The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
IGTTLVALSSFTPVLVILLGVVGLSALTGYLDYVLLPALAIFIGLTIYAIQRKRQADASS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
MerF
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| publication title |
Structure determination of a membrane protein in proteoliposomes.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Morganella morganii
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| total genus |
18
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-09-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF11431 | Transport_MerF | Membrane transport protein MerF |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | bacterial mercury transporter, merf |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJ2 A; 2H3O A; 1WAZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AQY O; 4Q6G A; 4LFB B; 2FML A; 4FLX A; 2RCV A; 1YTF D; 1R6T A; 3DGE A; 5DED A; 3FD9 A; 2YSU B; 2UUA O; 1S3J A; 1TUB A; 3ICX A; 4JAS A; 1J5E B; 1SC5 B; 3SYO A; 3A0H Z; 1W59 A; 3K9S A; 4LBE C; 4PV1 B; 2F1M A; 3M8A A; 1YJN V; 3E8B A; 2YEV B; 1K8A W; 2QDO A; 1R3K C; 4OPA A; 3T1H O; 1AJN A; 2AZ2 A; 3UM7 A; 2H94 A; 2ODM A; 1L1F A; 2VQF O; 4K3A A; 1QHT A; 2M6Y A; 3ASO C; 1WP8 A; 5FPR A; 1OCO C; 3JAS B; 1ZL8 B; 4YHH O; 3PJS K; 4Q20 A; 1XEQ A; 3B4S A; 2YXY A; 1YDX A; 3LSQ A; 5JCO C; 1VQM V; 3F5T A; 1P84 F; 2QM8 A; 1Y6X A; 1X4T A; 1YI2 V; 1B04 A; 4NTX A; 4J9Z B; 4CC5 A; 1P7G A; 1WB8 A; 4UB6 Z; 3N2G B; 3IAY A; 1W0J G; 2EIL C; 2JIZ G; 1KUQ A; 1KBH A; 5D5Q A; 4LF9 B; 5B1B C; 3ZIA G; 3SPC A; 3IFX A; 4UVB A; 2ZM6 B; 1Q81 W; 2XAF A; 2AW9 A; 5JQG B; 2PF4 E; 4UV9 A; 1K33 A; 1XMO O; 4TOI A; 4PEL A; 3S3W A; 3STL C; 4RQF A; 5KHI A; 3F7V C; 5LXT B; 2FTK A; 3E8F A; 3QF7 A; 1SER A; 3DC5 A; 4MW3 A; 1QBZ A; 1BMF G; 2Y4U A; 2Q67 A; 1BL8 A; 5LGN A; 4LWS B; 2UUC O; 1XL4 A; 2L35 A; 3SJB C; 2HEP A; 3HKD A; 1IBM B; 4CS2 A; 2X0L A; 5KAI Z; 1ZLZ A; 4WFG A; 1PPJ H; 2HFE C; 5KHG A; 5EZY A; 4B3S O; 1S72 V; 1EN4 A; 2GTS A; 4OX9 B; 4JYY A; 1N33 B; 2AHY A; 3JAM N; 3IC9 A; 1XMQ B; 4JI4 B; 4PA4 A; 3UO2 A; 1QLE B; 3AG4 C; 4FZ0 A; 2EJ7 A; 4TV8 A; 4OXS A; 3OR6 C; 4PA6 A; 3AK1 A; 2BSK A; 5B3S B; 3ZRW B; 2D3O W; 4B3R B; 3M99 B; 1KP3 A; 5BMV A; 3JAL B; 4ZOL A; 2IW5 A; 1OCZ C; 1PP9 H; 4X8A A; 3GWO A; 4HZ3 A; 3L9D A; 2GHY A; 1NVP D; 4UCU A; 4IGG A; 4LFC O; 3APQ A; 2P90 A; 2ADQ B; 5H5N A; 1YHQ V; 3RFR A; 1I7F A; 1QR8 A; 4DR7 B; 4DV4 B; 2FL4 A; 3RBZ A; 4JV5 O; 1ZWI C; 5B1N A; 2ZIM A; 4FFK A; 1SES A; 3ABK B; 4UFZ A; 5GW7 A; 4K0K O; 3LNN A; 3OT7 A; 2NLJ C; 2LFR A; 1SQF A; 4ICG A; 4XBF A; 1LUW A; 2EBO A; 3B77 A; 2YIA A; 5IWA B; 2Q7H A; 1QNM A; 1IBK B; 3DC6 A; 5LP6 C; 4CC6 A; 1BZK A; 1OCC B; 5J9P C; 1NH2 D; 4FVM A; 1SQP H; 2DOS A; 4KXR A; 4E2L A; 3O9O A; 3T1Y B; 3AG1 B; 4TQF A; 2ZDI A; 4DR6 O; 1W2B U; 4O4J A; 1VQN V; 4X1K B; 1XI1 A; 1BT8 A; 1PNM A; 3SR2 C; 3SDL A; 2VQE B; 2BTQ A; 1NKD A; 4WBN B; 4B7K A; 2EIN C; 4ZI7 B; 2KKW A; 5B1O A; 3BHP A; 3RWR D; 1RM1 C; 3X2Q C; 2Q7G A; 1SKV A; 5FL7 G; 2WLL A; 2B1G A; 2Q5Z A; 2IBZ H; 4I50 B; 1D5N A; 4FM1 A; 3E8G A; 4TUY A; 2R72 A; 4KUM A; 1ZSP A; 5J2U A; 3K08 A; 1WA8 A; 3OGC C; 1YIT V; 2LW1 A; 4LH6 A; 5LHG A; 5KUK A; 2X7R B; 5EC2 C; 3OMN B; 1SQG A; 5KMG B; 1N36 B; 4CS4 A; 1XHZ A; 3LDE A; 2F4V B; 3ASO B; 1YXB A; 3K3W A; 1L8D A; 3QO5 A; 2ILM A; 2QE7 G; 2ZXW B; 3RYI A; 4DV3 O; 1DTO A; 4JI5 O; 3DSQ A; 4TQD A; 4EB6 A; 4LF7 B; 3H1I H; 4DR2 B; 4TV9 A; 3D3Q A; 3B8M A; 4JGS A; 5JJN B; 4NR1 A; 4PDL A; 4JTA B; 2Q7E A; 1MNG A; 1ORQ C; 4CS3 A; 2EIL B; 2GUZ A; 2QKC A; 3JSN A; 4I4T A; 4JAA A; 1NU1 H; 5B1B B; 5KAF Z; 1URF A; 2VWK A; 4XDK A; 4DR5 O; 1Y66 A; 4J7Z A; 3KG2 A; 4IIJ A; 2KG7 B; 3H1L H; 1L0L H; 1KMI Z; 1NTM H; 2ITC C; 4RAI A; 3W7X A; 1GN3 A; 4YXW G; 4B7E A; 1AB3 A; 1HNZ O; 5LHI A; 1Z2G A; 5GON A; 1FJG B; 5EBM C; 2Q0O C; 4FPP A; 1XMQ O; 3UT5 A; 4IHJ B; 1AP5 A; 3JAK A; 1E1Q G; 4J7K A; 1MMM A; 5EIB C; 4H33 A; 4B3R O; 3JD3 A; 2ZNI A; 4O2B B; 4CZZ A; 1FS0 G; 4NXN B; 3CCM V; 1K9M W; 2CE4 A; 1IVS A; 2EIJ C; 4X62 B; 1I94 O; 3NXS A; 3K57 A; 1PL0 A; 4PDV A; 4X64 O; 4IL6 Z; 4WFA V; 1FD9 A; 1YCI A; 4PA3 A; 3AG3 C; 2V7Q G; 3AG4 B; 1M90 W; 3B09 A; 3VOU A; 4UCS A; 5KA6 A; 1M56 C; 2QGN A; 1DLB A; 4UCV A; 3MHS C; 2WPD G; 4JPR A; 4X20 A; 4YJ3 B; 3QTC A; 1JFF B; 1H38 A; 4GX0 A; 2JS5 A; 4PI0 A; 5BR8 B; 1N34 B; 1R1B A; 4DV0 B; 5LMN B; 1FAF A; 5IJ0 A; 5HFL A; 2N74 A; 3LNM B; 1V55 C; 5IYZ A; 4GX1 A; 3JAW B; 4ZHQ A; 4ZBM A; 3ETG A; 4K35 A; 3ZCC A; 2HLD G; 3CS5 A; 3I55 V; 4X66 B; 1SZT A; 1NTK H; 2GSM B; 4MVS A; 1VQ6 V; 1J95 A; 2DYR C; 4DW1 A; 3WG7 C; 1Y67 A; 2CTW A; 2UXC O; 2P5O A; 4LFA O; 3A0B Z; 3ZRX A; 5FNV A; 3K5N A; 5LP6 B; 4DUZ O; 4YY3 O; 4KHP O; 3P3N A; 4FLZ A; 2CH7 A; 1Q5O A; 4IYH A; 2E5L O; 2LW7 A; 1PL4 A; 4JI2 B; 4GUN A; 5JVD B; 3ABM C; 3FYE B; 5H9C A; 1GAX A; 1H8H G; 1IBL B; 1MG1 A; 3HPL C; 5CBH A; 4I9Q A; 5EBL C; 4X1I B; 4JI1 B; 3M7M X; 2GV9 A; 3CCU V; 3OW2 U; 1K5S A; 1K3E A; 2F93 B; 4Z1V A; 4FLY A; 3AEI A; 1SA0 B; 2BOC C; 3FFQ A; 2EIN B; 5L3D A; 1S5H C; 5D5P A; 1K4C C; 1RM1 B; 2XTA A; 2IJH A; 2JGD B; 3SJC C; 4G27 B; 3X2Q B; 4D6T H; 1MOF A; 4DV1 O; 3OUF A; 1KC8 W; 4H13 B; 4GKJ B; 5LYJ B; 1G8M A; 5L3B A; 3JCZ A; 1TGO A; 4WFB V; 5B66 Z; 4H44 B; 1MZF A; 4MVO A; 1WPX A; 3FAV B; 4BR6 A; 3SPI A; 5KUM A; 3E83 A; 3NR7 A; 2MK3 A; 3ASN C; 1US6 A; 1EN5 A; 3LUT B; 4UCT A; 3ZHV A; 1EM1 A; 5L3E A; 4BIU A; 1H2K A; 3FB7 C; 4KFM A; 1IDS A; 4JI7 B; 4ABM A; 2BTO A; 1RPR A; 4F6R A; 1O9G A; 3MHH C; 3B40 A; 3HKB A; 3JD0 A; 1U97 A; 2K9P A; 2PGG A; 1X59 A; 5IY5 C; 2E76 B; 4B3T O; 2EIM B; 4DR1 B; 4LF6 O; 3H01 A; 4XDL A; 4E4E A; 4MW8 A; 2PY5 A; 1M4U A; 1HNX O; 3OTO O; 4X65 O; 3H1J H; 4DO2 A; 4LCU C; 4NXN O; 2ZT9 B; 2UXD O; 1B06 A; 1JOY A; 2LQT A; 5J2T B; 4P2Z A; 1KP2 A; 3OGI B; 4DR4 B; 1WJZ A; 1N8R W; 2V4D A; 2WWW A; 4R8C A; 1GH6 A; 4DV6 B; 1HP8 A; 3SGI A; 3BA8 A; 4JI3 B; 4JI8 O; 2ITD C; 5EYP A; 2UXB O; 2EIJ B; 3C90 A; 3SYP A; 3FB8 C; 4DV7 O; 1KQS U; 3ZED A; 1RPO A; 1BHB A; 4PJ0 Z; 1ZX3 A; 3RYF B; 2UUB O; 1M5I A; 3ZMU A; 2OCC C; 5EK0 A; 3CCR V; 3AG3 B; 2ZQM A; 3DXR A; 4HYO A; 2ZDI C; 5BZB A; 3CCJ V; 5CMU A; 4JI0 O; 4F4L A; 4B08 A; 2OTL V; 3STZ C; 3L71 H; 4DK0 A; 2UU9 O; 4LF5 O; 1D2D A; 2GBO A; 1XL6 A; 3A2F A; 3B8N A; 3IGA C; 3L74 H; 3SPH A; 2LGQ A; 2ZE8 A; 2YIC A; 2WLH A; 1ARO P; 4FM2 A; 1P49 A; 5E79 Z; 3K5M A; 1TUB B; 3ZRS A; 3G6E V; 2W6I G; 4BAY A; 3JAT A; 1FYJ A; 2HVK C; 2ADP A; 2RDC A; 3ZHT A; 2IM9 A; 1V9P A; 5GTI Z; 3OUS A; 3GVM A; 4J10 A; 2DYR B; 3WG7 B; 3ABT A; 4GKK B; 3QO7 A; 1F51 A; 3TET A; 4B3M O; 2PTM A; 2CTP A; 3OEE G; 3P32 A; 4A5U B; 2XAQ A; 4JTD B; 4MS2 A; 1VEW A; 4GCZ A; 2ZCE A; 4J80 A; 1NR1 A; 5JJE B; 2FKX A; 3ABM B; 2B9Z A; 1K5Q A; 1F4N A; 3P30 A; 3BPZ A; 2HR3 A; 2LP7 A; 1K7D A; 2ZNJ A; 4OPH A; 4TWK A; 3FB5 C; 2X6C A; 2G38 A; 2XHB A; 1AI5 A; 1JX9 A; 1IX9 A; 1KEC A; 2A9H A; 1PV0 A; 3TXS A; 4JYB A; 4KP4 A; 2DQ3 A; 1H2N A; 1OZ0 A; 4LF4 B; 5LA6 A; 2YIB A; 1Q43 A; 4CH6 A; 1RP3 B; 1Y4M A; 2YC0 A; 2QEX V; 4O4H A; 3WB2 A; 4LNU A; 4I0X A; 4CH3 A; 2IJJ A; 2YXH A; 1N32 O; 1AI4 A; 1VMG A; 1GKF A; 4XDJ A; 1Q3E A; 3H1K H; 2XAH A; 3HKD B; 2CTQ A; 4RQE A; 3ASN B; 3Q4H A; 3G6B A; 2H8P C; 2ZIO A; 1I5X A; 1VQ4 V; 2OIG A; 1OJH A; 4G2K A; 1DGS A; 4JI6 O; 5EZY B; 2GDS A; 1PNK A; 1W0K G; 2FB5 A; 1ZUQ A; 2VRZ A; 4O2A A; 3CC2 V; 4C7U A; 2L6L A; 1IXM A; 3CCQ V; 2QWQ B; 3ZS8 C; 3ZHR A; 2Q69 A; 4BW9 A; 4TV8 B; 3VQY A; 3CWB H; 3L72 H; 2JGU A; 4HAM A; 2BSK B; 5IY5 B; 4I55 A; 3CXC U; 4HNA A; 5BMV B; 4PA9 A; 1A32 A; 1WNS A; 1OCR C; 4ZOL B; 1BSM A; 1MAB G; 5EBW C; 4DV2 O; 1EZJ A; 2QWO B; 4U7O A; 4DW0 A; 5IYB O; 5DN6 G; 2LJ2 A; 2QWR B; 3E22 A; 2Q8V A; 4JAU A; 3HKE A; 1QU7 A; 5FLX N; 2Y0I A; 3RYC A; 1VAR A; 1SQV H; 4DV5 B; 1XNQ O; 3W7S A; 2EIK C; 2WLI A; 5ITZ A; 2HHH B; 3EFF K; 5LGT A; 3D36 A; 4WFH A; 3LDC A; 3K04 A; 1Q7Y W; 1H2S B; 3CCS V; 4LFB O; 5F2V O; 1T5E A; 4DR3 B; 2IU3 A; 2ZIN A; 4OGQ B; 3AK3 A; 2F43 G; 2Y69 B; 2QKA A; 1IZ3 A; 3ZHS A; 3L70 H; 4O4J B; 1VQ9 V; 4PDM A; 1NS1 A; 2C2A A; 5B1A B; 2BTQ B; 4MTG A; 5KA5 A; 4TSF G; 1J5E O; 3AK2 A; 4R6Z A; 1TVK A; 3EHB B; 1BS3 A; 1H8E G; 4GT1 A; 4GKK O; 4J9Y B; 3MDS A; 3G71 V; 2F95 B; 2QR4 A; 2K1E A; 4DK1 A; 3G67 A; 1HNW B; 3OR7 C; 3J80 N; 2P22 C; 1VQO V; 1Q82 W; 1S77 D; 2WLL B; 4H37 A; 2P06 A; 3WU2 Z; 2QM7 A; 2JVD A; 4TUY B; 2OIE A; 3ZHU A; 3O65 A; 3K9A A; 5J2U B; 1SF9 A; 1WA8 B; 4P30 A; 3CRM A; 2PUS A; 2CTR A; 3N27 A; 3CJH A; 1COW G; 4MVZ A; 1ZTE A; 3BAA A; 2YIB D; 4O4L A; 1NT2 B; 2HJF C; 4WCE V; 3I5D A; 3RYI B; 4YJ2 A; 2CUG A; 1GN4 A; 4ZIB A; 1VF7 A; 1XNR B; 4EB6 B; 1OCO B; 2B5U A; 4LF9 O; 4TV9 B; 4PHZ A; 1M93 A; 3EVK A; 1YVW A; 3FX7 A; 3CCL V; 2ZM6 O; 3SJA C; 4L87 A; 3ABU A; 4UVC A; 3RT3 C; 5JH7 A; 3GB7 C; 1ENV A; 3CYO A; 2GUZ B; 4I4T B; 1HDJ A; 2Q9L A; 1S76 D; 1NI8 A; 1Y74 A; 1R3I C; 5IYC O; 1RSO A; 2DE0 X; 5LMU B; 4IIJ B; 1FPO A; 4NXM B; 1IBM O; 3SPG A; 3OD4 A; 2EZO A; 2Q0A A; 3VQV A; 3D3I A; 3E8H A; 4O4I A; 5GON B; 1YEW A; 1VQK V; 2A7W A; 3JCU Z; 2QJ1 A; 3UT5 B; 3B2E E; 2JJ1 G; 1EZV H; 4OX9 O; 1R3L C; 2QWN B; 1N33 O; 3J7A U; 3JAK B; 1GK9 A; 1KKC A; 4JI4 O; 4FFB A; 1WPB A; 2IJI A; 4L8J A; 4LF8 B; 4RO2 A; 3HKC A; 2W0X A; 1NBM G; 4DUY B; 3JSL A; 1FFX A; 2YXL A; 2R9R B; 3LDD A; 4YIP A; 3HB3 B; 4JZG A; 2ATK C; 1UFI A; 3SYQ A; 3U11 A; 3RW0 A; 3A8T A; 3CME V; 3VQW A; 2JEU A; 5K1X A; 3E2E A; 5KX5 A; 4GLX A; 5CA1 A; 4D7S A; 4JYA B; 2LO1 A; 4DR7 O; 1OCR B; 4DV4 O; 1KU9 A; 4X20 B; 2NN4 A; 5IDJ A; 2DYS C; 1DF4 A; 1HR0 B; 3CX5 F; 5IJ0 B; 2ETN A; 2WLJ A; 4UUJ C; 1OCZ B; 3RGB A; 1PM9 A; 1G1X B; 3W7T A; 5IYZ B; 3LSU A; 4ZHQ B; 4F6E A; 2WA3 A; 3MD0 A; 5IWA O; 2JK5 C; 3KCY A; 2IJK A; 1IBK O; 1SS3 A; 1YSC A; 1L0N H; 2F23 A; 2X6A A; 1QR9 A; 1LNQ A; 2R9A A; 3T1Y O; 4QNH B; 2EIK B; 2IH1 C; 4MVM A; 1OV9 A; 5FNV B; 5KHK A; 1GTO A; 3UCS C; 2CH7 B; 4FLW A; 5LGU A; 1KYO F; 2HVJ C; 5KLV H; 1YTF B; 2DWD C; 5E1A C; 1ZAU A; 4BIZ A; 4YIO A; 2VQE O; 2PI5 A; 3JAR A; 2PZS A; 2ZE6 A; 2YI9 A; 4G28 B; 2Z0A A; 3K58 A; 1FXK A; 2A0L A; 3G80 A; 3DTU B; 4NB5 A; 1CP9 A; 1GO3 F; 1BQZ A; 4AQY B; 2ZR2 A; 2Q73 A; 5H6R A; 4AHC A; 3BAB A; 3K5L A; 1EBO A; 3OM3 B; 1B6Q A; 1SQB H; 1Y76 A; 2UUA B; 1JPX A; 1XBL A; 3T4Z A; 3W7W A; 4UCR A; 1N36 O; 3AG7 A; 3CRR A; 2HG5 C; 1V54 C; 1YZB A; 2F4V O; 3CD6 V; 1VQP V; 3BEH A; 4K8Z A; 4I7Z B; 5CBG A; 3ML0 A; 1VQ5 V; 2ARH A; 3D8C A; 2RN9 A; 4MT8 A; 4LF7 O; 4DR2 O; 4X89 A; 3H9V A; 2VQF B; 1I0H A; 4K8X A; 4R7C A; 1TAE A; 2YI8 A; 4QE9 A; 1BGY H; 3CCE V; 2QWP B; 1S0V A; 4YHH B; 1P7B A; 3QNE A; 2WAM A; 1Q90 D; 4TT3 G; 3UKM A; 4NTY A; 1QVF U; 1Z5W A; 3ZMT A; 1Q6U A; 2DQ0 A; 2JJ2 G; 4F6R B; 1VF6 A; 2ZE5 A; 4X1Y A; 3HKB B; 1GM9 A; 2WLK A; 2QTS A; 4MTO A; 5H2F Z; 3JYC A; 4UV8 A; 2UXN A; 2N05 A; 5LOV A; 3QG5 A; 4MTF A; 1FJG O; 1NZ6 A; 2QA4 V; 2XAG A; 2E74 B; 2LFS A; 2XAS A; 4LF8 O; 1XMO B; 4X88 A; 1XUQ A; 2CK3 G; 4N21 A; 1NQT A; 3ZN0 A; 4J7J A; 3OMA B; 2JS3 A; 1G6U A; 3K06 A; 2UUC B; 2OT5 A; 2KSD A; 2NR5 A; 4QIW F; 4X62 O; 1AIL A; 2H3O A; 3CP1 A; 5EC1 C; 3AG2 C; 3ETE A; 4JYA O; 3D36 C; 5EYP B; 4B3S B; 1EFR G; 5C8Y A; 4LR3 A; 1AVM A; 2RNB A; 3UQ8 A; 2LGW A; 1NVP B; 4GX5 A; 2A79 B; 2P6J A; 3OAA G; 3DXR B; 3L73 H; 4RUF A; 5BR8 O; 1N34 O; 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