4ISRA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with rat synaptotagmin ii
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Neurotoxin
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isrA02
1AVBA 2P3KA 1WLDA 1LHOA 2VSAA 1O4YA 5EG6C 2WJSA 1V6XA 1KDKA 3BOPA 4LO7C 2OUHA 3AP4A 4AN6A 4XOGA 2EALA 4HL0A 2JJ6A 3HBWA 1JYIA 1IRAX 2D1ZA 4D8HA 4Y20A 4QBCA 2Y9GA 2ZGQA 3VV1A 3PVEA 2EXJA 5GZDA 5JOXA 3ZSKA 1W3AA 2GNBA 1LEMA 1Q1UA 2M49A 4M00A 3QR5A 5F90A 4XJ9A 4Z8SB 1RMLA 2FGFA 1S0FA 2VW1A 3AFKA 2R0FA 1KNMA 3VKFC 4FQ4A 1Q03A 3OY8B 2ZHLA 3MEPA 5EXOA 1HQWA 4CZSA 5KXBA 4IZXA 4XJWA 2D7FA 3M1HA 5HPZA 1LU1A 4X38A 4JQ0A 4JCKA 2ESUA 3WUCA 4BLIA 1XG6A 1IKQA 3I4IA 1LEDA 2XB6C 1Q8PA 2Z48A 3ZXFA 4YFZA 4I4PA 3WG1A 1JBCA 5BXRA 2VW2A 1AFCA 4USPA 4R9AA 4I1BA 3O5WB 5GAQA 3HSMA 3BIWE 1Y7BA 3BAQA 3QYDA 2KLLA 3T8SA 1F5FA 2D24A 1WCSA 4KEKA 1SLIA 1W6OB 3OYWB 3E8LC 1CQ9A 1HLCA 5T54A 5IUQA 4KC3A 5GLUA 4FVVA 1ABRB 1GGPB 1SZ6B 3NBEA 3JUUA 1HKNA 4XJUA 3AKGA 2ZGPA 2LALA 2WSVA 3ILNA 2PHXA 4YG6A 4G6JA 4XFSA 1LENA 2YV8A 3AZYA 5BOWA 2GN7A 2A7AA 3WO3A 4XYXA 3O3QA 2DRZA 2YZ4A 1HCEA 4YOLA 1YF8B 3NV2A 2C9AA 1BXHA 1AVUA 1S0CA 1G9FA 5DUXA 1LOBA 1W3FA 3AJYA 1JY0A 3IAGC 1HCDA 1JT3A 4YLZA 4Y1VA 1LULA 3AH1A 3LTQA 2ZA9A 1LOAA 2RQ9A 2W52A 3NV4A 4XE9A 4I3NA 1JLYA 3O4CA 3ZSLA 1HDKA 4GOYA 3RMYA 2YROA 1W6QA 3PMEA 1TTUA 4CRQA 1ISYA 1FMMS 1YI7A 4EB2B 2ZHKA 4FPEA 4XFUA 2ZABA 1RINA 1LOEA 1BJQA 5BP5A 2OUJA 2NTDA 3AJ5A 4EEEB 3B69A 4Q9GA 3IM6A 3B01A 2CNAA 2J3PA 1LGBA 2Q9XA 1WBLA 3JU9A 4GKYA 2AR6A 3V0AA 2DVDA 2ZQOA 3TAYA 2EXKA 2VW0A 3JRRA 1W3GA 1QQLA 1DZDA 1AVAC 5D63A 1SFYA 1FX5A 3POSA 4LBLA 2FO1A 1BFBA 1SLTA 3POYA 2BEAA 4P14A 2NZ9A 4LO0A 4XXAA 1VIWB 1MS1A 1GLHA 2DUQA 3TB0A 1H9PA 1CE7B 1DQGA 4M3CB 3W59A 4AYUA 4IONA 4I4OA 4ZBVB 3M3EA 3A07A 1ULGA 3FFZA 1CONA 1QF3A 5DZUA 2W68A 1GANA 4QKRA 1Q04A 2K43A 2E4MA 2UWBA 2D44A 3WDUA 3UJ4A 2ZGOA 5IK8A 3USUB 5BXTA 4JKQA 4L4HA 1BASA 4ENDA 1LECA 5H9RA 2Q3NB 3CA6A 4Q1PA 5GLVA 3CA4A 1R1ZA 5SV8A 4FOQA 1LGCA 3ENRA 4YGBA 1QXMA 1QOSA 3WVJA 4Q9PA 4XJ8A 5H9SA 4DS0A 1SLCA 3CRGA 3IPVA 4ZGRB 1DQ4A 2EXHA 1AZDA 1NZKA 2ZMKA 3B3QE 2A71A 4I4SA 2NVHA 1WW7A 3AP9A 2KKIA 2ZGRA 4OWJA 4P9XA 3PUBA 3AKIA 2A3YA 1JT5A 4WBCA 4DEPA 3UD9A 3B9UA 2QN4A 1JT7A 1QU0A 4J23B 5GLWA 1MS5A 1V6MA 2ZACA 3N7JA 3N7KA 5E8AA 1KJRA 1ILR1 3BAGA 3I2AA 3AZVA 21BIA 3ILFA 1MC9A 3P53A 1WBFA 4P0JA 2WT1A 3GALA 4EKXB 1VCLA 2AFGA 3V64A 1PUMB 1BYHA 3WDTA 5DXDA 1IS6A 5FZUA 1UZZA 5T50A 3N7LA 2IWTB 2VSEA 1PUUB 4LBOA 1KQRA 3V65A 2PHUA 4KBBA 2PHRA 3BTAA 5DUYA 5EHAA 2D6OX 4QO3A 3VSZA 5EWSA 1IS3A 3NBDA 2FFUA 1LESA 4I4XA 4I8MA 3D7WB 4DENA 3OY8A 5JLVA 1WW4A 3TC2A 2R1BA 4DPNA 1A78A 4R9DA 1J0SA 3AXDA 3M3QA 3OJVA 4K1YA 5GM0A 1O4ZA 3WUDA 1JHNA 2DV9A 4QD2B 1OQ1A 3MW2A 4YW2A 3ZX7A 2ZGKA 3BB2A 2AGSA 3WINA 5IK5A 5GZGA 2WSUA 1MACA 2A6YA 3ZXEA 5JVVA 3FJFA 7I1BA 4WVVA 4A7YA 1TP0A 3POKA 1DFCA 3ZYRA 3O4OA 2VUAA 3D5OA 4Y24A 3IM5A 1W6OA 3M3CA 3OYWA 1GSLA 1CPMA 1S1AA 4JP0A 4IZEA 1VALA 3CRHA 4AGGA 3IM7A 4LO1A 5GLZA 4BPZA 1ISWA 2D23A 1G82A 3RMXA 4FP2A 2VXTI 5D62A 2DVGA 3O0WA 2PELA 3O5SA 4XMAA 4OWLA 2K4AB 4Q8KA 3FJDA 3INAA 1Z0HA 1R8NA 2C5DA 5CB7A 3BA7A 1PZ7A 1TOOA 1V6VA 2MIBA 3VSFA 4YW1A 3ASIA 4JC1A 3VKLA 1V6IA 1ENRA 2E51A 1NXD1 3OPZA 1SBEA 2ZAAA 4PCRA 3BRFA 4GKXA 2CYFA 1HQLA 2HWAA 3AP6A 2GDFA 1FN0A 3CAHA 1ULCA 3FJIA 4XBQA 3WCRA 3HOMA 1ULEA 1LHUA 2R9KB 1P63A 4X37A 3O4DA 3T2TA 4LO0C 4U36A 2UU8A 2AREA 3BA5A 2V5YA 4I7IA 1ENSA 3R05A 4F83A 3ZXLA 3O12A 3KQRA 2WRYA 5FZYA 1V00A 5T5OA 2E7TA 1CN1A 3AJ6A 2E6VA 2E4MC 2P2KA 4OWKA 2P34A 2DYCA 3P6JA 1ISXA 4GAIA 1SLBA 3CA1A 3RS6A 4M01A 3FJ9A 2GMPA 4XIKA 1S0GA 1HWPB 1QNWA 1UPSA 1Z4SA 4YFWA 4A7ZA 3N3HA 4DRVA 1V6UA 5B2HA 1JLXA 3PVOA 4FPKA 4F34A 2AXMA 2DVFA 2K8RA 1APNA 2Z49A 2D3PA 4YG0A 1LHVA 2KH2A 2A75A 1LOGA 4PQ9A 3WLUA 1LTEA 3OBRA 4Q27A 2XOAA 3WO4A 4M3CA 1DYKA 4J2SA 3CA3A 4GALA 2DREA 4IYBA 4XHXA 5T52A 3WDXA 2ZHNA 1DQOA 4IQPA 4D0ZA 2BEBA 3WNXA 4Y1ZA 1I1BA 1QOTA 4LO3C 3ILAA 3USUA 2GO2A 3ZSJA 1IJTA 4TYSA 5FZZA 2WKKA 1WW6A 1V6JA 2MLLB 4FPHA 1BARA 3NV3A 1ONAA 3AYEA 3O0XA 1I3HA 4CTEA 1JXNA 4Y22B 3AK0A 1PC8B 3LCPA 1MS9A 1FQ9A 4YZ4A 5G00A 2JE7A 3R4UA 2NMOA 1S0LA 3RTIB 4X3AA 2D6KA 2ERFA 4XHBA 1QOOA 2D7IA 2JDZA 2I2SA 1N1TA 1QDCA 2GMEA 5BVPI 4JKXB 1IKPA 1I1EA 2W39A 3SH3A 4H04A 1CIWA 3LSEA 1FNZA 3FUQA 1LHWA 2ZGTA 3WINC 5F8SA 2WT0A 2VH9A 2ERMA 3ZC9A 3EF2A 2AH2A 2D3RA 1ULFA 3FJHA 3N0KA 1JW6A 4MYEA 2AAIB 3WOGA 3CRIA 3CU1B 4YZ1A 3PJQA 2CTVA 4XXPA 3FLRA 3AYAA 1OKQA 1JT4A 3KM5A 2A70A 3K1XA 3OGGA 4LO1C 4OUJA 5AVAA 3AH4A 5DG2A 1AXZA 1LOFA 5E89A 4YGCA 1L2HA 2CWMA 3A22A 1JTCA 4FPCA 2YY1A 2KM2A 3DUIA 4P6AA 1MS8A 2F8XC 4FPJA 5T5PA 1GZ9A 1UKGA 4YZ2A 1TFMB 2NP0A 3FBYA 1BFCA 1WBCA 4II0A 4OW4A 3IIRA 3BODA 3ZXGA 3M2MA 4L4IA 1YRZA 5LK5A 1Q8QA 4XJAA 4Y1XA 1ISVA 2FDBM 1LU2A 1YBIA 4P0LA 1XYFA 5GLTA 4Q91A 3MPPG 1CVNA 4FOWA 4UW6A 3FUOA 3F62B 2GZBA 3FGMA 4EFPA 3ZPYA 1Q8OA 1KITA 3O0VA 1NLSA 3FJKA 2YMZA 2DURA 1AJOA 3NBNA 4QALA 2PHTA 2JECA 3F1RA 4GP0A 4YM1A 1V6LA 1AX0A 3HN1A 5DZFA 1FAYA 1LHNA 5FNXA 1MS3A 1AVWB 2GNMA 3FLPA 5DUVA 1DIWA 2ZGLA 1IOAA 2A6ZA 3WDWA 4UW3A 1SLAA 3FJBA 2D6MA 5F8YA 1V6KA 2KI4A 4UW5A 4PBPA 5BYNA 1XHBA 1TEIA 1N1VA 2A3WA 3BA4A 3DGTA 3BADA 4Q26A 5DUWA 4AGVA 3NJ5A 1QQKA 4GP3A 4JPZA 2UUSA 3V0BB 3IN9A 1UAIA 1HKDA 4OEGA 2JE9A 4G1RA 1DQ2A 4I0YA 1N1YA 5IK7A 2R16A 2DUPA 4C1XA 3VWCA 1ONKB 2JD4A 1DQ6A 2AUYA 1AXYA 4R9CA 4IY8A 1V6NA 3BRGC 2GALA 3VT0A 1DJSB 4XTPA 3RTJB 3WZ1A 1LOCA 4YGDA 1BKZA 4PBOA 4RL7A 3R4SA 4Y1YA 4NO4A 3WMVA 1GZCA 4XFTA 3IKWA 3AKFA 4LO3A 3OJMA 4KEJA 4P9WA 4XJZA 2OVUA 5DZEA 4D69A 4AVSA 1JQZA 3I8TA 1ZA4A 1MR5A 1HIBA 3FJAA 3BX1C 2SBAA 4OZXA 1RY7A 4ZFUB 5DUUA 2YUGA 1D0HA 4ZLBB 2D3SA 3BRDA 1EV2A 4DQAA 1B09A 5GZCA 3RRDA 3W9TA 3H6QA 5F5QA 4I4UA 4DRRA 2TEPA 2D7RA 5H9PA 4YW5A 2A6VA 3NV1A 4I1EA 1PZ9A 2R1DA 2F2FA 4EFRA 4HA2A 5CNAA 4ATFA 1C1FA 2ARBA 2NN8A 4SLIA 1WLCA 2GN3A 2EXIA 4XZPA 3HR9A 4JAWA 1VLNA 1FATA 4Q8LA 1R8OA 2ES3A 3ATGA 3D4KA 4XKIA 4AN7B 2OW4A 3AKHA 3BAOA 1FV2A 1DYPA 4K21A 2D22A 1FMZA 3VT1A 5GJ6A 2BFHA 4J2KA 3VKNA 2QYIB 2ZGUA 5CA6A 2DVAA 4Y22A 3T1LA 2HW9A 1K5UA 3T1MA 1II4A 4I6IA 4ASMB 1DQ0A 5EC5A 4I4QA 1LOFC 1SR4A 1WUVA 4G9MA 1WW5A 2VY0A 1DZCA 1UMZA 1F31A 1SLLA 2ZMLA 4YW4A 4FPGA 2HWMA 4P0KA 3SITA 1A8DA 1ZM1A 4LO7B 1JN2P 1IS5A 1G7YA 3UJQA 4QD2C 1AJKA 3GNEA 3AP5A 3VEQA 1QDOA 1GYKA 4Y26A 1N3PA 3CQAA 1FGAA 2DS0A 1WLWA 3APBA 2Y9FA 1DLLA 1GZWB 2BQPA 3P6IA 1MZ5A 8I1BA 1FWUA 5KXCA 4XIOA 3WHTA 4BMEA 3ZXKA 2P3JA 4I4VA 2SLIA 4OEEA 2B7YA 1WD4A 2W08A 2A6XA 4I2SA 1HWNB 3FJCA 3C9ZA 3AJZA 2A5ZA 4LBQB 3H6RB 1IT0A 2A6WA 3AZXA 1CESA 3SNVA 1PWAA 1N3OA 2UURA 4ZFWB 3CA5A 2AENA 3ZC8A 1ITBA 5JOWA 1G86A 5E88A 1SBFA 2DRYA 1FWVA 1RIRA 4I4RA 1TWMA 3KMVA 4AWDA 1KJLA 1W0OA 4FOVA 4LBQD 1BZWA 3OBTA 5DG1A 41BIA 5T55A 4ZOTA 1C1LA 2CY6A 1Z78A 1IRPA 2ARXA 1LCLA 4K1ZA 3MALA 2FMDA 3PHZA 3OGFA 5D61A 1MZ6A 3PG0A 4NOTA 1PZZA 2WLQA 2D6NA 3SH5A 6I1BA 4YZ3A 5CAZA 3CA0A 4GOVA 5FNWA 4XILA 2ZMNA 3FLTA 4R9BA 5EYYA 4GXLA 4HJJA 1LGNA 1AVXB 1DQ5A 1HWOB 3OJBA 2XG3A 4Q1RA 1GNZA 1BLDA 2UWCA 3U4XA 2KI6B 4LO2A 3NWKA 3MW3A 5BQUA 4FGFA 3VKOA 4YGEA 3A23A 4EFQA 4J2XA 4AVVA 3UJOA 2VLCA 1AXKA 2G4IA 1AXMA 1KRIA 5L73A 1GKBA 3V0BA 1IOBA 4LBJA 3AYDA 4I37A 3W58A 2EAKA 3UD8A 4P9YA 1SCSA 1Z2VA 3UD7A 4JRAA 1YIFA 4XMIA 1T4QA 1XQNA 3VT2A 4YM3A 2LIEA 2Q5TA 3JUTA 4BMBA 4ZXKA 1HWMB 5GALA 2F2FC 2IHOA 1AX1A 4U2AA 3A0KA 1G9AA 2DVBA 4ZKTB 4XDQA 1M16A 2ZKNA 2NYYA 2LTNA 4TZDA 3AXEA 1RITA 4DFSA 4QKSA 3Q7XA 4DCKC 2WT2A 4YZ5A 2A3XA 4G6MA 1N47A 4XTMA 1W6MB 3I29B 3HMYA 1JUIA 3VKMA 1U0AA 2R0HA 2NM1A 1RZOB 1S0JA 1N3QA 4IY9A 1W6NB 1FV3A 2WQZC 3WDYA 4QBVA 1MD6A 2RHPA 3AX4A 5F8WA 5JDBA 1XZZA 1QKQA 4KEIA 1ENQA 4FP3A 3Q7WA 1SR4C 2RG9B 3L2YA 3O4BA 2HYKA 2R49A 3AZZA 1OQLB 9ILBA 2VU9A 3A0NA 2D6LX 1MS4A 4H55A 4TLPA 1EYLA 1OFSA 1G8WA 3ZVXA 3AP7A 4GAFA 1UX6A 4BM8A 2D20A 1C4RA 4Y20B 2PHFA 4Z8BA 1T9FA 2P37A 5JOZA 5BXSA 1GNHA 3AYCA 3WMUA 4X39A 1DQ1A 3RQ0A 3FJ8A 5IT6A 2I1BA 3H0OA 3N36A 2ZQNA 31BIA 1BLAA 3MW4A 4BOWA 3WA1A 1UN1A 3I2XA 4LO8B 3IM0A 2ZGSA 2HZ9A 4FPOB 3LSDA 3NBCA 1Q56A 3O44A 1K5VA 1YXWA 5T5LA 5DZGA 1VAMA 2GNDA 5FRAA 1QNYA 4FPFA 4OEFA 1FYUA 2DUOA 4CJMA 1N4KA 3FJEA 1BQPA 4ZFYB 2ZR1B 1PZ8A 1AF9A 3RSJA 3UL2A 1H30A 2ENRA 2DTWA 1IILA 1E0OA 1RG8A 3IMNA 4K20A 1W6PA 3WG2A 1G9BA 2ZHMA 5DVHA 2E53A 3WDVA 1Q8SA 1BFGA 3VUOA 2Y9WC 4ZA3B 1C57A 5GZFA 2YXSA 5DSSB 4W65A 2V73A 5E24E 1DFQA 2ZBJA 2DU1A 1CR7A 4WV8A 1DBNA 1WD3A 1BA7A 1ISZA 1TWEA 3SH4A 2X2SA 2EIGA 3B00A 5I1BA 1GZWA 1A3KA 1S0DA 1MVQA 1YTOA 3S8KA 2CWSA 4HR6C 4L8QA 2PHWA 3BAVA 1JOJA 3SLIA 3ZYPA 1X50A 3C2UA 2WNEA 1MS0A 2FHRA 2P23A 1GV9A 3WCSA 1URXA 4ITCA 5HCAA 1WBAA 5GZEA 2WBCA 4XBLA 2DWRA 2D6PA 4LBQA 3H6RA 4Y1UA 4YG3A 2P3IA 4H9WA 1UL9A 3ZXDA 2LIQA 4FPYA 1F9KA 1SBDA 1YYNA 1YO8A 4RA0A 3ZSMA 4G9NA 4LBKA 1FNYA 1GICA 1DHKB 5JOYA 4FPLA 4LO2C 5BQUC 1DGLA 3A4UA 1TIEA 1SCRA 3BAHA 3QCWA 4YM2A 4PC4A 1MVEA 2MC2A 4LBMA 3UDAA 4YW3A 1J1TA 3Q9OA 1S0IA 3N7MA 4A7KA 1W6QB 4BLJA 3Q7YA 2EF6A 2P39A 1SACA 2AYHA 4UW4A 2GNTA 1AX2A 5F9TA 4IHZA 4AGRA 3CNAA 3A21A 4ISQA 4M3CE 1GBGA 4J2YA 1QGLA 1BFFA 4GWNA 4Q2FA 5FREA 3D6EA 3ZXJA 2CL2A 1M2TB 4I4YA 2D43A 3SISA 3WHUA 1D2SA 2GMMA 3LLPA 4QC4A 3V0AB 1QMJA 1UZYA 4Z9WB 3UK9A 3PVNA 1W0PA 2UWAA 2AQZA 2RSTA 2L5XA 5EYXA 3BAUA 4FOYA 2Z42A 1H9WA 1ULDA 3WO2A 1V6OA 4GWMA 4YM0A 1Q8VA 4C1WA 4ISRA 1LODA 5CBLA 3S8JA 2Y9XE 4PF5A 4I96A 4GA9A 3SNMA 1CJPA 1S0BA 2NMNA 1W6PB 1G9DA 4ATEA 3N35A 4WVWA 3WG3A 1IHKA 2VXRA 4I30A 5H9QA 2E7QA 1S0EA 3POWA 4R6UB 1N1SA 2DTYA 1JYCA 3WV6A 5BP5C 3O4AA 2X2TA 5T5JA 2ZZJA 4AVTA 1V6WA 3OJ2A 1EVTA 3HALA 1VAVA 4HANA 1IS4A 3UJ0A 2FFVA 2DU0A 1CPNA 3AH2A 3RG0A 2JKBA 4LBNA 5JMCA 2H0BA 5KXDA 3IPVB 3O49A 4WZFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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