The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
VLQVLDRLKMKLQEKGDTSQNEKLSMFYETLKSPLFNQILTLQQSIKQLKGQLNHILE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding/protein transport
|
| molecule keywords |
PALS1-associated tight junction protein
|
| publication title |
Structural basis for L27 domain-mediated assembly of signaling and cell polarity complexes.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
24
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-09 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZL8 A; 1Y76 A; 1Y76 B; 1Y74 A; 1Y74 B; 1RSO B; 1VF6 C; 1VF6 A; 3B40 A; 1ZL8 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4GCZ A; 3JCZ A; 1S77 D; 4FLZ A; 5L3G A; 3CE2 A; 4NXM B; 2OIE A; 1XMO O; 4I4T B; 4WFG A; 2RJZ A; 1K9M W; 4IIJ B; 5H6R A; 1XMQ B; 1M57 B; 2EBO A; 5H5N A; 1WNS A; 2QM7 A; 3PJS K; 3ZRS A; 3F7V C; 4U7O A; 1S5L Z; 5L3E A; 5KA5 A; 5CBF A; 3C3T A; 1KEC A; 5B3S C; 3G6E V; 4K8X A; 4YJ2 A; 1K34 A; 1WAZ A; 4X89 A; 2UUB O; 3JAL B; 4BWA A; 3OGI B; 1NTK H; 3A2F A; 4GKK B; 3FKS G; 1NTZ H; 3OMI B; 1LUV A; 1Q6H A; 1SQF A; 3ZBH A; 2YUA A; 4NTW A; 2ZKO A; 3QO7 A; 1M56 C; 2WWW A; 4JI2 O; 2E5L B; 2WA3 A; 3HKE A; 3ZHT A; 4FZ1 A; 2YDE A; 4X1I A; 4TUY A; 3T4D A; 4U3J A; 4DR3 O; 1M90 W; 2PTM A; 4JGS A; 3VQW A; 4LFA O; 1UJW B; 3ABL B; 2QJ1 A; 2IJH A; 3FB8 C; 4R6Z A; 3SYC A; 4Q6G A; 1RSO B; 1N32 O; 4UVA A; 4WFH A; 1JOY A; 1QQC A; 1PV0 A; 4LF5 B; 4I55 A; 1TA8 A; 3SR2 C; 3OE7 G; 5C8Y A; 4EEQ A; 3HKC A; 2R72 A; 4DV6 O; 2QE7 G; 3RYC B; 4GKJ O; 3CXH F; 1DTO A; 1S0V A; 1B6Q A; 1CXZ B; 3FAV A; 1R3I C; 1SES A; 5E79 Z; 1FXK B; 4PDL A; 1R1B A; 1AVM A; 1N36 O; 4O2B A; 1FYJ A; 5J2T A; 4E2L A; 4OX9 O; 2M7W A; 4FLX A; 2IH3 C; 3L72 H; 1IXB A; 1BE3 H; 2E3C A; 4ZOL A; 3BEH A; 3MD0 A; 5JH7 B; 4C7U A; 4DR6 B; 4DV5 O; 1P49 A; 4LP8 A; 1IBK O; 1SC5 B; 1YDX A; 1IXM A; 4DV7 O; 4DK1 A; 1SET A; 3BA8 A; 4WFB V; 4IYI A; 5EC2 C; 4QE7 A; 4DR5 O; 4JI4 O; 3GWO A; 5F2V O; 2OYQ A; 3AK2 A; 3AK3 A; 3L71 H; 4DR4 B; 1IDS A; 2P7T C; 2Z3Y A; 4FLY A; 1B3Q A; 2CTQ A; 1PL4 A; 1IUR A; 1FJG B; 2UUA B; 3IGA C; 4NTY A; 2LJ2 A; 5IYD O; 1Y74 B; 4R8C A; 3APO A; 2F66 C; 2YS8 A; 2KG7 A; 3OR6 C; 4YY3 O; 4WFF A; 4QIW F; 1FFX A; 2OTL V; 5L3D A; 2GUZ B; 1QVG U; 3KCY A; 2YID A; 1KB9 F; 4QGP A; 4ZIB A; 3K5L A; 4J41 A; 3ZN0 A; 2JS5 A; 3AG4 C; 1PNL A; 2ZD9 A; 2CTR A; 4JI8 O; 2UXN A; 3CMA V; 2YXH A; 2QA4 V; 4PA9 A; 1AP6 A; 1WJZ A; 2FYU H; 5DM6 V; 3K08 A; 3CC7 V; 3J7A U; 3RGB A; 1TGO A; 2FL4 A; 4MVQ A; 3MAQ A; 5EBL C; 3H1H H; 2MW2 B; 3IC7 A; 2UXC O; 5KUK A; 2RQ6 A; 1Q5O A; 4JV5 O; 1T5E A; 1W0J G; 2Q0A A; 4O4J B; 5TIS Z; 5IYZ A; 1JFF B; 5KUM A; 4Z1M G; 4KHP O; 4JYA B; 3ASN B; 3M8A A; 4PD4 F; 2VQE B; 1K4C C; 1WB7 A; 4WF9 V; 4W4K A; 4J80 A; 4KUM A; 5CN0 A; 4BR6 A; 2FKX A; 2N04 A; 2P22 C; 3UQ8 A; 2P5O A; 3S3W A; 1SKV A; 1OCR B; 1NI8 A; 4IHJ B; 1YTF D; 3CYO A; 3I56 V; 3JSN A; 1AIL A; 3UO2 A; 1AI5 A; 3X2Q C; 1FPO A; 4LH6 A; 2HHH O; 1BS3 A; 3B40 A; 1NU1 H; 1Z5V A; 3EXA A; 3VQX A; 2X0L A; 2UXB B; 4JF3 A; 4MVU A; 4D7S A; 4UV8 A; 4QJF B; 5KX5 A; 1SER A; 4K0K O; 4LWS B; 5EC1 C; 5L3C A; 1LUW A; 2V1D A; 2P6J A; 4A5U B; 1NR1 A; 4ZHQ A; 5EIB D; 2AXT Z; 3CC4 V; 1IBL B; 2HJD A; 5FL7 G; 1GRJ A; 5LP6 A; 1N4C A; 5DEC A; 1OJH A; 1W59 A; 3E35 A; 4O4I A; 1NVP B; 4GUN A; 4DRX B; 4RAI A; 3AG1 B; 1H2G A; 3H01 A; 3OT7 A; 3RWR D; 3RYF A; 4JAA A; 2VQF O; 5KLV H; 2YXY A; 4EB6 A; 4WBN B; 5IJ9 A; 1DLB A; 3ABM B; 3BAB A; 1SZX A; 5B1O A; 2KQX A; 3ZHU A; 3W7X A; 2F43 G; 1UFI A; 1N34 B; 2YIB D; 1V9P A; 5A9G A; 4FIP C; 3BHP A; 4J7J A; 3IC9 A; 2BSK B; 2ZNI A; 1K8A W; 2A79 B; 1HNX O; 2QWN B; 3T1H O; 1FXK C; 2M6Y A; 1I08 A; 4FFK A; 2FML A; 1L0L H; 2EIK B; 1K5Q A; 1R6N A; 3WB1 A; 2D3O W; 1SA0 B; 1YCI A; 1YZB A; 2DN9 A; 2IH1 C; 1VQ5 V; 3RYI A; 3G80 A; 1VQ6 V; 1H2K A; 4H13 B; 1SQQ H; 1MAB G; 2BCC H; 3JYC A; 4B3T B; 2XAQ A; 4RQE A; 1H2L A; 3D3I A; 3GVM A; 2CTP A; 1S3J A; 1TUE B; 3CRA A; 4L8J A; 1S76 D; 2XAG A; 1GN2 A; 4PV1 B; 2DYR B; 4IYH A; 4LF6 B; 1ZWI C; 5LHG A; 3BRC A; 2CH7 A; 5BR8 B; 2YI9 A; 1JCH A; 3OMA B; 3TXS A; 3CCM V; 4EFE A; 3BFR A; 3MHH C; 1G1X B; 5JQG B; 1WP8 A; 1K5S A; 4DV1 B; 1XHZ A; 4OPA A; 1I7F A; 1NS1 A; 2YXL A; 4X64 B; 4PDM A; 4NXM O; 1R73 A; 5LMU B; 3K9S A; 2A06 H; 1I0H A; 1V54 B; 2WSS G; 3I55 V; 4NTX A; 1Z5W A; 3E22 A; 3RYH A; 2AHY A; 1NTM H; 4DV3 B; 3THO A; 4TSF G; 1PKX A; 2EIN C; 3LNM B; 1YI2 V; 4TOI A; 1GAX A; 2GTA A; 3F5T A; 3WFV A; 1SQX H; 2X6B A; 1EFR G; 3W7U A; 1QLE B; 1KC8 W; 3E2E A; 5CBG A; 2ILM A; 4FM1 A; 1BZK A; 2CK3 G; 5CA1 B; 4B3S B; 4MTG A; 4KFM A; 5AG2 A; 3WB0 A; 4K8Z A; 4UXN A; 5KHK A; 4FFB A; 3JD0 A; 4GKK O; 4FLT A; 2EX3 A; 3SJC C; 3CP1 A; 2W6I G; 3M7M X; 1D5N A; 2CTW A; 4CZZ A; 5LA6 B; 3ZRW B; 1OCZ B; 1W0K G; 4FZ0 A; 4F6R B; 3IAY A; 1TVK B; 2EIJ B; 3QO8 A; 1ZUQ A; 1KKC A; 3ETG A; 3DC6 A; 2YSU B; 5K1P A; 1H2N A; 5IYC O; 3QF7 A; 2KKW A; 4MTX A; 3AG2 C; 2P4K A; 2GV9 A; 1PM9 A; 1KP3 A; 1XL6 A; 4CH4 A; 1X4T A; 3MDS A; 3ZMZ A; 2ZE6 A; 4TT3 G; 3TET A; 5KA6 A; 2QWP B; 1ZL8 A; 4LF4 B; 5FNV B; 2OIG A; 3DSQ A; 1Q6U A; 3NR7 A; 3N2G B; 4YIP A; 1WLE A; 2P90 A; 3B77 A; 2IU3 A; 4BAY A; 1I94 B; 2VRZ A; 3K9A A; 3LSU A; 1J5E B; 1SQP H; 5JCO A; 2IJJ A; 1TUB A; 3OUF A; 1RFY A; 1XNR B; 5ITZ A; 1MNG A; 1AR4 A; 2WAM A; 1M9N A; 3SYA A; 1YEW A; 1U97 A; 3CJH A; 3ZIA G; 1N0J A; 4DR6 O; 1M5I A; 3CRR A; 5L3B A; 1P84 F; 3LSQ A; 5BMV A; 2ZM6 B; 1ARO P; 5LOV A; 3FYE B; 2JS3 A; 1OCC C; 4I5S A; 3CPW U; 4JI1 O; 4XBF A; 1QR8 A; 3FB6 C; 2JGU A; 4DR4 O; 2WLK A; 4D6T H; 2UUC B; 3ZMT A; 4OXS A; 3H1I H; 1XIL A; 3TCU A; 2YIA A; 4PHZ A; 2UUA O; 4I4T A; 3DGE A; 4B7K A; 3ML0 A; 4YXW G; 4DO2 A; 2DW4 A; 3ASO C; 2HVK C; 2UU9 O; 4IIJ A; 4KXR A; 2LGQ A; 2P4V A; 4FVM A; 2BTQ B; 1B04 A; 2ZR2 A; 3UCS C; 4Z2W A; 2YIC A; 4O4H A; 4UCU A; 4R7C A; 4UFZ A; 4JYC A; 4CS3 A; 1E1Q G; 3A0B Z; 3S3X A; 2JGD B; 2YIB A; 2CUG A; 1WPB A; 2DYR C; 1ZSP A; 1VF6 A; 1MSD A; 3FB7 C; 2BOC C; 2R9A A; 4W4L A; 2V4D A; 3WG7 B; 2L6L A; 2CAZ C; 1YJ9 V; 1SRY A; 3JAL A; 1BQ0 A; 4HBN A; 2Q69 A; 4GX2 A; 2ZIN A; 3LUT B; 3ETE A; 2LW1 A; 1HNZ B; 5JVD B; 1BQZ A; 4DUY B; 1D2D A; 4TV9 B; 1NR7 A; 3MHS C; 4X1K B; 3LNN A; 1US6 A; 3JD1 A; 4CH5 A; 4NKG B; 2DOS A; 2JRI A; 5H2F Z; 4B08 A; 3KG2 A; 4KP4 A; 2E75 B; 4DYL A; 5KMG A; 1YJN V; 3OUS A; 4U3F H; 2F93 B; 2Q67 A; 3OTO B; 1RM1 C; 1RSO A; 3ZHV A; 3EHB B; 4HAM A; 4G2K A; 3ZHS A; 5L3F A; 4ZBM A; 1QLE C; 4PEL A; 2IU0 A; 5B5E Z; 2EIM B; 1K97 A; 3H1K H; 4YIO A; 2LQT A; 5LMN B; 4O2A B; 3RYC A; 1F7Y A; 2UXB O; 4BW5 A; 4DV4 B; 3GWK C; 4Z1V A; 1PPJ H; 2PF4 E; 1FXK A; 5IJ0 B; 2HKO A; 1BMF G; 3UKM A; 3G67 A; 1IBL O; 4G28 B; 4JI5 B; 1V55 C; 3JAT B; 3CCE V; 2Q6A A; 5JH7 A; 3RVY A; 1KBH A; 3FYI B; 4X62 B; 3CCV V; 1KU9 A; 4X1I B; 5KHJ A; 2IW5 A; 3OEH G; 1IX9 A; 1ZX3 A; 4P9O A; 3H9V A; 4J42 A; 1MZE A; 1GMG A; 3WB2 A; 2W0X A; 1AI6 A; 4JI0 B; 5IDJ A; 1M1K W; 1N34 O; 3JAS A; 1XNQ B; 5B1B C; 4UCV A; 3CS5 A; 5B1A B; 5C8Y B; 3RBZ A; 2P67 A; 3SPG A; 1F4M A; 4NXN B; 1Y74 A; 3HKB B; 4H44 B; 4X1Y B; 1GH6 A; 2ZE8 A; 5LXT B; 3CXC U; 1EN6 A; 1JPX A; 2Y4T A; 4IT5 A; 3CX5 F; 5JJE B; 4MW3 A; 2WLH A; 2GUZ A; 2B5U A; 2DJV A; 1GM9 A; 1KYO F; 3K04 A; 1GKF A; 3ABK B; 4Q20 A; 1VF5 B; 1EN5 A; 3BCC H; 1FKA O; 2R9I A; 2Q7G A; 1OCO B; 2QEX V; 4B3T O; 5JCO C; 1HDJ A; 2Q5Z A; 2HG5 C; 4FMT A; 3AG3 B; 2OCC C; 3ZS8 C; 3W7T A; 2XAH A; 4LF6 O; 1Y66 A; 1FAF A; 5BZB A; 5BR8 O; 1HR0 B; 3R65 A; 2W6J G; 4TQF A; 1PP9 H; 1COW G; 5IY5 B; 5IWA B; 1VQ7 V; 4QNH B; 2FB5 A; 5K1X A; 4O4J A; 4DV1 O; 1JFF A; 2Y69 C; 4G27 B; 5EIB C; 4X64 O; 2EJ7 A; 2QTS A; 2JVD A; 4ZI7 B; 2XT9 A; 3HB3 B; 2DQ3 A; 3ZHQ A; 4BW9 A; 5LMU O; 2B9Z A; 2XND G; 1QR9 A; 2Y0P A; 4IHJ A; 4IL6 Z; 5JWP A; 4JAS A; 4DV3 O; 1M57 C; 1XRE A; 2QGN A; 2XHB A; 3N2K B; 5CB4 B; 1CEZ A; 5LBQ A; 3K0D A; 4KL1 A; 3JD2 A; 2AZ2 A; 3RVZ A; 5CA3 A; 1VQ8 V; 4LWS A; 2QKS A; 4B3S O; 1VF6 C; 4H0L B; 5J2U B; 1AI7 A; 1MA1 A; 2QSA A; 1HWY A; 1GTO A; 4LFB B; 2DQ0 A; 2JEX A; 1Y76 B; 4I9Q A; 2HLD G; 4EFB A; 1RP3 B; 3O9O A; 4O4L B; 4DRX A; 4CH6 A; 3DC5 A; 1HNW O; 3SDL A; 2N05 A; 2HFE C; 3IFX A; 1MZF A; 2GHY A; 4AI8 A; 3F5W C; 4YHH B; 2ADP A; 3FFQ A; 4WBN A; 5E1A C; 1QHT A; 1O9H A; 4RUE A; 2EIM C; 3SYO A; 2ZQM A; 4LF7 B; 3ABL C; 2Q73 A; 4X8A A; 3HKD B; 4H33 A; 4JI7 O; 4LNU B; 2ZE5 A; 2BSK A; 1VQL V; 3M99 B; 1S5J A; 4GKJ B; 4HNA B; 2C2A A; 4I7Z B; 1Q81 W; 4BIO A; 4LF4 O; 3QVN A; 1SA0 A; 2NNU A; 1BSM A; 4UB6 Z; 4B7E A; 1BT8 A; 2F4V O; 4DUZ O; 1KQS U; 4JPR A; 5D5P A; 4X20 B; 2JK5 C; 2UXX A; 2RDC A; 2QTO A; 4JYY A; 4DW1 A; 3K5N A; 1I94 O; 1J5E O; 2QDO A; 4FPP A; 1J95 A; 3K3W A; 1S72 V; 2ZE7 A; 1Q3E A; 3ZJZ A; 2ZT9 B; 1XNR O; 4DV5 B; 2JJ2 G; 3DXR B; 4DV7 B; 2Q8V A; 4CS2 A; 4X65 O; 4DR2 O; 2GDS A; 3ZRX A; 5IJ9 B; 2ZM6 O; 4LH7 A; 2H94 A; 5H6Q A; 1DGS A; 2IBZ H; 5JQG A; 4TV8 B; 4LFC B; 3P3P A; 1Y67 A; 2V7Q G; 2UUC O; 2BTO A; 3STZ C; 4CBC A; 1ZLZ A; 1N8R W; 5C93 A; 1G4Y B; 5CA0 B; 3E86 A; 3OAA G; 4UCO A; 4DV2 B; 3B09 A; 3JD3 A; 1VQO V; 1CP9 A; 2R70 A; 4CC5 A; 3ZN1 A; 3UT5 B; 1YIT V; 5EYP A; 5EZY B; 5KHG A; 4DV0 B; 3RYI B; 1G8M A; 1NJI W; 4UV9 A; 3TK1 A; 4B3R B; 4XDK A; 1O9G A; 2PYJ A; 3U11 A; 2UXD B; 2WLL B; 5J9P C; 3PN1 A; 1UPG A; 1SZT A; 3OMN B; 2HEP A; 1XMQ O; 4UCS A; 1VF7 A; 3QNE A; 5B3S B; 1FFT B; 4I50 B; 5CA1 A; 3ETQ A; 1SQV H; 1Z2G A; 1QLN A; 4MVS A; 4K35 A; 4LF9 B; 1XL4 A; 5IE9 A; 4FK5 C; 4UVB A; 2BE3 A; 1NH2 B; 1R3K C; 3SGI A; 1HNZ O; 4UB8 Z; 1MMM A; 4DUY O; 1JJ2 U; 4YJ3 A; 1PNK A; 3ZRW A; 5EBW C; 4F6R A; 1VIB A; 1IVS A; 1H38 A; 4KHP B; 2IM9 A; 2WLI B; 1TVK A; 1JVM A; 5GTI Z; 3HPL C; 1EZJ A; 2L35 A; 1M56 B; 3STL C; 5FPO A; 4F6E A; 3CCU V; 4RUF A; 1JR9 A; 3UM7 A; 3ASN C; 3JAR B; 4GX1 A; 3OTO O; 1QBZ A; 2E5L O; 3SPH A; 4MVO A; 4LF8 B; 4MTO A; 3FB5 C; 1YJW V; 3ZHR A; 1OCR C; 2Y0I A; 5HFM A; 5FNV A; 5LMN O; 2QR4 A; 3E8F A; 4GZR B; 5B66 Z; 4QE9 A; 4DV4 O; 4E4E A; 5LHI A; 1X59 A; 4MW8 A; 4FFB B; 4LF5 O; 3ABT A; 3C3S A; 4JI3 B; 2YEV B; 2HR3 A; 4JTD B; 4CH3 A; 3LSS A; 3JAM N; 3CB2 A; 3R66 A; 3U0Z A; 1E79 G; 4X62 O; 1BHA A; 3K03 A; 3QG5 A; 1B06 A; 4DR7 B; 3AG1 C; 1GN3 A; 2EJR A; 4I0X B; 3J80 N; 2PZS A; 1U96 A; 3BA9 A; 2QM4 A; 1ORQ C; 2H8P C; 5BXZ A; 1FD9 A; 4D7T A; 3VOU A; 1WA8 A; 4JI0 O; 3ZX6 A; 4FLV A; 4ABM A; 3ABM C; 3ICX A; 2E74 B; 4RWU A; 2PY5 A; 1XNQ O; 3CWB H; 3CME V; 3RN4 A; 1OZ0 A; 4UUJ C; 1QVF U; 1ZL8 B; 3JCU Z; 5LYJ B; 3CHX A; 4NXN O; 4LC1 A; 4NYK A; 4MS2 A; 3K06 A; 4B3M B; 4ASU G; 3AK1 A; 3EFF K; 4DR1 B; 1BHB A; 4XDL A; 2BTQ A; 3ETD A; 2X6A A; 2EIK C; 2Y48 A; 1NKD A; 1FJG O; 1F51 A; 3JAK B; 3CEI A; 4PJ0 Z; 2VS0 A; 3TGU H; 1WN7 A; 3JAW B; 2DE0 X; 2JGD A; 5LGU A; 3H1J H; 1WP7 A; 4JTC B; 1BGY H; 1GM8 A; 1MOF A; 2QKA A; 1NVP D; 2FTK A; 3AG4 B; 5GON B; 2QM8 A; 1DF5 A; 2G38 A; 2R9R B; 4J7Z A; 2W0F C; 4K3A A; 1H8H G; 5JVD A; 4FLW A; 3Q4H B; 3W7W A; 1HR0 O; 2K1E A; 4GX5 A; 4TV9 A; 4P9P A; 5KHH A; 5IWA O; 2ZR3 A; 4X1K A; 1Q7Y W; 1R6T A; 4CS4 A; 3QTC A; 3D36 A; 1F23 A; 2DWD C; 1KKD A; 1XHX A; 1NBM G; 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