3FNUA

Crystal structure of kni-10006 bound histo-aspartic protease (hap) from plasmodium falciparum
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
EFDNVELKDLANVLSFGEAKLGDNGQKFNFLFHTASSNVWVPSIKCTSESCESKNHYDSSKSKTYEKDDTPVKLTSKAGTISGIFSKDLVTIGKLSVPYKFIEMTEIVGFEPFYSESDVDGVFGLGWKDLSIGSIDPYIVELKTQNKIEQAVYSIYLPPENKNKGYLTIGGIEERFFDGPLNYEKLNHDLMWQVDLDVHFGNVSSKKANVILDSATSVITVPTEFFNQFVESASVFKVPFLSLYVTTCGNTKLPTLEYRSPNKVYTLEPKQYLEPLENIFSALCMLNIVPIDLEKNTFVLGDPFMRKYFTVYDYDNHTVGFALAKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords HAP protein
publication title Crystal structures of the histo-aspartic protease (HAP) from Plasmodium falciparum.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 79
structure length 326
sequence length 326
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3fnuA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3fnuA01
2PK5A 3OHFA 3VFBA 2ASIA 5P79A 1AJXA 2IENA 2AZ8A 2VIEA 4RGHA 4DQCA 2O40A 5OZHA 3PEPA 3PVKA 3BC4A 5OZMA 5JODA 3ECGA 4Y47A 5P1PA 1GNNA 2QZKA 4BEKA 2ZHRA 5DR1A 1PFZA 3T7XA 2Q63A 4MC9A 4Y3SA 1K1TA 5P2UA 4Y3EA 5P6JA 3S53A 4EQJA 2RKFA 1LS5A 2NNKA 5P65A 4DUSA 5P6HA 3PMUA 4U8WA 4NJUA 4A4QA 5P6SA 1K6VA 4Q5MA 2B7FA 3KFRA 5P7VA 5OZ4A 5P4FA 1LV1A 3C9XA 3PLDA 5P0NA 3GGAA 4IVSA 5P00A 5P1YA 5HE7A 1SIPA 2PH8A 5P1JA 2OAHA 5P8NA 1KJ4A 5OZ9A 4ER1E 4D8CA 1ZSRA 2XFKA 5P2NA 4R91A 3OHHA 2PYMA 1EBWA 5P4OA 1FEJC 5DR0A 3DCKA 2UY0A 3KFPA 5APRE 5P71A 4HVPA 2CEJA 3ZKNA 4Q1XA 2FNTA 4PZWA 4Y4DA 3SKFA 2IRZA 1T6GA 4M8YA 5P34A 3CYWA 4I10A 1MTBA 1PSAA 5P3HA 4YD5A 3LITA 2QU2A 5P7SA 3T3CA 5P2TA 3BXSA 1EPOE 1G2KA 1B6KA 3UQPA 5P07A 3TKWA 4EWOA 4K8SA 5P4UA 5P12A 5P8DA 3S54A 1FF0C 3KFNA 3Q6YA 2NMZA 1FIVA 3VLBA 5OYRA 3OU1A 2IKUA 5P44A 2VS2A 5HDUA 2FMBA 3NDUA 3SA5A 1SMEA 5P58A 5OZLA 1FQXA 5P31A 2IGXA 4CKUA 5F01A 4DVFA 2QNPA 5P3DA 1EPRE 3RSXA 5P42A 2FLEA 1EC2A 4DJXA 3GI6A 5P4DA 3HDKA 4K9HA 1QBSA 2A1EA 1BWBA 5DQ2A 4FRIA 5DGUA 2BPVA 1C6YA 5P7MA 5KOQA 4PEPA 4D89A 2P3AA 1GVXA 2Q15A 3HAWA 3NU4A 3PSYA 4GJ9A 1W6IA 1J71A 4GJ8A 4TVHA 4PHVA 1EC3A 3EC0A 3UCBA 3UDQA 2ER9E 1OD1A 4EJ8A 2QI1A 1MESA 3EL4A 5P4LA 4TVGA 5P2BA 5P4NA 5P66A 1BDQA 5P3OA 5P2HA 1KJGA 3KYRA 2JE4A 2HAHA 5P4GA 5P1RA 4YCTA 3QIHA 2PSGA 1D4HA 2J9JA 4DQBA 1BAIA 1M43A 5P0UA 1C6ZA 1B5FB 3O9BA 1DPJA 4QJ9A 3UDHA 5DGWA 5OZYA 5OZ2A 2WHHA 3OOZA 3L5DA 1QDMA 5COKA 3OU3A 3CYXA 2OHUA 2ZJNA 2QCIA 3SFCA 1IDAA 2ZJHA 2HB2A 5P54A 5P1LA 5KOSA 2A4FA 2JYSA 5P28A 5P5JA 3URLA 5P2ZA 2AODA 4I0GA 4Y4WA 1LYBA 4Q1YA 5P4HA 1FFFC 5P8PA 5CLMA 1NPWA 2AQUA 3Q4BA 3NU9A 4A6CA 4B72A 3QAAA 2WF2A 5KQXA 5P38A 4Y3QA 2WJOA 5P83A 1LYAB 4Y5LA 5HDZA 5P6BA 3CKTA 3CKPA 5P2SA 3QBFA 5P7JA 5P26A 3R1GB 3K4VC 1GVUA 4ZSQA 5P62A 2QU3A 3UQUA 2NR6A 3O9FA 1OHRA 1FGCC 2O4SA 4PPHA 4J0VA 3TL9A 3HW1A 2G26A 3UDNA 5HU0A 3NDTA 1IZIA 2WECA 3OXXA 4I0ZA 3PSUA 4LXKA 2AIDA 4X2LA 5P5VA 1GNMA 3SABA 3OQAA 5P37A 3UF3A 5P7BA 1QBRA 5DQ4A 2QK5A 3HLOA 4FGXA 3NUJA 5P5YA 5P6IA 5P1NA 3HAUA 2UPJA 5TOLA 5OYWA 1M4HA 2QNQA 3NU5A 2WL0A 5P4SA 3KF0A 1HPXA 4Y5EA 2AVSA 1QRPE 3DOXA 3SACA 4DJWA 3SKGA 1BXOA 2IDWA 4R93A 4Y58A 2QZLA 2IKOA 3EKTA 1D4JA 2IQGA 3WZ8A 4Q1WA 5P1WA 5P8JA 3PCZA 4Y3DA 3NWXA 5P0WA 3S45A 3NU6A 4FAFA 1IDBA 4X7IA 3UDRA 4I0IA 3S85A 1IZEA 4Y3YA 5P6KA 3OQKA 3D20A 4Y5PA 2IS0A 1FMUA 2RMPA 5OZAA 3UQRA 4GMIA 4U7QA 2O4LA 3VYFA 5P0GA 4S1GA 5P35A 3CKRA 5P3LA 1W51A 4GJAA 3D1XA 3NYGA 3TOHA 2FIVA 2Q54A 5P68A 3HZCA 3BUHA 5P5LA 4DJYA 4KE1A 5P7XA 3OWNA 5P4TA 4L7HA 3LPKA 1VIJA 3SM2A 3PI5A 2OHKA 2PWCA 3QVCA 5P23A 5P5DA 1YTIA 5P40A 1A9MA 3MSKA 5P7AA 5P18A 4Z22A 3ER5E 3NLSA 1K1UA 2APRA 2QMPA 5P0DA 4QJ6A 3B80A 4APEA 1ZJ7A 5P3KA 4B1EA 1SMRA 1W5XA 2V11C 3O9AA 4ZIPA 4HA5A 3OUCA 1DW6C 5P11A 2WEDA 5OYVA 3OU1B 4EPJA 3ZMGA 2BPXA 4IVTA 3I8WA 5P6PA 4ZPFA 4RVJA 5P5XA 5P0KA 5P2VA 5P7LA 3PB5A 4Y5AA 5P78A 2I4XA 4J54A 2XFIA 2V0ZC 3FNSA 3O9GA 3IN3A 1G0VA 4BELA 4YD6A 2OHMA 4XXSA 3SA6A 4B78A 3SPKA 3SA4A 4Y41A 3H0BA 5OZNA 1B6PA 4Y5KA 4Z2ZA 4FRKA 5P3MA 4Y5NA 3TOGA 2QI6A 4ER2E 5KQZA 1B5FA 4FAEA 5P0YA 3LZVA 1GVTA 5P47A 3AIDA 1HTFA 4Y3TA 1HVKA 5P8KA 5HCTA 5P5IA 4RVXA 5P3YA 1EBZA 1APTE 4FM6A 3FV3A 2G22A 1UH7A 3KT5A 2Z4OA 5P6TA 1EC1A 4YD7A 5P49A 7HVPA 2XYEA 5IVQA 4Q1NA 1MERA 2QP8A 5IVRA 5OZ5A 2FNSA 1A30A 2OHLA 1SBGA 1MUIA 1HVHA 1W5WA 3BXRA 1MRWA 3OOTA 5KQYA 4OBHA 1ZSFA 4AUCA 3INDA 1LYAA 5OYZA 4YBIA 1TZSA 5P1SA 3OXCA 3EKPA 4Y35A 4OBDA 2QD8A 3IXKA 2I0DA 2AOIA 3SA3A 5P8EA 4DQGA 4FRJA 2VIJA 2F3EA 2I4QA 4Y53A 1BV7A 1HTEA 2R9BA 3APPA 5CONA 1ODXA 5P56A 4FE6A 5P8TA 4N00A 5DPZA 2P3DA 4J17A 1NSOA 2G20A 2ER6E 5P82A 4L7JA 4OBKA 2BPYA 1NH0A 3PCWA 5HCOA 5P4RA 3LZYA 1ODWA 4CPXA 1ZPAA 3K5DA 4YCYA 5KAOA 5P5KA 2VKMA 5P52A 3DCRA 1GKTA 1NPVA 5P7YA 2WEZA 1G6LA 4JECA 5P3PA 4PYVA 4J1CA 4Y39A 3KA2A 3GGUA 5P8FA 3QN8A 4RYGA 1APWE 1CZIE 4B70A 5P0XA 4KE0A 3R0YA 2ZHVA 2OHRA 1B6JA 4UPJA 2BPWA 2FDDA 1HRNA 5P1ZA 5P7FA 3TPPA 5OZGA 2V10C 5OZZA 3RTNA 4Y4JA 4QGIA 4L6BA 3FNTA 1NPAA 4Y3GA 3D1YA 5P8SA 5P3BA 2I4UA 1GVVA 3EKWA 1LYWB 5P1XA 5P7WA 5C9DA 1E82E 3OQFA 2V13A 4TRWA 4GJBA 2FGUA 1YM2A 4I0DA 5P7ZA 3OY4A 4M8XA 3U6AA 4A6BA 2O4PA 1SDUA 5OZQA 3UHLA 5P41A 1KJFA 5OYSA 4EXHA 2RKGA 1A8KA 1SGUA 1BBSA 3EM4A 2VA6A 2HPEA 6UPJA 4ZLSA 5P1AA 3KDBA 3ER3E 5P8QA 2I4DA 1FQ6A 5I3XA 2VNNA 1GVWA 5P36A 5P6MA 5P48A 4H3FA 3L5CA 4J55A 3NUOA 2WF0A 5J25A 2G21A 1MT7A 4PZXA 4Y4XA 3EKQA 1OEWA 5P0CA 2BJUA 5OZBA 1RPIA 5P2GA 4DQEA 5P20A 4RVIA 4NJTA 3HD8A 3L38A 4RCDA 5OZ7A 3RTHA 4RLDA 2BQVA 5KQFA 4RYCA 3URJA 4CP7A 4OBGA 2G94A 4CPQA 5P4QA 3R2FA 5P70A 4HDPA 4LBTA 3FX5A 5ENKA 2VNMA 2ZJJA 4LAPA 1W5YA 4I0JA 5OZSA 5P6CA 4XKXA 3IXJA 5P2RA 2B8VA 1M0BA 5P0IA 5P3NA 5OZVA 5P7TA 3PWMA 5P7CA 1YM4A 3EXOA 5B18A 5OZXA 3TNEA 1HHPA 5OZPA 4BFDA 3MSLA 1HVCA 5P3VA 2H6SA 1D4KA 3T6IA 1T7KA 5P0ZA 5DR8A 3ZPSA 3URIA 1K6CA 3EL0A 2QI4A 1EBKC 1META 2G1YA 4COEA 5P3AA 1K2CA 5P5RA 4Y3RA 4HDBA 3PJ6A 4FLGA 5P4VA 5P5EA 3OADB 4FIVA 3S8IA 5P45A 3VG1A 4Y37A 4QJ7A 5P64A 1KJ7A 3TPRA 4J0ZA 4ZSPA 5IVSA 4DJPA 5P1HA 3HBOA 2ZHUA 3ZKGA 5P6UA 1AZ5A 1ZLFA 1BWAA 5P10A 3OUAA 2VA5A 5P88A 1IVQA 4LL3A 4NPUA 5P4KA 3CMSA 2V16C 5P74A 4Y3WA 2WF1A 1FMBA 3OXWA 4GJ6A 1FQ5A 4DFGA 4NJSA 8HVPA 5P53A 4TRYA 1FLHA 2ZGAA 5P4WA 2EWYA 5OYYA 4EQ0A 1SGZA 1SDVA 4LC7A 5P5BA 4RRSA 4MC6A 3MXDA 5P4IA 1HWRA 2AVOA 3ZPTA 3UDMA 1FKNA 2ZHTA 1Q9PA 4JOOA 3DK1A 4Y3PA 1DMPA 1Z1RA 3EBZA 3JVYA 4NKKA 3PSGA 5P67A 1TCXA 1HPVA 3IVIA 1YTJA 5BS4A 2HB4A 5P85A 2PSUA 3M9FA 2P83A 3VEUA 4Y54A 5P2CA 4DJRA 5P8MA 1MVPA 5P15A 3PWWA 4K4PA 2AOCA 1APVE 4RZ1A 2QAKA 2ZJMA 3S2OA 1ME6A 4Y3MA 2HIZA 2PWRA 3QVIA 4R95A 3LIZA 1AXAA 1LYWA 3BVAA 1T7JA 4J0PA 3NR6A 4Y57A 5P5TA 4GJ7A 4F73A 5OZ1A 4I11A 1AAQA 3FSMA 3H5BA 5P6XA 4JPEA 4OC6B 3MXEA 5HVPA 5DR3A 5P69A 3S7LA 4HE9A 4Z4XA 3O9CA 5P2XA 5EZXA 5I3YA 5P0BA 1HVRA 4J1HA 2QI3A 5JG1A 3LZSA 5P60A 5P6OA 1HVIA 4J1FA 1RQ9A 2OHTA 4JPCA 1HXBA 3L3AA 1PPME 5P8RA 1W6HA 2CEMA 3SAAA 2G69A 5HD0A 3A2OA 5P84A 4RRNA 4Y56A 5P6QA 1HVSA 1XE5A 3KN0A 5ER1E 3K5GA 5OZ0A 5COPA 4L7GA 5P89A 4RCFA 3NSHA 3TPJA 1HEGE 3CIDA 2QD6A 3LINA 4B05A 1IZDA 4NJVA 3K5FA 5IE1A 3ZL7A 3D91A 3OXVA 2VJ6A 3LHGA 4FSEA 5P5PA 1IIQA 5KR0A 5AH9A 5P0JA 5P7EA 1MT8A 3O9LB 4EHCA 3GGXA 1FQ4A 3NXNA 5P4PA 3GI5A 4DQFA 1AJVA 7UPJA 1WBKA 1DP5A 4LXMA 2PH6A 4JP9A 1IBQA 3JVWA 2BPZA 2NXMA 5P86A 4F74A 1HTGA 3ZKSA 4OD9B 4Y4TA 3AUPA 4H1EA 3L59A 1MTRA 3NDXA 4DJQA 2HS2A 4J1KA 5C9BA 5P4JA 3QRSA 6FIVA 3BVBA 2AOJA 3L5BA 4U7VA 1BDLA 3CIBA 5P0SA 2FGVA 4OBJA 5SY2A 5P7NA 4Y3LA 3EL1A 3KM4A 5P0FA 3OAGA 1DAZC 1HVJA 1AIDA 3QS1A 3SA7A 5P5ZA 2NTRA 4WY6A 5HU1A 3HVPA 3K4VA 3OADA 2QMGA 1MEUA 5BWYA 5P02A 3SQFA 1KZKA 3S43B 4DJOA 3DJKA 2ZJLA 1UH9A 1BXQA 5P6AA 5P0QA 5P1UA 2P3CA 1B6MA 5P1TA 1XL5A 3QPJA 5P80A 2R8NA 2Q64A 4Y44A 1FFIC 5P32A 1KJHA 5P3EA 5SY3A 2J9KA 2FDPA 1F7AA 5P4AA 4EJKA 4ZSRA 1EAGA 5P7UA 5P8IA 4B00A 5P1BA 1FQ7A 1A8GA 3PMYA 2VIYA 3R0WA 5P1VA 4FRSA 1YT9A 1EPLE 3F9QA 5DQ5A 1TSUA 2AVVA 1HVLA 3OK9A 3OGPA 3QRVA 3ST5A 4RROA 1LEEA 3T7QA 4QJ2A 5P6FA 3VV7A 3WZ6A 2F8GA 4GIDA 2R5PA 2QI0A 4L1AA 4Y36A 4Y3XA 3SA8A 1E80E 5OYQA 2V12C 1HBVA 2PK6A 1D4YA 5P6EA 3QRMA 2HC0A 5P3WA 5P4CA 5OZFA 3PBDA 4Y3ZA 2I0AA 1WBMA 3TOFA 2AOEA 2NXDA 1EPME 3UTLA 4Y50A 5P8LA 4J0TA 5DQ1A 5OYXA 1T6EX 1ENTE 4Y45A 5P14A 3U71A 4Y5MA 3SA9A 1C70A 2B8LA 3BHEA 5P46A 3FIVA 5AH6A 1QS8A 2OHQA 5ER2E 2P3BA 1HIHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PK5 A;  3OHF A;  3VFB A;  2ASI A;  5P79 A;  1AJX A;  2IEN A;  2AZ8 A;  2VIE A;  4RGH A;  4DQC A;  2O40 A;  5OZH A;  3PEP A;  3PVK A;  3BC4 A;  5OZM A;  5JOD A;  3ECG A;  4Y47 A;  5P1P A;  1GNN A;  2QZK A;  4BEK A;  2ZHR A;  5DR1 A;  1PFZ A;  3T7X A;  2Q63 A;  4MC9 A;  4Y3S A;  1K1T A;  5P2U A;  4Y3E A;  5P6J A;  3S53 A;  4EQJ A;  2RKF A;  1LS5 A;  2NNK A;  5P65 A;  4DUS A;  5P6H A;  3PMU A;  4U8W A;  4NJU A;  4A4Q A;  5P6S A;  1K6V A;  4Q5M A;  2B7F A;  3KFR A;  5P7V A;  5OZ4 A;  5P4F A;  1LV1 A;  3C9X A;  3PLD A;  5P0N A;  3GGA A;  4IVS A;  5P00 A;  5P1Y A;  5HE7 A;  1SIP A;  2PH8 A;  5P1J A;  2OAH A;  5P8N A;  1KJ4 A;  5OZ9 A;  4ER1 E;  4D8C A;  1ZSR A;  2XFK A;  5P2N A;  4R91 A;  3OHH A;  2PYM A;  1EBW A;  5P4O A;  1FEJ C;  5DR0 A;  3DCK A;  2UY0 A;  3KFP A;  5APR E;  5P71 A;  4HVP A;  2CEJ A;  3ZKN A;  4Q1X A;  2FNT A;  4PZW A;  4Y4D A;  3SKF A;  2IRZ A;  1T6G A;  4M8Y A;  5P34 A;  3CYW A;  4I10 A;  1MTB A;  1PSA A;  5P3H A;  4YD5 A;  3LIT A;  2QU2 A;  5P7S A;  3T3C A;  5P2T A;  3BXS A;  1EPO E;  1G2K A;  1B6K A;  3UQP A;  5P07 A;  3TKW A;  4EWO A;  4K8S A;  5P4U A;  5P12 A;  5P8D A;  3S54 A;  1FF0 C;  3KFN A;  3Q6Y A;  2NMZ A;  1FIV A;  3VLB A;  5OYR A;  3OU1 A;  2IKU A;  5P44 A;  2VS2 A;  5HDU A;  2FMB A;  3NDU A;  3SA5 A;  1SME A;  5P58 A;  5OZL A;  1FQX A;  5P31 A;  2IGX A;  4CKU A;  5F01 A;  4DVF A;  2QNP A;  5P3D A;  1EPR E;  3RSX A;  5P42 A;  2FLE A;  1EC2 A;  4DJX A;  3GI6 A;  5P4D A;  3HDK A;  4K9H A;  1QBS A;  2A1E A;  1BWB A;  5DQ2 A;  4FRI A;  5DGU A;  2BPV A;  1C6Y A;  5P7M A;  5KOQ A;  4PEP A;  4D89 A;  2P3A A;  1GVX A;  2Q15 A;  3HAW A;  3NU4 A;  3PSY A;  4GJ9 A;  1W6I A;  1J71 A;  4GJ8 A;  4TVH A;  4PHV A;  1EC3 A;  3EC0 A;  3UCB A;  3UDQ A;  2ER9 E;  1OD1 A;  4EJ8 A;  2QI1 A;  1MES A;  3EL4 A;  5P4L A;  4TVG A;  5P2B A;  5P4N A;  5P66 A;  1BDQ A;  5P3O A;  5P2H A;  1KJG A;  3KYR A;  2JE4 A;  2HAH A;  5P4G A;  5P1R A;  4YCT A;  3QIH A;  2PSG A;  1D4H A;  2J9J A;  4DQB A;  1BAI A;  1M43 A;  5P0U A;  1C6Z A;  1B5F B;  3O9B A;  1DPJ A;  4QJ9 A;  3UDH A;  5DGW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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