1EPQE

Endothia aspartic proteinase (endothiapepsin) complexed with pd-133,450 (sot phe gly+scc gcl)
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title Analyses of ligand binding in five endothiapepsin crystal complexes and their use in the design and evaluation of novel renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 80
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epqE02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1epqE01
3PM4A 5P05A 5T4SA 3OQKA 4WY6A 2FXEA 3OWNA 2QD7A 3OUBA 1HVSA 4DJUA 5OZOA 1FQ7A 3QP0A 5P25A 2IDWA 5P30A 5P5OA 4CPSA 5P8NA 2QU2A 3HD8A 5OZ0A 4CPWA 1DIFA 5OZZA 3SM1A 3UDYA 2O40A 3EKTA 4COEA 5P1NA 1ZLFA 1EPNE 3DCRA 3QBHA 3T7PA 4Q1XA 5P3CA 2PSGA 1SDVA 4HZTA 5COPA 1GVVA 1N49A 1ZPAA 1ZAPA 2AVOA 5P3GA 2QI7A 5OZ1A 5P66A 3GGAA 1HVLA 4FM6A 4N00A 3L59A 4OC6B 4FM7A 4Y3YA 5P4ZA 1MSNA 1NPVA 3NDTA 5P0AA 3PRSA 5P4MA 5P8HA 5P52A 3VF3A 5OZSA 2G1OA 5DGWA 1PROA 4F73A 5AHCA 4GZFA 5P5MA 1BVGA 4Y3RA 2AZ8A 4YD3A 5KR0A 4JPCA 2ZJIA 4KE0A 4TRZA 4LP9A 2F3EA 5P3KA 3B7VA 5P4VA 4YA8A 3HZCA 3BUFA 3OU4A 2O4NA 5P3QA 5P5QA 5P2ZA 5OZAA 2Q63A 4U8WA 3NDWA 3GI5A 4OD9B 2J9JA 3SM2A 1IVPA 1LV1A 4Y56A 3CKPA 3PEPA 5P7NA 2PC0A 4K4QA 2OF0A 2G24A 5P09A 5P27A 4YD6A 2UXZA 3I7EA 5P2UA 4I0JA 1MRXA 3DJKA 5P1MA 4M8YA 5P68A 5P53A 5P03A 1HPXA 3UQUA 4KE1A 3T6IA 5OZQA 1LF4A 3UFLA 1LYBB 5OZTA 3UDRA 4Y3HA 1NPAA 3SKGA 3WZ7A 3TPLA 1XN3A 5P1ZA 5P8FA 2I4DA 5P2AA 2FS4A 5HDUA 3NUJA 3KDDA 1MPPA 2V12C 3AUPA 3VYEA 1W6IA 2QZKA 4J5JA 1WBKA 4OBDA 4XXSA 4I10A 5P3DA 3KT2A 4I8WA 1DW6C 4I1CA 4J54A 3K5GA 5P7SA 5P3HA 4Y3PA 4OBHA 5P0GA 2AVQA 4B00A 1BWBA 4EJDA 3WZ8A 2OHMA 4J1EA 1MTRA 2QD6A 4Y5LA 4MC1A 3ZKNA 1AM5A 1GVXA 5TOLA 5P77A 3IN3A 4BFBA 3KA2A 3K5FA 4YBIA 4Y57A 5P0UA 3PBZA 4TRYA 3EL5A 5P4SA 3SO9A 5P3IA 5DQ5A 4CPXA 4B1DA 2I4WA 2R9BA 1KJFA 5P72A 1ZSRA 3FSMA 4R91A 4NJVA 5P0TA 1SP5A 4Y45A 2J9KA 4MC9A 1ME6A 3OAGB 5OZDA 1TW7A 3BRAA 2PK6A 3ZPUA 3S7MA 2SAMA 3N4LA 5P2TA 3NLSA 1MT9A 4Y4EA 1HRNA 1J71A 4FS4A 4PHVA 5P7GA 5SXNA 4LXKA 2I4QA 3OADA 4I0ZA 5P88A 1LF3A 3K1WA 3UPJA 2XFKA 4S1GA 2NPHA 4B78A 4PPHA 4WY1A 2HM1A 1E82E 5KQYA 3LIVA 1HSIA 1EPME 3JW2A 4J0ZA 3CYWA 3FNTA 3HVPA 5HD0A 1B5FB 2NXLA 4I0DA 2O4KA 3LINA 1FFIC 1ZP8A 2BPWA 5P4UA 5P6HA 2P4JA 6UPJA 5HDXA 2VJ9A 3T7XA 5KR8A 1EAGA 3PJ6A 3IVIA 2H6SA 3KFNA 4YDFA 1BIMA 2NXDA 3SLZA 4EXGA 5OYTA 4CMSA 3CKRA 4B1CA 3D1XA 4L1AA 3JVYA 3PSYA 4FL8A 3FNSA 2PK5A 3URIA 3VF7A 4H3FA 2AZBA 1W5VA 3VYDA 1ZJ7A 3UFNA 2V13A 5P3YA 2OHRA 3NUOA 2WF0A 1ODYA 4HEGA 2JJIA 2V16C 3PWRA 5HU1A 5P5JA 5P5RA 4RLDA 3UF3A 4OBZB 3UQWA 5P0PA 1B6MA 4Y5KA 3IA9A 4RVXA 5P69A 5KR1A 4Y5MA 4GYEA 5C9DA 5P8OA 3OXCA 2QMGA 5OZ6A 5I70A 5P2NA 1FG6C 3EKWA 3PB5A 3DUYA 1T6EX 1VIKA 5DPZA 1APUE 3QN8A 1SDTA 2O4LA 4DQEA 3R2FA 1W50A 3NXEA 5P82A 5P63A 5P8MA 2V11C 5AGZA 1GNOA 1OEXA 4QJ8A 1K1TA 2QI0A 3WSJA 5P2SA 1SGZA 4ER4E 3H5BA 5P1DA 3GI4A 1BDQA 3DK1A 3BGCA 1SBGA 5P32A 3OXWA 5P6SA 3CKTA 2G1YA 2V00A 5P4GA 2QHCA 3PVKA 2OHQA 3ZKMA 4QJAA 1SIPA 2HPFA 5HE7A 5P6PA 1M4HA 1XDHA 5ENMA 5P61A 3OY4A 2ZHSA 5HVPA 4K4RA 1RV7A 1HOSA 3Q70A 2VIYA 4A6CA 4ER1E 1D4YA 2B42A 1QBRA 1TZSA 5P0DA 2QZLA 2PYMA 2OAHA 1B6LA 5OZYA 5P0VA 5P7ZA 4DUSA 5E5KA 5AH7A 4FIVA 5HU0A 5P78A 2J9JB 5E5JA 3S7LA 5DR7A 1APTE 5P6FA 1EPPE 1SDUA 5P62A 1TSUA 5P6IA 4EJ8A 2BJUA 2G21A 5P47A 1HPSA 3HW1A 1LF2A 3G6ZA 3SA8A 3LPJA 2IGYA 4CPUA 4NJUA 5OZMA 3HBOA 5DR0A 4J17A 4J0YA 3INHA 5P15A 2ASIA 5P2JA 1JLDA 3R1GB 5P87A 4MC6A 1GVTA 1M43A 3EL9A 4X2LA 1NH0A 5OZ4A 4JPEA 1FG8C 2QI4A 4FSEA 4I0EA 2PMAA 2ZJLA 4FRSA 1OD1A 2FIVA 4YDGA 3MSJA 3S85A 3G70A 3UHLA 4U7VA 4LAPA 5P5TA 3TPPA 4J0VA 3EM4A 3RVIA 5COOA 2CEMA 1MTBA 5P55A 3NWQA 1HIHA 4ZSMA 3SA7A 3TPJA 5ISJA 1YG9A 2JXRA 4GJ7A 5FIVA 4FE6A 1EC2A 4GJCA 3Q4BA 2AIDA 1YTGA 3VSWA 3EL4A 5P4PA 4Y4WA 4D89A 1G0VA 3IXJA 3O9GA 2WF3A 4QJ9A 5P14A 1QBTA 5P8VA 2AOIA 2G69A 5HCOA 4DI2A 1ZTZA 1KJ7A 3D1ZA 2QHYA 1YTHA 1RL8A 1TCXA 1PPKE 5P7KA 5P24A 5P34A 2AODA 2P83A 4CPTA 5P3RA 1GVUA 3S43A 3LIZA 1A8GA 1K2BA 4ZSQA 2HC0A 4L6BA 4FLGA 4Y3SA 5P4AA 4Q1NA 1LEEA 5I3WA 2NXMA 4I0GA 2A4FA 3VEUA 5P6EA 3M9FA 4Y3EA 4LHHA 2WHHA 3UDNA 1MSMA 4Y5AA 5P6MA 3ZPTA 5P5UA 2NNPA 1HVIA 3Q5HA 4APEA 2B8VA 2NNKA 5P3UA 3OGPA 4U7QA 5P1RA 4DJXA 1XE5A 3UDJA 2MIPA 3KT5A 2PYNA 4Y3WA 3VG1A 4AZYA 3LZVA 4L1AB 5DQ1A 5I3XA 4J1HA 3SABA 4DQHA 4Y3JA 2ER9E 3BUHA 4AA9A 5P35A 4A6BA 4FRJA 1BXOA 3VCMA 1LYWA 2NR6A 5KQFA 1BBSA 1CZIE 2NMZA 1IDBA 3CICA 3VLAA 1EPQE 3I25A 4R8YA 3EC0A 2PQZA 5P5VA 3R4BA 1TQFA 3R0YA 3LZYA 5P4WA 5P6YA 1HVKA 3OGQA 3T11A 2VNNA 4Y47A 2XYFA 3OHHA 2VJ7A 5P58A 2F80A 3PMYA 5P8TA 5P3BA 3CMSA 2G27A 5PEPA 4R92A 2WF1A 6APRE 3PLDA 4EP2A 5P41A 3TLHA 5P6XA 5P36A 1AVFA 5F00A 5OZJA 2B7FA 3B80A 5P0HA 4YCTA 3VF5A 2R8NA 3APRE 5P1JA 1BV9A 3K5DA 5P46A 1PSNA 5P5AA 4Y38A 3DV1A 3SA6A 4Y4XA 1HIIA 4EP3A 4GIDA 3INFA 5P43A 5P5CA 2OHNA 1YTIA 5P16A 1QBSA 3LITA 1MT7A 4EJKA 3GGXA 5P76A 2ZDZA 2FNTA 4M8XA 1EBZA 4Q5MA 4J0PA 5BS4A 5B18A 3DM6A 2VA7A 2FMBA 5P00A 2ZHUA 1HXWA 4GJBA 2HIZA 2P3BA 1ENTE 3BVAA 4RGHA 5P7EA 5P8KA 2AZCA 4B70A 5P5PA 3QRSA 4ZSPA 2AZ9A 2I0AA 2QMPA 3HDKA 5P3AA 3UDMA 4XKXA 4Y3LA 5P6KA 4J1FA 5P29A 2VJ6A 2HAHA 3NU5A 1FQ6A 1NSOA 4X7IA 5P84A 1FMBA 4GMIA 3O99A 2PH8A 4APRE 4I8ZA 2IRZA 4PZXA 5HE5A 1HIVA 2FGVA 2QMDA 4NPTA 1BWAA 2ZJKA 5P85A 1C70A 1EBWA 3ZPSA 5P1LA 2Q64A 5P2GA 2ANLA 3ZLQA 4CPQA 5P2DA 4DFGA 5P2KA 3D91A 4J0TA 5P0IA 2PH6A 5P7YA 4F76A 1LZQA 5P7QA 5P8DA 1PPME 3NU3A 2IEOA 5OZKA 3NDXA 2WEBA 1A8KA 4JOOA 4HLAA 4DQFA 5P5YA 1FLHA 5P06A 1HEGE 5P1AA 5P08A 2AOJA 3KMYA 1ZBGA 5P20A 3O9BA 2Q15A 3L5CA 2F3KA 1DP5A 4QJ7A 1SMEA 5P71A 3RTNA 1AAQA 3O9LA 1K2CA 5OYZA 5P8GA 3URLA 3L5EA 3QRMA 2PWCA 3IAWA 1DAZC 2UPJA 4I0IA 1UH7A 4DH6A 3GW5A 5P2YA 2V10C 2QI6A 4YE3A 5P2VA 4ZIPA 5KOQA 2BPYA 3VYFA 5P7TA 4H3GA 5OYXA 4RVIA 4EJLA 1HTRB 5P81A 5P4XA 3OK9A 1T3RA 3G72A 4E43A 2XFIA 2AVVA 1VIJA 2WKZA 5P1IA 2B8LA 2HS1A 2HB2A 4Y4ZA 5P6RA 5P38A 3RTMA 3OUAA 4IVTA 5P5BA 3A2OA 2QU3A 1PFZA 4R95A 3SFCA 5P4JA 2R43A 2G94A 4PEPA 4J1CA 4CKUA 3CYXA 3KDCA 1A9MA 4Y35A 2BKSA 4ZPGA 5IVTA 3SQFA 4GJAA 5DR3A 3OU3A 2ZHTA 5OZ2A 3ZL7A 1RNEA 5P3FA 3HVGA 1QBUA 5P0BA 2VA5A 4QJ6A 5P3XA 3K4VC 4LXMA 4RRNA 5P6UA 5KQXA 5OZWA 3TOFA 5BWYA 4DJYA 3QAAA 4HDBA 3FIVA 1FF0C 4EQJA 3ZKSA 3Q6YA 5CONA 3PWWA 1ER8E 5OZXA 2VIJA 1D4IA 4A4QA 5P2FA 1HWRA 5OZPA 2WF4A 3IN4A 4PZWA 1HVJA 5P7XA 3H0BA 4ZPEA 4CP7A 5P3EA 5P51A 4EHCA 5P1FA 5P1XA 5CLMA 6FIVA 5P0YA 3U6AA 1W5YA 5OYWA 5P64A 2IENA 3SACA 3GI6A 5DR4A 4Y5EA 1W6HA 4OC6A 5ISKA 3PCWA 1Q9PA 3O9DA 2RKGA 1LYWB 4FRIA 5OZNA 5P3PA 1IVQA 1EBYA 3PCZA 3UQPA 5P5LA 1UH8A 3PI0A 3SA9A 8HVPA 1AJXA 3SA4A 3CIDA 4KUPA 3OXVA 4Y36A 1HVRA 2QNNA 1U8GA 2Q3KA 4TVHA 5P7PA 1HHPA 5P7DA 2ER6E 3S56A 2HB4A 5P44A 1OEWA 4KB9A 3EKXA 2Q5KA 4Y4GA 5P23A 2FNSA 5P4NA 1BAIA 5AH8A 4Y3FA 3DOXA 1XE6A 3GGUA 1IDAA 1K6CA 1Z1HA 5P8UA 2OHUA 1HVCA 4H3JA 5BRYA 1NPWA 5P2QA 5P13A 5P0ZA 4D83A 4Z2ZA 5OZVA 2P3CA 1T7JA 4NKKA 3PLLA 5P8PA 1BDLA 3LIQA 2V0ZC 3OU4B 2ZYEA 2BBBA 1K1UA 3IXKA 4D8CA 5OZ5A 5P3JA 4Y4AA 1T7IA 1KZKA 1W5XA 1LYBA 4Y50A 5EZZA 4ER2E 3PSUA 1MIQA 1GVWA 3HAWA 1EC0A 5P5FA 5DGUA 4JECA 2BB9A 3OQDA 1IBQA 5HDZA 5P6ZA 2IKOA 5P8JA 3ZKXA 1WBMA 5OZEA 3OU1A 2AVSA 2OHKA 1F7AA 4DVFA 2G1SA 4TRWA 4I0HA 5DR8A 1D4LA 4HA5A 1LYAA 5P0WA 4DPFA 3VV7A 5AHAA 4OBGA 2G20A 1FQ5A 3L38A 5P22A 3MSKA 1HVHA 4Y51A 1HSHA 4RYGA 3ER5E 5P0MA 5P4LA 2ZHRA 1CPIA 3KF0A 4YD5A 5P7HA 1UPJA 5OZ3A 5P65A 5P2HA 1XN2A 4IVSA 2AVMA 4QGIA 5COKA 4AA8A 1HEFE 4ZSRA 5P0JA 5P6LA 4DJWA 1G35A 1W5WA 2AOEA 5P1KA 3QPJA 1LS5A 3HLOA 4Y5GA 5P7UA 4I0FA 1EC1A 3OTSA 5P10A 1MEUA 1SH9A 2ZJHA 2P3AA 4GJ6A 5APRE 5P83A 2BPVA 5P73A 5P2RA 4K4PA 5P67A 2VS2A 3O9HA 1AZ5A 3GI0A 1MERA 2BKTA 5P6CA 3LIXA 5I3VA 4EPJA 1C6XA 5P5DA 1FQXA 3EM6A 5P18A 5OYQA 3L3AA 2I0DA 5P8CA 3MXDA 5P6OA 3O9LB 1B5FA 1GKTA 5P4KA 4XX4A 2R3WA 1META 4ZPFA 3O9EA 1D4KA 4Q1YA 1PPLE 1XS7D 4HDFA 5P3SA 3RU1A 5DQCA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PM4 A;  5P05 A;  5T4S A;  3OQK A;  4WY6 A;  2FXE A;  3OWN A;  2QD7 A;  3OUB A;  1HVS A;  4DJU A;  5OZO A;  1FQ7 A;  3QP0 A;  5P25 A;  2IDW A;  5P30 A;  5P5O A;  4CPS A;  5P8N A;  2QU2 A;  3HD8 A;  5OZ0 A;  4CPW A;  1DIF A;  5OZZ A;  3SM1 A;  3UDY A;  2O40 A;  3EKT A;  4COE A;  5P1N A;  1ZLF A;  1EPN E;  3DCR A;  3QBH A;  3T7P A;  4Q1X A;  5P3C A;  2PSG A;  1SDV A;  4HZT A;  5COP A;  1GVV A;  1N49 A;  1ZPA A;  1ZAP A;  2AVO A;  5P3G A;  2QI7 A;  5OZ1 A;  5P66 A;  3GGA A;  1HVL A;  4FM6 A;  4N00 A;  3L59 A;  4OC6 B;  4FM7 A;  4Y3Y A;  5P4Z A;  1MSN A;  1NPV A;  3NDT A;  5P0A A;  3PRS A;  5P4M A;  5P8H A;  5P52 A;  3VF3 A;  5OZS A;  2G1O A;  5DGW A;  1PRO A;  4F73 A;  5AHC A;  4GZF A;  5P5M A;  1BVG A;  4Y3R A;  2AZ8 A;  4YD3 A;  5KR0 A;  4JPC A;  2ZJI A;  4KE0 A;  4TRZ A;  4LP9 A;  2F3E A;  5P3K A;  3B7V A;  5P4V A;  4YA8 A;  3HZC A;  3BUF A;  3OU4 A;  2O4N A;  5P3Q A;  5P5Q A;  5P2Z A;  5OZA A;  2Q63 A;  4U8W A;  3NDW A;  3GI5 A;  4OD9 B;  2J9J A;  3SM2 A;  1IVP A;  1LV1 A;  4Y56 A;  3CKP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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