3ER5E

The active site of aspartic proteinases
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title X-ray-crystallographic studies of complexes of pepstatin A and a statine-containing human renin inhibitor with endothiapepsin.
pubmed rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 78
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1991-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3er5E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3er5E01
4FAFA 1KJ7A 1IBQA 2Q11A 5P3OA 5P47A 2QZLA 1HOSA 1HSGA 2CEJA 2R5QA 2G20A 1HPSA 3FV3A 3EL5A 5P27A 3SPKA 3EL0A 4DQGA 3OHFA 5P2JA 3TKGA 3NXEA 4GJ6A 4DJPA 3MSKA 4K4RA 3ST5A 2IKOA 2IDWA 2NXLA 5CLMA 5P1QA 1FG8C 4FCOA 2UXZA 3ZL7A 2G21A 1UH7A 3EKQA 5P6SA 5P6RA 5P6OA 3GGXA 4JPCA 4I0HA 4CPUA 5P6CA 5P7YA 2ASIA 5P3GA 1YTGA 1ZAPA 5P40A 3O9FA 1EPLE 5HCOA 1K6TA 4FAEA 4QJ8A 1IVPA 1BDRA 4Y4XA 2JYSA 1Z1RA 4Y3QA 5EZXA 1IZEA 3LHGA 5P1JA 5P4BA 3PWWA 1EBYA 4DQFA 1WKRA 1NPVA 3KDDA 4Y3DA 3RTHA 1ENTE 1K2CA 1VIJA 2VJ9A 4ER4E 5P1PA 5P58A 3I8WA 1WBMA 4Y3HA 3S54A 2O40A 1FMBA 4EJKA 5P5FA 5P84A 5P01A 5E5JA 1BV9A 1BDQA 5C9DA 3TPRA 3Q5HA 2O4LA 4Y53A 4DJWA 5P3NA 2BKTA 1A8KA 5P1LA 5OZYA 4B77A 5P3SA 2QI4A 3LIQA 1EC3A 1APVE 3ZKIA 5KOQA 2XFKA 2RENA 3HDKA 1MT8A 2WHHA 4CKUA 1HXWA 3EL9A 3S8IA 1B5FB 2JXRA 5P1IA 4ZSMA 5P1VA 4K8SA 4KE1A 4QJ2A 1LF2A 1OD1A 2OHNA 5P7SA 5C9FA 2A1EA 2B8VA 4Y4DA 5DQCA 3K5DA 5P5CA 3UFLA 2HPFA 3GGUA 5AGZA 3SQFA 5HE5A 1EC1A 3EKPA 5P26A 4J0PA 1HVHA 3OGPA 1SIVA 3PMUA 1J71A 3ZKMA 5P02A 4H3FA 5C9BA 1MSNA 3OGQA 5OYUA 5P5EA 4Y57A 3DCRA 5P4FA 5OYYA 2PC0A 3TKWA 1FEJC 3I6OA 3BUGA 5P3HA 2PSVA 4YA8A 3PGIA 5P6EA 4N00A 5P6YA 3LPKA 4ZPEA 3F9QA 5P82A 3IA9A 4EJDA 2IS0A 3O9EA 1TSQA 5P8EA 1SIPA 4GJ8A 1MERA 2QHZA 1DPJA 3L5BA 5P1OA 5P0VA 4X2LA 1XL5A 2HIZA 4R8YA 5P2GA 4EYRA 1MEUA 5T4SA 3CICA 5P8KA 3HZCA 2QD7A 5P5GA 1HTFA 5P8QA 5P18A 2Q64A 5P76A 5P41A 4AMTA 1LYWA 4F76A 5P5XA 1RV7A 2V12C 3OUDB 5OZ4A 5HE4A 5P35A 4RYGA 1GNOA 3TPJA 3SABA 3SA4A 3LPIA 4YBFA 3EBZA 4Y50A 4K4QA 1EAGA 2QNNA 5P49A 5P6WA 3UDPA 4L1AB 4DVFA 1KZKA 2QI7A 5OZSA 4TVGA 3TOHA 5P1TA 2WEAA 1HVIA 2WKZA 2FXDA 2G1SA 1ZBGA 2O4KA 3ZKSA 3H0BA 4L7JA 2IGXA 3O9AA 5OZLA 5P4AA 3EL1A 2FIVA 1BIMA 4B00A 4YD3A 5P8VA 3OOZA 1EBZA 4YD5A 3BUFA 3IXOA 3AIDA 2J9JA 2P3AA 3BHEA 4Z2ZA 1T7KA 5HDZA 3I2LA 4E43A 5P28A 5P5HA 4ZPGA 4TRZA 2HC0A 3NUOA 2IRZA 1ODXA 2HB2A 1VIKA 5P4KA 3UCBA 5P00A 5HCTA 1FQXA 5P7DA 1GVXA 3BVAA 7UPJA 5P2UA 5P8OA 3PEPA 3ZOVA 2OAHA 4DPIA 1EPRE 3ZPTA 4HVPA 5OZXA 1FQ8A 1IDAA 4EQ0A 3O9DA 5JFPA 4H1EA 1HTGA 2QK5A 2EWYA 2XFIA 4J17A 2J9KA 1K6VA 2Q55A 1ZP8A 5P0KA 5TOLA 4Y5BA 5KQFA 1HTRB 5P7BA 1APUE 5P30A 2BBBA 3GGAA 3D1ZA 4PEPA 2R9BA 3HBOA 5P36A 5P52A 4NPUA 4R93A 5P2WA 5P5LA 3UQPA 2R43A 2PSUA 4RROA 3PLLA 1BXOA 1T6GA 4CPWA 4YDGA 2WF3A 2NXMA 1Q9PA 4LP9A 5P4NA 1CZIE 1PFZA 2I0AA 4FL8A 4I8ZA 5P83A 3HD8A 3EKXA 4I0GA 5AH9A 1CMSA 1NH0A 1A8GA 4HZTA 3OU3A 4D8CA 5P5YA 2QZXA 5DPZA 3UDJA 2FNSA 3O9LB 4I0EA 4I0IA 5P1HA 5P4MA 5P8PA 3ER3E 3QVCA 3S45A 3BXRA 3OY4A 5P6TA 3DUYA 4Y4UA 4I0JA 1BVGA 1W5YA 5P39A 4NJTA 1BV7A 3QBFA 2I4VA 1FKNA 4Y4WA 2PSGA 3N3IA 5P6LA 5KR8A 4H3IA 2F3EA 1T6EX 4GB2A 1AAQA 4Y5KA 3PSGA 1EPME 5P4HA 5P8RA 4MC6A 2AVVA 4Y3XA 5COPA 1F34A 1HRNA 2F80A 4Y47A 3TPPA 1SGUA 3OUDA 4L6BA 5I3YA 2ER7E 5P61A 5OZIA 5HDVA 3CMSA 2PQZA 5P66A 4CPQA 3BXSA 5P6NA 2UY0A 4Y3SA 4DV9A 4QLHA 4Q1XA 5P2XA 5P63A 5P87A 4DI2A 3OQAA 5P3WA 2VA6A 1MSMA 4L7HA 3DK1A 4FGXA 2RMPA 5OZHA 5OZUA 3KYRA 5P44A 2P3DA 2R5PA 5P5ZA 5HTZA 5KOSA 1LYBA 3DM6A 2ER9E 2V13A 1SP5A 1EC0A 3OADB 3QP0A 1HTEA 5P1CA 5OZ0A 3PB5A 3OXWA 3G72A 4Q1WA 4A4QA 3O9CA 1SDVA 3TPLA 4Y37A 4Y3GA 3ZLQA 4FLGA 4EQJA 2APRA 5P3LA 1PPKE 3QRVA 3L3AA 5P0MA 2AVQA 4Y41A 4Y43A 4MC9A 5P65A 2B60A 2AOEA 4D88A 4GJDA 3JVYA 5JODA 3T11A 5OZTA 5ISKA 4YCKA 2PWCA 3UPJA 5P4UA 2NXDA 2Q5KA 1TQFA 2Q15A 5P48A 3CKRA 4J54A 1HBVA 4NKKA 4RYCA 3CIDA 1XL2A 4U7VA 5P0PA 3ZKXA 5KR1A 3N4LA 3OQFA 1YT9A 2FGVA 4LXKA 1AXAA 2FGUA 1W5WA 3VLAA 5P74A 4LXAA 1IDBA 3TNEA 2I0DA 1GVWA 4B1CA 5DR3A 3UFNA 3VFAA 1HSHA 5P8AA 3DCKA 5P4DA 5HDXA 2NNPA 4AA9A 5P6IA 4Y3EA 4Y45A 2BPYA 5DQ2A 5SXNA 5P37A 4DQEA 5J25A 4GJAA 1HPVA 4CPXA 3OXVA 1SH9A 2PK6A 3UQWA 5P08A 5P3QA 5P1SA 2IQGA 4Y48A 1FMUA 1G35A 3DJKA 4M8YA 5P60A 3SACA 5OYTA 1M0BA 4GZFA 5OYZA 5P7JA 3OQDA 4OBZB 5DR8A 3URJA 3TH9A 4QGIA 4RCEA 2BPWA 1META 5PEPA 4Y4JA 3NU5A 1D4HA 2JE4A 3OAGA 2AVMA 1MIQA 1B6JA 4F74A 2HPEA 4I12A 4Y44A 1D4YA 1RQ9A 2Q3KA 4MC1A 1PSNA 5JG1A 1TSUA 2QAKA 2ZJLA 3WZ6A 4EP3A 3PSUA 5P2MA 3NU3A 1U8GA 2A4FA 1G0VA 5P7OA 3NU6A 3UQXA 1C6XA 1IZDA 1HHPA 3PBZA 1BWBA 4Y3MA 4CPTA 1HVKA 4FRSA 1KJHA 5P14A 3IN4A 5KQZA 3UDRA 1YTJA 1ZPKA 4RCFA 4EJ8A 3FSMA 5P7GA 5SZ9A 4Y4EA 4DJOA 1Z1HA 2QMGA 5P80A 4D89A 5P62A 1C6ZA 5I3XA 1KJGA 5HDUA 2OHMA 4Z4XA 5P57A 4ZPFA 2AOHA 1G6LA 1LS5A 3S2OA 5P8UA 5OYRA 4RGHA 2HAHA 5P8LA 3UDQA 4FRIA 3LITA 2V0ZC 5KR0A 5DR4A 3LPJA 5OZOA 1Z8CA 3VF3A 1PPLE 1APWE 2G26A 4IVSA 4GJ5A 5P2NA 1AM5A 3R0YA 1BDLA 3JW2A 4EXHA 3AUPA 2ZJHA 4D85A 3VYEA 1E80E 2V16C 4LL3A 3O99A 4OC6B 5P2BA 4ACUA 5P55A 3UDHA 1LYAA 3LIXA 4K4PA 4B72A 4YOAA 4TVHA 3OU4B 4YD6A 5P1MA 3FKTA 3OXCA 4J1HA 5P5PA 1FMXA 5KQYA 5IVRA 3SA8A 3PM4A 5P8IA 2H6TA 4ZEAA 3RSVA 5P4JA 3I7EA 1ODWA 4CPSA 5P1WA 3ECGA 4Y54A 4GJ7A 3PCZA 4EWOA 5I3VA 5P13A 3PSYA 5UPJA 1B11A 5P5AA 1KJ4A 2ZHVA 5E5KA 4I0FA 4XXSA 3L5EA 5P0SA 3KA2A 5P03A 3KFRA 2B42A 5P7CA 2PMAA 2WL0A 3O9GA 3KDCA 3I25A 5P6HA 2QI3A 2IL2A 2G24A 4RVIA 5P33A 1QRPE 3PWRA 4B0QA 5P71A 2XYEA 1HVCA 2AOCA 2P4JA 4I1CA 4DQCA 4QJ6A 3Q70A 4Y58A 2AZ8A 4OBJA 4DJYA 3IGBA 3IN3A 5P0DA 3S7LA 4ZSRA 4GJ9A 5P7EA 4RCDA 1T7IA 2QCIA 2VNMA 1QBTA 1W5VA 2FDPA 4ZE6A 2QZKA 4YOBA 3QROA 4OBHA 2ER6E 3R1GB 5P7LA 5SY2A 3UTLA 4OBZA 5P45A 5P89A 5P0FA 5HE7A 2QI5A 1HVRA 1JLDA 2ZJKA 1BXQA 3MSLA 5P3UA 5P04A 5P79A 3EM6A 4Y56A 3OTYA 5P54A 1B6LA 1DMPA 1FFFC 4YD4A 3SKGA 5APRE 5P4WA 5OZCA 2UPJA 2AZ9A 2OHLA 5P86A 5FIVA 1ZJ7A 1FFIC 3PI0A 1DP5A 3PVKA 5P6VA 5P56A 4DJVA 5OZRA 4EXGA 5P75A 2ER0E 1PROA 5AH7A 3NYGA 2AODA 5P7PA 5ENKA 4LHHA 5OZDA 3ZKNA 3OU1B 5HD0A 5P3KA 4H3GA 1QBSA 2B8LA 5P67A 3QRSA 3VF7A 2QMPA 2R3WA 1PSOE 2Z4OA 3LINA 2R38A 3IVHA 1TCWA 1A30A 5P3BA 3KFPA 4DUSA 4RLDA 4KUPA 4Z50A 4TRWA 5P4VA 5P0QA 1RPIA 3O9IA 2WEZA 5P7UA 4HE9A 5P2ZA 2NTRA 1SGZA 1EPOE 4DJUA 4Y5EA 5OZQA 5AHCA 4Y3JA 5OZFA 5P2KA 5P38A 3T7XA 2P8HA 1K6CA 2PYNA 5P0AA 5P4IA 3NWXA 1C6YA 5IVQA 1EPQE 3GI0A 2G1RA 1QS8A 3TOFA 2VJ6A 1OEXA 3NUJA 4NJVA 3FNTA 4CMSA 4U7QA 5COOA 1AZ5A 1HWRA 3KFSA 4KB9A 5P15A 4I0ZA 4MC2A 5P10A 2VIYA 5P5JA 1LZQA 1B5FA 2FS4A 5P6DA 3HLOA 5P4LA 2NMZA 3QN8A 5P8MA 4Y5CA 5DR7A 3OU4A 3KM4A 4Y3TA 3LNKA 2I4DA 3S43B 4M8XA 4I10A 4J0VA 2AQUA 4K9HA 5P0OA 5P1DA 5P7RA 3WZ7A 1FQ6A 3JVWA 3IAWA 1ZTZA 4GYEA 3L38A 3CKPA 2QNQA 2FDEA 3Q4BA 5AHAA 4YHQA 3SAAA 1MVPA 3OQKA 5P3VA 1M4HA 1D4IA 3NDTA 4FSLA 2IGYA 3L59A 4AA8A 5EZZA 1E5OE 4FSEA 4IVTA 1ME6A 1M43A 1PSAA 5P1ZA 2BPXA 1K1UA 1DAZC 5P88A 5P6MA 3D91A 3SKFA 4Y3WA 5P8TA 5P6QA 3PCWA 5P6AA 3UF3A 1C70A 5P8HA 3D1XA 5P4EA 2QI0A 4RRNA 5P1EA 1EBWA 4Y5GA 3TTPA 1FQ5A 1GVTA 2BQVA 3CYXA 1FQ4A 5ER1E 3OTSA 5P1YA 3SFCA 2B7FA 5P0JA 3LIYA 5P19A 4DJXA 1QBRA 5P7FA 6UPJA 5BS4A 5I70A 3HAWA 5P50A 4ER1E 3PMYA 5P0XA 5P1FA 5P2OA 2CENA 3PBDA 3URIA 4LBTA 1FF0C 1AIDA 3EM4A 3U71A 4L1AA 5P0TA 5AH8A 3FIVA 5P5RA 5P7WA 3BUHA 5P69A 3WB4A 5DR0A 4BELA 3QIHA 1XE5A 2VKMA 4FM7A 5P8GA 1XDHA 4RRSA 5P0GA 4ZIPA 3QPJA 2ZJNA 2OHQA 4Y3RA 3KN0A 2HM1A 2RSPA 5P3AA 2G22A 2AOGA 4BFDA 2WECA 1IZIA 3VFBA 5P0HA 3CKTA 3NR6A 1QDMA 1LV1A 3PLDA 5P7IA 1HVSA 3APPA 5P3DA 3UDMA 4DJRA 5P6ZA 4PZWA 2ZHUA 5OZMA 4EHCA 4J5JA 3OUBA 3PHVA 5OZPA 5OZ8A 1HPOA 4QJAA 4EJLA 3D3TA 1HIVA 4OBDA 2BB9A 3QAAA 2WEBA 3BGCA 3RTMA 5OYSA 1AVFA 2OHKA 1A94A 3NWQA 3VF5A 5OZBA 5P2AA 3HAUA 2P3CA 2G1NA 2P3BB 5P85A 3L5DA 2PH8A 5P1GA 1D4SA 5P8BA 4L7GA 3KDBA 5KR2A 1PPME 3M9FA 4PYVA 5P5BA 5P05A 4HLAA 1HSIA 3OWNA 3OUCA 3NU9A 1KJFA 5OYWA 3EKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FAF A;  1KJ7 A;  1IBQ A;  2Q11 A;  5P3O A;  5P47 A;  2QZL A;  1HOS A;  1HSG A;  2CEJ A;  2R5Q A;  2G20 A;  1HPS A;  3FV3 A;  3EL5 A;  5P27 A;  3SPK A;  3EL0 A;  4DQG A;  3OHF A;  5P2J A;  3TKG A;  3NXE A;  4GJ6 A;  4DJP A;  3MSK A;  4K4R A;  3ST5 A;  2IKO A;  2IDW A;  2NXL A;  5CLM A;  5P1Q A;  1FG8 C;  4FCO A;  2UXZ A;  3ZL7 A;  2G21 A;  1UH7 A;  3EKQ A;  5P6S A;  5P6R A;  5P6O A;  3GGX A;  4JPC A;  4I0H A;  4CPU A;  5P6C A;  5P7Y A;  2ASI A;  5P3G A;  1YTG A;  1ZAP A;  5P40 A;  3O9F A;  1EPL E;  5HCO A;  1K6T A;  4FAE A;  4QJ8 A;  1IVP A;  1BDR A;  4Y4X A;  2JYS A;  1Z1R A;  4Y3Q A;  5EZX A;  1IZE A;  3LHG A;  5P1J A;  5P4B A;  3PWW A;  1EBY A;  4DQF A;  1WKR A;  1NPV A;  3KDD A;  4Y3D A;  3RTH A;  1ENT E;  1K2C A;  1VIJ A;  2VJ9 A;  4ER4 E;  5P1P A;  5P58 A;  3I8W A;  1WBM A;  4Y3H A;  3S54 A;  2O40 A;  1FMB A;  4EJK A;  5P5F A;  5P84 A;  5P01 A;  5E5J A;  1BV9 A;  1BDQ A;  5C9D A;  3TPR A;  3Q5H A;  2O4L A;  4Y53 A;  4DJW A;  5P3N A;  2BKT A;  1A8K A;  5P1L A;  5OZY A;  4B77 A;  5P3S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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