The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
68
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLYKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Spectroscopic and Crystallographic Evidence for the Role of a Water-Containing H-Bond Network in Oxidase Activity of an Engineered Myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
68
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-12-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5JDO F; 1MOH A; 4HRT A; 1RVW B; 4SDH A; 3TM9 A; 1HBR B; 5F2A A; 2EB8 A; 1J3Y B; 1OR6 A; 1LFZ A; 1MNK A; 3K3U A; 3A59 A; 1O1P B; 2H8D B; 4YU3 B; 2Z6N B; 3S1I A; 4WJG A; 3DUT B; 1BBB B; 108M A; 3OO5 B; 3PI3 A; 1Y0A A; 3WCU C; 2NSS A; 1SPE A; 3WR1 B; 3ZOL A; 1DTM A; 3RJ6 A; 3PI9 B; 3GQR A; 2PEG A; 4DC8 A; 3D1A B; 1MNI A; 1ECD A; 1UT0 A; 3QJE B; 4L2M A; 3FS4 A; 1A01 A; 1Y2Z B; 4NS2 A; 1QPW B; 2RI4 A; 1LFT A; 1V75 A; 1DO4 A; 2NRL A; 1HBS B; 1YDZ A; 1LA6 B; 1ABY A; 2HHB B; 2PGH B; 3PT8 A; 1BIN A; 5ILP A; 5ILR A; 1J52 A; 1XZ4 A; 1J3Z B; 4ODC B; 2O5L X; 3WFT A; 1MYG A; 3UH6 A; 3OZW A; 1CH2 A; 1NIH A; 1LFL A; 2R4W A; 6HBW B; 1S56 A; 1HDS B; 1YHR A; 4AVD A; 2D5X B; 3CIU A; 1DXV B; 1BUW B; 1X9F A; 3PIA A; 1CG5 A; 2BWH A; 2IN4 A; 5CND A; 3BOM B; 2D2M C; 2R4X A; 3PT7 B; 1HBB B; 3NG6 A; 1V4X A; 2DXM B; 1O1N A; 1IT3 A; 2E2Y A; 1C40 A; 2GTL B; 3WCW B; 1Y5J A; 2DN2 A; 1ABW B; 2MGK A; 3IC0 A; 1PMB A; 1Z8U B; 2FRJ X; 1MWD A; 1XZU B; 1YHE B; 1Y8I A; 3ZJH A; 105M A; 1YEO A; 3QQQ A; 1BAB B; 1YIH A; 1Y31 B; 4NI0 A; 2GRH A; 1LFV B; 4ESA B; 1MYZ A; 1Y4R A; 1XZ7 A; 3PI8 B; 5HBI A; 3RGK A; 2MGC A; 2BNL A; 1A6N A; 3FH9 A; 3ZJS A; 1F63 A; 1Y83 A; 4PQ6 A; 3QM6 A; 1GLI A; 1YMA A; 1OUT A; 1DKE B; 5MBA A; 1HBG A; 3WCU B; 3HHB A; 1BZP A; 3ODQ B; 2QLS B; 1YE2 B; 4FWZ A; 1JF4 A; 2ZFB A; 4M4A B; 1CMY A; 2KSC A; 2VEE A; 1EWA A; 1V4U A; 1VXF A; 4PNJ A; 1Y85 B; 1FN3 A; 2MYE A; 1M9P B; 1URY A; 3QM5 A; 1KFR A; 1DTI A; 2EVK A; 1NPG A; 4MQC A; 1EMY A; 1X9F D; 4O1T A; 2D60 B; 1K0Y A; 1C7B B; 1XYE A; 3M3A A; 3QJB A; 1O1K A; 4WJG 1; 4UIQ A; 1JEB A; 3MJU B; 1QSI A; 1YVT A; 1RPS B; 4F4O A; 4MQG A; 3MJP B; 1Y46 B; 1MLL A; 3TLD A; 1COH A; 2LH1 A; 4O35 A; 4TWU A; 5EOH A; 3A5B A; 1YGD B; 1MNJ A; 1JZM A; 1J40 A; 1IBE A; 5EYS A; 1Y22 B; 3M39 A; 2D2M B; 1LTW A; 4N8T A; 1Y7Z B; 3PI4 A; 1CQX A; 4ROL B; 3E4N A; 2G0S A; 1CG8 A; 2BLI A; 1SHR B; 1GBV A; 3G4V A; 2EKU A; 1MLR A; 4N7N A; 3ZJR A; 1Y8W B; 5KDQ B; 1DWS A; 1MWB A; 1A0Z A; 1Y0C A; 1Y7G B; 2ZFO B; 3UHC A; 2O5B X; 1NQP A; 2W72 A; 1RSE A; 3HEO A; 2HBS A; 5JOM A; 2OH9 A; 1UVX A; 1MNH A; 2ZS0 A; 5C6Y A; 3ECZ A; 3UHR A; 1G08 B; 4ILZ A; 1XXT A; 1R1Y A; 3GKV B; 5CMV A; 3GQG A; 1YH9 B; 4O4Z A; 1FAW A; 2DN1 B; 4NK1 A; 5CN5 A; 2GRZ A; 1LH3 A; 1QXE A; 7HBI A; 1ECA A; 1YCB A; 3WCV D; 5EQM A; 2EKT A; 4TYX A; 2YRS B; 3ZJJ A; 2D2N C; 1LFY A; 2MGI A; 5JDO E; 3NFE B; 4F6G A; 3UHD A; 1C7D A; 2R1H A; 1CO9 A; 3WI8 A; 1LH2 A; 1YHU C; 3W4U B; 3M3B A; 1NPF A; 2W6V B; 3UHY A; 3TM3 A; 3GYS B; 5CNC A; 3ZH0 A; 3G4U A; 2OHA A; 1YGF B; 3MYM A; 1I3E A; 1MLH A; 2H35 B; 3CY5 A; 2HCO A; 1V07 A; 2HBF A; 4DWT A; 2HZ2 A; 1MKO A; 1O1J A; 1O1O A; 1L2K A; 1QXD A; 3B75 A; 1OFJ A; 2SPO A; 1S5Y B; 3HF4 B; 1YZI A; 5CNE A; 1Y09 A; 3QJC B; 1R1X A; 2V1G A; 5MBN A; 3BCQ B; 2ZT3 A; 3ARL A; 2FAL A; 3DHR B; 1RQ4 A; 2HBE A; 2JHO A; 3D17 B; 4GZG A; 3UHQ A; 1GBU A; 1ITH A; 1CIO A; 2DHB B; 2V1E A; 2C0K A; 2MGE A; 3LQD B; 3WFW A; 3VRF B; 3ORD A; 4N7P B; 1YVQ A; 3SDN A; 3UH7 A; 2ZLW A; 1S69 A; 3AT5 B; 3UHE A; 2HBG A; 2DN3 A; 4DWU A; 4PQC A; 4IT8 A; 3UHV A; 1DWR A; 1KD2 B; 1S5X A; 5JGG B; 1TES A; 1A6M A; 3SZK B; 3UHN A; 2R80 B; 1J41 A; 1J7S A; 3WCT D; 5HU6 B; 1IDR A; 1YEV B; 5KKK A; 3GOU B; 1FHJ A; 2AUQ A; 1BZ6 A; 2HBD A; 5AB8 A; 1FDH G; 5EUI B; 2VRY A; 3LR7 A; 2LH3 A; 1THB B; 4NXC A; 2H8D A; 2RAO A; 4YU3 A; 3UHG A; 2IG3 A; 5CN8 A; 3DUT A; 5E6E A; 1A0U B; 2HHD B; 3R5I B; 2VEB A; 4MXK A; 3OO5 A; 4U8U D; 2WTH A; 4KMV A; 5SW7 B; 1YEU B; 2B7H A; 2GL3 A; 1O1I A; 1HBA A; 1VWT B; 4KN3 A; 3UHI A; 1YHU B; 2OIF A; 3D1A A; 1TU9 A; 2GNW A; 4X0L B; 1Y2Z A; 1QPW A; 5EV5 A; 1YMC A; 1HGB B; 4F6F A; 1XZ5 B; 1HBS A; 1LA6 A; 3UGZ A; 3QJD B; 1MYJ A; 1HLB A; 3ZJL A; 1RQ3 B; 4ODC A; 3A0G A; 1EBC A; 2ZLT B; 1HAC B; 1JP8 A; 2G0R A; 3ZJO A; 3BJ3 B; 2ZLV B; 1IWH A; 1HGC B; 6HBW A; 4KJT A; 1BJE A; 1Y8K A; 1HGA B; 4MPM A; 2H8F A; 5CN7 A; 5F0B A; 1IOP A; 2G11 A; 1J7W B; 2D5Z B; 3VAU A; 2G10 A; 1A4F B; 2MGA A; 1T1N B; 5HAV A; 2O5M X; 3HRW A; 1HJT A; 1BVC A; 1HBB A; 1BZ1 B; 4N7O B; 4OOD A; 1JL7 A; 3LB3 A; 1DXT B; 4HHB A; 1MOB A; 1UX9 A; 2ZS1 D; 1G0B B; 2GTL A; 1SWM A; 3IA3 B; 4JAC A; 3WCW A; 4H2L B; 5CNF A; 1HAB A; 3NMM B; 4M4B B; 1Y0W B; 1AJ9 B; 1XZU A; 1A3O A; 1YHE A; 2ZT0 A; 1QI8 B; 1K1K A; 3LB4 A; 2ZS1 B; 4YU4 A; 2ZLX B; 3ZOM A; 1GDK A; 3IXF A; 1CO8 A; 4G51 B; 1EW6 A; 1C7C A; 1CH7 A; 1OJ6 A; 5E83 B; 102M A; 1BZZ B; 4ROM B; 1LFV A; 1JL6 A; 3S65 A; 4ESA A; 2EVP A; 3PI8 A; 1Y0D B; 3UHU A; 3AG0 A; 1WVP A; 4MQI B; 3WFU A; 1XZ2 A; 1S0H B; 5ILM A; 4MQJ B; 5E29 B; 3OVU C; 1GJN A; 2V1J A; 3M38 A; 2VYY A; 1SDL B; 3IC2 A; 4C0N A; 1DXD A; 1GDI A; 2ZSN A; 5HY8 B; 3EOK A; 1VRF A; 3A2G A; 5CN9 A; 2V1F A; 1YEN B; 1SPG B; 4HRR B; 1Y8H B; 3UHX A; 3DHT B; 2QSP B; 2VLX A; 3S1J A; 2W6W A; 2SPM A; 3HXN A; 4MQH B; 1RQA B; 1YEQ A; 1U7R A; 1YIE A; 1KR7 A; 1NXF A; 1Y7C B; 1Y4Q A; 3MVC A; 1UIW B; 2ZLU B; 4F69 A; 1HHO A; 2G0X A; 1GZX B; 5JDO D; 1CBM A; 4FC3 B; 1GCW B; 1RPS A; 1XZV B; 3MJP A; 1GCV B; 2LH7 A; 3AQ6 A; 1Y46 A; 2OLP A; 1NS9 B; 4B3W A; 1YGD A; 1NGK A; 1JZK A; 1Y22 A; 2ZFO C; 2D2M A; 4HRT B; 1DXU A; 1Y7Z A; 3MKB A; 1ECN A; 4ROL A; 1LFZ B; 3A59 B; 3ZJM A; 3ZJQ A; 1CLS B; 1V9Q A; 3HYU B; 3UHB A; 3K8B B; 3WCP A; 1MLN A; 1LJW A; 1JWN A; 5KDQ A; 2MYA A; 4UZV A; 1Y0A B; 1Y7G A; 1MLM A; 5ILE A; 2PEG B; 1SDK A; 3H58 A; 3PEL B; 1HBH A; 3BJ1 B; 2BLH A; 3FS4 B; 3P5Q B; 1A01 B; 2GDM A; 2RI4 B; 1LFT B; 3SDH A; 3UBC A; 1MBC A; 1Y35 A; 1J7Y B; 1ABY B; 1MTI A; 3WCV C; 3PT8 B; 1CH4 A; 4QAU A; 1DUO A; 2GNV A; 1XZ4 B; 1MBO A; 1YH9 A; 3LB1 A; 2LH2 A; 1GDJ A; 101M A; 1WMU A; 4XS0 A; 1MLK A; 1NIH B; 1LFL B; 1JW8 A; 3D4X A; 2FRK X; 1MNO A; 5C6E A; 3O89 A; 3D1K B; 1X9F B; 1NZ2 A; 4FH7 A; 1G9V A; 2BMM A; 3NG6 B; 1VXB A; 1HV4 A; 1HRM A; 1IRD B; 1V4X B; 3AT6 A; 2W6V A; 1Y5F A; 1O1N B; 1S6A A; 1UFJ A; 1Y5J B; 2XKG A; 1YGF A; 2H35 A; 3IC0 B; 112M A; 3BJ2 A; 1MYI A; 3H57 A; 1Y8I B; 2HHE A; 1HDB A; 1LFQ A; 1XY0 B; 4F6B A; 1W92 A; 2O5Q X; 3HF4 A; 2W72 C; 3ONZ B; 2R50 A; 1N9X A; 2VHB A; 2VYW A; 1O1L A; 3DHR A; 1Y4R B; 2MHB B; 3OZV A; 3PI2 A; 4G1B A; 1NWN A; 2QU0 A; 3FH9 B; 1Y83 B; 2G12 A; 3GQP A; 1M6M A; 3LQD A; 1WLA A; 3UHH A; 1OUT B; 3VRF A; 4PQB A; 2ZST A; 1Q1F A; 3HHB B; 1UVY A; 4VHB A; 3GDJ B; 1NZ5 A; 1G09 A; 3ZJP A; 1JZL A; 2ZFB B; 1FSX B; 1JP9 A; 3WCT C; 1CMY B; 1YG5 A; 1JP6 A; 1JY7 B; 2M6Z B; 1NEJ A; 1V4U B; 1FN3 B; 4FWX A; 1O1M A; 2R80 A; 1FLP A; 1N9H A; 3D7O A; 3VHB A; 4MQC B; 2MYD A; 1YFF B; 2V1H A; 3WCV B; 3E55 A; 3GOU A; 1Y5K A; 1K0Y B; 2ZSP A; 1XYE B; 1Y7D B; 3QJB B; 1DO3 A; 1O1K B; 1Y4G A; 1Y4P A; 1JEB B; 5EUI A; 3VRE B; 1QSI B; 2W31 A; 1YVT B; 4F4O B; 4MQG B; 3EDB A; 4MQK A; 1Y4B A; 2MGD A; 4U8U C; 3S66 B; 1COH B; 3NML A; 2D2N A; 1CP5 A; 2EF2 A; 2WTG A; 1IBE B; 2CMM A; 3KMF C; 3MYN A; 5SW7 A; 3G4R A; 1VWT A; 1SI4 A; 1YHU A; 4MBA A; 4UUR A; 1CG8 B; 1IRC A; 1YCA A; 1DXC A; 1OUU B; 1Y01 B; 2QMB B; 4FWY A; 1GBV B; 4N7N B; 1MOA A; 3OO4 B; 1A0Z B; 1Y0C B; 2BLJ M; 4F6D A; 1O16 A; 104M A; 3EU1 B; 1HGB A; 3QM7 A; 2ZS0 D; 1CH9 A; 1U7S A; 1Y45 A; 5CHQ A; 1QSH B; 1NAZ A; 1HCO B; 3NL7 A; 3QJD A; 2G3H A; 3OZU A; 2W72 B; 1RQ3 A; 2Z8A A; 2ZLT A; 2MGF A; 2EB9 A; 2MB5 A; 1PBX A; 3G4Q A; 3WTG A; 1Y0T B; 1N9F A; 1HGC A; 1V4W A; 1R1Y B; 1B86 B; 1YOH A; 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1VXG A; 2OH8 A; 1NZ4 A; 2HBD B; 3LB2 A; 2G14 A; 1BAB A; 1YE0 B; 2AUP A; 1Y31 A; 3WHM B; 1AJH A; 1CLS A; 2RAO B; 2ZT1 A; 3HYU A; 3K8B A; 1MLS A; 5E6E B; 1VXA A; 3PI1 A; 3AQ8 A; 2B7H B; 1O1I B; 1HBA B; 2Z6T A; 4HSW A; 2MYB A; 1ECO A; 1DKE A; 1HDA B; 3PEL A; 1CH5 A; 3WCU A; 3ODQ A; 3BJ1 A; 5CHR A; 1MOD A; 3P5Q A; 2XYK A; 2QLS A; 1YE2 A; 4M4A A; 1BZ0 B; 4MXL A; 2G0Z A; 5HLU A; 1UX8 A; 4NI1 B; 1MYF A; 1Y85 A; 1X9F C; 3OGB A; 1J7Y A; 3QZX A; 1M9P A; 3GKT A; 1Y4V B; 3GK9 A; 4H07 A; 1A9W A; 1G0A B; 3A0G B; 1MTJ A; 1N9I A; 2AA1 B; 2O5S X; 2D60 A; 2FRF A; 1C7B A; 111M A; 1IWH B; 1CPW A; 1Y8K B; 4WCH D; 4FH6 A; 2VLZ A; 3HEP A; 2H8F B; 3MJU A; 1RTE A; 3D1K A; 2GTL D; 1Y4F B; 2WY4 A; 4IRO B; 3WCW D; 106M A; 3HRW B; 1DO7 A; 5AZQ A; 1IRD A; 1F65 A; 4HHB B; 1MLO A; 1UFP A; 1ASH A; 2FRI X; 3G53 A; 1ABS A; 1HAB B; 3GLN A; 1MGN A; 1A3O B; 1SHR A; 1J3F A; 6HBI A; 1K1K B; 3V2Z A; 1XY0 A; 4YU4 B; 2ZSQ A; 1Y8W A; 2R4Y A; 1B0B A; 1FCS A; 1DUK A; 1C7C B; 3DR9 A; 3ONZ A; 3G4W A; 3ZJN A; 3QQR A; 2ZFO A; 3GQR B; 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