The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
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| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| total genus |
30
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CTW A; 2L6L A; 2QSA A; 2LGW A; 1FPO A; 4RWU A; 4J7Z A; 3UO2 A; 2CTP A; 2PF4 E; 1HDJ A; 2LO1 A; 2CTR A; 2N05 A; 2QWQ B; 2DMX A; 2CTQ A; 2Y4T A; 1WJZ A; 2N04 A; 2EJ7 A; 2Y4U A; 2YUA A; 1IUR A; 1BQZ A; 1FAF A; 2DN9 A; 2GUZ B; 2QWO B; 2QWR B; 2GUZ A; 3UO3 A; 3BVO A; 4J80 A; 3AG7 A; 3APQ A; 2YS8 A; 1NZ6 A; 1XBL A; 3APO A; 3UCS C; 1BQ0 A; 1GH6 A; 1N4C A; 2QWP B; 4IT5 A; 2CUG A; 2QWN B; 2M6Y A; 2KQX A; 2OCH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3WU2 Z; 4TOI A; 4J7Z A; 3JYC A; 2AW9 A; 4GKJ O; 4J10 A; 3OMA B; 1AR1 B; 2GTA A; 1ZUQ A; 1GM9 A; 4K3A A; 5L3C A; 3CHX A; 2YXH A; 2QTO A; 2RJZ A; 5E79 Z; 4DV4 B; 4UB6 Z; 3P3N A; 1SQF A; 1QQC A; 3WG7 B; 3B2E E; 5KHI A; 5J2T B; 4DUY O; 2EJ7 A; 2UXN A; 3EHB B; 4EEQ A; 3ASN B; 3AG7 A; 2IM9 A; 1VQ9 V; 3CD6 V; 3SJB C; 3D3Q A; 4X1I B; 2Q7G A; 4DR5 B; 2PYL A; 2WA3 A; 1K7D A; 4GX0 A; 3AK3 A; 3TK1 A; 2Q0A A; 3F7V C; 4TUY A; 4JI4 B; 1I08 A; 3ABU A; 4JI0 O; 3JAL B; 1NTZ H; 1GM7 A; 1YEW A; 2Q6A A; 4R8C A; 3U10 A; 3W7X A; 1Q8I A; 3UO3 A; 1Y4M A; 5IJ9 B; 4KL1 A; 3OEE G; 2Q7H A; 2ZCE A; 4LF9 B; 2Y69 B; 3VQV A; 1D5A A; 2A3Q A; 1HNX B; 1NU1 H; 4JI5 O; 4O4I B; 3AG4 B; 2QWQ B; 2DQ0 A; 1WB7 A; 2XTA A; 4DRX B; 1N8R W; 2E74 B; 3FFQ A; 2FKX A; 1K5Q A; 2HP8 A; 4BR6 A; 1VQ5 V; 4K0K B; 3VBB A; 1HNZ B; 3JAT B; 4JI6 O; 4P30 A; 4ASU G; 4OX9 O; 4UVB A; 2VRZ A; 1VQK V; 2HFE C; 1SKV A; 2XAH A; 1M4U A; 1DTO A; 2JGD B; 1AP5 A; 1AR4 A; 3HR0 A; 3JAK B; 2QM7 A; 4JF3 A; 4JI3 O; 3VOU A; 2YIA A; 4PI2 A; 3FYI B; 4HZ3 A; 3FYE B; 2X0L A; 1QR9 A; 1YTF B; 1YF2 A; 5H6R A; 4FZ0 A; 2BTQ A; 3X2Q B; 3J80 N; 2NR5 A; 1GK9 A; 1YTF D; 2F4V O; 2ZQM A; 5FNV A; 4Z1V A; 3N2K B; 1M90 W; 4TT3 G; 4LF6 B; 1R6K A; 2W6I G; 1I5Y A; 1XHX A; 3S3X A; 2P67 A; 4I0X B; 2XUM A; 1G6U A; 1XBL A; 1XL4 A; 1PKX A; 4UFZ A; 1XMO B; 5L3B A; 4H33 A; 5IJ0 B; 2ITC C; 4X64 B; 3TXS A; 1SC5 B; 1SQX H; 1THZ A; 4LFA O; 1UPG A; 4JPR A; 1Z2G A; 1J5E B; 4YXW G; 1F7Y A; 3CYO A; 4B3S O; 1K4D C; 1QBZ A; 1HDJ A; 3HKD B; 3W7W A; 3DSQ A; 5KHJ A; 3ZRS A; 3ZHT A; 2UXC B; 1PNL A; 3OE7 G; 2GTS A; 2E76 B; 2ILM A; 4DR7 B; 3AG1 B; 2OIE A; 3ZCC A; 4UCR A; 2VQE B; 3KCY A; 1N34 B; 3BEH A; 3CCE V; 5GTI Z; 3H1H H; 1Y66 A; 2EIM B; 3VQY A; 2DYR C; 1AR5 A; 1RM1 C; 1Q6U A; 5JJE B; 3W7T A; 4DV5 B; 3B40 A; 1SS3 A; 2CGO A; 2Y4U A; 4LC1 A; 2JEX A; 3OGI B; 2Q0O C; 4ZIB A; 1AIL A; 3APQ A; 4NTX A; 1XNQ B; 3HB3 B; 5GON A; 2PTM A; 4QPJ A; 2A0L A; 3B4S A; 4YJ3 A; 2OWO A; 3A0R A; 3SYO A; 3WB1 A; 4DR3 O; 2R9R B; 1WB8 A; 2JVD A; 3ABK C; 1Z5W A; 3JD1 A; 2CTP A; 2P4V A; 4MTX A; 1VQ7 V; 3K9A A; 5BR8 O; 5L3F A; 2X7R B; 3ASO C; 1AI4 A; 1GMG A; 3D3I A; 1EZJ A; 2YI8 A; 4PV1 B; 2JIZ G; 5F2V O; 3CX5 F; 5EYP B; 2DWE C; 3W7S A; 3CJH A; 2OT5 A; 5BZB A; 2EIL C; 4YY3 O; 1N0J A; 2NN4 A; 3CCM V; 1N33 O; 4JYA O; 1R6N A; 5IYZ B; 4Q6G A; 2PI4 A; 2CAZ C; 3T4Z A; 1E1Q G; 5JVD A; 1B3Q A; 3BPZ A; 4RAI A; 1MA1 A; 1PL4 A; 4X1Y A; 1SER A; 3RN4 A; 4CH3 A; 3N2G B; 2HJD A; 5C8Y B; 2QM4 A; 2BSK A; 4B3M B; 4MW3 A; 2QWP B; 4LFC O; 5GW7 A; 4O4L A; 1OCO B; 1I94 O; 4DV7 O; 4F6R B; 1VQL V; 4LWS B; 1I7F A; 2WAM A; 4PJ0 Z; 5LP6 B; 4TV8 A; 5KX5 B; 2CTR A; 2VWJ A; 4MTF A; 2XAS A; 4GKJ B; 4E4E A; 1KU9 A; 2EIN C; 5KA5 A; 1WPB A; 3M99 B; 5EBL C; 3SPJ A; 1K9M W; 4RUE A; 2B1I A; 1E79 G; 5J9P C; 2UU9 O; 1O9G A; 1BMF G; 2Y48 A; 2IH1 C; 4O4H B; 1R1B A; 4LF5 O; 3JCU Z; 1K92 A; 1MOF A; 1F51 A; 4LF8 O; 2CH7 B; 1FJG O; 4DUY B; 5HFL A; 3FB8 C; 3IC7 A; 3RVY A; 5LYJ B; 1NQT A; 4DV4 O; 1S5H C; 4B7E A; 3A0B Z; 4FFK A; 4JGS A; 3R66 A; 4WFE A; 3RT3 C; 2Z5U A; 4P9P A; 4FK5 C; 1JVM A; 3EVK A; 3E22 B; 4JI0 B; 2ADP A; 4DO2 A; 2CE4 A; 1B06 A; 4DK0 A; 5B1O A; 3RYH A; 3UCS C; 1FYJ A; 2QKC A; 1PV0 A; 4IL6 Z; 4X1I A; 4XDL A; 1JX9 A; 1VQ4 V; 3LSQ A; 1W0K G; 3THO A; 1TGO A; 4CC5 A; 1AB3 A; 5L3D A; 1AJN A; 4RWU A; 4MVS A; 4JI5 B; 2R72 A; 3JAL A; 2DYS C; 3CCJ V; 3D36 A; 3ZS8 C; 2WLI B; 1FXK C; 3OFN G; 4EB6 A; 4LF9 O; 3T1Y O; 3K58 A; 4MVZ A; 2QEX V; 1HNX O; 3OM3 B; 3ETE A; 3ZHQ A; 3B8N A; 1R3J C; 4FZ1 A; 4LBE C; 5CBF A; 3NR7 A; 3MHH C; 2WLL B; 2KQX A; 2WLJ A; 2LP7 A; 3QO5 A; 1VMG A; 3BCC H; 5CBG A; 4O4I A; 2R9I A; 2HKO A; 4Z1M G; 2P22 C; 1KP2 A; 1NKD A; 2C2A A; 4A5U B; 4JI6 B; 3ABM C; 1IBL B; 1P7B A; 4FLT A; 4DRX A; 3K79 A; 4DR1 O; 3A8T A; 1U96 A; 1ARO P; 1UJW B; 3UKM A; 3OMN B; 2IU3 A; 4OPA A; 4JI3 B; 4DUZ O; 1T5E A; 2IJH A; 3ZN0 A; 5JQG A; 1LR1 A; 3CXH F; 2PUS A; 1H2M A; 5BY1 A; 1L0N H; 1GAX A; 4J11 A; 4LF7 B; 1BE3 H; 2DN9 A; 1COW G; 1IXM A; 2JRI A; 2JGD A; 3B09 A; 3ZMV A; 4PI0 A; 4LNU B; 2E5L O; 2YEV A; 2PYJ A; 1H2N A; 4ABM A; 1IX9 A; 3L72 H; 4UUJ C; 1P4R A; 2DYR B; 4N21 A; 4B3S B; 1AI7 A; 2AXT Z; 3FAV B; 1VF6 C; 2UXX A; 3EXA A; 3CME V; 1RM1 B; 1TVK B; 4D7S A; 2ATK C; 2W0X A; 4I0X A; 4DV6 O; 1OCZ C; 1AI6 A; 3JAM N; 4LP8 A; 5LGU A; 3A2F A; 3ZIA G; 2PZS A; 5IJ0 A; 2QWN B; 1SQV H; 4NXM B; 1VQ8 V; 2UXC O; 3IAY A; 3HKD A; 1NVP B; 1PNM A; 1BL8 A; 2UUB B; 5LMN B; 3ABK B; 1NVP D; 1PD3 A; 3E8B A; 3WFV A; 1Q86 W; 4PA3 A; 2QGN A; 2P5O A; 3K5N A; 4MVR A; 2YI9 A; 3R65 A; 1GN4 A; 2ITD C; 4CH4 A; 2DOS A; 3K0D A; 4X8A A; 3LUT B; 2EIL B; 1QVG U; 1SZX A; 4DV0 B; 5H9C A; 2PI5 A; 3SYP A; 5BR8 B; 4UVC A; 4P9O A; 1B04 A; 3QNE A; 1MAB G; 1ZAU A; 4LF4 O; 1IBK O; 2D2C B; 3CE2 A; 1VQN V; 3K08 A; 3E2E A; 1FFX B; 3F5T A; 4YY3 B; 4B3R O; 4MT8 A; 4QE9 A; 1N33 B; 4JYA B; 5DED A; 1QHT A; 2YIB A; 1PPJ H; 3BVO A; 3ZBH A; 2ZR2 A; 3JAR B; 4D6T H; 2H94 A; 1NH2 D; 3SPH A; 5EYP A; 3LSU A; 3RYF B; 3UT5 B; 4ZHQ A; 4RQF A; 2QDO A; 1OCR B; 2EIN B; 4LFC B; 1H2S B; 1WNS A; 1FPO A; 2JDI G; 2EJR A; 1I94 B; 2F93 B; 5IYZ A; 4DV7 B; 4HBN A; 2LO1 A; 4DV1 O; 5CA3 A; 3ZED A; 4LH7 A; 1IUR A; 3G71 V; 4WBN A; 4DR2 O; 2F23 A; 3K3W A; 3ETG A; 4B3M O; 1S5J A; 1MNG A; 3N2G A; 3L70 H; 3M7M X; 4F6R A; 4GX1 A; 4LWS A; 5KMG B; 5LP6 A; 5KX5 A; 3FB7 C; 2UU9 B; 4U7O A; 5H2F Z; 5ITZ B; 1B6Q A; 4LF5 B; 2DQ3 A; 1Q43 A; 1I5X A; 4I9W A; 2XAQ A; 3OTO O; 4LF8 B; 2IU0 A; 1FJG B; 4FLY A; 3CXC U; 5FLX N; 1F4N A; 1JJO A; 1V9P A; 3ZN1 A; 1HP8 A; 2ZM6 O; 2XAJ A; 1KD1 W; 3SYA A; 4O4H A; 5KUK A; 4DV2 B; 1JFF B; 4CH6 A; 1WJZ A; 3OMI B; 1M57 C; 2YUA A; 1KQS U; 1FS0 G; 2CH7 A; 1F4M A; 3RFR A; 4U3J A; 2Z3Y A; 3OGC C; 3GWO A; 3MAQ A; 2AHZ A; 4ZOL A; 1FXK B; 2EIJ C; 4NR1 A; 4FLV A; 1F23 A; 4G28 B; 4IYH A; 3OT7 A; 1KB9 F; 1Q82 W; 4I50 B; 4FM1 A; 1NTK H; 4JAU A; 2EZO A; 4W4K A; 2LW7 A; 1Q6I A; 3ML0 A; 1J95 A; 4JAV A; 4PA4 A; 2LQT A; 3T1Y B; 4FM2 A; 2K1E A; 1G4Y B; 5KAI Z; 1GM8 A; 4RQE A; 3E86 A; 4JYY A; 3BAB A; 1VF7 A; 2A79 B; 3ETQ A; 3CCV V; 3RYC B; 3RW0 A; 1M93 A; 2CDY A; 1WP7 A; 3TGU H; 4CH5 A; 5EBW C; 3S3W A; 4DR1 B; 1ZL8 B; 5B1A C; 3OTF A; 5KLV H; 1D2D A; 5LBQ A; 2ZE8 A; 5B1B B; 2WLL A; 2WWW A; 4DUZ B; 3AG2 B; 1NBM G; 2OCC C; 3UO2 A; 5AG2 A; 1IBL O; 1RFY A; 1GTO A; 4X88 A; 2LFR A; 2LW1 A; 1Q7Y W; 3CRQ A; 2OYQ A; 3SGI A; 2YSU B; 3BA8 A; 2HEP A; 4PA7 A; 1FFT B; 4O2B A; 3ABL C; 3ABT A; 2E5L B; 1WLE A; 2CTW A; 2GHY A; 4NVP A; 3MDS A; 5CN0 A; 4LF7 O; 2BE3 A; 1JR9 A; 1SET A; 1ZX3 A; 5JCO A; 2VS0 A; 4BW5 A; 2RN9 A; 3TJT A; 4X9Q A; 3SPG A; 2XAG A; 1KYO F; 5L3E A; 3OR7 C; 3CEI A; 4DV6 B; 4I4T A; 2OCH A; 1IVS A; 1S76 D; 4J7J A; 2KSD A; 4PDR A; 3JD4 A; 3U0Z A; 4PEL A; 4LCU C; 2DE0 X; 2LFS A; 3L9D A; 4XDK A; 1M56 B; 3T4D A; 1ZSP A; 3FAV A; 4PHZ A; 5CMU A; 4QJF B; 2XHB A; 1TVK A; 1N36 O; 1XDC A; 2V7Q G; 4MSW C; 4PA9 A; 3SJQ C; 4DXW A; 4MS2 A; 4NXM O; 3QF7 A; 2YXL A; 1XEQ A; 4JI2 O; 2N74 A; 4JZ2 A; 5CA0 A; 3DXR A; 4MVO A; 4O4J A; 1NT2 B; 1DK1 A; 1YSC A; 1Q5O A; 4EFE A; 2UUB O; 5LMN O; 2IJI A; 3RGB A; 3JAW B; 2ZE6 A; 4O2A B; 1RSO B; 3B8M A; 1N4C A; 3OD4 A; 4LF4 B; 1IBK B; 1E1R G; 4WFB V; 2QM8 A; 3VQX A; 2RMK B; 3L75 H; 4GX5 A; 2OTJ V; 2R9A A; 3GWK C; 2WLH A; 1Q6H A; 4DV0 O; 2AZ2 A; 4MW8 A; 4AQY O; 4QNH B; 1G8M A; 2ODM A; 4B3R B; 3VQW A; 2OTL V; 2WLM A; 1FXH A; 1DGS A; 1NZ6 A; 1QLN A; 1KKD A; 4X62 O; 1N32 O; 3CCS V; 4BAY A; 4YIP A; 5EBM C; 2HLD G; 4NXN O; 1RPO A; 2X6C A; 2DW4 A; 4B7K A; 3K03 A; 3F7Y C; 3CC4 V; 3JD2 A; 4AIL C; 1Y76 A; 4GLX A; 1EN6 A; 1KP3 A; 3GB7 C; 2L35 A; 1TUB A; 1VQP V; 5IYB O; 4DV1 B; 1R73 A; 1KEC A; 1SZT A; 1S0V A; 4UXN A; 3JAR A; 4X65 O; 3G4S V; 4DR2 B; 3TCU A; 1GRJ A; 4LFB O; 4YHH O; 3RYF A; 3UT5 A; 1H2L A; 2ZKO A; 1MMM A; 4JYB A; 1XI1 A; 1HR0 B; 1URF A; 1WP8 A; 1NS1 A; 1V54 C; 3DGE A; 3MHS C; 1MG1 A; 1XUQ A; 2DMX A; 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3T2M A; 4IHJ B; 1VIB A; 2CUG A; 1YHQ V; 5JJN B; 1NR7 A; 3D36 C; 1YXB A; 4MTO A; 2YDE A; 4BIZ A; 3JAT A; 5DN6 G; 1CEZ A; 2JS3 A; 3E89 A; 2Y69 C; 4CC6 A; 1JOY A; 2GBO A; 1S72 V; 4WFG A; 2B5U A; 3BHP A; 2H3O A; 3JAK A; 2PGG A; 3NXS A; 2HHH O; 2BTQ B; 5FL7 G; 2JGU A; 5CA1 B; 1H8H G; 5FPO A; 3N27 A; 4RUF A; 3HKE B; 4J7K A; 5FNV B; 4E2L A; 3RBZ A; 2N05 A; 1GKF A; 2Y4T A; 3N2K A; 2ZDI A; 1SF9 A; 4KHP O; 2B9Z A; 3K5M A; 1N36 B; 3C3S A; 3JD3 A; 1DF4 A; 3E35 A; 2JS5 A; 5IYD O; 4UCS A; 4FLU A; 4JI2 B; 1BZK A; 4KUM A; 1R6T A; 1Y74 B; 2NNU A; 3P32 A; 1Z5V A; 1L8D A; 3X2Q C; 3ZRW B; 3FD9 A; 3QTC A; 1TUE B; 2JJ2 G; 4TV9 B; 2WLN A; 4W4L A; 3ASO B; 1TAE A; 3CC2 V; 4TQD A; 1US6 A; 1VAR A; 3B77 A; 1JJ2 U; 3STL C; 4G27 B; 4ICG A; 4Z2W A; 1XQ8 A; 4GUN A; 3FB6 C; 4AQY B; 1UFI A; 4PD4 F; 5LOV B; 4QIW F; 3OAA G; 2JK5 C; 1RSO A; 4KP4 A; 3P30 A; 2ZXW C; 4X62 B; 1N32 B; 4JYC A; 2KG7 B; 1EM1 A; 1JPX A; 4NXN B; 5CB4 B; 4J9Z B; 1P84 F; 3T1H O; 2GSM B; 1XHZ A; 4ZKI A; 4OXS A; 1NH2 B; 4FM0 A; 1O9H A; 1EN5 A; 1Q3E A; 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