5JLVA

Receptor binding domain of botulinum neurotoxin a in complex with human glycosylated sv2c
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
427
structure length
425
Chain Sequence
PMNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYANKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
publication title N-linked glycosylation of SV2 is required for binding and uptake of botulinum neurotoxin A.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 117
structure length 425
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2016-04-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 5jlvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 5jlvA02
1BYHA 1S0JA 2ZBJA 3SH4A 3VKMA 1UX6A 3A23A 4F34A 4AYUA 4YG3A 4LBQD 5H9QA 4XTMA 4AN6A 4YZ4A 1QOOA 1GBGA 3B00A 1FAYA 3AJ5A 3O4CA 4EFRA 3O4AA 4YG0A 3NJ5A 2ZAAA 3ZSKA 3AYAA 1BFBA 2LTNA 1NZKA 1GKBA 1V6VA 4ZBVB 3L2YA 1VCLA 1Z2VA 2DVBA 1V6MA 2JDZA 2A6YA 4EEEB 1F9KA 3MW2A 4TZDA 3VKNA 2Y9WC 1JYCA 1IHKA 1XYFA 3O49A 5BP5A 2ERMA 2ZGLA 2ZGTA 1ZA4A 1SLTA 3INAA 1H9WA 2ESUA 5H9PA 4SLIA 1E0OA 5FREA 3OJ2A 3USUB 2WBCA 1PZ7A 1GZWB 5I1BA 5T5PA 4AWDA 3N3HA 2D43A 2D7RA 1Q8QA 3WA1A 2G4IA 3FJDA 5BXTA 2Y9GA 2C5DA 1HWMB 4QC4A 2EXJA 3EF2A 1DQ4A 3OPZA 4XXAA 2VLCA 1G9BA 4ATEA 3FUQA 1UAIA 3VUOA 3WNXA 4Y20B 4QKSA 1X50A 1JT4A 4ENDA 3JUTA 4H9WA 3C9ZA 2FO1A 4XOGA 2GNBA 1MS3A 2NMOA 1SBEA 3JRRA 4D69A 2GZBA 1MS5A 1GZCA 3V65A 1V6XA 1DZCA 4YFWA 1J0SA 3O4BA 2DTWA 31BIA 4P0JA 1JXNA 1Z0HA 4ZA3B 1HKDA 2X2SA 1I3HA 2A3YA 4UW3A 2D3PA 2RQ9A 1ULEA 3SISA 3PMEA 1C4RA 2AH2A 5BXPA 4FQ4A 2GN3A 3I2AA 3ZYPA 5DUYA 2DVDA 4GA9A 3FLRA 3AP5A 4FP3A 1S0BA 4XJZA 2D23A 3Q9OA 1YI7A 1XHBA 4AVTA 1UL9A 4LBKA 3POWA 4P6AA 3FFZA 3FBYA 1M2TB 1RINA 2I1BA 1LOAA 1ILR1 5BVPI 4I3NA 1I1EA 2A3WA 2DYCA 2H0BA 4YGBA 5JOZA 2V73A 1S0CA 1DFCA 1V6NA 1TEIA 1Z78A 1O4ZA 3AKHA 2FHRA 4IZXA 1WLWA 4I2SA 4D8HA 4YZ3A 1ENSA 1DFQA 4JAWA 2D7IA 4BPZA 1QXMA 3O5SA 1ULDA 3WDTA 2VSAA 2EF6A 3WDUA 3HSMA 1N3OA 1CPNA 2ZHNA 4QD2C 1FX5A 4I4UA 3PUBA 1R1ZA 4I4RA 1FNYA 3WG1A 1DJSB 2Y9XE 3ZSLA 3P6JA 3QLQA 1ULCA 4GWMA 1MZ5A 1AZDA 3VKOA 1YTOA 1W6NB 4XFSA 1W3GA 2DREA 3RTIB 2AYHA 2UUSA 5T50A 4H04A 1RMLA 1QGLA 4OUJA 3AX4A 1CPMA 4IY9A 3POSA 4M01A 1FNZA 3FJHA 1LU2A 5FZZA 1LCLA 1GZ9A 3CA4A 1N1YA 1J1TA 3MPPG 1JW6A 1EYLA 1G7YA 3AZVA 3NWKA 2R0HA 1RG8A 4LO0A 1W6OB 1CN1A 2WLQA 2YMZA 5IK4A 4TYSA 5BYNA 1FV3A 2NTDA 3USUA 1Q03A 3ZXGA 3ZXJA 3KQRA 4EB2B 2E6VA 5BP5C 1GZWA 3AP4A 2WSUA 1WLCA 1ENQA 1QF3A 4OEFA 2VU9A 5H9RA 1AVUA 3NBEA 1C1FA 3LSDA 1TP0A 1IT0A 3UD9A 1JT5A 3APBA 4G9NA 5T54A 4BMBA 1FWUA 1FMMS 1AXKA 3QCWA 4G9MA 3AXEA 3VSZA 4I37A 2R49A 4FOQA 3M3CA 4QALA 1W6MB 3B01A 1PZ8A 2D3RA 4RA0A 5T55A 5EHAA 3VT1A 1SLIA 2B7YA 3FJCA 5HCFA 1K5VA 3RS6A 3BRDA 1G82A 1I1BA 2E7QA 1VLNA 1WW4A 4OW4A 2E51A 4R9DA 1TWMA 5F8YA 2DTYA 2PELA 4WVVA 1ULFA 3WINA 4ZFUB 3N7MA 3I29B 2FFVA 4M00A 4Z8BA 3BB2A 4P0KA 4IZEA 3IPVA 3N7JA 1KJLA 1DLLA 2A6XA 3I2XA 2A3XA 4ATFA 2KM2A 4A7ZA 3WDXA 4L4IA 4I1BA 2A6VA 1BLDA 2QYIB 3W59A 5GZGA 3ILFA 3S8KA 4GOVA 2DRZA 5GJ6A 2DVAA 1LJ7A 2I2SA 1GANA 1C1LA 4PF5A 4PCRA 5T5JA 3V64A 3B9UA 1N3PA 41BIA 4GAIA 2Z42A 4XMAA 2Z49A 4Q8LA 4XMIA 1KITA 2D6OX 4FPKA 3ATGA 3AJ6A 3ENRA 4PQ9A 5IUQA 4AGVA 3UK9A 1IRPA 4J23B 3RG0A 4D0ZA 1IS4A 3AKFA 4KEIA 3IM6A 4QBVA 3CAHA 4AVVA 2WT1A 4DPNA 3ZX7A 2P3IA 4YG6A 4BOWA 3N7KA 2XOAA 2R0FA 5DZGA 3PVNA 3Q7WA 3BADA 1HWNB 3ZC8A 2LIEA 3LCPA 4XJAA 1FMZA 2FMDA 4Y1VA 3WG3A 1Q8PA 2LALA 4DCKC 2PHUA 3WZ1A 1W6NA 4Y1UA 4BMEA 1HQWA 4OWKA 3H6QA 3W9TA 4OEGA 3ZSJA 1JUIA 1N1TA 1N47A 3FGMA 3OJVA 2JD4A 3FJIA 1OKQA 1G8WA 1W6OA 4Y26A 2PHFA 4Q91A 1DQOA 1EV2A 4IY8A 1SBDA 3IM5A 5FNXA 3PVEA 4OZXA 3O0VA 1UKGA 2OUJA 3FUOA 4LO0C 3QYDA 2D22A 4LBMA 3SITA 3ZVXA 1IILA 2VSEA 2P3JA 1QNYA 4CZSA 1ISZA 1BFGA 1G86A 1LTEA 4EFPA 1GV9A 1O4YA 1RIRA 2W52A 4XIKA 2A7AA 1AXYA 1L2HA 3AKGA 3T2TA 1WUVA 3BAUA 3BODA 4LO8B 4J2SA 1W6MA 1LHUA 2VUAA 3B9CA 4ITCA 6I1BA 1QNWA 4GP3A 5EG6C 3N0KA 4Y1ZA 2VH9A 4Y1YA 1ENRA 1DQ1A 1LU1A 1A8DA 2VXTI 3TC2A 4XJWA 5DUUA 3ZXFA 3TAYA 1HWPB 4AGRA 1HCDA 3P6IA 1YRZA 4I6IA 1AJOA 3ILAA 2NM1A 4QBCA 3AK0A 4U36A 4QO3A 4YW2A 5HPZA 2VY0A 3WINC 3AZYA 4WZFA 2KI4A 5GLUA 1LOEA 4BLIA 3UJOA 1TIEA 4TLPA 1LGBA 2PHTA 3ZXKA 1MS9A 3AP6A 3ASIA 2ZGNA 4NO4A 4CTEA 1S0IA 5DZUA 2WJSA 1S0EA 2A6WA 1W3FA 4H55A 1DBNA 1PUUB 4FPGA 4WV8A 2WSVA 3CRGA 2ZKNA 4YZ1A 1V6IA 1AFCA 3KMVA 4P9XA 5IK5A 2NZ9A 4YM2A 4L8QA 2P23A 2DRYA 1Z4SA 4P9YA 1S0DA 1V00A 2YV8A 5D62A 3LTQA 4UW4A 1KJRA 7I1BA 21BIA 4LO7C 4FOWA 5AVAA 1TOOA 2DS0A 4K1ZA 2ZQOA 2ZGUA 5DXDA 3MALA 3CA6A 4FP2A 1AX1A 3WG4A 1Y7BA 1S0GA 3BRGC 3WCRA 4JCKA 4XBQA 2AR6A 4XTPA 5DUXA 4JP0A 1KNMA 3DUIA 3WMVA 1SFYA 1SLAA 1CVSA 3CRHA 4DS0A 5KXBA 1MACA 3FJJA 2DWRA 3IPVB 1AXMA 5F90A 1CJPA 2V5YA 2ZMLA 3WDYA 2X2TA 1RZOB 3OGGA 1V6OA 2D6MA 1TFMB 1NXD1 9ILBA 4LBNA 4XBNA 1U0AA 5GLWA 5SV8A 3RSJA 4QKRA 2W08A 5CNAA 3SH3A 1VAMA 1BFCA 2E7TA 1WBAA 3WLUA 4JC1A 5E89A 4YW3A 4LO1A 3WO2A 5DVHA 5H9SA 2NP0A 3OYWB 4YGEA 2ZGOA 3LLPA 1T9FA 4M3CB 2A70A 4R9CA 4FPCA 2PHRA 5E8AA 3MW3A 1FATA 2BQPA 3I4IA 5FRAA 4JKXB 2AGSA 3RRDA 4LO7B 1N3QA 1W6PA 4KEJA 3BRFA 4YW5A 1QOTA 3R4UA 2GNMA 8I1BA 1SR4A 3H6RB 1IKQA 4ISQA 5DUWA 5EYYA 3BAOA 1CONA 5D63A 5DG2A 5T5LA 4ZOTA 4KC3A 2WNEA 4XKIA 3CRIA 4GP0A 2Q5TA 2RSTA 3HBWA 2GN7A 2ZABA 2A6ZA 4C1XA 4USPA 2CY6A 2KI6B 4ZKTB 5L73A 1FGAA 3GALA 4USOA 3WV6A 1LHVA 4C1WA 1LHNA 1JY0A 3D5OA 5BQUA 3O0WA 2HYKA 3IM0A 1YYNA 3VKFC 2IWTB 4GALA 1ZM1A 3OY8A 3BX1C 1UN1A 4FPOB 2CYFA 3H6SE 2F8XC 4DENA 1AF9A 3AZWA 4Q27A 1WBLA 4PBPA 4XHXA 3AZXA 1W6QA 4I30A 4XJUA 3ZXEA 1ISWA 3BTAA 1LOFA 4XBLA 3LSEA 2D44A 1IOBA 4Q9GA 3DGTA 3CU1B 2YXSA 4P14A 3QR5A 4JKQA 1V6JA 3FJBA 1XQNA 4YLZA 4M3CF 4AVSA 3BAVA 1Q04A 4HJJA 3O12A 2TEPA 3V0BB 1A78A 2E53A 1MD6A 1WBFA 4ZGRB 2YROA 1HIBA 2AUYA 2BEBA 3OJMA 3POKA 2ZACA 4P9WA 4XYXA 4DRRA 1W3AA 3M3QA 1GNHA 1DIWA 2AREA 2R9KB 4XJ9A 3FLTA 4FPYA 2GDFA 1DQ2A 1ONAA 2JKBA 3UDAA 1ABRB 3WDVA 4YM3A 2GMEA 4WVWA 3B3QE 1SLBA 2ZZJA 5HCAA 2ZA9A 1V6UA 4ASMB 3VV1A 5DUVA 4YW1A 3VEQA 2SBAA 4Z8SB 1FV2A 4JPZA 2OW4A 1SCRA 3ZXLA 5FNWA 1Q1UA 2ZQNA 3WHTA 4FOVA 4XFTA 1LODA 2HZ9A 1AVBA 2IHOA 1MVEA 1M16A 2DUQA 5CB7A 4IHZA 3GNEA 4X37A 5LK5A 4IQPA 1AVXB 1AXZA 3FJ9A 4XXPA 3WCSA 1JYIA 2F2FA 1CIWA 3WG2A 1ISYA 3FJKA 3IM7A 4YGCA 1CE7B 3WOGA 5GAQA 3A0NA 1MZ6A 2GNTA 3FLPA 1DQ0A 1N1SA 2GMMA 4BLJA 1PC8B 5JOYA 3RMYA 3OYWA 4G1RA 3O44A 3ILNA 3ZPYA 3IKWA 4M3CA 4GOYA 1ITBA 1YF8B 2JE7A 5KXCA 2CNAA 4II0A 1GYKA 2SLIA 4LO1C 1ISVA 3CA0A 3ZXDA 5F8SA 1WW5A 2D20A 4JRAA 1CR7A 3H6RA 4LO2A 1BXHA 2DU0A 1OQLB 3MEPA 3NBCA 4RL7A 2ZHLA 1WBCA 4GXLA 1JTCA 2UWAA 5EXOA 5GLVA 2D7FA 1SR4C 3HN1A 3W58A 1AX0A 2P37A 2CTVA 4P0LA 1HWOB 4Q8KA 3BA7A 1LOBA 2Y9FA 1MS8A 5GALA 4XJ8A 1JQZA 3UJ4A 5G00A 3A4UA 4Z9WB 3OBTA 4ZXKA 2BEAA 1LECA 3CA3A 5GM0A 5IK7A 1LULA 4A7KA 1UZZA 1YO8A 2UU8A 5BQUC 1MS4A 3NV1A 3C2UA 3WHUA 1EPWA 4Y24A 1W0OA 5D61A 5GLTA 2WQZC 1FYUA 1LEDA 1P63A 4KBBA 2JE9A 1DGLA 1SACA 4LBLA 1H9PA 4I4XA 5F9TA 1CQ9A 2R1BA 4EKXB 1LOFC 1QOSA 5FZYA 3BOPA 1LESA 3V0BA 4XZPA 2ZHMA 3AYCA 1BARA 2DUPA 2FFUA 4HL0A 1QKQA 3WO3A 2MLLB 5E24E 1S1AA 2VXRA 5F8WA 1W6PB 3ZSMA 3O4DA 4FPFA 2KKIA 1WLDA 3A07A 1F31A 3WMUA 1HDKA 4X38A 3ZC9A 3BA4A 3Q7XA 4YW4A 2ZGKA 3HMYA 3D4KA 1OQ1A 1JT7A 4HR6C 1SZ6B 3AP9A 2D6KA 1R8OA 1C57A 1PZZA 3AH2A 4J2KA 2DURA 5JDBA 3CNAA 3AFKA 2EXIA 1APNA 2WT2A 4F83A 1YBIA 1QDCA 3UD7A 3UJQA 3O5WB 3VT0A 4ZFYB 1IS5A 1LENA 3O0XA 4XHBA 2YY1A 2GO2A 1S0LA 1PWAA 4JQ0A 4XIOA 3OY8B 1N1VA 3NBNA 4EFQA 4UW5A 2ZMKA 4I4YA 1GICA 3UD8A 2HWAA 4X39A 3IIRA 2NMNA 5GZFA 2F2FC 5B2HA 3AKIA 3ZYRA 1W6QB 1BASA 1IJTA 3UL2A 1DYKA 3KM5A 4XDQA 4OEEA 4I4VA 4HANA 4D0TA 1KDMA 1IS6A 2RHPA 3RMXA 2Q3NB 1CVNA 3BA5A 4XILA 1VIWB 4UW6A 2ZGPA 1MS1A 4YM1A 4G6JA 5T5OA 4LBQB 1JOJA 1HKNA 4HA2A 3B69A 2QN4A 3WO4A 5GZCA 3AXDA 4FOYA 4W65A 4OWLA 3WUCA 2P39A 2AQZA 4Y22B 1DHKB 4R9AA 4LO2C 1YXWA 4K1YA 5JLVA 2Q9XA 1LOCA 2ARXA 2UWBA 4I96A 1K5UA 3K1XA 5BXRA 3U4XA 2JJ6A 2OUHA 1Q56A 4AN7B 1OFSA 2ES3A 5IT6A 5CBLA 5BOWA 1G9FA 3T8SA 1T4QA 3WVJA 4CJMA 2K8RA 1H30A 3UJ0A 1ISXA 1V6KA 3JUUA 2FGFA 1SLLA 3OBRA 2DVGA 1YIFA 2D6NA 3BAQA 1B09A 4I0YA 2E4MA 2AFGA 3CQAA 4LBOA 2A75A 3R4SA 3VKLA 4DRVA 4M3CE 3A0KA 5DSSB 1BLAA 2K43A 3IMNA 2AAIB 3N7LA 2FDBM 4YZ5A 1JN2P 3VSFA 5KXDA 1CESA 4I4QA 2WKKA 4KEKA 3POYA 4I4OA 2A71A 1FWVA 1JHNA 1JLXA 3AP7A 4Q1RA 3VWCA 4LO3A 1F5FA 1BKZA 1UPSA 2ERFA 3ILRA 1TWEA 4XE9A 1FN0A 5GZEA 2YUGA 4GKYA 1AX2A 2EAKA 5HCBA 4WBCA 2ZGQA 4AGGA 2Z48A 2CL2A 2UURA 3CA5A 1ONKB 2EALA 2NYYA 2EXKA 5FZUA 1LGCA 4YM0A 2KLLA 3A21A 2LIQA 5BXSA 3V79C 3FJ8A 1Q8VA 1VAVA 1DZQA 3N36A 4L4HA 3T1MA 1DQ6A 3NV4A 1QQKA 4YGDA 1ULGA 4GAFA 1SBFA 1FQ9A 3HOMA 5EYXA 3AYDA 2HWMA 3AH4A 1D2SA 3CA1A 2VW1A 4FPHA 3TB0A 4IONA 4BQ1A 1XG6A 2MIBA 3M3EA 1SCSA 1UZYA 2P2KA 1RITA 3D6EA 4YZ2A 4Y1XA 4FVVA 3SH5A 3WDWA 2HW9A 3HALA 2XB6C 4Q1PA 3P53A 4I4PA 3SLIA 3BAHA 1S0FA 4U2AA 1URXA 2AXMA 5DZEA 2R16A 4Q2FA 3V0AB 1D0HA 4LBQA 1GGPB 2DV9A 1QDOA 2A5ZA 4ISRA 2D3SA 2XG3A 2D1ZA 1LHWA 3PJQA 1NLSA 1GSLA 1WCSA 3RQ0A 3AJZA 3BIWE 5E88A 4YOLA 3MW4A 1BJQA 2W68A 3M2MA 4Y20A 4Y22A 4FGFA 4YFZA 2OVUA 2ARBA 2ZMNA 1BZWA 1A3KA 1DQ5A 3S8JA 3BAGA 4QD2B 2PHWA 3F1RA 1KQRA 1N4KA 2ZGRA 3A22A 5GLZA 4OWJA 2K4AB 5JVVA 1IKPA 4Q26A 2ZGMA 2DVFA 5GZDA 1LOGA 2MC2A 3E8LC 4R9BA 2ET2A 2UWCA 5IK8A 1XZZA 2D24A 3O4OA 4BM8A 1PUMB 2WT0A 4K20A 2DU1A 1MS0A 3FJAA 1AVWB 1AVAC 1GLHA 3N35A 2C9AA 1AJKA 5EC5A 4FPEA 1WW7A 3F62B 1VALA 3PG0A 5EWSA 2E4MC 4I1EA 1HCEA 4A7YA 1LHOA 3HR9A 4R6UB 4XFUA 4FQZA 1R8NA 4J2YA 3IN9A 2ENRA 1DZDA 3AH1A 1HQLA 2PHXA 2DUOA 5JMCA 4MYEA 2P34A 5DG1A 2NVHA 4PC4A 2D6PA 1BFFA 1TTUA 3FJFA 3FJEA 5CA6A 2P3KA 1JLYA 2ZGSA 4DFSA 3VT2A 2GALA 4I8MA 4ZLBB 3PHZA 3T1LA 1LGNA 1GNZA 1PZ9A 3WUDA 3SNMA 4X3AA 2WRYA 1RY7A 1WD4A 3I8TA 3AYEA 3NBDA 1BA7A 4J2XA 4FPJA 3AZZA 1HLCA 1WW6A 4LO3C 2M49A 2BFHA 1EVTA 4GKXA 3M3OA 5CAZA 3NV3A 4IYBA 1MVQA 1W0PA 5F5QA 3RTJB 5JOWA 1G9CA 4G6MA 5JOXA 1NUNA 3Q7YA 4Q9PA 3SNVA 3R05A 4PBOA 2YZ4A 1QMJA 1WD3A 1QQLA 1KDKA 4ZFWB 1G9DA 5KXEA 1G9AA 2AENA 2R1DA 4FPLA 3NV2A 2VW2A 2EIGA 3IAGC 1IOAA 3M1HA 1KRIA 1UMZA 5DZFA 4I4SA 4NOTA 3O3QA 2VW0A 5T52A 1DQGA 1II4A 2RG9B 2ZHKA 3OJBA 1IRAX 2EXHA 2JECA 1Q8SA 1DYPA 2GMPA 2J3PA 2CWSA 1JT3A 1V6LA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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