5SXNA

Structure-based design of a new series of n-piperidin-3-ylpyrimidine-5-carboxamides as renin inhibitors
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
339
structure length
336
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSNSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Structure-based design of a new series of N-(piperidin-3-yl)pyrimidine-5-carboxamides as renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 336
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2016-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5sxnA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5sxnA01
1TSUA 5P4IA 5P2DA 1K6TA 5P3NA 1PPLE 4EHCA 5P3CA 2FNTA 4DJXA 3D3TA 5P3GA 3KN0A 4R95A 1BILA 1Z8CA 1EBZA 4GJ5A 1EPOE 3L3AA 3S43A 1TW7A 4I11A 5DR3A 5BS4A 2FGUA 2HM1A 4RYCA 4ZSMA 4DJQA 3O9DA 2OHMA 3MWSA 4D89A 3KT5A 5OZPA 1HTEA 5OZNA 1YT9A 4H3IA 5HU1A 1LF3A 5ER2E 4Y43A 5P8SA 1CPIA 4ACXA 1AXAA 5P77A 4L1AA 2P3CA 4YD6A 4TRYA 5HDVA 3QP0A 4Z2ZA 4DJVA 4NPTA 1SBGA 3VV7A 5P55A 4ER2E 1LYWB 2PMAA 4EXGA 1UH8A 3SAAA 1Z1RA 3C9XA 5P3QA 3LIZA 2A1EA 4I0GA 5OYWA 4Y3QA 5P80A 1VIJA 3OQ7A 1HEGE 5T4SA 5P2TA 2AOEA 2HPEA 2Z4OA 1AZ5A 3QRSA 3EMYA 3INDA 4AZYA 1W6HA 3SO9A 5OZYA 1LYAA 3H0BA 3ZL7A 1XE5A 4YDFA 5P26A 5P3HA 1RQ9A 5P2IA 3KDCA 4OBZB 4NJTA 4CPWA 5P1VA 5P76A 4OBJA 2B60A 5P8KA 5DR8A 1KJGA 4K8SA 5OZGA 1IVQA 4JPCA 4QJ6A 5P5IA 5P35A 5IE1A 1AAQA 5P16A 2G1OA 5P0VA 3KFRA 3UFNA 3ECGA 4GJ9A 5P6MA 4ER4E 4AUCA 5P3XA 3AUPA 2XFIA 2HS1A 3DV1A 2Q55A 5P6FA 1APVE 5AH9A 5P27A 5P1DA 5DQCA 4Y3SA 1FMXA 5P3UA 3O99A 3OY4A 1QDMA 5P7HA 2QI3A 1EC1A 3OAGA 3IAWA 5P0XA 5OZZA 3O9EA 4PPHA 4TVHA 3CKPA 5P30A 2ZJLA 3HD8A 3QIHA 4BFDA 4RVXA 1YTHA 5P6UA 4N00A 3HVPA 3ZPTA 1EPQE 3LPKA 1JLDA 3QI1A 5P1YA 3KT2A 4I10A 5P70A 3BUGA 3BVBA 2H6SA 2WKZA 2QP8A 4DJUA 3CICA 1A30A 3EL1A 3CKRA 5P4MA 5P7WA 2CEJA 2VIZA 5P0QA 2IGXA 5P5FA 5P63A 2ASIA 2FXDA 5P1PA 1MT9A 2VA6A 1MSNA 4Y5LA 3R1GB 5P4QA 5P5KA 5OZUA 5OYSA 5AGZA 3VV8A 4X7IA 4YD5A 1KJFA 4KB9A 5P44A 5P3PA 3O9CA 3SQFA 5P53A 5OZ3A 2I4DA 3LIQA 1YTJA 2OHRA 3PVKA 5P50A 5P4JA 3PWWA 5P37A 1T7KA 4FS4A 4QJ2A 4R5NA 5AH7A 4Q1YA 3ZKIA 4YCTA 5P2GA 3TPPA 4A6BA 4YCKA 3L5EA 3U6AA 3SLZA 2HS2A 4H3JA 1OHRA 5P66A 1ENTE 3L58A 1ZAPA 5OZEA 2QZWA 5P49A 3OQAA 3OK9A 3KMXA 3VV6A 4DPIA 2RENA 5P64A 4QJ8A 3EKWA 2V13A 5P2YA 1D4HA 1FQ4A 3WB4A 4APRE 5P72A 4EJKA 4Y3XA 4Y5KA 5P0IA 5P5LA 5P8EA 3QPJA 1BV7A 1UH7A 3UDPA 5I3XA 2VNNA 4EXHA 2QHCA 3WZ7A 5P11A 2IEOA 1EC2A 2OAHA 4Y5EA 3UQXA 2B8VA 4FGXA 5P5XA 4Y3RA 2WECA 2FLEA 5P5NA 1BXOA 5P3JA 5KR2A 3OHFA 5P2BA 4WY1A 4J0PA 4BELA 5OYZA 2Q15A 4B70A 2CENA 3O9GA 2ZHTA 5P2UA 3TOGA 7HVPA 1GKTA 4Y3TA 5P6NA 5IVRA 5IVQA 3HAWA 1SGZA 4LC7A 5P5EA 5ER1E 5P0AA 3SA7A 5P3OA 1B6PA 4Y57A 3K5FA 2OHNA 3OU3A 4LHHA 3ST5A 3EXOA 4APEA 4CMSA 4Y4BA 2J9JA 4CPQA 4Y54A 1RV7A 4PHVA 2CEMA 1ZSFA 5P6SA 3R4BA 3MXEA 2WHHA 5P7RA 3VLAA 3I6OA 4Y56A 4GJ6A 4CPXA 1M4HA 1E82E 3Q6YA 2WF3A 3S85A 2ZGAA 1GNMA 1SIVA 5P8HA 3UQWA 4FSLA 3PRSA 5P3ZA 2NXMA 1PROA 3DV5A 5P8BA 3GI0A 2NNPA 5HE4A 5OYXA 2FGVA 3MSLA 1HVHA 2O4PA 3IN3A 5P7SA 4J1EA 5F01A 3FNUA 2Q64A 2G1YA 1NPAA 5P03A 3OU1A 5KQZA 2O40A 5P02A 1YG9A 4Y5GA 5HCOA 3VF3A 5P3WA 4K4PA 2B7FA 5AHBA 1QBUA 4U8WA 5P5QA 2XYEA 3HDKA 2QZXA 1EEDP 2H6TA 2VIJA 1QBSA 4I0JA 1YM4A 5P81A 2Q54A 4Y3EA 5P6HA 5P7TA 2BJUA 4QGIA 4Y51A 5DQ5A 3K5CA 5P4YA 5P2MA 5P7JA 5P14A 5P1JA 1D4IA 1MEUA 1W5YA 4EJLA 3GGVA 1YTIA 4Y3FA 1HVJA 5P7UA 5P5YA 2OHSA 5P1AA 5P82A 2WL0A 1ZTZA 4RYGA 5P1LA 5SXNA 2QK5A 3SA8A 3L38A 5P6BA 4ER1E 1PSOE 1TQFA 3OGQA 2JE4A 2I4UA 4Y3YA 1TCWA 3VYDA 4D85A 1TSQA 5P7ZA 2BB9A 1MTRA 4J0TA 5COKA 2WF0A 4J5JA 4Y5PA 4FRKA 4I8WA 2FS4A 3Q5HA 4DI2A 1K2CA 5OZDA 5P3SA 3PEPA 3SA9A 4ZSQA 3OHHA 1FLHA 4FAEA 3SABA 1WBKA 3NLSA 3RVIA 4GJ7A 1HVLA 1LYBB 5C9FA 4DQHA 2P3BA 2NXLA 2I4VA 5P06A 4KUPA 1B6LA 3T7QA 5P60A 2P3AA 4CP7A 1C6YA 5P04A 3KA2A 5P4PA 3L5DA 2QD7A 5P0LA 4B0QA 5SY2A 3NU6A 3N3IA 3M9FA 2ER7E 3EM3A 1LEEA 5P34A 5P1CA 4Y35A 5P84A 2XYFA 4BFBA 3T7XA 1XS7D 3NYGA 1XN3A 2OF0A 5P1RA 2ANLA 2IS0A 4Y36A 3KM4A 5P6AA 3RSVA 2HPFA 5P5CA 2ZJKA 2F3EA 5P2SA 2QCIA 4OD9B 1IVPA 5OZJA 2I0DA 3L59A 3NU5A 1YTGA 3LZYA 4B1DA 2AOIA 1B11A 4WY6A 5P4CA 3LIXA 3OU1B 5KQFA 4J0ZA 1LYWA 3NWQA 1W5WA 4JP9A 1UH9A 1HEFE 4Y3GA 3PMUA 4PYVA 2O4KA 3WZ6A 2R43A 2I4QA 5P45A 1A94A 3DUYA 3VF7A 3IVHA 3K4VC 5P6EA 4QJ9A 5I3YA 3URJA 4EJDA 5P2CA 5P5GA 2JJIA 3VUCA 3FSMA 3QS1A 2ZJJA 5OYRA 5EZXA 3T7PA 4JECA 3PI0A 3UFLA 4OBZA 5OZLA 1XN2A 4OC6B 3KDDA 4K4QA 3VLBA 1CMSA 1WKRA 5HE5A 5P2OA 3RTNA 4Y4WA 1XL5A 1HHPA 1EPPE 2R8NA 5P6RA 4DQEA 5P52A 4J1FA 1G6LA 5P2AA 5P4XA 4JOOA 5P7PA 3WB5A 5DGWA 3MXDA 3EKVA 5P23A 3OTYA 2OHPA 3QAAA 4NJVA 5P8PA 3A2OA 5DPZA 2QNNA 2P3BB 4XX4A 2V0ZC 4XXSA 4XX3A 2FNSA 1EBKC 1K6CA 2ER6E 3FX5A 3NDWA 3UDMA 4B72A 5P4RA 1W5XA 4MC9A 2VNMA 3LIYA 1N49A 1SDVA 3PWMA 2BQVA 1FFFC 3NU3A 3L5BA 4OBKA 1RNEA 1HRNA 4J1HA 5OZ7A 3ZKGA 4FSEA 5KAOA 5P2RA 3UHLA 4Y4UA 5P8CA 5P78A 3I25A 3TL9A 1GNNA 1A8GA 3EL9A 4QLHA 5KOSA 5OZKA 5P8QA 1QBRA 5P8DA 4M8XA 5P74A 2F80A 3UF3A 4DPFA 4EPJA 4MC6A 3CKTA 1HSIA 3EM4A 3EL5A 2ZDZA 2R5QA 5BWYA 5P1KA 4Y4GA 4DQBA 2OHKA 2WEBA 5OZAA 4DJOA 1XL2A 1FQ5A 5E5JA 1OD1A 2QZLA 4GIDA 1IIQA 5P3IA 2NR6A 2AOGA 4GJCA 1BDQA 3UQRA 3RTHA 2BPYA 3FNTA 1ME6A 1ODYA 4HDBA 3D1ZA 3OWNA 4YHQA 3O9HA 5P8TA 4L7HA 5P2JA 5P3BA 3G72A 2G24A 1B5FB 5OZCA 5P1BA 5B18A 5P15A 3PSGA 3SFCA 3HBOA 4YOAA 3TKGA 5OZHA 5P1OA 5P10A 1RL8A 5P3MA 2QU2A 2PH6A 2FMBA 1E80E 2Q63A 2I4WA 5P4BA 5P85A 4FCOA 5P5UA 1M0BA 5P0SA 2NTRA 1FMUA 3OXXA 1FIVA 4R91A 3SKFA 4Y5NA 1ZPAA 3NR6A 1W6IA 2I1AA 2ZJHA 2QHZA 5OZOA 1G0VA 3PSUA 5P0EA 1EPRE 2QNQA 1HTGA 4FLGA 2AOFA 1EPLE 4Y53A 3QRMA 2QI7A 1EBYA 4DV9A 2QI4A 2HB3A 5P4EA 4Y4XA 4Y4JA 5OZWA 2F3FA 5P20A 5I3WA 1BVGA 4AA8A 2WEZA 5P3RA 5P3TA 3DCKA 4MC2A 4Y4ZA 3GW5A 5P2HA 4XKXA 4PZXA 1XDHA 2QI1A 5DR0A 1EPNE 4U7QA 4Y3PA 5OYVA 5P6CA 2FXEA 4CPRA 3LITA 3KFNA 4S1GA 4OBDA 1D4YA 2QD6A 4IVSA 5P4AA 4I0ZA 5ENMA 3FIVA 5P1TA 3VFAA 2AQUA 1BVEA 1KJ4A 2IKOA 2V12C 4U7VA 2FDPA 5CONA 4LXMA 5P8LA 2IL2A 5P46A 3ZMGA 4HE9A 5P5PA 1ZP8A 1QRPE 5OZ9A 4J0VA 1T3RA 4K4RA 5P83A 3NU4A 5P0UA 3VCMA 1TZSA 1ZPKA 4YA8A 5P6ZA 4J1KA 3APPA 3UDRA 2QI5A 1IDAA 5P00A 5P1ZA 4Y4AA 1IZIA 5P5BA 5P28A 3KFPA 1EC3A 2RSPA 2QU3A 3KFSA 3S8IA 4DH6A 1DAZC 5P0MA 1MTBA 2AZBA 5P47A 3S7MA 5P4LA 1F34A 1NPVA 5P7AA 1E81E 4FAFA 5P0JA 4OBGA 2F81A 3D1YA 1FQXA 4ZE6A 3JVWA 3QROA 1SGUA 5P87A 2ZE1A 2APRA 5P88A 2R38A 3K4VA 4HVPA 4EJ8A 8HVPA 3VEUA 5AH8A 3PCZA 2P4JA 5PEPA 2ER0E 5P2WA 5CLMA 3RU1A 2AOHA 1LYBA 3GGUA 3DJKA 2G94A 1BIMA 2BKSA 4I8ZA 4HEGA 1T7IA 4FE6A 2BPZA 3NXEA 5HU0A 5P5JA 3I8WA 4Q1NA 4ZEAA 5P0ZA 4L7GA 3IXKA 2PWCA 1ZBGA 5OYQA 2Q11A 3QBHA 4KE0A 5I70A 2PH8A 4GJDA 4D83A 1LF2A 4J0YA 2VJ9A 3S2OA 1Q9PA 5BRYA 2G27A 2PQZA 1FG6C 4HDPA 4R92A 3ZKSA 1D4KA 1PPKE 3BUFA 3B80A 5P2KA 4OD9A 3LZVA 1J71A 2G1RA 4YCYA 5P7XA 1EPME 4DQFA 4NJSA 5OZIA 5P1FA 2G22A 4RVJA 1PFZA 2Z54A 5P4SA 4AMTA 5DR1A 5P32A 3TOFA 5P4KA 5ENKA 5AHAA 3SA4A 3HAUA 5P0GA 3S45A 5KR1A 4Q1XA 3T6IA 4YBIA 5P31A 2QI6A 4FM7A 4RCDA 3R2FA 4NPUA 2P3DA 3O9AA 5P3LA 1KJHA 3FV3A 1FFIC 1GVVA 2O4NA 3INFA 3Q70A 3TLHA 5P43A 1HVRA 1IDBA 3K1WA 5P4UA 4I1CA 3TOHA 3ZKNA 3H5BA 2NMZA 2AODA 5OZMA 3BGBA 3JVYA 4OC6A 3UDHA 5P8RA 5P01A 5AH6A 5P1XA 4YDGA 3UCBA 5ISKA 5P5VA 2B42A 2OHQA 3ZPUA 2MIPA 2QMDA 4Q5MA 3QVIA 5C9DA 5P89A 1A8KA 1BXQA 3SACA 3IA9A 3PMYA 3ZKMA 1SDTA 5P6OA 1AJXA 5P5WA 5P5AA 5P57A 1MT8A 4OBHA 3VSXA 4ZIPA 1FG8C 1GVUA 5P09A 4Y5MA 4B1EA 3OQKA 5P56A 4I0HA 2ZHSA 1D4LA 5P0KA 1FGCC 1FQ6A 2HB2A 2VJ7A 5IS4A 1W51A 5P86A 4COEA 2IDWA 5OZFA 3VFBA 2R3TA 1K1UA 2XFJA 3TPJA 5OYUA 4Y37A 3U7SA 5IVTA 2IGYA 5P69A 5P54A 1SDUA 5P7VA 1APUE 2UY0A 1MT7A 3OADB 3QBFA 4YD3A 4YE3A 5P3VA 2UPJA 3DM6A 3K5DA 5J25A 1HBVA 4UPJA 2OHUA 4RRSA 2WEDA 3PCWA 3I7EA 4Y3MA 3LNKA 5P7FA 5OZ5A 5P6PA 4BEKA 3O9IA 3ER3E 3S7LA 3JW2A 4D8CA 2G21A 2V10C 5P05A 5APRE 5P7MA 5P3FA 2BPWA 4HLAA 4FRSA 5P4TA 1TCXA 1MESA 4LBTA 5JODA 3VYFA 5COOA 5KQYA 1MRXA 1MRWA 1U8GA 3ZLQA 4OBFA 2V16C 4Y3HA 4DJRA 4L6BA 2AVSA 3OQDA 4Y9WA 4F76A 2HB4A 4Y48A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1TSU A;  5P4I A;  5P2D A;  1K6T A;  5P3N A;  1PPL E;  4EHC A;  5P3C A;  2FNT A;  4DJX A;  3D3T A;  5P3G A;  3KN0 A;  4R95 A;  1BIL A;  1Z8C A;  1EBZ A;  4GJ5 A;  1EPO E;  3L3A A;  3S43 A;  1TW7 A;  4I11 A;  5DR3 A;  5BS4 A;  2FGU A;  2HM1 A;  4RYC A;  4ZSM A;  4DJQ A;  3O9D A;  2OHM A;  3MWS A;  4D89 A;  3KT5 A;  5OZP A;  1HTE A;  5OZN A;  1YT9 A;  4H3I A;  5HU1 A;  1LF3 A;  5ER2 E;  4Y43 A;  5P8S A;  1CPI A;  4ACX A;  1AXA A;  5P77 A;  4L1A A;  2P3C A;  4YD6 A;  4TRY A;  5HDV A;  3QP0 A;  4Z2Z A;  4DJV A;  4NPT A;  1SBG A;  3VV7 A;  5P55 A;  4ER2 E;  1LYW B;  2PMA A;  4EXG A;  1UH8 A;  3SAA A;  1Z1R A;  3C9X A;  5P3Q A;  3LIZ A;  2A1E A;  4I0G A;  5OYW A;  4Y3Q A;  5P80 A;  1VIJ A;  3OQ7 A;  1HEG E;  5T4S A;  5P2T A;  2AOE A;  2HPE A;  2Z4O A;  1AZ5 A;  3QRS A;  3EMY A;  3IND A;  4AZY A;  1W6H A;  3SO9 A;  5OZY A;  1LYA A;  3H0B A;  3ZL7 A;  1XE5 A;  4YDF A;  5P26 A;  5P3H A;  1RQ9 A;  5P2I A;  3KDC A;  4OBZ B;  4NJT A;  4CPW A;  5P1V A;  5P76 A;  4OBJ A;  2B60 A;  5P8K A;  5DR8 A;  1KJG A;  4K8S A;  5OZG A;  1IVQ A;  4JPC A;  4QJ6 A;  5P5I A;  5P35 A;  5IE1 A;  1AAQ A;  5P16 A;  2G1O A;  5P0V A;  3KFR A;  3UFN A;  3ECG A;  4GJ9 A;  5P6M A;  4ER4 E;  4AUC A;  5P3X A;  3AUP A;  2XFI A;  2HS1 A;  3DV1 A;  2Q55 A;  5P6F A;  1APV E;  5AH9 A;  5P27 A;  5P1D A;  5DQC A;  4Y3S A;  1FMX A;  5P3U A;  3O99 A;  3OY4 A;  1QDM A;  5P7H A;  2QI3 A;  1EC1 A;  3OAG A;  3IAW A;  5P0X A;  5OZZ A;  3O9E A;  4PPH A;  4TVH A;  3CKP A;  5P30 A;  2ZJL A;  3HD8 A;  3QIH A;  4BFD A;  4RVX A;  1YTH A;  5P6U A;  4N00 A;  3HVP A;  3ZPT A;  1EPQ E;  3LPK A;  1JLD A;  3QI1 A;  5P1Y A;  3KT2 A;  4I10 A;  5P70 A;  3BUG A;  3BVB A;  2H6S A;  2WKZ A;  2QP8 A;  4DJU A;  3CIC A;  1A30 A;  3EL1 A;  3CKR A;  5P4M A;  5P7W A;  2CEJ A;  2VIZ A;  5P0Q A;  2IGX A;  5P5F A;  5P63 A;  2ASI A;  2FXD A;  5P1P A;  1MT9 A;  2VA6 A;  1MSN A;  4Y5L A;  3R1G B;  5P4Q A;  5P5K A;  5OZU A;  5OYS A;  5AGZ A;  3VV8 A;  4X7I A;  4YD5 A;  1KJF A;  4KB9 A;  5P44 A;  5P3P A;  3O9C A;  3SQF A;  5P53 A;  5OZ3 A;  2I4D A;  3LIQ A;  1YTJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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