3G72A

Design and preparation of potent, non-peptidic, bioavailable renin inhibitors
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
337
structure length
333
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Renin
publication title Design and Preparation of Potent, Nonpeptidic, Bioavailable Renin Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 333
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2009-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3g72A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3g72A01
3KDDA 5P7ZA 4J0ZA 3HZCA 5P8MA 5P4PA 1FKNA 2RKGA 4ACXA 4YA8A 4X7IA 3O99A 2Z54A 5P6EA 5KQZA 2PMAA 2PSGA 1EPOE 2FDDA 2G27A 1MSNA 4FIVA 4Y5BA 5P3GA 3DCRA 4KUPA 5HE5A 5P4XA 4RVXA 5DGWA 4H3GA 3NYGA 3S7MA 4Y41A 3LPIA 1XE5A 1BDRA 4MC2A 3UQUA 5P8JA 3VF7A 2AOFA 3LINA 5COOA 4FLGA 2B8LA 5P36A 5HDXA 3FNUA 3GI0A 1SH9A 5P1AA 5IVRA 2J9KA 1YG9A 2FS4A 2VS2A 5OZPA 1MTBA 5P7HA 2QI7A 5P26A 3OXXA 5T4SA 3TKWA 1W6IA 5P3IA 5DQ5A 2PK6A 5P40A 4I0FA 3PLDA 5P1PA 3ZKSA 1ZSFA 5P4CA 4QJ6A 5APRE 2PSVA 4K4QA 3R0YA 3PI5A 3EL5A 3BVAA 1C6YA 5P77A 2OF0A 2FLEA 2AQUA 2V0ZC 4Q1NA 5OYRA 4Y4TA 1A8GA 5P3TA 1VIKA 1LF3A 4LP9A 5P2HA 4J17A 1IZDA 3TPRA 2ZHTA 4WY1A 1RQ9A 4Y4EA 2VIZA 4B72A 5P45A 1K2BA 3PBDA 2PYNA 4Y5MA 5P3QA 3QIHA 3OXWA 1LZQA 5P2KA 3TLHA 3OWNA 7HVPA 1FMUA 4F74A 2NTRA 4Y51A 1FMXA 2WF4A 4J1EA 4OBFA 1YM2A 2R43A 3CICA 3LITA 3BXRA 4DH6A 1G0VA 4DJPA 3S56A 4D8CA 3GGXA 4QGIA 5P47A 4I0EA 2R38A 5P3XA 5OYXA 1AJVA 1B5FA 5P4RA 3QI1A 4DJYA 5SXNA 5P7UA 4DJQA 3HLOA 3RSVA 2FGUA 2WECA 4PZXA 1FG8C 2G69A 5P6PA 3S53A 3LHGA 4Y3SA 1ZPAA 4D85A 2G24A 3EKTA 1APWE 5CLMA 2ZHVA 1BXOA 4Y57A 5KR1A 5P38A 4F73A 3N3IA 4Y3NA 1M0BA 4BFDA 4ZLSA 5P5CA 4J0TA 3MXDA 4LAPA 4ZSMA 3L38A 5I3VA 1TCWA 2JJJA 5P5YA 3EKQA 5P78A 3ZKNA 5IE1A 4EP3A 5P6VA 4RVIA 4JOOA 1XS7D 3N4LA 5FIVA 5P3MA 1BDQA 4Y4AA 3LIYA 1IBQA 3K1WA 1HRNA 5OZJA 3WZ7A 5EZZA 2V12C 4Y3HA 3D20A 2WL0A 3EL0A 2P4JA 3Q5HA 1W50A 2PSUA 1WBMA 3QRSA 4Y3LA 2ZJIA 1EBZA 4CPTA 4YD4A 5OZVA 3OUAA 1Q9PA 2NMZA 5P3UA 4HVPA 4QJ9A 3ZMGA 5P5BA 1TZSA 4FSEA 2AVOA 1HIIA 1KJFA 5HE7A 3OADA 5P1BA 1XN2A 2VIEA 4HEGA 5ENKA 2JE4A 1D4LA 1LS5A 5P48A 1HSHA 3NR6A 3UHLA 2OHKA 2ZDZA 2IGYA 5P49A 4Y47A 3S2OA 4DQCA 2NNKA 3SFCA 3SA3A 2QAKA 8HVPA 3PVKA 4TVHA 1HXWA 1SGUA 5OZYA 3VEUA 3OXCA 1RV7A 3PSUA 3OQKA 3MSLA 5P0HA 3T7XA 3NU9A 2PYMA 5P15A 1AAQA 5P5SA 4Y3QA 3KM4A 5P75A 3TPLA 5EZXA 3VF5A 5P6NA 3OOZA 1D4SA 4CPXA 5P5OA 1EPPE 2QHCA 1MIQA 3TOHA 4QJ7A 1HPSA 4IVSA 3GGAA 3VLBA 4ZPFA 5E5JA 5HD0A 5P6QA 5P6CA 2SAMA 2BPYA 5P3CA 4I0IA 4FS4A 1PROA 3LIVA 3PM4A 4XXSA 5P5EA 2BPWA 3O9EA 5P13A 2OAHA 3L5CA 5P16A 5HTZA 4Y38A 3OQFA 2MIPA 1APVE 1LYAB 5P6ZA 2QD8A 1MRXA 5P0CA 5P6JA 4I0DA 2QI3A 5OZKA 3MSKA 3ECGA 4Q1YA 5OZ0A 5AGZA 4HDPA 5OYVA 1HPVA 3K4VC 3QPJA 4R91A 3RTHA 5P3LA 4I12A 4BELA 1HIHA 4YD7A 5P7FA 5P0GA 2Q63A 3EM3A 5P2VA 2HS1A 5P2AA 3UQRA 2QZKA 3IAWA 5P6OA 2IRZA 2G1YA 3Q4BA 3L59A 1EBWA 2XFKA 5P86A 3TKGA 5P3AA 4R95A 1K6CA 3VYFA 1OD1A 4U7QA 5IVSA 1U8GA 5OYUA 5P22A 1FQ7A 5P88A 1QRPE 4DFGA 5P2RA 5OZOA 5C9FA 5P0DA 3VV8A 2V00A 2G20A 3Q70A 4TRZA 3GI6A 5OZHA 3UDRA 1SDUA 3IGBA 2P3AA 4HZTA 3OU3A 4Y5KA 3H5BA 4FAFA 5P08A 4Y4BA 2WEAA 3T6IA 3DK1A 3PGIA 4YOAA 4RCEA 2QNNA 3UFLA 1MT8A 1LF4A 3DM6A 5OZCA 4FL8A 5HDZA 4KB9A 5P09A 3OUDB 5P58A 3OQAA 3OAGB 4JPCA 1ER8E 1AZ5A 4J0PA 4OBKA 2WF3A 5P3FA 2XYFA 1C6XA 1UH7A 5P5JA 2ZJHA 3ZPSA 4DJRA 5P5QA 1EPME 2Q55A 4OBGA 3FSMA 2WEBA 2PK5A 2G1SA 4YCKA 5P3EA 4YBIA 2IGXA 5P8UA 6UPJA 3O9BA 3ZOVA 5P6SA 3SA7A 5TOLA 1MT9A 3ST5A 2I1AA 5P6GA 1YTIA 4EPJA 3O9DA 4EJLA 4DVFA 5OZ4A 3SO9A 1N49A 2VA5A 5P2EA 4GJ7A 2O4SA 1WKRA 3APRE 5P7EA 4APEA 5P7BA 3WB4A 4BEKA 5OZBA 5P8LA 3KA2A 3C9XA 2O4LA 5P0SA 3UPJA 2FGVA 3KYRA 3UDPA 1MSMA 3S45A 4CMSA 5P4JA 2AZBA 4PEPA 1QDMA 3BUGA 2QHYA 5P35A 5AHCA 2ER7E 3L5BA 4JP9A 2CEJA 3UDQA 1SGZA 1BIMA 5P0KA 4Y45A 5JG1A 5P8PA 4M8YA 2R5PA 3INFA 4B78A 5P42A 5P07A 4Y4WA 9HVPA 4ZSRA 3UTLA 2G1OA 1ODXA 4J1FA 5P8TA 4CPUA 2B7FA 3VYEA 5P3JA 1A8KA 4GJAA 1HVKA 1J71A 2Q5KA 1EC2A 4LBTA 5KAOA 2VNMA 4J55A 4Y4ZA 1NPAA 4Y3GA 2JJIA 4EQ0A 5C9DA 1HTEA 1RL8A 4QJ2A 3SKFA 5P7PA 4FM7A 3TTPA 5P8QA 4L6BA 2BKTA 2HB4A 3FV3A 4DQBA 5P66A 2ZJMA 5P5RA 3OGPA 3WSJA 1HEGE 3S7LA 5P8EA 5SY3A 5OZIA 5P2NA 5P8HA 5P2LA 5IS4A 3R1GB 4I8ZA 4EQJA 3LNKA 5P0IA 1IDAA 3NXEA 4H3JA 2IENA 1DIFA 5P03A 4J1KA 4RZ1A 6APRE 4Y50A 5OZEA 4Y3ZA 2HIZA 5P2MA 5IVTA 1OHRA 1NH0A 3WZ8A 3RTNA 1AIDA 5P37A 5UPJA 4PZWA 5P5IA 2AVMA 4Y3RA 2G21A 4Y3JA 3EL4A 4NKKA 3SM2A 1LYAA 3UDJA 1LF2A 5P85A 4DUSA 5P4AA 3SLZA 1E81E 2JXRA 4GJCA 1GNOA 1FMBA 3TPPA 4RGHA 4Y56A 2IQGA 5P7SA 2BPZA 3GI4A 5P31A 3EKXA 4XX4A 5DPZA 1FFIC 3KN0A 4I0JA 5P8OA 5P7TA 1OEXA 2WEZA 3OHHA 5P6BA 1ME6A 4Y35A 2F3KA 5OZSA 2ER9E 4WTUA 3O9IA 2I0AA 3CYXA 3ZPTA 1RNEA 2B42A 4IVTA 5P4OA 3VV7A 3INHA 5P59A 1PSAA 5P1UA 5E5KA 5P1DA 4KE0A 5P6LA 5P55A 2WJOA 3DJKA 5P3PA 5P5LA 3S85A 5HVPA 5P6KA 4J54A 3WZ6A 1TQFA 5ER1E 2FNSA 3I7EA 5P3NA 3HBOA 5P2OA 2UY0A 3ER5E 3KF0A 5KQFA 1B6PA 4DQFA 4B1CA 4RLDA 4QJAA 5P2SA 3T3CA 3ER3E 3A2OA 3D1XA 5AH6A 5SY2A 2VIYA 3OUDA 5P30A 1ZAPA 3OAGA 3NDUA 5DR0A 5P1SA 3ZKGA 5P8NA 4LXMA 5DQCA 4QJ8A 2QMGA 5SZ9A 1IZHA 1T7IA 2B60A 5P52A 5P6WA 1SIPA 2ZHUA 4GYEA 3WB5A 1HVIA 5P4UA 4OBDA 2P3BB 3URJA 4I11A 3JW2A 1BAIA 2I0DA 4AA8A 4PPHA 3G72A 4R93A 3D1ZA 2PH8A 1OEWA 1XL2A 2A4FA 5DQ4A 4EHCA 3UDKA 2QNPA 5P8IA 1AM5A 5P1KA 2B8VA 3EL9A 1HVSA 3CKTA 5P6FA 3TNEA 5P04A 5OZMA 3TPJA 2FXEA 3QS1A 3NDTA 3CYWA 3FNSA 3QVIA 3ZLQA 3D91A 3U71A 5P0XA 2QP8A 1NSOA 1VIJA 5P7VA 2I4DA 5P7WA 4S1GA 4RCFA 4B70A 2QHZA 5OZXA 1HTRB 5I3YA 1CMSA 2NXLA 5P6XA 3BVBA 2R5QA 3OU1B 2QMFA 1IDBA 1YT9A 2Q54A 3O9FA 5P4YA 3KFRA 5P1RA 4RYCA 2OHPA 4HDFA 5P4LA 3EMYA 1PPKE 5IVQA 2CENA 4Y5PA 3L5FA 3UCBA 5KR8A 1FEJC 3LZYA 2NNPA 2QK5A 3KFNA 2HAHA 2QNQA 4TVGA 3LZUA 1LEEA 1W5XA 2NXDA 1HVJA 3BRAA 2FDPA 5P8CA 4PYVA 5OYTA 2G1NA 1LV1A 5P1CA 3KMXA 1GVXA 5P5FA 1KJHA 4OBZB 1HTGA 3NSHA 1E82E 4CPWA 5P0AA 3Q6YA 1A94A 4ZEAA 4FRKA 1SMEA 5P53A 4LHHA 5P79A 1ODWA 2VJ7A 5P1HA 1NPWA 3IA9A 3G70A 2ZJJA 1W5VA 1K1TA 4NPUA 5P46A 5ISKA 4Y3WA 3UQXA 1BDLA 1ODYA 1XN3A 5P8VA 2AIDA 3PHVA 5P8KA 3OQDA 5BWYA 1EPLE 1DP5A 1XE6A 2OHTA 5P57A 4EXGA 4Y39A 1B11A 1SP5A 3SA6A 3CMSA 5DR1A 5P2CA 1MERA 1G6LA 4MC6A 5P76A 1FQ6A 1Z8CA 2QZXA 4DJVA 4Z2ZA 5I70A 1BV9A 3LIZA 4OBHA 3BXSA 5ISJA 5P0EA 4EJKA 3HVPA 1UH8A 5P8SA 5HE4A 4L7HA 2QD6A 4L7JA 5P87A 2VA6A 4K9HA 4A6CA 2A1EA 2HS2A 5P1WA 3HDKA 5P3BA 2R9BA 3LPKA 4PHVA 3PJ6A 4GJBA 4YOBA 4NJTA 2O4PA 4EP2A 3UF3A 5P4FA 3BC4A 4X2LA 2OHLA 5P3KA 3UQWA 4ACUA 4OC6A 5JFPA 3L5EA 1EPNE 3OY4A 5P6AA 1HVHA 2QU3A 3APPA 3PMUA 4DJXA 2XFJA 4Y5AA 5P7XA 5AH9A 1E80E 2Q3KA 1APTE 4EJDA 3GW5A 5P4KA 4J5JA 1FLHA 3EKVA 4Y5EA 2AODA 3SABA 3VYDA 4LC7A 1Z1RA 1GKTA 4H1EA 3SKGA 5OZDA 2PQZA 3GI5A 5P34A 5P39A 3VFBA 1IZIA 4GMIA 3HD8A 1G35A 1MTRA 5P89A 3DOXA 1MESA 5OZ9A 5P4NA 3NWXA 5OZZA 3QAAA 2H6TA 1B6KA 1KZKA 2OHMA 5P6TA 5P0FA 5P02A 4XX3A 1JLDA 2VNNA 3VSXA 2P3BA 3I25A 1SIVA 5P7AA 4Y4JA 3RSXA 5P71A 5P41A 1YX9A 5OYZA 2ZE1A 3BUFA 3FX5A 1KJ7A 1MPPA 3QN8A 2AZ8A 2V11C 4YCTA 3KFPA 3MWSA 4ZSPA 5P7OA 4FRIA 5P2IA 5P2UA 4EWOA 3LZVA 1XDHA 5P8RA 4MC1A 5P4QA 5P5GA 3QVCA 5I3XA 3O9HA 2F80A 4Y53A 4FCOA 2Q11A 2APRA 4I1CA 5P4MA 5P7RA 4Y5GA 3BGBA 3PMYA 4ZPGA 5P0UA 1HVLA 5HCOA 1FFFC 1HTFA 2HB2A 2EWYA 5P17A 4E43A 4AZYA 5P8FA 4BFBA 2O40A 3Q3TA 5HDUA 5OYWA 3NWQA 4Y5LA 3INDA 5P1ZA 3URLA 5P50A 4LL3A 1RPIA 2IEOA 4Y9WA 1BVEA 4LXAA 1AXAA 2VA7A 5P2XA 1T6EX 4RCDA 1IZEA 2F8GA 3UDYA 3BHEA 3EBZA 3OU1A 4GJDA 4Y43A 4ER4E 5P69A 1DPJA 3EM6A 2PWRA 5P5ZA 4Y4XA 5OZWA 7UPJA 3OTYA 5OZRA 4CPQA 1DAZC 1FGCC 2AVSA 2QD7A 2P83A 5OZGA 2I4QA 2I4XA 5P44A 2ZJLA 1MRWA 3HAWA 5P6MA 2O4KA 5P24A 5P4IA 5COPA 4Z4XA 1MVPA 4GJ8A 5KOSA 5P56A 1BXQA 1HEFE 3SA4A 5KOQA 4AMTA 2P3DA 1HSGA 2BB9A 5DQ1A 3PSYA 5P7JA 1F34A 1BVGA 2BPXA 5AHBA 4OBZA 5DR8A 1B6MA 3R2FA 5P64A 2RSPA 4A4QA 3SAAA 4FE6A 1KJ4A 5P5UA 4UPJA 4DI2A 1EC0A 3EXOA 1MUIA 5F00A 5P4GA 1G2KA 3SA8A 4OBJA 3L58A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KDD A;  5P7Z A;  4J0Z A;  3HZC A;  5P8M A;  5P4P A;  1FKN A;  2RKG A;  4ACX A;  4YA8 A;  4X7I A;  3O99 A;  2Z54 A;  5P6E A;  5KQZ A;  2PMA A;  2PSG A;  1EPO E;  2FDD A;  2G27 A;  1MSN A;  4FIV A;  4Y5B A;  5P3G A;  3DCR A;  4KUP A;  5HE5 A;  5P4X A;  4RVX A;  5DGW A;  4H3G A;  3NYG A;  3S7M A;  4Y41 A;  3LPI A;  1XE5 A;  1BDR A;  4MC2 A;  3UQU A;  5P8J A;  3VF7 A;  2AOF A;  3LIN A;  5COO A;  4FLG A;  2B8L A;  5P36 A;  5HDX A;  3FNU A;  3GI0 A;  1SH9 A;  5P1A A;  5IVR A;  2J9K A;  1YG9 A;  2FS4 A;  2VS2 A;  5OZP A;  1MTB A;  5P7H A;  2QI7 A;  5P26 A;  3OXX A;  5T4S A;  3TKW A;  1W6I A;  5P3I A;  5DQ5 A;  2PK6 A;  5P40 A;  4I0F A;  3PLD A;  5P1P A;  3ZKS A;  1ZSF A;  5P4C A;  4QJ6 A;  5APR E;  2PSV A;  4K4Q A;  3R0Y A;  3PI5 A;  3EL5 A;  3BVA A;  1C6Y A;  5P77 A;  2OF0 A;  2FLE A;  2AQU A;  2V0Z C;  4Q1N A;  5OYR A;  4Y4T A;  1A8G A;  5P3T A;  1VIK A;  1LF3 A;  4LP9 A;  5P2H A;  4J17 A;  1IZD A;  3TPR A;  2ZHT A;  4WY1 A;  1RQ9 A;  4Y4E A;  2VIZ A;  4B72 A;  5P45 A;  1K2B A;  3PBD A;  2PYN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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