2A75A

Trypanosoma rangeli sialidase in complex with 2,3- difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
634
structure length
632
Chain Sequence
MASLAPGSSRVELFKRKNSTVPFEESNGTIRERVVHSFRIPTIVNVDGVMVAIADARYETSFDNSFIETAVKYSVDDGATWNTQIAIKNSRASSVSRVMDATVIVKGNKLYILVGSFNKTRNSWTQHRDGSDWEPLLVVGEVTKSAANGKTTATISWGKPVSLKPLFPAEFDGILTKEFIGGVGAAIVASNGNLVYPVQIADMGGRVFTKIMYSEDDGNTWKFAEGRSKFGCSEPAVLEWEGKLIINNRVDGNRRLVYESSDMGKTWVEALGTLSHVWTNSPTSNQQDCQSSFVAVTIEGKRVMLFTHPLNLKGRWMRDRLHLWMTDNQRIFDVGQISIGDENSGYSSVLYKDDKLYSLHEINTNDVYSLVFVRLIGELQLMKSVVRTWKEEDNHLASICTPVVPATPKGGCGAAVPTAGLVGFLSHSANGSVWEDVYRCVDANVANAERVPNGLKFNGVGGGAVWPVARQGQTRRYQFANYRFTLVATVTIDELPKGTSPLLGAGLEGPGDAKLLGLSYDKNRQWRPLYGAAPASPTGSWELHKKYHVVLTMADRQGSVYVDGQPLAGSGNTVVRGATLPDISHFYIGGPRSKGAPTDSRVTVTNVVLYNRRLNSSEIRTLFLSQDMIGTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords sialidase
publication title Structural and Kinetic Analysis of Two Covalent Sialosyl-Enzyme Intermediates on Trypanosoma rangeli Sialidase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma rangeli
total genus 181
structure length 632
sequence length 634
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2a75A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2a75A01
1V3CA 1XQNA 1W6QA 5AVAA 1WD3A 3WHTA 4RA0A 1R1ZA 2W39A 4GWNA 1E8VA 1WW5A 4XIKA 4MZAA 4GZOA 2HT8A 2A3WA 2ZGUA 2A75A 1YRZA 2DTYA 3V0BB 1MS5A 2H0BA 2JJ6A 2GALA 4DQAA 1PZ7A 4HZWA 2VW2A 4K21A 2A70A 1W6MB 1SCRA 1B9VA 4KS4A 7NN9A 4Q2FA 1SNTA 5GLWA 3AK0A 1LESA 2DUQA 5CAZA 3K38A 3M3EA 1NSBA 4WVVA 4XJQA 4Y22B 4U36A 5NN9A 1KJLA 5EYXA 4Y24A 4FOWA 1JW6A 3O5SA 3BEQA 4K1HA 3GNEA 3VKLA 5GLVA 2E7QA 2VVZA 5E89A 1C4RA 4YLZA 3D4KA 4BOWA 1DGLA 2DV9A 3MW3A 4GZPA 1EUSA 5IUQA 4GKXA 3NV4A 1OFSA 2QWBA 1YXWA 1DLLA 1FX5A 2RHPA 3U4XA 1W0PA 5DZGA 2LTNA 2CWSA 4XJ9A 3WDWA 2V73A 1H9PA 2ZGOA 2DU1A 2A6YA 4QNPA 3D11A 2NZ9A 3IN9A 4FQZA 3SANA 1INYA 5JOWA 4MJUA 1CVNA 1WW7A 4AVTA 1DYKA 3SALA 1WUVA 2ZGKA 2YA6A 2YA4A 5GLZA 1DIWA 4YW5A 4YGBA 1LJ7A 3ILNA 4KS5A 2P3IA 2A5ZA 2A3YA 4UF7A 3AP4A 1ONAA 3LSDA 1Q8OA 1V6MA 4P9XA 1IS6A 2EF6A 3POWA 1XOEA 3R4UA 1ULEA 1GBGA 2DUOA 1INWA 4H55A 4LBOA 4ISQA 1N3QA 1E8UA 4H52A 1LOEA 2CL2A 2UU8A 1HQWA 4WZFA 2ZGMA 4JC1A 3T1MA 3APBA 4AGRA 3R4SA 5GM0A 1W6PB 1J1TA 2G4IA 5E8AA 2R1BA 3AYCA 3WCSA 2EXKA 4CPOA 2EIGA 3TI6A 3ZXLA 3GVJA 1MZ6A 4Y1YA 1S0CA 2PHUA 3OBTA 3W09A 3SLIA 2WSUA 2PHRA 3FUQA 3M3QA 3OJBA 5GJ6A 4Y1ZA 2VSKA 4CPYA 4GZQA 4LBQB 5GLUA 4M4VA 2WKKA 3A4UA 1ULGA 2ZBJA 2CWMA 2F11A 1DQ1A 3IPVA 1OKQA 2ZGSA 2WT1A 5JLVA 3PVEA 3O0XA 2GNBA 3RG0A 3ZXEA 2P3JA 4ISRA 4FOVA 1ULDA 1JYCA 6NN9A 4HZVA 2W38A 1Z4ZA 3M3CA 1Q8PA 4JCKA 3AX4A 2DWRA 1AXZA 3AP7A 4DRRA 4WA3A 2BQPA 4YZ2A 1VCJA 2A7AA 1W21A 4K1YA 4WA4A 4ATFA 1G9BA 3LSEA 3WLUA 1GZWB 4Y1VA 1DQ2A 1AX1A 2HU0A 3AZVA 5CA6A 1DQ0A 1VCUA 1IVFA 2F10A 1EUUA 4QN3A 1W6PA 1CPMA 3IM0A 2SIMA 2YA8A 3Q9OA 3ALXA 4QN6A 1FV3A 3VKNA 2R1DA 4GEZA 3RMYA 5HUNA 2CTVA 1QU0A 5DUWA 2HT7A 1UZYA 2D6MA 1GSLA 1BJQA 4ITCA 4XBNA 1YI7A 1XOGA 3KM5A 3BOPA 2DVBA 1CONA 4FPKA 4CPLA 2HYKA 3AXEA 3V0AA 4MWWA 1ZA4A 3AJZA 5JMCA 1V3EA 3JUUA 1IS5A 1IVDA 4FJ6A 3A0KA 3NWKA 1WW6A 3N36A 2V5YA 4M4NA 1S0EA 1C1FA 4PQ9A 3W59A 3H72A 1A14N 1A3KA 1NCAN 1G8WA 4AWDA 4K1JA 2ZKNA 4GXLA 2D44A 1W6NB 5DUUA 2B7YA 2CNAA 2HTRA 3UK9A 4Q26A 1QDCA 1FV2A 4AYUA 2W5OA 3USUB 1LOGA 1LTEA 4YG3A 2XZIA 4BLJA 3AJYA 3WDVA 1G9CA 2D6OX 3AFKA 4Q27A 3H0OA 3OY8B 1Q8SA 1H30A 4XJAA 4M00A 4M01A 1HLCA 1LODA 5HCFA 4C1WA 2E7TA 4FOYA 4XILA 1NCBN 2DVDA 5H9QA 2SBAA 1F8CA 3OGGA 1A4QA 5B2CA 4JF7A 1AX2A 5CB7A 5T54A 2YMZA 2NN8A 1SACA 5DZEA 4K20A 4GDIA 3D5OA 1GKBA 3R05A 1AJKA 1V6OA 4W65A 1DHKB 2W5NA 3AYDA 4KBBA 3ILFA 4CPNA 1D2SA 2YDTA 2VY0A 2QWGA 2HTVA 3HN1A 1C57A 4MWJA 1DZQA 2OVUA 2HTUA 2QWFA 1JHNA 2FMDA 2PHFA 1QOTA 1JOJA 4D8SA 2D6NA 3M3OA 4GZXA 3NV3A 1GYKA 3CKZA 3UJOA 1CESA 1GLHA 1W0OA 2ZA9A 4SLIA 1W6NA 3POYA 1Y7BA 1B09A 2UWCA 2P3KA 4XIOA 5DG2A 2ZGTA 3AYEA 1FATA 1AVBA 1BQPA 2VXRA 1NMCA 2QWEA 1V0EA 4XOGA 4MWLA 2QWDA 4XDQA 1SLAA 2C4LA 4ZXKA 1USRA 3CNAA 4YZ3A 2GN7A 2R0FA 4LBJA 4DS0A 5DXDA 1IVEA 2I2SA 1LEDA 1TEIA 3ZVXA 2UWBA 1KDKA 1NNCA 3CYEA 1Z50A 1G9FA 4U2AA 3VUOA 2YZ4A 2DU0A 1S0GA 1UKGA 1NSCA 2YA7A 1CQ9A 1L7FA 1L7GA 4HZXA 4YGEA 5T50A 4JRAA 1RIRA 5GLTA 4WEFA 3JU9A 3O0VA 5JDBA 4XHBA 2A6WA 3VKFC 5DUVA 1LHNA 2ZHMA 2QWIA 4NCSA 4IQPA 5IK7A 1IS4A 1CN1A 4MYEA 1ZM1A 1NN2A 2D6PA 4M3CA 4BQ1A 4CPZA 2HTWA 2Q5TA 4WA5A 1LGNA 1QMJA 2QWKA 4MZEA 1LU2A 3FUOA 4YM1A 1Z4XA 2WJSA 3TI5A 4HZYA 1OQ1A 2D7FA 1V6IA 4XYXA 2VWDA 1Z78A 2HTQA 1V2IA 1IKQA 4FZHA 5GZEA 1IS3A 2E53A 4BLIA 1S0JA 3V0BA 3H71A 3TAYA 4F83A 2Z42A 1V6LA 1RINA 5DUXA 2W20A 4P9YA 2DUPA 2ZGNA 1W6MA 1ULCA 1INXA 5DG1A 1FNYA 1QKQA 1UL9A 4YFZA 2CY6A 2GN3A 1F8EA 2WLQA 4B7JA 5H9SA 3N3HA 2E51A 1WCSA 4Y20B 3H73A 3POSA 1LOCA 4FPYA 4Y22A 1F31A 3AP5A 4XJ8A 1SO7A 1AZDA 2UWAA 1BKZA 2ZGRA 2C4AA 1LOFC 5GALA 4FPOB 3AP9A 3WV6A 1WD4A 1F5FA 1Z4WA 2WQZC 2JD4A 4LBKA 1LOAA 5KXBA 3SH5A 5HCAA 4GZTA 2EAKA 3ZYRA 4YW4A 3WZ1A 1YIFA 3FLTA 3OPZA 3VKMA 2A6ZA 3RS6A 1O4YA 4GB1A 1V6JA 2ERFA 3M1HA 5IK8A 2VH9A 2F29A 4GZWA 1MZ5A 1MACA 1SFYA 1QDOA 3AXDA 4H53A 3FBYA 1CR7A 3MW4A 3JU4A 5T5PA 1IVGA 3SISA 4X49A 4XJZA 4FOQA 3O0WA 1SBEA 2D3SA 3W58A 1APNA 2P34A 3HMYA 2CYFA 1INGA 1KJRA 3N7JA 3MEPA 2GNMA 4R9BA 1V00A 3K36A 1SBFA 4FVVA 1QNYA 1UAIA 3ZSJA 2BATA 2EXJA 4I30A 4XMAA 4YGCA 2XCYA 1N1TA 2OUJA 5T55A 1AXYA 3A72A 2XB6C 5KXDA 4XHXA 3SITA 3INBA 4KS1A 4CTEA 2YROA 1JUIA 2ZHNA 3BODA 1S0DA 3AZXA 4YZ4A 1LECA 2EALA 1V3BA 1V6KA 2KM2A 3O12A 3OYWB 2PELA 1S0BA 2C9AA 3RMXA 3IMNA 2OW4A 1W8OA 3ENRA 3ZXFA 4PCRA 2LALA 2ZMKA 5DZFA 4GWMA 5IT6A 3K39A 2X9MA 4HIZA 1SLCA 4LBLA 2BF6A 2ZHKA 1A8DA 3WDTA 1NNBA 3RRDA 4MWUA 2C5DA 4R9DA 3O9KA 1HQLA 1G9DA 2OUHA 4LBQA 3GALA 1MS8A 3IKWA 1NLSA 1W6OB 1YO8A 4XBLA 4Q1RA 3MW2A 3B3QE 2VK6A 1IVCA 4AGGA 4M3CE 2JE7A 4Q8LA 4LBQD 1LOBA 4WEGA 1G86A 3AZWA 3B00A 3H6JA 2ZB6A 4QN4A 5BYNA 1X50A 2ZHLA 2QWJA 3ZSKA 5CBLA 1YYNA 4X4AA 2GNTA 3TB0A 3NN9A 5F5QA 3V65A 4YZ1A 3K3AA 4YFWA 2ZB5A 3VV1A 1Q56A 3AYAA 4YG6A 3SH3A 5JYYA 5M1ZA 5EXOA 2AUYA 4D69A 4BBWA 2BZDA 2D3PA 2JECA 2ZZJA 1GZWA 1FNZA 1F8DA 4ZKTB 3BTAA 2ARXA 4FPEA 1GANA 4NN9A 3GVLA 2YXSA 1W6QB 5GZDA 1FYUA 4GA9A 1SLBA 3SNMA 2ARBA 3INAA 2FHRA 4PBOA 1BJIA 1DBNA 4Q6KA 3PVNA 2DVFA 2GNDA 1WCQA 1INVA 4LBNA 2AENA 2YV8A 1DYPA 1L7HA 4C1XA 5E88A 2XG3A 1NCDN 2WSVA 1MS0A 3FLRA 4YW3A 2EXHA 3T1EA 4R9CA 3WG2A 4FP2A 3ATGA 2W52A 5SV8A 2UURA 2NMNA 2BERA 3WNXA 5HCBA 1GV9A 5JOZA 1LENA 1NSDA 4RL7A 2R49A 2ENRA 2ES3A 1QOOA 1QGLA 1SCSA 2A71A 4X6KA 1CPNA 2YA5A 2VUAA 4XJUA 3WDXA 1EPWA 1Z0HA 3TIAA 3USUA 2RKCA 3WHUA 1ENQA 1LOFA 5GZGA 1LGBA 1V6NA 1NCCN 4BMEA 1MS1A 2AEPA 1KITA 1V0ZA 3D6EA 3OY8A 1KDMA 1S0FA 2JDZA 2ZMLA 1IVBA 2PHTA 3PJQA 2JE9A 4AGVA 2WNEA 4XXAA 1CIWA 3PMEA 2F24A 4B7QA 2VK7A 1AF9A 3PVOA 2D6KA 2PHXA 1U0AA 3AP6A 2SILA 1QOSA 4TYSA 3I8TA 2VSMA 1UZZA 2QWAA 4P9WA 1F9KA 5HUMA 1V3DA 1LEMA 3N7KA 1VAMA 1W8NA 3OBRA 4XJWA 2VK5A 2VU9A 5H9RA 2R16A 3NV2A 1G7YA 4Z8BA 3B9CA 2F12A 4WVWA 2NM1A 1HDKA 2DVGA 1MS4A 1USXA 3SILA 4B7RA 3I4IA 3ASIA 1IKPA 5B2DA 4AVSA 2B8HA 4HZZA 1MVEA 4L8QA 4FQ4A 2ZGLA 3WDUA 4MWVA 2P2KA 3ALWA 1W1XA 2XZKA 4NC5A 2QWCA 1MS9A 1JXNA 1LULA 4XMIA 2VW1A 3HR9A 1B9SA 3N7MA 4YZ5A 1I3HA 3MPPG 2DYCA 1Z4YA 1N47A 1Z4VA 3FFZA 1SBDA 4BMBA 3M2MA 1RITA 2VW0A 3AZYA 1GZCA 1BXHA 3ZXKA 2AYHA 3TICA 2NMOA 4QN5A 1KQRA 4X47A 4DPNA 2F25A 1BZWA 3TI8A 1JBCA 1LHUA 1UPSA 4FPGA 1AX0A 4XTMA 1VLNA 5H9PA 1B9TA 1N1VA 1WLWA 1AXKA 2PHWA 3BIWE 3ILRA 3IPVB 1N1SA 4FPFA 4CZSA 3NSSA 2JKBA 4WV8A 1V0FA 4DRVA 1MVQA 1DIMA 4YG0A 1BYHA 3WCRA 4MC7A 3ZPYA 1LHVA 4YGDA 2AH2A 1QF3A 2NYYA 1F8BA 4NOTA 4AVVA 1W20A 4HANA 1LCLA 1WW4A 4UW3A 2W68A 4NO4A 1NMAN 5T5JA 1C1LA 1UMZA 1CJPA 5EWSA 2QWHA 4FPLA 4KS3A 1ULFA 5JOXA 5JOYA 3V64A 3A71A 2ZGQA 5HUGA 2D43A 4ASMB 2ZACA 3TI3A 3ZXJA 1O4ZA 4GALA 4LBMA 3WUDA 2E6VA 2HTYA 1SLTA 1LHWA 4K1KA 3A0NA 1VALA 5L73A 3T1LA 1DQ4A 4M4UA 1HKDA 5IK4A 2AGSA 1H9WA 1WBLA 3DUIA 1GNZA 1SLLA 3LCPA 4MWYA 4FPHA 3ZSMA 1UN1A 5LK5A 3GVKA 2ZABA 2DURA 2A3XA 3WG4A 1G9AA 4MWRA 3CL2A 3V0AB 1DILA 3L2YA 4Y20A 4FVKA 3WDYA 4GJTA 4GKYA 4YM3A 3CL0A 3O9JA 4MX0A 4HL0A 2F26A 4UW5A 3C2UA 4PF5A 4M3MA 1GNHA 2A6XA 5JVVA 4TZDA 1URXA 3TI4A 1E8TA 5KXCA 5GZCA 1A78A 2CMLA 1MR5A 4PBPA 2DTWA 5T52A 3D12A 3AZZA 2AEQA 3N7LA 1KRIA 4B7NA 4FPCA 4Y1XA 3ZYPA 1FAYA 1LHOA 1N1YA 2AR6A 3DGTA 1ENRA 1MS3A 2WT2A 4OZXA 4MJVA 5T5LA 2F28A 1JN2P 1DFQA 4KS2A 1I1EA 1S0IA 4MWQA 5F9TA 2AREA 1WLCA 3SH4A 4CPMA 1N3OA 2F0ZA 2A6VA 1NNAA 3UL2A 5IK5A 5HUKA 4Y26A 5FRAA 4BM8A 4XZPA 2YY1A 1VAVA 1LGCA 3T2TA 4UW6A 3NV1A 5KXEA 5HX0A 1A4GA 1QNWA 1WBFA 3WG3A 2F13A 1N3PA 4YM0A 5EYYA 3WG1A 4ATEA 4DFSA 4Q1PA 2D6LX 2SLIA 4XBQA 2W08A 2D3RA 4I00A 4BPZA 3TIBA 1INHA 5T5OA 4R9AA 1SLIA 1JYIA 4XE9A 2YDPA 2WT0A 2GMEA 3OYWA 1INFA 4FPJA 4YW1A 1PZ8A 2NP0A 4Q8KA 3B7EA 2GMPA 1Q8QA 4Y1UA 4K1ZA 4GDJA 2ZGPA 1EURA 4XXPA 4FP3A 3N35A 4DGRA 3FLPA 3K37A 3UJQA 4M3CF 1PZ9A 2GMMA 4B7MA 4K1IA 3ZSLA 2ZMNA 1NMBN 3QCWA 1MWEA 5GZFA 4K3YA 3RSJA 2DVAA 1W6OA 4XTPA 1DQ5A 3QLQA 2TEPA 3WVJA 3RQ0A 1EUTA 3B69A 4YW2A 2F27A 1GICA 4XJRA 5CNAA 2R0HA 4P14A 4CRQA 1S1AA 2HT5A 1LU1A 4YM2A 1IOAA 2P37A 2EXIA 4QN7A 1ENSA 1GZ9A 1Q8VA 1WLDA 2ZAAA 4UW4A 1D0HA 1NXD1 3B01A 4M3CB 2XZJA 1AJOA 3WUCA 1DQ6A 5FREA 2GDFA 2HU4A 1VIWB 1UX6A 3KQRA 4J9TA 4GZSA 3WOGA 3VKOA 4MWXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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