The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Refinement of Myoglobin and Cytochrome C
pubmed rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
65
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1988-01-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1COH B; 2GRZ A; 1A0Z B; 3K8B A; 3ZOM A; 2D2M D; 1MWB A; 103M A; 1C7B A; 1YEQ A; 3NL7 A; 1JWN A; 3ONZ A; 1HRM A; 5C6Y A; 1CLS B; 1Y01 B; 1HCO B; 3PI9 A; 2EF2 A; 1O1I B; 1YH9 B; 2C0K A; 3WR1 B; 1BBB B; 1MYT A; 1YG5 B; 3WCT A; 1DXU A; 2ZSX A; 5B84 A; 3BCQ B; 1D8U A; 1JZK A; 1MTK A; 1A00 B; 1MBN A; 3FS4 A; 1HDB B; 1Y4R B; 1G0A B; 1F63 A; 3QM6 A; 3EU1 B; 3PT8 A; 1UVY A; 2MGL A; 1NPG A; 1HDS B; 4WJG A; 1OUU B; 5CN7 A; 1Y8H A; 2EVP A; 1BZR A; 3A2G A; 1MYJ A; 3RJN B; 1VWT A; 2R1H B; 1ECD A; 1MTI A; 2LHB A; 1Y5K A; 3MJU B; 2RAO A; 2G12 A; 5CN6 A; 1CQX A; 2D2M C; 1YOI A; 1NPF A; 1DXV B; 2MGK A; 1IT3 A; 1Y4V A; 3QM7 A; 3E5I A; 1EW6 A; 1J40 B; 1G08 A; 1HBH A; 2HBG A; 1OFK A; 3QJB A; 1TES A; 110M A; 1S69 A; 1YZI A; 101M A; 3ZJL A; 1Y8I B; 2XKG A; 1XYE B; 1WMU A; 3OZU A; 4O2G A; 4ROM A; 1RQ3 B; 3ZOL A; 3UHK A; 3UHZ A; 3AQ9 A; 1HGA B; 3S48 C; 2ZLT A; 1YHR A; 5CMV A; 1S56 A; 2EB8 A; 2QMB A; 1R1X B; 1T1N A; 1YHU B; 1MNJ A; 3NMM B; 3QJE B; 3AQ6 A; 3GYS B; 1Y7C B; 2IG3 A; 1J41 A; 1LH7 A; 3EOK A; 4MQJ B; 2LH6 A; 5EYJ A; 1DO1 A; 1SPG A; 1MNK A; 1G09 A; 2H35 B; 1YEN A; 4XS0 B; 4DC7 A; 1Y0C A; 3K3U A; 1J3Z B; 3ARK A; 1YVQ A; 1MLH A; 4YU3 A; 1C7D B; 4B3W A; 3BA2 A; 4M4B B; 1MNH A; 1O1L B; 2GTL B; 1IRD B; 2AA1 A; 1R1Y B; 3ZJN A; 1YMA A; 4AVE A; 4IRO B; 3BJ3 B; 1JW8 A; 1IOP A; 1Y85 A; 1BIJ B; 4HHB B; 5CNB A; 1HBA A; 6HBW A; 4ZVA A; 4MQG B; 1YMB A; 2RI4 B; 1GCW A; 1Y4Q B; 1XZU A; 1GZX B; 3W4U A; 5JDO D; 1QI8 A; 2HZ3 A; 1NZ2 A; 2Z6T A; 3S65 B; 5KDQ A; 1Y5J B; 4OF9 A; 4U8U B; 5AB8 A; 3HXN B; 1DLY A; 1DWR A; 1HBS A; 1V75 A; 4NI0 A; 2KSC A; 1UX9 A; 1Y4B B; 1M6C A; 5CND A; 3R5I A; 2H8D B; 4XDI A; 1VXE A; 2R4W A; 1XZV B; 3LHB A; 1YEV A; 1XXT B; 1Y0T A; 1FHJ A; 5HLQ A; 3NG6 B; 4ZVB A; 4C0N A; 2HCO A; 3A5A A; 4M4A A; 3WCT D; 3WCW B; 5CN4 A; 1JY7 A; 5SW7 A; 3WFX A; 5M3S A; 1HDA B; 2AUQ A; 1KD2 A; 3QM5 A; 1RVW A; 1A3N A; 1F5O A; 5E29 A; 1A4F A; 3HRW A; 3WHM A; 1Y4P B; 3P5Q B; 2B7H B; 1C40 B; 5JDO C; 1AZI A; 2LH7 A; 1Y45 A; 3GDJ B; 3MOU A; 111M A; 4HBI A; 1FN3 A; 3E4N A; 1LJW A; 1FAW B; 3V2Z A; 1K1K B; 1IT2 A; 1Y31 A; 3VRE B; 106M A; 4MBN A; 1M6M A; 3UHR A; 3NML A; 1XZ7 A; 1YEU A; 1OBM A; 4ODC B; 3IC0 B; 2E2Y A; 2QFN A; 2PEG B; 1Y0D A; 3IXF A; 3GQP B; 1YOG A; 4F6B A; 2HBE B; 1Y46 B; 2MHB A; 3WCT C; 1LA6 A; 4KN3 A; 2W72 A; 3OO4 A; 2G0V A; 1V4U B; 2D60 B; 1YDZ A; 3G4U A; 2ZWJ A; 1RSE A; 1Y83 A; 1GLI B; 3ODQ B; 109M A; 1UC3 A; 3D1K B; 1O1N A; 1CP5 A; 2ZSR A; 3ORD A; 3VRG A; 1HBR B; 1CQ2 A; 1OR6 A; 5JGG A; 1DWS A; 5HAV A; 1X3K A; 1HGB A; 1HAB A; 3KMF A; 4ESA A; 1BZ0 B; 1CH9 A; 2MYC A; 1A6N A; 2D2M B; 2W6W A; 1LFL B; 3SZK A; 2Z6N A; 3ZJM A; 4TWU A; 1XQ5 B; 4NK1 A; 4MQK B; 2BW9 M; 2HBF A; 1OR4 A; 1BZ1 A; 1N9F A; 1N9X A; 1HLB A; 1B86 B; 1Y0A B; 1YGF A; 1LFZ B; 1MKO A; 4O1T A; 1RTE A; 1QSH B; 1YEO A; 2D5Z B; 2GDM A; 3ECZ A; 5ILE A; 1Y5F A; 2O58 X; 1VRF A; 4MQC A; 1CH7 A; 2PGH B; 3OZW A; 3D1A A; 2V1E A; 1OUT A; 3UHU A; 1O1P B; 1DO4 A; 4H2L B; 2OIF A; 4L7Y B; 2DHB B; 1MLJ A; 3UHY A; 2OHA A; 1MOH A; 2ZT0 A; 4F68 A; 3WCV D; 1Y8K A; 1J7S B; 4MQH B; 3ZJP A; 4F6J A; 2ZLV B; 4F6D A; 5EUI B; 1BVD A; 3OO5 A; 3IA3 B; 1A9W E; 3A59 A; 4IT8 A; 2HHB B; 1YHE A; 1H1X A; 1HHO A; 1O1M B; 1XZ5 A; 3A5B A; 3ZH0 A; 1LFV B; 2NSR A; 2DN2 B; 2W6V A; 1Y7D B; 3GKV A; 1V9Q A; 5C6E B; 1YE0 B; 1EMY A; 1LH5 A; 1URV A; 3BJ1 A; 3V2V A; 1YCB A; 3B75 A; 1NEJ B; 1GDJ A; 1Y7G A; 3MKB B; 2M6Z B; 1SDL B; 1HSY A; 1MCY A; 4F4O A; 1RPS A; 2ZLW B; 1F65 A; 2SPM A; 1BVC A; 2V1K A; 1JDO A; 3WCV C; 1G0B A; 1MWD A; 1A9W A; 3QM9 A; 1BZP A; 3GQG B; 1AJH A; 3MJP A; 3A0G A; 3PI8 B; 1JEB B; 4KJT A; 3VRF B; 5KKK A; 1V4X A; 1O16 A; 1MLS A; 1O1K B; 1ABW B; 2EB9 A; 4HRT B; 1BUW B; 1A0U A; 1UIW B; 3UH5 A; 1ITH A; 1Y4F B; 1HGC A; 4N7P B; 1SDK B; 3QQR A; 2QSS B; 4MQI B; 3S66 B; 1CIK A; 1GDI A; 2GKN A; 2ZLU B; 3WCP A; 1MBI A; 3PEL B; 1BJE A; 3FH9 B; 5HU6 A; 3G46 A; 2HHD B; 4MXL A; 2VM0 A; 2VLZ A; 3S1J A; 1S0H A; 4DC8 A; 1XZ2 A; 1LFQ A; 1MGN A; 2D5X B; 1NZ4 A; 2HBC A; 3NFE B; 4L2M A; 2QU0 A; 1THB A; 3K8B B; 2MYA A; 3QZX A; 1GCV A; 3QJC A; 1QPW A; 1C7B B; 4HSX A; 3NL7 B; 3ONZ B; 4GZG A; 1JPB A; 1VHB A; 2LH5 A; 3G4W A; 1IBE A; 3WTG A; 3PT7 A; 3PI9 B; 1A6G A; 1JL7 A; 4H0B A; 2AUO A; 3ZJJ A; 2QSP B; 1MYH A; 5EV5 A; 2G11 A; 4ROL A; 3MN0 A; 3WCT B; 1DXU B; 3HEN A; 1JF4 A; 1UX8 A; 2W72 C; 1RQA A; 1FCS A; 2Z8A A; 3A9M A; 1M9P A; 5HY8 A; 3PT8 B; 1Y0W A; 2MYE A; 2W6Y A; 2G10 A; 3O89 A; 1HLM A; 1Y8H B; 1YFF A; 1MLL A; 1IRC A; 1N9I A; 3H58 A; 2R50 A; 1VWT B; 3HYU A; 2FRF A; 1A01 A; 4UIQ A; 2VRY A; 3KMF C; 3LQD B; 2RAO B; 3UH7 A; 1HBB B; 1X46 A; 1MYG A; 7HBI A; 1OJ6 A; 3BCQ A; 1Y4V B; 2MB5 A; 1Q1F A; 1N9H A; 1A00 A; 1G08 B; 1HBH B; 1VXG A; 1W92 A; 4FC3 A; 1YZI B; 5F0B A; 3UHD A; 2VEB A; 2MGC A; 1WMU B; 1MNO A; 1VXA A; 1WVP A; 4ROM B; 3UH3 A; 1DKE A; 1MYZ A; 1JP9 A; 1YVT A; 5E6E A; 2ZLT B; 1YHR B; 2VEE A; 1PBX A; 2H8F B; 2SPO A; 2XKH A; 4WJG 1; 2QMB B; 3E5O A; 4KMW A; 1T1N B; 2LH2 A; 5AZQ A; 2ZS0 A; 1RQ4 A; 1C7C A; 2G0Z A; 3EOK B; 2GNW A; 4NXC A; 5JDO F; 1HAC A; 3UHS A; 1SPG B; 3QJD A; 1Y8I A; 1G09 B; 3D17 A; 3PI2 A; 4JYQ A; 1YEN B; 1Y0C B; 2EKU A; 1YVQ B; 1Y7Z A; 4YU3 B; 2FRI X; 3HHB A; 1AJ9 A; 3CY5 A; 1YMC A; 2AA1 B; 3MVC A; 1JF3 A; 104M A; 1YHU A; 3NMM A; 2CMM A; 2V1I A; 3GLN A; 2ZFO A; 1XCH A; 1CG5 A; 2QFK A; 2EVK A; 1Y85 B; 2DN3 A; 1A3O A; 4MQJ A; 1HBA B; 6HBW B; 5CHR A; 1DLW A; 3AT6 A; 1GCW B; 3TLD A; 1XZU B; 1J3Z A; 3W4U B; 4BJA A; 2LH3 A; 1QI8 B; 2D6C A; 4G51 A; 1O1O A; 1MBD A; 5KDQ B; 3G4R A; 1BIN A; 1NIH A; 1Y35 B; 1J3Y A; 1HBS B; 4NI0 B; 1Y22 A; 5AZR A; 3WCV A; 3R5I B; 4IRO A; 2O5L X; 102M A; 1LFT A; 4ILZ A; 5D1V A; 1YEV B; 2VYZ A; 1Y0T B; 1XY0 A; 2R4X A; 1DXC A; 1B0B A; 1FSX A; 1FHJ B; 107M A; 3GK9 A; 2QLS A; 1NQP B; 2OHB A; 3VAU A; 3DHR A; 2G14 A; 2HCO B; 1J7Y A; 3UHN A; 4M4A B; 4NI1 A; 4MPM A; 1S61 A; 1JY7 B; 5SW7 B; 1S5Y B; 1KD2 B; 4U8U A; 3GOU A; 1A3N B; 1RVW B; 5E29 B; 1A4F B; 3HRW B; 3IC2 A; 5MBN A; 3D7O A; 2HBD B; 2FAL A; 1UT0 A; 2ZSY A; 1JL6 A; 3K9Z A; 2NRM A; 1LJW B; 3M3A A; 4YU4 A; 5ILP A; 4JAC A; 4NZI A; 1LHT A; 1Y31 B; 3WI8 A; 4HRR B; 3OVU C; 5B85 A; 2SPL A; 1YE2 A; 5CN9 A; 2G0R A; 3M38 A; 2MGJ A; 3PI3 A; 1QXD A; 4VHB A; 5EE4 D; 1DWT A; 1MWC A; 3OJ1 A; 1XZ7 B; 1YEU B; 1LFY A; 2ZFB A; 1Y0D B; 1AJG A; 1Y4P A; 1O1J B; 1A6M A; 3GQR A; 2MHB B; 3TM3 A; 2VYY A; 1GBU A; 2W31 A; 2OLP A; 1LA6 B; 2DN1 A; 3OO4 B; 1YDZ B; 3ED9 A; 1MTJ A; 1NS9 B; 1A6K A; 1Z8U B; 1Y83 B; 1YGD B; 1Y8W A; 3HEO A; 3UGY A; 2BKM A; 1ABY A; 3G4Q A; 4X0L A; 1MLR A; 3MBA A; 1O1N B; 2ZS0 D; 2ZSP A; 3VRG B; 1UFP A; 1MLU A; 5JGG B; 1CMY A; 3ECL A; 5KER A; 1HGB B; 3G4Y A; 1HAB B; 1VXB A; 2NRL A; 112M A; 4ESA B; 2YRS A; 2ZLX A; 2Z85 A; 2R4Z A; 3SZK B; 2Z6N B; 1NGK A; 4F6I A; 2HBF B; 5EE4 C; 1BZ1 B; 3UI0 A; 2VLX A; 2ZST A; 1YHU D; 1YGF B; 3ODQ A; 1MKO B; 1YEO B; 3SDN A; 1GBV A; 1MNI A; 2ZFO D; 1Y09 B; 4FWX A; 1Y5F B; 1HBR A; 1MYM A; 4MQC B; 5IKS A; 2V1G A; 2SPN A; 3D1A B; 1UVX A; 1OUT B; 2WTG A; 1CBM A; 4OOD A; 1MZ0 A; 3G52 A; 2MGG A; 2MYD A; 5EQM A; 3UBV A; 2ZS0 C; 4MQK A; 3UHX A; 1I3E A; 2ZS1 A; 2DC3 A; 2BLH A; 1S5X A; 2ZT3 A; 3BJ2 A; 1Y8K B; 1EBT A; 3CIU A; 1HBI A; 3DUT A; 3WCU A; 1DM1 A; 5HBI A; 1K0Y B; 4FH6 A; 3OO5 B; 2BLJ M; 3A59 B; 1YHE B; 1HHO B; 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1YEQ B; 2GL3 A; 1FDH A; 1CO9 A; 1SI4 A; 1LH6 A; 1CH5 A; 1YIH A; 2GKM A; 4QAU A; 4ROL B; 1CH1 A; 1MDN A; 1NZ3 A; 1LTW A; 2D5X A; 1IWH A; 1RQA B; 1M9P B; 5JOM A; 5HY8 B; 3ZJS A; 4N7N A; 3UH6 A; 1Y0W B; 5ILM A; 3FS4 B; 1HV4 A; 1COH A; 1A0Z A; 1YFF B; 2R4Y A; 2ZS1 D; 4MXK A; 3LR9 A; 3HYU B; 1A01 B; 2FRJ X; 3WCU D; 2ZT4 A; 1CLS A; 1JZM A; 2QSP A; 1JP6 A; 1HCO A; 3WFT A; 3E55 A; 1O1I A; 1YH9 A; 1MOA A; 3UHQ A; 3ZJR A; 1DO3 A; 1Y5K B; 3WR1 A; 1BBB A; 1NZ5 A; 4AVD A; 1YG5 A; 4FC3 B; 1S6A A; 2BNL A; 4UUR A; 1MYI A; 2ZT1 A; 2GRH A; 4O35 A; 1J3F A; 1HDB A; 1DKE B; 3QJB B; 1Y4R A; 1G0A A; 3EU1 A; 4DWU A; 1HDS A; 1DTM A; 1YVT B; 5E6E B; 1OUU A; 1PBX B; 3QMA A; 2G3H A; 3LQD A; 2AV0 A; 4FH7 A; 2R1H A; 1HBB A; 4O4T A; 2ZS0 B; 1RQ4 B; 1C7C B; 3AQ5 A; 3MJU A; 4NS2 A; 2MBW A; 2ZS1 C; 1RTX A; 1HAC B; 1DXV A; 1GDK A; 3QJD B; 3D17 B; 1J41 B; 1J40 A; 3WCU C; 1XYE A; 1Y7Z B; 4TYX A; 2GRF A; 4PQ6 A; 3KUO A; 1RQ3 A; 3HHB B; 4LPI A; 1AJ9 B; 3CY5 B; 3AQ8 A; 4NXA A; 2H8F A; 4KMV A; 1IDR A; 4F6F A; 2NX0 A; 1HGA A; 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