4ISQA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with human synaptotagmin i
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Neurotoxin
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 96
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isqA02
3AP6A 4I4SA 2GNBA 3CA6A 3WINC 4Y22B 1FGAA 4J2KA 1JYIA 4L4IA 4XMAA 1AVWB 2SBAA 2VUAA 3CNAA 3WO3A 1RITA 1SBFA 3FJCA 4BPZA 5BYNA 4I4QA 5SV8A 5T50A 5JOYA 2V73A 4AWDA 3R4SA 1BLDA 2D6NA 3KMVA 1M2TB 4ITCA 3ZXJA 1N3OA 3AP4A 3APBA 3A0NA 4BM8A 2ZGPA 3VSZA 1K5VA 3OGGA 1V6JA 1SBEA 2WT1A 2W52A 1SLLA 4FP2A 2UU8A 3O0XA 3A07A 1VAMA 1TIEA 2BQPA 1AJOA 4CTEA 3SNVA 2ZHKA 1ZM1A 4Y22A 3WMUA 3ZPYA 2ESUA 1S0GA 3S8KA 1JTCA 4AGVA 5HCFA 5IK7A 4Y24A 2ARBA 1S0EA 2WJSA 5DUXA 2EXIA 4YW2A 1JT4A 4D0TA 4XIKA 3VEQA 1WD4A 3C2UA 4YFZA 3IPVB 1HCDA 1HQWA 2HWMA 4A7ZA 1FNYA 3BA5A 4I6IA 2E53A 1CQ9A 1CJPA 4AVSA 1LCLA 5DUVA 3I2XA 3CA3A 1VCLA 4GAIA 1QOTA 4FQZA 1FMMS 4Y1UA 2AYHA 2D6MA 2R16A 5CA6A 2KH2A 1LEMA 4CZSA 4M3CA 1QOSA 3A0KA 3VT1A 3FJ8A 4XJWA 4LO1A 1DQ1A 5T5OA 2WKKA 2DREA 3WG4A 2R1DA 3MPPG 5EG6C 3UD7A 5BXTA 2GNMA 3WVJA 2FFUA 2ZAAA 4XHXA 1W3FA 1ULGA 1UZYA 2E51A 4LBQD 3T1MA 1Z2VA 4LO1C 1AFCA 1IOAA 2KKIA 3MW4A 2A70A 1XYFA 1N47A 1H9WA 3RTIB 1S0FA 5GLVA 3IPVA 1YYNA 3ZXKA 2JECA 4AGGA 4USPA 2A6VA 1AJKA 1VIWB 4XJ9A 4Q91A 3JUTA 3PVOA 3WZ1A 4U2AA 2A75A 3PHZA 2JD4A 4I1BA 3PG0A 5BP5A 1ABRB 3WO2A 4I96A 4YZ2A 3TC2A 2ZR1B 2AR6A 3N7MA 1LECA 3ZC8A 3D4KA 1PWAA 1W6QB 2LTNA 3N35A 3WG1A 2FO1A 1MZ5A 2E4MC 4IQPA 2RSTA 1YTOA 2GMPA 4EFQA 3AZWA 4ISQA 3EF2A 3B9CA 5H9PA 4XILA 4DEPA 1I1EA 1RMLA 1Z0HA 1IKQA 2ET2A 5DG2A 2XB6C 4BLIA 4JC1A 3FJIA 3WDUA 3NBDA 3RMXA 1YIFA 1V6WA 4GAFA 4YW4A 1W6OA 3N3HA 1DQOA 1DLLA 5JOZA 4X37A 1BFBA 4I0YA 1MVEA 5BQUC 2NTDA 1CIWA 4YGEA 3ZYPA 1DJSB 4QD2B 4OUJA 2A6ZA 1WCSA 1SLBA 2DVBA 4XJUA 3WOGA 4XFTA 2R49A 1CN1A 1W6QA 4YG0A 2A3YA 3W9TA 1QXMA 3AKHA 4G1RA 4II0A 1II4A 3F1RA 4QALA 1OKQA 3MEPA 3AZZA 31BIA 2VW2A 2DVAA 1LENA 5T52A 4JP0A 4IHZA 4BMBA 3PVNA 41BIA 4P0KA 2JE9A 3SISA 4XJAA 2I2SA 4D0ZA 4C1WA 1HCEA 3AKIA 1FWVA 1V6XA 3O4CA 3DGTA 2VLCA 1SCRA 1BYHA 1IHKA 5CNAA 3AXEA 5GLUA 5FNXA 1TWEA 4JPZA 4FPFA 3HALA 5IT6A 1LEDA 1AXZA 2UWBA 2CTVA 2GDFA 3VKOA 4DENA 4ATEA 3OJMA 1N1TA 2JJ6A 5GZGA 9ILBA 2X2TA 1DQ0A 2LIEA 1Y7BA 3B69A 1R8OA 5LK5A 5BXRA 2NM1A 1N1SA 3HBWA 3IM0A 3BAHA 3AZVA 1W6MA 2P3JA 3NBEA 4J2SA 4Y20A 2TEPA 3BA4A 1D0HA 2UWAA 1GV9A 2ZGKA 1CONA 1AXYA 5H9RA 3T8SA 3O49A 2VXRA 1BA7A 2ZGLA 1WD3A 1NZKA 1CPNA 1V6MA 3BAOA 4XZPA 4BQ1A 3ZC9A 2ZQNA 2MC2A 3WCSA 1WLCA 3B3QE 1MS0A 3JRRA 3NV2A 3QCWA 1JW6A 3PJQA 2BEBA 3OYWB 1IILA 4FPLA 4DFSA 3U4XA 2FGFA 1XZZA 3NV3A 4BLJA 3WHTA 4XFUA 4H9WA 2DVDA 3FJAA 4WBCA 1CE7B 5IK4A 3AP7A 8I1BA 1QNWA 1JOJA 2VXTI 3OBRA 3QR5A 1KJLA 2F8XC 3V0BB 1HQLA 1F9KA 1V6OA 4GA9A 4H55A 4KEIA 5T55A 4LO2C 2IWTB 4M3CF 1N1YA 4A7KA 3D7WB 3ZYRA 5DZGA 1A8DA 4G6MA 3HMYA 1Q03A 3UDAA 4G9MA 1HKDA 1DZQA 2PHUA 2YROA 5G00A 4L8QA 2GMEA 3N0KA 4FVVA 4EFPA 4KC3A 3WDYA 1BFCA 3M3EA 5JDBA 2UWCA 2C9AA 5T5JA 1UPSA 1V00A 3ZX7A 1W3AA 2PELA 4I30A 4HR6C 3WG2A 3WMVA 3KQRA 1EV2A 4I2SA 2J3PA 2VY0A 4DS0A 1VLNA 2K4AB 4LBMA 3V0BA 4LBNA 3IAGC 1Q8PA 5D63A 1JQZA 1HWMB 2DRYA 3AYEA 3WINA 1KQRA 3BAUA 1I3HA 1DGLA 1XHBA 1Q8VA 4I8MA 3LSEA 4X38A 4FGFA 3CRHA 4FPEA 2FMDA 5AVAA 4YGCA 2CL2A 4GXLA 4ATFA 3LCPA 2DYCA 1JT3A 4R9CA 5BOWA 3P53A 4I4OA 4XXPA 2HYKA 3BOPA 1Q56A 3AZYA 5DZEA 1BFGA 4PCRA 2DTWA 4SLIA 2NVHA 2GALA 1GGPB 1YF8B 2DVGA 4C1XA 1ZA4A 5FZUA 2ZABA 2Y9XE 4X39A 4P6AA 4RL7A 3O12A 1WUVA 2CWSA 1LU2A 1LU1A 4IZEA 4Q9PA 2NZ9A 3QLQA 4ASMB 1LOEA 4XBLA 1L2HA 4AYUA 5JOWA 3I8TA 1QQLA 4HL0A 5JOXA 4DRRA 3OY8B 5EWSA 3ASIA 3IIRA 3B00A 1JBCA 5CB7A 2NP0A 4YG6A 3O44A 1LGBA 4FOWA 2CWMA 5GLTA 4Y26A 4M3CB 6I1BA 1MS4A 5F8WA 1JLYA 5L73A 2DRZA 1K5UA 5KXCA 2WT0A 1LULA 1NUNA 1LGCA 5JLVA 3USUB 4IYBA 4XTMA 2JKBA 4YGBA 1WW5A 4U36A 2P37A 3AJYA 2PHRA 2B7YA 3V0AA 1ULEA 4G9NA 3M3CA 2D23A 1DQ5A 2Z49A 1R8NA 4XOGA 3OJBA 3V65A 2DTYA 4XFSA 4HJJA 2WLQA 4P9XA 3TB0A 3WV6A 1O4YA 1ISVA 4LBLA 3A23A 2VU9A 3UJ0A 1UMZA 2V5YA 3OY8A 1CVSA 1ULFA 4XDQA 1W6PB 2HZ9A 2A6WA 4AN7B 4I4YA 2I1BA 4BMEA 1H30A 1D2SA 2YXSA 3AJZA 4M01A 3VKFC 2P23A 4EFRA 4CRQA 3FBYA 2XG3A 4K1YA 1HWOB 1WW7A 2D7RA 4A7YA 4GOVA 3IMNA 3UK9A 3USUA 1GZCA 4I4UA 1YXWA 1HKNA 1LHVA 4YLZA 1GNZA 2AQZA 1KJRA 3CRIA 2R0HA 5GAQA 2Q5TA 3AP5A 4QKRA 4YM0A 4UW6A 1YBIA 3BRFA 4AVVA 5FRAA 4M3CE 1W6OB 3AH4A 5F8YA 5GJ6A 1SBDA 1W6NB 3O4BA 2UURA 1C1LA 4LO0A 1W6PA 5FZZA 4Q2FA 2D6PA 3MW2A 1W0PA 2E4MA 3ZSJA 4P9YA 1Q8OA 1WLWA 3PUBA 3A4UA 1FYUA 2A7AA 3WDXA 3INAA 1LESA 3FUOA 4LO0C 3WDWA 1WBAA 3I2AA 5E89A 5JVVA 2GN7A 3RS6A 1J0SA 1FN0A 4AVTA 2ZA9A 3T1LA 4I1EA 1VALA 4I4XA 1TWMA 2Q9XA 1DFQA 3VUOA 2HWAA 3BAQA 1IS4A 2AUYA 5GLZA 3SH5A 1GSLA 1A3KA 5BXSA 4FPOB 5BQUA 2NMNA 4GOYA 2AXMA 5FZYA 4LBKA 1FMZA 1JT5A 4Q26A 3SITA 3IM5A 3BIWE 2D44A 3ENRA 3POKA 1JT7A 1W6NA 1JY0A 5IK5A 1VAVA 2WBCA 3UL2A 4DRVA 3D6EA 2GO2A 4PBOA 1AX1A 2SLIA 1LOCA 2BFHA 3B01A 5JMCA 2AGSA 1UZZA 3AP9A 2WSUA 3H6RB 1UN1A 1N1VA 1GZWB 3WDVA 4DPNA 1FV3A 4GKYA 2D24A 1QDOA 3VKLA 2WQZC 5E24E 1W6MB 4YGDA 4EB2B 2D7FA 2XOAA 1LOGA 1ITBA 1EYLA 4LBOA 4Y20B 1Z4SA 4LO3A 4Y1ZA 3LLPA 2ZGQA 4KBBA 1Q04A 4ZXKA 3K1XA 1F5FA 4MYEA 2WRYA 2PHFA 1AXKA 2GNTA 4FP3A 4XIOA 1PZ8A 2ZMKA 2KLLA 4R9BA 4LO3C 4XHBA 1M16A 4QC4A 1FV2A 2ENRA 4DQAA 2K43A 4LBQB 3ZXDA 1IRAX 1QMJA 3HSMA 4JAWA 1PZZA 3FFZA 2GZBA 3H6RA 2CY6A 2DS0A 3O0VA 2DWRA 3HN1A 1T4QA 1V6NA 1GZWA 2D3PA 4FPJA 4Q1RA 3RSJA 2ES3A 4JRAA 2NYYA 3B9UA 2DV9A 3FJHA 3BA7A 1P63A 4FOYA 3BX1C 3FJ9A 21BIA 1HLCA 4AN6A 1OQLB 3WDTA 1KRIA 5F5QA 1AF9A 3A22A 1N3PA 1NLSA 2GN3A 4P14A 4ZOTA 3POSA 1F31A 3OGFA 2PHXA 2Z42A 2ZQOA 1BQPA 3O4OA 4YW1A 4YZ1A 3N7LA 1SFYA 2AREA 4YM1A 3BAVA 4LBQA 1OQ1A 1O4ZA 4GWNA 1IT0A 3O4DA 3VWCA 3FJFA 3H6QA 3AX4A 1MZ6A 5KXDA 1JLXA 1MVQA 1G9AA 4X3AA 2ZGNA 2ERMA 3AH2A 5I1BA 1IRPA 3ZVXA 4D69A 5BXPA 2FDBM 5HCAA 4OZXA 2OUHA 4DCKC 1WW4A 4LO2A 2ZHLA 3O4AA 4GALA 1W0OA 3VKNA 1MS3A 2HW9A 4YZ4A 2A3WA 1TTUA 2QN4A 2GNDA 5DXDA 4OEFA 4XE9A 4IY9A 1WBCA 5T5PA 1G9CA 2AFGA 5FREA 3CAHA 5CBLA 2ZGTA 4ZFYB 2Q3NB 3SH3A 1HWPB 5EYYA 4K1ZA 1V6UA 1KDMA 1GBGA 3GNEA 2ZGSA 3VV1A 4Y1XA 4XBNA 4Z9WB 4Q8LA 1AZDA 1FNZA 3R4UA 2D3SA 1SCSA 2PHTA 4OWJA 1QOOA 3POWA 2D1ZA 1URXA 1GKBA 3AYDA 1DFCA 4YFWA 4GKXA 4XJ8A 1JYCA 3ZXLA 3NV4A 4UW4A 3CA1A 3QYDA 2C5DA 3O0WA 4P0LA 1ILR1 1APNA 1MS8A 4R9DA 4I37A 2W39A 1AX0A 1DIWA 4IY8A 1DQ4A 3ZXFA 4ZKTB 5GZEA 1DQ2A 1G82A 4I4VA 3C9ZA 2A6YA 3RTJB 3WNXA 5DG1A 1T9FA 1FATA 1LGNA 5GZFA 2AAIB 1SLAA 5D62A 1YRZA 2JDZA 4Q9GA 4FPYA 2CYFA 3NJ5A 1HDKA 4YW5A 4YZ3A 5EXOA 2R1BA 1BKZA 2OVUA 4Q1PA 3CA4A 3ZXEA 2P3IA 3OBTA 4XBQA 3M1HA 4R9AA 3WA1A 2ZMNA 4XYXA 1DYPA 5DZFA 5GALA 2VH9A 1I1BA 1CESA 1G9FA 1J1TA 1EVTA 3Q7XA 3UD9A 1EPWA 3POYA 3NBCA 1RINA 2F2FA 3V0AB 4WVWA 4AGRA 1PUMB 4K20A 2EAKA 5DUUA 4Z8BA 2RHPA 3AKGA 1GYKA 3KM5A 1LHUA 5H9QA 2F2FC 2DU0A 1SLIA 2P3KA 1BASA 4I4RA 2RQ9A 2EXJA 2WT2A 1GANA 5HPZA 1AXMA 1FAYA 4JQ0A 2ZGMA 3O3QA 1NXD1 1PUUB 1AX2A 5EC5A 4LO7C 1QGLA 4F34A 2ZHNA 3W58A 4L4HA 3VSFA 2YV8A 1AVUA 1TEIA 5F90A 1RIRA 2EALA 5EHAA 1C4RA 5FNWA 1XG6A 2A3XA 2MLLB 3AXDA 1GZ9A 4D8HA 1JUIA 1RZOB 3WHUA 3D5OA 3O5SA 3FJDA 4NO4A 2ZHMA 1JHNA 1JN2P 2D43A 4FQ4A 4RA0A 2D3RA 2DUQA 1UAIA 3M3QA 3Q7WA 2R0FA 1N4KA 2NN8A 1ULDA 3BRDA 1SR4A 4ENDA 1UX6A 2DUPA 2A71A 5GZCA 3RG0A 1G86A 5DSSB 3ZXGA 1IS5A 3S8JA 1FWUA 5KXBA 2Z48A 3A21A 1LOBA 4CJMA 1SR4C 3AK0A 3CA5A 1WBLA 4I7IA 1SLTA 1BJQA 3FUQA 1SLCA 5DUWA 4YOLA 2ZZJA 2EXKA 3M2MA 3BODA 1UKGA 5GZDA 3WUDA 4EKXB 3UJOA 1C57A 3P6IA 3WLUA 5EYXA 1U0AA 3ILFA 1PZ7A 5BVPI 1ISZA 3WUCA 3W59A 1ULCA 2ERFA 4XTPA 3H6SE 4YW3A 1S0CA 2UUSA 4BOWA 1G8WA 1S0DA 2L5XA 1FQ9A 2KI4A 2VSEA 2R9KB 1DQGA 4YM2A 2OUJA 4KEJA 1MS1A 2AH2A 2QYIB 2CNAA 4GWMA 2H0BA 1S0LA 2D6KA 3AKFA 2D6OX 5KXEA 3OPZA 1DZCA 2ZGOA 1LHWA 7I1BA 4IONA 2G4IA 2E7TA 4W65A 3IN9A 5GLWA 3SNMA 2D20A 4QO3A 1S0BA 3ZSLA 4XKIA 3O5WB 4UW3A 3Q7YA 1YO8A 3N36A 3VKMA 4I4PA 3WG3A 2E7QA 2A6XA 4IZXA 1LHNA 3UJQA 3FJEA 4TLPA 1S0IA 1B09A 1SZ6B 4M00A 3AYCA 5BP5C 4PF5A 3F62B 2GMMA 1RG8A 5DUYA 4J23B 2WNEA 4I3NA 3LTQA 3PMEA 1TOOA 1DYKA 4H04A 1DQ6A 4FOQA 1SACA 3RRDA 5CAZA 1BXHA 1KITA 4TYSA 1ISWA 3AJ5A 2P34A 5H9SA 1HWNB 3GALA 1S0JA 4WZFA 3CQAA 3LSDA 4OEGA 2Y9WC 1BLAA 1X50A 2K8RA 5T54A 2DVFA 3AYAA 2LALA 5DVHA 2ZGUA 1LOAA 3IM6A 1BARA 1V6IA 2EF6A 1Q1UA 3NBNA 4USOA 4QBCA 3I29B 3BADA 1KNMA 3E8LC 4HA2A 3R05A 2LIQA 1DZDA 4FPKA 2PHWA 3P6JA 4KEKA 1MS9A 1IS6A 4JCKA 3OJVA 1C1FA 2A5ZA 1IS3A 4ZFWB 4QBVA 1AVXB 2YZ4A 3VT2A 1GNHA 4PQ9A 3FJJA 1OFSA 4NOTA 1QF3A 4GP3A 1QDCA 3BB2A 3VT0A 5E88A 4LO8B 2ZACA 4Q8KA 4YG3A 3UD8A 3ILNA 3JUUA 3CRGA 1MS5A 3AZXA 2ARXA 4WVVA 1ISYA 4GP0A 2D7IA 1QKQA 1DBNA 4XMIA 3PVEA 1ENRA 3WO4A 3FGMA 4Y1VA 2D6LX 4PBPA 4K21A 1IOBA 1BZWA 5IUQA 3ATGA 3V79C 5F9TA 1GICA 2P39A 1ONKB 3FJBA 2ZBJA 2VW1A 4Q27A 1E0OA 5T5LA 4G6JA 1MC9A 2VSAA 4QD2C 1ONAA 1V6KA 1G7YA 1CVNA 1WLDA 1N3QA 3IM7A 4ZLBB 2BEAA 4OEEA 1G9DA 3ILRA 4P9WA 1V6LA 5D61A 3DUIA 1FX5A 2Y9FA 2M49A 4YM3A 3MW3A 1BFFA 1IKPA 4ZGRB 2NMOA 5IK8A 1IJTA 1DHKB 4JKQA 2YMZA 1MACA 2EIGA 3FLPA 3HR9A 3I4IA 4ZBVB 2EXHA 3L2YA 2P2KA 4LBJA 5B2HA 4F83A 2DURA 1RY7A 3CU1B 1Q8QA 4Y1YA 3RQ0A 3AJ6A 3OJ2A 3CA0A 2OW4A 1QNYA 1WW6A 1GLHA 3AFKA 2X2SA 3H0OA 2Y9GA 5GM0A 3T2TA 2MIBA 2YY1A 2ZGRA 4FPCA 2ZMLA 4EEEB 4ZA3B 1PC8B 4UW5A 3SH4A 1ENSA 1WBFA 2W68A 3AH1A 1MR5A 4FPGA 3NWKA 3FLRA 1XQNA 3WCRA 4R6UB 3FJKA 4YZ5A 2E6VA 2RG9B 3ZSKA 1LJ7A 3N7KA 4OWKA 4ZFUB 3V64A 2YUGA 5F8SA 2FFVA 1HIBA 1CR7A 1LHOA 2FHRA 4XXAA 3UJ4A 4OW4A 1W3GA 1R1ZA 1PZ9A 4P0JA 1UL9A 1QU0A 1KDKA 4FOVA 1YI7A 3Q9OA 3ILAA 3M3OA 4PC4A 1CPMA 1ENQA 2WSVA 1LTEA 2W08A 1LODA 3ZSMA 4TZDA 2KI6B 4QKSA 1Q8SA 5E8AA 2KM2A 1TFMB 2IHOA 3FLTA 1H9PA 1S1AA 4HANA 3HOMA 4FPHA 3OYWA 1V6VA 1TP0A 2DU1A 3TAYA 4J2YA 4Z8SB 1A78A 3RMYA 2ZKNA 1LOFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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