The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
AAILEESMHARDQLMEQNFALDKARQEAEMAVHARNDFLAVMNHEMRTPMHAIISLSSLLLETELSPEQRVMIETILKSSNLVATLISDVLDLSRL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Ethylene response sensor 1
|
| publication title |
Structural Model of the Cytosolic Domain of the Plant Ethylene Receptor 1 (ETR1).
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Arabidopsis thaliana
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| total genus |
34
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.13.3: Histidine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-09-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QM7 A; 3D36 A; 4MTX A; 2LFR A; 4JAS A; 4Q20 A; 4BIU A; 2FTK A; 3TK1 A; 3A0R A; 2P67 A; 3ZRV A; 4FMT A; 4U7N A; 3ZRW B; 4KP4 A; 5B1N A; 4ZKI A; 5B1O A; 3MD0 A; 1F51 A; 3ZRW A; 3DGE A; 4JAU A; 3ZCC A; 2QM8 A; 1IXM A; 4QPJ A; 4I5S A; 2LFS A; 2C2A A; 4GCZ A; 4FPP A; 4GT1 A; 3NXS A; 4LC1 A; 3ZRX A; 5C93 A; 2WWW A; 4MT8 A; 4JYC A; 1JOY A; 4U7O A; 4BIZ A; 4JAV A; 4QPK A; 5IDJ A; 4JYB A; 3P32 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KD1 W; 1NH2 D; 2E5L O; 3SYC A; 5LMU O; 3L73 H; 1M56 C; 1WPX A; 4GKK B; 5LYJ B; 3H1I H; 3MHS C; 5D5Q A; 2P6J A; 2HHH O; 1VMG A; 3DC5 A; 2PYL A; 1S5L Z; 1DK1 A; 1KMI Z; 5CBG A; 1Q5O A; 4JI8 B; 1D5N A; 4FLX A; 3IFX A; 5GTI Z; 1BSM A; 4RAI A; 3FFQ A; 2KQX A; 4UCU A; 2BSK A; 1P7B A; 2E74 B; 2GTS A; 2ZXW B; 3HKD A; 3OT7 A; 2YI9 A; 1F51 A; 5C8Y B; 3SJB C; 4RQF A; 1YSC A; 3VOU A; 5J9P C; 3AEI A; 1W0J G; 4G28 B; 2JS5 A; 2V7Q G; 4LNU B; 1YIT V; 4B3M O; 1P7G A; 2JK5 C; 1SER A; 4O2A A; 4K0K O; 3HKB B; 5LOV A; 2JGD B; 1SF9 A; 4OGQ B; 3OGC C; 1KKD A; 2VWK A; 2ZIN A; 1MZE A; 3K9S A; 3RYF A; 1IZ3 A; 3MAQ A; 1SQX H; 3RYH B; 4XDL A; 1THZ A; 1RPO A; 2IJH A; 4RUE A; 1HNZ O; 2CDY A; 2WLM A; 3DC6 A; 1J5E B; 3JD4 A; 2FL4 A; 2WLL A; 5CB4 A; 1ZX3 A; 2NNU A; 4X64 O; 3A0R A; 3E8H A; 1ZAU A; 2IJK A; 4X66 B; 1N36 O; 1SQG A; 1AR1 B; 4LF7 O; 3CCL V; 1YTF D; 4DV2 O; 3T1C A; 4L8J A; 1XHX A; 3SPI A; 1FXK A; 4I0X B; 2W6I G; 5J2U B; 2OCH A; 4QPK A; 4FK5 C; 4X20 A; 4X1I A; 5B1A B; 5BZB A; 2LGW A; 1S76 D; 4JGS A; 3H1J H; 2CTQ A; 1DTO A; 3JAM N; 2Y0I A; 1SQV H; 1MAB G; 1QR8 A; 3GVM A; 1SQB H; 2EIJ B; 2DWD C; 5IJ0 B; 4CC6 A; 5CBH A; 2DE0 X; 3UM7 A; 1N32 O; 2OTL V; 1N0J A; 1SES A; 1XNQ B; 3LUT B; 2ADQ B; 4I50 A; 4HNA A; 3E83 A; 4LF8 B; 4LF4 O; 2GBO A; 1GN3 A; 1LUV A; 2Y48 A; 4BW9 A; 4I5S A; 3RVZ A; 4X65 B; 2P06 A; 4L87 A; 4X8A A; 3CC2 V; 1QBZ A; 4IYH A; 4PA6 A; 4B08 A; 3HKC B; 1M4U A; 4DRX A; 5LXT B; 2MK3 A; 2QR4 A; 1FYJ A; 5KLV H; 4DV4 O; 5JVD B; 4TSF G; 1H38 A; 4JV5 B; 3FAV B; 3AG3 C; 1JJ2 U; 4MW8 A; 1I7F A; 3K3W A; 5IYB O; 1A32 A; 1HNX O; 1F7Y A; 4TV9 B; 4UV9 A; 3FB8 C; 2ZNI A; 2R9A A; 1TVK B; 2ATK C; 3UO2 A; 4YJ2 A; 4DUZ O; 2DMX A; 4O4L A; 4MTO A; 5K1P A; 1KQS U; 4DR2 O; 3JAW B; 5IYZ A; 2RJZ A; 4LFB O; 3U0Z A; 4XBF A; 4GX1 A; 4O4J A; 1N33 O; 4JI6 O; 2BTO A; 3WG7 B; 1AJN A; 4PEL A; 5LHG A; 4UCV A; 1F4N A; 5JJN B; 4C7U A; 3KCY A; 5B5E Z; 3SPH A; 3JAR A; 2OIE A; 3F7V C; 1Q8I A; 2ETN A; 1SC5 B; 4PI2 A; 3JAS B; 3W7U A; 3S3W A; 3CYO A; 4DV1 B; 3O9O A; 4LF9 B; 2HVJ C; 3CX5 F; 4MTF A; 1E79 G; 3WB1 A; 4AIL C; 1I0H A; 2EIM B; 2PYJ A; 4DV0 O; 3E86 A; 2P5O A; 2FTK A; 3H01 A; 2OCC B; 4UB6 Z; 1GN6 A; 3N2K A; 2R9R B; 5FPO A; 2EIN C; 3OMI B; 4DK1 A; 1Q3E A; 2ZNJ A; 3CRR A; 4W4L A; 4WFE A; 5KA5 A; 3W7W A; 2EZO A; 4TWK A; 4LP8 A; 3CEI A; 1VAR A; 3L74 H; 5EZY B; 4DR3 O; 2IH3 C; 4I55 A; 4FLT A; 2NR5 A; 1ZL8 A; 4PJ0 Z; 2LGQ A; 4K8Z A; 1L8D A; 3CE2 A; 1XI1 A; 4IHJ B; 2NLJ C; 4NTY A; 1KB9 F; 3EFF K; 2ZIM A; 1RSO B; 3EVK A; 1YIJ V; 4NXM B; 5K1X A; 2WLH A; 3QO7 A; 3LSU A; 5EBW C; 1NR1 A; 1MNG A; 4HBN A; 3H1H H; 4D7T A; 2ZXW C; 1ORQ C; 3E2E A; 1SQQ H; 1XUQ A; 1IVS A; 1KYO F; 1GKF A; 1JFF A; 3K5M A; 1NTK H; 3ZBH A; 1HWY A; 2ODM A; 3JAT B; 2OT5 A; 5B1B B; 4UVC A; 3UKM A; 3C3S A; 1W0K G; 4IIJ B; 4PDL A; 4DR4 O; 5ITZ A; 1O9H A; 1EZV H; 4PD4 F; 1PP9 H; 2JJ1 G; 3B77 A; 1XIL A; 1K92 A; 4B3T B; 4FFB B; 5JCO A; 1M56 B; 4OX9 O; 3TGU H; 3P30 A; 2UXB B; 3ZN0 A; 3ABT A; 4DV7 B; 4FVM A; 2WLK A; 2Y0P A; 2Q9L A; 2Y4T A; 1UJW B; 3L75 H; 3ETE A; 3ZMV A; 1OZ0 A; 4X9Q A; 5H6Q A; 2Q69 A; 1AI6 A; 5F2V O; 3ABL B; 4A5U B; 4JTD B; 1Y66 A; 2CGO A; 3RVY A; 4LWS B; 1BS3 A; 3CB2 A; 4X88 A; 1WNS A; 3THO A; 1WA8 A; 1PNK A; 4PDM A; 3R65 A; 3MHH C; 1Q7Y W; 2JDI G; 1RM1 B; 1NU1 H; 4PA3 A; 3TK1 A; 3LSQ A; 3CCM V; 4DR7 O; 5L3E A; 4R7C A; 3N2G B; 3ZMS A; 3K5N A; 1VQ5 V; 5LGT A; 4NVP A; 3GB7 C; 3BCC H; 3R66 A; 5LHI A; 1BE3 H; 4I9Q A; 3ZRX A; 5C93 A; 2QE7 G; 1VQ8 V; 2WLI A; 1Y4M A; 1PD3 A; 1W59 A; 4JTC B; 5CN0 A; 2EJ7 A; 1BQ0 A; 3CPW U; 1R3J C; 1S3J A; 4QGP A; 2V4D A; 5KUM A; 4RQE A; 5JJE B; 1H2M A; 1COW G; 4J80 A; 1IDS A; 2PY5 A; 4QE9 A; 1VQ6 V; 4ZI7 B; 3BA9 A; 4DK0 A; 5KAF Z; 1Q90 D; 2LQT A; 4J41 A; 2HVK C; 2P4K A; 1IBM O; 2Q0O C; 1NTM H; 2Q8V A; 3JCU Z; 4K0K B; 2XAG A; 1MOF A; 4B3S O; 4MTX A; 1H8H G; 4J11 A; 5HFM A; 5KHJ A; 3I55 V; 4ZKI A; 1VP7 A; 3DXR A; 4H0L B; 3RBZ A; 4TQD A; 2HJF C; 1M9N A; 2YIB A; 5CA0 A; 1HNZ B; 1TUB A; 4XDK A; 1KP3 A; 4O2B B; 1DF4 A; 4W4K A; 3P32 A; 4GLX A; 4TV8 B; 2QM7 A; 4BR6 A; 2Q73 A; 3AK2 A; 4X64 B; 4LBE C; 1K5S A; 4U7N A; 4PDV A; 3B40 A; 4RO2 A; 1N36 B; 1VQK V; 1GM7 A; 1Y74 A; 4ASU G; 1WP8 A; 4JZG A; 2Y69 B; 5B3S B; 5KX5 A; 2A79 B; 4LF7 B; 1H2G A; 4P2Z A; 1KBH A; 1G1X B; 2EX3 A; 4JI7 O; 2PI5 A; 1ROP A; 4B3R O; 5KA6 A; 3OD4 A; 3QNE A; 3JCZ A; 3WG7 C; 1G4Y B; 1RFY A; 3HKB A; 2RNB A; 2OWO A; 2ZDI A; 2F4V O; 4MVO A; 5B1N A; 2UUB O; 1MSW D; 5H9C A; 1YVW A; 5IY5 C; 1S5J A; 4X1Y B; 5JH7 A; 1CXZ B; 2PUS A; 1P49 A; 2X0L A; 1N32 B; 3AG3 B; 1F4M A; 3B8M A; 2GUZ B; 4MVU A; 2N74 A; 4HZ3 A; 2GV9 A; 4KFM A; 2BOB C; 4LF4 B; 1N4C A; 1D2D A; 4I9W A; 2RMK B; 4UCT A; 4CS4 A; 1HP8 A; 4DV5 O; 5JQG A; 2W0X A; 4K8X A; 1PKX A; 1PPJ H; 4FM1 A; 1G6U A; 3ZIA G; 5FNV B; 4G2K A; 4I4T A; 1BHA A; 1R3K C; 4J7K A; 4JI0 O; 4WBN B; 2ZIO A; 2X7R B; 3FYI B; 4PHZ A; 1AI4 A; 3B4S A; 4B7K A; 2YIC A; 2FKX A; 2WPD G; 2UUC B; 4O4I A; 3FB6 C; 3JYC A; 5EYP A; 4EB6 A; 3IAY A; 4JYA B; 3RYI B; 1OCZ B; 2HEP A; 1V55 B; 4H13 B; 4NKG B; 3FKS G; 4WF9 V; 2VQE B; 2WWW A; 3BVO A; 1OHH G; 3OEH G; 4J7Z A; 2XUM A; 4DUZ B; 4IGG A; 3SJA C; 2OTJ V; 5EBL C; 1K7D A; 4DR2 B; 4YY3 B; 2AZ2 A; 4AI8 A; 3QO8 A; 1VF6 C; 2GTA A; 5B1B C; 2GDS A; 5IDJ A; 3KCX A; 4JI4 O; 3AG7 A; 3AG4 C; 2KSD A; 1K9M W; 2K9P A; 1P4R A; 1VQO V; 3ZHU A; 3LDE A; 5LMN O; 4JI3 B; 3ZCC A; 2JIZ G; 5AG2 A; 3RFR A; 1EFR G; 3I5D A; 3IC7 A; 2QGN A; 4DV0 B; 1KC8 W; 3ABL C; 2BTQ A; 1Q86 W; 3RYC B; 2QKS A; 2ZT9 B; 2E75 B; 1L1F A; 1IBL O; 2QSA A; 3ASN C; 3W7X A; 3CMA V; 4F6R B; 1SZX A; 1TAE A; 1SQF A; 1FD9 A; 2EIL B; 3UT5 A; 1RM1 C; 4X1K B; 2QWO B; 1S77 D; 2DW4 A; 3BAA A; 4IYI A; 4DUY O; 3L9D A; 3D36 A; 2XAH A; 1GAX A; 1GN2 A; 1UPG A; 1IX9 A; 5GON B; 1Z5W A; 1SZT A; 5LBQ A; 4K3A A; 4TUY B; 4B7E A; 5J2T B; 4PDR A; 2DOS A; 4DR6 O; 1Y76 B; 3VQW A; 2DWE C; 4FFK A; 1NBM G; 3OTF A; 2XAQ A; 2B1I A; 3W7T A; 1PL0 A; 3ZS8 C; 2CH7 A; 5BMV A; 4DR4 B; 3DGE A; 3TJT A; 2PTM A; 3EHB B; 4BWA A; 1DF5 A; 5H6R A; 1QVG U; 1I94 O; 1YEW A; 1YZB A; 4GZR B; 4OX9 B; 4U7O A; 3PN1 A; 5KMG B; 3K79 A; 1VQ4 V; 1S72 V; 3CCR V; 2W6J G; 4U3J B; 1DLB A; 4MW3 A; 4R8C A; 3Q4H A; 4WFF A; 4EKW A; 2BCC H; 3ABK C; 1Y67 A; 5LA6 B; 1FFX A; 3QF7 A; 4LFA O; 2UUA O; 3JAK A; 2QA4 V; 1FFT B; 3FYE B; 4DYL A; 5FPR A; 2JEX A; 1EN4 A; 1Z2G A; 5CBF A; 2YI8 A; 2JRI A; 2Y69 C; 5B3S C; 5KHI A; 2E76 B; 3ETQ A; 3CRQ A; 5BR8 B; 1XL4 A; 4X62 O; 2K1E A; 2XND G; 5B1O A; 4DR5 O; 3MD0 A; 2O57 A; 3E22 A; 3M7M X; 4H33 A; 4CH6 A; 4UXN A; 5JJJ B; 4JYC A; 4O4H B; 5KUK A; 3J80 N; 1JCH A; 1SA0 B; 1H2L A; 4YHH O; 4WFB V; 1ZLZ A; 3JAL B; 4NYK A; 2QM8 A; 4YJ3 A; 1Q43 A; 2LFS A; 4DV3 O; 3OAA G; 3CCE V; 5L3B A; 1IBM B; 2IJI A; 1ZUQ A; 1IBK O; 2JJ2 G; 4B3S B; 4FZ0 A; 4JF3 A; 4FLY A; 3SPJ A; 2UU9 B; 3K5O A; 1JQ0 A; 3ZHR A; 5FLX N; 4TQF A; 1V54 B; 1R6T A; 2P4V A; 2ZE8 A; 2QWQ B; 5IJ9 A; 3NXS A; 2F93 B; 2VWJ A; 2A7W A; 2Q7E A; 3J81 N; 4BIZ A; 2BSK B; 5IY5 B; 1OCZ C; 1VQP V; 1E1Q G; 1B3Q A; 5EK0 A; 4JAS A; 1FS0 G; 3HKD B; 1V55 C; 3FX7 A; 2UXN A; 3OGI B; 1MMM A; 3M99 B; 1GH6 A; 1S5H C; 1HR0 O; 1XBL A; 1PM9 A; 3OEE G; 4EFB A; 3OM3 B; 3APQ A; 1L0L H; 3LNN A; 4GYC B; 2YID A; 4O2A B; 5LOV B; 4B3R B; 5IWA O; 3RYF B; 4FZ1 A; 1K4C C; 2F4V B; 3T4D A; 1BMF G; 2A06 H; 2QM4 A; 4E4E A; 4JI8 O; 2P7T C; 2Z0A A; 1BCC H; 4UCO A; 2JGU A; 2LW7 A; 4MVQ A; 2WLL B; 5CB4 B; 2VQF O; 2ZR2 A; 2IH1 C; 2N04 A; 1N8R W; 2KG7 A; 3BA8 A; 2M6Y A; 4ZBM A; 4DR1 B; 3D3I A; 2EIK B; 3S3X A; 1KEC A; 1K8A W; 4UCS A; 3B09 A; 3SDL A; 3SYP A; 2F23 A; 1FXK B; 2ZQM A; 4DV5 B; 3I56 V; 1S0V A; 1JJO A; 4X20 B; 4X1I B; 4GKJ O; 3UO3 A; 4IT5 A; 1WB8 A; 2YEV A; 4JI0 B; 4JPR A; 2EIL C; 1CPY A; 1GTO A; 4AHC A; 1Q82 W; 3VBB A; 2XAJ A; 1Q6U A; 2ZCE A; 2A9H A; 1GM9 A; 1U96 A; 3MDS A; 2HR3 A; 3ZMZ A; 3CJH A; 3OR6 C; 1T5E A; 1QLE C; 2GHY A; 3AG4 B; 1QCE A; 1J5E O; 1XMQ B; 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2P22 C; 5H5N A; 4CBC A; 5C8Y A; 3SYO A; 2N05 A; 4DV2 B; 4I55 B; 2EUL A; 1I94 B; 3APO A; 1X59 A; 1ZL8 B; 1JOY A; 3CRA A; 4LNU A; 1M5I A; 2ZE7 A; 4KUM A; 1V54 C; 2LFR A; 2PF4 E; 2XHB A; 1XEQ A; 2JGD A; 2FYU H; 4LFC O; 3C90 A; 1HW7 A; 3CXC U; 5FL7 G; 4DV1 O; 4XDJ A; 2L6L A; 4H37 A; 5B66 Z; 3RYH A; 4CS3 A; 2XOK G; 4LFA B; 2UUA B; 1GN4 A; 3CCS V; 2RDC A; 1M1K W; 2AZ0 A; 3ETG A; 5L3D A; 4DW1 A; 4JI1 O; 1H2S B; 1JFF B; 3K06 A; 4HYO A; 2GSM B; 5TIS Z; 5A9G A; 2ZKO A; 2IW5 A; 2Q7H A; 3ZRV A; 3K03 A; 5ITZ B; 1WLE A; 5IE9 A; 2QWR B; 2YIA A; 2CTR A; 5EIB C; 1XDC A; 4J7J A; 1FAF A; 4I0X A; 1Z5V A; 3W7S A; 5J2U A; 2OYQ A; 1GM8 A; 1NZ6 A; 1LR1 A; 2X6B A; 1AIL A; 3TCU A; 4YHH B; 4DV4 B; 5EBM C; 1XHZ A; 3KG2 A; 3OW2 U; 1FJG O; 1YTF B; 1YDX A; 1WA8 B; 3CWB H; 4DV3 B; 4RUF A; 5KHG A; 3CME V; 5IJ0 A; 3T1Y O; 1HNX B; 3HR0 A; 2EIK C; 3ZMU A; 5KHK A; 3D8C A; 4X89 A; 1PNM A; 2ZM6 O; 4EFE A; 3O65 A; 1FXK C; 2EBO A; 2F1M A; 1O9G A; 1K5Q A; 4F6E A; 2B9Z A; 2AGA A; 3J7A U; 1SRY A; 3LDC A; 1I08 A; 1QQC A; 4LFB B; 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