The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
AKQDYYEILGVSKTAEEREIRKAYKRLAMKYHPDRNQGDKEAEAKFKEIKEAYEVLTDSQKRAAYDQYGHAAFEQGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
DNAJ
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| publication title |
The influence of C-terminal extension on the structure of the "J-domain" in E. coli DnaJ.
pubmed rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
11
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-08-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00226 | DnaJ | DnaJ domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GUZ B; 1NZ6 A; 2M6Y A; 2LGW A; 2QWO B; 1FAF A; 3BVO A; 2L6L A; 2PF4 E; 2OCH A; 2EJ7 A; 2QWN B; 1FPO A; 2N05 A; 4RWU A; 2YUA A; 1BQZ A; 2LO1 A; 2Y4T A; 2GUZ A; 3UO2 A; 2CUG A; 2QWP B; 3APO A; 1N4C A; 2DN9 A; 2CTR A; 4J80 A; 4J7Z A; 3AG7 A; 2QSA A; 3UO3 A; 2QWR B; 2CTQ A; 2N04 A; 2Y4U A; 1HDJ A; 1BQ0 A; 1WJZ A; 2CTW A; 2CTP A; 1IUR A; 2KQX A; 2QWQ B; 4IT5 A; 2DMX A; 1XBL A; 3UCS C; 2YS8 A; 1GH6 A; 3APQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4I55 B; 3CC7 V; 3ZMT A; 1AB3 A; 4K35 A; 3AK3 A; 3F5T A; 1I7F A; 1XI1 A; 3CCM V; 1HNW B; 1JCH A; 1OZ0 A; 1CPY A; 4LWS A; 4JI0 B; 3A8T A; 4ZIB A; 2CGO A; 5KA6 A; 1R6T A; 3FAV B; 1EN6 A; 4KL1 A; 2KB1 A; 1ENV A; 1AVM A; 3SR2 C; 3ASO C; 3JD1 A; 1IVS A; 4JYA B; 4JPR A; 5JVD B; 4FZ0 A; 1XMQ B; 4FPP A; 1YSC A; 5FPR A; 3TXQ A; 1M90 W; 2JJ2 G; 3JSL A; 1XMO B; 4DV3 O; 3CX5 F; 3ZHV A; 1Q81 W; 3RGB A; 1H38 A; 3T4D A; 1RSO A; 3K59 A; 3HKC A; 5L3E A; 3U11 A; 4OXS A; 1K9M W; 2BCC H; 2JS5 A; 3UKM A; 2WLI B; 2GBO A; 5BMV A; 3FYI B; 4RUF A; 4CH6 A; 3AG1 C; 1NTM H; 3CCL V; 4X62 B; 3SDL A; 1FFX A; 2A3Q A; 3E8G A; 1X4T A; 3TXS A; 4KHP O; 1SZT A; 1V55 C; 4OPH A; 5GW7 A; 1KC8 W; 2QM4 A; 4XDK A; 1YHQ V; 4GT1 A; 2JGD B; 3B2E E; 4TUY B; 2ZIM A; 1GKF A; 1W0J G; 1SA0 A; 1ARO P; 3OMN B; 2D3O W; 1VQN V; 2ADP A; 1JFF A; 2JRI A; 4FFB B; 1K3E A; 1SQX H; 2P7T C; 5CA0 A; 3GVM A; 3W7S A; 2R70 A; 3ABK C; 4NR1 A; 4QIW F; 1CXZ B; 4UCU A; 5J2U A; 4X65 B; 3G6B A; 4X88 A; 4X1Y B; 5A9G A; 3HPL C; 4YIP A; 4DV4 O; 1OCZ B; 2HLD G; 1N34 O; 2HKO A; 3LDC A; 1WP7 A; 2HJD A; 4TV9 B; 3T1H B; 2ZDI C; 4JI1 B; 2BSK A; 1MAB G; 1Q5O A; 4UB8 Z; 3G6E V; 1V54 C; 4LF9 B; 5B1N A; 2QDO A; 5H2F Z; 3G67 A; 1VF6 C; 2HHH B; 2P67 A; 2F4V O; 4DYL A; 2VWK A; 3RYH B; 1AR1 B; 4I50 A; 1PKX A; 1K5Q A; 4TQF A; 1PNM A; 1KP2 A; 4X1I B; 4GKK O; 2XAS A; 4JTA B; 3CRR A; 5CN0 A; 1DTO A; 3CJH A; 2DWE C; 4PA3 A; 2IM9 A; 2LFR A; 5LXT A; 4JI4 O; 1MNG A; 3SGI A; 4LF6 O; 4MVR A; 2V4D A; 3IC7 A; 2ZD9 A; 1H8E G; 1R73 A; 3HKD B; 4J42 A; 2IU3 A; 3FYE B; 1DF5 A; 2EIK C; 1VQ8 V; 1QR8 A; 3WB2 A; 3N2G B; 4NB5 A; 3NXS A; 2IH3 C; 1M56 B; 1QLN A; 2CDY A; 4UVA A; 5A2Q N; 1YTF D; 5JCO C; 1FFT B; 4MTF A; 2ODM A; 2Y0I A; 5JH7 A; 3ZHS A; 3ASN B; 4A5U B; 4HYO A; 2RJZ A; 3C3S A; 4H33 A; 2LFS A; 4ZI7 B; 1Z5W A; 4K8X A; 1JQ0 A; 3JAS A; 4JI2 B; 2DWD C; 4UXN A; 4BW5 A; 4KFM A; 4IIJ A; 4H44 B; 4J7K A; 4J80 A; 5LP6 B; 1OHH G; 1VAR A; 2Y4U A; 2WLL A; 1SKV A; 4B3R O; 1L0N H; 2PYJ A; 4EEQ A; 1ROP A; 2Z5U A; 1N33 B; 5C8Y A; 2UXB B; 4UCO A; 4LWS B; 2W0X A; 4HBN A; 4NTX A; 3AK1 A; 1Q3E A; 4GKJ B; 3UT5 A; 4DR5 O; 5L3F A; 2L35 A; 4JI6 O; 3FB7 C; 1JPX A; 2XHB A; 4LFA B; 3EXA A; 2ZE5 A; 1QNM A; 1SQB H; 4NXM O; 4RQF A; 3H1J H; 3N2K A; 4IHJ A; 2YC0 A; 3M7M X; 1VQM V; 2QWP B; 1YDX A; 3ETG A; 1RM1 C; 2X6A A; 2JEX A; 3HKC B; 1FXK A; 4QGP A; 3BAB A; 1HDJ A; 2BTO A; 3AG3 B; 2UXD B; 3TGU H; 5BMV B; 3RWR D; 1XNQ O; 1PPJ H; 2WLJ A; 5LYJ A; 5LMN B; 3B09 A; 3T1Y O; 1YXB A; 1KQS U; 1R3J C; 1PL4 A; 2ZNI A; 2P90 A; 1FFX B; 1PNK A; 3VOU A; 3MDS A; 1J95 A; 2EJ7 A; 2WLH A; 2XOK G; 2B9Z A; 4RWU A; 4TV8 A; 2Y4T A; 2YEV A; 4J11 A; 3L72 H; 5DM6 V; 2RN9 A; 3E8H A; 4LF7 O; 1GK9 A; 1URF A; 1SA0 B; 1RPO A; 1JFF B; 3JD3 A; 1U96 A; 4FVM A; 2QWO B; 4MVO A; 1JJO A; 2YIA A; 1R3L C; 5CA0 B; 5LL6 Y; 2OYQ A; 4DV1 O; 3BY6 A; 1Y74 B; 2HEP A; 4PDR A; 3E2E A; 1OJH A; 5J2U B; 2BOC C; 4NXN O; 1OCO C; 2OIG A; 1S76 D; 3KCX A; 3KG2 A; 3D36 A; 2K1E A; 1HR0 O; 5J9P C; 5DN6 G; 3H1K H; 3JAL A; 4C7U A; 5IDJ A; 2QKC A; 1YI2 V; 3M99 B; 4UCV A; 2AW9 A; 3GWK C; 3DC6 A; 3IAY A; 3B4S A; 5J2T A; 1GN4 A; 4PA9 A; 3SPG A; 4DR1 O; 4UV8 A; 3C90 A; 1SZX A; 1E79 G; 1IBL O; 1VQ4 V; 1D5A A; 2PTM A; 1L1F A; 4LH7 A; 3K04 A; 1XQ8 A; 3WB1 A; 4JAU A; 2ZE6 A; 4E2L A; 2E5L O; 2Q67 A; 4JI5 O; 1S72 V; 4FZ1 A; 1N36 B; 1N32 O; 3JSN A; 1K97 A; 2QGN A; 2PZS A; 4I50 B; 5B1A C; 5H5N A; 4DUZ O; 1Q6U A; 2UUC B; 1H8H G; 2LW7 A; 4P9O A; 1OCR C; 1Q8I A; 3CRC A; 2JGU A; 4GZR B; 3Q4H A; 1NVP B; 5CB4 A; 3OM3 B; 3CSX A; 1TUB B; 3L74 H; 1MOF A; 3CJH B; 4FK5 C; 5LXT B; 2YUA A; 1OV9 A; 3D3Q A; 4L8J A; 5IYC O; 2Q0A A; 1I0H A; 5L3G A; 1R6K A; 2DYR C; 1S77 D; 4X1K A; 2DJV A; 2YIC A; 5IY5 B; 3QO7 A; 1O9H A; 1CEZ A; 4JI3 B; 1P4R A; 4DR3 B; 1TAE A; 4DV5 B; 4DUY B; 1JOY A; 3CS5 A; 4KXR A; 2CH7 A; 3SJB C; 1SQP H; 3TCU A; 4WFB V; 3ABL C; 4YHH O; 5CMU A; 3E22 A; 4X66 O; 3ETD A; 3SPI A; 3JAS B; 5EK0 A; 1JMK C; 2BTQ A; 4I0X A; 4IIJ B; 4G28 B; 1H2G A; 4DR4 B; 3HKE A; 4X64 O; 2WLL B; 4FM1 A; 5JQG A; 4LFB B; 1Y6X A; 4FLU A; 2R9I A; 3QNE A; 4XDL A; 5C8Y B; 1KD1 W; 2WAM A; 3OD4 A; 2R9A A; 4R6Z A; 4DV2 O; 3OMA B; 1CP9 A; 3E86 A; 3T4Z A; 1XL6 A; 1ZTE A; 2HFE C; 1K5S A; 4B3T O; 3FB6 C; 3JAM N; 4WBN B; 3UT5 B; 1TA8 A; 4QE9 A; 1D5N A; 1EZJ A; 3CD6 V; 4WFE A; 2VQE O; 1Y66 A; 3RYI A; 5EBL C; 2YXH A; 2NNU A; 4UV9 A; 2KQX A; 2HVJ C; 3HKB A; 4DR2 O; 3L9D A; 3N2K B; 4IHJ B; 4O4I A; 3JD4 A; 1LUW A; 1VEW A; 2F66 C; 1FPO A; 4LNU A; 3OEH G; 4J7J A; 4FM0 A; 1M56 C; 4DV3 B; 5KAI Z; 3F7Y C; 1K4C C; 1QU7 A; 4X9Q A; 2Y0P A; 3A0H Z; 1ORQ C; 5KAF Z; 1BHB A; 2JVD A; 3RYC A; 4TV8 B; 5LHH A; 2YEV B; 1M1K W; 1IXB A; 4PEL A; 2A7W A; 2X7R B; 2IJI A; 3R65 A; 3CC4 V; 4DR6 O; 3ETE A; 1E1Q G; 4MVS A; 1NS1 A; 2OCC B; 4PA4 A; 4KHP B; 5LP6 C; 4FJC C; 3EHB B; 1KBH A; 1OCC B; 3ZRW A; 2UXC B; 3UCS C; 1QLE B; 4EB6 A; 1AI7 A; 1O9G A; 2GTA A; 2F23 A; 4P9P A; 4GLX A; 2EIJ B; 3ZRX A; 2W6I G; 5GTI Z; 4AQY O; 2N74 A; 1G1X B; 3DSQ A; 1H2M A; 5DED A; 1P7G A; 5L3D A; 4GYC B; 3O65 A; 4U7O A; 3A0R A; 1TUE B; 3H1I H; 2UU9 B; 3CB2 A; 1XEQ A; 3BRC A; 4FMT A; 3JAL B; 3LDE A; 4LFC B; 4MTG A; 3CRQ A; 1NI8 A; 1G6U A; 1QR9 A; 1WPB A; 2ZQM A; 2HJF C; 3L70 H; 3I55 V; 4DV4 B; 4X89 A; 4LF8 B; 5J2T B; 2O57 A; 1AR4 A; 1VQ5 V; 2P06 A; 3P3N A; 1N34 B; 1PNL A; 3E8F A; 5B3S C; 3BPZ A; 4R8C A; 2Y69 B; 2H8P C; 1BSM A; 4JAS A; 3BAA A; 5BR8 O; 2Z0A A; 4Z1M G; 4I4T A; 5LOV A; 4AIL C; 2YXL A; 2P5O A; 1KB9 F; 2CAZ C; 3QO8 A; 4CS4 A; 1S5H C; 2F4V B; 4BW9 A; 3Q4H B; 3UO3 A; 5CB4 B; 3JAR A; 3L75 H; 2JK5 C; 5DEC A; 1VP7 A; 5B1B B; 3STL C; 3I5D A; 2QA4 V; 4IYI A; 1IBM O; 3H1H H; 2KKW A; 4I5S A; 2ITC C; 5ITZ A; 1W0K G; 2YI8 A; 3AEI A; 2X6C A; 1MMM A; 3IFX A; 2CGN A; 4X1K B; 5EIB C; 1GM9 A; 1ZUQ A; 3ZHU A; 1YTF B; 4JI4 B; 2YXY A; 1DLB A; 2B1G A; 4LF6 B; 3OTO O; 2OWO A; 2DE0 X; 4HNA A; 1J5E O; 3OW2 U; 1M57 C; 1SQG A; 2YDE A; 4QPK A; 2GV9 A; 2Q7G A; 2ETN A; 4NYK A; 4DR7 B; 2CH7 B; 1QBZ A; 1YZB A; 3AG2 C; 2QWN B; 5LHI A; 3E22 B; 3SJC C; 4OGQ B; 1L0L H; 1JVM A; 4LF4 O; 1SES A; 3A2F A; 1VIB A; 3UM7 A; 2BTQ B; 4UB6 Z; 1WAZ A; 2QWR B; 2EX3 A; 3FB8 C; 3RFR A; 2B1I A; 4CH4 A; 1VQ6 V; 1TVK A; 3HKE B; 5FLX N; 2IJK A; 2RCV A; 3CCU V; 4MVU A; 5JQG B; 4FIP C; 3OMI B; 1Q6I A; 3WG7 C; 5LA6 A; 4NTY A; 1H2K A; 2IU0 A; 1NR1 A; 4GX2 A; 3AK2 A; 1KKD A; 4JZG A; 3ZHT A; 2Q8V A; 4B3R B; 1N0N A; 4YY3 O; 3MAQ A; 4JTD B; 1QVG U; 1IX9 A; 1YVW A; 2M7W A; 3F5W C; 5IYZ A; 3DXR B; 2OT5 A; 4F4L A; 1E1R G; 5JJN B; 3B40 A; 3CEI A; 3CC2 V; 2KSD A; 1FS0 G; 2LP7 A; 2W6J G; 2ZDI A; 3RYI B; 5IYB O; 3ZHQ A; 2Q4P A; 4TQD A; 1K7D A; 1SS3 A; 3HKB B; 4QNH B; 4DR5 B; 3QTC A; 2XND G; 3OT7 A; 5FL7 G; 4O4I B; 3ABT A; 4ZBM A; 2ZR3 A; 1VF6 A; 4B7K A; 1WA8 A; 2NR5 A; 3OR6 C; 2Q69 A; 4NXM B; 1PD3 A; 5KHJ A; 5HFL A; 1AJN A; 4H0L B; 2EIL C; 1S5L Z; 4FLZ A; 3ABM B; 3RYC B; 5CBH A; 3ZMS A; 1K92 A; 4EFE A; 5GON A; 2AGA A; 2ZM6 O; 2OTL V; 2X6B A; 4X65 O; 1SQV H; 4PDL A; 1HNZ O; 2ZCE A; 1A32 A; 3JCZ A; 3K0D A; 3ZRW B; 3BEH A; 1IBK O; 4EB6 B; 4DXW A; 4LF7 B; 2ZT9 B; 1LUV A; 4HAM A; 4XBF A; 1G4Y B; 5BXZ A; 3G4S V; 4PHZ A; 4JI1 O; 1IDS A; 2VWJ A; 4O2B A; 4B3M B; 1FAF A; 4N23 A; 4DV1 B; 2VQF O; 2EBO A; 2EIN B; 3EFF K; 5LMU O; 4K3A A; 4LF9 O; 3RW0 A; 4P2Z A; 5H6Q A; 1HR0 B; 4CS2 A; 3P32 A; 3DGE A; 1AIL A; 3TJT A; 2RNB A; 3K9S A; 3DC5 A; 4MTX A; 1PP9 H; 4DK0 A; 3J80 N; 4J10 A; 1GN2 A; 3CXC U; 3F7V C; 4RUE A; 3ABU A; 5CBF A; 4QJF B; 1YJN V; 4BIU A; 1XNR O; 3D8C A; 4MVM A; 4DR1 B; 1U97 A; 1Q43 A; 2EIM B; 2C2A A; 1IBL B; 4I4T B; 5LOV B; 1NH2 D; 1RSO B; 2XAH A; 1FXH A; 2P4K A; 1K73 W; 1Z2G A; 1M9N A; 3A0B Z; 3OUF A; 3ASO B; 2L6L A; 1F23 A; 4LH6 A; 5KLV H; 3RYF A; 1N8R W; 4FLT A; 2CTR A; 3HR0 A; 3K08 A; 2HR3 A; 4JAV A; 4JI8 O; 5ITZ B; 1DGS A; 3E8B A; 2QWQ B; 3K03 A; 2A06 H; 1MG1 A; 4PI0 A; 2WLN A; 3PN1 A; 1AJP A; 4TSF G; 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1AI5 A; 5JH7 B; 4DV6 B; 1BT8 A; 1B06 A; 2UUB O; 5L3B A; 3SYC A; 1YF2 A; 4EKW A; 1I08 A; 4BIO A; 4K0K O; 3BHP A; 2ILM A; 3SYQ A; 2H3O A; 5CA3 A; 5EC1 C; 5IJ0 A; 3CXH F; 1MSW D; 2FYU H; 3FD9 A; 2PUS A; 1SER A; 2EIK B; 4DR6 B; 3AG4 B; 1S0V A; 1GTO A; 3T2M A; 2JS3 A; 1F7Y A; 2DW4 A; 3JAT A; 2IW5 A; 4O2B B; 4JV5 O; 5KUM A; 1B04 A; 4RQE A; 1EN4 A; 1FJG O; 4D7S A; 3BVO A; 4AQY B; 3K57 A; 1Y76 A; 2ZE8 A; 2WSS G; 2ZE7 A; 1YCI A; 4KUM A; 3B77 A; 4RAI A; 1VQL V; 4EFB A; 1LNQ A; 1ZSP A; 2QSA A; 3CRM A; 4OX9 O; 1VF5 B; 2MK3 A; 2RDC A; 2KG7 A; 1PL0 A; 2RQ6 A; 4ICG A; 1KEC A; 1WB7 A; 2WLM A; 2ZNJ A; 2Y48 A; 3W7T A; 2H94 A; 4DW1 A; 3W7W A; 1VQK V; 2FB5 A; 1FXK B; 3ML0 A; 1KMI Z; 4WCE V; 1SC5 B; 4QPJ A; 3CCE V; 5BR8 B; 5LYJ B; 4Z2W A; 4WF9 V; 5K1X A; 2N04 A; 3SPJ A; 5H9C A; 1EFR G; 2XAQ A; 4GX1 A; 4HZ3 A; 3ASN C; 4MSW C; 3RYF B; 1W2B U; 5KHI A; 1DF4 A; 2PGG A; 2E75 B; 3B8N A; 3SYP A; 4BR6 A; 1RM1 B; 4G27 B; 2JEU A; 3KKY A; 3KCY A; 3OFN G; 4U7N A; 1IBM B; 4CBC A; 5KMG B; 3C3T A; 1BZK A; 5D5Q A; 3CCS V; 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