5JFR | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	369
structure length	366
Chain Sequence	KVQTDPPSVPICDLYPNGVFPKGQECEYPPTQDGRTAAWRTTSEEKKALDQASEEIWNDFREAAEAHRQVRKYVMSWIKPGMTMIEICEKLEDCSRKLIKENGLNAGLAFPTGCSLNNCAAHYTPNAGDTTVLQYDDICKIDFGTHISGRIIDCAFTVTFNPKYDTLLKAVKDATNTGIKCAGIDVRLCDVGEAIQEVMESYEVEIDGKTYQVKPIRNLNGHSIGQYRIHAGKTVPIVKGTRMEEGEVYAIETFGSTGKGVVHDDMECSHYMKNFDVGHVPIRLPRTKHLLNVINENFGTLAFCRRWLDRLGESKYLMALKNLCDLGIVDPYPPLCDIKGSYTAQFEHTILLRPTCKEVVSRGDDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords	Methionine aminopeptidase 2
publication title	Discovery of potent, reversible MetAP2 inhibitors via fragment based drug discovery and structure based drug design-Part 2. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	122
structure length	366
sequence length	369
ec nomenclature	ec 3.4.11.18: Methionyl aminopeptidase.
pdb deposition date	2016-04-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00557	Peptidase_M24	Metallopeptidase family M24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	5jfrA02
3.90.230.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Creatine Amidinohydrolase	Creatinase/methionine aminopeptidase superfamily	5jfrA01

3K69A 2DBBA 3SZTA 1A16A 2E7XA 2VXZA 3SXYA 3F3XA 1G3YA 1OR7A 1BM9A 5FD5A 4FLJA 4I0AA 1E2XA 1KP0A 3PFIA 4EJTA 5HDKA 2XVCA 4U75A 4KM3A 3ROUA 1LNWA 3C1DA 3DPLC 2KRFA 2VE9A 2W84A 2M30A 2V3ZA 3IWZA 5CE6A 1BIBA 4U73A 4ZNGA 2ADUA 1XN7A 2ESHA 3ZMZA 2OZUA 4YFNF 4ETSA 4KT5C 1CF7A 2BV6A 2ZJ2A 2AXLA 5K5OA 1K79A 3IHUA 4OIOF 1YQAA 1D8KA 4HDUA 3CB6A 2BWWA 2KIFA 2ZNZA 2BHDA 2DK8A 1G3SA 2OAZA 5E20A 2BWSA 1FYMA 1GHCA 2Z33A 4LLLA 2QWWA 1TQIA 3CO7C 4HF1A 1FLIA 4EGZA 4B8XA 3RKWA 3BROA 1BI2A 4M9XA 3WU1B 2H94A 5CIKA 5DD4A 4WWCA 2LNBA 1HW1A 3I0TA 4IF4A 1ZARA 5F6FA 2DQRA 2EFWA 2W24A 3K9TA 3IG4A 4EJOA 3KEQA 5D4SA 3V8KA 1BI1A 2OBPA 3CB5A 3FM5A 4FO8A 4Q48A 3I54A 2Z9OA 2DQLA 1Z6RA 2HYGD 3M1EA 4IKTA 1USSA 4LFUA 2DTRA 2LF7A 2BE5F 3HRMA 2GTXA 1STZA 2HKOA 3GFMA 1KQ0A 2HOEA 1LVAA 4L5JA 2X4HA 3LFKA 5K5RA 3FMRA 1IUYA 5FCHA 1LDKB 1IXCA 1YTYA 4KNYA 2M1BA 4RGUA 4UNOA 4OU0A 2F5EA 4UUVA 5DCMA 3KP4A 4FLKA 1T0FA 1OYYA 3IRRA 2P98A 1J0RA 1MZBA 2VN2A 1JGSA 3FMQA 1T38A 2NS0A 1X3UA 4ZWUA 1KGSA 4HF0A 2XROA 2GQQA 1CGPA 4FKCA 1QNTA 4HX8A 2A68F 2EFNA 1S7AA 2ZBKA 3CUQB 2QQBA 4LB5A 3KZZA 4MQ9F 5H6RA 3BPXA 3JSOA 2R3SA 4I01A 1RZ4A 2EB7A 5FB2A 4D0PA 1OKRA 2PJPA 3EDPA 1B1BA 1ZG1A 1TTYA 4PV4A 3L00A 1SFUA 5HOOA 1XB4A 1IN5A 4Q47A 4JUQA 4ESJA 3DFGA 1V3FA 5D6EA 4WK8F 4ENJA 1U8RA 1B9NA 1W5SA 1UCRA 5HVQC 2YSRA 3EYIA 5E18F 2BEOA 4R8HA 1FC3A 5A2QZ 2YPRA 3PKBA 1XNZA 4JBAA 1FBQA 1SD7A 1DUXC 2PFBA 4IKSA 2G6PA 1L3LA 3FMSA 3KP3A 1MKMA 2JTVA 2MATA 5D8LB 5J6XA 2CGPA 2IJLA 4EJUA 1P4AA 3U9GA 3HRTA 1QGPA 3BIPA 3GF2A 4GYGA 3TDZC 2O3FA 4IHSA 1ONVA 2IT0A 3WTZA 3GZ5A 1D8JA 5D5XB 5CVUA 2Q94A 3MZHA 1KQ9A 3MZYA 4EM1A 1TQMA 1U78A 1SAXA 1UFMA 5ILUA 2VOOA 2E7WA 1C0WA 1FZPB 2YR2A 5D6FA 1BI3A 3LA2A 3F8CA 1PUEE 4S00A 3M9AA 2V9VA 1J59A 1MJBA 4HOBA 2ETHA 1LDDA 4GXOA 1SFXA 4M6YA 2MBFA 2QENA 1SMTA 1LEBA 1JXSA 1FOKA 1Z05A 3EYYA 2LKPA 5ICFA 3K1PA 2K02A 4AVPA 1P2FA 3N97A 2FMYA 2RDPA 3CUQA 4QLCU 2GG9A 1R58A 4KUMA 1WWXA 3QP6A 2Z5UA 4UVCA 5JVTA 4M73A 1I27A 3FF5A 2A61A 2VC0A 2VBZA 1USTA 3R0AA 3IU7A 4LLNA 2GWRA 1K78A 1HKTA 1IN6A 3KZYA 1YIOA 4L18B 5E17F 2QBYA 1PP7U 1G3WA 1EH6A 3IKVA 5LRRA 2HFHA 3FX3A 4KIFA 4LLGF 2IPQX 3DQVC 1ZRDA 1ZRFA 5LGUA 4NQWA 4RAYA 1KA8A 4IHTA 4B28A 1Q1HA 2OA4A 1REPC 4GYIA 4HX7A 4MGRA 3LSTA 3PKAA 3LAJA 2PEXA 3J81Z 3F8FA 4FUKA 4EM0B 5LEKA 4BHCA 2NNYA 4MEYF 1O3QA 1ZREA 5EEGA 3CTZA 2V1XA 2FRHA 3R61A 2IP2A 2K86A 3E5QA 1B59A 2QQAA 3MAJA 2FSWA 2BWUA 4PDKA 1XGMA 4WXCA 4ZZLA 5L3FA 1W7PD 3KE2A 5LHIA 1LB2A 1UHWA 2YX4A 2J5OA 3K0LA 1R00A 2Z99A 3F72A 2BH3A 3WTWC 3CO6C 1R7JA 2J5PA 2EK5A 3FZVA 4Y13A 2O6GE 2R7FA 5FLXK 1WI9A 2ESNA 2G9WA 2NAZA 3GYHX 4KDPA 5ICEA 3HSRA 2L01A 3ECOA 4BAYA 1QBJA 1Z9CA 4IJAA 1SMYF 2IA0A 2P8TA 5KVRA 4HQMA 2GG5A 2PLYA 3ZMDA 4IRHA 3Q6DA 3SQNA 5CVVA 4G7ZF 1XCVA 4G6QA 3JW4A 2GIVA 4U1BA 2EA4A 2VONA 2ISZA 3U1DA 4ZWPA 2WV0A 4A6VA 5LEJA 5D5VB 4MQVA 4YIFA 5E1WA 4MNUA 3TO7A 3WGIA 4U76A 1GXPA 4TV7A 2GU4A 3L9FA 4I02A 1H0MA 2PG4A 3WTXC 3HTSB 3HHGA 1SFEA 2P5LC 4YFKF 1XGOA 1V4RA 4S05A 4BH9A 2VODA 1WRJA 3WTVC 2EJRA 3Q5FA 2DPDA 3WTYC 2OQRA 4N0BA 5LBQA 4L9NA 5HS7A 5L3EA 4CZZA 4UV8A 4A0YA 4ZH4F 5HS8A 2XHKA 1HSJA 4KICA 2M87A 2VE8A 1J2XA 3MCZA 1O3RA 2R7DA 3RKXA 2L4MA 1HSTA 1YFHA 1FT9A 4AWXB 2FBHA 3ZP5A 4L0ZB 2IW5A 4HDVA 3HRUA 4ZWOA 4ESFA 3KP2A 3BOQA 2COMA 1TBXA 2GAUA 4RZYA 4EJVA 1MDMB 1YW7A 1HW5A 4Z7MA 2JT1A 1UHMA 2LF8A 4S2TP 1I1GA 4M9SA 3CUQC 2GU5A 2DW4A 2EFPA 1S6LA 2Q93A 3I71A 2GG0A 1BJAA 4M6XA 2W25A 3K1NA 3BDDA 3ECHA 2ZKZA 3MATA 3G3ZA 2EV5A 4EV0A 2RQPA 4G94A 4U0VA 3MFKA 4CO8A 4RAZA 2HQRA 3AAFA 2QQ9A 3MQ0A 1DDNA 1ZG3A 1ZH5A 4BHBA 3T8RA 2KJBA 2XIGA 1YLFA 3TOAA 2D2WA 3IWFA 3HTUA 3I53A 1O3SA 3S6BA 4OIRF 4CGZA 1ZRCA 1B4AA 1XD7A 2P7VB 5E1ZB 4DQ2A 4IPAA 4KIBA 2CYYA 5DD8A 3ZN0A 1XCBA 1IN4A 2XV4S 2VOPA 3GFLA 5BQTA 1YW8A 2P5KA 2P9AA 3JAMZ 1RI7A 4HV6A 3RVAA 1KQ8A 1W4MA 2Q96A 1ZYRF 3LWFA 4U7BA 5CDLA 4A2UA 2Q92A 3HHHA 4LB6B 1IXSB 1FBUA 2EFQA 2XKPA 4HA8A 3PKEA 2OU2A 2FMLA 4L0YB 4RS8A 3W6JB 1C27A 3ABTA 4KMUX 3QRFF 3L09A 4A6EA 3S2WA 5IT9K 4JK1X 3DV8A 2XKOA 4BQAA 1F5TA 3I4PA 3ZN1A 4I2OA 4BNCA 5E8GA 5HLHA 4M72A 2FOKA 5JI6A 2NYXA 1YG2A 1FYKA 2VBYA 1TNTA 1XSVA 2GGCA 1O7LA 2ZCWA 3FXUA 3R60A 2Q95A 3RORA 4RGSA 4O6JA 5LLQA 2HTJA 4FHTA 3RTRA 2TDXA 4AIKA 4UXNA 4Q4ZF 4I98B 4UVBA 3E6MA 1SD5A 2V1UA 5D5UB 1J5YA 1ZLJA 3JSPA 3J80Z 2FQ3A 1U5TB 4GGGA 1Z91A 4RB0A 2JPCA 1IZ1A 3F6OA 4IRGA 2A6EF 3D27A 4HAMA 1HBXG 4MEXF 3QU6A 2F5CA 1WY2A 1QPMA 2L4AA 3ZMUA 3WE3A 1JHFA 1RUNA 1J7KA 2F2EA 4I09A 1JHHA 3KCCA 2HDCA 3IU8A 2Q8KA 1ULYA 3ML6A 1I6XA 2FBKA 1BC7C 1IW7F 1FSHA 1Z7UA 3E6BA 4RGZ1 4PZJA 5HDNA 2EVMA 2MLGA 1KU2A 2CW0F 3NEUA 2PBIA 1FPQA 3QU3A 5H6QA 3V8JA 2YX7A 3F23A 3MX6A 3TOBA 1IN7A 3SHFA 1VTNC 5AIPA 2Q2EA 5JR3A 1IN8A 2OZ6A 3I59B 4XLNF 5LHGA 4U6EA 4N9IA 2QYOA 1R1TA 5AIQA 4P9FA 2HYFA 4U6JA 1K7AA 2K27A 1MGTA 2H09A 1ZN2A 3MR1A 2XGXA 4XLPF 1PV9A 2ELHA 4S2RP 2GZ5A 1S3JA 3VODA 1MD0A 4JQFA 2A5YB 2W57A 1B6AA 4HLYA 3F6VA 4RB1A 3COAC 1XDSA 1BN5A 1QXWA 3IL2A 1D5VA 3Q9VA 3CTAA 5L3CA 2FE3A 4FX4A 4LK0F 4KYWA 1ON1A 5CDEA 1PDNC 4WX9A 1LQ1A 4ENKA 3BITA 4L9TA 2DU9A 5CJ9A 2BYVE 4L5IA 2CWEA 2L02A 2ACJA 2WTEA 4MTEA 2VBWA 5DYMA 3RPUA 1J9IA 2A69F 4HLXA 5L3GA 1LEAA 3QP5A 1QQIA 5K1YA 2OD5A 4I7HA 1GVJA 1OYIA 3VFZA 1R1UA 1T39A 2CSOA 3V7RA 1HQCA 2RKHA 1BBYA 3IRQA 5FD6A 3B73A 2VT3A 3DEUA 3V4GA 1KYWA 2EV0A 4CXFA 1WBQA 4KA4A 3N4MA 3RIRA 4IU6A 2ZMEB 4IF7A 3CLOA 5DV5A 3R4KA 3MEXA 1CHMA 3LQQA 5D8KB 3ZPLA 1NHAA 2K7LA 5HS9A 3D5LA 4P9UA 5CLSA 4UVAA 2PQ8A 5HLIA 2RC4A 1I1SA 3HOSA 3JAMK 2BWTA 3ELKA 3KFWX 2FU4A 3REOA 2RV8A 3I58A 1W7PB 1UB9A 1XMKA 4U70A 3E3VA 2PMUA 2Z3YA 4EGYA 3TO6A 4NB5A 5L3BA 1XGNA 1HKQA 1C24A 4U6ZA 2IA2A 2XASA 3WGHA 4A6DA 3FHZA 1F1ZA 1HW2A 1WQ2A 1HKSA 1KYZA 5CVRA 1TW3A 2GG3A 4HX4A 4OMZA 2DI3A 2ZXJA 1OPCA 3GFIA 3I59A 3KETA 3F22A 5D5WB 4FX0A 4A12A 4WXDA 3J7AO 2CO5A 1W5TA 5DDGA 2ZSGA 4A5MA 2HWVA 4KFCA 3L2CA 5JFRA 1R1VA 5F64A 1T2KA 2F5DA 2H6CA 3KLOA 2O0YA 1R23A 5BMZA 5HLGA 4LJZF 2HEOA 3O2PE 4WCGA 4AD9A 2XUBA 1YYVA 4RZZA 3GXOA 3F8NA 3F21A 5F1RA 1TQPA 4GCVA 3FWEA 3T1BA 3TDUC 3E5UA 3RYRA 2P5VA 3QAHA 2RVCA 1YO5C 4S01A 4WF2A 2GA2A 4OIPF 1WLRA 2JZYA 1BC8C 2EV6A 4MHGA 1QZZA 3CUOA 1C22A 2GU6A 1WKMA 4ZYDA 1ODDA 1EH8A 2DPUA 4P96A 4U88A 4ESBA 4RB2C 2VC1A 2X0LA 4LG0B 4IKUA 3V7SA 5A2QK 3PQKA 2P7CB 4E70A 3KP7A 2KIUA 2LDUA 2IW2A 2W85A 4CHUA 2GGBA 2FA5A 4Y15A 1W7PA 3GVAA 3LQRA 3DXJF 3TB5A 2EWNA 4LD5A 1ZGJA 3L7WA 4IDYA 5L3DA 3P9KA 1E17A 1XDUA 4PCQA 4KN4X 3BJ6A 3G73A 2FF4A 3H92A 2Q0OA 3WTSC 3I64A 2RNJA 3VOEA 3HOTA 4BXUA 4UHTA 2EVCA 3BP8A 3QPTA 3RYPA 4PGGA 4HQEA 2ZNYA 1FP2A 4MATA 2E1NA 4ZYHA 5ILSA 5J8CA 4G7HF 3JTHA 3R6SA 1IXRC 4WXHA 4AIHA 5LHHA 1P4WA 4OINF 1S8NA 3D0SA 5FGMA 2ISYA 1LDJA 2P4WA 1G4DA 2O8XA 2GG8A 2Y75A 1U5TC 5D4RA 4Q5SF 4I0BA 5DCMB 2M45A 5TRDA 2K4BA 2AS5F 2NQ7A 3HUGA 2JPBA 5H20A 1C23A 2EVOA 1G6NA 3WE2A 3C7JA 5ERIA 2P6SA 4RGXA 2GU7A 2D1VA 4BHPA 2GG7A 2HKXA 4EJWA 2L54A 3RDIA 2BWXA 3WU0A 1EH7A 2GXGA 5CVIA 3BZ6A 3ZMTA 4OOKA 2UXNA 2G7HA 2NQ6A 3E6DA 4EQQA 4CYDA 4G8XA 1DPRA 2V3XA 3QOPA 5E8IA 4L9VA 4LG0A 3TAVA 2HZTA 3J81K 3E5XA 3H3UA 3TKYA 3FXRA 2BBYA 3ISPA 2MLKA 2GA1A 2BGCA 3JTGA 4CICA 1R36A 5ICCA 2XAJA 4FT8A 4XBFA 4S04A 5DEQA 2FNAA 1IRGA 5E5BA 2QUFA 4EGEA 2QZ8A 3M7GA 1EV7A 1YJ3A 1W7VA 3Q9SA 3RJPA 3IKTA 2VBXA 2NNNA 4ZYGA 2B3HA 1FP1D 3B02A 1FWZA 1GXQA 2BHCA 2ZFWA 3IC7A 3LA7A 3IU9A 2F5FA 2O03A 3WTUC 2XAGA 3E6CC 1YS6A 2D1HA 5AONA 1YVMA 1QXYA 1G3TA 2STWA 5DCFA 4B09A 3H3ZA 3W6KB 4FO7A 1T6SA 2UZKA 1R22A 2WC2A 4G6DA 3ERED 2DK5A 2BWVA 1FYLA 5BPIA 4A5NA 3VB2A 1MDMA 3M8EA 4M74A 4OOIA 3KEOA 2KIMA 3MWMA 3P9CA 2HQNA 1ZLKA 1F4KA 2QLZA 3FM3A 4KN7X 1YW9A 3WGGA 2DLLA 1O57A 3C18A 2BB7A 5FFXA 1RNLA 4DNCA 4ENNA 4Y17A 4G7OF 3R0JA 2EA2A 5FLXZ 3GLXA 4YIIA 1OMIA 4IVNA 1TW2A 4LGWA 1R5HA 3SFZA 5LGNA 2A3SA 3DPTA 4R1HA 2IVMA 4A0ZA 4U0WA 2RN7A 1JE8A 2CG4A 2G7UA 1K78B 3GWZA 2LSOA 4Z2YA 2IRFG 2QBYB 2XAHA 2MA3A 3V8LA 2MH9A 1ZGAA 4R60A 2GG2A 2MC3A 1Y1NA 1W2MA 2V6CA 1PP8F 3PKDA 2M5WA 4UV9A 4OMYA 3CJNA 4A0XA 1FBSA 4YG2F 2MD5A 4H0EA 2HS5A 4ENMA 4L9JA 3EQLF 5BPDA 3LA3A 2NRAC 4PNCA 1F9NA 5HDGA 1AWCA 1BIAA 1U3EM 3ABUA 2DFIA 1WL9A 2XAQA 4EMSA 3GW2A 3V7CA 1MJ9A 1ZG5A 4K2EA 2DO7A 2JSCA 4HZFA 4LMYA 3L7GA 1S29A 2XAFA 2FNPA 2IA1A 2M8EA 1RIOH 5DUIA 3DP7A 2UXXA 2V1DA 5FO5A 2CQKA 1B9MA 3TGNA 2Y48A 1SD4A 1J75A 2OKNA 1MJAA 2MH2A 3ZQ7A 4ZZDA 3QPHA 4IXAA 5ICGA 4M9ZA 1FX7A 3WTTC 1O7FA 4R79A 2B3KA 3RI4A 1T98A 3GZ6A 3VEPA 1SD6A 5FCFA 2D45A 4HYEA 5ED4A 1U5TA 3GFJA 2O61A 4N9HA 2XRNA 1WN1A 4O3MA 1BOAA 3P9IA 2E1CA 3BWGA 4CDGA 2HGCA 2GZWA 4NHJA 4GO1A 4U71A 2ZO4A 5ILVA 2KKOA 5TJJA 1DPUA 2C6YA 3KP6A 1U2WA 1FSEA 1ZAOA 4IRIA 3K1MA 1IRFA 2PI0A 3WODF 3E97A 1XSDA 1MATA 2PN6A 3SZPA 2STTA 2VT2A 4P55A 1FY7A 4HV5A 4U69A 5IT3A 3OV8A 1RUOA 3T5XA 5CDVA 3HSEA 4QWQA 3L24A 2PMHA 6PAXA 1XGSA 1XMAA 4ASNA 5CNXA 4ZYEA 3FXQA 4A6WA 1KU7A 4U0YA 1KU3A 1FNNA 1P6RA 4XRFA 3TQNA 3GO5A 4M71A 2KJCA 3DKWA 1HXDA 3T8TA 3GUDA 2CFXA 1AOYA 1D3YA 3M8FA 3DF8A 2B3LA 4IECA 2HR3A 3HIFA 4EM2A 3J80K 5FFZA 3T0YA 3PKCA 3RKYA 1H9TA 3OOPA 3PQJA 5CVJA 3CDHA 1Y0UA 1O0XA 1BI0A 1OYWA 3HRSA 5DUKA 4BYYA 1IAWA 2L3DA 4U6WA 1KU9A 5IT9Z 3F8MA 3RPQA 1JAWA 2FEZA 4MTDA 3NRVA 2K4JA 4F7ZA 2A07F 4U7DA 3WG9A 1XSXA 4OIQF 1QO0D 4KIGA 2UWMA 5J8FA 3GX4X 1L0OC 1ZHFA 4PGHA 2P6TA 3K2ZA 3KLNA 3KP5A 3ZMVA 4XSZF 1WSUA 4U6CA 1CF7B 4G9YA 2ZMEA 1U6GA 1H9GA 4RB3C 3BJAA 4RGRA 1M35A 5KK1A 2BWYA 5LRSA 1YS7A 2H6BA 1ON2A 2WWYA 1N51A 4YFXF 3EUHA 2YU3A 4P5OA 4QR8A 2JRTA 3F8BA 3O3KA 4HW0A 4O5VA 4XSXF 3C3WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1C21 A;  3BJO A;  2DT5 A;

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5JFRA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations