3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
2MLLB 3CAHA 4LBLA 3BAHA 3IAGC 3WG1A 3N7LA 1AJKA 1MS5A 2R0FA 5EWSA 3TAYA 3QW8A 3AXDA 3INAA 3CA3A 3Q7YA 1CQ9A 3ZSKA 4GWMA 1DJSB 4LO3C 3O12A 3PG0A 3IN9A 3D4KA 1QGLA 4XMIA 4QBVA 4IZXA 1FAYA 1GGPB 1MS4A 1AVWB 1AXKA 1W6MB 2GNMA 2ZHMA 5BQNA 4KC3A 2A5ZA 1JN2P 3B9UA 2ET2A 2NM1A 3D7WB 1DFCA 1Q8QA 4RA0A 2AYHA 4MYEA 3BOKA 1MS9A 1RY7A 2CYFA 2ERMA 4K21A 4CRQA 2KLLA 5E88A 4Y1YA 1WBCA 4YGDA 2DRYA 3DSEA 1W6PB 2JE9A 2UWCA 1DZQA 2XHLB 4IQPA 1S0EA 4AN7B 2EF6A 3NWKA 5JVVA 3T1MA 2AQZA 3OGGA 3R4UA 1YYNA 1LOCA 1IOBA 1G86A 3OYWA 2GNTA 4Z8SB 2F2FA 1GZCA 1UPSA 3P6JA 3WINA 4AVSA 1K5UA 2A6YA 3ASIA 4AWDA 1M16A 3DEBA 1GNZA 1YI7A 2HZ9A 1CIWA 2ZGMA 3QW7A 2P34A 2AXMA 1QF3A 1QXMA 4L4IA 1LHNA 3WLUA 1X50A 4DRRA 4JCKA 4YW5A 2DRZA 3O4OA 3AP5A 4XHXA 3W59A 1W6QB 1GKBA 4KS6A 3H6QA 1QOTA 4XJWA 4OW4A 5JOWA 2D6OX 4J2YA 3D3XA 1QNYA 3ZYRA 1YRZA 4L4HA 4HANA 4AYUA 4LBOA 4X38A 3A21A 1NXD1 3OJ2A 1SFYA 2WQZC 1CESA 4YG0A 4QALA 1VALA 1XTGA 3BRGC 2DYCA 2D3PA 4I8MA 4M3CA 1WW6A 1QQKA 3AP4A 4OEFA 1CN1A 3EF2A 1R1ZA 2CWMA 4ZLBB 2GALA 3AFKA 3KQRA 1ULEA 1YXWA 4A7ZA 3FIEA 1HKNA 4Q9PA 4Y1VA 4QC4A 3H6RB 4I2SA 2ZABA 1HDKA 1LU2A 1LHOA 1G8WA 4GKXA 3RMXA 3N7MA 3UD7A 2KH2A 3CA4A 3M2MA 1I3HA 2DTYA 4HR6C 4EL4A 3WA1A 2ZGLA 2AENA 3WCSA 1KRIA 2B7YA 4FPJA 1AVAC 2HWMA 1ZKXA 1ABRB 4YW2A 5I1BA 5T54A 1WUVA 3WG3A 2OUHA 4JPZA 2DWRA 4OWLA 4DRVA 1ISVA 2E51A 1MVEA 2Q3NB 4R9BA 4EB2B 2VW0A 5GZGA 4ISRA 3Q9OA 4I4XA 2YROA 4XTPA 3FJ9A 1FV2A 3A23A 2JE7A 4HA2A 3OBRA 4WVVA 2D1ZA 4P0KA 1HWOB 3H6SE 1KJLA 1AZDA 2D7RA 1BYHA 2ZHNA 1KQRA 1LOGA 1FMMS 1ONAA 1BARA 1W6NB 2L5XA 2A6ZA 2DVFA 3I2AA 2W08A 5DZUA 1BFFA 5HCAA 5GALA 2R1BA 4IY8A 2E4MA 4I4OA 2XB6C 4FPOB 4I0YA 3ILRA 4FPYA 5F8YA 5GZCA 1PC8B 1S0LA 1ISXA 3NBNA 1UAIA 5FZYA 2PELA 2UU8A 3RG0A 4XJ9A 3IPVA 2CTVA 1UL9A 1GNHA 1YVGA 1Z7HA 4Y20B 3VKOA 3PUBA 2ZMKA 5GAQA 3E8LC 2D6NA 4D0ZA 3HR9A 3O4DA 1S0BA 2ZGRA 1QKQA 3APBA 1FMZA 1N1TA 3A07A 2V73A 3PVNA 4XKIA 2XOAA 5L73A 1Q03A 3WMVA 4LBKA 2BQPA 2DV9A 4Z8BA 1F5FA 4FP3A 4YM3A 1IKQA 1EYLA 4NOTA 3FUOA 1AX1A 5BQMB 3DDBA 3WO4A 5EYXA 1IJTA 4Q2FA 3RMYA 4YFWA 3QW5A 1HWMB 5HPZA 1URXA 2CY6A 4I4VA 4I4QA 3ZXGA 3ENRA 4R9CA 3C9ZA 1EV2A 1V6VA 2ZAAA 3OY8B 5DZEA 2QN0A 4XOGA 3VKMA 2RSTA 1C57A 4GAFA 2D3SA 1V6LA 1V6WA 2E53A 5CB7A 2ZMNA 1QU0A 4XXPA 3WO2A 2D23A 3ZSMA 3OJBA 2DVDA 1PZ7A 3V0BA 4X3AA 1CJPA 5T55A 2A8AA 2FGFA 1WLWA 4JC1A 4ISQA 2HWAA 1DZCA 1FN0A 1T4QA 2XG3A 2GZBA 4ZBVB 1N1SA 3A0KA 4YM2A 1Q8SA 3LSEA 1DFQA 3N0KA 2GN3A 3MPPG 5E8AA 1JXNA 2IHOA 4XHBA 5EG6C 1II4A 3I29B 2KM2A 2OUJA 5GZFA 1BXHA 2A71A 2JKBA 4RL7A 1XQNA 3QW6A 1C4RA 5T52A 3BAGA 3HN1A 4A7YA 1ZM1A 2VUAA 3O49A 8I1BA 2E6VA 3W58A 3AZYA 3CRGA 3UDAA 2F2FC 4QKRA 1N3OA 2A3YA 4TYSA 4XIOA 3WINC 3WO3A 1MACA 3BRFA 4YGBA 1Y7BA 1PZ9A 5FNWA 1AX0A 3OPZA 4GWNA 4QBCA 4G6MA 1V00A 4D8HA 4FPLA 1R8OA 1BFGA 1LOFA 1GZWB 4FPEA 2MC2A 2IMAA 1JLXA 2A75A 2UWBA 1WLCA 2YXSA 3PMEA 7I1BA 4LO8B 3B00A 2OVUA 3R05A 4X37A 3M3EA 1LULA 3BOOA 3ZC8A 2ZMLA 3USUA 1W6MA 4OWKA 4I4SA 4UW3A 1AXMA 2WRYA 3UJQA 1RMLA 4BMBA 2G4IA 3BONA 2Y9XE 2A3XA 5DSSB 2YUGA 2EXJA 1W6PA 4W65A 1V6UA 1Q8OA 4QO3A 4R9AA 1UMZA 3FJBA 1LOBA 1ULFA 3IIRA 1WCSA 2C5DA 1NLSA 1BA7A 3CA0A 3GALA 3VT2A 4BOWA 3DS9A 1NUNA 1D2SA 2W2DB 5KXBA 3VSFA 2Q5TA 2ZGOA 1JT4A 4JAWA 3WNXA 1RZOB 2FPQA 1TWMA 1N1VA 1SCSA 3WHUA 3R4SA 4WZFA 3V0AB 3QIZA 1N1YA 3ZYPA 2VSAA 2G7PA 1DQ4A 1ZKWA 3FJFA 1YBIA 31BIA 3FJIA 2VW1A 3BIWE 4OZXA 1QDOA 1PZ8A 1K5VA 3A0NA 1RITA 1W6QA 1J0SA 1RIRA 1B09A 4JP0A 4C1XA 3AXEA 3HBWA 3NBDA 1HQLA 4P0LA 4K1YA 2IWTB 1S1AA 1PUUB 21BIA 4YZ4A 2DUPA 3C8BA 4NO4A 3MEPA 3TB0A 2ERFA 1WBFA 3BADA 1CPMA 2PHWA 2M49A 5T50A 4M00A 1GYKA 3UJ0A 2DUOA 3AJZA 1MS3A 1V6JA 3BB2A 2E4MC 1SBDA 2CNAA 4QKSA 4WV8A 3WG4A 4G9MA 4PCRA 1SLCA 2VH9A 3FLRA 1S0DA 1GSLA 1DGLA 3H6RA 3NV1A 5HCFA 1SR4A 1LGNA 1ISWA 1AJOA 2C9AA 1DQ6A 4ZFUB 1JW6A 2VXRA 3U4XA 3ILFA 1TWEA 4OWJA 1IKPA 1N47A 2A6XA 2GMPA 4P9WA 5IUQA 5FZZA 1SLLA 1JQZA 1G9DA 4KEKA 2EXHA 1MS8A 1N3QA 3ILNA 5D63A 5BQUA 4LO1A 4XYXA 3WDWA 1G7YA 4BQ1A 4I30A 1R8NA 4LO7C 3RTIB 2IMCA 3MW3A 1Z4SA 4HJJA 2MIBA 4BLIA 2BFHA 3ZURA 2AUYA 1F9KA 1Z2VA 2ZHKA 4U2AA 2DREA 1WD3A 4FP2A 2PHFA 4TZDA 4Q8KA 1I1BA 4AN6A 4YW4A 41BIA 2D6MA 2VU9A 1Q04A 4LO2A 3OJMA 3BTAA 1W6NA 1ENQA 4IYBA 1SLTA 3AJYA 2D6LX 4Q1PA 1DQGA 4R6UB 3CRHA 3UD8A 4JKXB 4YOLA 1G9CA 2JD4A 1I1EA 3CA5A 5D62A 5F90A 1PUMB 4DFSA 3FJEA 1DYKA 3NV3A 2D44A 3H0OA 3QIYA 4AVVA 1VIWB 2X2SA 3OYWB 5BVPI 1FX5A 3K3QB 3WUDA 2D43A 1ZA4A 3ZC9A 3NJ5A 1IRPA 3ZSJA 4CZSA 3SNVA 2E7QA 2P37A 3S8JA 4Y20A 1AVBA 2D7IA 2G7KA 1YIFA 2R0HA 1WBAA 4I7IA 2NN8A 3WV6A 2ZGPA 1F31A 2FFVA 1WW4A 1QOSA 1DQ2A 1CPNA 2R16A 2F8XC 5JMCA 4LO3A 2GO2A 4BPZA 1CE7B 2EXKA 4XTMA 2E7TA 4GXLA 4X39A 1G9BA 1PZZA 1Q56A 2DU1A 3PHZA 1V6IA 5BQMA 1LU1A 3JU9A 4YZ1A 5EHAA 5GZEA 3V64A 1AXZA 1UZZA 3N7KA 5F8WA 4G9NA 4FGFA 4Y24A 4FOYA 2AAIB 3D6EA 4LBQD 1FWUA 1TIEA 4DPNA 1W6OB 3OY8A 1FQ9A 2GN7A 1LOFC 3OBTA 4ATEA 3BAVA 3VV1A 4EFRA 1IILA 3WG2A 4ZJXA 1IRAX 3ATGA 1DQ1A 1QMJA 5H9SA 1BQPA 1LODA 1FGAA 5D61A 2CL2A 2G7NA 3SLIA 4YFZA 3P6IA 1CVNA 3BWIA 1LEDA 4IHZA 1Z78A 2ARXA 4Q91A 3V79C 2G7QA 1OQ1A 2ZGUA 4Q27A 4EKXB 1SBFA 4GP3A 1UZYA 1VLNA 3AP7A 3M3CA 3WUCA 4OEEA 5JOXA 3WVJA 5DZGA 4J2KA 4GOVA 4KEIA 2W52A 2ILPA 3O44A 1YO8A 2ISEA 1XG6A 3N7JA 3QJ0A 1IS5A 3BOPA 3FBYA 4EFQA 4XFTA 4YW1A 3LSDA 4DEPA 3FLTA 5FZUA 3ILAA 1LHVA 1G9FA 3KM5A 4AVTA 4ZKTB 4OEGA 5GLUA 5GJ6A 3AYEA 2ENRA 3IM7A 5EXOA 4Z9WB 1IHKA 2LIEA 4BMEA 2VXTI 1TEIA 3HSMA 3ZUQA 4XBLA 4JKQA 5FNXA 2A97A 4XE9A 2WLQA 1LHUA 2ZZJA 1N4KA 1LENA 4GA9A 3AKGA 2WKKA 3WOGA 2W39A 5CAZA 1GZWA 5DUWA 2GNBA 1FNYA 4P6AA 4Y1XA 2LIQA 5E89A 2ZQOA 1C1LA 4DS0A 3C89A 4M01A 2ZHLA 2AREA 2W68A 4UW6A 3WDVA 3RQ0A 2BEAA 2HW9A 1T9FA 4PBOA 3DDAA 4DQAA 1FYUA 2A7AA 1T3CA 3BODA 3VSZA 1ISZA 3TC2A 3M1HA 2WNEA 3AJ5A 5CNAA 2P2KA 3FJAA 4FQZA 3SISA 4J23B 1MD6A 2DURA 4FOWA 4H9WA 2ZGNA 5GLZA 1WLDA 4ZFWB 2ARBA 5BXPA 2NMOA 3AP9A 2AH2A 4P9YA 3SH4A 1NZKA 3RS6A 4XIKA 1LESA 4XZPA 1SBEA 4XILA 2NVHA 1HQWA 1JT7A 1Q8VA 1W0OA 1GBGA 5CBLA 4YM1A 5HCBA 2PHRA 2YV8A 1H9PA 4ZXKA 1SR4C 1ULGA 4K20A 3T8SA 3AKFA 2FFUA 3FIIA 2A3WA 1P63A 3HMYA 3FUQA 3I4IA 4U36A 2DVGA 2ZQNA 4G1RA 2IMBA 1O4ZA 3RTJB 2ZR1B 1F82A 3WDUA 1D0HA 5KXDA 5BQUC 4FOVA 2WBCA 1CR7A 1APNA 2TEPA 3SH3A 3FJ8A 5EYYA 4KEJA 4XJ8A 3LLPA 1IS3A 3O5WB 2DVAA 4XBNA 1ENRA 3SNMA 3VKLA 1OFSA 4FPKA 2K4AB 2D6PA 2ZGQA 5BP5A 1CVSA 4GALA 3AZWA 1WBLA 3AYCA 4AGRA 2ZGSA 5IK5A 5F8SA 1BZWA 4ZOTA 2D3RA 3CQAA 1IS4A 5FRAA 2FMDA 3O5SA 4LO2C 1C1FA 4J2XA 1MC9A 4I4PA 2A6VA 4I3NA 4DENA 1EPWA 3UL2A 3I8TA 2R9KB 2P3IA 4L8QA 5H9RA 3O3QA 1ZB7A 4CJMA 4Y22B 3M3OA 1LECA 2XHLA 2X2TA 1JLYA 5EC5A 5GM0A 4FPFA 1A78A 1MZ5A 3QYDA 4ZGRB 2UURA 3ZXEA 1UKGA 1W3GA 1IS6A 4KTXA 4IY9A 5G00A 3WZ1A 4Y26A 2J3PA 3B69A 4DCKC 1EVTA 3CA1A 5IK8A 1VAMA 3BAUA 5SV8A 5T5OA 4USPA 1IT0A 4M3CF 2QN4A 5JOYA 1GICA 2WT2A 2GNDA 3IM6A 2Z48A 2PHUA 5IT6A 1W0PA 4XFSA 1KITA 3B3QE 3K1XA 1N3PA 5DUYA 1LOAA 4D0TA 3MW4A 1ILR1 3N36A 4CTEA 1AXYA 3WDYA 4G6JA 3ZVXA 2WJSA 1AVXB 4I1EA 1S0JA 1AX2A 4K1ZA 3FGMA 4I37A 1GV9A 4ITCA 5KXEA 3BX1C 4LBQB 1W3AA 1BJQA 2ZA9A 5GLWA 3USUB 1BASA 2P23A 4A7KA 3CNAA 2RQ9A 5DVHA 4YZ5A 1XYFA 1J1TA 4II0A 5BXSA 1FWVA 4GKYA 2R49A 1Q1UA 4YG6A 2PHXA 1PWAA 1YF8B 1V6MA 3O4BA 4Q26A 2QYIB 5DUXA 5JLVA 1SLBA 4P0JA 2NP0A 3AH1A 1SLAA 4EEEB 3FJKA 4I6IA 3BRDA 1UX6A 2VLCA 2RG9B 4D69A 3ZSLA 4TLPA 2ETFA 1BLDA 2K8RA 1V6KA 2EIGA 1M2TB 1LOEA 1JT3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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