1EPWA

Crystal structure of clostridium neurotoxin type b
Total Genus 401
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
401
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title Structural analysis of the catalytic and binding sites of Clostridium botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
total genus 401
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1epwA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1epwA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1epwA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1epwA01
1I3HA 3A0KA 1HKNA 2GN3A 3AZZA 3FBYA 1PZ8A 2W2DA 1MS4A 2ARXA 2X2TA 2Y9WC 2W68A 4I30A 4LO3A 5HPZA 5EYYA 1W6PA 1W6OA 3O3QA 4EB2B 3V0BA 1EV2A 4XJAA 4YGDA 1C1LA 1JT3A 1TWEA 5BYNA 3WV6A 4ZGRB 1W3AA 3RSJA 3CRIA 3ZXJA 4JRAA 3DSEA 2A3YA 2J3PA 1WD3A 3MEPA 1J0SA 4CRQA 3WDYA 3IM0A 3ZVXA 5DUWA 5CA6A 1V6VA 1DQ1A 2A70A 1II4A 1Z0HA 4I3NA 3OGFA 4Q2FA 4Q8LA 4YM0A 1JY0A 1JHNA 4H55A 2ZGOA 1AVWB 4XMAA 2WRYA 5D62A 1DJSB 1K5UA 3GNEA 5AVAA 5E89A 1Q56A 4NO4A 1ZB7A 4XFSA 3ZYPA 2P37A 3GALA 2QN0A 4GWNA 3BRDA 1YRZA 3O4DA 8I1BA 1GNZA 3RQ0A 5GJ6A 1N47A 1XTGA 3UL2A 2ZHLA 2FDBM 1IILA 2P23A 4P6AA 1LJ7A 2ZAAA 1CN1A 1ILR1 3AKGA 5BOWA 2XOAA 1JOJA 1GNHA 1ISXA 1ONKB 1LOGA 4YG6A 1RITA 1YBIA 5IK4A 3P6JA 3PHZA 1JBCA 1XZZA 3O0XA 3Q7YA 1HWMB 3VV1A 2ZHMA 3QW8A 1OQ1A 3B3QE 3PMEA 3ZUSA 1IS6A 3OJBA 1SCSA 3WHUA 2DVBA 3P53A 4JKQA 4LO7C 5T5PA 2YY1A 1CVSA 1W3GA 1GZWB 3B9CA 3N35A 3WCSA 1N3OA 3M3CA 1Q1UA 1T3CA 3O0VA 5T5LA 2UURA 4JPZA 1FV3A 4USOA 4FVVA 3FIEA 1BXHA 3QJ0A 1Q03A 4LO0C 5GZCA 4YW1A 1CPNA 1QNYA 1GV9A 4XTMA 2V5YA 3Q7XA 4G1RA 4JQ0A 2UWAA 4P14A 5EC5A 4KEIA 1C57A 3I2XA 3RG0A 4DQAA 3BOOA 2ZGUA 2D6KA 5T55A 4FQ4A 4YFWA 5FZYA 5BXRA 3O4BA 3V0AB 1BA7A 3RTIB 2GMEA 4Q91A 1HQLA 1W0PA 2Q3NB 4BLJA 2GZBA 1Q8PA 3HN1A 4Y1XA 3ZXDA 3O4AA 5DUVA 3NV3A 3WVJA 1O4ZA 1DZDA 3WNXA 5BVPI 3ZC8A 4ATFA 3FJKA 2P3KA 1W3FA 2PHFA 1QOOA 4XILA 1N1SA 2A6WA 3D3XA 1ULFA 1W6MA 4CZSA 4BLIA 3C9ZA 3JUUA 3LSDA 2E53A 5T52A 5IK7A 4AGGA 4YOLA 3ZUQA 5G00A 1OFSA 4DRVA 2A6XA 5B2HA 4LBMA 1WW7A 4XIOA 3BRFA 1NUNA 3C8BA 1SR4C 1ZM1A 3SISA 4BMEA 4XTPA 1Z7HA 3WDWA 1G9AA 4P9WA 4U36A 3AZWA 3OGGA 2D7RA 1BYHA 3WOGA 2KH2A 2ZBJA 3ASIA 3UDAA 1V6UA 2GNTA 2XB6C 4YW3A 5GLVA 4LBQB 1JUIA 4ZFUB 1IHKA 5T50A 3BAVA 5D63A 2DTWA 4Z8SB 1IKPA 3WG1A 1MD6A 2PHXA 1BARA 3R05A 2AH2A 2V73A 5CAZA 5EWSA 2DWRA 3NV4A 1PUMB 4AGVA 3RTJB 4XJ8A 3NV1A 3IM7A 2D6PA 3N36A 1MS5A 3IPVB 1R8OA 1W0OA 4R9DA 2GDFA 1S0LA 4KEJA 3AYCA 1MVQA 2WJSA 1FYUA 3OJVA 3DDBA 2D3RA 1AXYA 1GYKA 4XBQA 1LENA 1C1FA 3QW6A 2A71A 4LBQD 1MS0A 1C4RA 1Z78A 4Q1PA 1BLDA 1DZQA 2ESUA 1SLCA 1FWUA 3WO3A 4LBKA 5FZZA 1IT0A 3SH3A 4YZ3A 1PZZA 4R9CA 1ISWA 4Q9PA 5CB7A 1BFGA 4M00A 2WT0A 1F82A 3NJ5A 3OY8B 4WZFA 2LALA 1TWMA 3WO4A 5BQUA 3BOKA 2Y9FA 5EXOA 4ZOTA 2FGFA 3S8JA 3IN9A 4PC4A 5H9SA 3O44A 2EXIA 4KBBA 3TAYA 1S0FA 3R4UA 3KMVA 3PVOA 4M01A 1IOAA 2CWSA 4G6MA 1JLXA 4XJZA 4G6JA 2DVGA 3AH4A 5KXEA 2FMDA 3SLIA 3OBTA 2AUYA 2JECA 3D7WB 3BAQA 3BAHA 1A8DA 5DUYA 3C88A 3FJIA 4J2XA 4CTEA 1BQPA 1SACA 2PHUA 4JP0A 1ISVA 1A78A 4Y1ZA 2XG3A 5EYXA 1G9BA 1HLCA 2JDZA 1LU2A 3SNVA 1N3QA 4OW4A 3VKOA 2CY6A 3K3QB 1LOEA 3N7JA 4Y26A 1AXKA 4FPCA 2D43A 4L8QA 4XBNA 4K1ZA 3V65A 2F8XC 2VXTI 4IZXA 3HMYA 2AFGA 4JC1A 2AR6A 4BMBA 3FJCA 3ENRA 3QR5A 5DUXA 1QQKA 2ERFA 2WBCA 1AF9A 2D1ZA 1JXNA 3M3QA 1V6XA 4I8MA 3AJ6A 5DUUA 1XHBA 2E51A 4XIKA 3BAOA 2VU9A 4I4PA 2F2FA 3N7LA 1YI7A 1KDKA 1S0DA 2GMPA 4QKRA 3AJZA 3E8LC 1AXZA 2C9AA 4Q1RA 5GLUA 4XJ9A 3ZURA 4HA2A 2GNMA 1NZKA 2OVUA 3W58A 1K5VA 1ZA4A 1ZL5A 3CA0A 4YM2A 3QCWA 1Q04A 2DUOA 1LHNA 3CA5A 2SBAA 5I1BA 3I4IA 2WLQA 4LBJA 5GZDA 1H30A 4K20A 1ZKXA 1AXMA 3WLUA 4R9BA 1HIBA 1WLCA 4FPKA 1WLWA 2RG9B 2ES3A 4IONA 1HCDA 3NWKA 1YF8B 3BRGC 1MVEA 1SLLA 5FNWA 3UJQA 2ZQNA 1DQ5A 4GWMA 3CRGA 1Z4SA 3CAHA 1AJOA 4H04A 3VSFA 1QDOA 3H6SE 5BP5C 3AZYA 1ZKWA 3BWIA 1D0HA 1LCLA 4I4VA 2I1BA 2ZR1B 3LTQA 1DIWA 5CNAA 1IS5A 3FIIA 5JOZA 2D6LX 4LO2C 4J2KA 4P9YA 1GGPB 3AP9A 4GKYA 4ASMB 1JQZA 2XHLB 2ZHKA 4XHXA 4K21A 1V6JA 2JJ6A 1HQWA 3FLTA 1QMJA 4YZ2A 1XYFA 4X37A 5F8SA 5GZGA 3FJAA 4YZ5A 5HCBA 2NYYA 4I4QA 1UPSA 2GALA 4FOWA 4KEKA 3HSMA 5BQMB 3AZVA 1VLNA 2A7AA 4WVWA 2D7IA 3QIXA 3ZSJA 1SBFA 2B7YA 5FZUA 1R8NA 5DG1A 1JT4A 1LHWA 1TEIA 3N7MA 3M1HA 5GLZA 1JYIA 1FMMS 2NZ9A 1P63A 4Z9WB 1LGNA 6I1BA 5F9TA 1CE7B 1FMZA 2P34A 3FJ8A 4Q26A 2R16A 1FGAA 3WG3A 3ZSLA 3BX1C 2AQZA 3BOPA 7I1BA 2FHRA 3B69A 3W9TA 4K1YA 5T54A 3KQRA 3T1LA 3IMNA 3BTAA 1V6LA 2G7PA 3UK9A 4X39A 3AKFA 4XZPA 2DRYA 3I2AA 3QIYA 2DU1A 1N1TA 2FPQA 4Y20B 3POWA 4LO3C 1G9DA 2GMMA 3ZSMA 4QBCA 1SLIA 4WBCA 4FPEA 3ZXKA 3V79C 1ABRB 2WT1A 4LO7B 1FX5A 1OQLB 4H9WA 3T2TA 2AGSA 1FWVA 2DRZA 3LCPA 5F90A 3VWCA 2JE9A 3UD7A 2A8AA 5GAQA 1AVAC 2FO1A 1ZL6A 4LBNA 4XYXA 4LO0A 3BADA 2JE7A 2KI4A 1X50A 2ZHNA 3WHTA 1OKQA 2ZGKA 1ISZA 3MW3A 4YLZA 1L2HA 1GZWA 4YZ1A 2K43A 4ITCA 1F31A 5JLVA 1AVXB 3ILFA 2ARBA 2CTVA 3AFKA 3BAGA 3AP4A 4Z8BA 2DREA 3IIRA 1Z2VA 1TP0A 1Y7BA 1ZN3A 3TB0A 3USUB 4J2YA 3IM6A 4WVVA 1TFMB 4YG3A 2ISHA 3CU1B 1V6KA 3MW4A 4FGFA 3FJJA 4JCKA 4G9NA 2ZMLA 3DS9A 1VAMA 3ZXFA 4U2AA 3OYWB 2DS0A 4XFUA 2IMAA 4X38A 2Q9XA 2G7NA 5HCAA 2G4IA 3CA4A 4A7YA 3V0AA 3FJHA 2DVDA 2NP0A 3CA3A 3Q9OA 3AH1A 5FRAA 2M49A 1SR4A 1VAVA 1CESA 1LEMA 3FJDA 4AN6A 4P9XA 2ZKNA 31BIA 1TTUA 2EIGA 3VUOA 1GICA 2GO2A 2E7QA 5EG6C 1XTFA 5IK8A 4OEGA 1CONA 4Y22A 1XG6A 4ZFWB 2DU0A 3L2YA 4P0JA 4GP3A 2R9KB 3MW2A 1AFCA 4ZXKA 5EHAA 2G7QA 2YMZA 4AVTA 2NVHA 2RQ9A 3BONA 1FNYA 3DGTA 1W6QB 1V6IA 3ZPYA 4QALA 4FQZA 2EXHA 3FLRA 3A21A 2VY0A 3A4UA 4FPFA 1ITBA 3DUIA 3LSEA 2R0HA 4OEEA 2KI6B 4YGCA 2CYFA 4LO1C 1V6NA 4LBQA 4AGRA 3WUDA 1ENSA 2D44A 2WNEA 3O12A 2AYHA 3BB2A 2VXRA 5DZEA 2QYIB 2DUPA 4RL7A 3CNAA 4OWLA 1W6MB 3SH4A 4C1XA 4I37A 5GLWA 3IPVA 4BOWA 3PG0A 1RINA 3RS6A 1QNWA 4DFSA 1I1EA 1RG8A 3NBDA 3ILAA 4A7ZA 1ONAA 1DYPA 4LBOA 4EL4A 5JDBA 4IZEA 1F5FA 3A22A 3O4OA 2EF6A 3PUBA 5BXSA 3AXDA 4XXPA 1E1HA 1QOTA 4FPGA 5H9PA 4XKIA 5LK5A 1S0IA 2K8RA 5IT6A 3NBCA 3AKHA 2ETFA 2QN4A 1AJKA 1U0AA 3VKMA 1DQOA 1A3KA 2ISGA 3H6RB 3OY8A 3VT2A 3EF2A 4IQPA 2G7KA 4YM3A 5JOYA 2KM2A 1SLBA 2UWBA 4KTXA 2WT2A 2A5ZA 2AREA 2R49A 2UUSA 2P3JA 4EFRA 5L73A 5E88A 2CWMA 4PCRA 3CA6A 2BEBA 3VKNA 3A23A 4YGBA 2A97A 4M3CB 4KUFA 1DZCA 2A6ZA 4OZXA 4R6UB 2WSUA 2VSEA 1QU0A 2LTNA 3O49A 1UZYA 1KITA 1LTEA 2E4MA 1WD4A 3WINC 3AJYA 4OEFA 1YO8A 3FLPA 4D0ZA 2UU8A 4UW4A 1FV2A 1MS3A 4YZ4A 3M3EA 3HR9A 3AP5A 1CQ9A 5E8AA 4FPHA 1KJLA 4A7KA 1KJRA 1AX2A 1WBCA 3N7KA 1LHUA 4Q9GA 1JW6A 2VW0A 1DQ6A 1YTOA 1FQ9A 1XQNA 4UW6A 2D20A 1HWOB 1LOFA 4Y24A 1MZ5A 3AXEA 3D5OA 4PBOA 4EEEB 1G86A 1KDMA 1ULCA 5BQUC 3FJ9A 3UD8A 3UJOA 2ZGSA 4ISQA 4QBVA 5CBLA 1I1BA 4I4YA 2NTDA 4D0TA 2IMCA 1N1VA 1IJTA 1WBAA 4KS6A 4DPNA 1PUUB 4EFQA 4XJWA 2E7TA 1DBNA 3AYDA 2A3WA 2R1DA 2Y9GA 1LOAA 3WO2A 3ATGA 4I4UA 3NBNA 2RSTA 3HOMA 4FOQA 3WZ1A 5DVHA 1PWAA 2PELA 4F34A 1UMZA 3ZXLA 2DURA 4J23B 1VIWB 2OUJA 4GKXA 3UJ4A 3WG2A 5BP5A 1WW5A 2Y9XE 4GALA 3W59A 3TC2A 3AH2A 2CL2A 2Z49A 9ILBA 1UN1A 3A07A 3WMVA 3H0OA 1WBFA 1S0JA 4Q8KA 5F8WA 1UZZA 5DXDA 3RRDA 3UJ0A 5T5OA 1JLYA 4XFTA 3QYDA 4HEVA 5GALA 1DGLA 2ET2A 4MYEA 1S1AA 4XJUA 2ZGPA 4L4IA 3JU9A 1LEDA 1BJQA 1YIFA 2PHRA 1W6NB 1CR7A 3K1XA 3M3OA 4I0YA 3ZSKA 3UD9A 5GZEA 4GAFA 4IY8A 5HCFA 3T1MA 3WDVA 2OUHA 1KQRA 2KLLA 4ELCA 2ZGLA 3F62B 1LOBA 2HWAA 3BAUA 3WDUA 1LECA 3AKIA 2XHLA 1DQ4A 2P39A 4M3CF 4F83A 1EVTA 3BA4A 3LLPA 2D6OX 3VT1A 4I4XA 2VUAA 1V00A 2WQZC 5H9QA 1LU1A 4D8HA 5BQMA 4L4HA 3IKWA 2D23A 3AK0A 1S0BA 3I29B 3VT0A 2EALA 1JT7A 2CNAA 2Q5TA 4IY9A 4I96A 2LIEA 3M2MA 4Y1YA 4AYUA 1R1ZA 4JKXB 2ISEA 1SFYA 1YVGA 1BFCA 3V64A 1LESA 3C2UA 4ZJXA 3P6IA 1KNMA 2W2DB 2NN8A 2WSVA 1ENRA 1JN2P 4P0KA 4FPJA 2RHPA 1VALA 3HALA 1NLSA 1W6PB 1W6OB 3V0BB 5JVVA 3AJ5A 2DYCA 1SZ6B 2PHWA 3POKA 5GLTA 4Y20A 3NV2A 1APNA 1UAIA 4QC4A 2P3IA 1BZWA 1G9CA 4DRRA 1PC8B 2A3XA 4DCKC 5FNXA 1G82A 1MC9A 2YROA 1GKBA 4TLPA 3BIWE 4X3AA 3SITA 4C1WA 1AX0A 4HL0A 1LULA 2ZQOA 1JT5A 4DEPA 4HANA 4J2SA 3O5SA 3C8AA 1GZ9A 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