2QZXA

Secreted aspartic proteinase (sap) 5 from candida albicans
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
342
structure length
342
Chain Sequence
GPVAVTLHNEAITYTADITVGSDNQKLNVIVDTGSSDLWIPDSNVICIPKWRGDKGDFCKSAGSYSPASSRTSQNLNTRFDIKYGDGSYAKGKLYKDTVGIGGVSVRDQLFANVWSTSARKGILGIGFQSGEATEFDYDNLPISLRNQGIIGKAAYSLYLNSAEASTGQIIFGGIDKAKYSGSLVDLPITSEKKLTVGLRSVNVRGRNVDANTNVLLDSGTTISYFTRSIVRNILYAIGAQMKFDSAGNKVYVADCKTSGTIDFQFGNNLKISVPVSEFLFQTYYTSGKPFPKCEVRIRESEDNILGDNFLRSAYVVYNLDDKKISMAPVKYTSESDIVAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Candidapepsin-5
publication title X-ray structures of Sap1 and Sap5: Structural comparison of the secreted aspartic proteinases from Candida albicans.
pubmed doi rcsb
source organism Candida albicans
total genus 88
structure length 342
sequence length 342
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 2007-08-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzxA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2qzxA01
2F3KA 5SY3A 1G6LA 5P2OA 4Y44A 1YM2A 4HDBA 5OZ2A 5P69A 5P4NA 3IGBA 4B1EA 3O9EA 2O4PA 4H3IA 4CPRA 3LZVA 3SKGA 1AXAA 5P3SA 4DQFA 1RNEA 5P7EA 1MEUA 4DV9A 4QLHA 5P19A 4B0QA 4EXHA 4Y3FA 4M8YA 1LYAB 1FQXA 4Y4UA 5P3LA 5P3NA 5P3TA 4CPTA 4I0FA 5HDVA 5OZJA 5P0PA 5P35A 1GVUA 2BPXA 2HS1A 4H1EA 3O9HA 5P03A 2P3BA 5P58A 2AIDA 1DAZC 4J0YA 3WZ6A 5P7NA 3TPPA 5OZYA 2R38A 5P6JA 2I4UA 1EC2A 4Y36A 4FM6A 1SH9A 1GNMA 4Y51A 2OHSA 5P3XA 1K6TA 2B8VA 5P4BA 5P4YA 5P5HA 5P33A 6APRE 1ZLFA 2QMPA 4B77A 2R5QA 5JFUA 5DR4A 4ZIPA 5P07A 4Z22A 5HDZA 4DVFA 5P28A 3EL9A 5ISKA 4EXGA 2RSPA 4DQCA 4J1KA 1YTJA 3PRSA 1JLDA 2QD6A 3KM4A 3OQKA 4H3GA 3LPJA 5OYRA 1KJ7A 4RVXA 3TL9A 5P6UA 5P67A 1HVHA 4HA5A 4I8ZA 4QJAA 1MUIA 4YD5A 5ENMA 2B42A 1W5WA 2QHCA 1LYWA 5P2BA 1MERA 4YD7A 4JOOA 2AVQA 8HVPA 1SIVA 1B5FB 4HE9A 1NPVA 2O4LA 3OADA 5DQCA 3FNTA 5P52A 4K8SA 5C9DA 1NPAA 5P89A 4LXKA 2WEDA 4OBHA 3EKQA 1NSOA 2G1NA 4GZFA 2G24A 1MT8A 5P30A 4IVTA 4DPIA 5IVSA 1BVGA 5OZTA 4Y48A 4FSLA 3LZYA 5P5PA 2IGYA 3ZL7A 2VIZA 4TRZA 5P2JA 5BWYA 4OBGA 2A4FA 1GNOA 3UHLA 2QZKA 5P71A 5F01A 2V0ZC 3GGAA 4YA8A 3EKYA 1D4LA 2XFKA 2QI0A 4UPJA 3SA7A 2BBBA 4HDPA 3SA9A 3EMYA 3LPIA 5P27A 1Z1RA 2WF0A 4J1FA 5P87A 1BDRA 3QI1A 4J55A 1RL8A 4J5JA 1D4IA 5P5QA 5OYQA 5P4AA 4AMTA 1SMEA 2ZJIA 5P1XA 2BPVA 4NKKA 5P3ZA 4FAEA 3K5GA 5P6OA 5P2DA 1HPSA 5P1OA 1UH8A 2WF1A 2OAHA 3ZMGA 4WTUA 5P3CA 1EPRE 4Y5NA 3ER3E 2ER7E 1FG6C 5CLMA 3TOHA 3INFA 3CKPA 3OQFA 3PI0A 2ZHRA 3UQRA 2Q5KA 2G21A 3QN8A 3GGXA 5P8SA 3WB4A 1HEGE 1YT9A 5P12A 3CYWA 5P3DA 5BRYA 2VIJA 3O9DA 5DPZA 5P0YA 5P6YA 5P3BA 5P41A 5P8OA 1EC1A 1UH9A 5P05A 3LITA 3UDPA 5P0VA 5DQ5A 1TCXA 3Q5HA 3PB5A 1FIVA 5P5VA 3VLBA 4ER1E 5P7LA 2JXRA 2PSGA 2Q54A 5P50A 5P3AA 5P5KA 5OZ7A 2UXZA 2WEBA 5P7ZA 5P8NA 4Y4EA 2FXEA 5P4PA 2AOEA 1B6LA 1HPXA 2HPEA 1MIQA 5OYVA 6UPJA 5P8UA 3O9LB 1G35A 3OGQA 3SAAA 3R1GB 5P2LA 5PEPA 3SO9A 1EBZA 5P7QA 3KDCA 5P3KA 1NH0A 3NSHA 3OAGA 4Y3XA 5P3IA 3WB5A 3VYDA 4DJYA 1UH7A 3HLOA 5P51A 2WL0A 2BKSA 2XYEA 5KAOA 5P00A 4Y3NA 1ZP8A 5P39A 5P38A 5P4GA 3D3TA 5P53A 5SY2A 2BKTA 2HC0A 2XFJA 5P2MA 5OZPA 2VS2A 3S8IA 2OF0A 1LYBB 5AHBA 1MSMA 2A1EA 1SBGA 4YBFA 2QNNA 1Z8CA 5OZAA 5P2FA 4Y4ZA 3L5FA 5OZSA 5C9BA 4NJUA 5P8EA 5P4ZA 2AOGA 3ZKXA 4M8XA 5P70A 4J54A 2Q55A 3OHHA 4LXMA 5P1YA 4XX4A 3HAUA 2P3CA 3SKFA 3KF0A 5HU1A 3UDRA 3KYRA 3SLZA 1WKRA 3QRMA 4RRNA 5P1LA 3U71A 3LIQA 2NMZA 1HTEA 4I0IA 5P3YA 2NXDA 1QBUA 5P3JA 4Y3MA 4J1EA 1W6IA 4AA8A 4FLGA 2VKMA 5HE4A 5DR3A 1LEEA 5P6LA 4CKUA 3QP0A 3RTHA 5P7BA 1APUE 3VV8A 5P63A 3S45A 5P4KA 5P0UA 3KDBA 4EQ0A 4EJDA 4RYCA 5P14A 3LIYA 5P54A 4FIVA 5P7PA 2AVSA 3BVAA 3PWMA 4L6BA 5P6FA 5P1FA 3OXVA 1ZTZA 3TLHA 5P01A 4Y47A 3UQPA 2ZHSA 4N00A 1FLHA 5DR7A 3M9FA 3VSWA 3BUHA 3VV7A 1NPWA 3S43A 5SZ9A 5KOQA 3NR6A 4XXSA 5E5KA 3PCZA 3MSJA 5P6VA 3EL5A 5P1IA 2HIZA 5P4SA 5P7CA 1IZEA 4DH6A 2PK5A 4GIDA 4EQJA 2VJ7A 5DQ2A 1RV7A 2AVOA 1FKNA 2ZJHA 4J0VA 5P8CA 3JVYA 2J9JA 5P8BA 5P3OA 5P2HA 3O9FA 2FGVA 5OZ8A 3NU4A 2ASIA 4QJ2A 4Y57A 2F81A 4I12A 4EJKA 5OZIA 3QIHA 3L59A 3SA3A 1W5YA 3NU5A 5P8HA 5P8LA 4MC9A 2BPYA 5OZDA 3D20A 5P6WA 3BUGA 4MC1A 2P3DA 5EZXA 5SXNA 3SA6A 4LP9A 3AIDA 3OHFA 2FDEA 3OUCA 4ZSPA 2WECA 4L1AA 2QZXA 5P1KA 2RKGA 1EPPE 2QU3A 5OZQA 1FB7A 1TSUA 2ER0E 2AVVA 2QI7A 6FIVA 4Q5MA 5P7JA 4BFDA 5P65A 1LZQA 1U8GA 1ME6A 3ZKMA 4GMIA 1YTGA 2OHQA 2AOCA 5P1BA 3KDDA 2BQVA 3OQ7A 5P34A 1QBSA 5P2WA 1FQ6A 2QHYA 2CEMA 5P16A 5P4DA 3LZSA 5OZEA 3OWNA 2VJ9A 3ZPTA 4KE1A 3R2FA 3OTYA 2QCIA 1Q9PA 5P7RA 4YE3A 2JJIA 4Y4AA 5P0TA 3PWWA 5DR1A 5KR2A 5P36A 3N3IA 2WEZA 3OU1B 5P48A 5P29A 2PYMA 1HVJA 4MC2A 2FXDA 5P23A 2IRZA 3G6ZA 3H5BA 3FSMA 3OUDB 1CZIE 2NPHA 3MWSA 4NPUA 9HVPA 4OBFA 3ZKIA 3RTNA 5I70A 5OZBA 2V16C 4Y4WA 1IIQA 4JPEA 2Q15A 4CPQA 4MC6A 5P0BA 4F76A 3B80A 3C9XA 3GI6A 4RCEA 2WHHA 3DOXA 5P86A 2NNPA 2OHNA 2V12C 4DQHA 4WY6A 4I10A 4Y4DA 1ODXA 5CONA 1HPOA 5P06A 2H6SA 4OD9A 2R5PA 3PLDA 1META 1M43A 1ZPAA 3NDUA 4ZPFA 4PZXA 5KQXA 4Y5LA 4Y4BA 5IS4A 3K5FA 2QU2A 4EP3A 4D83A 4F75A 2WJOA 5HDUA 2R43A 4KE0A 4Y5EA 2HAHA 1MTRA 4Y45A 1AVFA 5OZ1A 5KR8A 3IA9A 2FDPA 2HB2A 1T7JA 5P4WA 4DFGA 3TKWA 1D4SA 3IAWA 4Y3TA 2FMBA 3KT5A 3DCRA 2BPWA 5P2GA 4FL8A 5P4IA 3ST5A 2ZJKA 1D4YA 1Z1HA 2P83A 1T6EX 2QP8A 5OZNA 2AQUA 5P5CA 3B7VA 5P8JA 3IN4A 2PSVA 3VLAA 2G20A 1FMUA 5P2AA 4JP9A 5P3EA 5P3HA 3VYFA 4DJQA 4B1DA 1A30A 2QMGA 3TOFA 3KN0A 1GVWA 1MPPA 4Z4XA 3OK9A 3DUYA 5KQYA 1HHPA 4OBZA 4D85A 5P73A 2QZLA 5P3PA 4FRSA 3I2LA 5P6KA 3Q3TA 1BDLA 3FV3A 3S85A 2AVMA 5T4SA 5OZRA 5P3VA 1HXWA 2NXMA 3QAAA 1XDHA 5P31A 5IE1A 2IS0A 2G22A 3PBZA 3Q6YA 5OYTA 4PHVA 4OC6A 3ZKQA 3ECGA 3CKTA 3LINA 4YOAA 5HU0A 4EPJA 4FS4A 3OY4A 4Y3GA 4ZEAA 5P2KA 5P8MA 2NMYA 5P1VA 5DR0A 5P5TA 3OQDA 4WY1A 5P5SA 4Y35A 5OZKA 1ER8E 2FLEA 4OBKA 4I0GA 5P4CA 5P5LA 3SA8A 1AZ5A 2ZHVA 5P6ZA 3IXKA 3VFBA 1QDMA 3NUJA 1GNNA 4Y3WA 1XE6A 1HWRA 1E82E 1PSOE 1ODWA 2RENA 2V00A 3QROA 4Y3HA 1IVQA 1PFZA 5OZLA 1HVLA 5P8TA 4CPXA 4R91A 3BXRA 3CIBA 5P84A 4AA9A 5P1QA 1EC0A 7HVPA 4JECA 4D8CA 3BHEA 2B7FA 5P6XA 3PLLA 5P75A 2IKOA 3CKRA 3SACA 2F8GA 2JYSA 4PEPA 3D1XA 1EPQE 2PMAA 2AOJA 3L5DA 5OZMA 4Y3RA 5OZWA 1WBMA 1WBKA 3SA4A 1HVCA 3LZUA 1MT9A 4DJOA 5P2TA 2Q3KA 5IVTA 4GJAA 4D88A 3IXJA 4I8WA 1T6GA 1HIIA 3VFAA 3RU1A 3O9BA 2O4SA 1EC3A 4RRSA 5P0JA 2AOIA 4ZSMA 1T3RA 1XS7D 4GB2A 1T7KA 3GGVA 1EEDP 1AAQA 4I0JA 5I3VA 5P4OA 2R9BA 5P7UA 3TH9A 5P09A 5P1HA 3UCBA 1E81E 1FMBA 3EKWA 2PQZA 3PI5A 3EXOA 2OHRA 3EM4A 5HDXA 3SM2A 1HOSA 3N4LA 2QZWA 2XFIA 5AHAA 3NDTA 2PK6A 5P37A 2P3AA 2WEAA 3VF3A 1D4KA 4I0HA 1MTBA 5P82A 4DJUA 3HW1A 5AGZA 3LPKA 4Y5MA 3QVCA 1J71A 3PSGA 4X7IA 2P3BB 5P88A 5P5MA 3NLSA 3KFPA 3UDYA 1HTGA 2WKZA 3GGUA 1HIHA 3DJKA 3VSXA 5OZ6A 5P6BA 3BC4A 5P8PA 4RVIA 1K6PA 5P80A 4A6BA 1KZKA 3OU4A 4Y37A 3OGPA 3NU6A 4U7VA 3D1YA 5P59A 4LBTA 4ACUA 5P04A 1F7AA 2G27A 5P0HA 4Q1YA 1BILA 1XN2A 1K6VA 1YM4A 4EWOA 4J1HA 4YCYA 5P79A 2IGXA 2Q64A 2QD8A 2OHTA 4DJPA 1APTE 1DW6C 2AODA 2OHPA 5P8VA 2F80A 5P5ZA 1LYWB 1FG8C 4PYVA 3U7SA 5P1TA 2RMPA 3K5CA 3L3AA 1C6YA 4QJ8A 3ZPSA 3OADB 4Y4TA 5I3YA 2AOFA 2IDWA 2V13A 5IVQA 4Y5AA 3TPRA 1OEWA 5P5FA 2OHMA 5P8KA 3AUPA 3PWRA 1YX9A 4DUSA 4H3JA 5OYYA 3NDXA 3KMYA 4RLDA 4Y54A 3CMSA 1RQ9A 3UDMA 5ER2E 2F3FA 3HD8A 3O9AA 2FGUA 2NNKA 4KUPA 4FRIA 4Y58A 5P7VA 3WSJA 5DR8A 4GJBA 4QJ7A 3OQAA 5P3UA 5P4MA 2SAMA 3KFNA 3K4VC 1SGUA 1G0VA 1C6XA 1K1TA 5JODA 3QVIA 1IZIA 1PPME 2V11C 5P1EA 4FRJA 3PVKA 5P6CA 3ZKSA 1SDVA 4XX3A 2RKFA 5P1JA 4Y41A 2QI4A 4RGHA 2JE4A 3I25A 3HVPA 5KR1A 3TKGA 5P4FA 5P7SA 5OZHA 1C70A 1VIJA 1SDUA 4Y5BA 1LV1A 4J0ZA 1FMXA 5P4EA 1SGZA 4DQEA 5P1PA 3NXEA 2QMDA 5P8FA 3R0WA 4LHHA 1LYAA 4Y4GA 2FNSA 3NU9A 3S56A 1AM5A 3S54A 5P7FA 4EJLA 5HVPA 1TQFA 1ZAPA 4DPFA 4GJ8A 5P1DA 1OEXA 3T7XA 1W51A 4YBIA 1FGCC 2IKUA 2QD7A 3A2OA 2AZ8A 4HLAA 3EM6A 5P7HA 3MXEA 4GYEA 5AH8A 2MIPA 4GJ6A 3OXXA 3OU3A 3OUAA 4ZPEA 3BGBA 1TW7A 1ZPKA 5DGUA 1HVIA 4I0ZA 1HIVA 3D91A 3F9QA 4TVGA 4APEA 5P7DA 4BELA 4B1CA 4YCTA 3BXSA 3L5EA 2VNMA 4Y3DA 3UFLA 4FCOA 1MVPA 2F3EA 1ZBGA 4CPWA 3T6IA 5P5RA 3D1ZA 4YD3A 4AUCA 4FRKA 5P26A 4HEGA 2IEOA 3GI0A 4Y50A 5KQFA 2QI3A 3TOGA 5P81A 1RPIA 5P5DA 5P57A 4B00A 5P4LA 3O99A 2HPFA 3NWQA 5P1MA 1APVE 2VA7A 3L58A 1B5FA 1G2KA 5OYUA 3VV6A 3T7QA 5COPA 2UY0A 5COOA 1EPOE 1MT7A 4PPHA 2IL2A 2FDDA 1HXBA 5P0FA 5P32A 1UPJA 2UPJA 4CPSA 3OAGB 5P40A 1A94A 4Z50A 4FGXA 3UQXA 2QK5A 3K1WA 3INEA 3KMXA 3TTPA 3VF5A 5P6IA 5P0SA 2R8NA 5AHCA 5OYSA 5OZ5A 1KJGA 4NPTA 3I8WA 3PGIA 5P45A 3T7PA 5P0KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F3K A;  5SY3 A;  1G6L A;  5P2O A;  4Y44 A;  1YM2 A;  4HDB A;  5OZ2 A;  5P69 A;  5P4N A;  3IGB A;  4B1E A;  3O9E A;  2O4P A;  4H3I A;  4CPR A;  3LZV A;  3SKG A;  1AXA A;  5P3S A;  4DQF A;  1RNE A;  5P7E A;  1MEU A;  4DV9 A;  4QLH A;  5P19 A;  4B0Q A;  4EXH A;  4Y3F A;  4M8Y A;  1LYA B;  1FQX A;  4Y4U A;  5P3L A;  5P3N A;  5P3T A;  4CPT A;  4I0F A;  5HDV A;  5OZJ A;  5P0P A;  5P35 A;  1GVU A;  2BPX A;  2HS1 A;  4H1E A;  3O9H A;  5P03 A;  2P3B A;  5P58 A;  2AID A;  1DAZ C;  4J0Y A;  3WZ6 A;  5P7N A;  3TPP A;  5OZY A;  2R38 A;  5P6J A;  2I4U A;  1EC2 A;  4Y36 A;  4FM6 A;  1SH9 A;  1GNM A;  4Y51 A;  2OHS A;  5P3X A;  1K6T A;  2B8V A;  5P4B A;  5P4Y A;  5P5H A;  5P33 A;  6APR E;  1ZLF A;  2QMP A;  4B77 A;  2R5Q A;  5JFU A;  5DR4 A;  4ZIP A;  5P07 A;  4Z22 A;  5HDZ A;  4DVF A;  5P28 A;  3EL9 A;  5ISK A;  4EXG A;  2RSP A;  4DQC A;  4J1K A;  1YTJ A;  3PRS A;  1JLD A;  2QD6 A;  3KM4 A;  3OQK A;  4H3G A;  3LPJ A;  5OYR A;  1KJ7 A;  4RVX A;  3TL9 A;  5P6U A;  5P67 A;  1HVH A;  4HA5 A;  4I8Z A;  4QJA A;  1MUI A;  4YD5 A;  5ENM A;  2B42 A;  1W5W A;  2QHC A;  1LYW A;  5P2B A;  1MER A;  4YD7 A;  4JOO A;  2AVQ A;  8HVP A;  1SIV A;  1B5F B;  4HE9 A;  1NPV A;  2O4L A;  3OAD A;  5DQC A;  3FNT A;  5P52 A;  4K8S A;  5C9D A;  1NPA A;  5P89 A;  4LXK A;  2WED A;  4OBH A;  3EKQ A;  1NSO A;  2G1N A;  4GZF A;  2G24 A;  1MT8 A;  5P30 A;  4IVT A;  4DPI A;  5IVS A;  1BVG A;  5OZT A;  4Y48 A;  4FSL A;  3LZY A;  5P5P A;  2IGY A;  3ZL7 A;  2VIZ A;  4TRZ A;  5P2J A;  5BWY A;  4OBG A;  2A4F A;  1GNO A;  3UHL A;  2QZK A;  5P71 A;  5F01 A;  2V0Z C;  3GGA A;  4YA8 A;  3EKY A;  1D4L A;  2XFK A;  2QI0 A;  4UPJ A;  3SA7 A;  2BBB A;  4HDP A;  3SA9 A;  3EMY A;  3LPI A;  5P27 A;  1Z1R A;  2WF0 A;  4J1F A;  5P87 A;  1BDR A;  3QI1 A;  4J55 A;  1RL8 A;  4J5J A;  1D4I A;  5P5Q A;  5OYQ A;  5P4A A;  4AMT A;  1SME A;  2ZJI A;  5P1X A;  2BPV A;  4NKK A;  5P3Z A;  4FAE A;  3K5G A;  5P6O A;  5P2D A;  1HPS A;  5P1O A;  1UH8 A;  2WF1 A;  2OAH A;  3ZMG A;  4WTU A;  5P3C A;  1EPR E;  4Y5N A;  3ER3 E;  2ER7 E;  1FG6 C;  5CLM A;  3TOH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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