3N7JA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d binding domain
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
415
structure length
405
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 405
sequence length 415
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7jA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7jA02
4YLZA 5EWSA 3PG0A 3NBDA 1CONA 1QNWA 4PQ9A 2A71A 1FATA 3VKOA 1AVUA 5JOZA 3ZSMA 4XE9A 4YOLA 4I4PA 2VW2A 4U36A 2Q9XA 3CA3A 2WT0A 1JHNA 4BLIA 1FQ9A 4GP3A 2YXSA 4XBNA 1GGPB 3V79C 3ILAA 3JUTA 3LCPA 1DQ2A 2W39A 4BQ1A 4X39A 3MEPA 4JAWA 3POYA 3A21A 5T5JA 3OJMA 1R1ZA 1WW5A 2P3JA 5I1BA 3IKWA 2XB6C 3BAQA 3AZVA 1CPMA 1KJLA 2R49A 4M3CE 3AZYA 1S0FA 4H55A 2X2SA 2D6MA 4AGVA 1EYLA 1QKQA 1TOOA 5GAQA 4FPGA 3DGTA 2VH9A 4DEPA 1WD3A 4XFUA 1C1FA 3RS6A 1OKQA 4YZ3A 3CA4A 4GP0A 5GALA 3K1XA 4D0TA 1MS4A 3RRDA 1SBFA 4GOVA 3VSZA 2GNMA 4BOWA 5D61A 5BQUC 3O4BA 1IKQA 2ET2A 1G9BA 2AYHA 1UZYA 2ZHMA 2A7AA 1W6NA 3N7JA 2OVUA 1Q04A 3WO3A 4LBQA 1BLDA 3JRRA 3ZSKA 4LO7C 2YZ4A 1N1YA 2ZGQA 2Z48A 4FPOB 3A23A 2ZQNA 1ENSA 1N3QA 1KNMA 2ZAAA 4JQ0A 4DRRA 4R9AA 2ARBA 2P34A 1QMJA 5IK5A 4X37A 4G9NA 3WOGA 1ZM1A 1WBFA 2LIQA 1LHVA 4PF5A 4KEJA 5H9QA 1D2SA 3RMXA 4XIKA 4WZFA 4I1BA 2R9KB 5FNXA 2XOAA 2IWTB 4OUJA 5G00A 3AK0A 1WW7A 4NOTA 4GALA 5F8SA 4PC4A 4WV8A 4GWMA 5KXEA 5CB7A 5CNAA 2VXTI 4K1ZA 3AH1A 4OEGA 4LBJA 3APBA 3H6QA 4K21A 3AKHA 4A7YA 1QOTA 1HQWA 2UURA 3AZZA 4Y26A 1ONKB 4BM8A 31BIA 3RTIB 3Q7WA 4XHXA 4Q91A 2ARXA 2D3SA 1F9KA 1WLCA 4I30A 4M00A 4XILA 2FFVA 1HWNB 5HPZA 2EIGA 2ZGSA 3AP4A 3ZSLA 4OWJA 4R9CA 5GZDA 1S0JA 5D63A 4QD2C 1TWMA 4LBNA 4HL0A 1QOOA 4II0A 3WV6A 3SNVA 1MS8A 4IHZA 1FGAA 5F9TA 4R9DA 1W6MA 3WDXA 5DUXA 3WHTA 3I8TA 2F8XC 1SFYA 4I96A 3UDAA 2GNDA 5B2HA 2SBAA 3HMYA 3BADA 4ZBVB 5IT6A 4I4XA 4LO3A 1PZZA 3ZPYA 2A3YA 4OZXA 2D23A 3AYAA 1WLDA 3D6EA 2ESUA 2P39A 1PZ9A 1ISWA 2NP0A 3T8SA 3JU9A 1AF9A 1AX0A 3AP6A 3IMNA 1CE7B 3POWA 1MS3A 2K4AB 3GNEA 1NZKA 1BZWA 1LGNA 2IHOA 1G9DA 2D3RA 2M49A 1PUMB 4F34A 4JCKA 4R9BA 1HWMB 1W6QB 3PVNA 5GZGA 1ILR1 4G6MA 1OQ1A 4Y24A 2OUJA 1FAYA 4OWLA 3PMEA 5DSSB 3BAHA 3BA7A 1AX2A 3E8LC 1ISYA 4P14A 3N35A 2A3XA 2FO1A 3C2UA 4WBCA 5GLZA 3N7KA 1EPWA 2DTWA 4BLJA 1XQNA 3OPZA 4D69A 4IONA 2EXHA 1K5VA 4C1XA 2ZMLA 4LO2A 1S0LA 3O5SA 1LOBA 3P6JA 1JXNA 3ZVXA 3OY8A 1FYUA 2DURA 1AVBA 4YG6A 1BFGA 1EV2A 2X2TA 1JYCA 2DRZA 1LOGA 1IS4A 9ILBA 1WW6A 1SBEA 1AFCA 4QD2B 3B69A 1TEIA 1LECA 4EB2B 2NVHA 1MZ6A 1DQ1A 2DU1A 1QDOA 3PJQA 4Q1PA 3D5OA 2DYCA 2ERMA 5T52A 2BFHA 3N7MA 2GALA 3AKGA 1LODA 1JT7A 2XG3A 3FLPA 3UL2A 2KM2A 1G9AA 1UMZA 2UWAA 2C9AA 5DUUA 4HANA 3Q9OA 1RY7A 3B01A 3KMVA 4QKSA 5DZEA 4YM0A 3ZXLA 4FPLA 3QCWA 1CN1A 1LULA 3CRHA 2CY6A 1S0DA 4PBOA 2EF6A 3FJBA 5HCBA 3V0AB 2GNTA 5BYNA 1QU0A 1CPNA 1SLAA 4Q26A 4I37A 3SNMA 1WBAA 2J3PA 4Q8LA 3SLIA 1CVNA 2JECA 2BEAA 3H6RA 1XHBA 3ILFA 3SH3A 6I1BA 4ISRA 5IK7A 1IS5A 4EFPA 4FVVA 1HLCA 1HWOB 1S0IA 1GZ9A 1IJTA 1XYFA 2D20A 3CAHA 3CA1A 4LBMA 1N3PA 2ZACA 2YY1A 5BXSA 4I4OA 1SLLA 2R0FA 4Y22B 2RG9B 1AXYA 1Q56A 1D0HA 1UN1A 3BAVA 4YW4A 3O4CA 3VWCA 2DWRA 4G1RA 2NZ9A 1W3AA 3IIRA 2NTDA 4FPCA 1DQ4A 3I4IA 3W58A 4FP2A 1S0BA 3HBWA 4CTEA 5FNWA 1DIWA 4XXPA 5DZUA 1BXHA 1KDKA 4ASMB 2D43A 3LSDA 1DQGA 1IS6A 3VV1A 2VSAA 2NYYA 2PHTA 4RA0A 1MVEA 1IRPA 4YW2A 3WMVA 4TYSA 4D0ZA 3HALA 2WQZC 2DVAA 1YIFA 1Z78A 4L4HA 2D22A 1FV3A 4ZFYB 1E0OA 3IAGC 3NV1A 4OEEA 4BPZA 4HA2A 4YZ2A 1BLAA 5EYXA 1O4ZA 2D3PA 3BB2A 2D6OX 1R8OA 1Z2VA 3CA5A 2KI6B 2SLIA 3OYWB 1QQLA 1BYHA 1DZQA 3UJOA 1MS9A 2ZHLA 4XJAA 1YRZA 2DUPA 5JOXA 3AJYA 4GWNA 1C57A 3O44A 2GNBA 4Q9GA 2GN3A 4LO0C 3MW2A 2P3KA 4LO1A 1V6WA 1JN2P 3SH5A 2VU9A 2W52A 2FDBM 1AZDA 4XJ8A 1SBDA 4XTMA 4OEFA 3AP9A 5DG1A 1FN0A 2PHRA 3WUCA 1UL9A 3FLTA 4GKYA 3C9ZA 4KC3A 1RIRA 4YZ4A 5EXOA 4K1YA 3AZWA 1LHOA 2D7FA 4J23B 4G6JA 3TC2A 1PC8B 3WVJA 1SCRA 21BIA 1CJPA 2R16A 5L73A 1QXMA 1O4YA 2R0HA 3BA4A 1MVQA 4ZFWB 1DZDA 3OBTA 5JLVA 4P6AA 2P2KA 2ZQOA 1W6QA 3B00A 3UD7A 5T5OA 3WMUA 3BRFA 2DRYA 1IRAX 5DUYA 1W6PB 1IKPA 3NWKA 1BKZA 3A0KA 2BQPA 3BAGA 3Q7YA 3RMYA 1K5UA 2DU0A 1SZ6B 5BVPI 4M01A 1HKNA 3NBCA 1S0GA 4IZXA 4I1EA 4OW4A 3B3QE 3BA5A 1SLBA 4I8MA 3BRGC 3AKFA 4I2SA 3RTJB 3W59A 3M3OA 2I2SA 4Y1XA 3WG4A 4YW1A 1URXA 2YMZA 1BASA 4XMAA 4GOYA 3VKLA 2R1DA 2MC2A 1CR7A 1WUVA 3W9TA 2NMOA 3OGFA 1PWAA 1YI7A 4IY8A 4DCKC 3WLUA 4NO4A 3CRIA 3MW3A 3AYDA 4H9WA 4Y1ZA 3POSA 4KBBA 3OGGA 3O49A 1LHNA 4YG0A 2E4MA 2JE7A 1JW6A 5F8WA 1G82A 3WO2A 1DGLA 1JT5A 3L2YA 3AJ6A 41BIA 2ZGTA 2AREA 3FJAA 4G9MA 3A07A 1LOFC 2LALA 2WRYA 4ENDA 3VKFC 1LJ7A 3BOPA 2GMEA 1V6VA 1AX1A 3IM0A 4FOQA 3V0AA 3ZC8A 1H9WA 3FUQA 3M3QA 4Y20B 4QALA 5HCFA 1GKBA 4SLIA 3CNAA 2ERFA 4FPKA 4XJZA 1C1LA 2DREA 2WLQA 5E24E 1DQ5A 3V65A 1V00A 1SR4C 1G7YA 1HIBA 3I29B 3N0KA 1JOJA 5IUQA 1H30A 1RG8A 3P53A 3VT2A 1VIWB 3CA0A 4XKIA 4ZA3B 3OJ2A 4JP0A 5DVHA 4EKXB 1QDCA 3VT0A 4DS0A 2WT2A 2EXKA 2EAKA 8I1BA 3ZX7A 3H6SE 4IZEA 4LO7B 3R05A 3UD8A 1AXZA 2DTYA 3POKA 4R6UB 4M3CB 3CU1B 1TFMB 5IK8A 1AXMA 2D7RA 1LOCA 1DQ0A 1J1TA 2DUQA 2D6LX 1DYKA 2W08A 2RQ9A 5FREA 3FJKA 2ZMKA 1M2TB 4FGFA 1BFFA 1QOSA 3WA1A 2D44A 3O0XA 2GN7A 1HDKA 4TZDA 4XIOA 5BOWA 4AYUA 5LK5A 2MLLB 1Q8OA 1DLLA 4I4RA 3MPPG 2ZZJA 3FJ8A 3INAA 5E88A 4H04A 2FGFA 3ILRA 4AVTA 4A7ZA 1W0PA 2MIBA 3UJQA 1N1VA 4QKRA 3B9UA 2AAIB 1KDMA 1ISVA 2D1ZA 3OYWA 1QGLA 2DVBA 2ZGOA 4CZSA 4Q9PA 1NXD1 1ULDA 1V6MA 3B9CA 4I7IA 5T5PA 1LCLA 5CA6A 3WDUA 4YG3A 1YYNA 5CBLA 2VXRA 1Y7BA 4X38A 3S8JA 3FJJA 5H9SA 3AXEA 1ISXA 1MD6A 4IY9A 3SISA 2VW0A 2ZGLA 2P23A 4YW3A 2DVGA 4FP3A 1W6NB 2Q3NB 2YROA 3EF2A 1FMZA 4JRAA 2ZGUA 2D24A 3ZXEA 1N1TA 3WG2A 2I1BA 1HCEA 5BP5A 1W0OA 5BXRA 2ZKNA 4QBVA 4HR6C 3FJCA 2WSUA 4D8HA 2H0BA 5DUVA 4I4QA 1GNHA 4P0JA 1Z0HA 1I1BA 2UWBA 1U0AA 1JY0A 1JLXA 4QC4A 1AJKA 2YV8A 3AX4A 2ZGRA 4KEKA 3Q7XA 2Y9WC 3IM7A 3D7WB 2RHPA 3BAUA 4F83A 1DFCA 2CL2A 2GO2A 4ISQA 1LESA 1KJRA 2RSTA 1GANA 2KKIA 3ZSJA 5JMCA 1BFCA 1W6PA 2Y9FA 2YUGA 3IM5A 4LBKA 3O4OA 3SITA 1QNYA 3PHZA 3AP7A 2G4IA 2HWAA 3LTQA 4YM2A 4EFQA 4KEIA 1SLIA 3FLRA 1FX5A 5DUWA 5H9RA 5FZZA 4LO2C 2A6YA 2PHXA 1KQRA 2ZGPA 4P9XA 2E7QA 4YM1A 5F8YA 3HSMA 3BRDA 3KM5A 3O12A 1WBCA 2F2FA 3WUDA 2Y9XE 3WDVA 1LGBA 3ZC9A 5E8AA 3O5WB 1L2HA 4XZPA 5IK4A 1KRIA 4ZGRB 2ES3A 3A22A 1PZ7A 4GA9A 2AFGA 2NMNA 1ABRB 1MZ5A 4XJWA 5BXPA 3O3QA 1V6NA 2Z42A 2CTVA 3FJ9A 4FOWA 1W6OB 5GLVA 2HWMA 5HCAA 2HZ9A 1W3GA 2QYIB 1FWUA 1LTEA 1I3HA 3P6IA 3R4UA 4Y20A 2FHRA 1IOBA 2VW1A 3PVEA 1JQZA 1HCDA 1YBIA 2WSVA 3WZ1A 4GAIA 4EFRA 1IILA 2JJ6A 3VSFA 4BMEA 1Q8SA 1GZWB 3RG0A 3NBNA 5FRAA 3AZXA 1W3FA 3WINC 5BQUA 1WLWA 5T54A 2ZGKA 3HOMA 4JKXB 3HR9A 3IPVB 1BARA 1C4RA 4ZOTA 4UW4A 4J2KA 2VUAA 3OY8B 1N47A 4ZKTB 3V0BB 1R8NA 3WDWA 1G86A 4LBLA 1FV2A 3MW4A 4M3CA 4YFWA 1EVTA 3WDYA 2ZHKA 1TWEA 1WD4A 3FJHA 5AVAA 4Z9WB 4U2AA 1X50A 2DVDA 2PHUA 4L8QA 2VLCA 4JPZA 4XOGA 3IN9A 2K8RA 4UW3A 3ENRA 4GAFA 1T9FA 2P3IA 3UJ4A 1N3OA 2GMMA 5DG2A 2PHWA 3QR5A 4ATFA 7I1BA 1FNYA 3LLPA 2BEBA 1LOFA 1HQLA 3R4SA 3WO4A 4DRVA 4Y1VA 1YXWA 4GXLA 5CAZA 2AH2A 3M3EA 2AR6A 1DQ6A 1XG6A 1MR5A 1WBLA 1ULEA 3GALA 1UAIA 3FBYA 4DFSA 4Y1YA 1KITA 2ENRA 2A6ZA 1TIEA 1MS1A 2CNAA 5EC5A 2EXJA 2NN8A 1G9CA 4UW5A 1G8WA 1DHKB 1SR4A 1VLNA 3HN1A 1FMMS 4ITCA 3NV4A 2E6VA 2C5DA 4CJMA 3S8KA 2AGSA 4J2YA 3KQRA 3H6RB 3AYEA 4YZ1A 3RQ0A 2PHFA 1ITBA 1LEDA 1JLYA 4P0LA 3CRGA 2ZABA 5E89A 4LO1C 1A78A 2EXIA 3ZXJA 1BJQA 2B7YA 1SCSA 1LU2A 2V5YA 3FGMA 3OBRA 2KI4A 2OW4A 5JOYA 2ZHNA 4I4UA 4XYXA 1JTCA 2VY0A 1S0EA 3WG1A 1ULGA 3TB0A 2CWSA 3QYDA 2A70A 3N7LA 1UZZA 3T1MA 5D62A 4XMIA 4Y1UA 5GZFA 1V6LA 5JOWA 5DZGA 3UD9A 1VAMA 3USUB 5GZCA 5H9PA 5GZEA 4I4VA 1YF8B 1DJSB 4LBOA 4Z8SB 5BXTA 3FJIA 1YTOA 2E51A 1OFSA 3VKMA 1F5FA 1A3KA 1HKDA 5T55A 4P9YA 1N4KA 4GKXA 2OUHA 3ZXGA 3BX1C 1B09A 4RL7A 4EEEB 1NUNA 3BAOA 1N1SA 1VALA 3AJZA 1AVXB 4AN6A 3FJFA 4P9WA 4XXAA 4Q2FA 2A6XA 2JE9A 2VSEA 3NJ5A 3FJDA 3DUIA 4XHBA 3O4DA 4Y22A 3NBEA 1ZA4A 1V6XA 4CRQA 3M2MA 4HJJA 2D6NA 4ZFUB 5EG6C 2UWCA 2FFUA 4YZ5A 1AXKA 4YGCA 4XBQA 2ZA9A 3AP5A 4XBLA 4I6IA 3PVOA 1GYKA 2EALA 1ULFA 1MC9A 1UPSA 3FFZA 1QF3A 1UKGA 4IQPA 3LSEA 1Q8VA 3N3HA 1W6OA 3NV3A 3U4XA 2E4MC 2ZBJA 1APNA 1QQKA 1ENRA 3ZYRA 1DYPA 2ZGMA 1JBCA 2JKBA 2A6VA 2AENA 3N36A 3NV2A 2NM1A 2GDFA 3FJEA 3RSJA 4X3AA 4XDQA 2A75A 4JKQA 1GICA 2R1BA 4YGBA 5F90A 1VAVA 2L5XA 3H0OA 4FPEA 1Z4SA 3CQAA 4AN7B 1LHUA 2CYFA 5DXDA 3IM6A 1JYIA 1GZWA 4YW5A 3F62B 5GLWA 4AWDA 5DZFA 3I2AA 3AYCA 3ASIA 3AKIA 4ATEA 4FPYA 1LHWA 2FMDA 1AVWB 3QLQA 2CWMA 5T50A 4YGDA 3TAYA 1MACA 3IPVA 1DBNA 2HW9A 4J2XA 5GLUA 4FPJA 2AUYA 2WKKA 2UU8A 1HWPB 4Z8BA 1ONAA 3V64A 4A7KA 3UK9A 2QN4A 1CIWA 4YM3A 4IYBA 1RITA 3V0BA 5EHAA 2Q5TA 4C1WA 3D4KA 5KXDA 3VT1A 3WCRA 2K43A 4LBQB 1IHKA 2JD4A 4I0YA 4FOVA 3ZXKA 1TTUA 1IT0A 2LIEA 2WBCA 1FWVA 2GMPA 1GV9A 3FUOA 2AXMA 1II4A 1FNZA 4LO3C 3AJ5A 3AFKA 3T2TA 1A8DA 4UW6A 2D7IA 3AH4A 1BQPA 4FQZA 1DFQA 4AVVA 4PBPA 3SH4A 3ILNA 1RINA 4Q1RA 1V6KA 5F5QA 3ZYPA 1Q8QA 5GJ6A 1RMLA 1P63A 3ATGA 3WDTA 4L4IA 1GLHA 3A4UA 1LOEA 2P37A 1S0CA 2D6KA 4DQAA 4J2SA 3WHUA 1AJOA 3BTAA 2KLLA 3MALA 4XTPA 3OJBA 1BA7A 1DZCA 4AGGA 1PUUB 2PELA 2AQZA 3UJ0A 1V6OA 1SACA 5JVVA 1T4QA 4TLPA 1DQOA 3WINA 1LEMA 2ZMNA 4USPA 3ZXDA 4Q8KA 2GZBA 1Q03A 3VUOA 4LO0A 5GM0A 1CVSA 3PUBA 1S1AA 2A6WA 2W68A 4YFZA 4FPFA 4FOYA 3AXDA 4I4YA 1GBGA 3M1HA 5KXCA 1WCSA 1RZOB 1TP0A 1MS5A 2KH2A 4Q27A 4XFTA 1W6MB 3WCSA 1BFBA 2DUOA 1JT3A 2LTNA 3A0NA 4FPHA 5GLTA 2D6PA 1MS0A 4WVWA 1H9PA 1UX6A 3WG3A 5BP5C 3CA6A 4YGEA 1WW4A 3VEQA 5KXBA 4AVSA 4P0KA 2E53A 2DV9A 4LBQD 4FQ4A 5JDBA 4QBCA 3AH2A 1ENQA 4M3CF 3USUA 1V6IA 3ZXFA 4LO8B 3BODA 4AGRA 2JDZA 4I3NA 5FZYA 5T5LA 4BMBA 1ISZA 1LU1A 2UUSA 2E7TA 1JUIA 3O0WA 3F1RA 1LGCA 1IS3A 3OJVA 4XJ9A 4DENA 2A5ZA 3WNXA 1SLCA 1ULCA 3M3CA 1F31A 1LENA 2V73A 2TEPA 1VCLA 1CQ9A 1GSLA 1Q8PA 1YO8A 1PZ8A 1XZZA 4K20A 1M16A 1LOAA 1SLTA 2Z49A 2ZR1B 2DS0A 2WJSA 3BIWE 4W65A 1JT4A 4QO3A 3O0VA 4XJUA 2DVFA 4MYEA 3T1LA 4I4SA 1G9FA 2Y9GA 3VKNA 2A3WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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