The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
160
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sequence length |
403
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structure length |
376
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Chain Sequence |
SMGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQWQQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYDKAKDKYVRSLWKLFAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQDEVVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEPGELQLNELTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPRERVQLLGKRQVLQEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fes/Fps
|
| publication title |
F-BAR domain of human FES tyrosine kinase
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
160
|
| structure length |
376
|
| sequence length |
403
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-29 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | HR1 repeat | ||
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 | Arfaptin homology (AH) domain/BAR domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YKT A; 2Q13 A; 2C08 A; 3OK8 A; 1I4T A; 2Z0O A; 3ACO A; 4WPC A; 4ATM A; 4AVM A; 2EFL A; 4NKG B; 1Y2O A; 2X3X A; 3HAH A; 3HAJ A; 3LLL A; 2Z0V A; 4NSW A; 1X03 A; 2RAI A; 3QWE A; 4IGG A; 3HAI A; 3DYT A; 4WPE A; 5C5B B; 2FIC A; 2RAJ A; 1UPG A; 1WDZ A; 2Q12 A; 4H8S A; 5C5B A; 3CAZ A; 3M3W A; 4AKV A; 4NB5 A; 1X04 A; 2X3W A; 2RAK A; 3SYV A; 1CXZ B; 1I4D A; 3PLT A; 3QE6 A; 3ABH A; 1I49 A; 3QNI A; 4NQI A; 1I4L A; 3Q0K A; 2Q0O C; 2D1L A; 2EFK A; 1ZWW A; 3G9G A; 4FZS A; 4BNE A; 1URU A; 2HJD A; 1RFY A; 2X3V A; 4DYL A; 4I1Q A; 2V0O A; 1URF A; 2Z0N A; 4DCN C; 3I2W A; 1US6 A; 2RMK B; 3Q84 A; 2ELB A; 3SOG A; 2D4C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DYR C; 2HR3 A; 3AG1 B; 1SQX H; 1X59 A; 4QE7 A; 4DO2 A; 4YY3 O; 1YVW A; 4EZP A; 1S5J A; 5KUM A; 3L75 H; 3ABH A; 1G1X B; 1I4L A; 1PL0 A; 3CCQ V; 1QLE B; 3CCM V; 4GZR B; 5JCO A; 2OCH A; 1OCZ B; 2VWJ A; 4JLC A; 3MD0 A; 4JWI A; 2UXN A; 3SOG A; 1D5N A; 4JTD B; 1R6K A; 3NXS A; 4X65 B; 2EZO A; 4QGP A; 3WG7 B; 3O3M B; 4LFC O; 3Q4H A; 2AHY A; 3K9A A; 3ZRW A; 4UVA A; 3ABT A; 3PN1 A; 1VF6 C; 2ND0 A; 3M3W A; 1YIJ V; 1FXH A; 2XHB A; 2P22 C; 2EIJ B; 4PDR A; 5K1X A; 4EB6 B; 2Y69 B; 2IJI A; 4EZY A; 1E79 G; 4J9Y B; 1YF2 A; 2RDC A; 3B52 X; 3ZMT A; 3LDE A; 3ETG A; 4I0X B; 1VIB A; 3QWE A; 3OW2 U; 3CXH F; 5J9P C; 1PM9 A; 3JD1 A; 4GKK B; 2UXD B; 5CB4 A; 5KHG A; 5KUK A; 1M5I A; 3ZRX A; 3RVY A; 1VQ6 V; 1SU8 A; 1HXK A; 4X1I B; 4E2L A; 2YS8 A; 2Q9L A; 1S3J A; 2YIB D; 4JI4 B; 3BLB A; 1COW G; 3BUI A; 4F6R A; 2FIC A; 2VQF B; 2GF4 A; 2UUC B; 4JI5 B; 5CBH A; 1JFF B; 2NCZ A; 3DC6 A; 2F23 A; 5KMG B; 3DDG A; 4XDJ A; 3CKD A; 5CN0 A; 4UB6 Z; 1R3I C; 1HNZ O; 1J95 A; 4LWS B; 4QPK A; 4CS3 A; 4O4I A; 1U00 A; 1RM1 B; 1IBM O; 3CCS V; 3OMA B; 1ZL8 B; 4RQE A; 5D5P A; 4TWK A; 3G80 A; 1K3E A; 3BA8 A; 3ETE A; 4GT1 A; 5A2Q N; 2AHZ A; 1HNX O; 1PNM A; 5IYC O; 4ASU G; 1JR9 A; 4DR4 O; 1NR1 A; 4F6R B; 3GVM A; 2O57 A; 4YJ2 A; 3B8M A; 4JI2 B; 2H8P C; 4PJ0 Z; 3H1J H; 2CUG A; 1FKA O; 4FM2 A; 1FFX A; 1R5E A; 4IYI A; 4O4I B; 2X3V A; 4UDX X; 4MT8 A; 3BAB A; 1NQT A; 2HVK C; 3DX0 A; 1SET A; 2CTR A; 4AZH A; 5FLX N; 1AR5 A; 2F95 B; 2ZD9 A; 5JJN B; 2NLJ C; 3G6E V; 3X2Q B; 4FM0 A; 2V1D A; 4FLW A; 2ZR3 A; 2JJ2 G; 4LFB O; 5KA5 A; 3OHX M; 1FFX B; 4UFZ A; 2ND1 A; 4B3R O; 3FFQ A; 2W6J G; 3ETQ A; 4K3A A; 3CB2 A; 3OTF A; 4FPP A; 2QKW A; 3D50 A; 5IJ9 A; 1Q90 D; 1ZLZ A; 4GX0 A; 1IBK O; 3CYO A; 3H1I H; 2PY5 A; 1SUF A; 5CA3 A; 5BR8 O; 5KHJ A; 4B7K A; 1R3J C; 1GH6 A; 1MNG A; 1XBL A; 5EC2 C; 4GYC B; 3P3P A; 4DR5 B; 3RV1 A; 1XOU A; 5IJ9 B; 4JAU A; 5LMU O; 1HW7 A; 1B04 A; 1I4T A; 4G28 B; 3N2G A; 2YID A; 1XHZ A; 2GSM B; 3BVT A; 4F00 A; 3SPJ A; 5IYZ A; 1WA8 A; 4FLZ A; 2HHH B; 1M4U A; 1Y6X A; 3F7V C; 1MSD A; 1W59 A; 3MAQ A; 1X4T A; 4JI3 B; 4BNE A; 4AZ7 A; 1B6Q A; 1H8H G; 2M7W A; 3H9V A; 3F7Y C; 3ZMV A; 4XDL A; 2X3X A; 1IXM A; 2P67 A; 4NSW A; 5LGN A; 3BVX A; 3RV0 A; 1WA8 B; 1TQV A; 1SA0 B; 4MW8 A; 2GUZ A; 4X65 O; 1M90 W; 1JOY A; 1S5H C; 3OGI B; 5ITZ A; 4X8A A; 3LVT A; 3ABM C; 2LO1 A; 2XAG A; 1PL4 A; 1F51 A; 1Q82 W; 2Y4T A; 1GN6 A; 2A06 H; 1DF4 A; 4GX1 A; 3SGI A; 3SDL A; 3THO A; 4IT5 A; 3TCU A; 2O0I 1; 5HFM A; 2P90 A; 4MVU A; 3CRA A; 5CBG A; 4H8S A; 5GON A; 1O7D B; 2UXC B; 4X1Y B; 2LM0 A; 4AZC B; 1Q3E A; 2WA4 A; 5LA6 B; 3UKM A; 1HR0 B; 3I04 A; 5ITZ B; 1IUR A; 2AZ0 A; 4EKW A; 2F4V B; 5CA0 A; 5GTI Z; 4GKK O; 3IAY A; 3FX7 A; 2UXD O; 4BIU A; 1E2U A; 3CRM A; 1Q86 W; 4MVM A; 5TIS Z; 2QWN B; 2RJZ A; 5EBL C; 2UXX A; 4WPE A; 5GON B; 4MTF A; 4JI7 B; 2DWE C; 1NS1 A; 3AG3 B; 1F4M A; 1CXZ B; 4JI4 O; 1OCC C; 3QE6 A; 2EIN B; 4NQI A; 3HPL C; 5CA0 B; 4NXM B; 2VQF O; 2PI5 A; 2UUC O; 4OXS A; 4JI5 O; 4EZO A; 3CZN A; 1KU9 A; 4FK5 C; 4JI0 B; 2D4C A; 2QWR B; 4W4K A; 2W0F C; 1GNT A; 3BVV A; 4NKG B; 1Q6I A; 2LXY A; 3HKB A; 1SER A; 4WFE A; 4KHP B; 2GV9 A; 4XBF A; 1AI5 A; 1NT2 B; 4DXW A; 4D7T A; 4DV6 B; 3F5T A; 5LP6 C; 2CGN A; 3IC9 A; 4F4L A; 2YEV A; 1XDC A; 4MTO A; 4PA9 A; 3K5N A; 4DK0 A; 5K1P A; 4LH7 A; 1O9H A; 3CRQ A; 4IWQ A; 2YIB A; 3B2E E; 5C93 A; 4UCV A; 4FMT A; 2IU0 A; 4Q6G A; 3N2K A; 4DV1 B; 2XTA A; 2A9H A; 3K59 A; 4GKJ B; 3B8N A; 2F1M A; 1Q8I A; 3ZN1 A; 2E3C A; 2YEV B; 4FM1 A; 3LSS A; 3L3O M; 1OCR B; 4IYH A; 4AVM A; 2YIC A; 3FB7 C; 4TUY A; 1WJZ A; 4I4T B; 4X64 B; 1P7B A; 2D2C B; 1Z5V A; 3SYO A; 1NVP B; 4JWC A; 1N32 B; 4MS2 A; 3N2K B; 1I4D A; 3VBB A; 3ABK B; 1NKD A; 1JVM A; 2ILM A; 2N74 A; 2WLM A; 3ZED A; 4D8J A; 1ENV A; 1M9N A; 2ZDI A; 3CCV V; 4ZI7 A; 1FYJ A; 4O2A B; 3AG4 C; 3ZS8 C; 2OTL V; 4DR5 O; 3ZMZ A; 1JJO A; 3LLL A; 1LNQ A; 4QJF B; 4EFB A; 3DYT A; 2CTW A; 4P9O A; 1IXB A; 2P5O A; 2YXY A; 1YCI A; 1N0J A; 2LJ2 A; 2EWF A; 5LP6 A; 1KP3 A; 2Q7G A; 3OWG A; 3FAV A; 5IT9 N; 3A0R A; 2EJR A; 4ZHQ A; 3BUQ A; 2IBZ H; 3DPO A; 1VP7 A; 2HHH O; 3ZRS A; 3FKS G; 3CXC U; 4DV0 B; 1EM1 A; 4IWO A; 4MTG A; 1A32 A; 4TT3 G; 4JI3 O; 5E84 A; 3DX1 A; 5JJJ B; 4TOI A; 1X03 A; 4LCU C; 3BCC H; 5LBQ A; 1SES A; 4FM3 A; 3RYF B; 1VQ9 V; 1JQK A; 4PEL A; 2YI9 A; 1GNL A; 1K73 W; 4ABM A; 4RWU A; 2GA9 D; 3D3Q A; 4HYB A; 1N33 B; 2OIE A; 2W6I G; 1M1K W; 4HR1 B; 1HDJ A; 1OA1 A; 1JA8 A; 1RFY A; 1VAR A; 2JK5 C; 2ZXW C; 3JAL B; 3SPC A; 1TQW A; 4LNU B; 5LGU A; 4O4J A; 5LOV A; 5BXZ A; 1MAB G; 4K8X A; 1XRE A; 1K4D C; 4LF9 B; 4N21 A; 2XAF A; 3HKE A; 4I9W A; 3FB6 C; 1H38 A; 1AI4 A; 1FS0 G; 2OO2 A; 1ZSP A; 2LFS A; 3UM7 A; 2BTO A; 2B1I A; 5GTH Z; 1TQT A; 5KX5 B; 1L0L H; 1S76 D; 3UO2 A; 2ADP A; 3A2F A; 3RPM A; 1R6N A; 2UXC O; 3KDR A; 3RGB A; 4R50 A; 5LOV B; 3C90 A; 1HR0 O; 5EZY A; 2ZIN A; 2JIZ G; 4XDK A; 4HZ3 A; 4A5U B; 3P32 A; 1M56 B; 3RVZ A; 2IH1 C; 2F4V O; 4BWA A; 2WYH A; 5H6Q A; 3ZHQ A; 3L70 H; 4PI2 A; 1SQV H; 1QNM A; 1M57 C; 2R9A A; 4H37 A; 4X88 A; 3ZBH A; 4BR6 A; 1VQ7 V; 4J7Z A; 4KIK B; 1R73 A; 2F7O A; 4JI7 O; 4DCN C; 4CH3 A; 2QKS A; 5EK0 A; 4DUZ B; 1XMO B; 1Q5O A; 5CMU A; 2F1A A; 5IYB O; 4NXM O; 5H9C A; 4B9Q A; 3JAT B; 2DOS A; 2N04 A; 3CS5 A; 3PJS K; 2DW4 A; 3W7S A; 4JI0 O; 3CP1 A; 5EIB C; 3JD3 A; 1VQP V; 3CC4 V; 1XL6 A; 4E3C A; 2XOK G; 4I7Z B; 1S77 D; 3ER8 C; 3TK1 A; 2B5U A; 4LFA B; 4KHP O; 3U11 A; 1Y74 B; 3ASO B; 3CVR A; 1QLE C; 5H5N A; 3RYI A; 2RNB A; 2F43 G; 3BRC A; 5IWA B; 1BQZ A; 1Q43 A; 2KG7 B; 5JJE B; 3E8F A; 4DV6 O; 1R34 A; 2YL5 A; 1UPG A; 3FB5 C; 4MVR A; 1Y4M A; 3WG7 C; 4I55 A; 1Q7Y W; 3ZN0 A; 4LH6 A; 2YIV X; 3E83 A; 4AQY B; 4NR1 A; 4CBC A; 4JI1 B; 2XND G; 4KUM A; 4PO2 A; 3DX4 A; 1XUQ A; 3RYI B; 4R5K A; 4DV1 O; 2KSD A; 2NR5 A; 1B06 A; 4TSF G; 2LFR A; 4GKJ O; 4DV2 O; 3K03 A; 4BIO A; 1GMG A; 3HAI A; 2A7W A; 4D6T H; 4CC5 A; 2F18 A; 2F93 B; 4DW0 A; 5IJ0 A; 4DR2 B; 2QWP B; 2ZE6 A; 4X64 O; 3Q0K A; 3AG7 A; 1UPX A; 2P06 A; 4DYL A; 1N32 O; 1IZ3 A; 2A3Q A; 1K34 A; 1WB8 A; 1WAZ A; 2QM4 A; 4AZB A; 4O4H A; 2OYQ A; 1OAO A; 4JWD A; 4ZBM A; 1WB7 A; 1SU7 A; 4M0M A; 1K33 A; 1V55 B; 2WYI A; 2FB5 A; 3R65 A; 3O9O A; 3SJQ C; 1H2L A; 2HFE C; 3O65 A; 2DMX A; 3HKD A; 3L72 H; 5AG2 A; 5C8Y B; 3B51 X; 2PTM A; 1RM1 C; 2E76 B; 1OA0 A; 3L73 H; 1BS3 A; 1KUQ A; 3RBZ A; 5BY1 A; 4DV0 O; 1H8E G; 2K9P A; 1Y67 A; 4KXR A; 4JI8 B; 2QSA A; 3M99 B; 2Q0A A; 1S0V A; 1BHA A; 3QO7 A; 1HWY A; 3ZCC A; 5B3S C; 4IL6 Z; 1VQK V; 3D36 C; 4JAA A; 1N33 O; 2UXB B; 2ITC C; 2WPD G; 1ARO P; 2CH7 A; 2WA3 A; 1FAF A; 3Q4H B; 4OX9 B; 2WLI A; 3ZRW B; 1LUW A; 3K04 A; 2Q12 A; 2N05 A; 2IH3 C; 4DR3 B; 2P4V A; 3SYP A; 4LF9 O; 1TAE A; 3S3W A; 3O3N B; 4G2K A; 1NZ6 A; 4QE9 A; 3JSN A; 2A79 B; 4Q20 A; 3X2Q C; 3L3P A; 3E35 A; 1XMQ O; 1TQU A; 5EYP A; 4DR7 B; 4IM0 A; 1YTF B; 2JVD A; 3LSQ A; 4JN4 A; 1MMM A; 5JH7 A; 3DSQ A; 3OT7 A; 1VMG A; 3JAS A; 4WF9 V; 1EN5 A; 3RYH A; 1VEW A; 1QCE A; 2JS3 A; 2PF4 E; 4X62 B; 5EC1 C; 1XL4 A; 1DTO A; 2JS5 A; 4JAV A; 2QJ1 A; 3W7T A; 5CB4 B; 1QU7 A; 2DYR B; 2P6J A; 1AI7 A; 1Q6U A; 1NJI W; 2UUB B; 3APQ A; 2XUM A; 5JH7 B; 3ETD A; 3UCS C; 3OEE G; 1MZE A; 1VF6 A; 2Y4U A; 2JEX A; 3WB2 A; 1P49 A; 4DUZ O; 1XMO O; 1WDZ A; 1ZUQ A; 3TXS A; 4AIL C; 4UUJ C; 1RPR A; 3APO A; 2D1L A; 1L8D A; 3OAA G; 3T4Z A; 3QO8 A; 5H2F Z; 4FLX A; 4LFA O; 1YDX A; 4YJ2 B; 2H3O A; 4JZG A; 2RN9 A; 2KB1 A; 4IWP A; 3DTU B; 4GUN A; 5IWA O; 3D4Y A; 1AR1 B; 1K9M W; 1G6U A; 3OTO O; 3AG2 B; 1HP8 A; 2QWO B; 1VF5 B; 3K0G A; 2ZT9 B; 3BAA A; 1V54 C; 4LC1 A; 1DLB A; 4AI8 A; 1F23 A; 5J2U A; 2BSK A; 4LF7 B; 1OCO B; 4AQY O; 1K7D A; 2FKX A; 4JI1 O; 3RFR A; 1QR8 A; 1U96 A; 2HG5 C; 1AJQ A; 1U97 A; 1OHH G; 5LHI A; 2DYS B; 3EJS A; 3H1K H; 2P4K A; 2KHO A; 2ZNI A; 2WIN M; 2WLL A; 1IX9 A; 3GWO A; 4BW5 A; 2W0X A; 1VQM V; 3BVW A; 1XQ8 A; 1MA1 A; 3CRR A; 2Z0N A; 5IY5 C; 4DR2 O; 1WP8 A; 4IIJ A; 2FTK A; 1Z2G A; 4J42 A; 2VQE B; 2QTO A; 5B1B B; 2PY6 A; 1SQB H; 4NXN B; 1XNR B; 4U7N A; 2WLL B; 4I5S A; 4JYC A; 4NPH A; 4FIP C; 5B1O A; 1BQ0 A; 2QKA A; 2EIN C; 1E1D A; 1PNK A; 3BUB A; 3CCE V; 4LF6 B; 3N2G B; 2PYL A; 4RQF A; 1XEQ A; 2ODM A; 4DRX A; 1RP3 B; 5IYZ B; 3OMI B; 4H6H A; 4LBE C; 3CAZ A; 4GX5 A; 5H6R A; 2YL8 A; 4I9Q A; 5E79 Z; 2LP7 A; 1I49 A; 1AI6 A; 2JRI A; 2QE7 G; 1PD3 A; 4EFE A; 3CV5 A; 4JI8 O; 1NR7 A; 2K1E A; 3ZHR A; 3G71 V; 4J80 A; 3D52 A; 1ZWI C; 3O3O B; 4HAM A; 2Q4P A; 1YXB A; 1W2B U; 4IHJ A; 3ZHU A; 2UUA B; 1N34 B; 2UXB O; 2XAS A; 2GUZ B; 4OGQ B; 4JNE A; 4OX9 O; 2QDO A; 3KCX A; 4DR3 O; 2GHY A; 2HKO A; 2B9Z A; 2OW7 A; 5FIG A; 5D5Q A; 3SYQ A; 2JGU A; 3K5M A; 4NYK A; 1PNL A; 4MVQ A; 2HVJ C; 2OIG A; 4UCR A; 2ZNJ A; 1I7F A; 3A0H Z; 3E89 A; 1Z5W A; 3UT5 A; 4LR3 A; 4HBN A; 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