The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVQRLLEFLI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| publication title |
Crucial points within the pore as determinants of K+ channel conductance and gating
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
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| total genus |
30
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-03-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4GX1 A; 5J9P C; 4LBE C; 4G28 B; 3OUS A; 2X6C A; 4PA6 A; 1OCC C; 2ITC C; 3ABM C; 3GB7 C; 4LP8 A; 2DYR C; 3T2M A; 3VOU A; 4DXW A; 1R3I C; 2HG5 C; 4QNH B; 4RO2 A; 2Y69 C; 3SYA A; 2QKS A; 4J9Y B; 5EK0 A; 2JK5 C; 4X88 A; 1S5H C; 3E86 A; 4PA3 A; 4GX5 A; 4PA7 A; 5EC2 C; 1K4C C; 1M56 C; 2WLI A; 3E8G A; 3STL C; 1OCR C; 3HPL C; 3R65 A; 4MTG A; 4ZBM A; 4UUJ C; 3SJQ C; 3K04 A; 2A79 B; 4MTF A; 4OXS A; 3ABK C; 2HVJ C; 4G27 B; 5CBG A; 2WLL B; 3ZJZ A; 3K08 A; 2DWD C; 3IFX A; 3K0G A; 3OR7 C; 4GX0 A; 4KFM A; 4WFE A; 2Q67 A; 5EBM C; 5CBF A; 2K1E A; 3SPG A; 1XL6 A; 4MVS A; 4MVR A; 4JTD B; 4WFH A; 3FB6 C; 5KUM A; 3SPJ A; 1LNQ A; 1P7B A; 3LDE A; 4JTC B; 4CBC A; 2WLN A; 4MVZ A; 2HFE C; 4PDR A; 3T4D A; 3IGA C; 4QE9 A; 2Q6A A; 4MVM A; 4HZ3 A; 4PA9 A; 2A9H A; 4I9W A; 2YEV A; 1K4D C; 2EIL C; 2AHY A; 3WG7 C; 1V55 C; 4H33 A; 1JVM A; 2EIJ C; 3ABL C; 3SYO A; 3X2Q C; 3TET A; 3F5W C; 3OGC C; 2IH3 C; 5E1A C; 4MS2 A; 1R3K C; 4XDJ A; 3BEH A; 4PDL A; 3T1C A; 2HVK C; 4XDL A; 2EIK C; 3RVZ A; 2W0F C; 2ZD9 A; 4P2Z A; 4XDK A; 2EIM C; 3AG1 C; 4MTO A; 2P7T C; 3SYQ A; 4JTA B; 4QE7 A; 1G4Y B; 1J95 A; 2WLL A; 2WLJ A; 4MVU A; 2ATK C; 4PA4 A; 3JYC A; 3F7Y C; 4R6Z A; 3SYC A; 1R3J C; 2DYS C; 5B1B C; 2X6A A; 3LDD A; 1ORQ C; 1OCO C; 3EFF K; 2AHZ A; 4P9O A; 3LUT B; 1R3L C; 4MVO A; 5EBW C; 1QLE C; 3STZ C; 4P30 A; 2QTO A; 3LDC A; 4WFF A; 3FB7 C; 3T4Z A; 4MW8 A; 5IY5 C; 3RBZ A; 5B1A C; 2A0L A; 4MW3 A; 3RW0 A; 4HYO A; 3LNM B; 3RVY A; 2BOB C; 5EC1 C; 2ITD C; 3AG4 C; 3TCU A; 3K0D A; 2OCC C; 2WLH A; 1ZWI C; 2Q68 A; 2WLM A; 3K03 A; 4TWK A; 4PDV A; 2R9R B; 1V54 C; 2ZXW C; 3E89 A; 4H37 A; 3E8B A; 4R8C A; 4LCU C; 3ASO C; 3F7V C; 4R7C A; 5KUK A; 3AG3 C; 3OR6 C; 2KB1 A; 2WLI B; 3FB5 C; 4WFG A; 4GX2 A; 2WLK A; 3ASN C; 3KG2 A; 2H8P C; 3ZRS A; 4RUF A; 4X8A A; 3SYP A; 4EKW A; 2X6B A; 1BL8 A; 4MVQ A; 3SPC A; 1XL4 A; 3K06 A; 3AG2 C; 2HJF C; 4BW5 A; 4PDM A; 4R50 A; 4RUE A; 2BOC C; 1OCZ C; 5BZB A; 3E83 A; 3FB8 C; 4F4L A; 1M57 C; 4MSW C; 5CBH A; 3OUF A; 3E8F A; 2NLJ C; 5EBL C; 3SPH A; 3UM7 A; 2EIN C; 1KKD A; 3UKM A; 3E8H A; 4P9P A; 2Q69 A; 2DWE C; 4J9Z B; 4RAI A; 5B3S C; 3SPI A; 3PJS K; 4X89 A; 2IH1 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1I5X A; 4FFK A; 4BAY A; 5LHH A; 1AI7 A; 2DYS B; 2UU9 B; 1AJP A; 2F95 B; 1BQ0 A; 2GBO A; 4I50 B; 4DW1 A; 3FX7 A; 2WLI A; 2EUL A; 3JD1 A; 1G6U A; 3HPL C; 4CH3 A; 1F4N A; 2ZE7 A; 2HVJ C; 4YHH B; 2EIN B; 2WWW A; 1YEW A; 4PJ0 Z; 3JAK B; 5JQG A; 4JI1 B; 2FL4 A; 3ASO B; 4FFB B; 2W0X A; 3ABT A; 4PA9 A; 3G4S V; 2HR3 A; 2VQF O; 4HAM A; 4FMT A; 3CC2 V; 1TUB A; 1WA8 B; 4X1Y A; 4A5U B; 2WA4 A; 3BCC H; 4XDL A; 1NVP B; 3P30 A; 1NKD A; 5A2Q N; 1GMG A; 3CCU V; 3ZN0 A; 4BW9 A; 3T1H B; 2IU3 A; 4ZOL A; 4JTA B; 3ICX A; 5KHG A; 4X1I A; 2Q9L A; 1K3E A; 1A32 A; 5LA6 B; 1MAB G; 4U3J A; 1XNR O; 1R1B A; 3MDS A; 3G6B A; 1L1F A; 1BMF G; 3ABL B; 1OCR B; 2A0L A; 2EZP A; 4NR1 A; 3H9V A; 1IVS A; 3I56 V; 2WLH A; 2YXY A; 1FFX A; 1OHH G; 4CS2 A; 2ZXW C; 3E89 A; 1F4M A; 2PYJ A; 2UU9 O; 1GN4 A; 1YCI A; 3FB5 C; 2JEX A; 1BT8 A; 1S77 D; 4TT3 G; 4FLY A; 1FS0 G; 2CE4 A; 2ZR3 A; 1SF9 A; 2IM9 A; 2AGA A; 1AI5 A; 2YS8 A; 3APQ A; 4BW5 A; 4F6E A; 5B1A B; 1Q3E A; 4EFB A; 1NS1 A; 2RCV A; 4JI1 O; 5J2U A; 2PYL A; 3CCL V; 3B2E E; 4UCR A; 4UXN A; 1MSW D; 3RYF A; 1PD3 A; 3CYO A; 5C93 A; 5L3G A; 2ITC C; 1EN5 A; 3OT7 A; 2VWK A; 4LFC B; 1PL0 A; 1WPB A; 5LXT A; 5ITZ A; 3QF7 A; 4DR1 O; 1JJ2 U; 4JAA A; 4MTF A; 4OXS A; 1M57 B; 1M9N A; 3T1H O; 2OIG A; 4ASU G; 1ZLZ A; 3RYI B; 4IHJ A; 4O4J A; 3BAA A; 3N2K A; 1H2S B; 1Q82 W; 3CRR A; 3J7A U; 1HW7 A; 1BZK A; 1K4D C; 1PV0 A; 1GRJ A; 1SQB H; 2IH3 C; 4FM0 A; 4JZG A; 4LF4 B; 2CDY A; 3OMA B; 5CA0 A; 1X4T A; 5F2V O; 2Y48 A; 2WLL A; 1FJG B; 5LP6 C; 3ZMZ A; 3EFF K; 2LQT A; 4P9O A; 1XMO B; 3STZ C; 2EIL B; 3JAM N; 1YTF B; 4EB6 A; 2GSM B; 3SJC C; 2V4D A; 3AG7 A; 2CUG A; 2IJH A; 1D2D A; 1FKA O; 4CS3 A; 4TWK A; 2QR4 A; 3D36 A; 4FIP C; 1S3J A; 3O65 A; 3KG2 A; 3HB3 B; 5CB4 B; 2LGQ A; 3LSQ A; 5KMG A; 1L8D A; 2IW5 A; 2Z0A A; 5IY5 B; 3U0Z A; 4JI8 B; 1HNW B; 2ZE6 A; 2JS3 A; 1NR1 A; 3RN4 A; 1GAX A; 4XDK A; 2B1I A; 1E1R G; 3C3S A; 4O4H B; 5BXZ A; 2P4K A; 3SJA C; 3ETQ A; 1Z2G A; 3DTU B; 3CX5 F; 3APO A; 1AJN A; 2D3O W; 4PI2 A; 4IL6 Z; 2JJ2 G; 4GX5 A; 3ABU A; 1M56 C; 3E8G A; 3HKB A; 4LF4 O; 3FAV B; 1N0J A; 1WAZ A; 3Q4H B; 2Q73 A; 3JAS A; 4O2B A; 5CBG A; 2OCC B; 4GX0 A; 4QPJ A; 1KC8 W; 3K9A A; 2M7W A; 2F23 A; 1FJG O; 1Q7Y W; 4MVR A; 5FNV B; 2IU0 A; 1VQ9 V; 3JCU Z; 3CC4 V; 4JYA O; 4U7N A; 1G1X B; 3G6E V; 1NVP D; 2QWP B; 2VQE O; 4KHP B; 2E5L B; 4KUM A; 4QPK A; 1OJH A; 4GCZ A; 4B3S O; 2N74 A; 1TVK B; 5AG2 A; 5LGU A; 5ITZ B; 4Z2W A; 4Z1M G; 3E22 B; 2ZCE A; 4GLX A; 3J81 N; 3AK2 A; 2DJV A; 2NN4 A; 4KXR A; 2X6A A; 4N23 A; 4DRX B; 4JI8 O; 5KHJ A; 4DR2 O; 4DYL A; 1U97 A; 4OGQ B; 4X1K B; 1YXB A; 3IJ4 A; 1HR0 B; 1M93 A; 2ZM6 B; 2OTL V; 2JGD A; 5CN0 A; 3CS5 A; 1P49 A; 2IJI A; 5LBQ A; 1JR9 A; 2P67 A; 5LHG A; 4X8A A; 5IWA O; 4U7O A; 1KQS U; 1TUE B; 3RYC B; 4BIO A; 2LO1 A; 4CZZ A; 2CTQ A; 3TXS A; 3E8F A; 3OD4 A; 1XQ8 A; 2EIN C; 5JH7 A; 1KEC A; 5K1P A; 4J11 A; 3OUS A; 1BE3 H; 5LOV A; 4LP8 A; 2DYR C; 3ZBH A; 4JYC A; 3UCS C; 3FFQ A; 4KHP O; 3EXA A; 4ZHQ B; 2E5L O; 3K5L A; 3C90 A; 1K92 A; 4FK5 C; 1HNX O; 4WFB V; 2CGN A; 2Q8V A; 4F6R A; 4EFE A; 4ZI7 A; 1XRE A; 4MT8 A; 5C8Y A; 1PPJ H; 5EBM C; 2K1E A; 3IC9 A; 4MVS A; 3K58 A; 3TJT A; 1XDC A; 4HNA B; 3KKY A; 3FB6 C; 1I5Y A; 3SPJ A; 1LNQ A; 1EN4 A; 1NT2 B; 1V9P A; 2YEV A; 2BSK B; 4LF5 O; 3ABL C; 1HR0 O; 1SS3 A; 4DO2 A; 2EJR A; 4PDL A; 4UCV A; 3U10 A; 2EIK C; 2KG7 B; 4LF7 O; 3BVO A; 1L0N H; 2ZM6 O; 4DR5 B; 2QM8 A; 3TGU H; 2BTQ A; 4QE7 A; 4PA4 A; 3WB2 A; 3FYI B; 5KAI Z; 1R3J C; 1YTF D; 4HBN A; 4DUY O; 3JAS B; 2CTR A; 5EBW C; 1VQN V; 2YIA A; 5B1A C; 1FAF A; 4MW3 A; 4J7J A; 3K0D A; 4I0X B; 1VF6 A; 4NTY A; 2R9R B; 3UT5 B; 3VQW A; 1I08 A; 3CJH B; 4WFG A; 2PUS A; 4GX2 A; 3SYP A; 1EM1 A; 1QLE B; 4MVQ A; 3ZMV A; 3QTC A; 3AG2 C; 2HLD G; 1M57 C; 2ZE8 A; 1EN6 A; 2NLJ C; 4UCT A; 2CTW A; 3UM7 A; 2VRZ A; 4P9P A; 3CP1 A; 1MMM A; 4TOI A; 3CEI A; 5EIB D; 5LHI A; 4YJ3 B; 3T2M A; 1GK9 A; 1SA0 A; 5LP6 B; 2UXB O; 2QKS A; 2ZQM A; 4I55 A; 4MTG A; 1JJO A; 3SJQ C; 3DSQ A; 3S3X A; 3QO8 A; 1ROP A; 3ZRX A; 5EZY B; 4DR5 O; 4FLU A; 4I9Q A; 3MAQ A; 3L72 H; 1MSD A; 2OTJ V; 4X9Q A; 5BR8 O; 1GM7 A; 4TV9 B; 3TK1 A; 3W7W A; 5LL6 Y; 2FML A; 1ENV A; 1SC5 B; 2G38 A; 5JWP A; 2C2A A; 3JAR A; 2EIL C; 4H33 A; 3G80 A; 1KD1 W; 2YXL A; 2HVK C; 1YF2 A; 4P2Z A; 4GUN A; 3L74 H; 1MZF A; 2A06 H; 2RQ6 A; 4ICG A; 1IUR A; 3BRC A; 3ZMT A; 1Q81 W; 4FZ1 A; 1J95 A; 2YIB A; 4R6Z A; 2XOK G; 3DXR B; 3F5T A; 3KCX A; 1FXK A; 3CCQ V; 1M56 B; 3CCM V; 5IY5 C; 3QG5 A; 1COW G; 3RBZ A; 2P90 A; 4CC6 A; 1AB3 A; 4LR3 A; 1GN3 A; 2K9P A; 3CRQ A; 2Q4P A; 4DV0 O; 2ADP A; 2AW9 A; 4H37 A; 1VF5 B; 1QNM A; 5CA3 A; 1QR8 A; 2CH7 A; 1K34 A; 4ZKI A; 1E79 G; 5GTH Z; 3ASN C; 2F4V B; 5EIB C; 3E2E A; 2XUM A; 2UXC B; 5IYC O; 4JI6 B; 4DV2 O; 1LUW A; 2XAQ A; 1FD9 A; 3SPH A; 4DR6 B; 1E1Q G; 4C7U A; 2DWE C; 3MHH C; 3A0B Z; 1R6T A; 1CXZ B; 1SQG A; 1RM1 C; 2LGW A; 3HKD B; 3ZN1 A; 2JK5 C; 4H0L B; 1XNR B; 3D3I A; 4YXW G; 5J2T B; 5CA1 B; 5L3B A; 4KFM A; 4JI4 O; 2R9A A; 1BHA A; 1GO3 F; 3QO5 A; 1THZ A; 2ADQ B; 1GKF A; 4DV7 B; 1F7Y A; 1HNZ O; 3G67 A; 1H8H G; 5IYB O; 5KA6 A; 3LDE A; 3JCZ A; 3T4D A; 3IGA C; 4MVM A; 2LW1 A; 4IGG A; 2AHY A; 1JVM A; 3OGC C; 2QEX V; 1SQF A; 3BEH A; 3IAY A; 2OCH A; 2PZS A; 4DW0 A; 2JEU A; 2W0F C; 5CMU A; 5HFM A; 1Y76 B; 1EZJ A; 2F4V O; 4L8J A; 2M6Y A; 4X66 B; 3JYC A; 2RN9 A; 2UXC O; 1AR4 A; 2DYR B; 5LGT A; 4JI6 O; 4O2A A; 4AQY O; 2VWJ A; 4FLX A; 1YSC A; 4RQE A; 5KX5 B; 2QTO A; 1VQ6 V; 2XTA A; 4DR6 O; 2L6L A; 1QVF U; 2FB5 A; 3NXS A; 5EYP A; 5GON B; 1YIT V; 1W2B U; 4DR1 B; 4JI3 B; 4PD4 F; 5BMV B; 2IJJ A; 1YJW V; 4KP4 A; 5B1O A; 3OGI B; 4Z1V A; 3OAA G; 2QM4 A; 3I5D A; 1ZUQ A; 5KUK A; 4WCE V; 1UFI A; 3OR6 C; 3RGB A; 5H9C A; 4GKK B; 2ETN A; 2HEP A; 2YSU B; 3K5M A; 3D36 C; 2D2C B; 3G71 V; 5CBH A; 3OUF A; 2EIK B; 4DV7 O; 2Q69 A; 4JV5 O; 2X0L A; 4E2L A; 4X89 A; 2IH1 C; 4LBE C; 4TV8 B; 4NTW A; 1JFF A; 3ZHT A; 4RO2 A; 2GV9 A; 1NZ6 A; 4X88 A; 5IJ9 A; 4OPH A; 4FZ0 A; 4ZBM A; 4L87 A; 2BTO A; 3ABK C; 5KA5 A; 2A7W A; 1M4U A; 3CC7 V; 4NXM B; 1NTM H; 4PEL A; 3HKE B; 3LSU A; 3OFN G; 4K3A A; 5L3F A; 4X66 O; 3SPG A; 1R6K A; 4JI0 O; 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1N36 B; 3H01 A; 5IWA B; 1F51 A; 1ARO P; 3DC5 A; 1CP9 A; 1VQP V; 4B3R O; 1RM1 B; 4YY3 O; 4WF9 V; 1PM9 A; 2W6I G; 2WLJ A; 4K8Z A; 1SQQ H; 2ZIM A; 2ZE5 A; 1KB9 F; 4RWU A; 3SYC A; 4JZ2 A; 1S5J A; 1IBM O; 5L3D A; 2XAG A; 1R3L C; 5J2U B; 3H1K H; 2XHB A; 3FB7 C; 1VQO V; 1L0L H; 4DV3 B; 3RYF B; 3B8N A; 3LNM B; 1QVG U; 4DR7 B; 2ITD C; 3TCU A; 2WLM A; 1HNX B; 3SJB C; 2PI4 A; 4PDV A; 1K5S A; 4LF6 O; 5LXT B; 1PL4 A; 4X20 A; 3A2F A; 1YJ9 V; 1NTK H; 1OV9 A; 4NXN O; 1IZ3 A; 3ZRS A; 1TAE A; 2UXX A; 3RYH A; 2XND G; 5KHK A; 3NR7 A; 1Q5O A; 4UVA A; 1VF7 A; 2Y4T A; 3BA9 A; 3K5O A; 4BR6 A; 5FPO A; 1YJN V; 4IHJ B; 4O4J B; 4LF5 B; 1Q90 D; 1KKD A; 3N2K B; 3AG3 B; 1FXH A; 4LF7 B; 4GT1 A; 3ABM C; 4DXW A; 2Y69 C; 4BIZ A; 3M7M X; 1H2K A; 1JOY A; 1VQK V; 1N36 O; 4CH6 A; 3JAT A; 1FFT B; 4PA7 A; 2OT5 A; 5CA0 B; 4DUY B; 2JJ1 G; 2EZO A; 4JPR A; 3JAL A; 2WLL B; 2LFS A; 2O57 A; 4WFA V; 1QU7 A; 3E35 A; 4EB6 B; 2E74 B; 4YJ2 A; 1K7D A; 4DV3 O; 4LWS A; 4DR7 O; 3X2Q C; 2LJ2 A; 1DTO A; 1XOU A; 4OX9 O; 1DGS A; 1AVM A; 3ZHV A; 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