2ASIA

Aspartic proteinase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
357
structure length
356
Chain Sequence
GSVDTPGYYDFDLEEYAIPVSIGTPGQDFLLLFDTGSSDTWVPHKGCTKSEGCVGSRFFDPSASSTFKATNYNLNITYGTGANGLYFEDSIAIGDITVTKQILAYVDNVRGPTAEQSPNADIFLDGLFGAAYPDNTAMEAEYGSTYNTVHVNLYKQGLISSPLFSVYMNTNSGTGEVVFGGVNNTLLGGDIAYTDVMSRYGGYYFWDAPVTGITVDGSAAVRFSRPQAFTIDTGTNFFIMPSSAASKIVKAALPDATETQQGWVVPCASYQNSKSTISIVMQKSGSSSDTIEISVPVSKMLLPVDQSNETCMFIILPDGGNQYIVGNLFLRFFVNVYDFGNNRIGFAPLASAYENE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Aspartyl protease
molecule keywords ASPARTIC PROTEINASE
publication title Crystal structure of the aspartic proteinase from Rhizomucor miehei at 2.15 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 82
structure length 356
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.4.23.23: Mucorpepsin.
pdb deposition date 1995-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 2asiA01
2OHSA 3O9CA 3OU4A 3VYFA 2QNQA 2G20A 1RNEA 4D8CA 5P6BA 5OZFA 4F74A 1GVXA 5P30A 3QIHA 4H3GA 2F3KA 3ZLQA 5P56A 1DIFA 2G1SA 1FQ7A 5P3TA 1EPQE 4NPTA 5P8HA 1HVRA 5KQFA 1A8GA 3CMSA 3O99A 5P48A 5P6FA 3O9GA 5P20A 1GNMA 1TSQA 5P3NA 3EBZA 3O9HA 3NXNA 5P6UA 2ZHRA 4Z2ZA 1KJ7A 5P0BA 3VF5A 1GNNA 1RL8A 4EXHA 2Q5KA 3CICA 2OHNA 2ZE1A 1A8KA 5SZ9A 3UHLA 2WF0A 5P84A 5P45A 2G69A 5OZUA 5P2AA 1FQ6A 5F00A 3NWQA 1MT8A 3LPKA 5P46A 5P76A 1C70A 2ZJKA 3BXSA 3ZL7A 5ISKA 4N00A 5P50A 5OZBA 1LV1A 2OF0A 1TQFA 3A2OA 1MRWA 3INFA 3U71A 5P0OA 5P2UA 1EPPE 4YD5A 3PI5A 4FRJA 3EL5A 5P0CA 3OTSA 4Y3YA 3UFLA 2AVVA 4FM8A 2OHKA 5P60A 4YD4A 1IDAA 2ER9E 5P2OA 2AVQA 1LYWA 2QZLA 4D89A 2ANLA 4F75A 2P3AA 5P37A 3TPRA 1NPVA 3EKPA 4EJLA 5OZTA 5P75A 3KM4A 5P8SA 4DQHA 5P5BA 5P5NA 4Y58A 5I3YA 5P3IA 4LP9A 5P63A 3S7MA 2WF3A 5OZ6A 1PSNA 2BPWA 3TPPA 4DJYA 4CPXA 3NU6A 4QLHA 2B60A 3UDQA 2PK5A 3WZ8A 3PSYA 3IXKA 5P0MA 1PPME 3H0BA 1ENTE 3O9AA 2QP8A 3I7EA 3RSXA 3OAGA 5P2TA 1OEXA 5P06A 4OBJA 2I4UA 3L58A 1SGUA 4AA8A 1B6MA 5OZ3A 2G26A 5FIVA 4DH6A 4XX3A 5P69A 3FX5A 1PFZA 3BUHA 4EHCA 2G24A 4I0ZA 1E80E 3VEUA 1ZLFA 2QI1A 2BB9A 4EXGA 1HSIA 2J9JB 5P01A 5P0ZA 2FDEA 3PWRA 5P87A 2F80A 3QRSA 4Y43A 5BS4A 5P04A 5OZQA 4Y5AA 5P0RA 1LYBA 2HB4A 3UDPA 5P1OA 4Y37A 3BUFA 2JJIA 1UH7A 5P39A 1YTJA 3BGBA 3TLHA 3PEPA 3OXVA 3U7SA 3SKGA 2G94A 5P0TA 1T6GA 4OD9A 2QD8A 5P7RA 4IVTA 4I0DA 5ER1E 1FKNA 5KR2A 5KR0A 1MRXA 1ZSRA 5SY2A 3R2FA 4RYCA 5P3DA 1AZ5A 1AM5A 2HB2A 5P4MA 2NMYA 3INHA 5P15A 2RSPA 6UPJA 5P3OA 5P55A 5KAOA 1TCWA 5P51A 2VJ9A 3RU1A 4OBZB 4NJTA 4I0FA 4Y4XA 4PPHA 2AOGA 5P6QA 3VF7A 4PZWA 2AOJA 5AHBA 5P8IA 5P2YA 3UF3A 2IDWA 1ER8E 5P1TA 3NDUA 3S85A 2FDPA 5P4QA 2XFIA 3SM2A 1FB7A 4R93A 5JFUA 4GJ6A 4DUSA 5I70A 3OUCA 3PSGA 5COKA 5UPJA 2IQGA 5P3GA 3EL4A 3FSMA 2I4WA 4RVIA 5P5FA 5P5PA 2WECA 2A4FA 4GJDA 1HVKA 3VFAA 4ZEAA 4RVXA 1W5WA 1EC1A 1ZJ7A 2VIZA 3IVIA 1GVTA 5P5DA 1BIMA 3B7VA 5IE1A 5P3HA 4PZXA 2I4VA 3F9QA 3EMYA 1SIPA 3QP0A 3L3AA 2OHLA 5P1YA 3K4VC 5P85A 5OYTA 2AZCA 4FS4A 1MSNA 3UDYA 3EKTA 3NR6A 5AHAA 3TL9A 2P3DA 2J9KA 3O9LA 1NPAA 3EKQA 3VV7A 5P8VA 5P6NA 2OHUA 1YTGA 3KT2A 3NYGA 2B42A 4Y45A 4LXMA 5AH9A 2Q63A 4DJXA 2QAKA 3OUDA 4COEA 3BXRA 4BFBA 3SA8A 3OXWA 3S7LA 5JG1A 2VNMA 3UDKA 5P74A 1B6LA 1HTGA 4DJVA 2V16C 5P6WA 5P25A 1IZDA 3C9XA 5P0EA 5P4DA 2R43A 3EM4A 3LITA 2ZYEA 1K1UA 5OZDA 5P7HA 2FGUA 4LAPA 5P4XA 5P3PA 4Y3RA 3NDXA 3TOFA 2Q11A 1SH9A 4ZPFA 1HVHA 2ZJJA 3O9IA 3S43A 1Z8CA 2QMPA 3LZUA 5P5RA 3QAAA 4RRNA 2NXDA 1HBVA 1SIVA 5P1CA 1T3RA 2RKGA 4M8XA 1WBKA 4TRZA 1FMBA 2PC0A 4JPEA 1BDRA 4FAFA 2G21A 3HDKA 5IVRA 1A9MA 5P2IA 3UDNA 4HDBA 5P8OA 3PI0A 5OYSA 5P27A 5P0QA 1HVSA 4Y4DA 3K5CA 5P4KA 4HDPA 5DGWA 1UPJA 1YTIA 3CKTA 3LPJA 3OWNA 4Y5LA 5OZGA 3LNKA 5P1DA 3LIQA 4AZYA 5CLMA 2VNNA 2FIVA 1OD1A 4EYRA 3KDDA 2QK5A 5P7JA 2P4JA 1BXQA 5P3BA 2JXRA 2AZBA 5DR4A 4OBHA 5P67A 1IDBA 4QJ2A 3SLZA 5AH7A 3QVIA 5OZNA 4YCKA 3OQKA 2H6SA 2QI7A 2I0AA 2QU2A 3PWWA 3PRSA 4HE9A 1SGZA 5OZMA 1B5FA 4J1FA 3URLA 5P0GA 2PYMA 1HXBA 1TW7A 4RRSA 3Q5HA 1IVQA 4Y3SA 2HB3A 3LZYA 3OADA 1T6EX 1CZIE 4Q1XA 4GJAA 4DQBA 5KQZA 3OU4B 3VSWA 1KJHA 3QRMA 2QD6A 3VSXA 2NTRA 2F3FA 3GI5A 3KA2A 1APWE 3T7QA 4DV9A 1BDQA 4Y3GA 2ZHVA 5P8NA 4Y4GA 1HVCA 1XN2A 3KMXA 5P3JA 2WF1A 2IS0A 3KDBA 4Y56A 3WB4A 3SACA 2VKMA 2F3EA 4RCDA 7UPJA 3N3IA 5P6RA 2NPHA 2AOEA 3N4LA 5P6IA 5P38A 2PMAA 3KN0A 2VJ7A 5P2ZA 1MTBA 2AVSA 5HD0A 1TZSA 5P83A 3ECGA 4ZIPA 3CKRA 5COOA 1B6KA 3RSVA 3UQRA 4RCEA 5BRYA 2IL2A 5P1GA 4AUCA 4HA5A 5OZPA 1IIQA 3NXEA 5P5SA 2NMZA 1BV9A 3OQDA 5OZ4A 3HVPA 5KOQA 5P6VA 5DQ5A 3OU1A 5OZCA 4YD3A 1EBWA 4Y4ZA 1E82E 3O9FA 2IGYA 5OYZA 4TRYA 1DW6C 5BWYA 5P10A 4B72A 3Q6YA 5P42A 3ZPUA 5P4NA 2IRZA 1QBRA 1AVFA 1K6CA 4DJOA 1QRPE 4Y5NA 2PSVA 3IVHA 5OZZA 3OQFA 3R0WA 1EPRE 1APUE 2QI3A 4I12A 4Y36A 1J71A 4YA8A 3OUAA 2VIEA 3RVIA 2WEAA 3ZMGA 5P7SA 4R5NA 4CPRA 5P5AA 4LXAA 5P4FA 5P61A 4DFGA 2ZDZA 5P82A 3VYEA 2IKOA 5P0VA 3ER5E 5P5HA 3KDCA 3UDRA 5P64A 4RVJA 5P7YA 2I0DA 5P35A 4A6CA 2P3BA 3NU4A 4U7VA 5CONA 1Q9PA 5AGZA 5OZ5A 5P7IA 1MTRA 2ZHTA 4HDFA 4ZSRA 4FRSA 3OAGB 2O4PA 5P6GA 3KFRA 2QHZA 2FNSA 2R5QA 5P7DA 3L5BA 5P2NA 1PSAA 3FNUA 2OHQA 5P4IA 2BPXA 3WZ6A 1OHRA 1D4LA 2R5PA 3NSHA 2AZ9A 2B8LA 1FFFC 1EBYA 5P0WA 5P7QA 2XFKA 1W6HA 4R95A 1HPSA 2AVOA 5P5OA 2ZJHA 5OZLA 1FMXA 5P7WA 3G70A 1N49A 1IZIA 4LBTA 5P72A 4A4QA 2HC0A 2Q15A 1G35A 3FNTA 2FGVA 3K5DA 4EJ8A 4A6BA 1ZSFA 5P6DA 1FQ8A 1LYBB 1EC3A 3LIYA 4B1DA 3APPA 2QU3A 5P8DA 1MT9A 4B70A 5P7KA 1F7AA 3ER3E 5PEPA 4OD9B 5P5IA 2V13A 3GGUA 3SQFA 5P31A 1FG6C 2O4SA 3LINA 2P8HA 5OYRA 5P5TA 2CEMA 3BC4A 4JOOA 1XL2A 4HLAA 3INEA 5P8GA 4QGIA 3FV3A 5HE5A 3IGBA 3MSLA 3OTYA 4FGXA 5IS4A 5P1XA 3WSJA 5P1LA 4CPUA 1MERA 4J1EA 1HIVA 4FRKA 2B7ZA 3QN8A 4XXSA 3QBHA 3TNEA 5P3CA 8HVPA 2R9BA 5P8EA 1XDHA 5OZXA 1MSMA 1WKRA 2XFJA 4Y3QA 4GJ8A 5P3UA 4F76A 5P81A 5OZ9A 2WF4A 5P11A 4Y3EA 3HLOA 3PCZA 3R4BA 3OOZA 5P2XA 5AH8A 4Y3MA 1G2KA 5JODA 1T7IA 5P6OA 5P2DA 5C9BA 5P7TA 1ZPAA 6FIVA 1QBSA 3SA4A 3DK1A 4YDFA 4Z22A 1SMRA 3R1GB 5P65A 4K4RA 5OZHA 5P32A 2Q54A 5HTZA 2QMGA 5P44A 1YX9A 1C6ZA 2XYEA 3OXXA 4NJSA 5OZRA 5P2RA 5P4LA 5P2HA 3Q70A 4Y5PA 5P8BA 1MT7A 4BELA 3SKFA 2RMPA 3VUCA 1HSHA 2B7FA 4NPUA 4OC6B 2QMDA 3D1XA 1LYAA 3O9BA 5P29A 5P00A 5OZEA 4Y3NA 4DJPA 3O9LB 5P7BA 1LF4A 4R92A 4Y3HA 4X2LA 2BQVA 3UDJA 5P2EA 4ACXA 3FIVA 5P3FA 3LIZA 3OUBA 5HDXA 5P6JA 3OUDB 3OU3A 2QD7A 3ZKSA 2QZKA 4MC1A 4WY6A 3MXEA 4CMSA 4Y4BA 5P7EA 5DQ1A 5P1QA 2QMFA 3L5CA 3L5FA 4Y5MA 2BJUA 2IGXA 3OGPA 5P7ZA 5P71A 4DJQA 4FM6A 2G1YA 3UPJA 5P8RA 3GGAA 1XL5A 3S43B 5P6XA 3L5EA 4Y3TA 4WTUA 3EXOA 2G1NA 3VF3A 4LC7A 2BKSA 3VV6A 2I1AA 2WEBA 3S2OA 4RROA 5P86A 1SP5A 4Y41A 2FXEA 3QI1A 5P6HA 4DI2A 5P7OA 4D88A 3L38A 4TVHA 4E43A 5EZZA 3VCMA 1DMPA 5P4RA 4J0YA 4I0GA 4K4QA 2O4KA 2PH8A 3ZKMA 4NJUA 1PROA 5P3RA 5P43A 4APEA 4B0QA 5KQYA 2JYSA 5HCTA 5P1SA 1KZKA 3UQXA 3K5FA 2QI4A 1F34A 5TOLA 5ER2E 4Y5KA 5P3YA 1PPKE 4RZ1A 4I0HA 5ENMA 1BVGA 1HVLA 3NU5A 2P3CA 2MIPA 3SM1A 5P3LA 1ME6A 3HD8A 3GGVA 4H1EA 3PMYA 4OBGA 5P0JA 4YOAA 1K6VA 2QNNA 2QI5A 5I3WA 3KF0A 4DQFA 5KOSA 4J1KA 4Y3JA 4Q1WA 4HZTA 4GJBA 4I0EA 5P6EA 5P5UA 3MXDA 1AAQA 4JECA 2NXLA 4Y4WA 5P3MA 5P5CA 5OZWA 3L59A 4IVSA 5P7PA 1K2CA 3VFBA 3KFNA 2WEDA 1MESA 4I1CA 3AIDA 1Z1HA 4R8YA 5P1PA 2PSGA 3QROA 1BAIA 4FLGA 4AA9A 5P7FA 5P49A 5OZYA 4F73A 2NNKA 5P1EA 3S45A 2RENA 5P6AA 1BV7A 3BGCA 2PWRA 5P2QA 3EL0A 2G1OA 4ZE6A 2PH6A 3PVKA 5P1NA 5OZVA 3I25A 3KMYA 2BPVA 3TH9A 4ZSQA 4OBZA 3K4VA 5OZ0A 1RV7A 4EQ0A 3ZPSA 5T4SA 4NKKA 3MSKA 5AH6A 4B1EA 4QJ7A 4I0JA 3GGXA 5P59A 4B05A 4RLDA 2I4DA 5P1FA 5DPZA 2FMBA 3ZKNA 1BWBA 1DAZC 5P13A 2AOFA 5SXNA 1GVUA 2FLEA 3D3TA 3OU1B 1W5YA 5P40A 1RQ9A 1FQ4A 4Y3DA 5P1VA 2IKUA 5DR7A 2BKTA 3CYXA 2VJ6A 4L7GA 5P4YA 5OYQA 2QHCA 4Y51A 1QS8A 3OQ7A 5COPA 1A94A 3NLSA 4Y9WA 3O9DA 1ODXA 5KR1A 3SA3A 4GB2A 3URIA 4L1AA 5P8MA 5P70A 5OZ7A 3URJA 4YE3A 5IVSA 5P8TA 5P73A 5P68A 5P1KA 5P3AA 5P1RA 2UPJA 3CYWA 2HAHA 3PMUA 1HPVA 1AJVA 5P5ZA 4XX4A 2AZ8A 5P3VA 5P2CA 4J0TA 1APVE 5P18A 3BVAA 5P33A 5HU0A 1QBUA 2FXDA 1EEDP 4H3FA 5OZ8A 4I8ZA 2P3BB 5P8LA 1FQ5A 1D4SA 4EWOA 2AQUA 1M0BA 4Y5GA 1RPIA 5P8QA 3KFSA 5OZ1A 3VV8A 3UQPA 4BFDA 2HS2A 3T7XA 5OZJA 3VLBA 1W51A 5P1IA 2R3TA 3BRAA 4Y3XA 3SA7A 4R91A 1XE5A 2Q55A 5P19A 5C9DA 5HU1A 1HEGE 3EKWA 5P5EA 4DPFA 4ZLSA 2AOCA 4Y5CA 5P6SA 3U6AA 4FCOA 4Y48A 5P1UA 1EBKC 5P5MA 5I3XA 3LPIA 4J17A 5KR8A 1XS7D 1KJGA 5P79A 3QPJA 5P89A 3IA9A 4U8WA 1A30A 1ZAPA 3VLAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2OHS A;  3O9C A;  3OU4 A;  3VYF A;  2QNQ A;  2G20 A;  1RNE A;  4D8C A;  5P6B A;  5OZF A;  4F74 A;  1GVX A;  5P30 A;  3QIH A;  4H3G A;  2F3K A;  3ZLQ A;  5P56 A;  1DIF A;  2G1S A;  1FQ7 A;  5P3T A;  1EPQ E;  4NPT A;  5P8H A;  1HVR A;  5KQF A;  1A8G A;  3CMS A;  3O99 A;  5P48 A;  5P6F A;  3O9G A;  5P20 A;  1GNM A;  1TSQ A;  5P3N A;  3EBZ A;  3O9H A;  3NXN A;  5P6U A;  2ZHR A;  4Z2Z A;  1KJ7 A;  5P0B A;  3VF5 A;  1GNN A;  1RL8 A;  4EXH A;  2Q5K A;  3CIC A;  2OHN A;  2ZE1 A;  1A8K A;  5SZ9 A;  3UHL A;  2WF0 A;  5P84 A;  5P45 A;  2G69 A;  5OZU A;  5P2A A;  1FQ6 A;  5F00 A;  3NWQ A;  1MT8 A;  3LPK A;  5P46 A;  5P76 A;  1C70 A;  2ZJK A;  3BXS A;  3ZL7 A;  5ISK A;  4N00 A;  5P50 A;  5OZB A;  1LV1 A;  2OF0 A;  1TQF A;  3A2O A;  1MRW A;  3INF A;  3U71 A;  5P0O A;  5P2U A;  1EPP E;  4YD5 A;  3PI5 A;  4FRJ A;  3EL5 A;  5P0C A;  3OTS A;  4Y3Y A;  3UFL A;  2AVV A;  4FM8 A;  2OHK A;  5P60 A;  4YD4 A;  1IDA A;  2ER9 E;  5P2O A;  2AVQ A;  1LYW A;  2QZL A;  4D89 A;  2ANL A;  4F75 A;  2P3A A;  5P37 A;  3TPR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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