1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
1HKNA 1C1FA 3PUBA 3O3QA 4FPEA 2DYCA 3N7MA 3NV1A 4YG6A 1PUMB 5DZFA 2K43A 1LGCA 3VSFA 1S0CA 4K1ZA 3PJQA 1TIEA 1SBEA 3CA0A 2HWAA 4EKXB 1AX1A 4YGDA 1UX6A 3ZC9A 4LO2A 3RQ0A 3CRGA 1DZCA 2IHOA 5JDBA 3A21A 3AXDA 2UWCA 1Z2VA 3MW3A 4XJAA 4FPGA 3UJ0A 1G9BA 2Q9XA 2AENA 1SBDA 2D7IA 1FYUA 3OYWA 4DQAA 3IAGC 2HYKA 2F2FC 4II0A 1W3GA 4YZ4A 4Y20A 3AZZA 2UUSA 3UJOA 3JRRA 1QQLA 4IY8A 2LTNA 1QXMA 3AYAA 4JCKA 3O4DA 2PHUA 4PQ9A 1ENSA 2AR6A 4P9XA 4I4OA 4X39A 4GP0A 1LTEA 2ES3A 5F8WA 1YIFA 4EFRA 1W6PB 3ZXGA 3DGTA 2AQZA 4I37A 1GZCA 1HLCA 1LHWA 3A0KA 4A7ZA 3Q7WA 5AVAA 2ZGQA 1WBAA 3ENRA 1IKQA 2YMZA 5DUVA 4L4HA 1RIRA 2Y9WC 1VALA 3HALA 1BXHA 1DQ0A 1PZZA 3HBWA 1FNYA 4G9MA 3V65A 3BAVA 1GZ9A 3PVNA 4K1YA 5T5OA 4XBLA 4LO3A 2OW4A 1UZZA 4C1WA 2GN7A 3WDVA 1GSLA 4XXAA 1V6XA 2WLQA 1AVBA 2PHRA 3AP7A 1ULDA 1LOBA 1FMZA 4R6UB 2X2TA 3IKWA 2D23A 2D3SA 4X37A 3ZYRA 4D8HA 3P6JA 3CRHA 3E8LC 1XG6A 4EFPA 1WD3A 2WNEA 5D63A 1LHVA 1AX0A 3RRDA 1BQPA 1YXWA 2EXHA 2ZKNA 1XQNA 3CA3A 3JUTA 2JDZA 2NP0A 1OQ1A 1DIWA 1QQKA 3FJ9A 2ZQNA 4SLIA 5T50A 1ISVA 1N3OA 2BEAA 3FJJA 5T55A 4HR6C 4FPFA 3AZVA 4YG0A 3WDUA 2JE7A 1Y7BA 4GXLA 4YG3A 2GO2A 3MALA 1GV9A 5IT6A 3VT2A 4LBJA 1ISXA 1HIBA 3WUCA 4FPYA 1VLNA 1UN1A 3M3CA 1LENA 4OW4A 1ISWA 4I4UA 1Q8OA 4FVVA 1SBFA 3SNVA 3WG1A 5JLVA 1AFCA 1IHKA 3S8JA 1IRAX 1LGNA 1MS9A 1QNYA 2Z49A 1S0FA 2YV8A 4XZPA 5F90A 2ZGUA 2YZ4A 3H6RB 2P37A 4I3NA 1JT7A 2AFGA 3CQAA 1HWOB 5HPZA 3T8SA 1J0SA 2DVBA 1G9DA 2EIGA 4DENA 3SISA 2YXSA 3NV2A 2ZGLA 4I4RA 3N7KA 2DTWA 3BA7A 3ZX7A 3HMYA 1AZDA 1BZWA 4FQ4A 2A3WA 2WKKA 3LLPA 4LBQB 4G6MA 2ERMA 2DVFA 1APNA 3CAHA 4DCKC 3AP6A 2PHWA 4G9NA 5DUUA 2MIBA 3WDYA 3OJBA 1LHOA 4U2AA 3FLPA 3D5OA 3V0BA 3AYEA 3ILFA 1JXNA 4A7YA 1G9CA 3UD9A 1URXA 1JYCA 3KQRA 2R16A 4FOWA 3T1MA 1PUUB 4ENDA 5DVHA 3BIWE 2V5YA 4LO8B 4R9BA 1DFCA 5FNXA 2BEBA 3OGGA 5D62A 4GOYA 4XKIA 3A0NA 4H9WA 5T52A 3PHZA 2GMMA 5H9RA 1MACA 2GALA 4CRQA 2NZ9A 1W0PA 3CA4A 3NBEA 1MS1A 5T54A 5F8SA 2TEPA 1JT3A 4XJUA 1W6NB 4F83A 4LO7C 2DRYA 4XMAA 1LOCA 1RZOB 1CVSA 1FV2A 3VUOA 3PMEA 1Z0HA 3UJ4A 2E51A 1DQOA 3NJ5A 2AREA 3HN1A 2W08A 4FPJA 1V6WA 2ZHLA 1DHKB 2ZGRA 2OUHA 4Z9WB 1Q1UA 4YW2A 3ZYPA 3M3QA 1CJPA 5KXCA 5BQUA 3OY8B 1GZWA 2DUQA 1JW6A 2AUYA 3B9UA 2DU1A 2ZGPA 3USUA 3UL2A 3C2UA 3AKHA 1JQZA 2P23A 1S0IA 3O5SA 1FMMS 4AGGA 1BFCA 2FO1A 1Q8VA 3N36A 3IM5A 4J2XA 1SLCA 5B2HA 4KEJA 5EHAA 1AVWB 3FJKA 3AKGA 5GZCA 5F8YA 2WRYA 4LBKA 3H6SE 2YY1A 2X2SA 3N3HA 2RG9B 3BAGA 4M3CE 2NN8A 2CWMA 3FJEA 1N47A 4XYXA 1FGAA 4LBLA 3OJVA 3O12A 1JYIA 3IPVA 1PC8B 2UU8A 2KI6B 4HA2A 4XJZA 1SLTA 4Y1YA 2VXTI 4USPA 2E4MA 3HSMA 1G9FA 4JAWA 3RSJA 5JOYA 2ZGKA 2VXRA 2ARXA 5H9PA 2FMDA 1WLWA 4YW5A 4MYEA 5GZEA 4D0ZA 1AVXB 5BP5C 3NBCA 1W3AA 3N7LA 1FAYA 1LJ7A 3MW2A 3M3OA 1ZM1A 2Q5TA 4BLJA 2VU9A 5CAZA 3CU1B 3B9CA 1ILR1 2Q3NB 4Q91A 2KM2A 1N1VA 3FLRA 3BADA 1X50A 4YGBA 2CY6A 3O0WA 4I6IA 5E24E 3WZ1A 3TAYA 4UW5A 4P6AA 4LO0A 3POSA 2ZHKA 3ZXJA 1A3KA 1D0HA 1IS5A 1LCLA 1ULFA 4Q26A 3O4AA 1MS8A 2ERFA 1CPNA 1N4KA 1V6KA 3ZXFA 1UMZA 4AN6A 2DV9A 2NMNA 2CWSA 2NYYA 5I1BA 4M3CA 2JE9A 3FGMA 3WINA 3QLQA 1J1TA 1ONAA 4XFSA 4XTMA 4FPLA 1UPSA 5T5PA 3V64A 1DYPA 1ENRA 4WVVA 1MZ6A 3ZXEA 2A6VA 4I8MA 4XHBA 1ULCA 1MD6A 3WHTA 1V6MA 2ZMLA 5DG1A 1F5FA 3RTJB 3OBRA 3VEQA 3N0KA 5EXOA 2A6XA 3POWA 3TC2A 1LU1A 3PG0A 2D3RA 3VKLA 5IUQA 1A8DA 1V6IA 1VIWB 4J2SA 3BAQA 4XIOA 2JJ6A 1Q04A 1QOOA 4ZFYB 3WG3A 1ISYA 1II4A 2WT1A 3AP5A 1R1ZA 4UW4A 5EC5A 1S0EA 2E6VA 1PZ8A 1LU2A 1TTUA 1WW6A 2LALA 2A6ZA 1QOSA 2F2FA 3WA1A 4BOWA 4I7IA 3W9TA 3TB0A 3FJCA 4FPCA 2DUPA 4FPKA 4XILA 3RMYA 2K8RA 2ZMNA 1S0JA 3ZSKA 1LECA 2RSTA 4GWNA 2D1ZA 2BQPA 2VSEA 4OEEA 5H9SA 1TEIA 1GGPB 4BM8A 5DSSB 3AH4A 1CN1A 4QD2B 4YZ3A 4I4XA 4R9DA 3R4UA 1N3QA 3M1HA 1DQ4A 2PHFA 5T5JA 4H55A 4PF5A 2P3JA 2HW9A 1Z78A 2SBAA 4P9YA 4KC3A 4Q27A 3O5WB 4OEGA 1G9AA 5EG6C 3ILNA 4FPOB 1N1TA 3ZC8A 3BOPA 4AVVA 5GLVA 5L73A 3V0AA 1BFBA 5GZFA 2KKIA 1SLBA 5BXSA 4P14A 4H04A 1DQ2A 3EF2A 1IILA 2P34A 2Y9GA 3P6IA 4I1EA 3APBA 3VT1A 4WZFA 1CQ9A 5BVPI 1W6QA 2DREA 4AGVA 1ISZA 3D4KA 1JT5A 3C9ZA 3VT0A 2CYFA 2D6NA 4LBOA 4XE9A 1T9FA 5E8AA 1CE7B 2A70A 3V79C 4LO7B 2DVDA 5GALA 4RL7A 4RA0A 1GYKA 2R0FA 1O4ZA 4YW3A 3I2XA 2CNAA 4YFWA 4Q1PA 2P3IA 3RTIB 4YZ1A 1FV3A 1EVTA 5LK5A 1LOGA 1N3PA 1DQGA 5BOWA 1AF9A 2PHTA 1VAVA 5EWSA 4LO3C 3B00A 3WVJA 2ZZJA 3RMXA 3FFZA 2LIQA 1UL9A 4XOGA 4GALA 4QBVA 3SNMA 1GKBA 3AX4A 1SR4A 5G00A 1BYHA 1WUVA 1EYLA 1RY7A 1S0DA 2VSAA 5F5QA 5GZDA 1AJKA 4Y22B 4IZXA 1DJSB 3CRIA 4R9CA 1YTOA 2F8XC 5BXPA 1JT4A 1DQ6A 2D44A 1G8WA 1FWUA 4GWMA 1OKQA 3FBYA 1LEMA 2D6MA 2BFHA 3FUOA 2QN4A 2K4AB 2VW2A 3CA6A 3DUIA 3BODA 3AJZA 3B3QE 3LCPA 1LOAA 1IS6A 5DZGA 1JY0A 2CL2A 1W6PA 1NZKA 1HWPB 1Z4SA 3FJHA 3MW4A 4ATFA 4QD2C 4XDQA 4ZGRB 4OEFA 3BRFA 1LGBA 2Y9XE 5DXDA 4ISRA 1YRZA 4XIKA 6I1BA 1C1LA 1XZZA 3B69A 4C1XA 3BAUA 4YFZA 2DRZA 3WMVA 3ZSLA 4LBMA 1I1EA 4YGCA 3VKFC 5FNWA 5CA6A 2E7TA 3S8KA 3LSDA 2H0BA 3MEPA 4KEIA 1K5UA 1QDCA 2XOAA 5JMCA 3ZXLA 2JD4A 3CA5A 1AXKA 5FRAA 2A3YA 4XJWA 3WO2A 2ZABA 1ULEA 3WDXA 5F9TA 1ZA4A 3HR9A 2RQ9A 4M3CF 2D24A 1U0AA 4JP0A 3AKFA 4WV8A 3KMVA 4YM3A 1C4RA 2PELA 2EF6A 2EXKA 2ZAAA 4ZOTA 4CJMA 3PVEA 4LBQD 2AH2A 2EALA 1FQ9A 1K5VA 1WW4A 1CR7A 3O4CA 3LTQA 4TZDA 5HCBA 3KM5A 1M2TB 1IT0A 3AP9A 1LHUA 4K21A 4Y1VA 5E88A 4P0LA 3N35A 1PWAA 4FOQA 2E53A 4GKYA 3B01A 1LOFC 4HANA 1JBCA 3UK9A 4JKXB 3RG0A 2ZGTA 41BIA 4D69A 4JPZA 4L8QA 3RS6A 3NWKA 2DVGA 3OBTA 4UW3A 1YF8B 3L2YA 1KRIA 4P0JA 4LO1A 1W6OA 5CB7A 1SCSA 4X3AA 3VKOA 4YOLA 1AVUA 1LULA 3W59A 1KNMA 3A07A 1S0BA 4I30A 2KH2A 2FGFA 4I4VA 1V6VA 1G7YA 1DZDA 1CIWA 2DUOA 3LSEA 1YI7A 1UAIA 4DS0A 1F31A 4GKXA 4OUJA 1DYKA 7I1BA 4ISQA 2DWRA 5BYNA 2ZMKA 2C5DA 3H6RA 3ZPYA 3MPPG 3QR5A 1W6MB 3O0XA 3ZXDA 2CTVA 1IS3A 2GZBA 4ZFUB 4LBNA 5KXEA 2R1BA 3N7JA 3F1RA 4DRRA 3GNEA 4IONA 1JLXA 1YBIA 4ITCA 5BQUC 4J2YA 4IZEA 3UD7A 1KDMA 3WHUA 4LBQA 2AYHA 1AJOA 1SCRA 1MZ5A 2ZQOA 5JVVA 3FJBA 1MS3A 4YW4A 1Q8PA 4XFUA 2EXJA 3AP4A 4FOVA 2OVUA 4AYUA 1WD4A 4ZLBB 1MC9A 4W65A 2WJSA 3ILAA 2V73A 3AZXA 1T4QA 4BMBA 3CA1A 3QCWA 1QOTA 2ZGOA 1UZYA 4YM2A 3A23A 1QU0A 4XXPA 3OYWB 1BJQA 1W6NA 1TWMA 4JC1A 4I4PA 2E4MC 3SH5A 3AK0A 3WDTA 4Y20B 3GALA 4WVWA 3WMUA 4XJ9A 4PC4A 4USOA 2GN3A 3NV4A 1QNWA 3BTAA 1FNZA 3VSZA 1MS0A 4YM0A 5GAQA 1GICA 2ZGNA 2D43A 4GP3A 1JHNA 4Y1UA 2B7YA 4GA9A 3OY8A 4OZXA 2R1DA 1V6LA 3AH2A 4IHZA 3V0AB 1BFFA 1IRPA 4Q1RA 4OWKA 5H9QA 2P39A 3H6QA 2D6OX 4P0KA 3WLUA 4I4QA 1KDKA 3HOMA 3I2AA 4LO0C 2UWAA 1YYNA 2XG3A 3Q9OA 2WBCA 1ENQA 4YGEA 4F34A 4Y1XA 4FPHA 1WBLA 3T2TA 1V00A 4FGFA 4JQ0A 21BIA 1WLCA 5GLUA 5CNAA 3WINC 4G6JA 5IK7A 4R9AA 1IOBA 1AX2A 4XBQA 2UWBA 4QALA 2EAKA 1JTCA 2ZHMA 2NTDA 4I1BA 3O44A 4UW6A 1R8NA 2C9AA 4BLIA 4ZA3B 1JLYA 1CONA 4Q2FA 2R0HA 4I4SA 2ZR1B 2I2SA 2OUJA 2ENRA 2VLCA 2R49A 1N1YA 1I1BA 1FN0A 2Z42A 1EPWA 3PVOA 2J3PA 4ATEA 1E0OA 5JOZA 1S1AA 1V6UA 2JECA 3FJFA 4DPNA 2VW0A 4BMEA 1SACA 4M01A 3OGFA 2AGSA 4LO2C 1HQWA 1MS4A 4HJJA 4EEEB 3VWCA 3NV3A 2D3PA 4QO3A 3ILRA 5SV8A 2PHXA 3I4IA 3OJ2A 2SLIA 5IK5A 2NVHA 2FFUA 4AVSA 3D6EA 4PBPA 3IM7A 4YW1A 1EV2A 4QC4A 1LODA 2VY0A 4ZXKA 4L4IA 4D0TA 1QF3A 9ILBA 4DFSA 1ITBA 1QGLA 1HDKA 2W39A 3SH4A 3ZSMA 3W58A 4XBNA 2ZACA 2HZ9A 4Y1ZA 1C57A 4EFQA 1QMJA 5DUWA 4GAIA 2DU0A 3SITA 4J2KA 2ZGMA 1FX5A 4EB2B 4J23B 3U4XA 4CZSA 8I1BA 4YZ2A 3M3EA 3V0BB 4FP3A 5DG2A 4Z8BA 3POYA 2GNTA 2WT2A 2LIEA 4ZKTB 1AVAC 3UDAA 1DBNA 3BAHA 1GBGA 5E89A 5BXTA 1TOOA 3IMNA 2A7AA 1PZ9A 4IY9A 2WQZC 4AWDA 1BKZA 3WG2A 3AJ5A 2I1BA 1IKPA 2W68A 3AXEA 4YZ5A 3AJ6A 4DEPA 4I96A 1CPMA 1JUIA 2VUAA 2D22A 1VAMA 4AN7B 4X38A 5IK8A 1XHBA 3QYDA 1DZQA 3ZXKA 3AYDA 3Q7YA 3BA5A 4P9WA 1NUNA 3NBDA 2WSVA 3AZWA 1BLAA 3FJIA 1TP0A 1DLLA 1AXZA 4Q8LA 3SH3A 2XB6C 2RHPA 1LHNA 1QDOA 2EXIA 1WBCA 3Q7XA 2MLLB 4KBBA 4M00A 1GNHA 3OJMA 1I3HA 5GZGA 4NOTA 1F9KA 1WBFA 5GLTA 4NO4A 4G1RA 1W6OB 3WCRA 1GZWB 1SR4C 1GANA 1H9WA 4YLZA 3POKA 1D2SA 3USUB 3WNXA 2DS0A 4XTPA 1GNZA 3BRDA 1VCLA 4TLPA 3CNAA 2A71A 3JU9A 1ULGA 3IN9A 1BARA 1RG8A 1AXMA 4I0YA 3VKMA 2KI4A 3A4UA 5FREA 1SFYA 3O0VA 1G86A 1KQRA 1N1SA 2KLLA 1DQ5A 3ASIA 2YUGA 2P3KA 4TYSA 4XJ8A 5JOWA 2GMEA 5DZEA 4ZBVB 3AJYA 3F62B 4PBOA 5DUXA 3AZYA 3IPVB 4PCRA 1M16A 3UD8A 1GLHA 3T1LA 3BB2A 3R05A 3FJAA 1LESA 3UJQA 4I2SA 2GMPA 5FZZA 5KXDA 4WBCA 1AXYA 2IWTB 1PZ7A 3WOGA 4QKRA 1LOFA 1S0GA 1YO8A 3AKIA 1BFGA 5KXBA 1JOJA 2GNDA 4JKQA 4FQZA 2A3XA 2ZBJA 5BXRA 2P2KA 3IIRA 3WDWA 1W3FA 4FOYA 4FP2A 4QKSA 2L5XA 1Q03A 1OFSA 1HCDA 1TWEA 5D61A 1R8OA 1G82A 2FDBM 5HCFA 1WW5A 3JUUA 1SLLA 4ASMB 1IS4A 4BPZA 1NLSA 2GDFA 2DTYA 4AGRA 1QKQA 4Y22A 2M49A 4GOVA 2DURA 3M2MA 4HL0A 5FZYA 2D7FA 1O4YA 4XMIA 2ZA9A 1RMLA 5EYYA 3O4BA 2D6KA 3SLIA 5GJ6A 1XYFA 1WCSA 1WW7A 3WO4A 1JN2P 4KEKA 1FWVA 2QYIB 3FJDA 1CVNA 2VW1A 2DVAA 3WV6A 4M3CB 2R9KB 1IOAA 1NXD1 3BRGC 2FFVA 1RINA 1HQLA 4ZFWB 3A22A 1A78A 1V6OA 3FUQA 4Q9PA 1LOEA 3AYCA 1DQ1A 4A7KA 1SZ6B 2D20A 1ONKB 2A75A 4XHXA 5GLWA 4I4YA 2WSUA 4U36A 4LO1C 2UURA 2FHRA 3D7WB 4XFTA 4IYBA 2YROA 5GM0A 1FATA 1IJTA 2G4IA 5DZUA 4Q9GA 3I29B 2VH9A 1L2HA 3WUDA 5JOXA 5BP5A 2GNBA 3ZVXA 2JKBA 3VV1A 2ZHNA 4CTEA 3ATGA 3BA4A 5EYXA 1H30A 1HWMB 1B09A 1Q56A 2MC2A 3IM6A 3I8TA 4Z8SB 3AH1A 4Y26A 1BLDA 31BIA 3K1XA 1HCEA 5GLZA 1HKDA 4K20A 2AXMA 4IQPA 2WT0A 1LEDA 2ET2A 2HWMA 3ZSJA 1CESA 2NM1A 5DUYA 3O4OA 1WLDA 2A6WA 4Y24A 3P53A 2Y9FA 1KJRA 2ESUA 1UKGA 1OQLB 1SLIA 1MR5A 2AAIB 3FJ8A 1Q8QA 4GAFA 1P63A 3VKNA 2D6PA 1HWNB 1RITA 1MVQA 4BQ1A 2D7RA 4Q8KA 3WO3A 5T5LA 5IK4A 4AVTA 3BAOA 3IM0A 3H0OA 1KJLA 4OWLA 3OPZA 2ARBA 4YM1A 1V6JA 2Z48A 1SLAA 3BX1C 2ZGSA 4JRAA 1ABRB 3R4SA 1H9PA 4QBCA 3WCSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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