The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
50
|
structure length |
50
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Chain Sequence |
DEAQFKECYDTCHKECSDKGNGFTFCEMKCDTDCSVKDVKEKLENYKPKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
|
| molecule keywords |
Pollen allergen Ole e 6
|
| publication title |
NMR Solution Structure of Ole e 6, a Major Allergen from Olive Tree Pollen.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Olea europaea
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| total genus |
14
|
| structure length |
50
|
| sequence length |
50
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF09253 | Ole-e-6 | Pollen allergen ole e 6 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Pollen allergen ole e 6 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SS3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y67 A; 3BAA A; 2OIE A; 3AK2 A; 4B3T O; 1DLB A; 2Q73 A; 1ZSP A; 2WLL B; 3RYC A; 4H0L B; 1GMG A; 3CWB H; 2YI8 A; 1L8D A; 4UV9 A; 4KHP B; 3TET A; 1OJH A; 3U11 A; 4B3T B; 4I0X A; 3G67 A; 2YUA A; 3LDD A; 3CSX A; 4QJF B; 4NVP A; 1QU7 A; 1US6 A; 4UFZ A; 3J80 N; 1NR7 A; 3H1I H; 5JVD A; 2DJV A; 4O2B B; 1KC8 W; 3MHS C; 3E35 A; 4JI4 O; 4DV1 B; 3KCX A; 4RQF A; 1K4C C; 2PYL A; 1B6Q A; 2ETN A; 2DWD C; 3G6E V; 1WA8 B; 4JI4 B; 1AJP A; 1Q6I A; 1ARO P; 2V7Q G; 1OV9 A; 1X4T A; 4Q6G A; 4NTY A; 2OCC B; 2DMX A; 4LNU B; 5B1A B; 1M9N A; 1TUE B; 4H44 B; 1MMM A; 4ABM A; 2P90 A; 1QVG U; 3A0H Z; 3C90 A; 3RT3 C; 1SES A; 3C3S A; 5J2U A; 1N0N A; 5JCO C; 1BT8 A; 1TVK B; 2OYQ A; 3BHP A; 4GUN A; 3N2G B; 4LF9 O; 4N21 A; 4X1I A; 2F1M A; 2QKS A; 3JAW A; 1JFF B; 1V54 C; 4JI8 B; 4MTF A; 1GTO A; 3B2E E; 2YXL A; 3QVN A; 2AHZ A; 3NR7 A; 2K1E A; 1IBM B; 1RPO A; 2N74 A; 1XNQ O; 5D5P A; 1S72 V; 4TUY B; 1K73 W; 4YHH O; 1YSC A; 1OCR B; 1MZE A; 2JVD A; 1XNQ B; 2IU3 A; 3HKC B; 1OZ0 A; 2ZKO A; 2LO1 A; 4YHH B; 1U97 A; 1TAE A; 4DRX A; 2WLH A; 1XEQ A; 2H3O A; 4G27 B; 1WJZ A; 1VF6 A; 5KUK A; 4IHJ A; 2CGN A; 2P22 C; 1NTZ H; 1PL4 A; 3JD3 A; 3SPH A; 5LMU O; 5KA6 A; 3T1Y B; 1NKD A; 1XOU A; 1GN4 A; 1GRJ A; 4NB5 A; 1WAZ A; 4MW3 A; 4X62 O; 5LMU B; 3K59 A; 4DXW A; 2AXT Z; 3GWO A; 2JJ2 G; 2DQ0 A; 3OGC C; 1UJW B; 5LMN O; 3EVK A; 2JS5 A; 4JGS A; 1NI8 A; 1BGY H; 3CJH A; 4ZI7 B; 4DV6 O; 2LP7 A; 1FFT B; 3HKB A; 5LMN B; 4FMT A; 1S77 D; 3G6B A; 5KHH A; 5LGT A; 5L3D A; 4DV6 B; 2ZE8 A; 4DUY O; 4I0X B; 1PD3 A; 3F7Y C; 4F6R A; 5EZY A; 1I5X A; 1XNR B; 1D5N A; 1CPY A; 1QQC A; 1VP7 A; 3AK3 A; 4E2L A; 4YIP A; 4DV4 B; 5JVD B; 1S5H C; 3CPW U; 2N04 A; 1M1K W; 3W7W A; 4DR5 O; 2Z5U A; 2B9Z A; 3FB8 C; 3SPG A; 1K9M W; 2QM4 A; 5GON A; 3L72 H; 3CYO A; 1YCI A; 4DR5 B; 4CS3 A; 1G6U A; 1TGO A; 1PM9 A; 2N05 A; 5KHG A; 2DOS A; 4WFA V; 1H2L A; 3H1K H; 5JJN B; 4X20 A; 3RVY A; 2ZXW B; 4NXN B; 4LC1 A; 1MA1 A; 4EEQ A; 4QNH B; 2D2C B; 4JI3 B; 1ZX3 A; 2EIK B; 5J2U B; 4DV0 B; 4WFF A; 5DM6 V; 3CXC U; 3SJC C; 3ZN0 A; 4K0K O; 3ABT A; 4JYC A; 1VQL V; 1M5I A; 4FJC C; 3NXS A; 2VS0 A; 4LFB B; 4X1I B; 3JAW B; 3APO A; 4K0K B; 3SYP A; 1K3E A; 1M56 B; 4J7K A; 1ENV A; 2ZD9 A; 1IXB A; 3STZ C; 5LP6 A; 4QIW F; 4I50 A; 1T5E A; 2HP8 A; 4CH4 A; 4BW9 A; 4FZ1 A; 5KA5 A; 2YDE A; 2YI9 A; 2UXC O; 4DR6 O; 3P3N A; 1EN6 A; 1FXK A; 4X65 O; 1IXM A; 3E8F A; 2YSU B; 3ASN B; 1S3J A; 4DR6 B; 2CH7 A; 4DRX B; 2Q6A A; 2UXB O; 3G80 A; 4IHJ B; 2DYS C; 3MAQ A; 4GZR B; 3OW2 U; 2IH1 C; 2AZ0 A; 5KHI A; 1PL0 A; 3LSS A; 5LYJ A; 4UB8 Z; 2JS3 A; 3AEI A; 3JSN A; 5IWA O; 3EHB B; 2HVJ C; 1G4Y B; 2WLJ A; 4PV1 B; 4J80 A; 3BA8 A; 4HNA A; 5IWA B; 1DF5 A; 4GX1 A; 4CBC A; 1GO3 F; 3K9S A; 3HB3 B; 5H9C A; 1DTO A; 2FB5 A; 1SQX H; 3TCU A; 3OMA B; 3SPJ A; 3OMI B; 1VQ9 V; 4D7T A; 1N33 O; 4BWA A; 1D2D A; 4B3M O; 3CJH B; 1HNZ O; 2B5U A; 3ZRX A; 3SYA A; 2EIM B; 3E86 A; 2IBZ H; 1N33 B; 1N0J A; 2ZIM A; 4JI5 O; 3MD0 A; 1YJ9 V; 1HNZ B; 4PDR A; 4F6R B; 1Q7Y W; 3W7S A; 1JPX A; 5EZY B; 1QLE C; 4JI5 B; 3M7M X; 2M7W A; 3SYO A; 5BR8 B; 3WU2 Z; 2F95 B; 5EIB C; 3CX5 F; 2A06 H; 2EUL A; 3IJ4 A; 2Y4T A; 4UB6 Z; 1YXB A; 3JSL A; 3OFN G; 4LH6 A; 3ZCC A; 1V9P A; 4QE7 A; 5GON B; 2AW9 A; 3L71 H; 4YJ2 A; 2PUS A; 5FNV A; 4PI0 A; 5JH7 A; 2YID A; 3CME V; 1KB9 F; 4KFM A; 1AVM A; 4DR2 O; 4O4I B; 4X20 B; 1OCZ B; 2IH3 C; 4XDK A; 5DEC A; 2Q7E A; 4DR3 O; 1Q81 W; 2QWN B; 4DR2 B; 4I5S A; 1EM1 A; 2W6J G; 3CRM A; 5LHH A; 1WP7 A; 4UCV A; 3FFQ A; 4RUE A; 1Y74 B; 2XOK G; 3T2M A; 2EIL C; 2E76 B; 3ZRS A; 3D3I A; 5K1P A; 3OUF A; 2P4V A; 2LW1 A; 1Q82 W; 5KMG A; 1DF4 A; 1HNW O; 5LP6 B; 1G1X B; 4I50 B; 3AG3 C; 3THO A; 2F4V B; 2QSA A; 5BMV A; 4FVM A; 1FAF A; 1EFR G; 3F5T A; 3AG1 B; 1FXK B; 4BAY A; 2CTR A; 4Q20 A; 1LR1 A; 5EBW C; 3AG2 B; 4BIU A; 2ZE7 A; 2CH7 B; 2XAJ A; 1JCH A; 5A2Q N; 4ZOL A; 2YXH A; 4DV5 O; 3CD6 V; 4LH7 A; 4HBN A; 1OCC B; 3SDL A; 4DV5 B; 5LYJ B; 5IDJ A; 1ZUQ A; 4LF5 B; 1R6N A; 2DWE C; 5FPR A; 1EN4 A; 2ITC C; 2QTS A; 4PA6 A; 4TOI A; 2FL4 A; 4RUF A; 1QBZ A; 4X1K A; 3FD9 A; 2X6B A; 1BL8 A; 2XAQ A; 4NTW A; 3CHX A; 5IJ9 B; 2F23 A; 4H13 B; 1PKX A; 5GW7 A; 4DV1 O; 2Q7G A; 2QWP B; 1JVM A; 2LW7 A; 4U7O A; 3VQV A; 1MOF A; 2JEX A; 3ZMS A; 4DV7 O; 3B09 A; 1AP6 A; 4DYL A; 4EFB A; 1IZ3 A; 4IIJ A; 4JTD B; 3GB7 C; 5B1O A; 4FFK A; 2ZDI C; 2KKW A; 3F7V C; 3JCZ A; 1K8A W; 3FB5 C; 4DV7 B; 2QEX V; 4LP8 A; 1G8M A; 2ZM6 O; 1KP3 A; 5EC1 C; 4JAU A; 1IVS A; 1CEZ A; 4CS2 A; 3W7X A; 2NR5 A; 2Q4P A; 2ZM6 B; 1O9H A; 5BY1 A; 2O57 A; 3SYQ A; 4WBN A; 2PF4 E; 1FYJ A; 2YIA A; 3Q4H A; 5EYP A; 4YJ2 B; 1KKC A; 1EZV H; 2QDO A; 3L73 H; 5FNV B; 3TGU H; 5JH7 B; 1YHQ V; 3AK1 A; 4Z2W A; 3OGI B; 2LGW A; 2X0L A; 1SQV H; 3D36 C; 4JYY A; 2CTQ A; 1RM1 C; 1ZLZ A; 3M8A A; 4N23 A; 2WLK A; 3E8G A; 1AIL A; 2JGU A; 2AGA A; 4J9Z B; 4L87 A; 1MSD A; 4GX0 A; 3BPZ A; 4O4H B; 3P3P A; 4JZ2 A; 3A2F A; 2DYR B; 2YEV A; 3H1L H; 1AR5 A; 3QF7 A; 4XDL A; 2JJ1 G; 1JQ0 A; 5KMG B; 4CZZ A; 3I56 V; 1NS1 A; 2ZQM A; 3OTF A; 1S0V A; 1YEW A; 2XAG A; 3K5L A; 4JV5 O; 2DE0 X; 3JD1 A; 2P6J A; 2QJ1 A; 2A79 B; 4X9Q A; 5BMV B; 4JV5 B; 4JPR A; 4MVU A; 1XMQ O; 1J95 A; 2PYJ A; 2RCV A; 4FK5 C; 2L6L A; 4O4J A; 4QE9 A; 4O4L A; 5IY5 B; 3PN1 A; 1JX9 A; 1XMQ B; 3ZN1 A; 4JI6 O; 4ZOL B; 5L3E A; 4WF9 V; 2GTA A; 2BOC C; 4JI6 B; 3DXR A; 2JRI A; 1KU9 A; 1NTM H; 1E79 G; 1J5E O; 2EIN C; 3ABM C; 3CS5 A; 5KHJ A; 2ZIO A; 5IT9 N; 3QG5 A; 2PI5 A; 1HWY A; 1SKV A; 3B40 A; 4UV8 A; 2CAZ C; 1JA8 A; 2KSD A; 2ZE5 A; 1HNX O; 4XBF A; 1AR1 B; 4X1K B; 1BMF G; 2LFS A; 2A9H A; 1GN6 A; 2V1D A; 3VQY A; 2KB1 A; 1V55 C; 1HNX B; 2R9A A; 3ZHQ A; 5KAI Z; 2CUG A; 4WCE V; 4J41 A; 4MVO A; 4RO2 A; 3ZJZ A; 2QTO A; 3ABK C; 4JI1 O; 4ZIB A; 4ZKI A; 2ARH A; 4LFA O; 1RP3 B; 4IIJ B; 4TV9 A; 2P7T C; 2A3Q A; 2Y0I A; 3N27 A; 4LFA B; 3CRQ A; 2NLJ C; 3GVM A; 4K3A A; 4YJ3 A; 2PY5 A; 1AB3 A; 3X2Q B; 1N36 O; 3RVZ A; 3Q4H B; 3ZHR A; 1I94 O; 5EYP B; 3CB2 A; 3ABL B; 5KLV H; 4LF8 O; 4JI0 O; 3OEH G; 1BZK A; 1N36 B; 1BE3 H; 1QNM A; 3ZED A; 1AJQ A; 3E8H A; 4OXS A; 4LF8 B; 4JI0 B; 1SQB H; 4P2Z A; 1K5S A; 1VF7 A; 4EB6 A; 5JJJ B; 4LF9 B; 3CMA V; 4AIL C; 3JD0 A; 3K5O A; 2JK5 C; 4GLX A; 2YEV B; 3B4S A; 2IW5 A; 1N8R W; 1FPO A; 3G71 V; 1PNM A; 4DW0 A; 1AR4 A; 1XIL A; 1FXH A; 3AG4 B; 3WB2 A; 2P67 A; 5EBL C; 1VQP V; 3K0D A; 4LBE C; 4K8X A; 1SA0 A; 1TA8 A; 4PA9 A; 4TV8 A; 3UT5 A; 2BTQ B; 4CH6 A; 3FAV A; 3A8T A; 1L0N H; 4X1Y A; 4RAI A; 4O4J B; 2FKX A; 4O4L B; 1XUQ A; 1F7Y A; 4FFB A; 1ZTE A; 4KXR A; 4DR1 O; 3BEH A; 5B1N A; 4CC6 A; 1CP9 A; 4MT8 A; 1NH2 D; 2ITD C; 1NQT A; 4DR1 B; 4UCO A; 4X62 B; 4YXW G; 5J9P C; 3DXR B; 4X66 O; 1FJG O; 2ATK C; 1H38 A; 3J81 N; 1V54 B; 4MS2 A; 3RGB A; 4X66 B; 1FJG B; 4UCT A; 4MTG A; 4W4K A; 3UCS C; 3RYC B; 4I9Q A; 2PI4 A; 2YIC A; 5JJE B; 2IJH A; 4LR3 A; 4LF4 O; 3L75 H; 2GSM B; 1SQP H; 4GX2 A; 3EFF K; 1W2B U; 2RMK B; 1OCO C; 5B3S C; 4AQY O; 4LF4 B; 4DUY B; 3DC5 A; 2IJI A; 1B04 A; 4PA4 A; 4HAM A; 2Y4U A; 5LBQ A; 2A0L A; 4AQY B; 1M56 C; 1VQ6 V; 1E1R G; 1GM7 A; 1VMG A; 2W0F C; 4GCZ A; 3B8N A; 5KHK A; 1P7B A; 1ZAU A; 4TV9 B; 4MW8 A; 2UUC O; 4FLT A; 3JAT A; 4BR6 A; 5KUM A; 3SPC A; 4JZG A; 3ETG A; 3MHH C; 4PDM A; 1GM9 A; 2UUC B; 3OUS A; 5K1X A; 3OD4 A; 2PZS A; 1S76 D; 4YJ3 B; 1NH2 B; 3ASN C; 1IBK O; 2EIJ C; 3IFX A; 1Z5V A; 4TT3 G; 4TQF A; 1Q6H A; 2CDY A; 1IBK B; 4P30 A; 3E8B A; 3D3Q A; 1IBL O; 3VQW A; 3IC9 A; 1XL4 A; 1FXV A; 2B1G A; 1P4R A; 5B66 Z; 1I0H A; 4B3R O; 4NXM O; 2ILM A; 1IBL B; 1UFI A; 4C7U A; 1GN3 A; 3ZHS A; 5E1A C; 4B3R B; 2ZR3 A; 1K34 A; 4UVA A; 5L3F A; 2UXX A; 1ORQ C; 4DR7 O; 4QPK A; 5FLX N; 1NTK H; 4RWU A; 3N2K A; 4Z1M G; 1YVW A; 4DR7 B; 2UXC B; 1XBL A; 1QCE A; 2L35 A; 3K5N A; 2WWW A; 1W0K G; 1YTF D; 1TUB A; 3K5M A; 1WNS A; 1RFY A; 1SF9 A; 1SA0 B; 1COW G; 1M57 C; 4IGG A; 2UXB B; 4TV8 B; 3UT5 B; 2W6I G; 3HKE A; 3FAV B; 1VAR A; 1GK9 A; 4X1Y B; 1WB8 A; 3VBB A; 3O65 A; 2QE7 G; 4DV2 O; 2HG5 C; 3QTC A; 3U0Z A; 2CE4 A; 4CH3 A; 3C3T A; 2KG7 A; 4IT5 A; 4PHZ A; 2QGN A; 1MSW D; 4DK1 A; 3K9A A; 1GAX A; 1Q6U A; 1ZL8 A; 2X6A A; 3QO5 A; 1S5L Z; 1VQN V; 1Y4M A; 1XDC A; 3OE7 G; 3E83 A; 3WB0 A; 3JAR A; 3CCR V; 4FM1 A; 3HKB B; 5LL6 Y; 1R3L C; 3ZIA G; 4P9O A; 4WFB V; 4B3M B; 1JJO A; 1B3Q A; 4UCU A; 3TXS A; 1QVF U; 2ZCE A; 1BHA A; 3ASO B; 3RBZ A; 5LGN A; 3I55 V; 1BQ0 A; 3D8C A; 4K8Z A; 3E2E A; 1AJN A; 1B06 A; 1H2N A; 4ZHQ A; 1SER A; 2PTM A; 1FFX A; 2RN9 A; 1YTF B; 3CE2 A; 3RWR D; 2Q67 A; 1DGS A; 3CCJ V; 4TQD A; 1LNQ A; 1W0J G; 3JAT B; 2AHY A; 4EKW A; 4I9W A; 2RQ6 A; 2RNB A; 3AG1 C; 3ZS8 C; 3U10 A; 4DV3 O; 1N34 O; 4B7K A; 3B77 A; 2XND G; 5LGU A; 1K7D A; 1N34 B; 5FPO A; 4DR3 B; 5HFL A; 1IUR A; 3RYF A; 1OCC C; 2Y69 C; 1A32 A; 4JYB A; 5GTH Z; 4U3F H; 3H1H H; 3RW0 A; 1SET A; 3RYI A; 1K4D C; 1HW7 A; 4WFG A; 2HHH O; 4KL1 A; 4MSW C; 2R9I A; 2ZDI A; 4HZ3 A; 4CC5 A; 3P32 A; 3PJS K; 4FM0 A; 1QLE B; 1AI4 A; 1HNW B; 4RQE A; 5CN0 A; 5KAF Z; 1VIB A; 1R3J C; 1SQQ H; 2JDI G; 3N2K B; 1QR8 A; 4JI2 O; 1K5Q A; 2C2A A; 3H01 A; 4PA3 A; 2D3O W; 4PDV A; 1R6K A; 5E79 Z; 5H6R A; 4IL6 Z; 1TUB B; 3D36 A; 1LUV A; 1R6T A; 3UQ8 A; 1W59 A; 3LSQ A; 4IYI A; 3H1J H; 4QPJ A; 5EBM C; 2CK3 G; 3HKE B; 1NJI W; 3A0B Z; 1F4N A; 4I55 A; 3RFR A; 1OHH G; 4FLV A; 3CCE V; 1JMK C; 3T4Z A; 4HNA B; 4R7C A; 1JR9 A; 2KG7 B; 1U96 A; 4FZ0 A; 3L9D A; 3OR7 C; 1AP5 A; 1ZL8 B; 3OTO O; 3RN4 A; 1WLE A; 1H2S B; 2WPD G; 3JAR B; 1URF A; 1GH6 A; 1MAB G; 1Y76 A; 4BIZ A; 2G38 A; 3WG7 C; 2WLM A; 3AG3 B; 3ZX6 A; 5IJ0 A; 3SJA C; 4L8J A; 1F51 A; 4O2A A; 3QNE A; 4X65 B; 5GTI Z; 1H8H G; 2HFE C; 1PV0 A; 1Q8I A; 3MDS A; 4ZHQ B; 5L3G A; 1YIJ V; 1NR1 A; 4MVM A; 1FFX B; 2R72 A; 2IM9 A; 3ETQ A; 4UCS A; 2LFR A; 2GBO A; 1GM8 A; 4JI7 O; 5LOV A; 3WB1 A; 4DO2 A; 1YJW V; 4GKJ O; 1NBM G; 4WFE A; 4KUM A; 4PI2 A; 3CCU V; 3IC7 A; 4LNU A; 4GKJ B; 5LHG A; 4OPH A; 2BE3 A; 1WP8 A; 3APQ A; 1RSO A; 4OPA A; 4FLY A; 3DC6 A; 5IE9 A; 2P5O A; 2VQF O; 1H2G A; 2QWQ B; 1SC5 B; 5B1B B; 1EZJ A; 4JAA A; 1H8E G; 4TSF G; 4X88 A; 2VQF B; 3RYF B; 2MK3 A; 4MVS A; 3RYI B; 5CA0 A; 3T4D A; 3G4S V; 2MW2 B; 5JWP A; 1NVP D; 4F6E A; 2CTP A; 4D6T H; 2OIG A; 1JJ2 U; 2E74 B; 3ZMT A; 2YS8 A; 1VEW A; 3TXQ A; 1HR0 O; 4X8A A; 4MTO A; 4NR1 A; 1WB7 A; 1P49 A; 1YDX A; 1ZWI C; 1D5A A; 1HDJ A; 1PNK A; 1BQZ A; 4ASU G; 1K97 A; 3M99 B; 3LDE A; 1AI7 A; 1BSM A; 1KUQ A; 4K35 A; 5JCO A; 3F5W C; 4YY3 O; 1EBO A; 2OTL V; 2OCH A; 3BFR A; 2OCC C; 1RM1 B; 4YY3 B; 3SPI A; 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