The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
SEALKILNNIRTLRAQARESTLETLEEMLEKLEVVVNERREEESAAAAEVEERTRKLQQYREMLIADGIDPNELLNSMAAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Dna binding protein
|
| molecule keywords |
DNA-binding protein H-NS
|
| publication title |
H-NS forms a superhelical protein scaffold for DNA condensation.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
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| total genus |
29
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| structure length |
81
|
| sequence length |
81
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | H-NS histone-like proteins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LR1 A; 3NR7 A; 2MW2 B; 1NI8 A; 4ICG A; 1OV9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W6I G; 3CCR V; 1ZL8 A; 2RN9 A; 1V55 C; 1OZ0 A; 3IC9 A; 4GX0 A; 2CGO A; 1VQ4 V; 2Y0P A; 3HKC A; 3ML0 A; 2Q6A A; 1QLE B; 3VQY A; 1TUE B; 3AEI A; 1Q3E A; 3D3Q A; 3EFF K; 1QR8 A; 3J80 N; 5KX5 B; 3I55 V; 4X88 A; 4UCS A; 3ZHT A; 4P9O A; 5JWP A; 3FB6 C; 1Z5V A; 1VAR A; 3A2F A; 3SYQ A; 4DUZ O; 2EUL A; 3ZRS A; 1Y76 B; 3WB2 A; 1GN2 A; 1KKC A; 5KX5 A; 3G6B A; 2GSM B; 3M7M X; 4WFB V; 1E1R G; 2G38 A; 3ABM B; 3QG5 A; 3AG2 C; 3OUS A; 3RVZ A; 3G71 V; 5CA3 A; 4LC1 A; 3CJH B; 3T4D A; 3M99 B; 1AR1 B; 3CD6 V; 3CS5 A; 3U0Z A; 4ZOL B; 1VQN V; 2WSS G; 5L3C A; 4LFB B; 2AZ2 A; 5IJ0 B; 2F66 C; 4DR1 O; 2MW2 B; 3E86 A; 1W2B U; 5B5E Z; 2Y48 A; 5BR8 O; 4JTA B; 3BA8 A; 3CJH A; 4J7Z A; 2XUM A; 4FM2 A; 1YIJ V; 2YIB D; 4ZOL A; 2Y69 B; 3N2G B; 4JTD B; 4H0L B; 2CTW A; 4A5U B; 3ZMZ A; 3VQV A; 5IJ0 A; 1US6 A; 1RP3 B; 1FPO A; 2UXB B; 1WPB A; 3K9A A; 3DXR B; 4PJ0 Z; 2JJ1 G; 3RWR D; 1HNX B; 4HNA B; 1QQC A; 3JD1 A; 3U10 A; 3N2G A; 4JI0 B; 4O4J B; 4ZI7 B; 4LFC O; 4N23 A; 3AG4 C; 1IBL B; 2XAF A; 2Q4P A; 3DXR A; 3WG7 B; 4YY3 B; 4HNA A; 1GO3 F; 2QWR B; 1WPX A; 4LF6 O; 5FL7 G; 3H1L H; 4NXM O; 5LA6 A; 1KBH A; 3DSQ A; 4O4J A; 3UQ8 A; 4ZI7 A; 4UV9 A; 1QVF U; 3HKE A; 2DWD C; 3QNE A; 1S72 V; 3CME V; 2P4V A; 3B40 A; 2ETN A; 4RQF A; 2F95 B; 3SYO A; 4JI4 B; 3ABU A; 1COW G; 2B9Z A; 4JYA O; 3L71 H; 3X2Q C; 2A3Q A; 1IX9 A; 1VIB A; 5IYZ B; 3P3N A; 1S5H C; 1KKD A; 1CEZ A; 4Z1M G; 1FJG O; 2BOC C; 2QA4 V; 2QM7 A; 4WF9 V; 2IU0 A; 2X6C A; 1WNS A; 2WLJ A; 1NJI W; 1JPX A; 4DV2 O; 4OX9 O; 4UCO A; 5LGU A; 3UT5 B; 5IYZ A; 1FYJ A; 1KMI Z; 1LUW A; 4Z2W A; 1BHB A; 5B1A B; 4TV8 B; 1IXM A; 4NB5 A; 5KHK A; 3HKD A; 1R3J C; 5DED A; 1H2L A; 3C3T A; 5LMN O; 1NVP B; 4YIP A; 3UT5 A; 2ZD9 A; 1N8R W; 1N0N A; 1H2S B; 1N32 B; 4LF8 B; 1VF6 C; 4J10 A; 3OW2 U; 3B4S A; 2UU9 B; 2ZKO A; 4D7S A; 2QWN B; 1J5E B; 4TV8 A; 1WP8 A; 2YEV B; 1MAB G; 1Q82 W; 3RGB A; 3CYO A; 2AXT Z; 1WAZ A; 4AI8 A; 2K9P A; 4B3S O; 4XDJ A; 3CRR A; 5IY5 B; 5CBH A; 4DUY B; 4TSF G; 2RQ6 A; 3ZHS A; 1ORQ C; 4KUM A; 1PV0 A; 1Q6U A; 1HNZ O; 2YEV A; 1FFT B; 1KP3 A; 4KFM A; 1MA1 A; 3AG1 B; 4UB8 Z; 2JEU A; 4U7N A; 4DR5 O; 2DE0 X; 1F23 A; 5B1N A; 1PNL A; 2PYJ A; 1W59 A; 1SC5 B; 1IBM O; 5JH7 B; 4CC5 A; 2UXD B; 3OMA B; 5EK0 A; 1SER A; 2YXL A; 1AJP A; 4O4L B; 2HFE C; 5JJN B; 1N36 O; 1SRY A; 4UXN A; 5KAF Z; 3FB7 C; 1M56 B; 5FPR A; 2QWP B; 2ZM6 B; 1DK1 A; 4JV5 O; 5JH7 A; 2ZE5 A; 3JAM N; 1KUQ A; 4O4L A; 3Q4H B; 2EIL C; 2FB5 A; 5JQG B; 5CB4 B; 2ZIN A; 1TGO A; 1GTO A; 2E76 B; 3B77 A; 1XL4 A; 4UCV A; 3KCY A; 1H2N A; 1OCC C; 3JSL A; 2VQF O; 3SYC A; 3RYI B; 4LNU B; 1YF2 A; 4F6E A; 3Q4H A; 1IUR A; 1XQ8 A; 3JAW B; 4BAY A; 1EN4 A; 1AIL A; 5JQG A; 5CB4 A; 4JYC A; 4X89 A; 3ABT A; 1ZWI C; 2FL4 A; 3ZIA G; 1YCI A; 3WFV A; 4B3T B; 3RYI A; 1FFX B; 4LNU A; 1Q81 W; 3MD0 A; 3ABL B; 1M9N A; 1MOF A; 1R6K A; 3MHH C; 1PD3 A; 3OFN G; 4NTY A; 3UO3 A; 4NYK A; 4H13 B; 1FFX A; 2P22 C; 1OCR B; 4X20 B; 4I4T A; 3ZRV A; 3SYP A; 3SPG A; 5FLX N; 4DR6 B; 4CH3 A; 1RM1 C; 1QCE A; 2H3O A; 3ETG A; 4OPH A; 2BSK B; 4KL1 A; 1Q43 A; 4ASU G; 3WU2 Z; 4X20 A; 5J2U B; 1AR5 A; 2QR4 A; 1B3Q A; 1GH6 A; 1SZT A; 4DV1 B; 2PZS A; 5FNV B; 4U7O A; 5IE9 A; 3IC7 A; 5J2U A; 1GMG A; 2HJD A; 4QJF B; 1JX9 A; 2AHZ A; 4B7E A; 1GM9 A; 3DTU B; 1VQ5 V; 5CA0 B; 3M8A A; 2OTJ V; 1K7D A; 1PPJ H; 2WA4 A; 5H5N A; 2JS5 A; 5FNV A; 1VQ7 V; 4JI6 B; 2CK3 G; 5D5P A; 2W0X A; 4ZIB A; 2EIN C; 3RBZ A; 4DV7 B; 3BHP A; 5CA0 A; 2Z0A A; 1NTZ H; 2JGU A; 1L0L H; 4I9Q A; 4GYC B; 1NH2 B; 4ABM A; 2IJK A; 1JA8 A; 2QEX V; 1ZSP A; 1R3L C; 1U97 A; 2OCC C; 2V7Q G; 1WJZ A; 1FXH A; 2HR3 A; 4LF5 O; 1VQ9 V; 1NT2 B; 1HR0 B; 2Z5U A; 4JI1 O; 2ITC C; 3A0H Z; 2A0L A; 3RN4 A; 3HR0 A; 4ICG A; 1EN5 A; 2ATK C; 2K1E A; 4CBC A; 1NVP D; 5KUM A; 3OTO O; 4B3M B; 4NKG B; 4DV0 O; 1V55 B; 4GKK B; 1NTM H; 1JJO A; 2EZO A; 2UUC O; 1AB3 A; 2ODM A; 1RPR A; 2DYR C; 2UUB O; 1GAX A; 4YJ2 B; 4PDM A; 3APQ A; 2IU3 A; 4PI2 A; 2E5L B; 3LSU A; 4U3J B; 1R3K C; 1NQT A; 4DR4 O; 3F7V C; 2YI9 A; 1XNQ O; 5GW7 A; 4PA4 A; 3CPW U; 4FFB B; 2YIC A; 4X1Y B; 4YJ2 A; 1QR9 A; 2UXC O; 3EXA A; 5LMU B; 2XT9 A; 3RT3 C; 4LF9 B; 4RAI A; 2DMX A; 4UUJ C; 4AQY B; 1EZV H; 3T4Z A; 1NZ6 A; 1LR1 A; 4X1Y A; 2VQE O; 1P7B A; 3APO A; 5B3S B; 4GCZ A; 1N33 B; 3QTC A; 4BW5 A; 1VF5 B; 1XHX A; 3K03 A; 2KB1 A; 2B1I A; 2CUG A; 1Z2G A; 2XTA A; 4MVU A; 3D3I A; 3LDD A; 4CC6 A; 2L6L A; 3CCS V; 4KHP B; 2Z3Y A; 4CS3 A; 2GTS A; 4RUF A; 2P90 A; 2YC0 A; 1K33 A; 1NTK H; 4DV3 B; 3K5L A; 3LSS A; 3OMI B; 2QTS A; 1GM7 A; 4J7J A; 4UFZ A; 2JJ2 G; 3CHX A; 3ASN B; 4FLZ A; 2PYL A; 1IZ3 A; 3K58 A; 3ETD A; 1PL0 A; 3AK1 A; 2LGQ A; 4JZG A; 3RYF A; 1X59 A; 1M93 A; 2DYS C; 1FD9 A; 4FPP A; 3ZRX A; 1P84 F; 4DV4 O; 2EIM B; 3LSQ A; 4P2Z A; 2H94 A; 1JJ2 U; 1IVS A; 2HKO A; 4YJ3 B; 1KEC A; 3SPH A; 1K8A W; 5GTH Z; 3G80 A; 1AJN A; 1N34 O; 4DV5 B; 3E8F A; 5C93 A; 1XNR O; 1JVM A; 1OCO B; 2OIE A; 4YJ3 A; 3CMA V; 3BPZ A; 3OAA G; 2EIJ B; 3SPJ A; 3ZHR A; 5ITZ B; 1Y4M A; 2F23 A; 3CCE V; 3OUF A; 2QGN A; 1PNM A; 3L75 H; 4PEL A; 1DF4 A; 1R6N A; 3GB7 C; 4GX2 A; 1B06 A; 2YXH A; 2UXN A; 2ZDI C; 5EBL C; 5B1O A; 2GBO A; 4X66 O; 1OCZ C; 4B08 A; 5ITZ A; 2D2C B; 3T1Y B; 4K0K O; 2PUS A; 3WB1 A; 4J11 A; 4FM1 A; 4JAA A; 4JI2 B; 3HKB B; 3ZN1 A; 1H2K A; 4X64 O; 2BOB C; 1OHH G; 1XBL A; 4K8X A; 3TCU A; 4DXW A; 1RPO A; 1HNW B; 1S0V A; 2LQT A; 2VS0 A; 2IJJ A; 4LF4 B; 2X6B A; 4B3R O; 2Q67 A; 1Y76 A; 1CPY A; 2PTM A; 3HKB A; 1IDS A; 2ZXW B; 4DR2 B; 1TAE A; 3R65 A; 2JK5 C; 3ZJZ A; 3BA9 A; 3JAL B; 1CXZ B; 5KUK A; 2M6Y A; 4GKJ B; 3KCX A; 1AVM A; 2E3C A; 3OR7 C; 1FJG B; 1K4D C; 5F2V O; 1FXK B; 2EX3 A; 2JGD B; 1SQP H; 4Q6G A; 2LJ2 A; 3JSN A; 2P4K A; 1JCH A; 2F4V B; 5CBF A; 1SQF A; 4NTW A; 5JCO A; 3D36 A; 1NH2 D; 5B1B C; 5EC1 C; 1Y66 A; 1FXK A; 1THZ A; 1K5Q A; 2JGD A; 4CZZ A; 1XMQ B; 4FLV A; 3PN1 A; 1KC8 W; 3VQW A; 2CTR A; 1NKD A; 2ZE6 A; 4YHH B; 2HJF C; 3THO A; 1ENV A; 2KQX A; 4UCT A; 3K5M A; 4PHZ A; 2GHY A; 2FKX A; 3RYC B; 5FPO A; 1JQ0 A; 1VF7 A; 2LFS A; 3T1H B; 3E8H A; 2RCV A; 4B3S B; 2NN4 A; 1GRJ A; 5IDJ A; 2AGA A; 3KG2 A; 3K5N A; 5EBM C; 1V54 C; 4R6Z A; 2VWK A; 1I94 O; 2XAQ A; 4FM0 A; 3RVY A; 1UFI A; 1BQZ A; 2CTP A; 2X6A A; 3ZX6 A; 5AG2 A; 2B5U A; 1SF9 A; 3OGI B; 3N2K B; 3AG3 C; 4DR5 B; 4LBE C; 2PI5 A; 1XMO B; 1QLE C; 3CEI A; 1SES A; 2GTA A; 3FAV B; 1PNK A; 5L3F A; 1YXB A; 3N2K A; 2RJZ A; 2AHY A; 5DEC A; 4FIP C; 2JEX A; 2P7T C; 3A8T A; 1HW7 A; 1Q6I A; 3AK3 A; 2WWW A; 3L72 H; 3TK1 A; 3FAV A; 1PP9 H; 4H33 A; 2CE4 A; 2N74 A; 1V9P A; 1PM9 A; 4XDK A; 3ABM C; 4O2A B; 1H8H G; 3CXC U; 3T2M A; 4MW3 A; 3SJA C; 5L3B A; 1XIL A; 3ZHQ A; 2ZCE A; 1VQO V; 1AI6 A; 1ZTE A; 3ZHV A; 2ZR3 A; 2A06 H; 5LOV B; 2UXB O; 5LP6 B; 4O2A A; 1H2G A; 1I08 A; 4I5S A; 5H6Q A; 3JD3 A; 1HNX O; 1UPG A; 4WBN B; 3IAY A; 3E83 A; 2QKC A; 4DK1 A; 3CCM V; 5LP6 A; 2Y69 C; 4W4L A; 1IBL O; 4G27 B; 1KYO F; 2V1D A; 2ADQ B; 2ILM A; 3EHB B; 4EEQ A; 4YY3 O; 5H2F Z; 4WBN A; 4UV8 A; 3QVN A; 1DGS A; 4JAV A; 1EBO A; 2KG7 B; 4L87 A; 4JZ2 A; 2JVD A; 2Q7G A; 5CMU A; 3U11 A; 3S3W A; 2ZR2 A; 3ZMU A; 4QGP A; 2R70 A; 5K1P A; 5LGN A; 4O2B B; 3RYH B; 3SJC C; 3WG7 C; 3OEH G; 3OR6 C; 3H1I H; 3S3X A; 3ZMS A; 4JI4 O; 1BE3 H; 2Y0I A; 2IBZ H; 4WFF A; 1YZB A; 3TXQ A; 3OTF A; 1QLN A; 4JYY A; 4X65 B; 3KZI Z; 2IM9 A; 5EZY B; 4DV6 B; 2GDS A; 4O2B A; 3RYH A; 4FK5 C; 2CTQ A; 2QJ1 A; 1FAF A; 1YHQ V; 1YDX A; 4QPJ A; 3K0G A; 4E4E A; 1I5Y A; 1QBZ A; 4MT8 A; 3P32 A; 4Z1V A; 2UUA B; 5KLV H; 4JI8 B; 3H1J H; 3RFR A; 2EJR A; 1ROP A; 1SS3 A; 3FB5 C; 4R8C A; 4BWA A; 4H44 B; 3K79 A; 1N32 O; 4PV1 B; 4LF8 O; 4PA6 A; 2UU9 O; 4JF3 A; 1J5E O; 3JAW A; 3L70 H; 4LFA B; 2FML A; 1RSO B; 4X1I B; 1Z5W A; 3CRQ A; 4DW0 A; 4IYH A; 4DW1 A; 4GX5 A; 1S77 D; 3UM7 A; 4JI3 O; 4TQF A; 2YS8 A; 3K3W A; 4DUY O; 4LR3 A; 1K34 A; 1JOY A; 3NR7 A; 5EYP B; 2L35 A; 4LF5 B; 4LWS B; 2QDO A; 4E2L A; 2FTK A; 4JI1 B; 2LO1 A; 4X1I A; 5L3E A; 4U3F H; 2XOK G; 3O9O A; 2IJI A; 4MTO A; 1KD1 W; 2JIZ G; 2N04 A; 3E89 A; 3G4S V; 5IYB O; 2QTO A; 5EYP A; 4QIW F; 2HVK C; 3ASO B; 1BSM A; 1L8D A; 1W0J G; 5IY5 C; 3K08 A; 1TUB B; 1XUQ A; 3MDS A; 2VWJ A; 2EIK B; 2UXD O; 2UUB B; 2BSK A; 2VRZ A; 2D3O W; 4PDV A; 3DC5 A; 1AI7 A; 3AG1 C; 2V4D A; 1EFR G; 3O65 A; 1TUB A; 4I0X B; 3JYC A; 2ZM6 O; 4UVB A; 2X7R B; 4GT1 A; 3ZRW B; 3CC2 V; 2IH3 C; 1DLB A; 3JAT B; 3K57 A; 4BR6 A; 4I0X A; 2HHH B; 1VQ6 V; 4MVQ A; 1YSC A; 2XAH A; 4CH5 A; 2CGN A; 3ZRW A; 2Q7E A; 2ZIO A; 3JAT A; 4NVP A; 5H6R A; 3BFR A; 3P3P A; 1G4Y B; 1I0H A; 1K5S A; 1WB8 A; 4LCU C; 4B3T O; 2Y4T A; 1RFY A; 3FD9 A; 2XAG A; 1M57 B; 4LF7 B; 1KQS U; 2LFR A; 5BXZ A; 3GVM A; 2QWQ B; 5B66 Z; 1MG1 A; 1M1K W; 2BTQ B; 2F1M A; 4AHC A; 4X62 O; 3NXS A; 1I7F A; 1KB9 F; 2QKS A; 1YEW A; 2O57 A; 1H38 A; 1K73 W; 5K1X A; 3CCQ V; 1ARO P; 3BAA A; 4DR6 O; 5HFL A; 2BTQ A; 4DR7 B; 4JI7 B; 3ABL C; 2P06 A; 4MW8 A; 5TIS Z; 5A2Q N; 4DO2 A; 4MTF A; 3LNM B; 1N34 B; 2Q5Z A; 1VQ8 V; 1E79 G; 4J9Y B; 4EFB A; 4R7C A; 3SDL A; 1IBK B; 3I5D A; 1R3I C; 2Q8V A; 1OCR C; 2F93 B; 1YIT V; 5KHG A; 4DV1 O; 1VMG A; 2YID A; 2WA3 A; 4U3J A; 3BCC H; 3J7A U; 1MNG A; 4FLW A; 1MZF A; 4JYB A; 5IWA O; 1GN6 A; 3DGE A; 3E8B A; 1VQP V; 2ARH A; 1EN6 A; 3JAK B; 2OYQ A; 2QM4 A; 2DWE C; 5LHI A; 2QE7 G; 4FFB A; 2WPD G; 3AG2 B; 1O9G A; 4X8A A; 1YJN V; 4JI6 O; 1E1Q G; 1ZUQ A; 4G2K A; 1TVK B; 3ZN0 A; 2RDC A; 1GN4 A; 3OM3 B; 3JAK A; 4DUZ B; 3L73 H; 4RO2 A; 2AZ0 A; 3C3S A; 1NU1 H; 4YIO A; 3BY6 A; 2WLH A; 2LW1 A; 4KP4 A; 1S5L Z; 2BE3 A; 1BS3 A; 2UXX A; 1TVK A; 3K0D A; 4UVC A; 3CC4 V; 1H2M A; 3F7Y C; 1SKV A; 2EJ7 A; 3G6E V; 5CN0 A; 5B1B B; 1ZX3 A; 1SQQ H; 5C8Y B; 3BVO A; 1HR0 O; 1AP6 A; 3SYA A; 1P49 A; 1KP2 A; 1MSW D; 4DR1 B; 2W6J G; 4X9Q A; 5BR8 B; 4GUN A; 5JJJ B; 3IGA C; 2A79 B; 5LYJ B; 1K9M W; 4B3M O; 4UB6 Z; 4WFG A; 3AG4 B; 3TXS A; 5LHH A; 2OCH A; 2WLK A; 5C8Y A; 5KA6 A; 4UCU A; 5E1A C; 2XAS A; 3EVK A; 4GKK O; 2AW9 A; 4QNH B; 1U96 A; 4RUE A; 1JMK C; 3CCU V; 1MZE A; 3E35 A; 5LYJ A; 2ADP A; 2E5L O; 1XEQ A; 2FYU H; 1W0K G; 4JI5 O; 1QNM A; 3JD2 A; 4MVR A; 2YUA A; 1R6T A; 4OGQ B; 4LFC B; 3IFX A; 3AG3 B; 1YJ9 V; 3ABK C; 4HZ3 A; 1K3E A; 3ZMT A; 4LF6 B; 5LMU O; 3X2Q B; 1N4C A; 4NXM B; 4IGG A; 4LF9 O; 1R1B A; 3HB3 B; 4AQY O; 2PF4 E; 1I94 B; 5L3D A; 3SPI A; 1N33 O; 4IT5 A; 1KU9 A; 4KHP O; 4XDL A; 3CRA A; 5E79 Z; 2X0L A; 1Q90 D; 4JYA B; 4J41 A; 3JCU Z; 1BMF G; 3CCV V; 4DV3 O; 4JPR A; 1NI8 A; 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