The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
CSTVSPGVLAGIVVGDLVLTVLIALAVYFLGRLGTAEVLGIISIVLVATVLKTIVLIPFLEQN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
DAP12-NKG2C_TM
|
| publication title |
The structural basis for intramembrane assembly of an activating immunoreceptor complex.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
19
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-09-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | YojJ-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NYK A; 3S3W A; 2FB5 A; 3S3X A; 3IJ4 A; 1WP8 A; 4FZ0 A; 4NTW A; 4NTY A; 2L35 A; 1WP7 A; 2QTS A; 4NTX A; 4FZ1 A; 3N27 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IT9 N; 2DWE C; 1BL8 A; 1YIJ V; 2E5L B; 1ZUQ A; 5C8Y B; 2F23 A; 1BQ0 A; 4PHZ A; 2P22 C; 4HNA A; 4LFC B; 1TUE B; 3H1I H; 1R73 A; 2E3C A; 4JI8 O; 4LF8 O; 4B7K A; 4CBC A; 4JI6 B; 3OEE G; 1ROP A; 1GK9 A; 5LA6 A; 1KC8 W; 3G6B A; 3EHB B; 4JAU A; 1Q8I A; 3L71 H; 4Z2W A; 2Z0A A; 3OUF A; 4QPK A; 5CA1 B; 1WNS A; 1QQC A; 5EBW C; 1GM9 A; 2IW5 A; 2IJI A; 1IBM B; 4PJ0 Z; 4PDM A; 1YJN V; 4R6Z A; 3QNE A; 4YY3 O; 2BSK A; 2QWR B; 2UXC O; 2K9P A; 1R1B A; 3RYC B; 3CCE V; 1I08 A; 3CRR A; 2VQE B; 4NXN B; 2RDC A; 1Y74 B; 4O2B B; 1H2K A; 3ABK B; 4DV2 B; 1JVM A; 1SQB H; 4O2A B; 3OUS A; 3ZX6 A; 1L8D A; 4FLX A; 3CMA V; 1PPJ H; 2HG5 C; 1T5E A; 4NTW A; 2OCC B; 1JCH A; 1JR9 A; 1N0J A; 3GVM A; 2ZM6 B; 4YXW G; 5KHK A; 4Z1V A; 3G4S V; 3JAW B; 2P4V A; 3BPZ A; 2ZE7 A; 2LQT A; 1VAR A; 2EIJ B; 4L87 A; 2EIL C; 5JJN B; 4WBN B; 3TJT A; 1Y6X A; 2QR4 A; 3SJB C; 4B7E A; 4CS4 A; 1FJG O; 1NZ6 A; 2OIE A; 3W7U A; 3F5W C; 2FYU H; 3A0R A; 1MSD A; 2P06 A; 1FFX B; 3VQW A; 5FL7 G; 4YJ2 A; 2PF4 E; 4QIW F; 4JI0 B; 2X6C A; 4I7Z B; 2QM8 A; 3F7Y C; 5H6Q A; 2LW7 A; 4F6E A; 1H2G A; 1YTF D; 3BA8 A; 1ARO P; 3CS5 A; 3ZMS A; 1Q90 D; 3ETQ A; 5EZY B; 2ZCE A; 5AG2 A; 1IUR A; 5LXT B; 4GX5 A; 3JCU Z; 4F6R A; 2MK3 A; 3APQ A; 2P4K A; 1CP9 A; 2Q0A A; 4TQF A; 3B2E E; 2B9Z A; 1FXK C; 2DOS A; 4X88 A; 1PV0 A; 2Q68 A; 2M7W A; 5CMU A; 3KCX A; 4K0K O; 3FAV A; 1G1X B; 5GTI Z; 4DUY B; 4RQE A; 2MW2 B; 2V7Q G; 1ZWI C; 2HR3 A; 3S3X A; 3OR7 C; 1D5N A; 3UKM A; 3C3S A; 2VQF B; 1XDC A; 4JI4 B; 3AK2 A; 3C90 A; 4KHP B; 3P3N A; 3RYH B; 3L9D A; 3VQY A; 1XNR O; 5DN6 G; 3DXR A; 1M56 C; 3LDC A; 3B4S A; 5BR8 O; 4JYY A; 1VQ6 V; 4ASU G; 4D7S A; 3SYC A; 5LP6 C; 1LR1 A; 4FMT A; 4QE9 A; 1OCR C; 2LO1 A; 2WSS G; 4UCR A; 5CBG A; 2Z5U A; 4ICG A; 4JI3 B; 2WLI B; 2XAF A; 1XMO O; 2W6I G; 2F43 G; 5IY5 B; 1US6 A; 1TA8 A; 3HKB B; 4DV7 O; 4CH4 A; 2UXB O; 3HKE B; 2WLK A; 2VWJ A; 4UCS A; 3STL C; 4NR1 A; 5JCO C; 1QBZ A; 3E35 A; 4I0X A; 3SYQ A; 1SA0 A; 4PA4 A; 1Q3E A; 5LMU O; 1N33 B; 3ZN0 A; 3IGA C; 4X20 B; 1LNQ A; 2Q7H A; 1IZ3 A; 3G80 A; 1QLE C; 2F66 C; 4QPJ A; 4MTO A; 3H1L H; 2GUZ A; 1KKD A; 2XAG A; 4DR3 B; 5LYJ A; 1TUB A; 4DO2 A; 3ZHQ A; 3CP1 A; 3JAR B; 1P7B A; 4TQD A; 1XHZ A; 3A0H Z; 1IXB A; 3TET A; 1EN4 A; 4MSW C; 4FZ0 A; 3B8M A; 1HNX O; 5BMV A; 2LGQ A; 5J2U A; 5GTH Z; 3TCU A; 4LC1 A; 4AI8 A; 3SPJ A; 4JYC A; 2IJK A; 2ZR2 A; 2YIC A; 3L75 H; 3CHX A; 1DK1 A; 3MDS A; 1JQ0 A; 2N05 A; 3E8F A; 2CUG A; 1RSO A; 1AJQ A; 4HAM A; 2UUB B; 1F4N A; 2KG7 B; 1FFT B; 1N32 B; 1P84 F; 1S3J A; 5CN0 A; 3K57 A; 1VQN V; 3M99 B; 4LFB B; 1E79 G; 1K92 A; 1QR9 A; 2X0L A; 1QNM A; 3RYI B; 4DR7 B; 4CH5 A; 1SZX A; 2EIK B; 1K9M W; 4ZBM A; 3UT5 A; 1U97 A; 1YTF B; 2E76 B; 5KX5 A; 4LFA O; 4JI1 B; 3U0Z A; 4U3J A; 1S72 V; 1M57 B; 1VF7 A; 5IYZ A; 4LF7 B; 2BOC C; 4KXR A; 2Y69 C; 3L72 H; 5HFM A; 1Z5W A; 3CCV V; 2JJ1 G; 2UXD B; 3OR6 C; 1HR0 B; 4I55 A; 5KMG A; 4PI0 A; 4PA6 A; 2QSA A; 1EBO A; 2ZDI C; 4JZG A; 3KKY A; 3R66 A; 1S0V A; 1FXH A; 1IBK B; 3T1H O; 4B3S O; 2UUC B; 3N27 A; 1OCR B; 1XUQ A; 3OE7 G; 4PDV A; 3ZRW A; 5JH7 B; 1ZL8 A; 2UXC B; 2EIM B; 1HNZ B; 2KB1 A; 1SES A; 3E8B A; 4FLY A; 1F7Y A; 1XHX A; 4WF9 V; 1M90 W; 1YEW A; 3QTC A; 4TT3 G; 3K5L A; 3CPW U; 4EB6 B; 1Z5V A; 3RW0 A; 4DR6 B; 1PL0 A; 3VQX A; 2QKC A; 1NU1 H; 1BHA A; 2UU9 O; 1AR4 A; 3SYP A; 1I5Y A; 3JAK B; 3BHP A; 1HDJ A; 3B09 A; 1K97 A; 2Q4P A; 4OX9 O; 3G67 A; 3RT3 C; 3NXS A; 4O4J A; 4X1I A; 3HB3 B; 2V4D A; 3B8N A; 3H1J H; 1B3Q A; 4X65 B; 4JV5 B; 1YXB A; 4DV4 O; 2ZE8 A; 5IJ0 A; 4X62 O; 1H38 A; 5CA0 B; 1M1K W; 4JI2 O; 1U96 A; 3E8H A; 2Z3Y A; 3JCZ A; 3CJH A; 1BMF G; 1B6Q A; 1GM8 A; 4DV3 O; 3ASO C; 3BEH A; 1S77 D; 4DUZ B; 2A0L A; 3H01 A; 4E4E A; 1OCC C; 3TGU H; 1VQ7 V; 4CS3 A; 2W0F C; 1NTM H; 3K08 A; 1VEW A; 1B04 A; 3CCQ V; 1XL6 A; 1BT8 A; 1M4U A; 2A7W A; 2HVK C; 2D2C B; 2C2A A; 4FZ1 A; 3N2G A; 3ZHV A; 3CB2 A; 4GYC B; 1KKC A; 4I50 B; 1ZAU A; 4B3M B; 4DW0 A; 5KAI Z; 1L0L H; 1GO3 F; 3T4Z A; 2HLD G; 2IH3 C; 4GX2 A; 4K0K B; 4JTC B; 4HYO A; 2XHB A; 4MTG A; 3K58 A; 5H5N A; 5L3C A; 2CTR A; 5CA3 A; 3JSL A; 3ZIA G; 1Y4M A; 1TVK A; 2B1G A; 3H1K H; 2QKA A; 4LF6 O; 4I4T A; 4GX1 A; 1H8E G; 2YXY A; 1F4M A; 3JSN A; 2BTQ B; 2EBO A; 1GH6 A; 4JI7 O; 1XL4 A; 1YI2 V; 1AR5 A; 3E2E A; 1NI8 A; 3ZJZ A; 1VQM V; 5KHH A; 1KEC A; 4J41 A; 1AIL A; 1J5E O; 3ABK C; 3B77 A; 1P4R A; 1K4D C; 4D7T A; 1NBM G; 3N2K B; 1EZV H; 4DYL A; 3AG4 B; 2GSM B; 3J80 N; 1XMO B; 4J7K A; 2OCC C; 2WA4 A; 3CX5 F; 3ABT A; 3P32 A; 2YEV A; 2Q7G A; 2AXT Z; 2DMX A; 1IBL O; 1SA0 B; 5HFL A; 1K5Q A; 2NR5 A; 2EIJ C; 3RYF A; 1SER A; 3KCY A; 3OD4 A; 4X1K B; 1IXM A; 3CCM V; 2JEX A; 4FK5 C; 2X7R B; 4X1Y A; 2M6Y A; 1QLN A; 4LCU C; 5DEC A; 3K5M A; 4A5U B; 4DK0 A; 3ZMT A; 2GV9 A; 1VQO V; 1VQL V; 4LP8 A; 2Q9L A; 1QVF U; 4DK1 A; 4AIL C; 3E22 B; 2R9R B; 1Y76 B; 5BMV B; 3JD2 A; 2Q6A A; 3K5N A; 3LDD A; 1JOY A; 4G2K A; 4PA3 A; 3JAL B; 4FM1 A; 5L3B A; 1WPB A; 2QA4 V; 3CC7 V; 2R9A A; 2PUS A; 2E75 B; 3CRA A; 2YIB A; 3MHS C; 2IBZ H; 1KUQ A; 5KHJ A; 5JQG B; 2OCH A; 4MVM A; 5LMN B; 4GX0 A; 1UJW B; 2Q7E A; 4BAY A; 5B3S B; 1K33 A; 4DR1 B; 1D2D A; 1H2L A; 4DV5 B; 4RWU A; 3CYO A; 5J2T A; 1WP7 A; 1SC5 B; 4RUE A; 3SR2 C; 1EZJ A; 1SQX H; 4DR2 B; 4UCV A; 4NTY A; 4LBE C; 5KAF Z; 1YF2 A; 1N34 B; 2ZT9 B; 2CE4 A; 2QKS A; 5EC1 C; 5LOV A; 4IHJ A; 4OPA A; 3A2F A; 4U3J B; 2VS0 A; 1I94 O; 3WB1 A; 2H94 A; 2OIG A; 3X2Q B; 1PM9 A; 5EBL C; 1N36 B; 2WLJ A; 2A9H A; 3H9V A; 1JFF B; 4DV1 O; 1SS3 A; 1E1R G; 5IWA B; 4UB6 Z; 2V1D A; 3D36 C; 4G28 B; 1MSW D; 1H2S B; 1YDX A; 1Q6U A; 4TV9 A; 1EN5 A; 4BR6 A; 4CH6 A; 4X9Q A; 4TUY A; 1L0N H; 1FXK A; 3NR7 A; 1S5H C; 1N4C A; 1MZF A; 3DC5 A; 4ZHQ B; 1JX9 A; 4JYA B; 1XOU A; 3HKC A; 5IY5 C; 3ZHR A; 1VF5 B; 3AEI A; 1O9G A; 3E89 A; 1SQF A; 4DR4 O; 3BAA A; 3D3Q A; 3T1H B; 4O4I A; 1YCI A; 1HP8 A; 5K1X A; 2CTQ A; 2DN9 A; 4AQY B; 1GTO A; 4GLX A; 2YIB D; 1IX9 A; 1SZT A; 4FM0 A; 3G6E V; 3SYO A; 5B1B C; 4ZOL A; 4R7C A; 4JI5 B; 3K9A A; 1PL4 A; 2Y0I A; 4N21 A; 2ILM A; 5LP6 A; 1P7G A; 2HJD A; 1RPR A; 2UXX A; 4O4L A; 4LNU B; 4LWS B; 1G4Y B; 5BXZ A; 2ZE5 A; 4P30 A; 3WB0 A; 3CCU V; 2RN9 A; 2IH1 C; 3BA9 A; 4B3R B; 2IU0 A; 1MZE A; 1DF4 A; 3M7M X; 2OTJ V; 2JIZ G; 3RGB A; 1K8A W; 2YIA A; 1BS3 A; 4HZ3 A; 4DXW A; 2FL4 A; 1XQ8 A; 3J7A U; 1EFR G; 2F95 B; 4X62 B; 2LFR A; 4H33 A; 5B66 Z; 3B40 A; 4I5S A; 4B3T B; 2BTO A; 2WA3 A; 1Q6H A; 1ORQ C; 3SJQ C; 3OTO B; 4TV8 B; 4NXM B; 3ZS8 C; 3L73 H; 3CCJ V; 4MVU A; 3LSU A; 3OGI B; 5A9G A; 2CH7 A; 2JS5 A; 2LJ2 A; 4WFB V; 1SKV A; 1PP9 H; 4ZI7 B; 1WP8 A; 1WA8 A; 2YXL A; 1PD3 A; 4IYH A; 2EIK C; 4IT5 A; 5IJ9 B; 4GCZ A; 2BE3 A; 4H44 B; 2Y4T A; 4R8C A; 3BRC A; 4BW5 A; 2OTL V; 4LH7 A; 3QO5 A; 2ZD9 A; 5LGU A; 1ZTE A; 1M57 C; 2AHZ A; 4IIJ B; 3CCL V; 2Y0P A; 1RPO A; 1GN4 A; 3PN1 A; 1W0J G; 4RAI A; 2DW4 A; 4YJ3 A; 2JVD A; 3CE2 A; 4U3F H; 4MTF A; 4QE7 A; 2WLM A; 1VQ9 V; 4W4K A; 2RNB A; 3AG7 A; 2K1E A; 3BCC H; 5BZB A; 5FNV A; 3FX7 A; 5L3G A; 1OJH A; 4JF3 A; 2EIM C; 4FFB A; 5GON A; 4LF9 O; 2WLL B; 1NQT A; 2LFS A; 2W0X A; 4JZ2 A; 4WFG A; 1KP2 A; 4IYI A; 2YI9 A; 3CME V; 4FLV A; 1TAE A; 2RMK B; 2JGD B; 4GKK O; 4LF5 O; 5JWP A; 2WAM A; 3JAS B; 3T1Y O; 1YJW V; 2EJR A; 4LH6 A; 4KUM A; 1BSM A; 3K59 A; 5B1B B; 1VF6 C; 1SRY A; 1JPX A; 4DV6 O; 2ZDI A; 4G27 B; 5EIB D; 2X6A A; 3WG7 C; 3JAT A; 4FIP C; 3ZCC A; 2IJJ A; 5LGN A; 5JVD B; 3RFR A; 3Q4H A; 1AB3 A; 1XRE A; 4X66 B; 1Q86 W; 1AI7 A; 5B1O A; 2Y48 A; 5A2Q N; 4P9P A; 5IDJ A; 4GKJ B; 1GKF A; 2XAS A; 1PNK A; 1PNM A; 2CK3 G; 4O4H B; 3S3W A; 3JD0 A; 1BQZ A; 2ZKO A; 1R3K C; 4N23 A; 5ITZ A; 2R72 A; 1QR8 A; 3ETE A; 1NR7 A; 2YDE A; 4FLU A; 1XMQ O; 2F4V B; 4I9Q A; 1Q81 W; 4DV0 O; 1YSC A; 1I0H A; 4HNA B; 3MAQ A; 4WFE A; 4X64 B; 4BIZ A; 3CEI A; 2KSD A; 3P30 A; 4Q20 A; 3ML0 A; 5EBM C; 2IU3 A; 1KU9 A; 1VQK V; 2FML A; 1HWY A; 5LHI A; 2EUL A; 2PZS A; 5JJE B; 5LA6 B; 1MOF A; 2IJH A; 2YS8 A; 3TK1 A; 3OMN B; 4J7Z A; 2E5L O; 2QWQ B; 2P90 A; 2YID A; 2XAQ A; 4JI8 B; 4LF8 B; 4PV1 B; 4CC5 A; 1GAX A; 1NH2 D; 4LFC O; 3OFN G; 3FB5 C; 1DLB A; 1AR1 B; 3OW2 U; 4DR5 O; 4JI6 O; 3CD6 V; 1OZ0 A; 5C8Y A; 3AK1 A; 5FPR A; 2BSK B; 3CC4 V; 3DC6 A; 1ZX3 A; 2RCV A; 2B5U A; 2EJ7 A; 1K7D A; 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3DTU B; 3E86 A; 4B08 A; 2AGA A; 1WB7 A; 2UUA O; 3DXR B; 4RUF A; 5EZY A; 5LXT A; 1JJO A; 2NN4 A; 1WLE A; 4DUY O; 3BVO A; 5CBH A; 1OHH G; 2HP8 A; 4NKG B; 3OAA G; 2VQF O; 1XNR B; 3TXS A; 4JI4 O; 2JGU A; 1AJP A; 4KHP O; 2FTK A; 5BR8 B; 5B1A B; 2PI5 A; 5H2F Z; 3FKS G; 1VMG A; 1R6T A; 4TOI A; 5KUM A; 4LF4 O; 4NYK A; 2W6J G; 1A32 A; 3KZI Z; 1H8H G; 2P7T C; 1GN2 A; 1DF5 A; 2ZR3 A; 3EXA A; 4LF9 B; 2XAJ A; 4FFK A; 4GT1 A; 2ARH A; 3RYH A; 2EZP A; 1W0K G; 1XNQ O; 4Q6G A; 1NH2 B; 4I0X B; 2ADP A; 4DV7 B; 4JI3 O; 2LP7 A; 4JAV A; 3E8G A; 1X59 A; 2UXB B; 1THZ A; 3T1Y B; 3JAT B; 5FLX N; 5CBF A; 1WN7 A; 2GUZ B; 1WJZ A; 2DYS C; 1GN3 A; 1TUB B; 5LYJ B; 2WLI A; 1NT2 B; 5LMU B; 3HKB A; 1LUW A; 3K3W A; 3T4D A; 3AG3 B; 1HW7 A; 1VQP V; 1QCE A; 1K73 W; 3O9O A; 1N33 O; 2HVJ C; 2CGO A; 5KA6 A; 5J2U B; 3ZN1 A; 3RVY A; 2JDI G; 4DR3 O; 4WFA V; 3VBB A; 5TIS Z; 1SQG A; 1AI4 A; 3U11 A; 4FJC C; 1NTK H; 3AG1 B; 4X20 A; 1RSO B; 1HNX B; 1NR1 A; 3QF7 A; 5L3D A; 3K06 A; 2GTS A; 2WLH A; 1OCO B; 3GWO A; 1R6K A; 2VWK A; 3ZRX A; 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