The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Structure of the Human Hemoglobin Mutant Hb Providence (A-Gly-C:V1M; B,D:V1M,K82D; Ferrous, carbonmonoxy bound)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
57
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UC3 A; 2AA1 A; 1N9H A; 3B75 A; 1Y45 A; 1IBE B; 1V5H A; 1GCV A; 3HEP A; 4L7Y A; 3OZW A; 3FS4 B; 3ARL A; 3GQG A; 1G9V A; 3WI8 A; 1HBH B; 1G08 A; 1HLM A; 1HBR A; 5KER A; 1NPF A; 2H35 B; 3ASE A; 2GRH A; 2OH9 A; 3NL7 A; 1MZ0 A; 1FCS A; 2HHB B; 3OO4 B; 3WCP A; 3HRW B; 2DN2 B; 1S6A A; 5CN4 A; 2ZFB A; 3WCV C; 3H58 A; 1S0H B; 1MTJ A; 1LA6 B; 3MN0 A; 4XS0 B; 1UFJ A; 3QJD A; 3V2V A; 1DTM A; 2D2N A; 3M3B A; 2R4W A; 4B3W A; 3KUO A; 1C7B A; 3A5B A; 1Y7Z A; 2O58 X; 1DXD A; 2Z85 A; 1O1P A; 3UHE A; 2G11 A; 3CIU B; 5JDO F; 4UIQ A; 1J7Y A; 3GKV B; 1MLM A; 3S65 B; 2LH1 A; 1MLQ A; 1BIJ B; 3KUN A; 1CH2 A; 3LHB A; 3BOM B; 2LHB A; 4MPM A; 4HRR B; 1VXG A; 3GOU B; 2CMM A; 3R5I B; 2AUO A; 3HYU B; 109M A; 2ZFO B; 2G10 A; 3UH5 A; 2GRZ A; 2VRY A; 3WFX A; 2SPN A; 2AV3 A; 1MBC A; 3AG0 A; 1FDH G; 2HBD A; 4FC3 B; 1YEU A; 1ECO A; 2XKI A; 1HBB B; 1A00 B; 2RI4 B; 3UH6 A; 1MLF A; 1HBI A; 2HBC A; 2ZT4 A; 2DXM A; 5ILM A; 1BZ0 B; 2VYW A; 1MBI A; 4X0L B; 2G12 A; 1R1Y A; 1VXH A; 1YEN A; 3E4N A; 1JZK A; 1X9F D; 1CH9 A; 4U8U A; 1FSX A; 1HHO B; 3WCU B; 1LHT A; 4TWU A; 4FH7 A; 2LH3 A; 2D5X B; 1CG5 A; 1GZX B; 3AQ7 A; 1YFF A; 3PEL A; 4PQB A; 4MQH A; 4ROM A; 1VWT B; 5JDO C; 1Y8W B; 4DC8 A; 1LH3 A; 1JDO A; 1F5P A; 101M A; 1QSI A; 3FS4 A; 2ZS1 B; 3PT8 B; 1T1N B; 3D17 B; 4L2M A; 1Y0C B; 3DHR B; 2OH8 A; 1H97 A; 2ZSR A; 6HBW A; 1Y7D B; 2VEE A; 2HZ2 A; 2H35 A; 1GJN A; 1FAW B; 1LFT A; 3ZJI A; 1JEB B; 2HHB A; 3OO4 A; 2ZLW B; 3BCQ B; 3HRW A; 2MGC A; 2DN2 A; 1D8U A; 3G4Q A; 1Y2Z B; 1N9X A; 4M4B A; 5D1V A; 1MNH A; 3W4U A; 3WFW A; 1MLU A; 1DLW A; 3IC0 A; 4N8T B; 1DUO A; 2G0X A; 2ZLU B; 3S65 A; 1CO9 A; 3ZJL A; 5CNB A; 1YOG A; 2GL3 A; 2ZWJ A; 1J40 B; 1BZR A; 3AQ8 A; 2FAL A; 1C7C A; 1Y4Q A; 1YGF A; 1LFQ B; 4DC7 A; 1UVX A; 1BAB A; 3K8B A; 1U7S A; 4HRR A; 3GOU A; 1LFV B; 3EU1 B; 3RGK A; 1VXD A; 1NWN A; 1A4F B; 2DN1 B; 3WHM B; 4F6F A; 1YVT A; 2ZSZ A; 5E83 B; 4JYQ A; 2D2N C; 2E2Y A; 1YEQ A; 1O1K A; 4HBI A; 4IRO A; 1YVQ A; 3QZX A; 3UHG A; 1NWI A; 1AJ9 B; 3OO5 B; 1HBB A; 5E6E B; 2W6V A; 1OR6 A; 1WMU B; 2QFK A; 2O5O X; 1DO7 A; 3FH9 B; 2GNW A; 2ZSS A; 2ZT0 A; 3GDJ B; 1RQ3 B; 1YE0 B; 4HSX A; 1F65 A; 4X0L A; 1A9W E; 1Y5F A; 5ILP A; 1UX8 A; 1M6C A; 1SPG A; 4MXL A; 1GCW B; 1NEJ B; 2NX0 A; 1VXE A; 2MYA A; 1A01 B; 1VWT A; 3TLD A; 5C6E B; 1L2K A; 1Y0D A; 107M A; 1MTK A; 3D1K A; 1YZI A; 4WJG A; 1AZI A; 1DLY A; 1MOA A; 3VRE B; 1G09 B; 3D1A A; 1FSL A; 3E5O A; 3QJB B; 3M38 A; 3UHU A; 1BZ1 A; 1CO8 A; 1FAW A; 1QXD A; 1IDR A; 2QRW A; 1Y5J A; 5JOM A; 3ODQ A; 1WLA A; 1V75 A; 4MQC B; 5D5R A; 4MQI A; 1Y2Z A; 2EB8 A; 4U8U C; 4N7O A; 1MYT A; 2GTL B; 3ZJM A; 1G0A A; 1Y35 B; 1QXE A; 3WFU A; 4ESA B; 1YHR B; 3MYM A; 1QSH B; 3SZK A; 3WCW D; 1HRM A; 1XCH A; 1RVW B; 5MBN A; 3VRF B; 3IA3 B; 4MQG A; 2AA1 B; 1VXB A; 4MBN A; 1LHS A; 2ZS0 D; 3B75 B; 1MYZ A; 1Y45 B; 2EKU A; 3QM8 A; 4NK2 A; 4QAU A; 1GCV B; 4L7Y B; 1R1X A; 1OUU A; 3GQG B; 3GLN A; 1J7S B; 3EU1 A; 1G9V B; 2MGA A; 3ZJQ A; 3BA2 A; 4KMW A; 3A2G A; 3EDB A; 2MGI A; 1G08 B; 1HBR B; 1LH2 A; 5KER B; 3NL7 B; 5E83 A; 1V4X A; 1JL7 A; 3WCP B; 3BJ3 A; 1MNO A; 3M39 A; 4HHB B; 1MLR A; 2ZFB B; 1HSY A; 1GVH A; 4FH6 A; 1MLH A; 1AJ9 A; 2FRK X; 3HXN B; 1NQP A; 1O1L A; 5E6E A; 2GLN A; 3QM9 A; 3OGB A; 1MBD A; 1MLO A; 3WTG B; 1JF4 A; 1C7B B; 1CBM A; 1RQ3 A; 1YE0 A; 1Y7Z B; 4DWT A; 2V1I A; 1HDB A; 2ZLV B; 1O1P B; 2VEB A; 1MNJ A; 1GBU A; 1Y8I B; 1J7Y B; 104M A; 1MYG A; 1GCW A; 4VHB A; 2B7H B; 3EOK A; 1A01 A; 4MQJ B; 1JY7 B; 2G0Z A; 3LB4 A; 110M A; 2O5M X; 5C6E A; 1DO4 A; 3ZJH A; 1A6G A; 1MLN A; 3HEO A; 2ZSQ A; 2WTG A; 4UZV A; 3UHR A; 5CN5 A; 1NGK A; 3HC9 A; 3OZV A; 1MGN A; 1LH1 A; 1J3Y A; 2XKG A; 5KDQ A; 1BZ6 A; 4NK1 A; 5EOH A; 4ILZ A; 3QM6 A; 3ZOM A; 1YDZ B; 2O5Q X; 2HBD B; 5C6Y A; 3AQ9 A; 1HAB B; 1BBB A; 2W31 A; 2GTL A; 4HRT B; 4H07 A; 2D2M D; 5CND A; 1MWC A; 1HBS B; 1R1Y B; 4ESA A; 1YEN B; 1YHR A; 2R1H A; 4NI1 B; 2QFN A; 1HCO A; 2VM0 A; 4U8U B; 1FSX B; 2R4Y A; 4ZVB A; 2OLP A; 2H8D A; 1RVW A; 1YMB A; 4F4O A; 3VRF A; 1XZ5 A; 1YFF B; 2V1F A; 1UX9 A; 3PEL B; 4MQH B; 4ROM B; 1OR4 A; 1F63 A; 1PMB A; 3ONZ A; 1J3Z A; 1MLS A; 3MOU A; 5F0B A; 1OBM A; 3KMF A; 1QSI B; 5AB8 A; 1FHJ A; 3UGY A; 1NS6 A; 102M A; 1J7S A; 1A3N B; 4G1B A; 5AZQ A; 2V1K A; 1B86 A; 3G52 A; 6HBW B; 2VLX A; 3NMM A; 2O5L X; 4F6I A; 1YGD A; 3OVU C; 1LFT B; 1IWH A; 4O4Z A; 1MTI A; 1YHU A; 1UMO A; 1JL6 A; 1SDL A; 1NZ5 A; 2GDM A; 1V4U A; 1IRD B; 4HHB A; 1MYH A; 1Y31 A; 4M4B B; 2HCO A; 4F6B A; 1Y0W A; 2V1E A; 1O16 A; 2HHE A; 3HXN A; 4MU5 A; 1SHR A; 1MKO A; 3DR9 A; 3W4U B; 3WTG A; 3WCT D; 2BLH A; 4G51 B; 3UGZ A; 3A59 A; 1X9F B; 1SI4 B; 4MBA A; 2ZLV A; 3ORD A; 1HDS A; 3VRG A; 3IC0 B; 2MYD A; 3IXF A; 1Y8I A; 2WTH A; 4HSW A; 2B7H A; 3ZJS A; 1ECD A; 3EDA A; 1DXC A; 4ROL A; 1LFY A; 4MQJ A; 1JY7 A; 1C7C B; 1A6N A; 1Y4Q B; 1YGF B; 1Y4P A; 1HGA B; 2NSR A; 1BAB B; 1FLP A; 1BUW A; 1OUT B; 1QI8 B; 3K8B B; 2RAO A; 1Y0A A; 3NFE A; 1NZ2 A; 2ZSN A; 3PIA B; 1YVT B; 2VLZ A; 1K1K A; 1V4W B; 3NG6 A; 1YDZ A; 1YEQ B; 3ZJR A; 1Y7G A; 1O1K B; 3MBA A; 2MGE A; 1CQX A; 1K0Y A; 5EV5 A; 4IRO B; 1DO3 A; 1YVQ B; 3ECX A; 3QZZ A; 3DHT B; 5CN6 A; 1XQ5 B; 1XY0 A; 1HAB A; 103M A; 1MBN A; 1CPW A; 2W6V B; 4HRT A; 3HHB A; 1XZ2 A; 1Y4B A; 1NZ3 A; 1CH7 A; 1RTX A; 3M3A A; 2MGG A; 2R50 A; 4H2L A; 1HBS A; 1Y5F B; 4NI1 A; 1AJH A; 3VHB A; 1SPG B; 1LH5 A; 1CH3 A; 1RQA B; 3PT7 A; 3IC2 B; 1A9W A; 2QLS A; 3UHK A; 3MYN A; 4NS2 A; 1Y0D B; 3D1K B; 1VRE A; 1V07 A; 4PQC A; 3D7O B; 1A0Z A; 1MNI A; 1YZI B; 2GKN A; 3UH7 A; 1I3E A; 1A3N A; 2ZT2 A; 3D1A B; 1URV A; 1C40 B; 1BZ1 B; 2MHB B; 1RSE A; 1QXD B; 2GTL C; 1NPG A; 1Y5J B; 1YE2 B; 1O1I A; 3ODQ B; 1OFJ A; 1YEO B; 1V75 B; 1IRD A; 1DKE A; 1ABS A; 5HY8 A; 4NXC A; 1UVY A; 1GDJ A; 1Y8K A; 4MQI B; 4TWV A; 1O1O B; 2OIF A; 1URY A; 4KN3 A; 5ILE A; 4N7O B; 2ZFO D; 3UHS A; 4NI0 A; 1G0A B; 3G46 A; 1V9Q A; 1COH A; 4KJT A; 1Y4V A; 3OZU A; 1QXE B; 3R0G A; 4F6J A; 1DXU A; 2ZLT B; 1G0B A; 1C7D B; 1Y22 A; 4G51 A; 1YG5 A; 1ABY B; 1X9F A; 1SI4 A; 1S5Y B; 2MGM A; 1XYE A; 1WVP A; 3KMF C; 3SZK B; 4AVD A; 1Q1F A; 4MQG B; 2HHD A; 3UHN A; 4LPI A; 5EET A; 1CIO A; 1HGA A; 1VXF A; 4MQK A; 1YHU C; 1HLB A; 3ARK A; 2ZT1 A; 1R1X B; 1OUU B; 1OUT A; 1QI8 A; 106M A; 2GRF A; 1BZZ A; 3SDH A; 3WCU D; 1HAC B; 4AVE A; 3PIA A; 5EE4 D; 2DHB A; 1VHB A; 3AT5 A; 4BJA A; 1V4W A; 3P5Q A; 1V4X B; 2PGH B; 1THB B; 4O4T A; 1MOH A; 2D5Z A; 3BJ3 B; 2O5B X; 1VRF A; 2ZS1 D; 1SPE A; 1YMA A; 2AUP A; 3DHT A; 1XQ5 A; 1NQP B; 1O1L B; 1A0U A; 5F2A A; 3GK9 A; 1CLS B; 1FN3 A; 1X46 A; 4NXA A; 4FWY A; 2AUQ A; 111M A; 3UBV A; 1HDB B; 2O5T X; 2HBF B; 2ZSP A; 3WCW B; 1GBU B; 5MBA A; 5CHQ A; 1RQA A; 3EOK B; 3IC2 A; 4FWZ A; 1TU9 A; 1W92 A; 2HZ1 A; 1HV4 A; 3G4V A; 1MOB A; 2FRF A; 3D7O A; 1YOH A; 3WCV D; 3MVC A; 1NXF A; 2W72 B; 1Y83 B; 2BW9 M; 5EYS A; 3UHB A; 1MWB A; 1LFL B; 2G0R A; 1J3Y B; 5KDQ B; 1NIH B; 2G3H A; 1C40 A; 1IT2 A; 4SDH A; 2MHB A; 4WCH D; 2FRJ X; 1GDI A; 2ZSX A; 1YIE A; 4M4A A; 1YE2 A; 2M6Z A; 1X3K A; 1DWS A; 1YEO A; 1O1O A; 1LFZ A; 1BBB B; 5CN7 A; 1MOC A; 5CN8 A; 1JP9 A; 2ZSO A; 2HBS B; 1Y46 B; 3V2Z A; 1HGC A; 2ZLT A; 3MJP B; 1C7D A; 2MBW A; 2W6Y A; 3S48 C; 4C0N A; 2R80 A; 1ABY A; 1ITH A; 3G4Y A; 1S5Y A; 2R1H B; 1HCO B; 2D6C A; 2BKM A; 3PI9 B; 1GBV A; 5HLQ A; 2IG3 A; 2H8D B; 2ZT3 A; 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2FRI X; 3MJP A; 4H2L B; 2LH5 A; 2MGB A; 3A5G A; 3PI9 A; 3PT7 B; 1M9P B; 1O1M B; 2QLS B; 2YRS A; 2D2N D; 2QMB B; 1J3F A; 1Y4R B; 1B0B A; 1A3O A; 5JGG B; 1A0Z B; 1N9I A; 4C44 A; 1DM1 A; 2BK9 A; 3HEN A; 4PNJ A; 2LH2 A; 5IKS A; 1YHE A; 1HDA A; 3QJC B; 3ECZ A; 3BJ2 B; 3ZJJ A; 1LJW A; 1YCB A; 3QMA A; 1CIK A; 1RPS B; 4F69 A; 3O7N A; 2SPM A; 1O1I B; 1BZP A; 4N7N A; 1MBS A; 2DN3 A; 1DKE B; 1Y8H A; 1S56 A; 5HY8 B; 1DWT A; 3K9Z A; 1Y8K B; 2QU0 A; 5HBI A; 1GLI B; 4G1V A; 1BVD A; 5HLU A; 2PEG A; 1XZV A; 3A0G A; 4IT8 A; 1UIW A; 4NI0 B; 5E29 A; 5HU6 A; 1Y0T A; 3U3E A; 5AZR A; 3GQP B; 1COH B; 2D2M A; 1Y4V B; 1DXU B; 1G0B B; 1VXC A; 1Y22 B; 4YU4 A; 2VLY A; 1YG5 B; 2ZST A; 3GQR A; 1PBX A; 112M A; 1XYE B; 1Y09 B; 5HAV A; 3RJN B; 2HHD B; 3G53 A; 4KMV A; 1YIH A; 3PI8 A; 3UHI A; 3QM5 A; 3LQD B; 4MQK B; 2G14 A; 3CY5 A; 3GYS B; 1CQ2 A; 3ECL A; 4U8U D; 1BZZ B; 1S61 A; 1EW6 A; 1XZ4 B; 1YMC A; 1Y5K A; 5EUI A; 2DHB B; 2QSS B; 3AT5 B; 1LH6 A; 5CHR A; 3NML A; 3P5Q B; 2NRL A; 3S66 A; 5JDO E; 2D5Z B; 4OOD A; 5CNC A; 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