3T7QA

Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the gewald reaction
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in complex with an inhibitor based on the Gewald reaction
rcsb
total genus 86
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2011-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3t7qA01
2QI7A 5P15A 4Y3EA 2AVQA 4R91A 3EM4A 5EZZA 2Q63A 1XE5A 2QNPA 1W5YA 3UQUA 2FIVA 5P33A 4MC1A 5P2LA 4LP9A 3URLA 5I3VA 1IDBA 5P28A 5OZPA 2AVMA 2F3KA 5P3UA 5P1JA 2Q5KA 2V16C 2AIDA 1LF4A 2IENA 2Q55A 2BKSA 3LHGA 5P18A 1G0VA 4Y5NA 5P3NA 5P61A 2UY0A 5P4AA 3RTHA 4HEGA 1BXQA 3VFBA 5P46A 4GZFA 3OK9A 3TOGA 3DJKA 2QI4A 2O4SA 3EKTA 2OHLA 4I10A 4U7QA 1PPME 2V12C 3GGUA 4WY6A 1PSNA 3DOXA 2NMYA 4NJVA 3PB5A 5P1OA 2R8NA 1FLHA 3PEPA 5P4BA 3EKWA 1D4JA 5P0PA 4CPWA 3FV3A 4DPIA 5P7AA 4I0FA 5OZ0A 5P0IA 1HTGA 3TL9A 5P6WA 4PHVA 2VIZA 3L5EA 1NPWA 4I11A 5OYXA 2BPVA 5AH7A 1W6HA 1B6LA 5P4FA 5P5TA 1CMSA 3QRVA 2IKUA 2SAMA 3L38A 2F80A 5P4EA 4DJWA 5OZHA 5DQCA 4ER1E 1IIQA 5OZEA 5P4CA 4KE1A 3MSKA 2JYSA 5IVQA 4QJ9A 2WKZA 1GKTA 5P0EA 4QJAA 4GJ7A 5HCOA 4ZE6A 5OZSA 3NXNA 5P6YA 5P7TA 2Q11A 3SA8A 2QI0A 4FS4A 3VYDA 1RNEA 3UDKA 5P0WA 3PCWA 5P7XA 2WF0A 1K6PA 3O9DA 1K2CA 1MEUA 2IL2A 4HA5A 4DJRA 2P3BB 2PQZA 5HE7A 1QS8A 4RVXA 4XX4A 4J1KA 5P0AA 1AIDA 5KAOA 4D85A 5OZGA 3NU9A 3TH9A 4DUSA 1TSQA 2UXZA 4FRSA 2ZJKA 3QP0A 1ODWA 4Y5EA 2B42A 4I0DA 3RSVA 4ACUA 4L7GA 5DR8A 2BJUA 5P4ZA 5P69A 5P7JA 5P5PA 5P4KA 5APRE 4Y4BA 3S53A 3MSLA 2VIYA 5UPJA 4Y5CA 5OYUA 4YBIA 3S8IA 5DR1A 4J5JA 2WHHA 2PSVA 3HBOA 4Y5GA 5P1PA 3GGXA 1B6PA 4B72A 3MWSA 5P05A 3CKTA 3JVYA 4GJBA 5P4HA 2F3FA 2FXDA 2NXLA 5P4JA 3BRAA 3HZCA 1HIIA 5IS4A 1YM4A 5DR0A 1FMBA 5P4RA 5DQ2A 5P2AA 2WEBA 4DJYA 3K5FA 3LIYA 5P7UA 1MT9A 4DPFA 1GVWA 4AA8A 3BVAA 3L59A 3RU1A 5P8VA 4YHQA 3TPPA 5P6FA 4M8YA 4WTUA 4EP2A 5P53A 5OYTA 4L1AB 1PSAA 1OEWA 4H3GA 5P3SA 5P56A 1HTRB 3KF0A 3EKXA 5E5JA 4LL3A 5P78A 4DJPA 5DQ1A 3G6ZA 2JXRA 4J1CA 3VV7A 3OUDB 3GI4A 5P2CA 1MPPA 2OHMA 3PWMA 3JVWA 4I0ZA 1QRPE 4Y53A 3OAGB 3S85A 4Z50A 3CKRA 3SLZA 3WZ8A 2RKFA 3PWRA 1C70A 5P3KA 5OYSA 1SMEA 4ER2E 5P4WA 3D1ZA 1T3RA 4GJAA 2P8HA 4I8ZA 1D4SA 2PMAA 3UF3A 1HVIA 1ZJ7A 4Y4WA 4Y4XA 5P6DA 4QJ2A 4IVTA 5KQFA 4PYVA 3EMYA 3IAWA 4DQCA 4Y5BA 5P0JA 4J54A 3S56A 5P79A 3CIDA 3OTYA 2A1EA 4JOOA 2R5QA 1LYBA 1XL5A 4L6BA 5P1HA 5P3DA 1ZPAA 2VJ6A 1HVRA 1IZEA 4Y3LA 3PHVA 3UDRA 4OBHA 5P35A 5P25A 2ZE1A 1T7KA 4J1EA 5P0UA 1FKNA 1EC2A 2R3TA 5JG1A 5OZYA 3S45A 5P3IA 4OBZA 4ZPFA 3HLOA 2F8GA 3DCRA 1OD1A 1HVKA 4Y57A 5AH6A 4RROA 4Y58A 4Y5LA 3ZKQA 4Y41A 4RVIA 4Y4JA 5P2HA 4QJ6A 5P3PA 5P0TA 1HSGA 2JJJA 5P42A 4R5NA 2QU2A 1FFFC 1HSIA 3OOTA 5P0VA 3ER5E 5P37A 5P5QA 5P85A 4I8WA 5P0CA 3KMYA 1T7JA 1JLDA 2NR6A 2HS1A 3CYXA 5DR4A 4Y56A 1GVUA 4Y4AA 4K9HA 2J9KA 1FFIC 3EL9A 3RVIA 1ZSRA 4UPJA 3AIDA 3EKYA 5P6KA 4Q1XA 5P73A 4DV9A 3TTPA 2VIJA 5ISKA 2HPFA 2RENA 5P8UA 2Z4OA 4EPJA 5P2EA 1M0BA 4RLDA 5P6CA 1B11A 2FNSA 2OHKA 1LYAB 5P2DA 7HVPA 5P2WA 5P5SA 3MXDA 4I0JA 4I0IA 4APRE 2G1SA 3R0WA 4AZYA 3ZKIA 2ZDZA 4B0QA 5P8DA 4RGHA 5SY3A 5OZ3A 5HVPA 5P1BA 2EWYA 5P1DA 2AZ9A 1HEFE 4GMIA 1MUIA 4OD9A 5P8EA 5I3YA 2G1NA 2QD8A 1HTEA 1W5WA 5P7ZA 5P5YA 3UDJA 5P7SA 2RMPA 4RCEA 5OZ7A 4CP7A 5P6VA 5OZIA 3OXVA 5P5OA 4Y4GA 2QZKA 4RCDA 2WEDA 1BVGA 5P5NA 1KJFA 3HVPA 3BVBA 5P4UA 5OZ8A 2PC0A 4A6CA 5C9FA 4Q1WA 3UTLA 2ZHUA 4R8YA 2G22A 3KDDA 5OZUA 1D4LA 2CENA 3BXSA 1SGUA 3TOFA 4FSEA 5P72A 4ZLSA 4ACXA 1NSOA 3T7QA 3VYFA 3OOZA 4COEA 4GIDA 4OBGA 5P7KA 5P4LA 4J1HA 2AOGA 2HS2A 4Y45A 5P8KA 4OBDA 3TPLA 5P8FA 3EC0A 3VF3A 1MTBA 3EL1A 4LAPA 4NJUA 3O9GA 5P1FA 1W51A 1B5FA 2F81A 2WF1A 3QPJA 1EEDP 2ZHVA 9HVPA 3PMUA 2ZJJA 3BGCA 1K6VA 3D1YA 5P8GA 3INDA 3UPJA 1HOSA 3D91A 2QI3A 5P5MA 4QJ7A 2QI5A 2V13A 5P19A 4FM6A 1EC1A 3RTMA 2QZXA 3VEUA 1HWRA 4ZIPA 5P3XA 4FRJA 3NLSA 4GJ6A 4PZWA 3NR6A 1Z8CA 2QI1A 4GB2A 1MT8A 3M9FA 3U7SA 7UPJA 5JFPA 4U8WA 1APTE 5P64A 4CMSA 5P8SA 5P6LA 3IN4A 3VSWA 3TNEA 3MXEA 5P3HA 1HBVA 3B80A 3NU5A 4RRSA 2FNTA 1KJ7A 1SBGA 4L7HA 3OHFA 1D4HA 1OHRA 1YTHA 4ZSQA 1IDAA 2ANLA 5P41A 3IXJA 2JE4A 3NU3A 2BPZA 5HE4A 1QBUA 3S7LA 1DMPA 1KJGA 1LV1A 1TSUA 3UQXA 5P06A 4RCFA 3Q4BA 5HDVA 5P82A 4CPUA 5DGUA 4I12A 4RYGA 5P2UA 5C9BA 5OZWA 5P2KA 4YD6A 2ZJMA 5DGWA 5COOA 2ZJLA 5ER1E 1ODYA 3OWNA 5OZCA 2AOFA 3UDMA 1EPPE 5P0SA 5P2OA 4F74A 5I3XA 1A94A 1OEXA 3KMXA 3WZ7A 2XYFA 1HTFA 3N4LA 3VYEA 3O9HA 5KOQA 2I1AA 1ENTE 3HW1A 4Y50A 5P6HA 5P3AA 2VA6A 3ST5A 2OHPA 4ER4E 4BELA 5P4NA 5P51A 3PCZA 4YOAA 3KM4A 5TOLA 4D89A 4EXGA 2V11C 5P0ZA 1HPXA 4Y3HA 5OZ4A 2I0AA 1PSOE 1ZBGA 3UQPA 3FKTA 3EL5A 4ZPGA 1HVSA 3GI6A 3SABA 1E82E 5OZFA 5P3BA 2AVOA 1FQ7A 1GVTA 4FCOA 4EP3A 2XFIA 2QMDA 3Q6YA 5P5LA 5P1XA 1YTIA 5P0BA 4PZXA 4Y51A 1A30A 5P52A 3PLLA 1LS5A 5HTZA 1K6TA 1ODXA 3PRSA 4YA8A 1EAGA 3IA9A 5P1RA 1GNMA 2Q15A 3KFSA 3URIA 3HAUA 4AUCA 1UPJA 1ER8E 3TOHA 5P1AA 3UDQA 4EHCA 3S54A 1HPVA 3UQWA 5P67A 3G70A 2QNNA 4I1CA 1N49A 3C9XA 5P81A 1FF0C 5OZAA 5P5FA 1DW6C 3EXOA 1LEEA 2G21A 2J9JB 3K5GA 4Q1YA 2FLEA 4J17A 3OQAA 3QS1A 5P5BA 3L5BA 1SDUA 1GNNA 3KFRA 3HDKA 2B8LA 3KT5A 2BBBA 1BIMA 5P4VA 5P6JA 4YD5A 5C9DA 2NTRA 5P27A 4FIVA 2AQUA 5P6AA 1AVFA 3O9EA 3BC4A 5BWYA 3NSHA 4QLHA 3GW5A 1GNOA 5P5AA 3I8WA 5P70A 5P0LA 3KN0A 1M43A 3O9LB 5P1KA 4ZSRA 4R95A 4Y4ZA 3VF5A 5AH8A 5OYZA 3EKPA 5P1ZA 5P09A 3L58A 5P1GA 5P3FA 5P3OA 5P5UA 3OADB 2V10C 3U6AA 5P86A 3L5DA 4Y5PA 3SM1A 5IVSA 4EYRA 4OC6B 1DAZC 5P5EA 3PGIA 1BDLA 3S43B 3KFPA 3QAAA 5J25A 4IVSA 1BVEA 3A2OA 4MC2A 3ZPTA 3F9QA 5KQZA 5P1UA 1DPJA 4BFBA 3ZKGA 4KUPA 4Y3WA 4DQEA 5P14A 3IXKA 4Y3XA 4Z2ZA 3KDBA 5P76A 4YCYA 2VKMA 5P5HA 2ER0E 2AOCA 3K5DA 5P57A 2P3BA 2IQGA 5P3GA 1QBSA 5P08A 5P8LA 3OQDA 4OBJA 4B1CA 3GI0A 2AZ8A 3UFNA 6FIVA 2PYNA 5P4OA 1ZTZA 3RSXA 5P6MA 4E43A 5ER2E 3WZ6A 5KR0A 5SZ9A 1EPLE 5P3CA 2AVVA 2ZYEA 5DR3A 5P0MA 3R2FA 1MVPA 3EBZA 2PYMA 1BAIA 3I6OA 4EJLA 5OZ5A 1XDHA 2F3EA 5DQ4A 3R0YA 3L5CA 4RRNA 4YD7A 4Y43A 3IVIA 1G6LA 3EKQA 3LNKA 2ZHSA 1EBYA 5P68A 4S1GA 1TW7A 2BB9A 3FNUA 5P1YA 3EL4A 5P6OA 5P8TA 1WKRA 1YTGA 5F00A 3PMYA 5P2JA 1EBKC 4YDFA 1LF2A 5P8BA 3TLHA 5OZOA 5P75A 4DH6A 3OY4A 5OZVA 3CKPA 2NNKA 2WF4A 1Z1HA 1EBWA 3LPIA 1T6GA 5P0FA 1XL2A 4B05A 1HPSA 5P63A 3BUGA 5P8PA 2AODA 4Y5AA 1TCWA 1ZPKA 5P3LA 1BV9A 3APRE 1W50A 1W6IA 2O40A 3BHEA 4B1DA 1EPNE 3WB4A 1HSHA 2QD6A 4EWOA 4ZSPA 2VS2A 1TQFA 2XFKA 4L1AA 1HIVA 3ZL7A 1G2KA 2VA5A 2XYEA 1E81E 5P2XA 4FSLA 1F34A 2CEJA 2I4UA 4HDBA 4L7JA 1HXWA 5P29A 2A4FA 5HD0A 3OUDA 1MRXA 2BQVA 3KFNA 2G27A 3QVCA 3INEA 4FAEA 2NXDA 3OAGA 5P3EA 4Y3GA 4Y3QA 1BWBA 1MIQA 5P6NA 5P5GA 5COPA 5HDZA 2G1RA 5P8QA 4X7IA 3ZKSA 3VUCA 4MC9A 3PBDA 5P50A 5OYWA 5P6RA 1HXBA 3UDHA 4TRYA 2ASIA 5P1EA 3VG1A 1SMRA 2ZJNA 4JPCA 4EQJA 4BFDA 3D20A 4Y4DA 1RL8A 2PWRA 2ER9E 1ZLFA 1C6ZA 4CPQA 1ZAPA 1PFZA 2G69A 1HIHA 5HU1A 4EQ0A 3LPKA 5P7MA 3BUFA 5OZLA 2BKTA 3O9IA 2AOHA 5P43A 5P31A 4Y3MA 4FRKA 4HDPA 2VIEA 3NXEA 2G26A 5P2MA 3O99A 3LIVA 4DJVA 4FLGA 3Q70A 4J1IA 4HDFA 1J71A 1IVPA 4YD4A 3SM2A 3PVKA 2QZWA 1FQXA 2OHNA 5KR8A 4B78A 5OZJA 5P12A 3U71A 1HEGE 5IVRA 2ZGAA 3FNSA 3O9BA 4FE6A 2G94A 4DQBA 1CZIE 3OU1B 4HZTA 3H5BA 3JW2A 5P3ZA 2PH8A 2QMGA 4FL8A 5P77A 1FQ5A 5P6ZA 5DR7A 4HVPA 4EJ8A 5OZBA 3VF7A 4X2LA 5P58A 2AZCA 3DUYA 2I4QA 3INFA 4YDGA 5HU0A 4RYCA 4Y4UA 1Z1RA 3UFLA 5P65A 3T7PA 1TCXA 1BBSA 5P8CA 4OBKA 3ZLQA 3NU6A 5AGZA 3SA9A 5OYYA 5P3RA 3I25A 3OU4B 4NJSA 1NPVA 3I2LA 1G35A 2VNMA 5P4MA 5P7BA 5P5XA 4EJKA 4Q1NA 3QI1A 4B70A 4DJQA 1FMXA 3BUHA 1LYWB 3WSJA 3SA6A 1E80E 3ECGA 1PROA 4NKKA 1LYAA 2HPEA 5P74A 1FGCC 5P7GA 4Y47A 5P7OA 3BGBA 5P7FA 5P3YA 4Y3SA 1E5OE 3KA2A 1ZP8A 1EPRE 5P5ZA 5P00A 3L3AA 4J0ZA 3R4BA 2ZJHA 2FDDA 3RTNA 5JODA 3OGQA 1YG9A 2P3DA 2VJ7A 5P1VA 1AJXA 5P1TA 1U8GA 1EC0A 3O9AA 4Y3FA 5P2BA 5P5VA 1A8GA 3OQFA 4XX3A 2P3CA 2PK6A 4Y6MA 5P47A 5CLMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QI7 A;  5P15 A;  4Y3E A;  2AVQ A;  4R91 A;  3EM4 A;  5EZZ A;  2Q63 A;  1XE5 A;  2QNP A;  1W5Y A;  3UQU A;  2FIV A;  5P33 A;  4MC1 A;  5P2L A;  4LP9 A;  3URL A;  5I3V A;  1IDB A;  5P28 A;  5OZP A;  2AVM A;  2F3K A;  5P3U A;  5P1J A;  2Q5K A;  2V16 C;  2AID A;  1LF4 A;  2IEN A;  2Q55 A;  2BKS A;  3LHG A;  5P18 A;  1G0V A;  4Y5N A;  5P3N A;  5P61 A;  2UY0 A;  5P4A A;  3RTH A;  4HEG A;  1BXQ A;  3VFB A;  5P46 A;  4GZF A;  3OK9 A;  3TOG A;  3DJK A;  2QI4 A;  2O4S A;  3EKT A;  2OHL A;  4I10 A;  4U7Q A;  1PPM E;  2V12 C;  3GGU A;  4WY6 A;  1PSN A;  3DOX A;  2NMY A;  4NJV A;  3PB5 A;  5P1O A;  2R8N A;  1FLH A;  3PEP A;  5P4B A;  3EKW A;  1D4J A;  5P0P A;  4CPW A;  3FV3 A;  4DPI A;  5P7A A;  4I0F A;  5OZ0 A;  5P0I A;  1HTG A;  3TL9 A;  5P6W A;  4PHV A;  2VIZ A;  3L5E A;  1NPW A;  4I11 A;  5OYX A;  2BPV A;  5AH7 A;  1W6H A;  1B6L A;  5P4F A;  5P5T A;  1CMS A;  3QRV A;  2IKU A;  2SAM A;  3L38 A;  2F80 A;  5P4E A;  4DJW A;  5OZH A;  5DQC A;  4ER1 E;  1IIQ A;  5OZE A;  5P4C A;  4KE1 A;  3MSK A;  2JYS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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