3KM4A

Optimization of orally bioavailable alkyl amine renin inhibitors
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
337
structure length
337
Chain Sequence
GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Optimization of orally bioavailable alkyl amine renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 337
sequence length 337
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2009-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3km4A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 3km4A01
3UPJA 5P7LA 5P02A 2NTRA 5P2QA 4EJLA 4DJUA 2WEBA 4Y5AA 5P75A 5P3RA 2G1YA 4PEPA 3ZKIA 1BDRA 3PHVA 3PWRA 4RYCA 4CPSA 3WZ6A 2WL0A 4KE0A 1GVVA 5P6GA 3SA4A 4OBHA 1LF3A 5P5HA 1ZTZA 1PSNA 2QI0A 5P5OA 4ZSPA 5KOSA 4Y4GA 1HSHA 3VF7A 3PSYA 3O9LB 2FDEA 5HDUA 4B77A 3PRSA 3VUCA 4ER2E 3TPRA 2PWRA 3IXKA 3BC4A 1T7JA 4JPEA 4Y58A 4TVGA 3INFA 4PPHA 2XFJA 5P6DA 4FSLA 4Y39A 2ZYEA 2HPFA 4X7IA 5OZ4A 4JP9A 2AZBA 1QDMA 5P6KA 1W5XA 2AOIA 5OZRA 1UH8A 2J9JB 4I0ZA 1FQ8A 4RVJA 5KOQA 2FGUA 4L7JA 2AOCA 5P8BA 3QVCA 1EPLE 3BXSA 2WJOA 5DQ4A 3IXJA 3VSXA 2WF4A 5P70A 4Y51A 5OYSA 2NMZA 3O9BA 1MVPA 5P7NA 5P4VA 5P2DA 9HVPA 1PPKE 5P6JA 5OZ1A 5P7RA 1ZP8A 4APRE 3OOZA 5KQZA 5P7PA 4ZSQA 5P6VA 5HU1A 5I3XA 5P5PA 4CKUA 3HD8A 1HVCA 5P1ZA 4Y3JA 1XS7D 1TSQA 5OYUA 3TKWA 2I4QA 5AHBA 3SQFA 3Q6YA 5P44A 3TNEA 1ME6A 4LL3A 4I0FA 3UTLA 3AIDA 3PGIA 1RNEA 5P7IA 2VA5A 3HVGA 5P68A 5KQXA 5P2LA 2FNSA 3OAGA 2R3TA 4F73A 4K8SA 5P7KA 2BKSA 4IVTA 3PWMA 5P37A 5OZUA 2O4NA 5P7AA 3L5CA 4EQJA 3UDNA 3BUGA 5P56A 1Z1RA 4H3FA 1QBSA 3OUDB 1C6XA 1UPJA 4A6BA 3FSMA 1ZLFA 1MIQA 2VIYA 3UDKA 4FRJA 1ZBGA 5P07A 5HE4A 5P6LA 2J9KA 3NXNA 4IVSA 2F81A 2ZJMA 5P3KA 3I8WA 5P8JA 3KMYA 4Y5NA 5P5CA 1LYAA 3UDYA 1WBMA 5OZ8A 1D4JA 4Y4AA 3S56A 2VNMA 3CIBA 5P7CA 5C9BA 5P3IA 1LYWA 5CLMA 1ODXA 2AOGA 2PMAA 5P1BA 5P3DA 3L58A 4Y5KA 5P1NA 4Y54A 4KE1A 5P62A 1KJGA 4EHCA 3IN4A 2HC0A 2O4KA 4NJVA 2FXDA 5P0NA 2QU2A 5P3CA 5P5XA 3ER5E 5DGWA 4A4QA 3U7SA 5COPA 1SDUA 2IKUA 1HTEA 3RSVA 1HEGE 1DMPA 1IZIA 5P50A 2WECA 5P5QA 5P81A 1MT9A 5OZQA 1FQ4A 5P8VA 1FQ6A 1MSMA 3JW2A 1NPAA 3CKRA 3OTYA 5P2GA 1YG9A 3KDCA 3TTPA 5P65A 2VA6A 3GGXA 5DQ2A 5P61A 5P0PA 1Z8CA 5P6YA 3BGBA 5P8UA 2ER6E 3PSUA 1T7KA 4APEA 4AUCA 5ISJA 3CMSA 3SPKA 3H5BA 4GZFA 1NPVA 4LXMA 1TSUA 2QK5A 4DV9A 5P0TA 2ZJHA 5P2AA 4YDGA 5P2IA 5P85A 3LPKA 2SAMA 2B7ZA 1C6YA 3EL9A 3NUOA 4Y3TA 2P3BA 1ZJ7A 4R93A 5AHCA 2FDPA 5P8HA 3RVIA 4YE3A 5P0IA 3SA9A 4H3GA 4FE6A 5P2HA 5P3EA 2QD6A 1IBQA 4CPQA 5OZ9A 2R5PA 3L59A 5P6IA 4Y37A 3FNTA 5P34A 5OZ6A 4R5NA 5AH6A 4Y4XA 3T3CA 1FG6C 5P8DA 5P41A 5P42A 3KDDA 2R5QA 4B0QA 1DW6C 5P6BA 4YD5A 4FM6A 4OBFA 3RSXA 1B6KA 2Z54A 4I1CA 1IVPA 3MSJA 2FLEA 2IKOA 3HAWA 3D1XA 2JJJA 3S8IA 4GJDA 5P46A 2QNQA 2G1SA 3ZMGA 1PROA 4FIVA 2AODA 5IVRA 4COEA 4TRYA 1XE6A 3QBFA 3R1GB 5P0HA 1EPRE 1LV1A 3VV7A 4DVFA 3INDA 1BDQA 1DPJA 2PK6A 2Q54A 5P0CA 5P2OA 3NDWA 1ZSFA 1SDVA 3OXWA 5OZVA 2I1AA 4RCEA 5P8GA 2R3WA 4Y43A 3PBZA 1WBKA 4I10A 3OHFA 2I4XA 4I8ZA 4RVXA 5KQFA 4B1DA 3ZKNA 3VCMA 4CP7A 1K2BA 5P10A 5P7GA 1APWE 3QVIA 4Y6MA 7HVPA 1QRPE 5JFUA 4Y56A 3R4BA 4GJBA 4J1FA 3ZKXA 1C70A 3KM4A 1FKNA 3ZPSA 1HWRA 1EPQE 4LAPA 5P30A 3BVAA 3KF0A 3EBZA 5AHAA 4GJ6A 3D91A 1W5WA 5P4YA 2CENA 3OU4B 5COKA 5C9FA 2BQVA 1Q9PA 4A6CA 2IDWA 3EKQA 3OADA 5P3YA 4QJ6A 4Y4UA 5I3YA 3LIZA 4BELA 4Y4ZA 4R91A 5P17A 3Q4BA 5P1XA 2NNPA 3NYGA 4NPUA 4I0JA 4ER4E 2QI5A 5P39A 2IL2A 1EPNE 1W5VA 1LEEA 3K5GA 2Q5KA 3KFRA 5P1FA 4Y5LA 5P5BA 3APRE 5P5KA 2QMPA 2G21A 3EM6A 5P58A 5P5VA 5P25A 1AVFA 1AXAA 1LF2A 2OHSA 2ER7E 1D4LA 5P4JA 2P4JA 4LXKA 2VIJA 5DQ1A 1KJ4A 5P82A 2VKMA 3TKGA 1PFZA 5DQCA 2QI6A 4Y41A 3KFSA 3LHGA 5P4CA 5P79A 1EBZA 3LZVA 3G6ZA 2G22A 1BXOA 2BPYA 5P4ZA 1HXBA 4U7VA 3EM4A 1LYWB 3UF3A 3EL0A 3OUBA 4GJ5A 3PLLA 5IE1A 2JJIA 1JLDA 3QRVA 5IVQA 5P4EA 5P59A 4KB9A 1Z1HA 3L5BA 2XYFA 4J1HA 5P8KA 5P1OA 1SMRA 5KR0A 4Y3LA 3QROA 4EJKA 5P6EA 1RPIA 5P2EA 5P2JA 3LIVA 4YD3A 4D88A 3I2LA 2V00A 1EC1A 5P87A 5P4TA 5EZZA 5T4SA 3O99A 3KFPA 5P76A 2ZHVA 5P1TA 4OC6B 3OTSA 1VIKA 4K9HA 2ZHUA 4Q1XA 4Y4TA 3OGQA 5P63A 1T7IA 1HIHA 2ER0E 3NDUA 3URIA 3OQAA 3K4VA 4DQCA 1T3RA 4OBKA 4KUPA 1HBVA 5P2TA 2P3BB 3VEUA 4Z50A 4RRSA 5P5TA 3SKFA 1A30A 5P1DA 5P7XA 3A2OA 1IDBA 2G1NA 4AA8A 4J0TA 1HTGA 4PZWA 3S7MA 3GGVA 3SA8A 4YBIA 3PCZA 4ACUA 1TCWA 2G69A 4XKXA 2AOHA 5KR8A 5P1CA 5P27A 3SA5A 3DM6A 3VV8A 3QN8A 2FMBA 1FIVA 4GB2A 3KA2A 2Q11A 5DR3A 4OD9A 5P19A 2VIZA 5IVTA 5HD0A 2B7FA 8HVPA 4K4QA 5HVPA 1M4HA 3HAUA 1EPOE 5P0EA 3TOHA 3R0YA 3DCRA 5P0FA 4OBJA 1D4IA 1GNOA 4XX3A 3JVWA 5P01A 2IENA 1XDHA 3PMUA 1AIDA 4Q5MA 5P0AA 1BWBA 4Y36A 4EP2A 1HVKA 2G1OA 1A9MA 2G1RA 5P60A 5AH9A 3HW1A 1LYBB 1U8GA 5OZHA 5P6RA 4EPJA 3EL1A 4QJ7A 5P4IA 2I4VA 4I12A 3R2FA 5P6OA 5P8MA 4Y45A 1M0BA 2FGVA 2BPWA 5OZJA 1FG8C 3NR6A 3OOTA 5P05A 6UPJA 2V11C 1TW7A 5P0QA 4D85A 2WKZA 5P5GA 5P38A 4YCKA 2V13A 3ER3E 5P0XA 4X2LA 1DIFA 3OU3A 4Y4BA 1FMUA 1FB7A 4I0GA 5P2CA 5P2NA 4YD6A 5I3VA 4OBZB 2ZJKA 2QD8A 2WF2A 2PYMA 5P7MA 3ECGA 3RU1A 4RVIA 3GI0A 4CPTA 5P45A 5P6SA 4Y3DA 5OYTA 3SM2A 2QAKA 2OHTA 1HVRA 3O9IA 5PEPA 1GVXA 3I7EA 1B5FA 1LS5A 3BXRA 4NKKA 3SM1A 4YHQA 1LF4A 2WF1A 5P1WA 1HOSA 1CPIA 1G2KA 1UH7A 4GJ9A 5P7BA 3IVIA 4GIDA 4Q1WA 2IEOA 1QS8A 3OU1A 5P8FA 3EKWA 5P6PA 3UFLA 5OZZA 3LZSA 5P47A 4Y35A 3HDKA 5P4AA 5HU0A 2ZHRA 3O9FA 3OQ7A 1HTRB 4B05A 2ZHSA 4F74A 1G35A 3HZCA 3OQKA 5P4FA 4I11A 4EXGA 2QZXA 4FRKA 5SXNA 5OZAA 2FS4A 1K6CA 2BPXA 2UXZA 3S43B 2IRZA 1SBGA 3IN3A 3LINA 4QGIA 2O4SA 3I6OA 4Y4DA 2IGYA 4Y3EA 5ENMA 2B8VA 4DJVA 4GMIA 3TOFA 2CEJA 1HRNA 5P23A 5P6CA 5P4UA 5P7VA 1EPPE 5P7OA 2UY0A 5P3JA 5P1UA 1F34A 2P3CA 4J1EA 1BDLA 5P48A 3NU6A 2OHQA 5OZTA 5P49A 3HBOA 5P3TA 1BIMA 5OZKA 3TPJA 1HSIA 4ZPFA 4YD4A 5P4KA 1FGCC 5P5MA 3K5FA 4H3JA 2O4LA 1D4KA 2HM1A 5HDXA 2BBBA 4YCYA 3UQRA 5OYWA 1K1TA 3S45A 2OHLA 4HLAA 3SAAA 4YD7A 1HHPA 2QZWA 1SIPA 3RTMA 3EKTA 5P77A 4HVPA 5P7EA 2IS0A 3VLAA 5P3HA 3LZYA 4LC7A 3O9AA 1BXQA 2WF0A 1PSAA 3NWQA 4FS4A 1DP5A 1YTHA 3DJKA 3L5DA 5P1RA 2Q55A 5P86A 3LZUA 1YTJA 3GGAA 4Y5MA 4EWOA 4DQEA 4RGHA 1K1UA 1APUE 1TQFA 3OQDA 2A4FA 1W51A 3T7QA 4FRIA 4L1AA 4OBDA 1HPVA 2IQGA 4HA5A 5P7HA 4B1CA 3NSHA 5JG1A 5P8NA 3BUFA 4FSEA 4OD9B 4YBFA 5P8CA 1B6JA 1BVGA 5P66A 4QJ8A 1HEFE 5P6TA 2V12C 5P3NA 2XFIA 2NXLA 3MSLA 2Q15A 5OZ7A 2VJ6A 4LHHA 5P0BA 5P22A 3EKXA 3DCKA 3ZL7A 5P1YA 3K5CA 1MRXA 2AQUA 5P1SA 3NXEA 5P8RA 5P83A 5P1MA 3T11A 4Z22A 1HVIA 2RKGA 4L6BA 2A1EA 3QPJA 3O9CA 3Q3TA 1OEXA 3UHLA 5AGZA 5ER1E 1XE5A 6APRE 3VG1A 4HDFA 3M9FA 1B6MA 2VJ7A 5P84A 3URJA 4CPWA 2APRA 1SGZA 3BHEA 1CZIE 1FEJC 5IS4A 1HIVA 2AOEA 2I0DA 3GI5A 1HPSA 5P6UA 5P26A 4Y3YA 5OZDA 5P09A 2PH8A 3KT5A 2AIDA 4MC2A 3PI0A 4RCDA 3GI4A 5P6HA 5P2FA 3VYDA 4J5JA 1YTIA 1HPOA 4Z4XA 3CKTA 4Y5PA 3SKGA 3SO9A 2OF0A 3N3IA 3MXEA 3NU4A 1K6VA 3D1ZA 5P0MA 5P2WA 5P7TA 3K1WA 5P11A 3OWNA 5P4SA 5P6MA 1BVEA 4M8XA 3OQFA 1ENTE 1E81E 3DOXA 5P3AA 3WB4A 3O9HA 4Y3SA 5P2UA 3ZPUA 4EP3A 3U6AA 4M8YA 5P3LA 4Y3RA 3B80A 1N49A 3O9LA 5P04A 4DJPA 1BILA 4HDPA 3H0BA 2F3KA 3BUHA 5P4GA 2AVVA 1YM2A 5HDVA 5OZEA 3MSKA 4PZXA 3UQUA 3TH9A 1OEWA 5EZXA 2EWYA 1PPLE 4Y4EA 3S7LA 5P31A 5OYQA 5OZBA 2AZ8A 3KYRA 4HEGA 5ISKA 2J9JA 2OHNA 1W6HA 2AOJA 4WTUA 3SA3A 2PWCA 1AZ5A 4Y5BA 3PVKA 1IIQA 5P8EA 1D4SA 3WZ7A 1SDTA 5P6XA 2ZJIA 2WEDA 1M43A 5OYVA 2O4PA 3OAGB 5P12A 3PBDA 5HTZA 5P43A 3LIYA 4CMSA 1DAZC 1IDAA 3HVPA 5P1GA 4FCOA 5P2RA 3KMXA 4DPFA 3L5EA 2BKTA 5P0KA 4GYEA 4I0IA 1ODYA 5P3BA 5OZCA 3SACA 2V0ZC 2V16C 5AH7A 5P16A 3NLSA 5DPZA 5P1KA 1YTGA 5OYXA 5P64A 2P3DA 4DQBA 2ZHTA 5I3WA 1LYAB 3NU9A 4S1GA 5P0JA 5P71A 3URLA 4HDBA 2JE4A 3LPJA 4TRWA 1XN2A 2HB4A 3LPIA 5P1LA 3U71A 3G70A 5DR4A 2ANLA 5P55A 2ASIA 5OZOA 4HE9A 3VF3A 3S2OA 3UQPA 4Y5EA 3ZKQA 3L5FA 4Y53A 3VLBA 5P00A 3TLHA 5P4WA 3CICA 1XL5A 4JPCA 1E80E 4RCFA 5P54A 4DUSA 4Y4WA 4Y3XA 5P1PA 4DQGA 3PI5A 3BRAA 4J54A 5P1VA 3NWXA 3EXOA 3ZKSA 3L3AA 4B70A 4QLHA 3FX5A 5P4HA 4GJAA 3LIQA 5OZ0A 4Y38A 3NUJA 1KJFA 4Y4JA 4FLGA 3S53A 2PH6A 3SABA 4K4RA 4B78A 5OZXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3UPJ A;  5P7L A;  5P02 A;  2NTR A;  5P2Q A;  4EJL A;  4DJU A;  2WEB A;  4Y5A A;  5P75 A;  5P3R A;  2G1Y A;  4PEP A;  3ZKI A;  1BDR A;  3PHV A;  3PWR A;  4RYC A;  4CPS A;  3WZ6 A;  2WL0 A;  4KE0 A;  1GVV A;  5P6G A;  3SA4 A;  4OBH A;  1LF3 A;  5P5H A;  1ZTZ A;  1PSN A;  2QI0 A;  5P5O A;  4ZSP A;  5KOS A;  4Y4G A;  1HSH A;  3VF7 A;  3PSY A;  3O9L B;  2FDE A;  5HDU A;  4B77 A;  3PRS A;  3VUC A;  4ER2 E;  3TPR A;  2PWR A;  3IXK A;  3BC4 A;  1T7J A;  4JPE A;  4Y58 A;  4TVG A;  3INF A;  4PPH A;  2XFJ A;  5P6D A;  4FSL A;  4Y39 A;  2ZYE A;  2HPF A;  4X7I A;  5OZ4 A;  4JP9 A;  2AZB A;  1QDM A;  5P6K A;  1W5X A;  2AOI A;  5OZR A;  1UH8 A;  2J9J B;  4I0Z A;  1FQ8 A;  4RVJ A;  5KOQ A;  2FGU A;  4L7J A;  2AOC A;  5P8B A;  3QVC A;  1EPL E;  3BXS A;  2WJO A;  5DQ4 A;  3IXJ A;  3VSX A;  2WF4 A;  5P70 A;  4Y51 A;  5OYS A;  2NMZ A;  3O9B A;  1MVP A;  5P7N A;  5P4V A;  5P2D A;  9HVP A;  1PPK E;  5P6J A;  5OZ1 A;  5P7R A;  1ZP8 A;  4APR E;  3OOZ A;  5KQZ A;  5P7P A;  4ZSQ A;  5P6V A;  5HU1 A;  5I3X A;  5P5P A;  4CKU A;  3HD8 A;  1HVC A;  5P1Z A;  4Y3J A;  1XS7 D;  1TSQ A;  5OYU A;  3TKW A;  2I4Q A;  5AHB A;  3SQF A;  3Q6Y A;  5P44 A;  3TNE A;  1ME6 A;  4LL3 A;  4I0F A;  3UTL A;  3AID A;  3PGI A;  1RNE A;  5P7I A;  2VA5 A;  3HVG A;  5P68 A;  5KQX A;  5P2L A;  2FNS A;  3OAG A;  2R3T A;  4F73 A;  4K8S A;  5P7K A;  2BKS A;  4IVT A;  3PWM A;  5P37 A;  5OZU A;  2O4N A;  5P7A A;  3L5C A;  4EQJ A;  3UDN A;  3BUG A;  5P56 A;  1Z1R A;  4H3F A;  1QBS A;  3OUD B;  1C6X A;  1UPJ A;  4A6B A;  3FSM A;  1ZLF A;  1MIQ A;  2VIY A;  3UDK A;  4FRJ A;  1ZBG A;  5P07 A;  5HE4 A;  5P6L A;  2J9K A;  3NXN A;  4IVS A;  2F81 A;  2ZJM A;  5P3K A;  3I8W A;  5P8J A;  3KMY A;  4Y5N A;  5P5C A;  1LYA A;  3UDY A;  1WBM A;  5OZ8 A;  1D4J A;  4Y4A A;  3S56 A;  2VNM A;  3CIB A;  5P7C A;  5C9B A;  5P3I A;  1LYW A;  5CLM A;  1ODX A;  2AOG A;  2PMA A;  5P1B A;  5P3D A;  3L58 A;  4Y5K A;  5P1N A;  4Y54 A;  4KE1 A;  5P62 A;  1KJG A;  4EHC A;  3IN4 A;  2HC0 A;  2O4K A;  4NJV A;  2FXD A;  5P0N A;  2QU2 A;  5P3C A;  5P5X A;  3ER5 E;  5DGW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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