The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
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sequence length |
88
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structure length |
88
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Chain Sequence |
GSSGSSGSYYDILGVPKSASERQIKKAFHKLAMKYHPDKNKSPDAEAKFREIAEAYETLSDANRRKEYDTLGHSAFTSGKGQSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| molecule keywords |
DnaJ homolog subfamily B member 9
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| publication title |
Solution structure of J-domain from human DnaJ subfamily B menber 9
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
17
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| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QWN B; 3UCS C; 2YS8 A; 2KQX A; 3UO3 A; 2QWP B; 2CUG A; 2LO1 A; 2QWR B; 3AG7 A; 2GUZ B; 3APQ A; 2DN9 A; 2Y4U A; 1N4C A; 2L6L A; 2YUA A; 1IUR A; 1XBL A; 1HDJ A; 2GUZ A; 2QSA A; 4J7Z A; 2N04 A; 1GH6 A; 1NZ6 A; 4IT5 A; 1WJZ A; 2EJ7 A; 3BVO A; 1BQZ A; 2CTP A; 1FAF A; 4J80 A; 2DMX A; 2CTQ A; 2Y4T A; 4RWU A; 1FPO A; 1BQ0 A; 2M6Y A; 2LGW A; 2CTR A; 2QWQ B; 2CTW A; 3APO A; 3UO2 A; 2OCH A; 2N05 A; 2QWO B; 2PF4 E; #chains in the Genus database with same CATH topology 4P9O A; 3K0G A; 2UXB B; 1RFY A; 3CX5 F; 1PL4 A; 4DK0 A; 3J7A U; 3D36 C; 2WLL B; 4MW3 A; 1VQ4 V; 1V54 C; 1SQQ H; 2OTJ V; 4ASU G; 2EBO A; 3L73 H; 1SA0 B; 1QR8 A; 2RMK B; 1JX9 A; 3ZMS A; 2X0L A; 1OCO C; 4DR6 O; 3WU2 Z; 2ZM6 O; 1THZ A; 3DC6 A; 4I4T A; 4PA3 A; 2AXT Z; 5EBW C; 2A0L A; 2XAJ A; 2HP8 A; 2HLD G; 4DR7 B; 5LL6 Y; 4LF6 O; 2QKA A; 3TCU A; 4YJ3 A; 3C3T A; 1CEZ A; 1BMF G; 1VMG A; 2E3C A; 3VOU A; 1PPJ H; 3JAR B; 2CH7 B; 3BEH A; 2QWP B; 1BE3 H; 5CMU A; 5GTI Z; 1ARO P; 4LF7 B; 4AQY B; 5KMG A; 4WFA V; 3U10 A; 3GWK C; 1EFR G; 1QU7 A; 4K35 A; 1ZLZ A; 4TUY A; 2OCC B; 1M93 A; 5B1N A; 4UFZ A; 2FML A; 3OTO O; 2YSU B; 1YF2 A; 3N2K A; 3QVN A; 3SR2 C; 4O2A B; 2KKW A; 3LNM B; 4EEQ A; 2CUG A; 3I56 V; 2Q7E A; 2YC0 A; 5D5P A; 2WA4 A; 4DR1 O; 2Z3Y A; 4DV6 O; 1ZL8 B; 4DR5 O; 3CEI A; 1EN6 A; 1N8R W; 3ABK B; 3K57 A; 5IE9 A; 1F4M A; 5GTH Z; 2VWJ A; 4X1Y B; 2D3O W; 2WLI A; 5EYP B; 4Z1V A; 2RNB A; 2H94 A; 3T1H B; 2DE0 X; 4F6R A; 2WSS G; 1JFF B; 1QBZ A; 1J5E O; 2XOK G; 1BQ0 A; 3ZHU A; 2DJV A; 3HKD A; 1F4N A; 5IDJ A; 2VQE O; 1WPB A; 1WN7 A; 2O57 A; 1RSO A; 3H01 A; 1ZSP A; 4MTG A; 3OR7 C; 3E35 A; 1EM1 A; 2Y4U A; 3CP1 A; 5LP6 C; 5FNV A; 3ZCC A; 2JGD B; 5EBL C; 3N2G B; 1NZ6 A; 3CCS V; 4MW8 A; 2BTQ A; 2CTP A; 1P7B A; 2F1M A; 3AG1 C; 3SDL A; 5LGN A; 2X6C A; 4F6E A; 1NR7 A; 4LH7 A; 1Q3E A; 1H2S B; 5JCO A; 4JTD B; 4NR1 A; 2QM4 A; 5BXZ A; 2ZIO A; 2GSM B; 1IBK B; 2YID A; 4YY3 B; 2WLK A; 2VQF O; 3UCS C; 4JAV A; 1BL8 A; 2GUZ B; 4K8X A; 2PUS A; 5AG2 A; 1M9N A; 3TJT A; 2GHY A; 1N0N A; 2ADP A; 1HNZ B; 1IBM O; 2E75 B; 3FYE B; 1YDX A; 5DED A; 4D7S A; 1I08 A; 1WB8 A; 3F7V C; 4ZBM A; 1SQF A; 1N33 O; 5KA5 A; 3E8G A; 2LW1 A; 3BRC A; 2YIB A; 3SYP A; 2ARH A; 3D3Q A; 4I0X B; 4DV1 O; 4R7C A; 1XNQ O; 1XMO O; 3KZI Z; 2EIN B; 4P2Z A; 1RM1 B; 3CD6 V; 2IW5 A; 1IBL B; 1AJP A; 5IYD O; 2QDO A; 4KHP B; 4WFE A; 1SQP H; 1DLB A; 2WA3 A; 1KEC A; 4WBN A; 3N27 A; 3E89 A; 3MD0 A; 2EIK C; 1YIT V; 2ZR3 A; 3FB7 C; 3JD1 A; 4JPR A; 4JYY A; 1NTZ H; 3OFN G; 1O9G A; 4JF3 A; 3ZHV A; 1V55 C; 3UT5 B; 4MVU A; 1MSW D; 3K9A A; 4Q20 A; 1G4Y B; 1GKF A; 1VQ6 V; 3AEI A; 4WFF A; 2IM9 A; 3VQX A; 2UXD O; 1XL4 A; 3LDC A; 5CBH A; 1QLE B; 3ASO B; 3DXR B; 2R9A A; 5BY1 A; 3KKY A; 4K8Z A; 3CRC A; 4BR6 A; 3W7X A; 3MAQ A; 2CDY A; 4FM2 A; 1M57 B; 3RYC A; 4DV7 O; 3ZRX A; 1AI6 A; 3ZHR A; 1B3Q A; 3CC2 V; 3EFF K; 3CRQ A; 4G2K A; 1HNX O; 4NTW A; 4LFC O; 5A2Q N; 5H6Q A; 5CA1 B; 4H13 B; 3B77 A; 1IUR A; 5LHG A; 1ENV A; 4ZIB A; 4X1K A; 1BT8 A; 3RYH B; 1WP8 A; 1N32 O; 3L9D A; 3SPI A; 3H1H H; 4RUE A; 2Q68 A; 5KHG A; 1Y74 A; 4X9Q A; 4CZZ A; 3KCX A; 1I5X A; 4JYB A; 3OM3 B; 1OCR B; 3C90 A; 1TUE B; 3MHS C; 4NKG B; 4OXS A; 2JS5 A; 1N34 B; 4AI8 A; 4JI1 O; 3D36 A; 1HW7 A; 4I7Z B; 2CTR A; 2R9R B; 3RYF B; 2JJ2 G; 5GW7 A; 4K3A A; 2FYU H; 3K5N A; 3JCU Z; 4EB6 B; 3OEE G; 4W4K A; 4YHH B; 3UO3 A; 5IT9 N; 3D8C A; 2BSK A; 2QWR B; 4PI2 A; 5EZY B; 3LDD A; 1AR1 B; 5DM6 V; 4ABM A; 1VP7 A; 1Q5O A; 3ABM B; 1VQO V; 2F95 B; 3FB8 C; 1Y67 A; 2Y69 C; 4JTA B; 3MHH C; 4ZI7 B; 4I9W A; 3WG7 B; 2W6I G; 1WA8 A; 1MA1 A; 2P67 A; 2Q8V A; 4DV4 O; 5LOV B; 3LDE A; 2YEV B; 3O9O A; 5JJN B; 3ZRW B; 2FL4 A; 2WLJ A; 3IC9 A; 3QF7 A; 3BAB A; 4IIJ B; 1FXK A; 1GK9 A; 1GN6 A; 1SC5 B; 1Q7Y W; 5IY5 B; 4EKW A; 2UXB O; 3OUF A; 4DR3 B; 2Q7H A; 1XL6 A; 3I55 V; 2ZE8 A; 1XOU A; 3BFR A; 3CMA V; 4DV3 O; 3U11 A; 1NS1 A; 5J2U A; 1VQ8 V; 1HNW B; 4LF9 B; 2IU0 A; 4KFM A; 3E8B A; 3RBZ A; 2NLJ C; 1M5I A; 1K5Q A; 1M4U A; 4MVO A; 3SYC A; 3BAA A; 1JVM A; 2ZR2 A; 3ABT A; 2R70 A; 2UUC B; 4DR7 O; 2ITC C; 2F66 C; 3B4S A; 1YJN V; 4LFB B; 2RCV A; 4R8C A; 3JYC A; 2UXN A; 4YIO A; 5LA6 A; 1QVG U; 5JWP A; 1PNM A; 2QSA A; 1JR9 A; 1Q81 W; 3AG3 B; 3L70 H; 1GM9 A; 2GV9 A; 2AHZ A; 3FAV A; 1XUQ A; 5L3G A; 3T1C A; 4TV8 B; 1KKC A; 4AQY O; 4KP4 A; 4PDR A; 3CC7 V; 3K5O A; 3AG2 B; 1GO3 F; 5CA3 A; 1H2M A; 1EN5 A; 1AVM A; 5LP6 A; 4J7Z A; 3JAM N; 4FIP C; 1S5J A; 4D7T A; 2C2A A; 2Q0A A; 4R50 A; 4O4L A; 2KSD A; 5E1A C; 1FYJ A; 3OEH G; 1HP8 A; 1QVF U; 2ZXW C; 2QWO B; 2ZE5 A; 1Z5W A; 3JAS A; 4LCU C; 3B40 A; 2H3O A; 1WAZ A; 1OCR C; 1K9M W; 2DW4 A; 5JJJ B; 1I5Y A; 4PHZ A; 4RUF A; 4PD4 F; 4HNA B; 2B5U A; 3RFR A; 3RW0 A; 1X4T A; 1AP5 A; 2ODM A; 2WLL A; 3CCE V; 4XDK A; 1HR0 B; 2LJ2 A; 2UU9 B; 4PA4 A; 4X65 B; 1SA0 A; 1PV0 A; 3T1H O; 4QJF B; 4FFK A; 4HBN A; 4TV9 B; 1WNS A; 3ABM C; 2IJK A; 1XHX A; 3BHP A; 4N21 A; 1BQZ A; 3CCM V; 1G8M A; 4PA9 A; 1XQ8 A; 1GN3 A; 1XNR B; 1BCC H; 4H44 B; 1K4C C; 1Q6U A; 3JAK B; 1VQM V; 2ADQ B; 3HKC B; 2X6B A; 1KP3 A; 4RQF A; 3K79 A; 5KHH A; 1IZ3 A; 4QNH B; 1TA8 A; 3IFX A; 1S72 V; 4KL1 A; 2NNU A; 1NTM H; 2YUA A; 2VRZ A; 4O4H A; 3JAR A; 3IGA C; 1W0J G; 1K73 W; 1MNG A; 2CE4 A; 3HPL C; 3RVY A; 4JYA B; 1YSC A; 4IT5 A; 1IBK O; 4LC1 A; 4YY3 O; 1M56 B; 4J80 A; 4UVB A; 1I0H A; 1YJ9 V; 3ASN B; 3A8T A; 3QNE A; 2B1G A; 5HFL A; 3S3X A; 4G28 B; 3KG2 A; 3FD9 A; 1HNZ O; 4U7O A; 4PJ0 Z; 4O2A A; 2QJ1 A; 2PYJ A; 1IX9 A; 1ZTE A; 1VF7 A; 1L0L H; 5B3S B; 1R73 A; 4FFB B; 1XHZ A; 1H8E G; 2ZDI C; 4JI0 B; 1QLN A; 4R6Z A; 1KB9 F; 1Q8I A; 5IJ9 B; 2PI4 A; 1ZL8 A; 3UO2 A; 3AK1 A; 3HKE B; 1SZX A; 1VEW A; 3CJH B; 3P30 A; 1OV9 A; 5JVD B; 1SRY A; 2PI5 A; 2JEX A; 4X1Y A; 3QO5 A; 4NB5 A; 3HKB A; 1B6Q A; 4WCE V; 5JQG B; 2GBO A; 1SQX H; 5EYP A; 2XT9 A; 1WJZ A; 2LFS A; 1IBL O; 4KHP O; 2Q9L A; 1NH2 B; 2BE3 A; 4ICG A; 2LGW A; 1R3J C; 2ZT9 B; 2DYS B; 3ETE A; 2EIL B; 4DW0 A; 1W59 A; 2YXH A; 2DWD C; 5B1O A; 3B8N A; 2AHY A; 1NQT A; 4PA7 A; 3WB0 A; 3JCZ A; 3D3I A; 2JGD A; 2QGN A; 2DMX A; 3N2G A; 3TK1 A; 2EIM C; 4LF5 B; 4X66 O; 5BR8 B; 1GN2 A; 2IH1 C; 4JZG A; 3APO A; 1QHT A; 2E74 B; 4JZ2 A; 1L1F A; 2K1E A; 1R6K A; 1GN4 A; 4RQE A; 3OMI B; 3JD3 A; 1RP3 B; 3QO7 A; 1FXK C; 2JJ1 G; 4FPP A; 1HDJ A; 2GUZ A; 3U0Z A; 1Q82 W; 3A2F A; 4RAI A; 2RDC A; 3OAA G; 5J2T A; 2UUA B; 4IL6 Z; 1R3L C; 2A79 B; 1A32 A; 4B7E A; 1H38 A; 1SQG A; 5TIS Z; 1T5E A; 2KG7 A; 3EVK A; 3BPZ A; 4JGS A; 5EBM C; 5K1P A; 4BW5 A; 5LXT B; 4QGP A; 3GVM A; 4HZ3 A; 5C93 A; 3ETD A; 3ZJZ A; 3CRM A; 3ZMU A; 2BCC H; 1RPO A; 1V9P A; 1VIB A; 4I0X A; 4LNU B; 1N34 O; 4E2L A; 3LUT B; 2QM7 A; 4CBC A; 3ZHS A; 1LUV A; 1PD3 A; 1CPY A; 3ABU A; 5LMN B; 4PA6 A; 1P7G A; 2JRI A; 3LNN A; 3W7U A; 2JK5 C; 1WP7 A; 2V7Q G; 1DGS A; 4JV5 B; 3P3N A; 2EUL A; 4YHH O; 2QM8 A; 1FXH A; 4I9Q A; 1QCE A; 4CH5 A; 4B7K A; 5L3C A; 1HWY A; 3ASN C; 1S5H C; 3UT5 A; 4UXN A; 5IYB O; 4B3S B; 4EFB A; 4DUY B; 3OMN B; 4I50 B; 5KUK A; 1F7Y A; 2YXL A; 3SJB C; 4LF8 B; 1JJ2 U; 3DXR A; 3OW2 U; 2P5O A; 2FKX A; 3CYO A; 1MAB G; 2ITD C; 2ZNJ A; 1H2L A; 2QE7 G; 2KB1 A; 5IWA B; 2H8P C; 1VQ9 V; 2HHH B; 1FJG B; 3CB2 A; 1N36 B; 3FX7 A; 1KUQ A; 1S3J A; 3QO8 A; 4TQD A; 4DR2 B; 3AK3 A; 4UVA A; 3CCR V; 1MZE A; 3SYA A; 4FLZ A; 3E2E A; 4C7U A; 4DR3 O; 3ETQ A; 1AIL A; 3LSQ A; 2YI8 A; 1FAF A; 1NI8 A; 2E5L B; 1GM7 A; 4GYC B; 1R6T A; 1WLE A; 1Y6X A; 2DYS C; 1HNW O; 2EIL C; 4LF9 O; 1PNK A; 4LFA B; 5IYC O; 4LWS B; 1MOF A; 4AHC A; 1KBH A; 4Z2W A; 1DF5 A; 2LQT A; 4XDJ A; 5CBG A; 3ZRV A; 4TUY B; 1AI7 A; 1DTO A; 2BOC C; 2UUC O; 4MVR A; 1R6N A; 4ZHQ A; 4LFB O; 3N2K B; 5KHK A; 3K0D A; 2DQ3 A; 2QKS A; 1L8D A; 4O2B A; 3H1K H; 5F2V O; 1XDC A; 2JDI G; 1S0V A; 3ZHQ A; 3RYF A; 1OHH G; 3RGB A; 4EB6 A; 4CS2 A; 3CCL V; 3L71 H; 3SGI A; 3JAL A; 4QIW F; 5EZY A; 1L0N H; 3FB6 C; 4K0K O; 3ZIA G; 4FK5 C; 2ZCE A; 1K92 A; 3JAT B; 4J7J A; 4JI2 B; 2OCC C; 2WLI B; 5LOV A; 5H5N A; 3DTU B; 5IJ0 A; 4CH4 A; 1CXZ B; 4J9Y B; 3ZRW A; 3FFQ A; 3GB7 C; 1G1X B; 2ILM A; 3SPH A; 3HKD B; 4IIJ A; 2Q73 A; 5IYZ B; 5CB4 B; 4GX2 A; 2F43 G; 3ABK C; 1ZWI C; 1VQN V; 2JGU A; 2UUB B; 2BTO A; 3O65 A; 2AZ2 A; 2CAZ C; 1MG1 A; 1DK1 A; 1HR0 O; 5BMV A; 2UU9 O; 2Q6A A; 3R66 A; 4X65 O; 3L75 H; 2P7T C; 1UPG A; 2ZDI A; 1XEQ A; 1SZT A; 1OCZ B; 1KU9 A; 2VWK A; 1BZK A; 1Q6I A; 4X20 A; 4OPH A; 3T1Y B; 3ZRS A; 1XBL A; 4FM0 A; 1XNR O; 3K5M A; 1YEW A; 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2F23 A; 3JAW B; 3GWO A; 4JAA A; 2ZE6 A; 1M57 C; 4LF7 O; 2XAF A; 4TWK A; 4X89 A; 2XND G; 1IVS A; 2ZKO A; 2EZO A; 2A9H A; 2UUA O; 1N0J A; 3K9S A; 4FZ1 A; 3CWB H; 2YXY A; 5JH7 A; 1TAE A; 1W0K G; 1U97 A; 2UXC B; 2RN9 A; 4X1I B; 1K33 A; 4CS4 A; 1YTF B; 3EHB B; 3AK2 A; 1OCZ C; 2BSK B; 1QR9 A; 3TET A; 5IJ9 A; 4UB6 Z; 2OYQ A; 2YS8 A; 4UUJ C; 1EZJ A; 3AG4 B; 3HKE A; 3CJH A; 5JVD A; 1M90 W; 2MW2 B; 3M99 B; 2K9P A; 4BWA A; 4DO2 A; 1AJQ A; 1ROP A; 1WA8 B; 5JQG A; 2OIG A; 1VQK V; 4BIU A; 2BOB C; 2IJI A; 2RJZ A; 5LMN O; 4FLU A; 2N74 A; 2N05 A; 4JTC B; 1E1Q G; 4JV5 O; 2Q67 A; 4X64 B; 4X88 A; 3S3W A; 3DSQ A; 5FPR A; 1Y76 B; 4JI6 B; 1Q86 W; 2PZS A; 4JI3 B; 5LMU B; 1Q6H A; 2CGO A; 2YIA A; 2EZP A; 1TUB B; 4TSF G; 3G67 A; 4QE9 A; 3SYO A; 4B3S O; 4J11 A; 4DUY O; 4UCR A; 3WG7 C; 4NXM B; 3ICX A; 2Z5U A; 1H8H G; 4LF8 O; 3HR0 A; 5E79 Z; 3STL C; 2P4K A; 2AGA A; 1SER A; 4PI0 A; 3CS5 A; 2CH7 A; 5GON B; 1US6 A; 5HFM A; 4LF4 B; 1GH6 A; 5IWA O; 5B66 Z; 1NKD A; 2HHH O; 5EK0 A; 1FJG O; 1N36 O; 2DYR C; 2XAQ A; 5IY5 C; 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