3FFZA

Domain organization in clostridium butulinum neurotoxin type e is unique: its implication in faster translocation
Total Genus 344
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
344
sequence length
1251
structure length
1246
Chain Sequence
PKINSFNYNDPVNDRTILYIKPGGCQEFYKSFNIMKNIWIIPERNVIGTTPQDFHPPTSLKNGDSSYYDPNYLQSDEEKDRFLKIVTKIFNRINNNLSGGILLEELSKANPYLGNDNTPDNQFHIGDASAVEIKFSNGSQDILLPNVIIMGAEPDLFETNSSNISLRNNYMPSNHGFGSIAIVTFSPEYSFRFNDNCMNEFIQDPALTLMHELIHSLHGLYGAKGITTKYTITQKQNPLITNIRGTNIEEFLTFGGTDLNIITSAQSNDIYTNLLADYKKIASKLSKVQVSNPLLNPYKDVFEAKYGLDKDASGIYSVNINKFNDIFKKLYSFTEFDLATKFQVKCRQTYIGQYKYFKLSNLLNDSIYNISEGYNINNLKVNFRGQNANLNPRIITPITGRGLVKKIIRFCKNIVSVKGIRKSICIEINNGELFFVASENSYNDDNINTPKEIDDTVTSNDLDQVILNFNSESAPGLSDEKLNLTIQNDAYIPKYDSNGTSDIEQHDVNELNVFFYLDAQKVPEGENNVNLTSSIDTALLEQPKIYTFFSSEFINNVNKPVQAALFVSWIQQVLVDFTTEANQKSTVDKIADISIVVPYIGLALNIGNEAQKGNFKDALELLGAGILLEFEPELLIPTILVFTIKSFLGSSDNKNKVIKAINNALKERDEKWKEVYSFIVSNWMTKINTQFNKRKEQMYQALQNQVNAIKTIIESKYNSYTLEEKNELTNKYDIKQIENELNQKVSIAMNNIDRFLTESSISYLMKIINEVKINKLREYDENVKTYLLNYIIQHGSILGESQQELNSMVTDTLNNSIPFKLSSYTDDKILISYFNKFFKRIKSSSVLNMRYKNDKYVDTSGYDSNININGDVYKYPTNKNQFGIYNDKLSEVNISQNDYIIYDNKYKNFSISFWVRIPNYDNKIVNVNNEYTIINCMRDNNSGWKVSLNHNEIIWTLQDNAGINQKLAFNYGNANGISDYINKWIFVTITNDRLGDSKLYINGNLIDQKSILNLGNIHVSDNILFKIVNCSYTRYIGIRYFNIFDKELDETEIQTLYSNEPNTNILKDFWGNYLLYDKEYYLLNVLKPNNFIDRRKDSTLSINNIRSTILLANRLYSGIKVKIQRVNNSSTNDNLVRKNDQVYINFVASKTHLFPLYADTATTNKEKTIKISSSGNRFNQVVVMNSVGNNCTMNFKNNNGNNIGLLGFKADTVVASTWYYTHMRDHTNSNGCFWNFISEEHGWQEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type E
publication title Domain organization in Clostridium botulinum neurotoxin type E is unique: its implication in faster translocation.
pubmed doi rcsb
total genus 344
structure length 1246
sequence length 1251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3ffzA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ffzA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3ffzA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3ffzA01
4PBPA 1JN2P 3QIXA 4DRRA 4ZFUB 1FV3A 3VKNA 3QIZA 1NXD1 1SLAA 5JOYA 4X39A 1YTOA 4Y1ZA 2HWAA 1V6LA 1ULCA 4YGDA 1V6JA 3FGMA 3LSEA 2QYIB 5EXOA 4J2SA 3I4IA 2NMNA 5FREA 3UJ4A 1WBAA 5EYYA 5F5QA 3N7MA 1W6PB 1S0BA 2FMDA 3RQ0A 1MS1A 2VW1A 2FFVA 1QDCA 4Q2FA 1ISYA 4GWNA 2IWTB 3PVNA 4BOWA 2A6WA 3B00A 3AJ5A 3MW2A 3N35A 2V5YA 5D61A 1WBFA 3OBTA 4Q26A 4NO4A 5GLTA 2IMAA 1IHKA 4Z8SB 5JOXA 1YI7A 1ZKWA 3AKIA 3WDVA 4LBKA 2ZGPA 5EYXA 2ES3A 3BRGC 1Q8OA 2GNDA 1LOCA 1GZ9A 4PC4A 4QKRA 3CA3A 4OUJA 2YROA 2ILPA 2NP0A 3AZYA 4XJ8A 3VT0A 4Y20B 5T5OA 4HJJA 1R8OA 3CRGA 4J2XA 1S0DA 1XHBA 2FFUA 3AYDA 3PJQA 4HR6C 3AYCA 4FPEA 3D3XA 2NTDA 3AFKA 2CNAA 2JE7A 1S0CA 2PHUA 1S0IA 1UL9A 4U2AA 1R8NA 5BYNA 1CVSA 3FJKA 4R6UB 4TYSA 5JOZA 3OBRA 3WDYA 5EWSA 3ZSMA 4A7YA 2D7FA 3ZPYA 1AF9A 3AJZA 1N1TA 2R1DA 2LIQA 3TAYA 4IY8A 1GZCA 4JC1A 1GLHA 5B2HA 2ETFA 4QD2B 4D0ZA 3I29B 3C89A 2PHRA 3BOKA 5F8WA 3IKWA 4WVVA 2TEPA 1FX5A 3I8TA 3JUTA 4ISQA 4AGGA 1UAIA 2C5DA 5CB7A 1AVWB 4OEFA 3WDWA 1DQGA 2ZGKA 1C57A 3O4DA 2AREA 2FGFA 3CRHA 2XOAA 2K4AB 5SV8A 1AVUA 4DENA 3R4SA 1DQ1A 4GKYA 2ZQNA 1LOGA 1K5UA 5DUXA 4FGFA 4LO2A 1PUUB 1N1SA 1DQ0A 3QYDA 1OQ1A 1E0OA 4PCRA 3V79C 2D43A 2JJ6A 4ATEA 3IN9A 3ZXDA 4XMIA 3M1HA 4EEEB 3OJBA 4EKXB 1MS5A 4GOVA 3QCWA 4ZJXA 1VALA 5IK8A 2VW0A 4YW1A 3T2TA 4P9XA 2ZGMA 2AQZA 4KTXA 1XTFA 3AH4A 2GN3A 1EV2A 5GZEA 4WVWA 4DFSA 1T4QA 1LEDA 2VY0A 21BIA 2NZ9A 1YO8A 3W58A 2E6VA 1IJTA 3VEQA 3JRRA 2P34A 4XIOA 4M3CA 1IOAA 2BEAA 4W65A 1DQ4A 2A6VA 3RS6A 1ZL5A 3BA4A 4Y1XA 3RRDA 1UZZA 1Q8QA 5T55A 3ILAA 3ZYRA 5EC5A 4XMAA 1SBDA 1V6WA 3AZXA 1UN1A 1S0LA 2W68A 4XKIA 1TOOA 3WCSA 4PF5A 1G9BA 1MZ6A 1NLSA 3POYA 1HKDA 3QJ0A 4D69A 4JP0A 3T1LA 1EVTA 4I8MA 3AZWA 2Y9WC 4M00A 1SCSA 3V0AB 3M3QA 3M3CA 3AXDA 3AK0A 3ZYPA 5IK7A 4I4UA 3VKMA 1BFFA 3A21A 1XQNA 2EIGA 3M3OA 2A3XA 2DS0A 3UD8A 3D7WB 2RSTA 3AYAA 1LGBA 4LO7C 3H6RB 2JE9A 2EAKA 4XJWA 1FWUA 1OKQA 4AVVA 1ZL6A 3WO4A 4P0JA 2WNEA 4XIKA 4J2KA 1JOJA 1AJKA 1QOOA 5BOWA 1ONAA 3FJEA 3V64A 3BADA 3DUIA 3HBWA 4XYXA 2Z49A 1X50A 2D6OX 3W9TA 3FIEA 3A0KA 4G6JA 5IT6A 2YMZA 2ARBA 3W59A 4JRAA 3FUQA 4UW4A 3A22A 2ZZJA 3CU1B 5BQMB 4I37A 2G7NA 1WW5A 3ZSLA 3FIIA 4I4QA 4P14A 1AX1A 2MLLB 1DBNA 4X38A 4ZKTB 2GMPA 2PHFA 1C1FA 4I2SA 1LOAA 4AGVA 2B7YA 3OYWA 1DQ6A 1C1LA 2W2DA 3VT2A 5JMCA 4IONA 1AVBA 2ZGQA 4LBMA 3V0BB 2PHTA 1ZM1A 1SCRA 3VSZA 4ZFWB 4WZFA 3QIYA 3AJ6A 4XXPA 3ILFA 3IPVB 2BFHA 1Q56A 3CA5A 4I4YA 1YRZA 4I0YA 1BYHA 3CAHA 1KJRA 3O3QA 4IZXA 3OJVA 3I2XA 1IRPA 4I4RA 4OEGA 1MVQA 1SFYA 2KLLA 2WJSA 4XBLA 3QW7A 1MS4A 1PZ8A 4XJ9A 3BIWE 2D6PA 3SH5A 3VT1A 2WLQA 4KEKA 2KI4A 5DUYA 2D20A 3AXEA 3WG1A 4ZA3B 4FQ4A 1W6PA 4SLIA 2DREA 1MS8A 5DSSB 1IT0A 3UJ0A 1U0AA 5E24E 4UW5A 4DCKC 3BTAA 1PC8B 4J1LA 2X2TA 1MD6A 2UWBA 1T3AA 3NBEA 1QXMA 3ZXLA 2A6XA 1VLNA 3SH4A 3WHUA 4I3NA 2JDZA 31BIA 4DS0A 2AH2A 3INAA 2A5ZA 1W6MB 2DUPA 1AXZA 1UKGA 4Z9WB 1JW6A 4OEEA 1FATA 4CJMA 3WUCA 1AVXB 3VWCA 2LTNA 4MYEA 1GKBA 3FLRA 2GNMA 4FOWA 4Y20A 1JLYA 4II0A 2R0HA 1I1EA 2G7PA 2I2SA 4LBQB 3RMYA 2Z48A 2DU1A 4GALA 5F90A 2A70A 1S0FA 1JTCA 1ZN3A 3VKOA 4LO3C 1S0EA 2H0BA 5DZGA 3AP5A 1MVEA 4R9AA 1HWPB 2JECA 1QNWA 2L5XA 4I30A 5CAZA 5DZUA 5HPZA 3SNVA 3BAUA 4OZXA 1MC9A 3IIRA 4L4HA 4FPYA 2DRYA 2DTWA 1C4RA 2ZBJA 1G7YA 5IUQA 4OW4A 3KM5A 2EF6A 4K1YA 4EFQA 1BKZA 4TLPA 4ZXKA 2F2FA 5G00A 5BQUA 1DHKB 1SLTA 1JLXA 4BMEA 2AFGA 2CY6A 2A71A 2ZHLA 4D0TA 4IHZA 3O5WB 1ENRA 2A7AA 2A97A 5DG2A 3CA6A 4YW4A 5DUWA 2XG3A 3NWKA 4AVTA 3CNAA 4JKQA 2R0FA 4XJAA 2EXHA 1ISXA 1FGAA 3UDAA 4KEJA 2Q3NB 5GLWA 4Q1PA 3ILNA 3WLUA 1ENSA 4QKSA 4YFWA 4Q8LA 3AP7A 4XHXA 2ZHKA 2A3WA 3HALA 3GNEA 3POSA 1GNZA 1OFSA 4YM0A 2EALA 4KC3A 3WCRA 1IS3A 1BQPA 4XOGA 5KXBA 3OJ2A 1LHVA 1ISZA 3D6EA 5BP5A 4M01A 1II4A 1GNHA 1D0HA 4IYBA 3CQAA 1CQ9A 4YW2A 4R9BA 1MS0A 4X37A 1MS9A 1PZZA 2IMCA 4YG6A 4Z8BA 2DV9A 3ZSJA 4D8HA 1W6OB 4X3AA 1S0JA 3N7JA 4I6IA 1G9AA 3UK9A 3FJ8A 2W52A 2FHRA 1LHNA 3TC2A 1WLCA 1TTUA 3EF2A 3B01A 1QQKA 2ZGLA 2NMOA 2J3PA 2DUOA 1V6UA 3PG0A 1JT3A 1TWMA 3IAGC 1XYFA 5FRAA 3BAGA 3FJJA 1JT5A 3NV3A 3BA7A 3NV4A 1LTEA 1QU0A 2P3KA 2DURA 1J1TA 1ULFA 4A7ZA 1CPNA 3AH1A 3QW5A 2ZGUA 2ZACA 3N0KA 2GDFA 2ZGTA 2D6NA 3R4UA 4H55A 4LBOA 4H9WA 1WBLA 1FNZA 3V0AA 3FBYA 4K21A 1CONA 2WKKA 3HOMA 3RG0A 3WA1A 4JAWA 4LO1A 4DEPA 3A23A 4LBQD 3ENRA 3AH2A 2MIBA 3ZX7A 1M2TB 4YOLA 2Q9XA 1HQLA 5T5LA 2D7RA 1WCSA 5KXCA 3H6RA 2AENA 3POWA 5BXTA 4LO2C 1QOTA 1ULGA 1I3HA 2R16A 3ZXEA 5FNWA 2YV8A 2HYKA 1RIRA 1N4KA 3AJYA 2VXTI 4XTMA 1DYKA 3WDXA 2QN4A 3P6IA 3DDAA 3UL2A 4LBNA 3P6JA 5BXRA 2AYHA 3WDUA 2DTYA 3DGTA 1CN1A 1DJSB 3OGFA 2EXIA 1DQ5A 2RG9B 5BQMA 1VAMA 4AVSA 4EFRA 3USUB 3SH3A 4WBCA 4FP3A 3JU9A 1PWAA 1J0SA 4HL0A 4FP2A 2XB6C 3A0NA 2YUGA 5GALA 2E4MA 1FNYA 1LODA 4Q8KA 2IHOA 3Q7XA 4FPJA 4LBLA 1OQLB 4ENDA 4BPZA 8I1BA 3V0BA 5GZFA 4YGEA 9ILBA 2ZAAA 1G82A 2D6KA 4KS6A 3MW3A 3O44A 5DVHA 3DDBA 3IPVA 3H6QA 3FJCA 3ZXJA 1URXA 3ILRA 4P0LA 5F8SA 5CA6A 3WV6A 4UW3A 3S8KA 1KJLA 1W6NB 3LCPA 3IM7A 3WO2A 5E88A 2YY1A 5DXDA 3FLPA 3RSJA 1TFMB 1IS5A 4A7KA 3M2MA 2CWMA 3FJBA 1ENQA 5I1BA 2VH9A 2AUYA 1S1AA 4LBJA 1FQ9A 1P63A 1A8DA 2W08A 2BQPA 5IK5A 4WV8A 1Z0HA 4AN7B 1A3KA 1W6MA 5GJ6A 1H9WA 2AR6A 4GAIA 1LECA 4G9NA 4YG3A 3SITA 4G6MA 1YXWA 5AVAA 1KITA 3NV2A 4C1XA 3QR5A 2ZMNA 1N1YA 2VSEA 3C9ZA 2PHWA 1LESA 4LBQA 3H6SE 4AGRA 1G9FA 1CESA 2HWMA 1F5FA 3MEPA 1QF3A 1A78A 3A07A 3FJ9A 4ZFYB 3K1XA 1WW4A 1Z4SA 1PUMB 4XFUA 1V6OA 1ISWA 3PUBA 4FPFA 4LO0A 2DYCA 3E8LC 2D6MA 1SLLA 1CPMA 4Q27A 2MC2A 4XHBA 3N7KA 2RQ9A 3ZVXA 1G9CA 4HANA 1S0GA 1FYUA 3WINC 1ISVA 5E89A 4EJ5A 2CTVA 3O0WA 2WBCA 2ZGOA 2R1BA 5DZEA 1IKQA 2XHLB 1VAVA 3BODA 2D3PA 1LU2A 4YZ3A 1GZWB 2G7QA 1DQ2A 3C2UA 4QBVA 3BAQA 1CJPA 2ZABA 3MALA 5KXEA 3BONA 1HDKA 2VW2A 2KKIA 1PZ9A 3WINA 1HWMB 1GANA 3K3QB 4PBOA 3AZZA 4Y26A 1Z2VA 4Q1RA 5DUVA 3FJHA 3M3EA 3UJQA 3A4UA 2EXJA 2AXMA 1R1ZA 4YLZA 3O49A 4CZSA 2A6YA 1SLBA 2P37A 4RA0A 3B9CA 4XXAA 1DFQA 1HQWA 1IS6A 4XFSA 1ILR1 3OJMA 3CRIA 4PQ9A 4XE9A 2BEBA 4DPNA 1IKPA 1MACA 4P9WA 1L2HA 2ZMKA 4Y22B 1W6OA 1QGLA 3WO3A 2OVUA 1DYPA 4ITCA 4YZ4A 1IRAX 2D3RA 4EFPA 1DZCA 3T8SA 3HSMA 1V6IA 2GMMA 1HWNB 2FPQA 3BX1C 4IQPA 1JBCA 2D24A 1F82A 2ZKNA 3HMYA 1GGPB 1W3GA 4FVVA 4XFTA 2UU8A 3OY8B 1CIWA 2DU0A 3BB2A 4I4XA 1W0OA 2ISHA 1RY7A 4QD2C 5FZYA 1JXNA 5E8AA 4I4VA 2HW9A 3HN1A 2K8RA 5H9PA 1SR4A 2D1ZA 3N36A 3RMXA 3UD9A 3FJIA 4DRVA 4G9MA 4FPOB 2F2FC 5BQUC 2D3SA 1BXHA 7I1BA 3KQRA 5BXPA 2ZHNA 2DVDA 1FMMS 2A3YA 1HLCA 4ASMB 2Q5TA 4HA2A 6I1BA 1NUNA 1LHWA 4RL7A 1G86A 2D22A 3AX4A 1SLIA 2GMEA 2OUHA 1AVAC 2ERMA 4EL4A 1V6KA 3C88A 1H30A 3BOPA 4FPGA 1AJOA 5HCFA 1EPWA 1BFBA 5H9RA 4AYUA 4XDQA 1T3CA 3SNMA 3AP6A 3IMNA 1HKNA 3CA0A 2F8XC 3NF3A 1V6MA 4GA9A 5BP5C 1W0PA 1LULA 2M49A 4ISRA 5GZGA 3USUA 4C1WA 2YZ4A 2P3JA 5HCBA 1N1VA 1BZWA 5T52A 1QNYA 1LHUA 1UX6A 2GO2A 2W39A 1Q04A 3ZUQA 1RZOB 4ZBVB 1YYNA 3JUUA 1G8WA 1BASA 3LTQA 5CBLA 1SBEA 4XBNA 5GLZA 4Y1YA 3ASIA 3RTIB 2GALA 5LK5A 1HCDA 2ZGSA 1GSLA 4FOVA 3BA5A 3DS9A 4L8QA 1AXYA 3ZSKA 1APNA 1Q03A 3NBNA 1MS3A 4GWMA 1JYIA 1JUIA 3O0VA 3CA4A 4QBCA 4JCKA 1JHNA 2JKBA 3I2AA 1SACA 1N3OA 3FLTA 5FZUA 1KDKA 3WNXA 4BLJA 4I96A 2DVFA 4I4SA 4HEVA 5GAQA 1LENA 4ZOTA 1B09A 4LO8B 2E53A 4U36A 2CL2A 3AKHA 2ISEA 2IMBA 4FQZA 1Q8PA 1W6NA 3B3QE 1TWEA 1PZ7A 4JPZA 2LIEA 5JOWA 2OW4A 2E7TA 2DVGA 1ULDA 3Q9OA 1XZZA 2D6LX 2G4IA 1VCLA 4LO1C 1O4YA 3R05A 5BXSA 1W3AA 1Q8VA 4CRQA 4OWLA 4GP3A 1O4ZA 1GYKA 1AFCA 1F9KA 1BLAA 5T54A 3DEBA 1ULEA 4NOTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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