The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
88
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structure length |
88
|
Chain Sequence |
MHHHHHHLVPRGSILKEVTSVVEQAWKLPESERKKIIRRLYLKWHPDKNPENHDIANEVFKHLQNEINRLEKQAFLDQNADRASRRTF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
KIAA0730 protein
|
| publication title |
Solution structure of DnaJ domain of human KIAA0730 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
15
|
| structure length |
88
|
| sequence length |
88
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1N4C A; 2QWR B; 3BVO A; 2EJ7 A; 2PF4 E; 4IT5 A; 1XBL A; 2CUG A; 2QWP B; 4J7Z A; 2LO1 A; 2LGW A; 2QWN B; 3APQ A; 1HDJ A; 2GUZ A; 2OCH A; 1GH6 A; 3UCS C; 1WJZ A; 1IUR A; 2Y4T A; 2YUA A; 4RWU A; 1FAF A; 2DMX A; 2CTW A; 3APO A; 2CTR A; 2GUZ B; 2QWQ B; 4J80 A; 1FPO A; 2N05 A; 2QWO B; 3UO2 A; 2N04 A; 2KQX A; 1NZ6 A; 2CTQ A; 2DN9 A; 2QSA A; 2Y4U A; 3UO3 A; 2L6L A; 2CTP A; 3AG7 A; 2M6Y A; 1BQZ A; 2YS8 A; 1BQ0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HPL C; 1YEW A; 3W7W A; 3SYP A; 2QKA A; 4FLX A; 1IBM O; 3K58 A; 1VQL V; 3WFV A; 3LDE A; 1F7Y A; 4K8X A; 3RFR A; 3JAR A; 4JZG A; 1K7D A; 1S3J A; 3WB0 A; 4TV9 A; 1XEQ A; 2EIK B; 3DSQ A; 4X1K B; 1FFX B; 2JJ2 G; 1XMO B; 1OCC C; 1IVS A; 5B1O A; 1K92 A; 2ZIM A; 4TV8 B; 4J10 A; 2P67 A; 4J7Z A; 4N21 A; 5EBM C; 2AXT Z; 5CMU A; 1IXM A; 1R3I C; 1M57 C; 4EFE A; 2PI5 A; 3E8H A; 3IC9 A; 1BMF G; 1XMO O; 2BTO A; 3KZI Z; 3OM3 B; 1H2N A; 1SQP H; 3LSQ A; 3B09 A; 5HFM A; 4CS2 A; 3M8A A; 2ZE8 A; 4TUY A; 3E86 A; 2PTM A; 2LO1 A; 4Z2W A; 3HB3 B; 1BZK A; 3B4S A; 2NNU A; 2JEU A; 3OR6 C; 3SPH A; 3T1C A; 4O4L A; 2HKO A; 4JGS A; 2W6J G; 2D3O W; 2QKC A; 1URF A; 1W0K G; 1KU9 A; 4FK5 C; 1QCE A; 1QVG U; 4AQY O; 1AR5 A; 4NYK A; 1R73 A; 5K1X A; 2Q69 A; 3TCU A; 3KCX A; 1MSD A; 2JGD B; 2F93 B; 3TET A; 4UV8 A; 3CC2 V; 4R6Z A; 1N36 B; 5EIB D; 1H2K A; 1GN4 A; 2H94 A; 3N2G B; 4P9O A; 4UB6 Z; 4YJ3 A; 2ADQ B; 3APQ A; 4IIJ A; 4B7K A; 2F95 B; 3ABM B; 5GTH Z; 5LP6 C; 2HJF C; 1N36 O; 2ZNI A; 1K4D C; 4WFA V; 5FPR A; 5EC2 C; 1Q81 W; 2YIC A; 3ML0 A; 3FAV B; 4JI3 B; 2LFR A; 5LL6 Y; 2ZCE A; 5H9C A; 1GM7 A; 1FYJ A; 4GX2 A; 2UUB O; 1H2M A; 1DTO A; 2UUC B; 1HWY A; 2YDE A; 2YXY A; 5KAF Z; 4FVM A; 1M56 C; 4XDJ A; 4NTX A; 1Q8I A; 4H13 B; 1MSW D; 1KBH A; 4JYY A; 4JI3 O; 1QVF U; 1ZTE A; 3CHX A; 4DV3 B; 4JV5 O; 5LXT A; 2UUC O; 4LC1 A; 3ZRW B; 4UCO A; 2QJ1 A; 1B04 A; 4UVB A; 3IAY A; 1VP7 A; 2FYU H; 2ITD C; 3BHP A; 3R65 A; 2F66 C; 4DV3 O; 1XIL A; 1YJN V; 4IHJ A; 1Q82 W; 5EIB C; 4J9Z B; 3K9S A; 4HNA B; 4CH4 A; 5LHI A; 5FNV A; 5KLV H; 4DR6 B; 2HG5 C; 4X88 A; 2R70 A; 2P22 C; 1VQK V; 1SRY A; 2P4V A; 2Q0O C; 1YJ9 V; 5L3F A; 1AJP A; 4WFE A; 2CE4 A; 2WWW A; 1QQC A; 4DR6 O; 2YIA A; 5CB4 B; 1E1R G; 3F7V C; 5LMU B; 3ZMT A; 1S77 D; 3RVZ A; 1YSC A; 2LW1 A; 4DR7 B; 1MMM A; 5DEC A; 4FLU A; 1M5I A; 4DV0 B; 4WF9 V; 3NXS A; 2Q8V A; 2ZE6 A; 4J11 A; 4J80 A; 3BPZ A; 5LOV A; 3G67 A; 4KUM A; 1CP9 A; 4IYH A; 4X62 B; 4FIP C; 4F6R B; 3K04 A; 4MTX A; 5LHH A; 2ZDI C; 3ZBH A; 2UXB B; 3OD4 A; 2HR3 A; 5J9P C; 3D3Q A; 3CCV V; 4R8C A; 4O4J B; 2WLN A; 4DV4 B; 4BW9 A; 2DOS A; 3K5L A; 2QM7 A; 4CZZ A; 3E83 A; 4DRX A; 1W0J G; 4X62 O; 1VQ4 V; 2BE3 A; 2XAS A; 4WFG A; 3CMA V; 2UXB O; 4O4H A; 3L72 H; 3QNE A; 4DV4 O; 2ZT9 B; 1SQB H; 5C8Y B; 1V55 C; 3JD0 A; 4I7Z B; 5EK0 A; 4X9Q A; 2PYL A; 1G8M A; 4PI2 A; 3DXR A; 1ZWI C; 2YUA A; 1PNK A; 1ZX3 A; 2DYR B; 4DXW A; 3THO A; 1IXB A; 2JIZ G; 4KHP B; 4PHZ A; 3E22 B; 3K06 A; 3L75 H; 3Q4H A; 3B77 A; 4MW8 A; 1PNL A; 2ZQM A; 4UB8 Z; 2XND G; 2DW4 A; 3JD1 A; 3JAS A; 2KKW A; 3ABM C; 2P5O A; 4DR5 B; 2Y4T A; 4KHP O; 1OCZ B; 3S3W A; 4ABM A; 4X20 B; 5JCO C; 3F5T A; 1JVM A; 5CA1 B; 4G28 B; 4UXN A; 1PL4 A; 1Y66 A; 2PY5 A; 2AW9 A; 5LA6 B; 2E74 B; 3BFR A; 2M7W A; 1F51 A; 3VQV A; 1KUQ A; 4DR5 O; 3ZED A; 2A79 B; 5K1P A; 4GCZ A; 2KG7 A; 3AK1 A; 4F4L A; 4NB5 A; 3ABL B; 2YI8 A; 3BY6 A; 1ZL8 B; 2QWP B; 2FB5 A; 4PA4 A; 4PD4 F; 5BZB A; 3ETG A; 4H33 A; 5D5Q A; 1PKX A; 4MVO A; 2B1G A; 3CJH A; 1YIT V; 1GTO A; 3APO A; 3N27 A; 1NKD A; 3U10 A; 5B1A B; 4LBE C; 4I0X A; 1S5H C; 2HFE C; 4FFK A; 1F4M A; 2LQT A; 4UCV A; 4QNH B; 3CCQ V; 2BOB C; 4IT5 A; 1AR1 B; 2BOC C; 5DED A; 3T1H B; 1L0N H; 1JCH A; 4JPR A; 2JJ1 G; 2W0F C; 1S0V A; 4WBN A; 3I55 V; 1FPO A; 4I55 A; 4E2L A; 3SJA C; 2ZD9 A; 4LF7 O; 2WLL B; 2IJI A; 3ZX6 A; 3T1H O; 3OTF A; 3JAW A; 3JCU Z; 1Y4M A; 1P84 F; 3CCU V; 3LSS A; 3AEI A; 2FTK A; 3B40 A; 4O4I B; 1VF6 A; 2CH7 B; 2WPD G; 4LF9 O; 1L8D A; 4D7S A; 5BXZ A; 1I08 A; 2GTS A; 4OX9 B; 1I0H A; 4DW1 A; 1KQS U; 1M4U A; 2Q7H A; 2PGG A; 3OGI B; 1BHA A; 1YVW A; 4LFB B; 2GTA A; 3DTU B; 2DJV A; 4IL6 Z; 5AG2 A; 5IE9 A; 5KHG A; 2HJD A; 4U7N A; 4OX9 O; 4J7J A; 1FXK B; 3FB6 C; 1F23 A; 2R9I A; 2R9R B; 4FZ0 A; 2CTR A; 4B3T B; 3ICX A; 4LFB O; 2EIJ B; 2BCC H; 3JAL B; 4DV5 B; 3JCZ A; 1M57 B; 1S5L Z; 5EYP A; 3VQX A; 4FLV A; 4EEQ A; 4MVZ A; 5KMG B; 4B3T O; 1BCC H; 1VQM V; 2E3C A; 5IYC O; 4DV5 O; 3RN4 A; 2X6C A; 3FYI B; 1AIL A; 3UO2 A; 3B8M A; 4LWS B; 1WNS A; 4CBC A; 2Q7G A; 5IWA B; 1V54 B; 5CBF A; 1JJ2 U; 4NVP A; 1EZJ A; 2H3O A; 4LF8 O; 5LMN B; 1DGS A; 2XAJ A; 2LJ2 A; 5GON A; 5B3S B; 3MHH C; 2Y0I A; 3LNN A; 5IWA O; 5A2Q N; 4I50 A; 5BMV B; 2F43 G; 5KUM A; 1RSO B; 4P2Z A; 3HKD A; 5IJ0 B; 1TAE A; 2Q73 A; 4QE9 A; 3H1H H; 3SJB C; 5LMN O; 2C2A A; 2HVK C; 3AG2 B; 1X4T A; 4JAS A; 2NN4 A; 4RAI A; 3RYF B; 4WCE V; 2K1E A; 4EB6 A; 1OCZ C; 4XDK A; 1QLN A; 1KD1 W; 2YIB A; 1VIB A; 2P4K A; 1GK9 A; 2GUZ B; 5KUK A; 4YIO A; 1VQ6 V; 5CBH A; 2IBZ H; 3ABL C; 1JFF A; 3WB2 A; 5CA0 B; 5JQG A; 1BE3 H; 4JF3 A; 2PUS A; 3MHS C; 1L0L H; 1VF7 A; 2ATK C; 4YJ2 B; 4DR3 O; 1AR4 A; 3E8F A; 4ZOL B; 1AI4 A; 1YHQ V; 3JAT B; 4X1Y B; 1JR9 A; 3UT5 A; 5JJJ B; 3RYC B; 1N0J A; 1WN7 A; 4EFB A; 5B1A C; 2YEV B; 4DR4 B; 2Q6A A; 1AB3 A; 4JI8 O; 4GUN A; 3UKM A; 4UVA A; 4ASU G; 3PJS K; 1US6 A; 1AVM A; 3OUF A; 2Q0A A; 1YJW V; 4I9Q A; 4DR4 O; 2B9Z A; 3WG7 B; 5LGU A; 3BA9 A; 2AGA A; 4JTD B; 4NKG B; 4LNU A; 1TUB A; 1XHX A; 2PYJ A; 3K3W A; 2W0X A; 1CXZ B; 1IX9 A; 4DV2 B; 1LNQ A; 2IW5 A; 2UXX A; 1FJG B; 1MZE A; 1Q6I A; 3L71 H; 3ABK B; 1D2D A; 3HKB B; 1V9P A; 2JDI G; 3SYA A; 3FB7 C; 4JI1 O; 4WFH A; 4DV1 O; 5BY1 A; 2YSU B; 1TVK B; 3GWK C; 1LR1 A; 3UM7 A; 4GX5 A; 4DV2 O; 2OCH A; 4NXM B; 2ZM6 B; 1FJG O; 3FB5 C; 5EC1 C; 3OW2 U; 1H8E G; 3STL C; 1VMG A; 3FB8 C; 4TV8 A; 3ZHQ A; 3J7A U; 4NXM O; 1XDC A; 2ZM6 O; 1FXK C; 2GDS A; 3WB1 A; 1GMG A; 2JS3 A; 1KB9 F; 4RUF A; 4GZR B; 2AHY A; 5LGN A; 2HP8 A; 2EIJ C; 2GSM B; 4HYO A; 2XAG A; 4Z1V A; 4GT1 A; 3JAM N; 4QGP A; 4GYC B; 4P30 A; 1EBO A; 3SR2 C; 3QO5 A; 4FPP A; 4DUY B; 4KP4 A; 3CCJ V; 1SS3 A; 4TV9 B; 1S76 D; 5JJE B; 1KKC A; 4CC5 A; 4JI4 B; 1IDS A; 2AHZ A; 3QO8 A; 2ZR3 A; 1SQX H; 1V54 C; 5IDJ A; 2HHH B; 4AQY B; 1XL4 A; 4DUY O; 1OV9 A; 3SPJ A; 3BAA A; 3CSX A; 1E79 G; 1QR9 A; 2X7R B; 2K9P A; 3WU2 Z; 4JI4 O; 3CX5 F; 3B8N A; 4JYB A; 5B3S C; 3CWB H; 4O2A B; 3G80 A; 2HHH O; 3VQW A; 3L9D A; 2YC0 A; 4TUY B; 1H8H G; 3CYO A; 1WA8 A; 3CME V; 5C93 A; 5F2V O; 1VQ8 V; 3HKE A; 3AG2 C; 1FAF A; 2DMX A; 3SPG A; 1V55 B; 3AG3 C; 1R3K C; 2N05 A; 1SC5 B; 2CTP A; 4DW0 A; 3N2G A; 3H01 A; 2YS8 A; 3IGA C; 2F1M A; 2QGN A; 2EJ7 A; 5IJ9 B; 2YXH A; 4NTW A; 5H6Q A; 2EBO A; 2OWO A; 2JEX A; 3CRC A; 1X59 A; 1MA1 A; 2QWO B; 5JCO A; 2UUB B; 3K03 A; 4R7C A; 1AI6 A; 3FAV A; 1YF2 A; 2LP7 A; 4PEL A; 3HKC A; 2IJH A; 3C3S A; 4YXW G; 3QF7 A; 4PA7 A; 1QLE C; 4JV5 B; 2E76 B; 2QM4 A; 3U11 A; 4YJ3 B; 2QA4 V; 1XMQ B; 2KSD A; 3ZRX A; 4IIJ B; 3P3P A; 4YY3 O; 4XBF A; 4GLX A; 3WG7 C; 4DYL A; 3ZRW A; 1D5N A; 1CPY A; 4BWA A; 1WLE A; 1XMQ O; 1FXV A; 1YTF B; 3ZCC A; 3W7T A; 2LGW A; 3ABK C; 4U3F H; 2WLM A; 3CCL V; 3E2E A; 2JVD A; 2RJZ A; 5EZY B; 3D36 C; 4TQD A; 3TJT A; 3W7X A; 1I5Y A; 5DM6 V; 3CXH F; 1P7G A; 4NTY A; 4X64 B; 2WAM A; 5FL7 G; 3M7M X; 1K8A W; 2EIL B; 3K5O A; 5J2U B; 5L3G A; 1QNM A; 1AP5 A; 3CE2 A; 1BGY H; 4LCU C; 2DE0 X; 4X64 O; 4QPJ A; 3OE7 G; 2KB1 A; 2QE7 G; 5E1A C; 3DC5 A; 4K0K O; 5LHG A; 4AHC A; 1THZ A; 3BA8 A; 2EZO A; 1K34 A; 2F23 A; 1NVP B; 3ASO C; 3D3I A; 4LR3 A; 3T2M A; 2YXL A; 1NT2 B; 1NZ6 A; 2FKX A; 4DO2 A; 1AP6 A; 3FKS G; 1VAR A; 1Q7Y W; 3K08 A; 2VQF B; 2A0L A; 2BTQ A; 1H38 A; 2VWK A; 1TGO A; 3CS5 A; 1OJH A; 4LH7 A; 1BQZ A; 3J81 N; 2XOK G; 4O4J A; 1XRE A; 2XHB A; 5CA3 A; 1Y74 B; 4ZHQ A; 5JH7 A; 2BSK B; 1QR8 A; 3FFQ A; 1GM8 A; 3OAA G; 2VQF O; 3L73 H; 1XUQ A; 5L3B A; 3MAQ A; 2PZS A; 4X66 O; 1HW7 A; 2AZ2 A; 1VQO V; 4KXR A; 2NR5 A; 4P9P A; 1Q43 A; 3K0G A; 4MVM A; 5JWP A; 4BIZ A; 1BSM A; 3A0B Z; 3VOU A; 1TUE B; 2ZIO A; 3RWR D; 3G71 V; 1YTF D; 3RYH B; 4GKJ B; 1GN2 A; 1SQV H; 1NH2 D; 1SER A; 2HLD G; 1DF4 A; 4TQF A; 1FD9 A; 4JYC A; 1OHH G; 3CRR A; 1KMI Z; 4FM0 A; 1Z5W A; 4GKK B; 4GKJ O; 3S3X A; 4JI7 B; 4B7E A; 4C7U A; 2QWN B; 3K57 A; 1HDJ A; 4K3A A; 5CN0 A; 3ZJZ A; 5CA1 A; 1ARO P; 5LA6 A; 5ITZ A; 5IYB O; 1H2G A; 4QPK A; 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3T4Z A; 4B3S B; 2WLK A; 4FLW A; 1TA8 A; 3B2E E; 2EZP A; 4X65 B; 3G6E V; 4FFB A; 4UUJ C; 5KMG A; 2UXC B; 2IM9 A; 4HBN A; 1ENV A; 3OMA B; 4H0L B; 2GV9 A; 4DV7 B; 1N0N A; 4B3S O; 5D5P A; 4LWS A; 4LF8 B; 4X65 O; 2R72 A; 5BR8 O; 3ABU A; 5TIS Z; 2ZNJ A; 4B3M B; 2UXC O; 3EFF K; 4DV7 O; 3OFN G; 1NI8 A; 3H1K H; 1Y76 B; 2OCC B; 2V4D A; 4UFZ A; 5BMV A; 1NJI W; 4MTO A; 4B3M O; 4CH6 A; 3RGB A; 5JJN B; 3CC4 V; 4UVC A; 4MT8 A; 4PJ0 Z; 2Y48 A; 4LFA B; 4ICG A; 3RVY A; 3AG7 A; 3AG3 B; 3J80 N; 4I9W A; 2A9H A; 1GN6 A; 3G6B A; 3NR7 A; 4HAM A; 1RM1 C; 3E35 A; 1GH6 A; 1B6Q A; 4LFA O; 2ZKO A; 4DR3 B; 2ARH A; 3UQ8 A; 4E4E A; 4A5U B; 4K35 A; 5LP6 A; 3IC7 A; 2JGU A; 3QO7 A; 4I50 B; 3K79 A; 1WAZ A; 4JI8 B; 3VQY A; 1L1F A; 3X2Q B; 2IH3 C; 4B3R B; 1OZ0 A; 3HKD B; 3ETE A; 3LDC A; 4ZIB A; 3ZHV A; 3JAT A; 5GW7 A; 5KX5 B; 3RYC A; 3CRA A; 1IBL B; 1EM1 A; 4I4T A; 5KHI A; 1BL8 A; 1XNR B; 2UXN A; 3O9O A; 2ZXW C; 2OYQ A; 1ZAU A; 4B3R O; 1WB7 A; 3U0Z A; 2DYS C; 4ZI7 A; 4N23 A; 1IBL O; 1QLE B; 1NTK H; 1GRJ A; 5LYJ A; 1XNR O; 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