 1HDB B; 1YGF B; 2W6V A; 2QSS A; 3HHB B; 3U3E A; 4JAC A; 1Y7C B; 1THB A; 3UHX A; 3PT8 A; 1HV4 B; 3DHT B; 2V1G A; 1C7C B; 1LTW A; 1MLR A; 2ZS0 C; 1KD2 B; 3ORD A; 1FDH A; 2Z85 A; 4UUR A; 3QM7 A; 1XY0 B; 1CH2 A; 3TLD A; 1NIH A; 103M A; 3MYN A; 2WTG A; 5JDO E; 2GTL A; 1G09 A; 1YOG A; 3LR7 A; 4H07 A; 1Y83 B; 1SDL A; 4NI0 A; 3PI9 A; 3ZJJ A; 1NPG A; 1MLQ A; 1NZ4 A; 3QJB B; 3OK5 A; 1GBV A; 1ABY A; 5ILE A; 1RVW B; 2HBE B; 1SHR B; 2O5S X; 1NS6 B; 2HBS B; 4L7Y A; 1EMY A; 1CMY B; 3LHB A; 1DO1 A; 2MHB A; 1O1O B; 3MKB B; 5CNC A; 2DN3 B; 1W92 A; 2ZS1 D; 2HHB B; 2HHD A; 1LH7 A; 4G1V A; 1YE2 A; 1Y01 B; 1YE0 B; 1COH A; 3HXN A; 1GBU A; 3WCT C; 5HU6 B; 2EVK A; 3D7O A; 2FRK X; 2QSP B; 2DN2 A; 4JYQ A; 4M4A A; 1FAW A; 2QMB B; 1AJ9 B; 5AB8 A; 7HBI A; 1GDI A; 3HYU A; 2HBF A; 4YU3 B; 3UHB A; 1J3Z A; 3UGZ A; 1BIN A; 2W6V B; 3LB2 A; 1TU9 A; 2ZLV B; 1THB B; 5KER A; 3PT8 B; 3K9Z A; 1LH6 A; 3A59 A; 3AQ9 A; 1C40 A; 2E2Y A; 1EWA A; 1IRC A; 1LH2 A; 5CHQ A; 4NI1 B; 4UIQ A; 3ZJR A; 1X9F D; 2ZFO C; 1K0Y A; 1OUT B; 4U8U C; 2MGK A; 110M A; 2AA1 A; 1JEB A; 3AT5 A; 1G09 B; 4N7P B; 2Z6N A; 4FWY A; 4TWU A; 3QMA A; 1SDL B; 3LB1 A; 4B3W A; 3HF4 B; 3K8B A; 1BAB A; 1QSH A; 1YIE A; 4C44 A; 4L7Y B; 1DKE A; 1MOB A; 3ASE A; 3ZJN A; 2HHD B; 1OJ6 A; 4AVD A; 1NQP A; 1HGC A; 2OIF A; 1KFR A; 2ZLW A; 3DHR A; 1COH B; 1F63 A; 1ECD A; 3HXN B; 3FH9 A; 2H8F A; 3D7O B; 3UHS A; 2DN2 B; 5CNE A; 1M6C A; 1HSY A; 1JPB A; 1AZI A; 1Y0W A; 1Y31 B; 4M4A B; 4F6I A; 1YMA A; 2G3H A; 1SDK B; 2HBF B; 2O58 X; 1YZI B; 4F6B A; 4WCH D; 1Y0D A; 2D5Z A; 1A01 B; 1ABW A; 4N7N A; 3RJ6 A; 2GNV A; 1D8U A; 1O1L A; 5KER B; 1QXE A; 1S5Y A; 4GZG A; 1XZ2 A; 3G4R A; 3BJ2 A; 2O5L X; 4KMV A; 3R0G A; 1GJN A; 2G11 A; 3R5I A; 3CIU A; 4KJT A; 1B86 A; 5KDQ A; 1V4W B; 2AA1 B; 109M A; 1HAB B; 1HLM A; 3SDH A; 1R1X B; 1LH1 A; 1A4F A; 2ZSY A; 1CG8 A; 3WCU B; 3A5A A; 2ZS1 A; 1HBA A; 1QPW A; 3OO4 B; 3UHR A; 2MYB A; 3UHQ A; 1DO3 A; 1MBD A; 3K8B B; 1QSH B; 3QJE A; 3E5I A; 3GOU A; 3GYS A; 2OLP A; 1CP5 A; 3G4Y A; 1A9W A; 1DKE B; 4TYX A; 4XDI A; 1CQX A; 1Y4P B; 4HSW A; 1A0U A; 5CN7 A; 1MWD A; 1NQP B; 1HGC B; 1MLO A; 3E55 A; 1Y7G B; 3DHR B; 1JP6 A; 2QU0 A; 1Z8U B; 2LH7 A; 3FH9 B; 1J7Y A; 2H8F B; 1N9I A; 5EUI B; 3LB4 A; 1X3K A; 4HRT A; 1Y0W B; 3D17 B; 2OH9 A; 2V1E A; 4HHB B; 1MLJ A; 2RAO A; 3ZH0 A; 1X9F A; 1Y0D B; 4ZVA A; 1ABW B; 1MBS A; 1MYF A; 1O1L B; 3MJU A; 1S5Y B; 4XS0 A; 1M6M A; 5EET A; 2HCO A; 2GTL C; 1YVT A; 1Y5F B; 4NXC A; 4G51 A; 5AZR A; 1JL6 A; 1S5X B; 3QZX A; 5EOH A; 3CIU B; 3LB3 A; 2D2N D; 1G0A A; 1RSE A; 5KDQ B; 4MQK A; 3HRW A; 1LFY A; 1A4F B; 4F6F A; 1SPE A; 3K3U A; 1U7R A; 2XKI A; 2ZS1 B; 2VLY A; 3KUO A; 1CO9 A; 1YEQ A; 1QPW B; 4G1B A; 3PI3 A; 3PI1 A; 2G0V A; 3KMF A; 3OJ1 A; 2FRI X; 1SPG A; 2DN1 B; 3GOU B; 4PQ6 A; 3OGB A; 1LFT A; 4ROL A; 3WR1 A; 3G4Q A; 1J3Y B; 3ED9 A; 2NX0 A; 3BA2 A; 2MYC A; 5ILR A; 3EOK B; 1YIH B; 2QU0 B; 2MGG A; 1VRE A; 3WFX A; 2EB9 A; 1J7Y B; 3UHK A; 3O89 A; 1GDJ A; 1MLH A; 5SW7 A; 1VXD A; 4HSX A; 1HDA A; 4HRT B; 1DLW A; 4NZI A; 3GDJ A; 1FCS A; 3BJ3 B; 5F0B A; 1DM1 A; 3WFU A; 3QQR A; 1X9F B; 1FHJ B; 2BLH A; 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3VAU A; 3MJP B; 1YGD A; 1MBC A; 3P5Q B; 1MNO A; 2ZLV A; 1LFV A; 1OUU B; 5C6E B; 4N8T B; 1FLP A; 3D1K A; 4M4B A; 1HGB B; 3GLN A; 5EQM A; 3ZJS A; 2SPO A; 4NS2 A; 1MTK A; 5HY8 A; 1Y4F B; 4N7O A; 1GZX B; 4NI1 A; 2R4Z A; 1O1K B; 2GNW A; 1X9F C; 1YMC A; 3UH5 A; 1OUT A; 1LFZ B; 1NXF A; 1ECA A; 2AUO A; 1MLS A; 4N7P A; 3GKT A; 1Y4R B; 1BZZ B; 1BUW B; 1OR6 A; 1XZV A; 1JF4 A; 3HF4 A; 2D2N B; 5F2A A; 3M39 A; 1OBM A; 1C7B A; 5EYJ A; 1Y22 B; 3ZJO A; 5B84 A; 1MLU A; 2ZLT B; 3A5G A; 1MLG A; 1V4X A; 3AQ8 A; 1I3E A; 2WY4 A; 1S56 A; 2O5T X; 1GLI B; 2VEE A; 2SPM A; 2H35 B; 3KMF C; 1JF3 A; 1DWT A; 4FC3 A; 1YEO A; 4ODC B; 1Y31 A; 2DHB B; 1YVQ A; 3GQR B; 1S61 A; 2EF2 A; 1RQA A; 1FSX B; 1SDK A; 1YZI A; 2ZSP A; 3MBA A; 3EDA A; 1YGD B; 2MBW A; 1A01 A; 5HBI A; 101M A; 3ARJ A; 1LFV B; 1YMB A; 3D1K B; 4M4B B; 1OFJ A; 3S66 B; 5HY8 B; 4N7O B; 1SWM A; 2SPN A; 3W4U B; 4OOD A; 4ROM A; 112M A; 1XQ5 B; 1A0Z A; 1MYG A; 1CIO A; 2HZ3 A; 4YU4 A; 5CN4 A; 1V4W A; 4DC7 A; 1HAB A; 1Y85 A; 1R1X A; 3B75 B; 3SDN A; 3UBC A; 3UHC A; 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