The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
137
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structure length |
137
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Chain Sequence |
GFKQDIATIRGDLRTYAQDIFLAFLNKYPDERRYFKNYVGKSDQELKSMAKFGDHTEKVFNLMMEVADRATDCVPLASDANTLVQMKQHSSLTTGNFEKFFVALVEYMRASGQSFDSQSWDRFGKNLVSALSSAGMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Dehaloperoxidase A
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| publication title |
Role of polarity of the distal pocket in the control of inhibitor binding in dehaloperoxidase-hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Amphitrite ornata
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| total genus |
50
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| structure length |
137
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| sequence length |
137
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.11.1.7: Peroxidase. |
| pdb deposition date | 2012-10-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MBS A; 1BBB B; 2NRM A; 2OHB A; 2ZS0 C; 1MLR A; 3HXN A; 4DC8 A; 1MWB A; 105M A; 1V4U A; 2RI4 B; 1SDL B; 1GVH A; 3UGY A; 1EBT A; 4MQI A; 4U8U C; 1PBX B; 1J7S A; 3VRG B; 1X9F D; 1JP6 A; 2ZFO B; 1HDB B; 1V4X A; 3WI8 A; 1MNI A; 2VEE A; 1V4W A; 3HXN B; 1YCA A; 3OZW A; 4M4B A; 4MQI B; 1YHE A; 1J7S B; 1TES A; 1Y7G A; 5E6E A; 4JYQ A; 3WHM A; 1UX9 A; 1XZV A; 1Y8I A; 1NZ5 A; 1V4W B; 1C40 A; 1O1L A; 3OO4 A; 3BJ1 B; 2EKU A; 4M4B B; 4F6F A; 3AQ6 A; 1YHE B; 1Y7G B; 5E6E B; 3UH5 A; 3HYU A; 3WHM B; 1XZV B; 3ZJR A; 1Y8I B; 3LR7 A; 1MOB A; 2HBS A; 1YE2 A; 5IKS A; 3QZX A; 3UHR A; 4MQC A; 1C40 B; 1O1L B; 4WCH D; 1DXT A; 1X9F A; 1N9H A; 1NAZ A; 1G9V A; 1MLS A; 4TYX A; 3QM6 A; 3ZJO A; 5CN8 A; 1MWD A; 3HYU B; 4KMW A; 4NXC A; 1EWA A; 1YFF A; 3MBA A; 1MYG A; 2HBS B; 1BVC A; 1YE2 B; 2XKI A; 4MQC B; 1J3Y A; 3DHT A; 1DXT B; 2MGF A; 1EBC A; 1X9F B; 5AZQ A; 1IT2 A; 1G9V B; 3R0G A; 4MAX A; 1FHJ A; 1Y0A A; 2ZFB A; 1LH1 A; 1Y45 A; 3BJ2 A; 3QJB A; 3AQ7 A; 3KMF C; 1BZP A; 1G0A A; 4TWV A; 4FH7 A; 2SPL A; 3A0G A; 1J3Y B; 1NEJ A; 2GRF A; 3UHQ A; 3DHT B; 5HY8 A; 3RGK A; 1FHJ B; 1Y0A B; 1XXT B; 5JDO C; 1Y0T A; 2ZFB B; 2R80 A; 1Y45 B; 3BJ2 B; 2MHB A; 1DLY A; 1MOC A; 3QJB B; 1Y22 A; 4ODC A; 1CLS B; 1YH9 A; 2Z85 A; 1G0A B; 1FN3 A; 1V9Q A; 3V2Z A; 1XQ5 A; 3A0G B; 2O5L X; 5HLQ A; 2H8D A; 1NEJ B; 1A6N A; 1QXE A; 1YIH A; 3H57 A; 5HY8 B; 4MPM A; 2MYB A; 3UH3 A; 2HHD B; 3P5Q A; 1Y0T B; 3DUT A; 2W72 A; 1YZI A; 2HCO B; 1YMA A; 2EVP A; 4ODC B; 1YH9 B; 1N9X A; 1FN3 B; 2G0R A; 1XQ5 B; 2BNL A; 2AV0 A; 1AJ9 A; 3CY5 A; 2H8D B; 1QXE B; 1YIH B; 1G08 A; 3P5Q B; 3UHN A; 1MOD A; 1MYT A; 2DN1 A; 2QMB B; 3DUT B; 2W72 B; 1YZI B; 3ARL A; 1BIN A; 1F5O A; 3A2G A; 4AVE A; 1K1K A; 1FDH A; 1DXC A; 1S5Y A; 3ORD A; 3CY5 B; 3G52 A; 1NS9 A; 1BIJ A; 1B86 A; 3QJD A; 2CMM A; 3GDJ A; 1VXC A; 1Y7C A; 1C7C B; 1G08 B; 3FS4 A; 1SI4 A; 2DN1 B; 3PEL A; 1VWT A; 1YE0 A; 2ZSY A; 1UFP A; 1K1K B; 4IT8 A; 4N7N A; 2FAM A; 1GDJ A; 1MZ0 A; 2ZFO C; 3UI0 A; 4FC3 A; 2ZWJ A; 1SWM A; 1S5Y B; 3SDH A; 1NS9 B; 1BIJ B; 1B86 B; 5E83 A; 3QJD B; 3KUN A; 3GDJ B; 1Y7C B; 3MVC A; 1YGF A; 3FS4 B; 4UZV A; 3HF4 A; 3QJC A; 1SI4 B; 1RPS A; 3K9Z A; 1BZ1 A; 2EF2 A; 1HLM A; 3PEL B; 4FWZ A; 1YE0 B; 5HBI A; 4N7N B; 2QFK A; 3FH9 A; 2H35 A; 1BZR A; 2O5S X; 4FC3 B; 3GQP A; 5CNB A; 3ARK A; 5JGG A; 5E83 B; 1A3O B; 1YGF B; 2V1I A; 4F69 A; 3HF4 B; 1YMB A; 3QJC B; 1RPS B; 1SHR A; 1BZ1 B; 1CG8 A; 1A3N A; 1IT3 A; 5C6E A; 2G10 A; 1LTW A; 4UUR A; 3VAU A; 3SZK A; 1DUK A; 1DKE A; 2QFN A; 4ROL A; 3FH9 B; 2H35 B; 3GQP B; 5JGG B; 3WCT D; 5CNF A; 4TWU A; 1MYI A; 1SHR B; 1CG8 B; 3UHH A; 1A3N B; 1ABW A; 2MGE A; 3S48 C; 1N9F A; 3SZK B; 3WCW D; 2AUO A; 1DKE B; 3NMM A; 1JL6 A; 4ROL B; 2FRF A; 1OFJ A; 2WTG A; 1CG5 A; 1K0Y A; 3MN0 A; 2HBG A; 3PT8 A; 4N8T A; 1R1X A; 1TU9 A; 1YHU D; 1FCS A; 104M A; 4L7Y A; 1X9F C; 1ABW B; 2XKH A; 2ZS1 A; 1RSE A; 1CBM A; 1Y5K A; 2O5O X; 3NMM B; 1HGA A; 3ODQ A; 1CG5 B; 1K0Y B; 3HC9 A; 2DHB A; 4N8T B; 1R1X B; 2BLI A; 1WMU A; 1JWN A; 3HRW A; 4MBA A; 2D5Z A; 1CPW A; 2C0K A; 1SPE A; 2ZSN A; 4L7Y B; 3ZJI A; 1JL7 A; 107M A; 3HHB A; 2ZS1 B; 1IRC A; 4HSX A; 3WCU D; 1Y5K B; 4MQG A; 1HGA B; 3ODQ B; 1MGN A; 3WCT A; 2DHB B; 1A0U A; 1RQA A; 3UHV A; 1WMU B; 3HRW B; 1A0Z A; 3NL7 A; 1IDR A; 2D5Z B; 2R4Y A; 3GLN A; 3UHB A; 1MLO A; 1HBH A; 1MBC A; 3HHB B; 2VRY A; 4MQG B; 1YHU A; 3IC0 A; 1A6K A; 3MOU A; 3WCT B; 1A01 A; 1ECO A; 3S1J A; 1A0U B; 2PEG A; 1GDK A; 1RQA B; 1SPG A; 1YGD A; 1A0Z B; 3NL7 B; 3UHT A; 3WCW B; 2MGG A; 1YCB A; 1O1P A; 1HBH B; 1EW6 A; 3WFW A; 1FSL A; 2NSS A; 110M A; 1DXV A; 1YHU B; 3IC0 B; 4ZVB A; 3OO5 A; 1URV A; 1A01 B; 1QSI A; 2PEG B; 4G1V A; 1SPG B; 4M4A A; 1A00 A; 1VRE A; 1YGD B; 4HRR A; 1F63 A; 1U7S A; 3WCU A; 2W6Y A; 1O1P B; 5HLU A; 1DXV B; 3PI3 A; 1MYZ A; 2SPO A; 3OO5 B; 4O1T A; 1VXB A; 2ZT1 A; 5CN9 A; 5EUI A; 1QSI B; 3QZZ A; 4M4A B; 1JY7 A; 3GKV A; 1A00 B; 2HZ2 A; 3NML A; 2D2M D; 4HRR B; 4SDH A; 2ZSP A; 1JF3 A; 1J40 A; 4N7P A; 3WCU B; 1PBX A; 1OUT A; 3UHE A; 1YEN A; 2R4W A; 1LFV A; 1JZM A; 2QLS A; 1UC3 A; 5KKK A; 2ZST A; 1HBS A; 5EUI B; 2D2N D; 3UHK A; 1JY7 B; 3GKV B; 1AJG A; 2FAL A; 3R5I A; 3G53 A; 1CH7 A; 1GDI A; 1J40 B; 4N7P B; 4HSW A; 2G11 A; 3ARJ A; 1OUT B; 2H8F A; 1YEN B; 1NGK A; 1YOG A; 3UHW A; 1LFV B; 1J3Z A; 2QLS B; 1HBS B; 2MGK A; 2O5T X; 2V1K A; 2W31 A; 2OLP A; 1CH9 A; 3R5I B; 3BJ1 A; 1J7W B; 3ZJL A; 1D8U A; 1V75 A; 1CIK A; 2H8F B; 3ECL A; 1J3Z B; 1C7D A; 5EU2 A; 1VXG A; 2EKT A; 3DHR A; 3RJN B; 1X46 A; 2D2M A; 1RTX A; 1XZ7 A; 2GTL D; 2AUR A; 1DM1 A; 3VRF A; 1Z8U B; 2DN2 A; 2SPN A; 1BZ6 A; 1MBO A; 1U7R A; 3HEO A; 2G14 A; 5EE4 D; 5ILM A; 1V75 B; 2ZSX A; 1MYH A; 2D2N A; 1C7D B; 4MXL A; 1DO7 A; 3DHR B; 3G4U A; 1HHO A; 4HRT A; 2D2M B; 1KFR A; 1XZ7 B; 3VRF B; 1JZL A; 2DN2 B; 5CHR A; 1O1J A; 1CH4 A; 2ZLU A; 1BZZ A; 2OHA A; 1LFQ A; 1OUU A; 1Y2Z A; 1OBM A; 2D2N B; 2MGA A; 2HBD A; 1L2K A; 1MBI A; 2ZS1 C; 1HHO B; 4HRT B; 5CN6 A; 2GDM A; 2AV3 A; 1CMY A; 1O1M A; 1Y5J A; 1C7B A; 1QPW A; 1O1J B; 2ZLU B; 1JDO A; 2MGL A; 1M6M A; 2AUP A; 1XXT A; 1BZZ B; 1KD2 B; 2V1J A; 3QMA A; 1LFQ B; 3D17 A; 1OUU B; 1Y2Z B; 4F6G A; 3D4X A; 1CLS A; 2HBD B; 2W6V A; 1MYM A; 1VXA A; 1HCO B; 3MKB A; 5ILE A; 1CMY B; 1O1M B; 3WFX A; 1Y5J B; 1C7B B; 3UHS A; 4L2M A; 1HGB A; 1QPW B; 3M38 A; 1J3F A; 1M9P A; 2HHD A; 2O5M X; 5C6Y A; 1HSY A; 1IBE A; 1XZU A; 5HLX A; 1YDZ A; 1OFK A; 2HCO A; 1MNJ A; 3D17 B; 1S5X A; 3D4X B; 3ZJS A; 2KSC A; 2W6V B; 2G0Z A; 3LB2 A; 3MKB B; 1YHU C; 2ZSQ A; 1W92 A; 1HGB B; 5CND A; 1M9P B; 3ZH0 A; 3AT6 A; 3PI8 A; 4ROM A; 1IBE B; 4JAC A; 1HBG A; 2MYC A; 1XZU B; 4IRO A; 1CP5 A; 1YDZ B; 3D7O A; 2QMB A; 1A4F A; 2BWH A; 1O1K A; 1S5X B; 3OVU C; 111M A; 3UHZ A; 2QSS A; 3KUO A; 2ZS0 D; 4O2G A; 2BW9 M; 1YOI A; 5EOH A; 1MLL A; 1O1N B; 1T1N A; 1MKO A; 1RTE A; 4U8U D; 3AT6 B; 1C7C A; 3PI8 B; 1V07 A; 4ROM B; 3ASE A; 2VYY A; 4IRO B; 1UFJ A; 3D7O B; 1JF4 A; 102M A; 2BK9 A; 108M A; 1VXH A; 3PT7 A; 3WCU C; 1Y8K A; 1A4F B; 3S66 A; 1O1K B; 1CIO A; 3QJE A; 1RVW A; 2QSS B; 3K8B A; 3A9M A; 3D1A A; 1J7Y A; 1QSH A; 4F4O A; 3UHG A; 1T1N B; 1MKO B; 1HJT A; 5KER A; 2YRS A; 5CNG A; 1G0B A; 3ED9 A; 1DO1 A; 1A9W A; 4NI1 A; 3PT7 B; 3UBV A; 1Y8K B; 3S66 B; 1NZ3 A; 3GYS A; 1Y31 A; 2XKG A; 3QJE B; 3M39 A; 1HAC A; 1SDK A; 4X0L A; 1RVW B; 2G3H A; 3K8B B; 3D1A B; 1UVY A; 1J7Y B; 1BJE A; 1QSH B; 3O89 A; 4F4O B; 2Z6S A; 4B3W A; 5KER B; 1A3O A; 4ZVA A; 1Y0D A; 3AQ9 A; 1LHS A; 1DWS A; 2YRS B; 1G0B B; 1F65 A; 1HBR A; 1KR7 A; 4NI1 B; 3QM5 A; 3GYS B; 4FH6 A; 1Y31 B; 4MBN A; 4QAU A; 4X0L B; 1HAC B; 1SDK B; 1YMC A; 4F6I A; 1MLK A; 1NS6 A; 2V1F A; 2LH6 A; 2IN4 A; 1FAW A; 2G0X A; 1GCV A; 1Y09 B; 2MGB A; 1XCH A; 1MLJ A; 3HEN A; 1NWN A; 1Y0D B; 1LUE A; 5CMV A; 3H58 A; 1HBR B; 2ZS0 B; 1HDS A; 3NFE A; 4U8U B; 1NS6 B; 2MGC A; 5EV5 A; 1Y4B A; 1A6M A; 3GK9 A; 1Y85 A; 1FAW B; 1GCV B; 1YVT A; 4PQC A; 5HAV A; 1NWI A; 2MB5 A; 1IOP A; 2G0V A; 2GNW A; 2RAO A; 4MXK A; 1O1I A; 3E5O A; 2V1H A; 1YEQ A; 3BJ3 A; 1S61 A; 3LHB A; 1HDS B; 3NFE B; 4DWU A; 2ZT3 A; 3EU1 A; 1DXU A; 1Y4B B; 1ASH A; 2NX0 A; 2G12 A; 1Y85 B; 1GBU A; 1YVT B; 1VXF A; 2WTH A; 5JDO D; 3LR9 A; 2RAO B; 4H07 A; 1O1I B; 1YEQ B; 2VLY A; 3BJ3 B; 3ZOM A; 3AT5 A; 3LQD B; 1OR4 A; 3EU1 B; 1NXF A; 3PI4 A; 1ABY A; 1DXU B; 3A59 A; 3QQQ A; 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1BZ0 A; 5JDO F; 1QXD A; 3QQR A; 1J7W A; 2ZLT A; 3HEP A; 1S69 A; 1XZ4 B; 3QM8 A; 2HBC A; 2V1E A; 3S65 A; 4H2L B; 3B75 A; 2W6W A; 1URY A; 1YEV A; 2HHB A; 1HRM A; 2LH5 A; 3S1I A; 1CQ2 A; 1FLP A; 2FRJ X; 4PNJ A; 3PIA A; 1AJH A; 2MYE A; 1BZ0 B; 3TM9 A; 1Y4P A; 1QXD B; 1MLM A; 5CHQ A; 2ZLT B; 1H97 A; 2SPM A; 2HBC B; 4F6J A; 2ZSZ A; 3S65 B; 2DC3 A; 3B75 B; 3A5G A; 1YEV B; 2HHB B; 1V4U B; 3BCQ A; 2Z6N A; 1LJW A; 1Y4F A; 1YG5 A; 2O5B X; 5JOM A; 3PIA B; 1Y4P B; 2MGI A; 2FRK X; 2LHB A; 3WFU A; 1O1O A; 2D5X A; 1NPG A; 5SW7 A; 3WCV A; 4MQK A; 2VEB A; 4NXA A; 1GCW A; 1YOH A; 1WVP A; 1V4X B; 1EMY A; 3U3E A; 1LFZ A; 1N9I A; 2EB9 A; 1MLF A; 3OGB A; 2MGH A; 4F6D A; 2HBF A; 3BCQ B; 2Z6N B; 1LJW B; 4G1B A; 3G46 A; 2M6Z A; 1Y4F B; 1YG5 B; 5D1V A; 2LH3 A; 1IWH A; 1Y4R A; 1O1O B; 2D5X B; 3UGZ A; 4BJA A; 5SW7 B; 3WCV B; 2IG3 A; 1KD2 A; 4YU3 A; 4MQK B; 1NZ2 A; 1GCW B; 2ZLV A; 2ZT4 A; 109M A; 3MJP A; 2BMM A; 2FRI X; 4XS0 A; 1LFZ B; 3UHI A; 3OZU A; 2HBF B; 2BLH A; 1HCO A; 5D5R A; 3OO4 B; 2M6Z B; 1M6C A; 1MDN A; 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