5ENKA

Compound 18
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
387
structure length
359
Chain Sequence
FVEMVDNLRGKSGQGYYVEMTVGSPPQTLNILVDTGSSNFAVGAAPHPFLHRYYQRQLSSTYRDLRKGVYVPYTQGKWEGELGTDLVSIPHGPNVTVRANIAAITESDKFFINGSNWEGILGLAYAEIARPDDSLEPFFDSLVKQTHVPNLFSLQLCGSVGGSMIIGGIDHSLYTGSLWYTPIRREWYYEVIIVRVEINGQDLKMDCKEYNYDKSIVDSGTTNLRLPKKVFEAAVKSIKAASSTEKFPDGFWLGEQLVCNIFPVISLYLMGEVTNQSFRITILPQQYLRPVDCYKFAISQSSTGTVMGAVIMEGFYVVFDRARKRIGFAVSACHVHDEFRTAAVEGPFVTLDMEDCGYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Beta-secretase 1
publication title Targeting the BACE1 Active Site Flap Leads to a Potent Inhibitor That Elicits Robust Brain A beta Reduction in Rodents.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 90
structure length 359
sequence length 387
ec nomenclature ec 3.4.23.46: Memapsin 2.
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5enkA01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5enkA02
5P56A 5P3FA 5DQ2A 2RSPA 2JYSA 1LF2A 3NDXA 5DR4A 3NWXA 5OZQA 5P7QA 4Y4JA 1QBRA 5DGUA 5P18A 2OHMA 3KFRA 4COEA 3QBHA 5P6MA 4RLDA 3PMYA 1HEGE 2QK5A 4Y6MA 4LHHA 5P5MA 5I3XA 5AHBA 2A4FA 3NU3A 1IIQA 4AA9A 2RENA 3WSJA 5OZPA 5P4JA 3CKPA 5P1FA 5P3PA 4HEGA 1SGZA 2R9BA 3Q70A 5P5FA 1DW6C 5P7IA 4FLGA 4RCFA 2XYEA 3D20A 4DUSA 1QDMA 3OY4A 2B7ZA 3LZYA 1W50A 2IKUA 5P62A 4TRWA 5ER2E 3VF3A 5P5XA 5HE5A 5P2HA 4DI2A 5P16A 1LYBB 2OHSA 5P36A 1LF4A 3CYWA 4J0TA 5P6UA 4TRYA 1T7IA 3MWSA 3QBFA 3L59A 2FIVA 3IAWA 1FQ8A 4Y37A 4QGIA 2F80A 1EPPE 2BPZA 5P5WA 3QPJA 5P0PA 4PEPA 4K4RA 5P47A 2G1NA 3IXOA 1MPPA 5P0HA 4YBFA 4B1CA 5P3UA 1B6PA 3FNUA 5P5UA 3VYDA 4F74A 5P7GA 3LZSA 3RTHA 5P3ZA 5P70A 3S2OA 5C9DA 5P2KA 5P7ZA 2H6SA 4DJOA 5P1LA 4ER1E 4Q1XA 5P3EA 5P1EA 2WEBA 2HS2A 1RQ9A 4FIVA 2FMBA 1ME6A 4Y53A 2I4QA 5P88A 2VIEA 1HVRA 5P0NA 5P1XA 5P67A 2QI6A 2ZHUA 1MUIA 3S43B 5P52A 5P6WA 2WEZA 5OZKA 5P2RA 1LYBA 5P55A 1XL5A 4YE3A 3OUCA 4XKXA 3D1XA 5P64A 5P1OA 1T7JA 5P0XA 4J5JA 5P4HA 3VFAA 2EWYA 2QD8A 3LIZA 4QLHA 5EZXA 5P63A 3G72A 1OEWA 1TCWA 3HDKA 5P2BA 1N49A 2OHLA 5P2NA 2IDWA 4EHCA 3UHLA 3EKQA 5AHCA 1BDRA 3VF5A 2O4SA 3HBOA 1HIHA 3GI0A 3QI1A 1G0VA 4Q1WA 1FFIC 5OZZA 3OXVA 5P0UA 2VIYA 5P32A 1YTHA 5P6EA 5P7AA 2P3BB 3GGUA 1MRXA 1SIVA 5P3MA 2ZJHA 3S43A 2G27A 5P31A 2J9JA 2Z54A 4J17A 4Y3NA 5P5HA 4H3IA 4RGHA 4LC7A 1QRPE 4WY1A 5P8EA 3IA9A 4APRE 4LP9A 4I8WA 3QRVA 4GJCA 1D4KA 1GKTA 2RMPA 1FQ5A 4HZTA 1HSHA 3DOXA 4Y45A 3L5DA 3ZKQA 2VKMA 4J0YA 5HDVA 4BFDA 5P81A 5P7TA 4OD9B 3OQFA 1D4LA 2QI1A 3OOZA 3EM3A 4J0ZA 3KFNA 4OC6B 5JFUA 5P86A 2FNTA 2P3BA 4FM6A 5P34A 5OZ7A 1W5YA 4Y47A 2AVVA 2PK5A 2PH6A 3VV6A 3OTSA 5P1SA 1ZBGA 3SAAA 1OEXA 5IE1A 4PZXA 5ER1E 3O9IA 3DV1A 3ZKGA 4Y3RA 5P8RA 5OYVA 1IZDA 2XYFA 1T3RA 5KR8A 5BWYA 1EPRE 1FIVA 1HVSA 2I0DA 5BS4A 4L1AB 5COKA 3INFA 3DJKA 3EL9A 3OXWA 3PWMA 4J1CA 4I1CA 2VA6A 3K1WA 5P3QA 3KF0A 3O9HA 5ISKA 1IZEA 3ZPTA 4I12A 5IVTA 5P3NA 5P8VA 4LL3A 5DR0A 5KQXA 5P25A 4MC2A 5P0EA 3UDYA 4HA5A 4OD9A 4Y3MA 4TVHA 3SACA 1JLDA 4HDPA 3EMYA 3NUOA 4FAFA 1LF3A 5OZYA 1AXAA 3Q6YA 3MXEA 3OU1B 3UDQA 3LITA 5ISJA 3C9XA 1W6IA 4GJ9A 4B0QA 5P2YA 5IVQA 5P30A 2PSUA 1RL8A 5P0IA 4AA8A 3TPLA 2IS0A 1HSGA 4BELA 3NU6A 2AZ8A 3LIQA 3HAUA 3FSMA 3EKWA 3NU4A 4F73A 4H3GA 1HPVA 3ER3E 1SMRA 5P1BA 5P8NA 3SFCA 1NSOA 1XDHA 5P5RA 5HE7A 3RTMA 5P4VA 5P7JA 3TOHA 4PHVA 1YM2A 3R4BA 3OGQA 5OZBA 2QU2A 2V16C 2ZE1A 2RKFA 2JE4A 3FNTA 5OZHA 1BBSA 5P8JA 3LPJA 5P4GA 5DPZA 2AZ9A 3PCWA 1D4HA 3MSJA 1SP5A 2P3CA 3R1GB 3PLLA 3T3CA 3OU1A 5P7SA 1B6JA 2G20A 4R92A 1XL2A 2CENA 2R5QA 2G24A 2Q63A 4QJAA 4DJWA 5DQ5A 3OQ7A 4H3JA 5P38A 1GNOA 5P46A 3QS1A 4J1FA 3Q3TA 3OU4B 3L5EA 5P6TA 1C6XA 4DQEA 2UY0A 5P6YA 2FGUA 4GJ6A 3ECGA 5P6LA 1UH7A 5P1JA 2OAHA 1SIPA 3FIVA 3OAGB 4L7JA 3L38A 3HVGA 5OZMA 2B42A 5IS4A 3KMYA 5P8OA 5KOSA 2QI7A 2WKZA 4FRKA 5P8PA 2AOEA 5P66A 4DPFA 5P5IA 1SGUA 4EYRA 3VF7A 3FNSA 4AZYA 4AUCA 5HU1A 1FMUA 2ZJKA 5DQ4A 5OZSA 4DJYA 5SZ9A 5P74A 5FIVA 3KDBA 5OZTA 5P6BA 5P1WA 5T4SA 9HVPA 5P2MA 4Z2ZA 2Q11A 4YD7A 2Z4OA 1W51A 4JP9A 1APUE 5P17A 1HRNA 5P1IA 3BVAA 3KFPA 1HTRB 5APRE 4IVSA 1NPAA 5P3BA 5P78A 2FXDA 1GVVA 2SAMA 5P61A 1YT9A 5P8CA 3S54A 3I7EA 2IRZA 4CPWA 3LINA 3NLSA 5P3CA 4GB2A 5JG1A 3QN8A 1RV7A 3QP0A 4NPTA 3K4VA 1MRWA 4RVJA 1FQ7A 1Z8CA 5P11A 1LYWB 3ZL7A 3HAWA 1FQXA 2AOIA 2Q64A 5P2FA 3D1YA 4OBKA 2PC0A 3CICA 2ZYEA 4ACUA 3SA4A 2AIDA 1ZAPA 3Q4BA 3KM4A 2NNKA 5P08A 5P0OA 3LZUA 2PYNA 2AOFA 1APTE 1W6HA 3SKGA 2G1SA 2QHYA 5P8UA 3IN4A 2PQZA 2R8NA 5P4WA 3TLHA 1AZ5A 5P10A 5OZ9A 2AVQA 2QI3A 3VG1A 3QROA 4LXAA 5P0KA 1SBGA 2I4DA 1GNNA 5OYSA 5P2TA 3OQDA 5HTZA 3EKVA 4Y5NA 1ENTE 3D91A 4YD3A 2FXEA 5P3TA 4GZFA 2NMZA 5P3JA 5OZXA 2HB4A 1HPXA 5P2AA 4Y58A 4DJXA 4FM8A 3BUHA 3QVIA 3S7LA 5P8AA 3BHEA 5P6SA 2IENA 3INHA 1TW7A 2HPFA 2CEJA 5SY3A 3TOFA 3NXNA 1MTBA 5P23A 5P35A 1EAGA 5P2LA 5P06A 1F7AA 2I1AA 4Q1NA 4EXGA 3VV7A 5P39A 5P7HA 2B8LA 5P0YA 5P87A 5P1HA 1EPNE 3AIDA 4Y3ZA 2QNNA 1SMEA 1ZPKA 3TOGA 3N4LA 2WF1A 5P7WA 1B6KA 7UPJA 5HCOA 5P40A 3NU9A 6UPJA 4Y3QA 3OU3A 2VA5A 3SO9A 3WZ7A 3L58A 4I8ZA 5P15A 5OZAA 2P3AA 3PEPA 2B60A 1EBKC 4FS4A 2ZHRA 5P6PA 4Y54A 2FNSA 4L7GA 1A9MA 3UQRA 3OUDA 1ZSFA 4Y51A 4JPCA 2ZDZA 5P2ZA 5P42A 5P6ZA 3U71A 5P2EA 5P2WA 5P0CA 5P7RA 5DQ1A 3OUAA 4ZEAA 5KAOA 4RYCA 3UDRA 5P83A 3SA3A 3DM6A 1VIJA 1WBMA 2NMYA 1HBVA 4ZPFA 4Y39A 2ER7E 4KUPA 3GI4A 4GJDA 4QJ7A 2R38A 3F9QA 4OBHA 2WEAA 3PSYA 2WHHA 4WTUA 2QP8A 5OZ0A 5OZLA 4DQBA 1EC1A 1HIVA 5P45A 4Y5CA 1AAQA 4DJQA 5P53A 5SXNA 1G6LA 5P0RA 5JODA 1T6GA 4XXSA 3OHFA 3INEA 2F3EA 4A4QA 2HAHA 1BAIA 3CKRA 2B8VA 5P27A 5P5VA 3CYXA 1ZP8A 1XN2A 3VFBA 2O4PA 5P01A 5P0VA 3PSUA 1PROA 4I10A 4FAEA 2V10C 4I0FA 5DQCA 2QHZA 4B78A 3NR6A 5J25A 5P03A 5OYYA 5P5GA 1IZIA 4U8WA 5P7CA 3T7PA 5P4KA 4CPSA 3HW1A 4Z4XA 3QIHA 2PSVA 1BV7A 3OWNA 3UFNA 4Y3PA 1EPOE 4B05A 5P5YA 2BPWA 5P59A 1QBTA 2B7FA 3PWWA 1KJFA 1KJ7A 1MERA 3UTLA 4YA8A 4Y3JA 3TH9A 2AOGA 3EKXA 2F8GA 1LEEA 2MIPA 1ZTZA 5P8FA 5OZNA 3WZ8A 2VJ7A 1ZJ7A 5HU0A 2WEDA 5P5JA 5P76A 4YBIA 1XE6A 1AVFA 1B6MA 1EBWA 4J0VA 1BV9A 4EP2A 3OHHA 3VYFA 4K4QA 2I4WA 4Y3XA 1GNMA 5P77A 3TPRA 4Y41A 2O40A 5P00A 2VJ6A 2ZJJA 4I0HA 3INDA 5P49A 1PPME 3JVWA 5P1RA 2QI0A 3PMUA 3UPJA 3PI5A 5P3OA 1AJVA 1BVEA 3H5BA 5P60A 3BXRA 5P8KA 3GW5A 3ZPSA 5I70A 3B7VA 1DAZC 3DUYA 3NUJA 2ZHTA 1K1UA 4YD4A 1K2BA 4K9HA 3PLDA 2AOCA 3OADB 3K5GA 4RCDA 1A8GA 5P50A 4GMIA 5P7NA 5P4NA 1BWBA 3BC4A 2F3KA 5P5CA 4Z22A 1E82E 1TQFA 4A6BA 5P73A 4Y5LA 5OYRA 4Y3HA 4RRSA 1M43A 1BDLA 1C6YA 2R5PA 5OZFA 1M4HA 1YG9A 1CMSA 5P6CA 4Y5GA 5P09A 2QU3A 1HPOA 4HDBA 3BXSA 2PWCA 2G1YA 4R8YA 1BILA 2XFIA 5P7FA 2I4UA 5P8HA 2ZJIA 1PPLE 1PSAA 4Y5BA 4UPJA 4D89A 3BUFA 3PJ6A 3PHVA 3EM6A 4Y3FA 2FDEA 5P43A 1Z1HA 5P89A 1HVCA 4NKKA 5CONA 5P44A 2AODA 2QD7A 4Y38A 3VCMA 3S45A 2AOHA 4NJUA 3UDMA 4Y5AA 5P5EA 3EM4A 3EL1A 1APVE 5P4DA 5P8TA 3I25A 3OADA 5P4LA 1HIIA 4Y4GA 1D4JA 7HVPA 5P6XA 2FDDA 3I6OA 5OZJA 4B77A 5P33A 4YOAA 3ZKSA 5P7UA 3KN0A 1EC3A 1OD1A 3R2FA 3KFSA 1BVGA 2WF4A 2R43A 3KMXA 3B80A 1GVTA 4OC6A 3WB4A 5P4RA 1TSQA 2ANLA 5OZ8A 3KYRA 3ZOVA 1RPIA 4RYGA 4Y4XA 1D4SA 4Y3WA 5P0MA 4FRJA 2UPJA 3O9EA 1YM4A 5P2VA 4RZ1A 3O9LB 1ER8E 5OZWA 5P4IA 1PSOE 1XS7D 4Y4WA 2FS4A 4L1AA 4D8CA 4F75A 5P24A 1FMXA 5KQYA 5OZEA 4B1EA 3VUCA 3SA8A 4D88A 3APPA 1EC0A 5P14A 4QJ8A 2V12C 4Y3TA 2VIZA 5P6KA 1OHRA 4Y3DA 2G94A 1IDAA 5P41A 3S53A 1Q9PA 5OZCA 2P3DA 5P8SA 2VJ9A 4Y4AA 3TKWA 4Y3GA 4OBGA 5P8IA 5I3VA 2IEOA 3GGVA 4Y4EA 5P48A 4EJLA 4PPHA 5P4OA 2PYMA 5P1YA 4Y4BA 2F3FA 3ZMGA 4U7VA 5P7BA 1HTFA 5P8LA 3O9LA 3LPIA 4YD6A 3PCZA 3GI5A 3JVYA 4DPIA 4KE1A 6APRE 1D4YA 3WB5A 1DPJA 3N3IA 5OYZA 1K6TA 3EBZA 5P2QA 5P1UA 1LYAB 5COPA 1XE5A 4HDFA 4CPTA 2BQVA 2IL2A 5P3LA 5P6RA 5P4EA 5P6QA 3KT2A 1MT7A 3EKPA 1VIKA 4Y50A 3UCBA 4R91A 2QNQA 2G1RA 5P71A 2G22A 3SA7A 2QMDA 2QHCA 2ZGAA 5AH8A 5AH6A 2RKGA 5OZ5A 5P6AA 5HCTA 3HZCA 2NTRA 3RSXA 5P5DA 4Y43A 3OU4A 4RCEA 3KDCA 4FL8A 3UFLA 5P84A 2JJIA 1C6ZA 2QI5A 5P0BA 2F81A 3OAGA 4DJUA 2FLEA 1IVPA 4ZLSA 2ZHSA 1J71A 2G69A 5P5TA 1TZSA 4L6BA 2HM1A 4JOOA 2WF3A 3DCRA 1LZQA 1EC2A 2JXRA 4LXKA 2G21A 5UPJA 1FG6C 3VV8A 3IVIA 1BDQA 2WL0A 4AMTA 5HDUA 1LS5A 5P29A 2O4LA 5E5JA 5OYTA 4J54A 3LIXA 2IGXA 4FCOA 1FF0C 3UDNA 4I0IA 3CKTA 3O9CA 1BWAA 5P57A 5P0SA 4X7IA 1F34A 5P5KA 3LHGA 1NPWA 5AGZA 1MTRA 4PYVA 4N00A 2Q3KA 1G35A 1XN3A 1PPKE 5ENMA 2ZHVA 5P7KA 3RVIA 3RU1A 3S85A 1HTEA 1GVWA 5P1MA 1BXOA 2QNPA 1LYWA 3UDPA 5HE4A 4FRIA 4WY6A 4Y3AA 3SM1A 4YHQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P56 A;  5P3F A;  5DQ2 A;  2RSP A;  2JYS A;  1LF2 A;  3NDX A;  5DR4 A;  3NWX A;  5OZQ A;  5P7Q A;  4Y4J A;  1QBR A;  5DGU A;  5P18 A;  2OHM A;  3KFR A;  4COE A;  3QBH A;  5P6M A;  4RLD A;  3PMY A;  1HEG E;  2QK5 A;  4Y6M A;  4LHH A;  5P5M A;  5I3X A;  5AHB A;  2A4F A;  3NU3 A;  1IIQ A;  4AA9 A;  2REN A;  3WSJ A;  5OZP A;  5P4J A;  3CKP A;  5P1F A;  5P3P A;  4HEG A;  1SGZ A;  2R9B A;  3Q70 A;  5P5F A;  1DW6 C;  5P7I A;  4FLG A;  4RCF A;  2XYE A;  3D20 A;  4DUS A;  1QDM A;  3OY4 A;  2B7Z A;  3LZY A;  1W50 A;  2IKU A;  5P62 A;  4TRW A;  5ER2 E;  3VF3 A;  5P5X A;  5HE5 A;  5P2H A;  4DI2 A;  5P16 A;  1LYB B;  2OHS A;  5P36 A;  1LF4 A;  3CYW A;  4J0T A;  5P6U A;  4TRY A;  1T7I A;  3MWS A;  3QBF A;  3L59 A;  2FIV A;  3IAW A;  1FQ8 A;  4Y37 A;  4QGI A;  2F80 A;  1EPP E;  2BPZ A;  5P5W A;  3QPJ A;  5P0P A;  4PEP A;  4K4R A;  5P47 A;  2G1N A;  3IXO A;  1MPP A;  5P0H A;  4YBF A;  4B1C A;  5P3U A;  1B6P A;  3FNU A;  5P5U A;  3VYD A;  4F74 A;  5P7G A;  3LZS A;  3RTH A;  5P3Z A;  5P70 A;  3S2O A;  5C9D A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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