4S1GA

Renin in complex with (s)-1-(3-fluoro-5-(((s)-1-phenylethyl)carbamoyl)benzyl)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxotetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Iminopyrimidinones: A novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4s1gA01
3FKTA 5P6DA 5P6QA 4AUCA 4B70A 3Q6YA 2XYEA 3TL9A 3NWXA 5P88A 5P7BA 3EL9A 1B6KA 2R5QA 4Y48A 5P3XA 1BBSA 3APPA 4RGHA 5P05A 5P5GA 2PQZA 4DJYA 2CEMA 2FGUA 1SGUA 3PSUA 5P76A 5P8CA 1MPPA 5P7SA 2R3TA 1BAIA 5P3YA 1PSOE 5DQCA 5P6PA 1HTFA 2IKUA 3NDTA 4DJRA 4QGIA 3UDRA 5P41A 1HVCA 3OQ7A 1HVSA 1MTBA 5HVPA 2HS2A 3APRE 1SDTA 5P4BA 5P7UA 1Z1RA 1YX9A 1EBYA 3N4LA 3DUYA 2OHTA 5KAOA 5P0QA 2NNKA 1FMUA 4LHHA 5P4JA 5KOSA 5P4TA 4PEPA 5P6EA 5P0DA 2FMBA 3SM2A 2R5PA 3BXRA 5P5LA 1GKTA 1EPME 3CICA 3U7SA 2FXEA 3ZMGA 2Q3KA 3VUCA 5P2WA 5P3TA 4I11A 4XX3A 1B6MA 3FNTA 4H3GA 5P5OA 4L7GA 3IXKA 3EKQA 3OGPA 5P49A 2R43A 3ZPTA 4NJTA 2PWRA 1HPSA 2AVVA 5P8GA 5ER2E 3QPJA 4Y36A 5P79A 4NJSA 2I4VA 1EBKC 4L7JA 5ISKA 3Q3TA 5HE4A 1TCWA 5P1EA 1G2KA 4K9HA 3OAGA 4Y3TA 3UDMA 5KR1A 3PBDA 5P27A 5P6GA 3S54A 4FSEA 5P7KA 5P3EA 4Y4WA 5P01A 5P3JA 5E5JA 3GI4A 4HE9A 2G21A 5P36A 1XL2A 5OZCA 1WBKA 2PYNA 5P2YA 1RPIA 5IVSA 3JVYA 3UTLA 3DV5A 3SPKA 4LXMA 4TVHA 5SY2A 1F7AA 3GGVA 2ASIA 4EHCA 2QI5A 5P35A 3WB4A 5OZ7A 3OUCA 4KB9A 1DIFA 1OEXA 3VV8A 3PI0A 3QN8A 1BDQA 5P3SA 3C9XA 5P14A 5P6RA 3KDBA 1GVUA 5P6ZA 3D20A 3ER3E 2XFJA 4R92A 2QU2A 2QMDA 2F3EA 3T6IA 3KFNA 3AIDA 2Q54A 1D4SA 5P5WA 4TRWA 2V16C 4FRSA 2OHMA 5J25A 3CIBA 4OC6A 1RNEA 5P2LA 5HDXA 3MXEA 4EPJA 5P4SA 3TPLA 1FFFC 5DR1A 2HC0A 3BUFA 1IDBA 5P8DA 1BIMA 4XKXA 3FNUA 4NJUA 1FQXA 3BVBA 4RCDA 2PC0A 5P1HA 5P31A 3K1WA 3GI0A 4PPHA 2G1YA 5P5VA 1AZ5A 1MRWA 5P8PA 3KDCA 5P1OA 5P2JA 1NPWA 3KN0A 3L59A 3K5DA 4Y4GA 2VIZA 5P19A 1XN3A 5OZ3A 2AVMA 1FQ5A 3BXSA 1AXAA 1W6HA 1HXWA 1FGCC 2ER0E 4H3FA 4CPWA 2QHCA 5P78A 4YD3A 5P6YA 3MSKA 3CMSA 4J1KA 3EL4A 3BVAA 4EP2A 5P84A 3I7EA 4EP3A 5P2SA 3OQDA 4Y3WA 5DGUA 1QDMA 4J55A 3LINA 3OU1B 5P0YA 1A30A 4I0DA 1D4KA 4EJDA 4CPXA 2RENA 1BDLA 2QK5A 1HPOA 2AVQA 3Q5HA 2CENA 2VKMA 4Y3RA 4I12A 5P74A 4J17A 5DR4A 4M8XA 3EBZA 1K2CA 4U8WA 1Z1HA 5HTZA 2CEJA 3PB5A 4GZFA 1MSNA 5P51A 2QHYA 4M8YA 4RRNA 1EEDP 2G24A 3O9BA 1K2BA 4K4PA 2VJ9A 5P8VA 2FS4A 2AIDA 5OZ1A 5P1VA 3HLOA 3LPIA 1RV7A 4FM6A 5OZXA 3TH9A 2QI1A 5ER1E 5P3KA 4JPCA 2QZLA 3RSXA 4Y4EA 2I4DA 2HS1A 5OYYA 1B6LA 4J5JA 4L1AA 1T7IA 1KJ7A 5AH8A 1Z8CA 3PMYA 3NXEA 4WY6A 1BWBA 3QS1A 5KR2A 3UCBA 4EXHA 4GJDA 3B80A 5P0ZA 1DMPA 5P0LA 5P53A 1RQ9A 5P28A 3OXXA 4FS4A 5BS4A 5P1DA 5P15A 3CKRA 5P6HA 3PLDA 1HVHA 1FG6C 3NYGA 3BUHA 1MT9A 1QBUA 4I0ZA 1A9MA 3URIA 3Q70A 2QMPA 2HM1A 5FIVA 5P0MA 5P4MA 2PH8A 5P13A 5P8NA 4QJ9A 1IZEA 2BKSA 3BGBA 1APVE 2ZHUA 2G22A 5P8JA 4ZSRA 2BPVA 5P0GA 5P6UA 5EZZA 3PWWA 5P1YA 1ODXA 3A2OA 2B42A 2ER6E 5OZ9A 4GJ8A 2WHHA 4Y5MA 4RVIA 3O99A 5P3RA 3BRAA 5P7LA 1GNOA 2QZKA 3LZUA 5P4VA 4YCTA 5P7OA 2I4UA 3OY4A 4GJ7A 2QD6A 4OD9A 5P1BA 3KFRA 4CP7A 4ACUA 3I2LA 3OTYA 2PYMA 1YTIA 4Y3EA 1D4LA 4F73A 3S53A 3INFA 5P12A 1GVXA 5P3AA 3O9IA 3T3CA 5P4CA 1QRPE 3PI5A 2IS0A 4NPUA 1FMXA 1HPXA 1K6VA 4H1EA 4Y3DA 4Y5NA 4D8CA 2RKFA 4DPFA 1EC3A 4B72A 3SA3A 4LBTA 5P5ZA 1IZDA 2J9JA 1SMRA 2MIPA 2F3KA 1GVVA 2ER9E 4A6BA 4Y4XA 3K5FA 3ZKSA 2NPHA 3TPRA 2ZJMA 4RCEA 5DR0A 5P3WA 5P4UA 3MXDA 5P8HA 5P7IA 5P4HA 3UQUA 2ZYEA 5F00A 3GI5A 4LL3A 5P34A 5P3NA 2JYSA 2ZHTA 4RVJA 5OYQA 3RSVA 4H3IA 2B8LA 5P4RA 2NR6A 4EQJA 3SA6A 5KR8A 3OQAA 3DM6A 5P8MA 4Y45A 1MESA 5P8AA 3OUAA 4J1CA 5P6KA 2V11C 4R8YA 3DV1A 2V00A 2H6TA 4CPSA 5AGZA 2WF0A 3SAAA 1NPVA 4DJXA 4APRE 3IAWA 3QAAA 3RU1A 5P8LA 1T3RA 1W50A 1MUIA 4YHQA 3RVIA 5P5HA 3SKFA 5P33A 3S2OA 3ZOVA 4Y35A 3R4BA 5P29A 4Y41A 5OZUA 5P58A 2HPFA 3O9CA 3UDJA 3S43B 1T6EX 5ISJA 5P5QA 1IZHA 5P1QA 3NDUA 3HVGA 3VYDA 3URLA 3K5GA 2P3BB 1VIKA 2QP8A 5P4ZA 2Q55A 4Y4BA 4GIDA 1FMBA 3TOHA 1ENTE 3HZCA 5AH9A 5C9FA 2G1SA 5P3PA 4AZYA 4Y4DA 4Y3AA 1LYAA 4DQGA 3KFPA 5P7DA 3IGBA 4OBZB 4FSLA 5P1WA 3PLLA 1SDUA 1W5VA 5P1LA 5P7AA 5OZQA 1B11A 1SGZA 4F76A 1MT8A 2VJ7A 2BJUA 5P2RA 3LZVA 1M4HA 4CKUA 3OXVA 4CMSA 3U6AA 1IVQA 5COPA 1SMEA 3HD8A 4Y3MA 4B05A 5P2ZA 3N3IA 7HVPA 1LYBA 2G1RA 2OHLA 3D1XA 5P1GA 3H0BA 4NKKA 1FG8C 2V0ZC 2WKZA 2V13A 4Y5GA 2A1EA 4YDFA 5P2FA 3SABA 1VIJA 1BXQA 4Y6MA 1BWAA 2G27A 2HB3A 3OQFA 1T7KA 5HU1A 5P57A 1KJHA 2FDEA 3EKTA 4YD5A 4YA8A 3KMXA 3T7XA 1FQ4A 1EBZA 1LS5A 1DP5A 4PZXA 5UPJA 2NTRA 3UDPA 2P83A 5P85A 1HHPA 2XFIA 4N00A 5P52A 2BPXA 1B6JA 6UPJA 2G69A 3OU4A 4K4QA 2HB4A 1HRNA 1MERA 2Z4OA 3VSWA 2HAHA 3UDHA 1XS7D 4Y50A 3PRSA 4ZIPA 5B18A 2FNTA 4ER2E 1LYWA 2NMYA 5P0XA 4QJ8A 1AVFA 5P0CA 5P7PA 5OZPA 3OXCA 5P7WA 4HA5A 3HVPA 2NMZA 9HVPA 4GJ9A 5P0WA 3WZ7A 5P5DA 2G26A 3VG1A 1HVKA 3HBOA 5P82A 3EKVA 3ZLQA 3I6OA 5P11A 5P1PA 5P1ZA 3SM1A 5P4NA 3SA8A 4EQ0A 2WECA 5P7EA 5P4YA 3VEUA 5AHAA 1EAGA 5P3IA 5P6BA 3EM4A 5P5SA 1FKNA 5P0HA 4Y3XA 1QBSA 5P6VA 4DJUA 5AH7A 2QAKA 4NPTA 5P0FA 3CKPA 5P26A 3OHFA 5I3VA 5OYRA 3ZL7A 5P42A 5IE1A 5P3ZA 5P3QA 1W51A 2ZJNA 1FB7A 3VLAA 3PWMA 5P6FA 4YBIA 1UH9A 1E80E 3VV6A 2P8HA 3R0YA 1W5YA 2IGXA 4DH6A 3SA5A 5P4EA 1QS8A 5OZOA 1G0VA 5DQ5A 4FRKA 2QI6A 2O4PA 2VA6A 4Z22A 4PHVA 4J1EA 2B8VA 1ZSRA 3DJKA 3PCZA 3IVIA 3UFNA 5P8UA 3GGUA 5P4XA 5P4WA 1MEUA 5IS4A 1AJXA 4J1IA 5P5NA 3L3AA 4RLDA 4B00A 2B7FA 2BBBA 5P8EA 3ZKGA 5DQ4A 1XL5A 5P3GA 4Y4ZA 5IVRA 2AOGA 5P4FA 3QIHA 3PBZA 5P2NA 5P38A 1FF0C 2WL0A 2H6SA 2QZXA 2QNQA 1EBWA 5P59A 5P3LA 3VYFA 1D4IA 2SAMA 3QRVA 4QJAA 4CPQA 5P08A 1LV1A 4FM7A 4TRYA 4D83A 2XYFA 3OXWA 2G94A 3CKTA 4BEKA 4ZEAA 3EL5A 5P1MA 5P1NA 4GJCA 4APEA 3PCWA 4YD6A 1HIIA 5KQFA 1IBQA 3OU3A 1FEJC 2O4SA 4DQHA 1MTRA 1ER8E 1ZBGA 4I0EA 5P8RA 5P0UA 1B5FA 3EL1A 1A8GA 4DFGA 4LXAA 5P8KA 5P5JA 2IQGA 1K6TA 2IEOA 3O9LA 3L5CA 1PPKE 4Y4JA 4ZPFA 2BPYA 4Y5AA 3LIYA 3R0WA 1XE5A 3TLHA 1FFIC 4YOAA 2Z54A 2XFKA 3OUBA 1PFZA 4RROA 4FE6A 1FQ8A 1HVIA 2BB9A 1HSGA 3LNKA 3VSXA 4Z50A 3PMUA 1B6PA 2AVSA 2WEZA 4RVXA 2OHKA 2Q63A 3GW5A 1M0BA 4OBDA 5P7ZA 3BHEA 2AZ8A 3S85A 4EWOA 1T7JA 1ZAPA 1LF3A 2NXLA 3D1ZA 3VYEA 5P80A 3OAGB 1GNNA 3LIVA 4LXKA 2R38A 5HE7A 2QI3A 2AOJA 3WSJA 3NU4A 1DAZC 4ER4E 2QNNA 5JFPA 3ZKNA 1TSUA 4Y43A 3UDYA 3UFLA 1EC1A 3K4VA 1IDAA 1IIQA 5P1AA 1CZIE 1YG9A 4B0QA 5P56A 5DR3A 3IN4A 4CPUA 4RRSA 5P75A 4Y3SA 2EWYA 2P3DA 3L5FA 4OBGA 5OZWA 5IVQA 1EC2A 2WJOA 4U7VA 4Y5EA 5AHCA 4NJVA 3OADA 2VA5A 2VNNA 1YTHA 4J0ZA 5COKA 5P03A 2V12C 3VFBA 1HVJA 1EPQE 3PEPA 4Y39A 5DQ1A 1JLDA 3S8IA 4DV9A 4QJ7A 5P23A 4YBFA 4OC6B 2QI7A 5P3MA 1ZTZA 2BPZA 4DVFA 2HIZA 2RKGA 4LP9A 3KDDA 1SDVA 4L7HA 2VIEA 1NSOA 1SP5A 5P3UA 4RYCA 2F3FA 3G70A 5P0SA 5P4LA 4I8ZA 5PEPA 4J1HA 1KZKA 5P7TA 1YM2A 3LIXA 1MRXA 4FRIA 5P1UA 4B1CA 4HEGA 5KR0A 4AMTA 2I4XA 5P2EA 3SLZA 5P7QA 3I8WA 2UY0A 4Y3YA 4Y5BA 5P1SA 3WB5A 3H5BA 2QD7A 3O9AA 1C6ZA 5I3WA 4QLHA 4Y53A 1GVTA 5P1JA 5P3DA 5P2AA 4Y3QA 2ZJIA 2JXRA 1TZSA 4Y54A 5P0KA 2APRA 5I3YA 5P6IA 4ZPGA 3OUDA 1KJFA 2O40A 5P5EA 3CYWA 1KJGA 5P2KA 4MC9A 4Y58A 5BWYA 4R93A 4Y56A 1E5OE 5OYUA 1FIVA 1W6IA 3WZ8A 3EXOA 2G1OA 4DJVA 1HPVA 5OZ5A 2IKOA 4JP9A 4HLAA 1K1TA 4EXGA 2FXDA 2JJIA 2OHQA 2PK5A 5OZBA 4FIVA 3G72A 4B1EA 3VV7A 5SXNA 4A6CA 4Y3LA 5P3VA 1HTGA 2AOHA 4TRZA 5P2VA 5P7VA 4JPEA 5P3CA 2B7ZA 4DQBA 4Y3FA 5CONA 4D89A 4JECA 3QI1A 1C6YA 3Q4BA 3DOXA 3DCRA 2I4WA 5OYVA 3ZKQA 4ER1E 3OHHA 1BVEA 5OZVA 5P50A 5P6MA 5P83A 2G1NA 4KE1A 5HCTA 3LZSA 4Y51A 5P0NA 5P4GA 5OZJA 4Y3PA 3CIDA 5P22A 5OZNA 4ZE6A 4I0FA 2IGYA 5P2BA 2FGVA 4L1AB 1NH0A 3O9GA 4OBFA 1LEEA 1K6CA 1KJ4A 4Y3NA 5P47A 3K5CA 3MSLA 5P8TA 2QI4A 5P18A 5OZSA 4CPRA 3INEA 5OYZA 5IVTA 5C9BA 5P24A 3TPJA 4BELA 3KYRA 5P6CA 1W5WA 1ZPAA 5P6TA 5OZEA 3LITA 5P2GA 5P5IA 2AOIA 3NU6A 1PSNA 5P62A 1GVWA 3ZKMA 4ZPEA 3EM3A 1TW7A 3SA9A 4BFBA 4HDFA 4DQCA 4Z2ZA 1APTE 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FKT A;  5P6D A;  5P6Q A;  4AUC A;  4B70 A;  3Q6Y A;  2XYE A;  3TL9 A;  3NWX A;  5P88 A;  5P7B A;  3EL9 A;  1B6K A;  2R5Q A;  4Y48 A;  5P3X A;  1BBS A;  3APP A;  4RGH A;  5P05 A;  5P5G A;  2PQZ A;  4DJY A;  2CEM A;  2FGU A;  1SGU A;  3PSU A;  5P76 A;  5P8C A;  1MPP A;  5P7S A;  2R3T A;  1BAI A;  5P3Y A;  1PSO E;  5DQC A;  5P6P A;  1HTF A;  2IKU A;  3NDT A;  4DJR A;  4QGI A;  3UDR A;  5P41 A;  1HVC A;  3OQ7 A;  1HVS A;  1MTB A;  5HVP A;  2HS2 A;  3APR E;  1SDT A;  5P4B A;  5P7U A;  1Z1R A;  1YX9 A;  1EBY A;  3N4L A;  3DUY A;  2OHT A;  5KAO A;  5P0Q A;  2NNK A;  1FMU A;  4LHH A;  5P4J A;  5KOS A;  5P4T A;  4PEP A;  5P6E A;  5P0D A;  2FMB A;  3SM2 A;  2R5P A;  3BXR A;  5P5L A;  1GKT A;  1EPM E;  3CIC A;  3U7S A;  2FXE A;  3ZMG A;  2Q3K A;  3VUC A;  5P2W A;  5P3T A;  4I11 A;  4XX3 A;  1B6M A;  3FNT A;  4H3G A;  5P5O A;  4L7G A;  3IXK A;  3EKQ A;  3OGP A;  5P49 A;  2R43 A;  3ZPT A;  4NJT A;  2PWR A;  1HPS A;  2AVV A;  5P8G A;  5ER2 E;  3QPJ A;  4Y36 A;  5P79 A;  4NJS A;  2I4V A;  1EBK C;  4L7J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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