The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
51
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVQMKQHSSLTTGNFEKFFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| publication title |
Role of polarity of the distal pocket in the control of inhibitor binding in dehaloperoxidase-hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
51
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| structure length |
137
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.11.1.7: Peroxidase. |
| pdb deposition date | 2012-10-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UHW A; 4M4A B; 3LR9 A; 1SHR A; 3WHM B; 4NXA A; 1DO4 A; 1FDH A; 1JZK A; 2G0R A; 1V4U B; 5JGG B; 1OFJ A; 1QSI B; 3WCV C; 3VRG B; 2PGH B; 4C0N A; 4ODC B; 1IBE B; 1VRF A; 3S66 A; 2O5L X; 3CIU A; 3OO4 A; 3PI4 A; 2V1F A; 4FH7 A; 3ZJR A; 2FRF A; 1DKE A; 1QPW B; 3VRF B; 3A0G B; 107M A; 2D5Z B; 2HBD A; 1AZI A; 1FSL A; 1CH9 A; 3AT6 B; 1OUU B; 2D5X A; 2OHA A; 1Y22 A; 1V9Q A; 1LFY B; 1J41 B; 1S6A A; 1O1O B; 2VRY A; 3MJU A; 2GRF A; 1YHU B; 1JWN A; 1XZ5 A; 2HCO B; 2D60 A; 1DUO A; 3FS4 A; 3UHR A; 1XY0 A; 1HGA B; 3SDN A; 1MBS A; 1LH5 A; 5E6E A; 1VXG A; 3O7N A; 5HY8 A; 4NK1 A; 1LFQ B; 2GTL B; 2NSS A; 3G53 A; 1IDR A; 4U8U A; 1XQ5 B; 2ZS1 A; 1MBC A; 1YCA A; 1MBD A; 1MGN A; 2NRL A; 2WTH A; 4DC8 A; 2IN4 A; 3LB3 A; 1VXD A; 1COH B; 3QM6 A; 3OO5 A; 5CHR A; 1MCY A; 3TM3 A; 1Y4Q B; 3DHR A; 4ROL B; 3IC0 B; 3PT8 B; 1YHR B; 3OJ1 A; 1O1J B; 1YCB A; 3UGY A; 2W72 C; 1S5X B; 2VLX A; 108M A; 2FRJ X; 3D1A B; 1MTK A; 1S0H B; 2ZFB B; 2G3H A; 5SW7 B; 1HDS B; 3ZJH A; 3ZOM A; 3WR1 A; 2ZFO C; 1Y0A B; 3AG0 A; 1YVT A; 3HXN B; 1CH7 A; 1CG8 B; 2ZLT B; 5KER A; 1A0U A; 1Y7G B; 4F4O B; 2OH9 A; 1CQ2 A; 1HV4 A; 1Y8W A; 1SPG A; 5KDQ A; 5E29 A; 2R4X A; 112M A; 4H0B A; 1MYF A; 2D2N D; 3UH6 A; 1CO8 A; 109M A; 2QU0 B; 4L7Y B; 4ESA A; 5EE4 D; 1XZ7 A; 2YRS A; 5EYS A; 2B7H B; 1XYE A; 3BJ2 B; 3D4X A; 2D2M B; 1O1K A; 1J7S A; 3M3B A; 1YZI A; 1J3Z A; 1Y4V B; 2PEG B; 3WCV D; 3W4U B; 2QMB B; 1QXD B; 2LH6 A; 3UH5 A; 2GL3 A; 3GQG A; 1Y09 B; 1RQ3 B; 1DXU A; 1YVQ B; 2XKH A; 3WFW A; 1X9F B; 1HDB B; 2MGM A; 1JW8 A; 3CY5 A; 1XXT B; 1G09 A; 1YEO A; 1NS6 A; 1EW6 A; 1Y0D A; 2Z6T A; 5E83 B; 1VWT A; 1YEU A; 3HEP A; 2R1H B; 5CN8 A; 1MBN A; 1NWN A; 3R5I B; 2VEB A; 1F5P A; 2HBC A; 4F6B A; 1LA6 B; 2GNW A; 2DN2 B; 2MYA A; 3WCW A; 3UHY A; 1LH1 A; 1BZ1 B; 1J3Y B; 1Y0C B; 1HSY A; 1YMA A; 3PEL B; 4MQI A; 1MOA A; 3GLN A; 2NX0 A; 3AQ6 A; 4YU3 B; 3S1J A; 1AJG A; 1YH9 A; 1OBM A; 6HBW A; 2HZ2 A; 1JY7 A; 4MQC A; 5D5R A; 3E5O A; 2ZT2 A; 1PMB A; 1DXD A; 3GOU B; 4N7N A; 1AJ9 A; 3UH3 A; 1C7B A; 1KR7 A; 1F63 A; 1SPE A; 2MYE A; 1GBV A; 3PI9 A; 2D6C A; 2AUP A; 2VLY A; 4FWX A; 1VXF A; 1BUW B; 1OJ6 A; 1H1X A; 1YGF A; 1OUT A; 1FLP A; 3WCV A; 3S65 A; 5F0B A; 2W6V B; 3QJD B; 2BLJ M; 1CO9 A; 1Y8I A; 3EOK A; 1URV A; 3ASE A; 2AA1 A; 2ZS0 C; 1UX9 A; 3WCU B; 1RQ4 A; 1U7S A; 1V75 A; 3PI3 A; 2MGI A; 5MBA A; 4YU4 B; 2W6W A; 4HRR B; 1LH3 A; 1JZM A; 1ABY A; 1YG5 A; 1ABS A; 3UHG A; 1CH4 A; 3EU1 A; 5CN9 A; 1UT0 A; 2VEE A; 5JDO E; 4KJT A; 7HBI A; 5CN7 A; 1ECA A; 2MBW A; 2HBE A; 4MBA A; 3PT7 B; 1N9I A; 3WCT C; 3OZW A; 1DXC A; 1DXV A; 3TLD A; 3LB4 A; 1GBU B; 1XZU A; 1CP5 A; 1KD2 A; 1MYH A; 3KMF C; 1Y4G A; 1IOP A; 102M A; 4MQG A; 1A0Z B; 1HBR B; 3ZJP A; 2CMM A; 2QLS A; 5CNC A; 1Y35 A; 1EBT A; 2LH5 A; 2ZSN A; 3E55 A; 4FC3 A; 1ABW A; 2DC3 A; 2HBF B; 1LTW A; 3K3U A; 3BOM B; 1M9P A; 3D17 B; 1O1P A; 4NI0 A; 3HHB B; 3G4W A; 3ZJN A; 5HLX A; 4MQH B; 1HGC B; 4NXC A; 4WJG A; 3ODQ A; 2RAO B; 1CH5 A; 4DWU A; 1Y7C B; 1A4F A; 1DXT B; 1MLM A; 1YGD B; 3QZX A; 1SHR B; 4PQB A; 4H07 A; 5JDO D; 3IC2 A; 1GDJ A; 1DO3 A; 1HGB A; 1WVP A; 2ZSQ A; 3ECZ A; 2W72 A; 2V1E A; 4O35 A; 2QSS A; 4H2L A; 3S66 B; 1J7W A; 4FWY A; 4NS2 A; 1S61 A; 1Y4B A; 3CIU B; 1A00 A; 3RJN B; 2HHE B; 1QI8 A; 1SDK B; 1F65 A; 3BCQ A; 3V2Z A; 2EKT A; 2DN1 B; 3GDJ A; 2HBD B; 4HSW A; 2EF2 A; 1BZZ A; 1Y85 A; 5IKS A; 2D5X B; 1FAW A; 3G4U A; 3B75 A; 1F5O A; 1XZ4 A; 4JAC A; 3EDA A; 1Y7D B; 1A3N A; 2VLZ A; 6HBI A; 1YMC A; 2V1J A; 1XZ5 B; 4NZI A; 3UBC A; 1SDL A; 3FS4 B; 1Y5F A; 1Y31 A; 1Y5J A; 3G46 A; 1YE0 A; 4MQK A; 5CN4 A; 2MGG A; 5E6E B; 1MNO A; 5HY8 B; 2DHB A; 5C6Y A; 1Y8H A; 4PQC A; 3HRW B; 2GDM A; 1RVW B; 1Y45 A; 3GKV B; 1YHU C; 1O1M B; 3LR7 A; 2ZS1 B; 1MBI A; 3UHQ A; 4KN3 A; 1FHJ A; 5EYJ A; 3WCP B; 5KKK A; 1G08 B; 2ZSP A; 4F68 A; 3LHB A; 5AZR A; 1LFZ B; 4DC7 A; 5CN6 A; 1LH7 A; 3DHR B; 1DWS A; 2OIF A; 3ZJM A; 1J52 A; 4F6F A; 2LH7 A; 4HRT A; 4U8U D; 4N7O B; 3A5G A; 1BBB A; 105M A; 2H8D A; 2V1H A; 5B84 A; 3NMM A; 5AZQ A; 3VRE A; 1G9V A; 3BJ3 A; 3WR1 B; 3QM7 A; 1JZL A; 1YVT B; 2GLN A; 3G4V A; 3OZV A; 1NGK A; 3LB2 A; 1BVD A; 5KER B; 1A0U B; 4IRO A; 3QJE A; 1Y46 B; 1HBI A; 5CMV A; 2AUR A; 3EDB A; 3UHD A; 1SPG B; 4NI1 B; 5KDQ B; 5E29 B; 3OK5 A; 1RPS A; 1Y0T B; 1YFF B; 2FRK X; 1NEJ B; 3WFU A; 4C44 A; 3V2V A; 4ESA B; 1DLY A; 3HYU A; 1NQP B; 1XZ7 B; 3DR9 A; 2YRS B; 2ZSR A; 2XKI A; 2BLH A; 5HU6 A; 1XYE B; 1LUE A; 1NIH A; 1FDH G; 3D4X B; 3P5Q A; 1MLG A; 2GKM A; 3SDH A; 2MGF A; 1O1K B; 2DXM A; 1J3Z B; 3ECL A; 1DWR A; 1SI4 B; 2XKG A; 1S56 A; 1NZ4 A; 1JEB A; 1HBB A; 1YIH A; 1IWH B; 1NS9 A; 1TES A; 1MBA A; 3ZJO A; 1CMY B; 3QJC A; 3CY5 B; 2M6Z B; 1YEO B; 1MDN A; 2ZSO A; 1NS6 B; 3NFE B; 2O5M X; 2EB9 A; 2MGE A; 1LFL B; 2EKU A; 2FAM A; 1YEU B; 4O2G A; 1HAB A; 1RTE A; 106M A; 1JL6 A; 1QSH B; 1X9F C; 2SPM A; 2ZLU B; 1EWA A; 1UVY A; 2IG3 A; 2HBC B; 3A59 B; 1I3D A; 5HBI A; 1GZX A; 5JDO F; 3WCW B; 2O5T X; 3ZJL A; 1IT2 A; 1DO1 A; 1YE2 B; 3UHZ A; 4WJG 1; 1CH1 A; 2GNV A; 3ZJI A; 2O5O X; 3DHT A; 2HHB A; 2MYC A; 2G10 A; 1MLN A; 1J40 A; 2QFN A; 1HLB A; 6HBW B; 5CHQ A; 1JY7 B; 1K1K B; 4MQC B; 3WCW D; 2MHB A; 2D2N B; 4JYQ A; 2R4Z A; 2G0S A; 3QQR A; 1B86 B; 1LFT B; 1A6N A; 1CBL A; 1DTI A; 4N7N B; 1AJ9 B; 1JP8 A; 3UH7 A; 2NRM A; 1C7B B; 1BVC A; 2HHD B; 1X3K A; 4SDH A; 3A2G A; 3GK9 A; 1MWD A; 2G0V A; 1BZ6 A; 1V5H A; 2C0K A; 3WCV B; 3S65 B; 1S5Y A; 2O5S X; 2ZSY A; 4O4T A; 1HLM A; 3EOK B; 2AA1 B; 1ECN A; 1RQ4 B; 5B85 A; 1V75 B; 1CG5 B; 4WCH D; 1ASH A; 4ZVB A; 2ZSZ A; 3UHE A; 1ABY B; 1YG5 B; 5JGG A; 3EU1 B; 3ED9 A; 1NWI A; 3ZH0 A; 4ILZ A; 2PGH A; 3K9Z A; 2BLI A; 4ODC A; 1MNJ A; 5EQM A; 3WCU C; 1BZR A; 1JF3 A; 1DXV B; 1L2K A; 2W6X A; 1XZU B; 1KD2 B; 3QMA A; 1O1N A; 2H8F B; 4ROM A; 3HEO A; 1Y2Z B; 3AT5 A; 1QPW A; 4MQG B; 1URY A; 1BAB B; 1T1N A; 1BIJ A; 2Z6N B; 2QLS B; 1Y35 B; 1OUU A; 4FC3 B; 2HBS A; 1G0A B; 3A5B A; 3ARK A; 1M9P B; 1RQA B; 3PI8 A; 4NI0 B; 1LFY A; 4MXL A; 1O1O A; 2VM0 A; 1Y0W A; 1YHU A; 4M4B B; 2H35 A; 4LPI A; 4DWT A; 2MYD A; 1HDA A; 4MBN A; 1LH6 A; 1GDK A; 2RI4 B; 3OGB A; 4MAX A; 1R1Y A; 1OR6 A; 1YEV B; 1MLU A; 3GQP B; 2QSP B; 2ZWJ A; 1HAC A; 1FN3 B; 1HGB B; 1GVH A; 1KFR A; 2FAL A; 2SPN A; 4F6J A; 5ILE A; 1UFJ A; 3NML A; 2GRH A; 2QSS B; 4H2L B; 1COH A; 3SZK A; 1GCV B; 3BJ1 B; 3PIA A; 2BWH A; 1Y4B B; 4HBI A; 1Y4Q A; 3QM8 A; 1QI8 B; 1R1X B; 1NPG A; 1UIW A; 3M3A A; 4ROL A; 3PT8 A; 1MLO A; 1O1J A; 1U7R A; 1Y4F A; 2Z8A A; 3AQ7 A; 3G4Y A; 3WTG A; 3UHS A; 3GKT A; 3D1A A; 3K8B A; 5EOH A; 1FAW B; 1IRC A; 5MBN A; 1V4W A; 1HDS A; 2W6Y A; 3G52 A; 4X0L B; 3B75 B; 1Y8K B; 2ZFO D; 4HHB A; 1THB B; 1MLL A; 2XYK A; 3D1K B; 1XZV A; 1SDL B; 1Y7G A; 1Y5F B; 1MNI A; 1A3O A; 1Y5J B; 3GQR A; 1MYZ A; 1YE0 B; 4MQK B; 1YDZ A; 2QU0 A; 4ZVA A; 2DHB B; 1C7D A; 1Y8H B; 2B7H A; 3NG6 A; 1Q1F A; 4MQJ A; 1G0B A; 4QAU A; 3BJ2 A; 1K0Y A; 1DO7 A; 1LFV A; 4XDI A; 3QJB B; 3R0G A; 2R4Y A; 1Y4V A; 1Y7Z A; 1Z8U B; 1HBH A; 1WLA A; 4F6I A; 1JL7 A; 2QMB A; 1QXD A; 1C7C A; 3OVU C; 2ZLV B; 3ARJ A; 1WMU B; 1Y09 A; 1RQ3 A; 1MYM A; 1UX8 A; 4G1B A; 5CNE A; 1A6K A; 1CBM A; 1YVQ A; 1A9W A; 4HRT B; 1X9F A; 1HDB A; 1XXT A; 1Y01 B; 2AUQ A; 2R80 B; 3HF4 A; 3NMM B; 3VRE B; 3PI1 A; 1G9V B; 3BJ3 B; 1XZ2 A; 3NL7 A; 5M3S A; 5E83 A; 103M A; 3UHB A; 1YOH A; 4TWV A; 5EUI A; 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3HC9 A; 1HJT A; 1S5Y B; 1DXT A; 5ILR A; 3MJP A; 1IT3 A; 5EE4 C; 3S1I A; 1HCO A; 3MN0 A; 1YMB A; 1HRM A; 1MTJ A; 1LJW A; 3RGK A; 5F2A A; 1J7S B; 1YZI B; 3UHU A; 4OF9 A; 1HBA A; 1PBX A; 1MYG A; 3ZOL A; 2ZLX A; 3VHB A; 1SWM A; 4MXK A; 3GQG B; 4N8T A; 2O58 X; 1DXU B; 3AQ9 A; 3ZJQ A; 2HHE A; 1SDK A; 3M39 A; 2D2M C; 1O1N B; 4ROM B; 1G09 B; 2ZS0 A; 3AT5 B; 1TU9 A; 2ZST A; 2DN1 A; 1M6C A; 3AQ8 A; 1YHE A; 1T1N B; 1BIJ B; 1Y0D B; 1S69 A; 1MLQ A; 2GRZ A; 1A01 A; 2HBS B; 3AQ5 A; 1Y5K A; 1VWT B; 3PI8 B; 104M A; 1A6M A; 1Y7D A; 1NZ2 A; 1Y0W B; 1H97 A; 3UGZ A; 3WCT A; 2H35 B; 5JOM A; 1ECO A; 1HDA B; 1VHB A; 1R1Y B; 1IRD A; 3KMF A; 2NSR A; 4UZV A; 2QRW A; 1A6G A; 4MQI B; 1FSX A; 1BIN A; 5EU2 A; 1NPF A; 1HAC B; 3HRW A; 1RVW A; 3GKV A; 2AV3 A; 1O1M A; 1B0B A; 1NXF A; 1YHU D; 1YH9 B; 1C40 A; 1YOG A; 3WCP A; 1G08 A; 2MB5 A; 3SZK B; 4PQ6 A; 3PIA B; 2MGA A; 1LFZ A; 1UFP A; 1DLW A; 4KMV A; 1UIW B; 2QFK A; 1NAZ A; 2EB8 A; 3H58 A; 2GTL D; 2ZSX A; 2Z85 A; 3MVC A; 1Y4F B; 4N7O A; 1MOD A; 3WTG B; 1GBV B; 3PI9 B; 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