The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
45
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGWAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| publication title |
Aquomet Structure of His100Trp Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| total genus |
45
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CG8 A; 3NL7 A; 3UH3 A; 3GQP A; 1Y09 B; 3LQD A; 1XZ7 B; 2C0K A; 1RQ3 B; 3UI0 A; 1Y8W B; 2DN3 A; 2LH3 A; 1Y5F A; 2O5B X; 3PI9 A; 3LB3 A; 4HRT A; 3WHM B; 4UUR A; 1XZU A; 1HBB B; 3NG6 A; 1G08 B; 2HHB A; 5CNE A; 1G0A A; 1Y7G A; 2QFN A; 4FH7 A; 1A0U B; 2R50 A; 1Y5J B; 1A3O B; 3A5A A; 1YHE B; 2Z6S A; 2QSS B; 4TWV A; 3QJB A; 3UHV A; 1CH1 A; 3DHT B; 1UIW B; 3A9M A; 1DUK A; 4YU4 B; 1MBD A; 2ZFO A; 2NRL A; 1WVP A; 3G4U A; 1TES A; 4LPI A; 1JEB A; 2GRZ A; 4O35 A; 5D5R A; 1NPF A; 3UHQ A; 1C7B A; 1RTE A; 1Y7Z A; 3VRE B; 5EYJ A; 1UFJ A; 4HHB B; 4ODC B; 1S5Y B; 1FSX A; 1O1L B; 1ABS A; 2LH1 A; 1A6N A; 3PI1 A; 2ZS0 B; 111M A; 1URY A; 1J3Y A; 4NK1 A; 1O1I A; 1HGA A; 3OO4 B; 1OUT A; 2D60 A; 3O7N A; 4MU5 A; 2AUP A; 1MYG A; 1MGN A; 4O4T A; 1O1J B; 2G0R A; 3EOK B; 4KMV A; 1A00 B; 1YVQ B; 1R1X B; 3QJC A; 1Y45 B; 3UHI A; 1JY7 B; 1YE2 B; 2YRS A; 3K9Z A; 2AV3 A; 1RVW A; 2HHD A; 4N7N B; 1DXU B; 1MLN A; 2VLZ A; 1Y4F A; 2QRW A; 3G4Q A; 2O5Q X; 5CNF A; 2D2N B; 3S65 A; 1FHJ A; 3MYM A; 1MOA A; 1MLM A; 2W72 C; 4IT8 A; 1K0Y A; 4NI0 A; 3WCU B; 1HDA A; 1NPG A; 2MGF A; 4JAC A; 1XY0 A; 1O1O B; 1NS6 B; 1Y09 A; 2WTH A; 1YGD B; 1J7W A; 1SI4 B; 1HHO B; 3QJD A; 1RQ3 A; 1Y8K B; 1MLF A; 1Y8W A; 3EU1 B; 3IC0 A; 4MQK A; 2G14 A; 1MLR A; 1BZ1 A; 1DWR A; 1YVT B; 1BVD A; 1OUU B; 3ZJR A; 1J3Z B; 1HBB A; 2GTL C; 6HBW A; 5HY8 B; 1G08 A; 2FAL A; 1EMY A; 1YHR B; 1EWA A; 1DO4 A; 1ECO A; 3UHR A; 3AQ8 A; 2MHB B; 3D4X A; 1V07 A; 5F0B A; 1MOD A; 1HBI A; 1QSI A; 5KDQ A; 2QSP A; 2ZSO A; 1Y83 A; 1MLJ A; 2R4Y A; 1UIW A; 4O1T A; 2MGG A; 1S5X B; 1Y46 B; 5SW7 A; 3HRW B; 1MYJ A; 3UHK A; 1IRD A; 5CND A; 1AZI A; 5CN5 A; 1DM1 A; 3MJU B; 4N8T B; 3QJE A; 1FAW B; 3VRE A; 2G12 A; 3UHW A; 2LH6 A; 4ODC A; 1S5Y A; 2G0S A; 2GTL D; 1MOC A; 1NS9 B; 3GQG A; 3FS4 B; 1Y0D B; 1CPW A; 2FRJ X; 2ZLT A; 3UGY A; 1BAB B; 1A6M A; 2XKH A; 1QXE A; 1GLI B; 1LHT A; 1VWT A; 1CH7 A; 3QM7 A; 1YEN A; 5E83 B; 2AUR A; 2Z6N B; 1V4U A; 2GL3 A; 1BZ0 A; 1MBC A; 2RI4 B; 3OZU A; 1X3K A; 1O1K B; 1MTK A; 1YIH A; 2VRY A; 1MLU A; 1O1J A; 3NML A; 4FWY A; 1XZ2 B; 2ZSY A; 1R1X A; 1HSY A; 3WCP B; 6HBI A; 1JZM A; 3OZV A; 1GDI A; 2ZFO C; 2PEG A; 3GLN A; 1YE2 A; 5HU6 B; 3G4V A; 1DXU A; 1CBL A; 1S69 A; 1SPG B; 1NEJ B; 1THB B; 1DO7 A; 1MWB A; 1Y4Q B; 3AT6 A; 2QMB A; 2M6Z B; 3FH9 A; 3B75 B; 3PEL A; 5AZQ A; 2WY4 A; 1O1O A; 4F69 A; 104M A; 1NS6 A; 1Y85 B; 3QMA A; 3BJ2 A; 2QU0 A; 1B0B A; 3WCT B; 1YGD A; 2SPN A; 1EW6 A; 1ABY B; 1Y8K A; 2HHE B; 1OFJ A; 1NZ5 A; 1JF3 A; 2V1I A; 1J40 A; 1X9F A; 1YE0 A; 3ZJP A; 1YEU A; 2W6Y A; 1Y31 A; 2W6X A; 1MYI A; 1M9P B; 1MNH A; 2ZFO D; 3U3E A; 3ED9 A; 1IT2 A; 1GZX B; 4NXC A; 1XXT A; 1MYM A; 3WI8 A; 5EET A; 1Y7D A; 2MHB A; 3AQ9 A; 1JP9 A; 3DUT B; 2VYY A; 101M A; 3WFW A; 4C44 A; 3ECZ A; 1YZI B; 2ZLX B; 3P5Q A; 1Y8I B; 3ORD A; 1UT0 A; 2DXM A; 2DHB B; 4XDI A; 1DWS A; 1FDH G; 3CY5 A; 1DKE A; 2XYK A; 3ZJM A; 4U8U B; 4FWZ A; 4XS0 A; 2NRM A; 1O1M B; 2LH7 A; 5CN4 A; 4X0L B; 1YMB A; 5ILR A; 1J7S A; 3LR9 A; 1JL7 A; 1SDK B; 2MYB A; 1AJH A; 3E55 A; 108M A; 5JDO E; 1VXE A; 3S1J A; 1BBB B; 1Y0D A; 1YMA A; 4M4B B; 1K1K A; 1IRC A; 1GLI A; 3G53 A; 2G10 A; 3QZX A; 4MQJ B; 4MQC A; 3AQ6 A; 1Y7C B; 2LHB A; 3BJ1 B; 3ZHW A; 1C40 B; 1BVC A; 2AUQ A; 1JL6 A; 3A5G A; 2VLX A; 2XKI A; 1J41 A; 1V4X B; 4M4A A; 1Y0T B; 1YGF B; 1YCA A; 3EDB A; 3D1A A; 1MWC A; 3HHB B; 1HBA B; 3M3B A; 5CMV A; 1DLY A; 1NIH A; 1YHU A; 4IRO B; 2O5S X; 1Y01 B; 3LB1 A; 1MYT A; 2HBC B; 3RJ6 A; 5E29 B; 2MBW A; 2BNL A; 2B7H B; 1OR4 A; 3MN0 A; 1Y4Q A; 3AQ7 A; 3PT7 B; 3H58 A; 1Y22 B; 2VEE A; 2MGC A; 4ILZ A; 1MBS A; 5JDO F; 1A6K A; 1Y85 A; 1AJ9 B; 4H0B A; 1LFV A; 1HGB A; 1NQP A; 2HHE A; 3IXF A; 1LH2 A; 5EU2 A; 4ROM A; 1S61 A; 1XZV B; 3ZJI A; 1G9V B; 3CIU B; 1CMY B; 1KR7 A; 3S66 A; 2ZWJ A; 1TU9 A; 1FDH A; 1ABW B; 1HAC A; 4F6F A; 1SDL B; 1GZX A; 3D1K A; 2H35 A; 2CMM A; 1RQ4 A; 2WTG A; 2HBS B; 1SHR B; 1U7R A; 4OOD A; 1Y0A B; 1HGC B; 5EUI B; 2MYC A; 1LH5 A; 1GVH A; 1LFY A; 2HZ2 A; 1JP6 A; 2EVP A; 1YG5 B; 1XZ5 B; 3GK9 A; 1FN3 A; 3E5I A; 4U8U A; 3A0G A; 2VYW A; 1O1M A; 1DXD A; 1N9I A; 4X0L A; 4KN3 A; 2BWH A; 2ZFB B; 3ARJ A; 2D5X B; 2DC3 A; 3HEP A; 1J7Y A; 1X9F C; 4YU3 B; 5CHQ A; 1LFT B; 2ZLW B; 2MGI A; 2Z85 A; 1A6G A; 4M4B A; 4AVE A; 3ZJJ A; 3ODQ B; 3BCQ A; 1UVY A; 4MQJ A; 1C7D B; 2V1J A; 1Y7C A; 3BJ1 A; 1XCH A; 3V2Z A; 2DN1 B; 3GKV B; 105M A; 4G51 B; 1C7C B; 1Y5K B; 5EOH A; 1Z8U B; 1I3D A; 1HBR B; 1O16 A; 4TWU A; 1LH6 A; 3HHB A; 1BIN A; 2D2M A; 4MQH A; 2HBE A; 3DHR B; 1O1P A; 4IRO A; 1PBX A; 3GKT A; 2NSS A; 1R1Y A; 2HBC A; 1X9F D; 1HDS A; 2ZSN A; 4KJT A; 4MXK A; 1B86 A; 4NI1 B; 1RPS B; 3PT7 A; 3R5I A; 1MYZ A; 4N7O A; 1Y22 A; 1Y4R A; 3K3U A; 4PNJ A; 1LFQ A; 3WCV B; 1YDZ A; 1LA6 B; 2GNW A; 2BLH A; 1YEV A; 1LJW B; 3K8B A; 2G0X A; 3BOM A; 1CH2 A; 4MAX A; 1G0B B; 4H2L B; 5CNB A; 2ZS1 B; 1CLS A; 3MBA A; 1XZV A; 3CIU A; 2MYE A; 1A01 A; 3GYS B; 2BLJ M; 3PT8 B; 5JGG B; 2OHA A; 1GJN A; 5CN7 A; 1G09 B; 4WJG 1; 2MGA A; 3WR1 B; 3WCW B; 3UHN A; 1AJG A; 1WLA A; 4VHB A; 1Y0A A; 1YHU C; 2MGM A; 2HBD B; 5ILM A; 5C6Y A; 1QPW B; 1MNK A; 3UHY A; 1IBE A; 1YG5 A; 1HV4 B; 1XZ5 A; 2GDM A; 5KER B; 3KUO A; 1XQ5 B; 2QLS A; 2DN2 B; 1Y0W B; 1MBA A; 2ZT1 A; 4L2M A; 1NGK A; 5EV5 A; 2OIF A; 5CN9 A; 1WMU B; 1QSH B; 1GBU B; 4O4Z A; 4DC7 A; 2D5X A; 1QXD B; 1S0H A; 2H8D A; 1BZR A; 1UX9 A; 2HBF B; 3VRG B; 3AT5 A; 3VRF A; 1S6A A; 1XZ7 A; 1N9H A; 1YHU D; 1JP8 A; 3ODQ A; 4ROL B; 2EKT A; 1HBH B; 1D8U A; 3ZOL A; 3BA2 A; 4FC3 B; 3GQR B; 1MLL A; 4ZVA A; 1ECN A; 3PIA B; 3PI8 B; 1Y5K A; 3WHM A; 1BZP A; 1DUO A; 1HAB B; 3UHD A; 5CNC A; 2EF2 A; 3UGZ A; 3SZK B; 4PQC A; 1CH9 A; 4U8U C; 5HBI A; 1A0U A; 1Y5J A; 3LR7 A; 1A3O A; 3NMM B; 1YHE A; 1XYE B; 2QSS A; 2AA1 B; 4C0N A; 3W4U B; 1YEO B; 2R1H B; 2Z6T A; 1M6M A; 3G52 A; 3DHT A; 5HLU A; 1IWH B; 5MBA A; 4UIQ A; 4YU4 A; 2BMM A; 1MYF A; 3HXN B; 1LJW A; 4FH6 A; 106M A; 1PMB A; 1N9X A; 3UH5 A; 1HBS B; 1MNI A; 3UHH A; 2ZLU B; 112M A; 2G3H A; 2GKN A; 4HHB A; 1A9W A; 2O5L X; 4NXA A; 2R4X A; 3PI4 A; 2AV0 A; 1O1L A; 3MOU A; 2XKG A; 1A4F B; 3GYS A; 2GRH A; 1CG5 B; 1DLW A; 2ZS0 A; 4QAU A; 1A3N B; 3KUN A; 4U8U D; 1SWM A; 1DXT B; 3OO4 A; 1CBM A; 2D2M C; 3UHT A; 1MKO B; 3OJ1 A; 5C6E B; 2FAM A; 3S1I A; 1UVX A; 4PQB A; 2H8F B; 2G11 A; 3QQR A; 3EOK A; 1BZ6 A; 3KMF A; 1Y2Z B; 1V75 B; 1HV4 A; 1A00 A; 1YVQ A; 2ZSQ A; 2VHB A; 5KER A; 1ITH A; 1Y45 A; 2EB9 A; 2DN2 A; 1JY7 A; 1MCY A; 4N7N A; 1HLM A; 3HYU B; 1GCV B; 3GOU B; 1DTI A; 2LH5 A; 1W92 A; 1WMU A; 2D2N A; 1QSH A; 1N9F A; 1YFF B; 1GBU A; 3QM9 A; 3D7O B; 3WCU A; 2ZT2 A; 1Y4V B; 2NX0 A; 5EYS A; 2D2M D; 2W6V B; 3GDJ B; 3HEN A; 4F68 A; 1MLK A; 5HLX A; 1SI4 A; 1HHO A; 2ZT4 A; 1MDN A; 4NS2 A; 3MJP B; 1GCW B; 3EU1 A; 2BKM A; 3SDN A; 1LFZ B; 110M A; 1YIE B; 1ASH A; 1NZ2 A; 5B84 A; 3OVU C; 2W6W A; 1YVT A; 3PI8 A; 2MGE A; 2ZSS A; 1OUU A; 1MWD A; 1J3Z A; 1JDO A; 3E4N A; 5HY8 A; 1VHB A; 1Y4G B; 1YHR A; 2W72 B; 1X46 A; 3SDH A; 2LH2 A; 1MLH A; 2MGJ A; 3NMM A; 1XYE A; 4KMW A; 3W4U A; 1LFL B; 2R1H A; 3UHG A; 1NXF A; 1FLP A; 1MOH A; 1KD2 B; 1S5X A; 1Y46 A; 3HRW A; 1LH7 A; 3HXN A; 4NZI A; 4MQI B; 2PGH B; 3MJU A; 107M A; 3QZZ A; 1Y35 B; 1UFP A; 4HRR B; 2ZSR A; 4N8T A; 1S56 A; 1ECA A; 3PI3 A; 3NFE B; 1F65 A; 1FAW A; 4MXL A; 1YCB A; 5HAV A; 1HCO B; 1COH B; 1NS9 A; 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3WCU C; 3ECX A; 1LUE A; 2PGH A; 1Y35 A; 3ONZ B; 4WJG A; 1CIK A; 3ZJN A; 1HBG A; 1SDK A; 1EBT A; 1HCO A; 1YOG A; 1CO9 A; 3D17 B; 2YRS B; 5IKS A; 2HHD B; 1RVW B; 1BBB A; 3IA3 B; 3ZJO A; 3EDA A; 1Y0C B; 1SPE A; 3S65 B; 1FHJ B; 1O1N B; 3G4Y A; 102M A; 1K0Y B; 3QM5 A; 4NI0 B; 1C40 A; 2D2N D; 4F4O B; 3UHE A; 1HDB A; 1V4X A; 1CQX A; 1XY0 B; 1Y0T A; 3RGK A; 3WCU D; 1YGF A; 1CP5 A; 1J7W B; 4NK2 A; 3QJD B; 4MBN A; 4MQG A; 1MBN A; 4F6I A; 1HBA A; 3IC0 B; 4MQK B; 109M A; 3VAU A; 1BZ1 B; 2D6C A; 2OHB A; 5E29 A; 1JF4 A; 6HBW B; 2B7H A; 4HSX A; 1JPB A; 2R80 A; 2VLY A; 3MVC A; 1UMO A; 4ESA A; 1VRF A; 4L7Y B; 2OH9 A; 3D4X B; 2GRF A; 1YEQ A; 1QSI B; 5KDQ B; 1VXD A; 2QSP B; 1AJ9 A; 1Y83 B; 1CIO A; 3BJ3 A; 1LHS A; 2G0V A; 5SW7 B; 1MLO A; 1BUW B; 2MB5 A; 5CN8 A; 1IOP A; 1G9V A; 1IRD B; 2EVK A; 4ZVB A; 1CMY A; 3WTG A; 1YOI A; 1ABW A; 3UH6 A; 3QJE B; 2FRK X; 1SDL A; 3QM8 A; 2HBS A; 1SHR A; 1HGC A; 1MZ0 A; 3GQG B; 5EUI A; 1V9Q A; 2ZLT B; 1J52 A; 2IN4 A; 2BK9 A; 1EBC A; 1QXE B; 1VWT B; 1LTW A; 2VEB A; 3OK5 A; 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