The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
79
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structure length |
79
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Chain Sequence |
MDRVLSRADKERLLELLKLPRQLWGDFGRMQQAYKQQSLLLHPDKGGSHALMQELNSLWGTFKTEVYNLRMNLGGTGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Viral protein
|
| molecule keywords |
LARGE T ANTIGEN
|
| publication title |
NMR structure of the N-terminal J domain of murine polyomavirus T antigens. Implications for DnaJ-like domains and for mutations of T antigens.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Murine polyomavirus
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| total genus |
19
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| structure length |
79
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| sequence length |
79
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-07-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CTQ A; 2EJ7 A; 4J7Z A; 2CTP A; 2CTW A; 1HDJ A; 2YUA A; 2QSA A; 2Y4U A; 1XBL A; 3APO A; 3UCS C; 1BQZ A; 2QWQ B; 1BQ0 A; 2N05 A; 1WJZ A; 2DN9 A; 1GH6 A; 2DMX A; 2QWR B; 1IUR A; 1FPO A; 3UO2 A; 2LO1 A; 2OCH A; 3APQ A; 2N04 A; 3AG7 A; 1N4C A; 2M6Y A; 2PF4 E; 2Y4T A; 4IT5 A; 1FAF A; 2YS8 A; 2GUZ B; 3UO3 A; 2QWN B; 2QWP B; 2CUG A; 1NZ6 A; 4J80 A; 2L6L A; 2LGW A; 2QWO B; 2GUZ A; 2CTR A; 3BVO A; 4RWU A; 2KQX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1P4R A; 2P06 A; 2R9R B; 3LDD A; 4LF4 B; 5LHI A; 4Q6G A; 4B3M B; 4GKK O; 5BMV A; 1G6U A; 3MHS C; 2XT9 A; 2OT5 A; 1N32 B; 2KSD A; 4YHH B; 3D36 A; 1NI8 A; 3K57 A; 1IBM B; 1M90 W; 5JJJ B; 2YEV A; 2H94 A; 1I7F A; 4DR7 O; 4LF7 O; 1P7G A; 1J95 A; 2GDS A; 5IWA B; 1Q86 W; 2A7W A; 3AEI A; 1M1K W; 5CBF A; 5GON B; 4GUN A; 3K9S A; 3K5L A; 1R3J C; 1FS0 G; 4NB5 A; 4X20 B; 3WG7 B; 3EXA A; 3SGI A; 4DV4 B; 3PN1 A; 1AJP A; 1GM9 A; 2P6J A; 1B3Q A; 2B5U A; 2Q5Z A; 2OYQ A; 2IH3 C; 1OCR C; 4O4I B; 4XBF A; 2XOK G; 4GKJ B; 4CS3 A; 4D7S A; 2AZ0 A; 4LF5 B; 1NBM G; 4H44 B; 4X9Q A; 3QVN A; 3L75 H; 4L87 A; 2F43 G; 2H3O A; 4J42 A; 4PJ0 Z; 2CGN A; 3ZMS A; 2JDI G; 3ZHU A; 1VF6 A; 1Q90 D; 4YIO A; 1YSC A; 1WPX A; 1OJH A; 3TCU A; 4ZKI A; 1S3J A; 5LL6 Y; 3KZI Z; 3HKD A; 2XAG A; 1FXK A; 4WFF A; 1BGY H; 1AVM A; 2X6C A; 1FJG B; 5LMU B; 1DK1 A; 2EX3 A; 3GVM A; 3FKS G; 5J2U A; 4I7Z B; 2P22 C; 4QIW F; 3WU2 Z; 3T1C A; 2UXN A; 1Y74 A; 4FFB B; 4RQF A; 1K33 A; 1ZSP A; 3HPL C; 3QO5 A; 5JWP A; 1I94 B; 3S3W A; 5EYP A; 4DV6 O; 2WLN A; 1HR0 O; 2WLJ A; 3SPI A; 4B7K A; 4O4J B; 1QNM A; 1EZJ A; 4NXN O; 2EIM B; 2F95 B; 3K04 A; 4H13 B; 3U10 A; 4OPA A; 4FLV A; 1NT2 B; 2UXD O; 2LO1 A; 2WA3 A; 2OTL V; 4TV8 B; 3VBB A; 3LDC A; 1YCI A; 5KMG A; 4QPJ A; 2QE7 G; 4ZOL A; 2YIA A; 1SQP H; 4ASU G; 3OW2 U; 3HKB A; 1S72 V; 1JVM A; 4B3S O; 2E3C A; 5C8Y B; 2H8P C; 3VQV A; 4LFA B; 1IX9 A; 5FLX N; 2P4K A; 4CH3 A; 4JYB A; 4DV2 B; 4DUY B; 1IXM A; 5EBL C; 4B3R B; 1PPJ H; 1V9P A; 4X64 B; 3ABK C; 2EIL B; 4LNU A; 2X7R B; 1FFX B; 2LGW A; 4YJ2 B; 3L72 H; 1TUE B; 2V7Q G; 2EIN C; 2IW5 A; 2ZXW C; 4IHJ B; 2QEX V; 1RP3 B; 5KX5 A; 3DXR B; 4IIJ A; 3A2F A; 3JD0 A; 1ZL8 B; 4LF9 O; 4YY3 O; 1VQ7 V; 1KYO F; 2E5L B; 4TSF G; 3OR6 C; 4WFG A; 3K0D A; 5LYJ A; 1IVS A; 1GN2 A; 4K35 A; 1COW G; 3JD2 A; 2BOC C; 2UU9 B; 1VQO V; 4FFK A; 2Q0A A; 3JAL A; 5BXZ A; 3BEH A; 3AK1 A; 2K1E A; 2ZQM A; 5D5Q A; 1QCE A; 3K58 A; 1NTK H; 3CCU V; 2Q6A A; 4U3J A; 1PNK A; 3R65 A; 1SES A; 2PYL A; 1WP8 A; 4DR5 B; 2UXC B; 3FYI B; 2YUA A; 2Z3Y A; 5CMU A; 4JI5 O; 5ITZ A; 3AG7 A; 1QR8 A; 1QHT A; 2IJJ A; 1FXV A; 3QO7 A; 4HBN A; 4FLZ A; 1VQ8 V; 1GM8 A; 1OV9 A; 1OZ0 A; 4LH7 A; 4N21 A; 1RSO A; 1FXH A; 3ABM B; 1Z5W A; 3ABL C; 2C2A A; 3E86 A; 4BWA A; 4LWS A; 5EC2 C; 3SJB C; 1VIB A; 4U3F H; 1QVG U; 5IY5 B; 1NVP B; 5L3G A; 4I55 B; 1H2S B; 3FB6 C; 3M7M X; 5B1A C; 2ZIN A; 3ZMT A; 4G27 B; 5EC1 C; 4LFC B; 3C3S A; 3CCQ V; 5L3C A; 5JH7 B; 2BSK B; 3VQX A; 1H2M A; 4RWU A; 1WA8 B; 2A0L A; 4O2A B; 4TT3 G; 3VQY A; 3SYA A; 5IYB O; 3JAS A; 4R7C A; 1XBL A; 2ZR2 A; 4DV3 B; 4DO2 A; 3DSQ A; 3W7W A; 4DV5 B; 3CRM A; 1KQS U; 2PGG A; 2ZM6 B; 4XDK A; 1GN6 A; 1YDX A; 4GX2 A; 2YXH A; 1DF4 A; 5H2F Z; 4MTF A; 3OEH G; 4O4L B; 3ZX6 A; 5KA5 A; 3ZBH A; 2HVJ C; 3RYI B; 1Z5V A; 3G71 V; 4Q20 A; 1IZ3 A; 1PM9 A; 2XAQ A; 1XRE A; 3CJH A; 1MSW D; 3WG7 C; 4EEQ A; 2Q68 A; 2BTQ A; 5CA1 A; 3ML0 A; 1H8E G; 3CRQ A; 3MDS A; 4UXN A; 4I5S A; 3K5N A; 4JI2 B; 1Y76 B; 1RFY A; 2PI5 A; 4AI8 A; 3CXH F; 4C7U A; 2KB1 A; 5LHH A; 4N23 A; 4FZ0 A; 3RVY A; 2ATK C; 2Y4T A; 3Q4H B; 4K3A A; 3QNE A; 5A9G A; 2HG5 C; 2OIE A; 3JAM N; 4JGS A; 3T1H O; 4D6T H; 3UT5 B; 5B5E Z; 3RVZ A; 1NKD A; 4AQY O; 4O4H A; 4P9O A; 3C90 A; 2ETN A; 2JEX A; 3W7X A; 1AIL A; 4FLW A; 2Q69 A; 5EIB C; 3MHH C; 2GTS A; 1Y6X A; 2CH7 A; 2K9P A; 3CWB H; 5F2V O; 3A0R A; 3LNM B; 3BA8 A; 4FVM A; 1I08 A; 1KP3 A; 1O9G A; 1TVK B; 3RWR D; 1M56 B; 4KUM A; 2F93 B; 4WBN A; 2HKO A; 2ZDI A; 3FX7 A; 1T5E A; 2CTP A; 1BQ0 A; 4DR6 O; 2JEU A; 1TGO A; 2ILM A; 1SA0 B; 1IUR A; 2YEV B; 4ZBM A; 2EIM C; 2DQ0 A; 3H01 A; 1S0V A; 4X1I A; 2WLI B; 3W7T A; 1IDS A; 1NU1 H; 3RYH A; 4DR4 O; 3CRR A; 3HB3 B; 1E79 G; 3MAQ A; 4UB8 Z; 3ZN0 A; 4K8X A; 3RN4 A; 2MW2 B; 2PI4 A; 5L3D A; 1NR1 A; 4TV9 A; 3HR0 A; 2DQ3 A; 2FYU H; 3JD3 A; 3CS5 A; 4JAA A; 5JCO C; 4JI1 O; 4NTW A; 1US6 A; 3RYC B; 3RGB A; 3AG4 B; 4UVA A; 3GWK C; 5LHG A; 1E1R G; 1GM7 A; 1L1F A; 2EIL C; 1BSM A; 1EN6 A; 4JAV A; 4CBC A; 2ADQ B; 4DW0 A; 3FAV A; 3RYF B; 3HKC A; 2F1M A; 5IYZ B; 2DYR B; 3NXS A; 1XHX A; 5DN6 G; 1YTF D; 1JCH A; 3CYO A; 4X1Y A; 4JI3 B; 3SJC C; 5JJN B; 2JRI A; 2EIN B; 2FML A; 2QWO B; 3K06 A; 1XNR O; 1VP7 A; 2HR3 A; 3H9V A; 4OXS A; 1HNZ O; 3E22 A; 1WLE A; 3JYC A; 1JFF A; 5EZY A; 2LGQ A; 1AI4 A; 2Y0P A; 3ICX A; 4TQF A; 1W0J G; 5KHI A; 1S5J A; 1LR1 A; 5CBH A; 1Q6H A; 5E79 Z; 4DRX A; 1PKX A; 2YI8 A; 2YI9 A; 3K03 A; 3RFR A; 3ZS8 C; 2EZP A; 4YIP A; 3THO A; 4JZ2 A; 4TUY A; 4F4L A; 3K08 A; 4FM0 A; 2B1G A; 2HJD A; 4NTX A; 1CP9 A; 3T1Y O; 3BCC H; 4ZOL B; 2YS8 A; 5H6R A; 5CBG A; 2X6A A; 4HNA A; 1H2L A; 3K79 A; 3OTF A; 4JV5 O; 5LOV A; 4G2K A; 4I4T B; 4UCU A; 1QLN A; 1RPR A; 1R73 A; 3ZED A; 1S5H C; 4TOI A; 3O65 A; 4J11 A; 3ZMU A; 2EIK B; 3ABM C; 4R6Z A; 4UV8 A; 4EFB A; 2VWJ A; 1M57 B; 5IJ9 A; 3DGE A; 4PDR A; 3P32 A; 4JI8 B; 4MW3 A; 4UVB A; 2A06 H; 4GKK B; 5IY5 C; 5IYD O; 3AG1 B; 3N2G B; 1J5E O; 1VQL V; 2JIZ G; 2WLL A; 3ZRV A; 1QLE C; 2XAJ A; 2AGA A; 1N36 B; 1LUV A; 2GUZ A; 5KAF Z; 4DR7 B; 2CTR A; 3OTO B; 1XMQ B; 2LQT A; 1Y4M A; 3LSS A; 3SYC A; 2OTJ V; 2HEP A; 3JAW A; 1U97 A; 4WCE V; 3K5M A; 1AR1 B; 2BOB C; 2QWR B; 1UPG A; 3UQ8 A; 1Q5O A; 3EVK A; 1M93 A; 4KL1 A; 4ICG A; 3N27 A; 4IGG A; 1QU7 A; 3CC2 V; 1SQB H; 1IBK O; 2VQF O; 2W0F C; 3JAL B; 1DF5 A; 1XL4 A; 1N34 O; 1QR9 A; 5H5N A; 1XQ8 A; 1KC8 W; 1U96 A; 2ITD C; 1F4M A; 1GKF A; 3UCS C; 1RM1 B; 1ARO P; 4LCU C; 1FYJ A; 1R1B A; 4QJF B; 4FM2 A; 2KG7 A; 4GYC B; 5BY1 A; 1ROP A; 1YJN V; 4LFB B; 4CZZ A; 2O57 A; 4CH4 A; 4DR3 B; 5IDJ A; 1ZX3 A; 5GW7 A; 1PNM A; 1NQT A; 4RUE A; 1A32 A; 3JCU Z; 3K0G A; 4DYL A; 4CC5 A; 3L71 H; 4HAM A; 2ZE8 A; 2FL4 A; 5LXT A; 2DMX A; 2PYJ A; 1KU9 A; 4DV7 O; 4MTX A; 1PL0 A; 4X8A A; 2YXL A; 1SQF A; 5J2T B; 5FNV B; 2L6L A; 4AHC A; 4D7T A; 1MZF A; 1EBO A; 3HKE B; 4JPR A; 1H38 A; 1AR4 A; 4DV6 B; 3L70 H; 2ZE5 A; 1HR0 B; 4JI0 O; 3ABT A; 3TET A; 2JS5 A; 3STL C; 2M6Y A; 2PF4 E; 3IAY A; 2NLJ C; 3ASO B; 3CRC A; 3SJQ C; 1URF A; 4B3T B; 4LF4 O; 3E8H A; 4JI6 B; 3IGA C; 3L9D A; 3JAS B; 5KUM A; 5CB4 B; 1VEW A; 2NNU A; 4NXM B; 3JAT B; 1N32 O; 4YHH O; 1K97 A; 1M56 C; 1R6T A; 4LF8 B; 5H6Q A; 2Y69 B; 3D36 C; 4DV0 O; 2ITC C; 5IWA O; 2Q67 A; 4I9W A; 4ZI7 B; 3O9O A; 1VMG A; 3OR7 C; 5LMN B; 3E8B A; 1OCO B; 4PD4 F; 2QM7 A; 4J41 A; 4DV4 O; 4UCR A; 5KA6 A; 2YID A; 3VQW A; 1BCC H; 3CJH B; 4CH5 A; 2LFS A; 1YXB A; 4LC1 A; 1K9M W; 4GKJ O; 5KHH A; 2HP8 A; 5CA1 B; 1KP2 A; 1L8D A; 4JYA B; 5B1B B; 3IFX A; 2UXB O; 1ZUQ A; 1SQX H; 1S77 D; 4ZHQ A; 3CC7 V; 1XNQ B; 4GX5 A; 5DM6 V; 3AG4 C; 1OCC B; 4KP4 A; 5E1A C; 2RCV A; 1D5A A; 1F7Y A; 2QTO A; 1L0L H; 1VQM V; 4JZG A; 3OGC C; 4UCT A; 5KUK A; 5LA6 A; 1VQN V; 4YJ3 B; 2UUA B; 1FFT B; 3OUS A; 2DYR C; 3TGU H; 5JQG A; 1FJG O; 5LMU O; 4NYK A; 1K4D C; 1Q8I A; 5DED A; 3BVO A; 3WB2 A; 3TK1 A; 4WFB V; 2VQE B; 3ETE A; 3N2K B; 4I50 A; 4FPP A; 1TUB B; 1L0N H; 5JVD B; 1BL8 A; 1GH6 A; 2D2C B; 3U0Z A; 1GK9 A; 2UUC B; 2GBO A; 3C3T A; 4FZ1 A; 1I94 O; 2Y48 A; 3ZRS A; 4B7E A; 5CA0 B; 4UCO A; 4PEL A; 4F6E A; 2KQX A; 1VAR A; 4F6R A; 3CCV V; 3ZHS A; 2Y4U A; 1JA8 A; 1VQ6 V; 3RYH B; 1NH2 D; 3D3Q A; 1WNS A; 3A0H Z; 4EB6 A; 2IJI A; 4RAI A; 1KKD A; 1FAF A; 2Q73 A; 2JGD B; 1FD9 A; 3E35 A; 2IM9 A; 4BR6 A; 1V55 B; 2JVD A; 4I0X B; 1XDC A; 3DC5 A; 1EN4 A; 4P2Z A; 2F4V B; 4ZIB A; 3P30 A; 4OGQ B; 4B3R O; 4X64 O; 2XND G; 3ABU A; 3OGI B; 2Q0O C; 4GZR B; 1SET A; 2EIK C; 3U11 A; 4DK1 A; 1XMO B; 1E1Q G; 3SYO A; 1M57 C; 2RDC A; 2E74 B; 5LGU A; 4GX1 A; 5BR8 B; 1GN4 A; 4PA4 A; 3JAK B; 4X62 O; 3AG1 C; 1XOU A; 4FMT A; 2ZKO A; 2BE3 A; 3JAR B; 4JI7 B; 1JOY A; 1XIL A; 3J81 N; 2ZR3 A; 2PY5 A; 3TJT A; 2AHZ A; 2YDE A; 1BZK A; 5GON A; 2AW9 A; 1CEZ A; 1QLE B; 4J10 A; 4X20 A; 1VF7 A; 2GTA A; 4MT8 A; 2CGO A; 1GTO A; 4BW5 A; 4O4I A; 1BHB A; 3E22 B; 1PL4 A; 1K73 W; 4K0K O; 3QTC A; 2CTQ A; 1EZV H; 3J80 N; 1M4U A; 1SZX A; 1N8R W; 3STZ C; 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1OCC C; 3CPW U; 4L8J A; 2JGU A; 1AI7 A; 2W0X A; 1HNZ B; 4JYY A; 1EFR G; 2IJH A; 2R9I A; 3CRA A; 3ETQ A; 1OCZ B; 4E4E A; 2JK5 C; 1GRJ A; 4MTG A; 2QGN A; 2Z0A A; 2YIC A; 3OFN G; 1FKA O; 4FK5 C; 2RMK B; 2DOS A; 4HZ3 A; 3HKD B; 1FXK B; 1VF5 B; 2YXY A; 1W0K G; 1YIT V; 5J2U B; 1Q82 W; 1S76 D; 2FKX A; 3FFQ A; 1KB9 F; 3B77 A; 3SR2 C; 1KEC A; 3IJ4 A; 1Y74 B; 3H1L H; 1WN7 A; 1NJI W; 1I5X A; 3OAA G; 5EYP B; 4H33 A; 4NVP A; 5LP6 A; 4MVO A; 2HVK C; 1IBL B; 3D8C A; 1S5L Z; 4MS2 A; 4DR1 O; 1J5E B; 1KUQ A; 3SPG A; 4X1K A; 4X66 B; 2BSK A; 4LF6 O; 3ZMZ A; 1WA8 A; 4O2A A; 1BMF G; 1V55 C; 3CP1 A; 2N04 A; 1Y67 A; 4MTO A; 5KMG B; 3T4Z A; 2A79 B; 4FM1 A; 3JD4 A; 3HKB B; 3E83 A; 2RNB A; 4JI4 O; 1HNX B; 5EBW C; 3DTU B; 2XUM A; 3ZHR A; 1NVP D; 4KHP O; 2VQF B; 1SQV H; 3ZRW A; 1N33 B; 5LA6 B; 2XHB A; 3M8A A; 3LUT B; 4O4L A; 1F51 A; 4OPH A; 4LNU B; 3RYI A; 1WB8 A; 4NTY A; 4I50 B; 1JJ2 U; 4UV9 A; 4JAS A; 2P4V A; 3JCZ A; 1UFI A; 4QE7 A; 4LF7 B; 1HNW O; 4UCV A; 5KX5 B; 4MVR A; 4IIJ B; 3H1H H; 1BE3 H; 3K3W A; 3BA9 A; 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