The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
65
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structure length |
65
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Chain Sequence |
DLFSTMEQHASYGVGRQMGEQLAANSFEGIDIPAVQAGLADAFAGKESAVSMEELQVAFTEISRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
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| publication title |
Crystal structure of N-domain of FKBP22 from Shewanella sp. SIB1: dimer dissociation by disruption of Val-Leu knot
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Shewanella
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| total genus |
17
|
| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| ec nomenclature |
ec
5.2.1.8: Peptidylprolyl isomerase. |
| pdb deposition date | 2011-06-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, N-terminal domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Q6H A; 1Q6I A; 3B09 A; 1Q6U A; 1FD9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MTX A; 2R9A A; 2PYL A; 2OCC C; 3K58 A; 3K0G A; 4MW8 A; 3K5N A; 1H2S B; 2XAG A; 4I9W A; 1Y74 A; 2P22 C; 2JJ1 G; 2WLI A; 3WB2 A; 5BXZ A; 2E5L O; 4JI2 B; 4J9Y B; 4LCU C; 2Q8V A; 5LP6 B; 4U3J B; 1AI5 A; 1PPJ H; 5BZB A; 3L75 H; 3D3I A; 2WA4 A; 3HKE A; 4R50 A; 1L0L H; 3G71 V; 2CUG A; 2ZDI C; 1RPR A; 1WB7 A; 2P67 A; 1IZ3 A; 4PA6 A; 2N74 A; 4LF8 B; 3ZRX A; 3A0B Z; 3B8N A; 3RYH B; 4F6E A; 3HKC A; 3BAA A; 3CXC U; 1DLB A; 2B9Z A; 5EBM C; 2H8P C; 4JYB A; 1K9M W; 4IYI A; 3UO2 A; 1TUB A; 5EZY A; 2ZNJ A; 3L73 H; 3OEE G; 1M9N A; 2W6I G; 3EXA A; 1QLE B; 1WN7 A; 4JAV A; 1K34 A; 1Q7Y W; 1UJW B; 1LUV A; 4PA3 A; 1BCC H; 3F7V C; 5H6R A; 1WPB A; 1G8M A; 2P6J A; 1ENV A; 3AEI A; 4JI0 B; 1S5J A; 1RFY A; 3WG7 C; 4K0K B; 3ASN C; 4CH4 A; 4KXR A; 2VQF B; 5KAF Z; 2P5O A; 1FXK B; 1TAE A; 3OT7 A; 3BVO A; 3OUS A; 2Q4P A; 1K4D C; 3ASO B; 5GTH Z; 4O2A A; 1JJO A; 1CEZ A; 2YIC A; 1R6K A; 2IH1 C; 1RPO A; 5B66 Z; 1Q6I A; 2EIJ C; 1L1F A; 4LFA B; 2CTP A; 5J2T A; 3ABM C; 4E4E A; 5B1A C; 3OD4 A; 1NKD A; 2X6C A; 5ITZ B; 3ZMS A; 1KQS U; 1VQ5 V; 2WLH A; 2EIN B; 2EIM C; 4P9O A; 3M99 B; 3CRR A; 1B3Q A; 4FZ0 A; 4DR5 B; 3B77 A; 2EZP A; 2OTL V; 1QHT A; 4OGQ B; 1L8D A; 1IVS A; 4FVM A; 2RN9 A; 3U0Z A; 3QG5 A; 1VQO V; 4PD4 F; 5IJ9 A; 4GX5 A; 4G27 B; 5LP6 C; 5L3F A; 2BE3 A; 3T1C A; 1N8R W; 1J5E O; 5IT9 N; 2Z5U A; 1VF5 B; 2RQ6 A; 4WBN B; 3ZS8 C; 5KLV H; 4AQY B; 4CS3 A; 1KBH A; 3C90 A; 2Y0P A; 4TUY B; 3M7M X; 4U7O A; 1EN6 A; 1Z5W A; 2N04 A; 2E74 B; 4R7C A; 3B40 A; 3UM7 A; 3RGB A; 5LA6 B; 2IJK A; 3JAW A; 4X88 A; 1R6T A; 1D5A A; 1HWY A; 3R66 A; 1Z2G A; 3X2Q B; 4JTD B; 4PHZ A; 3EHB B; 2Z0A A; 5J2U A; 3SPG A; 3JAS B; 4DR6 B; 1NVP D; 1IBL B; 4JI8 B; 3C3S A; 3OMN B; 2DYR B; 2HFE C; 4Z1V A; 2PI4 A; 4YJ3 B; 2YXY A; 3HKD B; 1VQ8 V; 4X66 B; 4MT8 A; 3FB5 C; 4IYH A; 1YZB A; 2QWR B; 5LXT B; 1GO3 F; 3CYO A; 4OPA A; 2CTR A; 4DK0 A; 1JMK C; 3G80 A; 5B1N A; 2UUB O; 4NTX A; 2RCV A; 2QKA A; 2OT5 A; 1GM7 A; 4I55 A; 3E8G A; 4FLU A; 2FTK A; 1FXK C; 5JH7 A; 1PD3 A; 5CA0 B; 2NLJ C; 3PJS K; 1N32 O; 3QNE A; 3ASO C; 4JYC A; 4HNA A; 4MTG A; 3E89 A; 3JAT A; 2GDS A; 3CC2 V; 4UVA A; 1COW G; 2CH7 B; 2UXN A; 2WWW A; 4YIO A; 2E3C A; 3ZIA G; 2ODM A; 1NTZ H; 4JI3 B; 4ZKI A; 3N2G A; 4O4L B; 1I94 B; 4KFM A; 4J9Z B; 1WNS A; 2DYS B; 4EB6 A; 1XMO O; 1P4R A; 1F7Y A; 1OCZ B; 4LBE C; 4Q20 A; 3ZRW B; 4X1I B; 1FXV A; 5CBG A; 1XUQ A; 1MSD A; 5CA1 A; 4Z2W A; 3DSQ A; 4UCT A; 2GSM B; 3ZRS A; 5B1B B; 1T5E A; 2IU3 A; 1XNR O; 1YSC A; 3JAL B; 4KHP B; 1SQP H; 2H3O A; 4B3S O; 1V54 B; 3CB2 A; 2EUL A; 5LYJ B; 4PI0 A; 5C93 A; 4O4J B; 4JTC B; 3ZHS A; 1NVP B; 2LJ2 A; 3K5M A; 2RDC A; 4ZI7 A; 2DN9 A; 4ZBM A; 4UCR A; 5EC1 C; 4N23 A; 1IBM B; 4I4T B; 3LDC A; 4JI8 O; 2GTA A; 3GWK C; 5HFM A; 4A5U B; 4H13 B; 4D7T A; 2CTQ A; 4LC1 A; 4FM2 A; 3FB7 C; 3E8H A; 1XMQ B; 3CRC A; 2DYR C; 3JD2 A; 5JVD A; 1WAZ A; 4TV9 A; 5EBW C; 1WA8 A; 1AR4 A; 2ADQ B; 3FD9 A; 1VQ9 V; 2EJR A; 2WLI B; 3QF7 A; 1U96 A; 4FPP A; 4JPR A; 3SGI A; 2CGO A; 4J42 A; 2DQ3 A; 1I5Y A; 1K97 A; 3CCV V; 2FML A; 4GKK O; 3WB1 A; 4O4I A; 5FPO A; 2JEX A; 2XAH A; 2XUM A; 3I56 V; 1PP9 H; 3RYI A; 5LHG A; 3W7W A; 3HKC B; 1M93 A; 1AI4 A; 1P49 A; 1DK1 A; 4DV5 B; 2IJJ A; 4IHJ A; 1AP6 A; 2FKX A; 3OTF A; 4J7Z A; 4Z1M G; 3IFX A; 3IC9 A; 1TUB B; 4UB6 Z; 2DYS C; 5EZY B; 3H1K H; 1OCZ C; 1SF9 A; 4NKG B; 4DV3 O; 2VQE O; 3SPJ A; 3KKY A; 4LNU B; 1Y6X A; 1KKC A; 3K5L A; 1TGO A; 2HJD A; 3BEH A; 1KB9 F; 3MAQ A; 1K73 W; 3HB3 B; 4FM1 A; 3VQX A; 5JQG A; 5LHH A; 4QPJ A; 4DV2 O; 2EZO A; 2KG7 B; 2ZE8 A; 1MZE A; 2ZM6 B; 1SZT A; 2WAM A; 1V54 C; 1URF A; 4PA7 A; 2QWQ B; 1O9G A; 2EIK B; 1QVG U; 2F4V B; 1L0N H; 4DR4 B; 1N36 B; 4O2A B; 1GM9 A; 2ZQM A; 3K04 A; 2ATK C; 1XRE A; 1M1K W; 2Q67 A; 1QR9 A; 2QWN B; 5J2T B; 3VQV A; 3P3N A; 3CJH A; 1XMQ O; 1MG1 A; 4EEQ A; 3CWB H; 2K9P A; 2CTW A; 3APQ A; 1QU7 A; 2YDE A; 1ORQ C; 2EBO A; 1PKX A; 4JI4 B; 1QVF U; 3SDL A; 5GW7 A; 1EBO A; 4NTW A; 3JSL A; 3ZHT A; 3JAS A; 5K1X A; 2W6J G; 4YJ3 A; 2HG5 C; 1OZ0 A; 1SQQ H; 2WA3 A; 5IJ9 B; 2ZXW C; 3CSX A; 3SYC A; 3OM3 B; 1KEC A; 5IWA O; 3D8C A; 5LHI A; 1ZWI C; 1F51 A; 1ZX3 A; 2F1M A; 4IL6 Z; 4NB5 A; 5FNV A; 4PA4 A; 3T1Y B; 3SYA A; 1VQ4 V; 3OMA B; 5B1O A; 2UXB B; 3TET A; 3T4D A; 4FIP C; 2A9H A; 4GZR B; 3JAW B; 4W4K A; 1NBM G; 1NTK H; 3WFV A; 2GUZ B; 5LMN B; 5J2U B; 3VQW A; 1XQ8 A; 1XOU A; 2M7W A; 3CXH F; 4JI1 O; 3FYI B; 1CXZ B; 4MS2 A; 4UCV A; 4PJ0 Z; 4Q6G A; 3RBZ A; 2HLD G; 1H2G A; 1US6 A; 2XAJ A; 4JTA B; 2ZE5 A; 1JQ0 A; 3LNM B; 3OTO B; 3CX5 F; 3CCE V; 1TUE B; 2WLK A; 4LP8 A; 1YIT V; 3K9A A; 4DR4 O; 1XEQ A; 5JH7 B; 3P32 A; 3K57 A; 1EN4 A; 1SET A; 2R70 A; 3DXR A; 3H1L H; 1O9H A; 2EIK C; 5KUM A; 2RMK B; 2Q7H A; 3Q4H B; 2PI5 A; 4LF4 B; 2UXD B; 3CRQ A; 3SYP A; 4HNA B; 3OW2 U; 3JAT B; 1AI6 A; 3RT3 C; 5LYJ A; 1VIB A; 1XHZ A; 4JI6 B; 1YJ9 V; 2QA4 V; 3N2G B; 4DO2 A; 1BQ0 A; 2YXL A; 2YIA A; 3CCR V; 2EJ7 A; 4JV5 B; 3TCU A; 4CH6 A; 4DR3 O; 4CC5 A; 5DM6 V; 1ZLZ A; 4MVR A; 5EC2 C; 2QWP B; 2YI9 A; 3K06 A; 1P7B A; 2YS8 A; 4DR1 O; 5DN6 G; 1GH6 A; 3ICX A; 4XBF A; 1G4Y B; 5CA1 B; 4RUF A; 5DEC A; 1BQZ A; 4DV1 O; 2AW9 A; 4YIP A; 2ILM A; 4J7K A; 1IDS A; 4LFC B; 2X6B A; 2E75 B; 3SPI A; 1YVW A; 4K3A A; 3QO7 A; 4EFB A; 2W0F C; 2XT9 A; 2IM9 A; 4DV6 B; 2B1I A; 3IJ4 A; 4IGG A; 4DW1 A; 5IY5 B; 1A32 A; 4DUZ O; 1YEW A; 2Y0I A; 2IJH A; 4YY3 O; 3CHX A; 5LMN O; 4HZ3 A; 4ZI7 B; 3BA9 A; 3OGC C; 5CMU A; 1PNL A; 2WPD G; 4JAA A; 1SES A; 1AR1 B; 1N33 B; 1KYO F; 2IBZ H; 5IYZ B; 1M4U A; 2CGN A; 2ZE7 A; 1I7F A; 2BTQ B; 4X65 O; 2WLL A; 1DF4 A; 2PF4 E; 5JVD B; 2BCC H; 3MD0 A; 3AG1 C; 3T2M A; 4TV9 B; 1WA8 B; 4X62 O; 4RQE A; 3O65 A; 2VRZ A; 4UFZ A; 1FJG B; 2ZT9 B; 4LNU A; 3ETD A; 4FLW A; 1JFF A; 1R6N A; 3AG2 B; 3D36 A; 4LFB O; 5HFL A; 1W59 A; 4O4I B; 3L71 H; 4TQD A; 2NNU A; 3E22 B; 5D5P A; 3F5W C; 3KCY A; 2KG7 A; 2LGQ A; 5FPR A; 4BIO A; 2XAS A; 2DJV A; 3RYI B; 2JDI G; 4GX1 A; 2QM4 A; 3UO3 A; 1OJH A; 1VF6 A; 4H44 B; 2DWD C; 1SQB H; 2XOK G; 4IHJ B; 5KHH A; 2YXH A; 3S3X A; 2QTS A; 2DE0 X; 5BR8 B; 1Q6H A; 1AP5 A; 1K92 A; 4NTY A; 1IX9 A; 2QJ1 A; 2Q0A A; 1QNM A; 4N21 A; 5LGT A; 4K35 A; 4MW3 A; 3RVZ A; 2Q0O C; 4K8Z A; 4BAY A; 3I5D A; 1DGS A; 2OCH A; 1FD9 A; 4G28 B; 4MTO A; 1NU1 H; 4X1Y A; 1Q43 A; 4JI2 O; 2OIG A; 1TVK A; 4B3T B; 2HVJ C; 5IJ0 B; 2KQX A; 3MHS C; 5JQG B; 4IIJ B; 1AIL A; 3O9O A; 4J10 A; 4FLV A; 2JJ2 G; 2F43 G; 2G38 A; 2M6Y A; 3E2E A; 1MA1 A; 1V55 B; 1I0H A; 1KP2 A; 4LF8 O; 1P84 F; 4TT3 G; 3TJT A; 2Y69 B; 4DV4 B; 1D2D A; 2CE4 A; 3CMA V; 3CJH B; 4RWU A; 4RAI A; 1ARO P; 1N34 B; 2IW5 A; 1YDX A; 3K59 A; 4RQF A; 4NXN B; 4X1K A; 1YJN V; 4PDL A; 5EYP B; 1Q5O A; 3JYC A; 4ICG A; 2UU9 B; 1FJG O; 2V4D A; 2GUZ A; 4G2K A; 4X64 B; 2UUC B; 3UKM A; 1QLE C; 1P7G A; 3ZHU A; 4JI0 O; 3P3P A; 1S77 D; 4K0K O; 1SS3 A; 2HVK C; 1PM9 A; 1VAR A; 5L3C A; 2R9I A; 1GRJ A; 2LO1 A; 5C8Y A; 3SR2 C; 2VQF O; 5JCO A; 5L3D A; 2LFR A; 3AG2 C; 3HKB A; 1K8A W; 4LF7 B; 2UUA B; 5H9C A; 4UVC A; 1WP8 A; 3OGI B; 2QSA A; 1HDJ A; 5FNV B; 1SQV H; 5LMU B; 1MZF A; 1JVM A; 4ABM A; 4LFA O; 1W0J G; 4HBN A; 2NN4 A; 3LSS A; 1E79 G; 2ITC C; 4WFE A; 2GTS A; 3Q4H A; 5H5N A; 3RFR A; 1OCO B; 1U97 A; 1I5X A; 4PEL A; 4ZOL A; 2D3O W; 2Q5Z A; 1LNQ A; 1Y76 A; 4JYY A; 4E2L A; 3U10 A; 3T1H B; 1MSW D; 1N0N A; 4DR7 B; 1QCE A; 4DR5 O; 3ABT A; 1LUW A; 4CS4 A; 3AK2 A; 3FAV A; 2EIN C; 3BPZ A; 4OXS A; 1G1X B; 1VQ7 V; 2Q7G A; 2F66 C; 4UCS A; 1FPO A; 1GN3 A; 4XDK A; 3ABL B; 2HP8 A; 4GYC B; 1VP7 A; 4O4H B; 4AI8 A; 4AQY O; 3DXR B; 1BT8 A; 4JZ2 A; 1BHA A; 3HR0 A; 4TSF G; 2BOC C; 1V55 C; 1BHB A; 3CCM V; 2ZIM A; 1PL4 A; 4JI5 B; 4YJ2 A; 2Y69 C; 4WFF A; 5LBQ A; 2EIL B; 1KD1 W; 1HR0 B; 1MOF A; 1VQK V; 2UU9 O; 4GT1 A; 1S3J A; 4XDJ A; 3QO8 A; 1ZAU A; 3ZBH A; 3VOU A; 3CCJ V; 2FYU H; 2ZR3 A; 2IH3 C; 3L70 H; 1FYJ A; 5B5E Z; 4B7K A; 4PA9 A; 4DR6 O; 1X59 A; 5IYB O; 1IBL O; 4FK5 C; 4L8J A; 3X2Q C; 4MVO A; 1M56 B; 4X66 O; 5IYZ A; 4FLY A; 4QE7 A; 2BTQ A; 2XAF A; 1Y67 A; 3LSQ A; 4P2Z A; 2JIZ G; 3W7X A; 1BSM A; 2UUA O; 2PY5 A; 4F6R A; 2A06 H; 2PUS A; 4D6T H; 2ETN A; 4PDM A; 3MDS A; 1FS0 G; 1WPX A; 2BSK A; 3CME V; 1WP7 A; 1Q6U A; 4DUY B; 3W7T A; 1ROP A; 2IJI A; 4J11 A; 2UXC B; 1EM1 A; 1XHX A; 4B3M B; 4OX9 B; 1FFT B; 3RVY A; 3E22 A; 3T1H O; 4EKW A; 2B5U A; 3ZMV A; 1OCO C; 4JI3 O; 1I94 O; 5BY1 A; 5EIB D; 4DV7 B; 3CS5 A; 2HHH B; 3SYO A; 1S5H C; 3W7S A; 1NZ6 A; 1YTF D; 2WLL B; 1NQT A; 3CC4 V; 1ZSP A; 4ZHQ B; 1SA0 A; 3FB6 C; 3RYF B; 2XTA A; 3OR6 C; 5JWP A; 3A8T A; 2Y4T A; 2JS3 A; 4FFK A; 1R73 A; 3A0R A; 3J80 N; 4KL1 A; 1JFF B; 2X6A A; 3LDE A; 4KHP O; 3CP1 A; 3TXQ A; 1MAB G; 5FL7 G; 3DTU B; 5B1B C; 1PNM A; 1M57 B; 2ZIN A; 5IJ0 A; 5CBH A; 1GKF A; 4IIJ A; 4JGS A; 1BMF G; 4JAU A; 2EIL C; 1PV0 A; 2X0L A; 3KG2 A; 3ETE A; 1IBM O; 4I50 B; 1BL8 A; 1R1B A; 3AG4 B; 4XDL A; 1E1R G; 1SQG A; 2QM8 A; 5A9G A; 2QGN A; 1XBL A; 4JYA B; 1JR9 A; 1Q82 W; 4FFB A; 4GX2 A; 3SJB C; 1M56 C; 2AZ0 A; 2ZNI A; 5EYP A; 3ABU A; 5IE9 A; 3FFQ A; 4YXW G; 3S3W A; 5CN0 A; 4DUY O; 1N0J A; 4X1Y B; 4WFA V; 3SPC A; 1TVK B; 4HAM A; 3VBB A; 1N4C A; 5JJJ B; 2NR5 A; 3STL C; 1YJW V; 2JS5 A; 2F95 B; 4OX9 O; 5IYC O; 4R6Z A; 3CCL V; 4DW0 A; 2PYJ A; 4I5S A; 1KC8 W; 3FX7 A; 1YTF B; 3K79 A; 3OE7 G; 4U3F H; 3ZRV A; 4DV5 O; 2HHH O; 4HYO A; 1XDC A; 2F93 B; 1X4T A; 4X1K B; 1IBK B; 4GUN A; 2DOS A; 1EFR G; 3GWO A; 5BMV A; 2XHB A; 1DF5 A; 2YC0 A; 3OMI B; 4B08 A; 2MW2 B; 2JK5 C; 1JA8 A; 4FLX A; 1SZX A; 2YI8 A; 2ZR2 A; 4X20 A; 3AK3 A; 1PL0 A; 1K4C C; 2FL4 A; 1Q8I A; 1AI7 A; 3OUF A; 3CE2 A; 3GB7 C; 1F23 A; 4TWK A; 2E5L B; 3EFF K; 2QWO B; 5LL6 Y; 2YEV A; 4I0X A; 2Y4U A; 5LGU A; 1VQ6 V; 2WLM A; 5C8Y B; 1BZK A; 2O57 A; 5KHJ A; 3BFR A; 1YCI A; 2LW1 A; 3D36 C; 3HKB B; 2ZM6 O; 1WLE A; 2PTM A; 1MNG A; 4UV9 A; 4FMT A; 2F4V O; 3F5T A; 3ZJZ A; 3LUT B; 1N36 O; 3CRA A; 2HR3 A; 1M5I A; 4O4H A; 3NXS A; 1VF6 C; 1RSO A; 2MK3 A; 1HNZ B; 5CB4 B; 4JYA O; 5KUK A; 4ZOL B; 3AG4 C; 4TQF A; 2N05 A; 1Y76 B; 3KZI Z; 4MVZ A; 4LH6 A; 2AZ2 A; 3L9D A; 4JI4 O; 3WG7 B; 3L72 H; 5FLX N; 2JGD A; 3FAV B; 1WJZ A; 4LR3 A; 1SQX H; 2QDO A; 5KHI A; 1AJQ A; 2OWO A; 2Q68 A; 5EK0 A; 3R65 A; 3E83 A; 1VQP V; 3SJQ C; 1AJP A; 2YIB A; 5KHK A; 4BIZ A; 4J41 A; 5B3S B; 5B1A B; 2A0L A; 5EIB C; 1EN5 A; 3ETQ A; 1GM8 A; 4UB8 Z; 4YJ2 B; 3T1Y O; 3E8B A; 3N2K A; 2UXB O; 4GKJ B; 3SJC C; 4H0L B; 1UPG A; 3BCC H; 5E1A C; 1J95 A; 1OCC B; 3G6E V; 3K3W A; 1NT2 B; 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