The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
231
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structure length |
231
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Chain Sequence |
IMPQHDQLHRYLFENFAVRGELVTVSETLQQILENHDYPQPVKNVLAELLVATSLLTATLKFDGDITVQLQGDGPMNLAVINGNNNQQMRGVARVQGEIPENADLKTLVGNGYVVITITPSEGERYQGVVGLEGDTLAADLEDYFMRSEELPTRLFIRTGDVDGKPAAGGMLLQVMPAQNAQQDDFDHLATLTETIKTEELLTLPANEVLWRLYHEEEVTVYDPQDVEFKC
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
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| molecule keywords |
33 kDa chaperonin
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| publication title |
Crystal structure of monomeric hsp33
rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
53
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| structure length |
231
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| sequence length |
231
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-03-16 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | helix hairpin bin | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(bab) Sandwich | Hsp33 domain | Hsp33 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HW7 A; 1VQ0 A; 1I7F A; 3M7M X; 1VZY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3L9D A; 4JI5 B; 3O9O A; 4B3S B; 5LGU A; 4B3T B; 4IYH A; 1JPX A; 1FXH A; 4MSW C; 3B40 A; 3S3W A; 4X1K A; 3H1J H; 3W7W A; 4J41 A; 3LNN A; 1S5J A; 1BQ0 A; 1Q6I A; 2F95 B; 1OCO C; 1M57 B; 4PA4 A; 4H0L B; 3PJS K; 3ML0 A; 3DXR B; 2WLH A; 1R3J C; 4J10 A; 5IWA O; 1XMQ B; 5JQG A; 1M5I A; 4QNH B; 5KHH A; 1VQ4 V; 4X64 O; 2YIA A; 2P7T C; 4YHH O; 1XL4 A; 5LYJ A; 5FPO A; 3JD3 A; 2UXC O; 1TVK B; 5BMV B; 5IJ9 B; 2D3O W; 4LFB B; 4UCR A; 4DV2 B; 2RJZ A; 4IHJ A; 1D5A A; 4UVB A; 1AP6 A; 2DOS A; 2ZIO A; 3FAV B; 3OUS A; 1H8E G; 2QM4 A; 4FLV A; 2Q73 A; 3K0D A; 3ASO B; 4GX0 A; 1K97 A; 5B66 Z; 2HVJ C; 3O65 A; 2LGW A; 4A5U B; 5IYB O; 1I0H A; 2H94 A; 5AG2 A; 4UV8 A; 3Q4H B; 1S76 D; 4KUM A; 4EB6 B; 5FPR A; 1MA1 A; 2C2A A; 1K5Q A; 1BL8 A; 5EYP B; 4DR7 B; 2DQ0 A; 2OT5 A; 3JAW A; 4CC6 A; 4Z2W A; 1DF5 A; 1NR7 A; 2IU0 A; 3UO2 A; 4LFC O; 4YJ3 A; 1I94 O; 2NLJ C; 4FM2 A; 4X64 B; 2DYR B; 1J95 A; 2WLI B; 2XAQ A; 1H2M A; 4YHH B; 4PA7 A; 4J7K A; 4MVO A; 3F5T A; 2UXC B; 2JGD A; 1FPO A; 4FM1 A; 4NR1 A; 4JPR A; 5KHI A; 3N2G B; 2Q7E A; 2XND G; 1M90 W; 4HNA B; 3JAM N; 3ABM C; 3ZHR A; 5H2F Z; 2ZDI A; 2R70 A; 2BOB C; 1IVS A; 3CJH A; 1JFF B; 3SJQ C; 4UFZ A; 2DW4 A; 2YUA A; 2JJ2 G; 3ZHQ A; 4I7Z B; 1DF4 A; 3ETD A; 1GO3 F; 4PDV A; 4FFB A; 3CC7 V; 1FFX B; 4PD4 F; 1Q3E A; 3CCV V; 2QKA A; 4CC5 A; 4YIP A; 1YXB A; 3SGI A; 4FM0 A; 4D6T H; 3ZHU A; 2AW9 A; 1MAB G; 5BR8 O; 3A2F A; 3BRC A; 4LFC B; 4AQY O; 3E8G A; 1I94 B; 3CSX A; 3VQY A; 4TUY A; 1M56 B; 1EN5 A; 5JH7 B; 4GKK O; 2FKX A; 4ASU G; 1AI7 A; 1K7D A; 1O9G A; 5C8Y B; 2X6B A; 3QO5 A; 1GRJ A; 1OCR C; 2IM9 A; 5IT9 N; 1EFR G; 4ZOL A; 3KKY A; 3OFN G; 4XBF A; 3B8M A; 4ZBM A; 4YXW G; 3K58 A; 1W2B U; 3B09 A; 3L73 H; 1A32 A; 5L3G A; 2NNU A; 1F4N A; 2DJV A; 4I9W A; 1I5X A; 1N8R W; 1DK1 A; 4RQF A; 3ZHT A; 3ZRV A; 2Q67 A; 1G1X B; 5F2V O; 3K03 A; 4CS4 A; 1JVM A; 1KUQ A; 3N2K A; 3BEH A; 1NQT A; 4U3J B; 4JTA B; 4DV3 O; 5LL6 Y; 3TJT A; 4MTG A; 2ZE8 A; 5BR8 B; 2BSK B; 1H2G A; 3ASN B; 1ORQ C; 2XUM A; 1KEC A; 1HNZ B; 3G4S V; 3CMA V; 4WBN B; 4X8A A; 1YI2 V; 4GKK B; 2ZM6 B; 1I7F A; 1SQG A; 4NB5 A; 4AIL C; 3BA9 A; 2JRI A; 4DRX B; 3MDS A; 2PZS A; 2ITC C; 1SER A; 1VIB A; 1S0V A; 2AHY A; 3WU2 Z; 5IY5 B; 4DV5 O; 4DV7 O; 3SPH A; 2PY5 A; 1N33 O; 1AJN A; 5A2Q N; 1M57 C; 1FXK B; 3EVK A; 4DV0 B; 2V1D A; 4MVR A; 4JTD B; 4X9Q A; 4LWS A; 3IFX A; 3OMA B; 3WG7 B; 5LHI A; 1IDS A; 1Q81 W; 3WB2 A; 2LFR A; 1QQC A; 4HYO A; 3H01 A; 4PHZ A; 3ZIA G; 3RYH A; 2ZIM A; 2IH3 C; 5L3F A; 3ETE A; 2KG7 B; 1ROP A; 3CP1 A; 4DV3 B; 2A9H A; 3TXQ A; 4I4T B; 3ASO C; 3OAA G; 2B9Z A; 1XQ8 A; 2WA3 A; 4UCS A; 2VQF O; 1Q90 D; 1N32 O; 4JAA A; 3KCY A; 1QLN A; 3CCQ V; 4IHJ B; 1SZX A; 3HKB A; 1MG1 A; 3AK3 A; 2W6I G; 3UCS C; 4GX5 A; 5D5P A; 5JCO C; 4DV7 B; 5ITZ A; 1XHX A; 1YVW A; 1EZJ A; 4EKW A; 1KU9 A; 3K9S A; 1VF7 A; 4UXN A; 2Y69 C; 1HNW O; 2QTS A; 2MK3 A; 4N21 A; 1NS1 A; 3ZRW B; 4FLZ A; 3BA8 A; 5DEC A; 3T1H O; 2DYR C; 3GWO A; 3C3S A; 4DO2 A; 3NXS A; 5CB4 B; 3JAW B; 2Q7G A; 1NT2 B; 1K34 A; 1QLE B; 3BVO A; 4LH7 A; 4LF7 O; 4YJ3 B; 3FD9 A; 2X7R B; 2CUG A; 2CH7 A; 2P4K A; 2B1I A; 2RN9 A; 2Q6A A; 5KHG A; 1URF A; 2ZCE A; 1VQ6 V; 1AP5 A; 1Y76 A; 1IZ3 A; 1YDX A; 3QO8 A; 3ZMT A; 4MT8 A; 2JGD B; 4JAV A; 4DW1 A; 5FNV A; 3RYC A; 1YEW A; 4MTF A; 4KFM A; 3UO3 A; 3F7V C; 3SPC A; 1K73 W; 2QTO A; 3DTU B; 3OTF A; 2EIN C; 1R3L C; 3BAA A; 1XMO O; 4CH5 A; 4FZ0 A; 2BTQ B; 3RWR D; 1P7B A; 1QU7 A; 4MTO A; 4UCU A; 2Q5Z A; 3E86 A; 2E3C A; 2NN4 A; 1WB7 A; 2EUL A; 1Y67 A; 1R6N A; 4X62 O; 3SYC A; 1M56 C; 3W7T A; 4JZG A; 5EZY A; 1NBM G; 4HZ3 A; 1XHZ A; 2IJI A; 4EFE A; 2AHZ A; 1M9N A; 3ZMU A; 2ZR3 A; 1FKA O; 4BIO A; 4TQF A; 1VQ0 A; 4LF7 B; 5GW7 A; 1Z5V A; 1M4U A; 5EC1 C; 4TUY B; 1OCC C; 1YJW V; 4DR5 O; 2UUC O; 1MNG A; 1US6 A; 1BMF G; 4X88 A; 5GON A; 1SET A; 2LFS A; 3CS5 A; 1NI8 A; 4MVQ A; 1U96 A; 1ZL8 A; 4FLX A; 4UCT A; 4FIP C; 3U11 A; 3SPG A; 2QJ1 A; 2OYQ A; 5FLX N; 2GV9 A; 5IDJ A; 3JYC A; 3JAL A; 3JSN A; 3OR7 C; 2ZT9 B; 2E5L O; 2H8P C; 2O57 A; 3E22 A; 1XMO B; 3CE2 A; 4J7J A; 1O9H A; 4JI4 O; 3RYF B; 5FL7 G; 1ZAU A; 2DWD C; 4WFF A; 2F93 B; 1SQP H; 2JIZ G; 4LCU C; 4MW3 A; 2DN9 A; 2EIL B; 3ASN C; 1HP8 A; 2GTA A; 5DN6 G; 3BY6 A; 4DYL A; 4ZHQ A; 4BW9 A; 4X62 B; 4ZI7 A; 2RMK B; 5LXT B; 1NVP D; 4FVM A; 4O2B B; 5L3D A; 1F4M A; 4IIJ A; 2XT9 A; 3K9A A; 5B1N A; 3VQW A; 4BR6 A; 4U7O A; 3H1I H; 4O4J A; 1S5H C; 3E8H A; 5IY5 C; 3W7U A; 5J2U B; 1HDJ A; 4G2K A; 1M1K W; 1FXK C; 5B1O A; 3FYE B; 1IBK O; 5CA3 A; 4GKJ O; 4R6Z A; 4RAI A; 3RVY A; 4DR5 B; 5IYZ A; 2UXB O; 4WFA V; 3WG7 C; 1V54 B; 3OUF A; 1G4Y B; 4DR3 B; 2P90 A; 5IJ0 A; 3P3N A; 2X6C A; 4FMT A; 2B1G A; 3DC6 A; 3VQV A; 3D8C A; 3LDE A; 1IBL B; 1TA8 A; 1P84 F; 2ILM A; 2E5L B; 4GX2 A; 4LWS B; 4JTC B; 1R6T A; 3RYI B; 4UVC A; 4JI4 B; 5EK0 A; 1RM1 B; 2ZIN A; 2FTK A; 1R6K A; 1K4D C; 1HWY A; 1H2S B; 4JI0 O; 1IXM A; 3MHS C; 3S3X A; 3CRR A; 1IBM B; 4LH6 A; 1AVM A; 3APQ A; 4TWK A; 1X4T A; 3IGA C; 2A7W A; 4HAM A; 1Z2G A; 1SRY A; 2RNB A; 1YF2 A; 2F4V O; 1I5Y A; 2IBZ H; 2YC0 A; 4X1Y A; 2XAF A; 4JYC A; 5B1B B; 3STZ C; 4JYA O; 4JAU A; 1B3Q A; 3AG4 B; 1Q43 A; 1WP8 A; 5KMG B; 3SYP A; 4H44 B; 1PP9 H; 4JI6 O; 1IBK B; 2Q7H A; 5H6R A; 4GKJ B; 2QWR B; 4JYB A; 2UXB B; 5H6Q A; 1BZK A; 3HKB B; 1VQN V; 2M7W A; 3FB7 C; 4JI2 O; 5A9G A; 2ZR2 A; 3FB5 C; 4G27 B; 2RQ6 A; 3SPI A; 2PTM A; 4X65 O; 2UUA O; 5LP6 B; 3NR7 A; 1QLE C; 3JAR A; 2KQX A; 4X89 A; 3X2Q B; 3OE7 G; 2ZKO A; 1BCC H; 3H1L H; 2HR3 A; 4I55 A; 2ITD C; 3T4D A; 1OZ0 A; 3ABU A; 4I0X B; 1T5E A; 1GTO A; 1K8A W; 4JI0 B; 1WAZ A; 3ZN1 A; 5GTI Z; 4RQE A; 3JSL A; 5KAF Z; 2VS0 A; 1F51 A; 5KA6 A; 2E74 B; 1VEW A; 1YSC A; 3HKD A; 3ZRX A; 3HB3 B; 1P7G A; 2WAM A; 1LR1 A; 4NTX A; 4BAY A; 2ZDI C; 3TET A; 2F4V B; 4MVZ A; 5K1X A; 5L3E A; 2WWW A; 4Q6G A; 4W4K A; 4JYA B; 5E79 Z; 1XDC A; 5J2T A; 4JI6 B; 3WB0 A; 5FNV B; 3RYC B; 3A0R A; 3F5W C; 4EFB A; 2JJ1 G; 1M93 A; 3SYA A; 5LHH A; 4QIW F; 4X20 B; 4GZR B; 4P9P A; 2N74 A; 2KSD A; 3H9V A; 2Y48 A; 5IWA B; 1Q6U A; 4JI2 B; 2MW2 B; 2ZE5 A; 2LP7 A; 2VRZ A; 5LGT A; 5B5E Z; 2WSS G; 4B3M O; 3L71 H; 4O4L B; 4X65 B; 2UUA B; 4FK5 C; 4K0K O; 4KL1 A; 3CB2 A; 4DW0 A; 1JQ0 A; 4LBE C; 1VQK V; 4LF5 O; 2WLK A; 1Q7Y W; 4ABM A; 5EZY B; 4LFA O; 1W0J G; 2M6Y A; 2Q68 A; 1S72 V; 4DUZ O; 2OCC B; 1NU1 H; 3SYQ A; 1ZWI C; 4I5S A; 4O4I A; 3R66 A; 3D36 A; 5JVD A; 3LSU A; 4OX9 O; 3SDL A; 1V55 B; 2UU9 O; 2BTO A; 1H2N A; 2AZ0 A; 2F43 G; 4QE9 A; 3E83 A; 4WFB V; 5GON B; 4J42 A; 1XIL A; 5LMU O; 1DTO A; 3ABK B; 3JAT A; 3ZS8 C; 1ZL8 B; 1E1R G; 1TAE A; 1K9M W; 4XDK A; 1UPG A; 2EIL C; 2IJK A; 4JF3 A; 2A0L A; 4XDL A; 2QR4 A; 1JJ2 U; 2CGN A; 2QA4 V; 4LF9 O; 4PDL A; 2GUZ A; 3ZMV A; 3DC5 A; 4B3M B; 4AHC A; 5KUM A; 1J5E O; 5HFM A; 4K0K B; 3L74 H; 3HPL C; 2WLJ A; 3K3W A; 4FPP A; 4B3R O; 4LF5 B; 1VQ8 V; 4ZI7 B; 2UXD O; 4X66 O; 4LFA B; 1TUB B; 2QM8 A; 1D5N A; 4PDM A; 3N27 A; 1V54 C; 4RO2 A; 4O4J B; 4DUZ B; 4X1I A; 1W59 A; 1N4C A; 4PA9 A; 2YDE A; 1ZLZ A; 1Q6H A; 1MOF A; 4OX9 B; 1XUQ A; 4H13 B; 2UU9 B; 2W0X A; 4WFG A; 2OTL V; 3B8N A; 4GT1 A; 3CEI A; 5B1A B; 2WLN A; 1RM1 C; 3MAQ A; 5LMU B; 1Y74 B; 3KG2 A; 3SPJ A; 4KXR A; 5IYD O; 2FL4 A; 2Q4P A; 4AQY B; 4LF9 B; 1WNS A; 1S77 D; 4JAS A; 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1QR9 A; 3H1K H; 1YHQ V; 2HFE C; 4DR2 O; 4B08 A; 3CCR V; 3JD2 A; 4JI7 O; 1AR1 B; 4F6E A; 4DV1 O; 2OWO A; 4JI1 O; 4WFH A; 4K8X A; 2CDY A; 2HHH B; 2ATK C; 1HNX O; 3RN4 A; 2YXY A; 2A06 H; 1DLB A; 4RUE A; 5LMN O; 3LSQ A; 5BMV A; 4NXN O; 2VWK A; 4TQD A; 5KLV H; 3JD0 A; 2ARH A; 5CBF A; 3FAV A; 1XNQ O; 2YIC A; 4ZIB A; 4WFE A; 2VQF B; 1N32 B; 1ZUQ A; 1V55 C; 2CAZ C; 2KB1 A; 3SR2 C; 1QNM A; 2QE7 G; 4IGG A; 1VQ9 V; 1XRE A; 1ARO P; 2LQT A; 3Q4H A; 3ABK C; 3WFV A; 3CJH B; 4IYI A; 4C7U A; 5KUK A; 4NXM O; 3RFR A; 4EB6 A; 2AZ2 A; 5JVD B; 2OCH A; 5EYP A; 1CPY A; 3RW0 A; 4P2Z A; 1HNW B; 1MSW D; 3ABL B; 3JAS A; 2A79 B; 4FFB B; 3ZX6 A; 1QVG U; 5GTH Z; 4DV4 O; 4TV8 A; 1K33 A; 4D7T A; 3OR6 C; 3CCU V; 3I55 V; 3T1H B; 4DR2 B; 5EIB D; 1BHA A; 2YSU B; 1LUV A; 4JI7 B; 3THO A; 4CH6 A; 1RPR A; 3G67 A; 4L8J A; 4JI1 B; 3ZBH A; 3JD1 A; 1HNX B; 3TCU A; 2GUZ B; 3AK1 A; 2YS8 A; 5J9P C; 4NXN B; 5K1P A; 4QPJ A; 4HNA A; 2Y4T A; 1XNQ B; 3I56 V; 5CBH A; 4ZOL B; 3CXC U; 3EXA A; 4OPA A; 1XEQ A; 1GAX A; 3ETG A; 3H1H H; 1JFF A; 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