The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
42
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structure length |
42
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Chain Sequence |
RYPYYLSDITDAFSPQVLAAVIFIYFAALSPAITFGGLLGEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
PROTEIN (BAND 3 ANION TRANSPORT PROTEIN)
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| publication title |
Structural studies on the effects of the deletion in the red cell anion exchanger (band 3, AE1) associated with South East Asian ovalocytosis.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
7
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| structure length |
42
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| sequence length |
42
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-11-01 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helical hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BZK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JAV A; 2JVD A; 3N2K B; 3ASO C; 3IGA C; 3K9A A; 1K73 W; 5HFM A; 1Z2G A; 2ZIN A; 4GYC B; 1G4Y B; 3JSL A; 3ZHV A; 4BAY A; 4FM1 A; 5CB4 B; 5B5E Z; 2Q8V A; 3AK1 A; 5JJN B; 2PZS A; 3AG2 B; 4G2K A; 4I0X B; 1P4R A; 1BSM A; 2DWE C; 4QE9 A; 2LQT A; 4O2A B; 1GK9 A; 1YIJ V; 1VEW A; 1GN3 A; 1ROP A; 2D3O W; 4X1K B; 1XQ8 A; 2QWO B; 5KA6 A; 5B1A C; 1M5I A; 2HFE C; 5J2T B; 1IBM B; 3JAM N; 5LP6 C; 1FFT B; 2OYQ A; 1XNR O; 1W0K G; 4JYY A; 2IJI A; 1L1F A; 1WJZ A; 2KKW A; 4R8C A; 1ZAU A; 2GUZ B; 3LSQ A; 1JPX A; 4TV9 A; 2PI4 A; 2C2A A; 2OIG A; 5L3G A; 1I5X A; 4DV2 O; 3JD4 A; 5GTI Z; 2OTJ V; 2DYR B; 1PL0 A; 1XMQ O; 3RN4 A; 4MT8 A; 4LC1 A; 3Q4H B; 1V55 C; 3K0D A; 3K59 A; 5GON B; 1J5E B; 1MA1 A; 3CSX A; 1RSO A; 2Y69 B; 4IL6 Z; 2XAQ A; 3CRQ A; 1S5J A; 3OM3 B; 1P7G A; 4IGG A; 3RYC B; 1J5E O; 4GT1 A; 3ZCC A; 3OR6 C; 3JAR A; 4H44 B; 4NXN B; 4QE7 A; 1UJW B; 1S0V A; 1NT2 B; 2YIC A; 4LF7 B; 1AI5 A; 1M56 C; 2GSM B; 1BS3 A; 2EIN B; 4JI1 O; 2Q9L A; 5EK0 A; 5EBM C; 4NR1 A; 1N34 B; 3E35 A; 1QHT A; 3CMA V; 2WLL A; 1J95 A; 4X66 B; 1VMG A; 4PD4 F; 1IVS A; 1V54 B; 4WFH A; 2P7T C; 1Q81 W; 3CP1 A; 2PY5 A; 3SYO A; 4X66 O; 2Q68 A; 2UUA B; 3FKS G; 5DM6 V; 1P84 F; 5LYJ A; 1OCC C; 5LHG A; 2UXC B; 2ZQM A; 3BEH A; 4GX0 A; 3UT5 B; 5LP6 A; 4JI2 B; 4LF4 O; 1W59 A; 5KAF Z; 3AG4 C; 3A0B Z; 1BE3 H; 2HVJ C; 4D7S A; 2JK5 C; 2ZM6 O; 3CD6 V; 2HHH B; 2YIB A; 4O4L A; 4EKW A; 2QKA A; 1PP9 H; 3ZMT A; 4TUY B; 4NTW A; 1BGY H; 4NXM B; 1BZK A; 1NTK H; 1H2N A; 3KCY A; 2HHH O; 2Q0A A; 2JGD A; 1YDX A; 1VP7 A; 2ZE7 A; 2KG7 A; 2ADP A; 2WLJ A; 1LNQ A; 2WLN A; 1XI1 A; 4NXM O; 2HJF C; 2Y48 A; 3TCU A; 2HG5 C; 2HP8 A; 1FXH A; 1HNX B; 1NTZ H; 1K33 A; 1DLB A; 3HKC B; 3OGC C; 5IT9 N; 2ZT9 B; 1S77 D; 3C90 A; 2ZCE A; 4JI3 B; 5ITZ B; 4TWK A; 3FB7 C; 5E79 Z; 1SES A; 1ORQ C; 3SJQ C; 1EN4 A; 1HNX O; 3C3S A; 2P5O A; 4ZBM A; 3U11 A; 1QQC A; 1K8A W; 4MVO A; 4O4H B; 4JI3 O; 1WA8 A; 1IX9 A; 4MVZ A; 1ENV A; 2ZNJ A; 5FL7 G; 4BIU A; 5C93 A; 1NBM G; 3AK2 A; 1WN7 A; 4JTC B; 4I9W A; 3IJ4 A; 2QA4 V; 5JVD B; 5FPR A; 2V4D A; 1OCR C; 2HKO A; 4ZHQ B; 3CS5 A; 4J42 A; 1T5E A; 1W0J G; 4LFA B; 2ZKO A; 1NJI W; 2WLI A; 3L75 H; 1R6T A; 1VQ5 V; 2F4V B; 5KHG A; 2IBZ H; 2AHY A; 3CC7 V; 3WB0 A; 1I5Y A; 5B1N A; 3NXS A; 1FXK C; 1MMM A; 4J11 A; 5JCO C; 3NR7 A; 1KUQ A; 1HWY A; 4WFG A; 4I4T B; 2F4V O; 3HKB A; 1S76 D; 5B3S C; 1D5A A; 1KU9 A; 4HNA B; 4X20 B; 4TV8 A; 4DV3 B; 1QR8 A; 1JFF A; 2A9H A; 1IZ3 A; 4UFZ A; 5CMU A; 3OGI B; 2P4K A; 5J2U B; 2Q69 A; 1FJG O; 2BTQ B; 1N4C A; 2DYS B; 3MHH C; 5A2Q N; 4U7O A; 3BAA A; 4L87 A; 2BOB C; 2AXT Z; 2PGG A; 1FXV A; 3B2E E; 4X62 B; 2W6I G; 3LDE A; 4NVP A; 1WP7 A; 3H1L H; 3T1H O; 4NKG B; 1BHB A; 1VQN V; 1RPO A; 4PEL A; 3VBB A; 4DV5 O; 4I5S A; 4CZZ A; 1KC8 W; 3FX7 A; 4DR3 B; 2CDY A; 4X62 O; 4ZI7 A; 1VQ6 V; 4YHH B; 4LFB B; 2HR3 A; 3ZMZ A; 4B3T O; 5L3E A; 1UPG A; 2LGQ A; 1K3E A; 4FLZ A; 3FYE B; 4CH4 A; 4FLX A; 5JQG B; 4O4I B; 3S3X A; 4PDV A; 4J7K A; 1M57 B; 1OCO C; 3JAL B; 2EIK C; 1TUB A; 4LWS A; 4PA6 A; 4TSF G; 2N05 A; 1K7D A; 2YXH A; 1K5S A; 1TVK A; 1Y74 B; 4KFM A; 5H6Q A; 2Z0A A; 4UCO A; 3WG7 B; 4NTX A; 5JCO A; 3KKY A; 5KX5 A; 1KP2 A; 2PYL A; 1MSW D; 2B1I A; 1GN4 A; 1R1B A; 3E86 A; 1GTO A; 4FFB A; 1N33 B; 1QBZ A; 1Y66 A; 4MVM A; 4LF9 B; 2QWQ B; 3E8H A; 1N8R W; 4DR5 B; 1NS1 A; 1I0H A; 2IH3 C; 2ZE5 A; 1Q8I A; 2JEU A; 4EFE A; 2VRZ A; 2IJJ A; 1PV0 A; 3UQ8 A; 4DRX A; 4IYH A; 4DV4 B; 5IWA B; 4ABM A; 2QWN B; 4DYL A; 2RCV A; 1IXB A; 2E5L B; 1ZSP A; 1SQV H; 2AW9 A; 4IT5 A; 3TXQ A; 4JZG A; 4DR6 O; 5F2V O; 5CBF A; 3ML0 A; 2CTP A; 3K58 A; 1ZL8 B; 4P9P A; 1UFI A; 1TAE A; 4BIO A; 2RN9 A; 2Y0I A; 1F7Y A; 3K04 A; 1YHQ V; 1GMG A; 4JGS A; 1KYO F; 1VQ7 V; 2XAH A; 3STL C; 5LHH A; 3ZHU A; 1VF5 B; 3DTU B; 2UXB B; 1SQB H; 4PA4 A; 4PI0 A; 4J80 A; 3R65 A; 5H9C A; 3ZBH A; 1VQ8 V; 2D2C B; 4YY3 B; 3OTO O; 2V7Q G; 2JS3 A; 2EZP A; 3FFQ A; 4RO2 A; 3SYA A; 5IYZ A; 4H0L B; 5LHI A; 3G67 A; 5BMV B; 2CAZ C; 4YIP A; 5B1B B; 5BY1 A; 4YY3 O; 2YIA A; 3G71 V; 5KA5 A; 1HW7 A; 1U97 A; 1Q82 W; 1HP8 A; 5LOV B; 5EIB C; 4X65 B; 2DQ3 A; 1GKF A; 3ABL B; 4QPK A; 3OD4 A; 4UB8 Z; 3WFV A; 1AJQ A; 2UUC B; 1QCE A; 1E1Q G; 5EZY B; 4BIZ A; 2DN9 A; 3N2G B; 1Q6U A; 2BSK A; 2R70 A; 1FFX B; 2VQF B; 2QJ1 A; 2F95 B; 5IJ0 A; 3JAW B; 5L3C A; 4DR2 O; 1X4T A; 1N0N A; 1P49 A; 2YSU B; 2RMK B; 3AG2 C; 3DXR B; 2Y4U A; 1B06 A; 2F43 G; 4JI4 B; 2X6B A; 4U3J A; 3K3W A; 1JCH A; 2QTO A; 3SJC C; 4X64 B; 1AB3 A; 4CS3 A; 4XBF A; 4F6R A; 2YEV B; 3L74 H; 4DV1 B; 1Q5O A; 3THO A; 3JD1 A; 3OTF A; 3VQW A; 4K0K B; 4X64 O; 4X8A A; 2O57 A; 3I55 V; 3BAB A; 5FNV A; 5IY5 B; 1JOY A; 3CJH B; 3VQX A; 3JAS A; 5LXT B; 3CB2 A; 3SJA C; 2FKX A; 1CEZ A; 1K4C C; 2JRI A; 2Q0O C; 3W7W A; 2UU9 O; 2OTL V; 2BOC C; 3CEI A; 3A2F A; 3QO7 A; 4YJ2 B; 2ADQ B; 4GCZ A; 4KL1 A; 1OCZ B; 1SC5 B; 3HKD A; 4OX9 B; 1IBK B; 5JH7 A; 1QVF U; 5FPO A; 2NNU A; 4UVB A; 3E2E A; 4UVC A; 3S3W A; 4PJ0 Z; 3OMA B; 3ZED A; 2KB1 A; 4I55 A; 2A0L A; 3JAT B; 5C8Y A; 2ETN A; 3JD0 A; 2DW4 A; 3FB5 C; 3E22 B; 3N2K A; 2QE7 G; 4K8Z A; 1LUV A; 3JAK A; 3ZRW B; 3CCL V; 3TET A; 4GZR B; 2RNB A; 2WLH A; 5CN0 A; 3SJB C; 3T2M A; 3H01 A; 3HKE B; 1AVM A; 5CB4 A; 1KKC A; 4G28 B; 3ABM B; 2FML A; 3SR2 C; 1PNK A; 3ABK C; 3KG2 A; 1XNR B; 4GKJ O; 1SZT A; 2N04 A; 4I0X A; 5KMG B; 3P30 A; 1R6N A; 4O2A A; 4CBC A; 3E83 A; 4TQF A; 3AG7 A; 2IW5 A; 4LBE C; 3H1K H; 4DV2 B; 4QGP A; 1S3J A; 4ZIB A; 2GV9 A; 5LBQ A; 2N74 A; 1XOU A; 4UUJ C; 1PNL A; 1XIL A; 3SPG A; 1XMQ B; 3L73 H; 1XL6 A; 2GUZ A; 4J41 A; 1YTF D; 4JAU A; 1PNM A; 2YXL A; 3ASN B; 4FVM A; 4EB6 B; 2QDO A; 3CHX A; 3I56 V; 3K5L A; 4AIL C; 2QWR B; 2XND G; 4DUZ B; 4FIP C; 3CRC A; 1LR1 A; 2L6L A; 2YS8 A; 2NR5 A; 4J9Z B; 1VQK V; 1ZUQ A; 2EIJ B; 3OW2 U; 4RAI A; 3BFR A; 1FYJ A; 3Q4H A; 2CGN A; 2EBO A; 1N36 B; 3CC2 V; 4DUZ O; 1QU7 A; 3G6B A; 5GON A; 1FS0 G; 2X6A A; 1NVP D; 3JD3 A; 4OPH A; 3A8T A; 3CRR A; 4LF8 B; 1YF2 A; 4FM2 A; 1D2D A; 3SDL A; 1JJ2 U; 1N36 O; 2YDE A; 4FFK A; 3M8A A; 4NB5 A; 3RYC A; 3ZS8 C; 1MG1 A; 4JI1 B; 4LF8 O; 5LGN A; 1XL4 A; 2V1D A; 2R9A A; 3P32 A; 3JD2 A; 3UM7 A; 3SPJ A; 1IXM A; 3ZRV A; 4LNU B; 4R50 A; 1VF7 A; 2ZXW C; 3B8M A; 1JMK C; 1H8E G; 1K92 A; 4X1I A; 4KHP O; 2GTS A; 2HVK C; 2E74 B; 3ETD A; 3ASO B; 1COW G; 1THZ A; 2CH7 A; 3SPC A; 4JAS A; 2LGW A; 2WLL B; 1QVG U; 4LF4 B; 3X2Q C; 3LDD A; 2WPD G; 4B3R O; 2UXX A; 3JSN A; 2ZM6 B; 3E8F A; 3O65 A; 3T1C A; 3RVY A; 3KCX A; 4RUE A; 4UCT A; 3QO8 A; 3UT5 A; 1F51 A; 3JYC A; 2DJV A; 5B1A B; 1G1X B; 5IE9 A; 1AP6 A; 2W0X A; 4I50 A; 5LP6 B; 4DR7 O; 5IJ9 A; 5EBL C; 1SS3 A; 4O2B A; 3QF7 A; 1XRE A; 2X7R B; 4O4J A; 1R3J C; 3FB8 C; 4TUY A; 1W2B U; 3ZMV A; 1G8M A; 1D5N A; 2HLD G; 3P3N A; 4BW9 A; 2PF4 E; 5CA1 A; 2P4V A; 1RM1 B; 1H38 A; 2W0F C; 3F5W C; 2DWD C; 1BQ0 A; 1KQS U; 2JGD B; 2ZE6 A; 1Q86 W; 2OCC C; 1VF6 A; 3GB7 C; 2KG7 B; 2A7W A; 1EFR G; 3K5N A; 5CA0 B; 3HKC A; 4PA7 A; 4UV9 A; 5KUM A; 1V55 B; 2QM8 A; 4QNH B; 1DF4 A; 1HNZ B; 5ITZ A; 1RPR A; 2X6C A; 4KXR A; 2JIZ G; 2RDC A; 3AK3 A; 2QKS A; 4DV6 O; 1BQZ A; 3DGE A; 1DF5 A; 5GW7 A; 2IU0 A; 4O4H A; 2XT9 A; 1HNZ O; 4U3F H; 1HNW B; 4FLW A; 4I7Z B; 3J81 N; 4WBN B; 1M57 C; 1N0J A; 4ZHQ A; 3EXA A; 4H37 A; 1HNW O; 4YJ3 B; 1SER A; 3VQY A; 3B77 A; 3SYP A; 5KUK A; 5L3D A; 1XEQ A; 1AR1 B; 1IUR A; 4G27 B; 3WG7 C; 1PD3 A; 1IDS A; 4FK5 C; 3QTC A; 1FJG B; 1K34 A; 1NTM H; 4YIO A; 2WLK A; 3K9S A; 4DV7 B; 1YVW A; 4BR6 A; 2K9P A; 3ZHR A; 3K57 A; 5A9G A; 1OCC B; 1NR1 A; 3T4D A; 1JX9 A; 2RQ6 A; 1QR9 A; 4DV7 O; 5LA6 A; 4OXS A; 2BTQ A; 5CA3 A; 1QLE B; 3FAV B; 3LUT B; 1MZE A; 3T1H B; 1JFF B; 3AG4 B; 1XNQ O; 4DV5 B; 3BVO A; 2VWK A; 1KB9 F; 3LDC A; 3RGB A; 1QLN A; 5LMN O; 3UO3 A; 4OPA A; 3J80 N; 4B08 A; 1GH6 A; 2IJH A; 4KP4 A; 4FPP A; 3G4S V; 3U0Z A; 4AHC A; 3MAQ A; 1H2L A; 2UUB O; 1NH2 D; 5K1P A; 4B3T B; 2WA3 A; 4MVS A; 1AJN A; 1WNS A; 2CTW A; 3FB6 C; 4JI5 B; 1TA8 A; 5H5N A; 1K4D C; 2LW7 A; 1VAR A; 3O9O A; 1AR4 A; 2YIB D; 4MVQ A; 5DEC A; 4X9Q A; 4RQF A; 3MD0 A; 2JEX A; 2XHB A; 2EX3 A; 4JI5 O; 1H2G A; 2L35 A; 5FLX N; 1YIT V; 3CRM A; 5CBH A; 2ZR2 A; 2H94 A; 3B09 A; 5CBG A; 3CCR V; 4ICG A; 2EIM C; 4FLV A; 3EHB B; 3R66 A; 2P06 A; 3PJS K; 4Q20 A; 3JAL A; 1VQO V; 2H8P C; 5LMU O; 2ZIM A; 1JJO A; 3AG1 C; 5EYP A; 1OCR B; 1NKD A; 3APO A; 2ATK C; 3RYF A; 4LWS B; 1Y74 A; 4P2Z A; 2P67 A; 3CCS V; 3HB3 B; 4J9Y B; 1SET A; 2YC0 A; 1TUE B; 4JI8 O; 1YI2 V; 4D6T H; 4LFC B; 4QIW F; 1VQM V; 3D3I A; 2ZDI C; 4D7T A; 1YZB A; 1FXK B; 5KX5 B; 5IYC O; 2P6J A; 4JZ2 A; 4MS2 A; 5KHK A; 3M7M X; 3IFX A; 2Q73 A; 1NU1 H; 4LFC O; 1ZTE A; 2ARH A; 2YXY A; 4DR6 B; 1GRJ A; 1SF9 A; 5B3S B; 5HFL A; 1H2K A; 2B1G A; 4JF3 A; 1N32 O; 1RP3 B; 4F4L A; 3K5O A; 2F66 C; 2WLM A; 3ABU A; 4NTY A; 4DR1 O; 1Y76 A; 3ZRX A; 4Z1V A; 1Q7Y W; 3ZX6 A; 3RYH B; 4CH5 A; 1GN6 A; 2VQE O; 3L70 H; 1ZL8 A; 3ZHQ A; 1VQ4 V; 1I94 O; 4FZ0 A; 3TJT A; 3WB2 A; 3OTO B; 3ZIA G; 1EM1 A; 2XTA A; 4UCU A; 3OAA G; 2HJD A; 3OR7 C; 3ICX A; 4DW0 A; 3W7S A; 1SZX A; 3ETE A; 1MOF A; 4PDM A; 4J10 A; 1SQP H; 2KQX A; 4JYA O; 1EZV H; 3G80 A; 5DED A; 1B04 A; 4H13 B; 1Q6I A; 1P7B A; 5BMV A; 1XMO O; 3CCV V; 4JTA B; 5EC1 C; 3K5M A; 2IJK A; 1ARO P; 3VQV A; 4B3M B; 2B9Z A; 1R3K C; 2BE3 A; 3KZI Z; 3K79 A; 4HYO A; 1TGO A; 5LOV A; 4IIJ A; 2EIL C; 3T1Y O; 2LO1 A; 2ZR3 A; 4B3M O; 5K1X A; 4DUY O; 3APQ A; 1GO3 F; 4RUF A; 2EUL A; 3AG3 B; 3B8N A; 1DTO A; 4DR2 B; 4GX2 A; 2A06 H; 4MTG A; 1M1K W; 1AI7 A; 1QNM A; 5LL6 Y; 4P30 A; 2ZDI A; 2WAM A; 4LR3 A; 2QM4 A; 1Y67 A; 3K06 A; 3N2G A; 3CCE V; 4IHJ B; 1O9G A; 3RW0 A; 4LCU C; 3JAW A; 4Q6G A; 3SYC A; 5DN6 G; 1YTF B; 2MK3 A; 4MW8 A; 3RFR A; 3HR0 A; 4X1Y B; 1NQT A; 3DC6 A; 5IJ0 B; 4UCV A; 2FB5 A; 4XDK A; 1S5L Z; 3TXS A; 3W7X A; 1KP3 A; 4NYK A; 4UV8 A; 1YJ9 V; 2JGU A; 1SA0 A; 1R3L C; 4CC5 A; 4PHZ A; 4PDL A; 3K03 A; 1EN6 A; 1NVP B; 4BWA A; 1ZLZ A; 1OJH A; 2UU9 B; 2MW2 B; 5L3F A; 4F6R B; 3ASN C; 3SYQ A; 3CPW U; 4JV5 O; 3C3T A; 3CJH A; 4ZOL A; 2F23 A; 3LSS A; 4AQY O; 5BZB A; 2DYR C; 3EVK A; 5FNV B; 2YUA A; 3OMI B; 2E3C A; 4TT3 G; 3UO2 A; 1R6K A; 3ZRS A; 4JI7 O; 2XAS A; 3CCU V; 2E75 B; 4YJ2 A; 2FYU H; 1AR5 A; 2Y69 C; 1RFY A; 4B7K A; 4CH3 A; 1DK1 A; 4UCS A; 3QG5 A; 4QPJ A; 2AGA A; 3LNM B; 4GX5 A; 2NLJ C; 3JCU Z; 1Y4M A; 5LGT A; 1F23 A; 4JI0 B; 4LH6 A; 2ITD C; 2XAG A; 3HKD B; 2PUS A; 3RYI A; 1V9P A; 3OT7 A; 5KLV H; 1Q3E A; 3H1I H; 4JI0 O; 2R72 A; 3ABT A; 2IH1 C; 4CS2 A; 4I55 B; 1OZ0 A; 2EIN C; 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