1A8DA

Tetanus toxin c fragment
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Neurotoxin
molecule keywords TETANUS NEUROTOXIN
publication title The 1.61 Angstrom Structure of the Tetanus Toxin Ganglioside Binding Region: Solved by MAD and Mir Phase Combination
pubmed rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 113
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1998-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1a8dA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1a8dA02
4JRAA 1YF8B 1OQ1A 5GZCA 3RQ0A 4QO3A 2DVDA 2DREA 4Q9GA 1DQ5A 1HQLA 5D61A 2PHUA 1WW5A 4FPKA 1Q8QA 3RRDA 1IJTA 1AXZA 4Q91A 1JT7A 1W0PA 4AVSA 4I96A 3B9UA 3ZSMA 3HOMA 3P6JA 4Q8LA 4II0A 2ZGTA 5SV8A 5T5OA 4OEGA 4FPOB 4YOLA 3AZXA 4OWKA 5F8SA 4I37A 3GALA 3WDYA 1Q8SA 5T50A 3QR5A 3P6IA 4G9NA 1CJPA 2ES3A 3NV1A 2ZQOA 1WW7A 4IYBA 1WUVA 1LOBA 2WT0A 4XJAA 4Y22B 3V0BB 3S8JA 5DZEA 2ERMA 5FREA 4XOGA 1I1EA 3FLTA 5BOWA 2V5YA 2FFUA 1ENSA 4OEFA 1SBDA 1W6OB 4YM0A 1UN1A 4Y1XA 2AH2A 4YM3A 3BOPA 3AYDA 4DFSA 1ISYA 4ZFUB 1XHBA 3BRDA 4GXLA 1IRAX 4DPNA 4DENA 4FOVA 1QNYA 2A3WA 3AJ6A 3K1XA 5JDBA 2VW2A 1PZZA 3NJ5A 1JT3A 4FPCA 4LO1C 2GN3A 4GKYA 1LU1A 3N35A 4J2KA 4AWDA 4PF5A 1JT5A 2VW0A 1LOGA 3ILRA 5E88A 1ONKB 1XQNA 3GNEA 3V0BA 3FJIA 5GLZA 2Z48A 3AH2A 3WDWA 4LO1A 1H9PA 1W6OA 2NN8A 1N3PA 4FPEA 3UJOA 4GP3A 4LO0C 3BAGA 2DU0A 3N7MA 4DS0A 1G9FA 4D0ZA 3O0VA 2AENA 2ARBA 1IILA 2UWAA 4A7YA 4IZXA 4GAFA 2MLLB 4EFQA 1FWUA 2BQPA 1PWAA 3AZZA 5EYXA 1D0HA 2ZHLA 3SITA 4K20A 4LO0A 4W65A 3AJYA 3T1LA 1CVSA 1II4A 1BFGA 2IHOA 1LGBA 1LODA 5EHAA 3MEPA 1E0OA 1GV9A 3OJ2A 1M16A 3WHTA 4FPYA 2E7TA 2D20A 4GWNA 2WBCA 1NLSA 4P9XA 1QOOA 4I4RA 3VWCA 4YW3A 2EALA 1OFSA 1ULFA 5T55A 1IT0A 3OJVA 1PZ9A 3ZSJA 4H04A 1BQPA 3KMVA 3SNMA 2JD4A 1W3AA 4I4PA 3WG3A 4I4YA 5FZZA 1MS4A 2P37A 1R1ZA 1BA7A 2ZGOA 4WZFA 4M3CA 4I6IA 1LHNA 4BPZA 3ILAA 1CQ9A 3D6EA 2FFVA 3NBEA 1D2SA 4XJ9A 3A0KA 2OVUA 2KI4A 3B9CA 3DUIA 3AZYA 3O3QA 1DYKA 1LHUA 3WDXA 4P9WA 3OY8B 3ZXJA 3BAHA 3IM6A 4I3NA 3WCSA 1MS9A 2ZGSA 1SLLA 4XZPA 5GLVA 4YZ1A 3NV4A 2ZGRA 4BOWA 2IWTB 4JQ0A 5BXTA 2AYHA 1Z4SA 1GZWB 4QD2B 2NVHA 3PMEA 4YW5A 1DLLA 1Q8OA 1P63A 1AXKA 2BFHA 1RZOB 2D3RA 4TYSA 4XYXA 3AH4A 2PHXA 1BXHA 3O4BA 4QD2C 3RTIB 4Y24A 4XXPA 2SBAA 5EG6C 1G7YA 1NUNA 5EXOA 1IS4A 1GANA 3RMXA 2DTYA 4M00A 2Q3NB 1MZ5A 4AGRA 3ASIA 1QXMA 3CRIA 4IHZA 1CR7A 3WDTA 4I1EA 1GZWA 1JW6A 5L73A 1IS5A 1GYKA 2Y9WC 2E6VA 1CIWA 2CTVA 1BLAA 3ZYRA 2VW1A 1AF9A 4TLPA 5DUYA 2ET2A 1IOBA 1LEMA 5GZFA 4KC3A 2P23A 3D4KA 1XYFA 3I29B 1DQ0A 3WUDA 1DJSB 1BFBA 1WBLA 1RITA 1KJLA 1IKPA 4BMEA 3FJ9A 5FRAA 1N1YA 4ISRA 3NV3A 4IY9A 3BA5A 2RQ9A 3CA1A 3N7KA 3LSEA 1AFCA 1R8OA 2PHFA 1MS5A 1NZKA 2ZGNA 4H55A 1Q1UA 1UZZA 2A3YA 2VUAA 4ZXKA 1G8WA 5DG1A 3UJ0A 1VIWB 2W68A 1SCSA 5GM0A 3WA1A 6I1BA 2EAKA 5BYNA 4XIOA 4IONA 1YXWA 1WBCA 4CZSA 3F1RA 3UK9A 1O4ZA 3UDAA 2D6PA 2WNEA 2R0FA 5EWSA 1W3GA 5GZDA 4ENDA 5DUWA 2I1BA 1S0CA 3B00A 3ZYPA 4XJUA 2D6KA 4GAIA 1T4QA 3O5WB 2NTDA 3VKNA 5HCFA 1HCEA 1HWPB 1A3KA 4J2SA 5JOZA 2KI6B 3ILFA 3FFZA 3VKLA 4G1RA 1N4KA 4OEEA 2E53A 4XFUA 2WSVA 3BX1C 4IQPA 4EEEB 4J2YA 1FGAA 4R9DA 8I1BA 2UWCA 2CYFA 3T8SA 2Q9XA 4YG6A 4WV8A 1G9AA 3AXDA 3PUBA 1W6NB 1PUUB 1DFQA 3ZXLA 2VSAA 4P9YA 2VU9A 1W6PB 3O0XA 2X2TA 4Z8SB 3M2MA 4UW5A 5DG2A 2UUSA 5HCAA 21BIA 3OPZA 4XTPA 3UL2A 2ENRA 4AVVA 4BM8A 1WBFA 2A71A 2D7FA 3O49A 4RA0A 1QNWA 2D3SA 3AP9A 2NMNA 1GLHA 4ITCA 1F5FA 3VKFC 2EIGA 2CWMA 2R16A 3Q7XA 3IM7A 2ZMNA 3I2AA 3WUCA 4OWJA 5H9QA 2DVAA 1JT4A 4GALA 3ZSKA 3OBTA 5IK7A 1ITBA 1O4YA 1W6NA 1YO8A 3BODA 1BYHA 3V65A 4OWLA 1JTCA 3R4UA 2ERFA 1W6PA 1JYIA 3WZ1A 4XIKA 2VH9A 4K1ZA 2P2KA 3SLIA 1DQ4A 4Y1ZA 2P3IA 1SZ6B 5CB7A 4GOYA 3AJ5A 1UX6A 2EF6A 5FZYA 1NXD1 3V0AA 1TFMB 3IIRA 3FJKA 2ZZJA 4R9BA 3MPPG 5DZGA 3AFKA 3WO2A 2MIBA 4YGEA 5G00A 4FQ4A 2DRYA 3BAOA 1IOAA 1KJRA 4XFSA 1IS6A 5T5LA 1SLTA 3A23A 2DV9A 3POKA 3PG0A 3OYWB 5GZGA 4QKSA 1WLDA 3BB2A 1TEIA 1XZZA 1ULGA 3ZXDA 3RS6A 7I1BA 1QGLA 4LBMA 4K21A 5BQUC 2GMEA 2P3JA 1Z2VA 1LOCA 4ZA3B 4Q2FA 5F9TA 4BLJA 3AP5A 5KXEA 1AXYA 3OJMA 5BVPI 3WO4A 2ZHKA 3H6RB 2J3PA 4CJMA 2WRYA 4OW4A 5E8AA 4YW2A 1JQZA 1SR4A 4DRVA 2E4MC 4WBCA 1AX0A 2AUYA 1N3QA 4LBNA 4YG0A 1GZ9A 2LTNA 1V6MA 4LO2C 3FJFA 1W6MB 1LCLA 2D24A 3CRHA 5BQUA 1CONA 1HKNA 1MACA 4XTMA 2P3KA 5DZFA 4Q8KA 4KBBA 1EPWA 5DUVA 4XHBA 1ISVA 3AKFA 5H9SA 3CA3A 4G9MA 4XKIA 3OYWA 4CTEA 5GLTA 3N3HA 1DIWA 2V73A 3R05A 2E4MA 3FJ8A 5JOYA 1RINA 3CA6A 4I1BA 4Y22A 3BAVA 2SLIA 1G9DA 2D7RA 5F5QA 4LO2A 1YTOA 3B01A 1RMLA 4XJWA 4I4VA 1ISWA 2YV8A 1ULCA 4A7ZA 5E24E 1DQGA 2HW9A 3VT1A 3H6RA 1HIBA 2VSEA 4EFRA 4OUJA 2GALA 4AVTA 1S0EA 3WINC 4XBQA 1S0JA 1OKQA 2EXJA 1HLCA 4GKXA 1ENQA 1W6MA 1KDMA 1ENRA 3NWKA 5BXPA 1MS8A 4QALA 2AAIB 4IY8A 2Z42A 1WCSA 3DGTA 3MALA 5FZUA 4XMAA 1GBGA 5KXDA 5AVAA 3H6SE 5HPZA 4R9CA 3WINA 4LBJA 1HWNB 4Y1UA 1Y7BA 4L4HA 2ZGMA 4XE9A 3VV1A 4I2SA 1ULDA 2ARXA 1IS3A 1KDKA 1MS0A 3AJZA 3UJQA 4ZFYB 3W59A 2KM2A 5F8WA 2RHPA 1URXA 4QC4A 3H0OA 1FMZA 2ZMLA 3D5OA 2LALA 4LBOA 1V6UA 4AGGA 2DYCA 4Y1VA 3OJBA 1QDCA 1WLCA 1WW4A 1SCRA 4P6AA 1C57A 4ATEA 4LBLA 2HWMA 4I8MA 1FX5A 3RMYA 4H9WA 3BAQA 1IRPA 2ZGKA 1QOSA 2CNAA 4XDQA 1FNZA 2E7QA 2ZMKA 1DZQA 1SLCA 4LBQD 1V6VA 4FP2A 3O0WA 1AX2A 1FV2A 3CNAA 3JUTA 4F83A 3S8KA 3CA0A 2ZGPA 4AN7B 5GLWA 1TWEA 3KQRA 3WHUA 2R0HA 2OUHA 1LGCA 2D43A 4CRQA 2G4IA 4MYEA 1LU2A 1V6XA 3AZVA 2GNBA 4G6JA 1IKQA 2DUQA 4Z9WB 3IM5A 2KLLA 3BRFA 1JYCA 31BIA 1YIFA 4NO4A 4AN6A 2VLCA 1PZ8A 2VY0A 4YGCA 1ILR1 4HJJA 5BXSA 3V64A 2H0BA 1BARA 1UKGA 3M3OA 4JKXB 4BLIA 4ZKTB 3WG1A 3OY8A 3EF2A 1BKZA 2A6XA 2I2SA 3SH4A 3WDUA 4AGVA 1Q56A 4LO7B 1MVQA 4YM1A 1RG8A 4Q9PA 4NOTA 2A6YA 5HCBA 1JLXA 2UURA 5IK5A 1WW6A 1KQRA 1LHVA 2JE9A 5GAQA 1XG6A 3RG0A 4XBNA 3USUB 3AX4A 2KKIA 5CAZA 4P0JA 1QOTA 4Y1YA 2R9KB 1LOFC 1Z78A 4FPLA 3FJAA 4LO7C 4GA9A 4USPA 2YMZA 2ESUA 2DVFA 3NBNA 1B09A 4Y20B 2D7IA 2ZAAA 3Q9OA 4RL7A 4ISQA 4XJ8A 5IK4A 1DFCA 2GNTA 3ZC9A 3W9TA 1BZWA 1YBIA 2YZ4A 3AXEA 4YW4A 1QQKA 1LOFA 5CNAA 3VSZA 4YLZA 3WOGA 2DS0A 4YFWA 2K43A 3KM5A 4PBPA 1AX1A 1MS1A 5BXRA 1YYNA 2NMOA 2DRZA 2DVGA 1JN2P 1V6NA 1ISXA 3BRGC 3USUA 3POWA 4PCRA 2WT2A 2ZACA 4JCKA 1HDKA 2D6OX 3H6QA 4GP0A 2YY1A 1APNA 4ZOTA 2HYKA 2JECA 5JVVA 3A07A 2ZGLA 1FV3A 1WBAA 3CA4A 2Y9FA 2WSUA 4KEIA 4A7KA 3JUUA 5H9PA 2FMDA 3ZXFA 2A6VA 1BFFA 2D6LX 4I30A 2K8RA 4HA2A 4L4IA 2ZHMA 5CA6A 4EFPA 2YUGA 2RSTA 1QQLA 1W0OA 1UL9A 3FGMA 2XG3A 2Y9XE 1UPSA 2GNDA 3FJEA 4TZDA 2C9AA 3FJHA 5EC5A 1UMZA 4QKRA 3WCRA 4FPFA 1OQLB 3UJ4A 1WD3A 3AP7A 3ZSLA 4R9AA 2ZGQA 2EXKA 1HCDA 1G9CA 1DQ2A 1BASA 1CVNA 5DUUA 3AKIA 3FJDA 3IM0A 4XXAA 3CU1B 1QF3A 3M3CA 1PZ7A 1TTUA 1AZDA 2ZGUA 1K5UA 1Q03A 1CPMA 5KXBA 3WG4A 2GMPA 5FNWA 3WMVA 1TOOA 3UD9A 1V00A 1S0DA 1LTEA 3VKOA 5DVHA 4FOYA 3FUQA 4I4SA 2D44A 1YRZA 3FJJA 4JP0A 1SACA 2LIEA 3M1HA 3IPVB 3FBYA 1G82A 2GN7A 3O44A 1F9KA 4C1XA 2B7YA 41BIA 4ZGRB 5T5PA 2AXMA 1Q04A 1FMMS 4R6UB 4ZBVB 4BQ1A 1A78A 2A6ZA 1HWOB 2M49A 1N1TA 3A4UA 1BJQA 3VT0A 4WVWA 5GJ6A 1AJKA 1N1VA 2LIQA 2CL2A 3HR9A 3HSMA 2A6WA 2GNMA 5CBLA 1GKBA 2F2FC 3AP6A 1AVAC 4Q26A 4YGDA 3WV6A 1JHNA 4LBKA 2ZA9A 3N0KA 3U4XA 3HN1A 2DWRA 1AVWB 1AVXB 1MVEA 2KH2A 3OGFA 2AQZA 4D69A 3MW3A 4I4XA 1RIRA 1G9BA 3ZXKA 2TEPA 3IPVA 1V6LA 2A3XA 3POYA 2F8XC 4FOQA 2EXIA 5GZEA 2F2FA 4YGBA 1MR5A 5BP5C 1KNMA 1SR4C 2DUOA 3IMNA 4P14A 4PC4A 1H9WA 3RSJA 3JRRA 2W39A 3VUOA 1MS3A 3T1MA 3TB0A 4UW3A 2AR6A 3LTQA 1VALA 3VT2A 2R1DA 1GGPB 3HBWA 4LBQB 4USOA 1I1BA 1V6IA 4BMBA 2PHWA 1SLIA 3BAUA 4DRRA 5BP5A 1LEDA 4EKXB 4FQZA 2A5ZA 2QYIB 3LCPA 5DSSB 3CQAA 1N47A 1SBEA 2ZHNA 3B69A 3AK0A 2D3PA 2YROA 1LOAA 4YZ4A 1S0BA 4UW4A 3PHZA 1R8NA 3UD7A 2D23A 5D62A 1KRIA 5DUXA 2UU8A 3A21A 3BA4A 4DEPA 3E8LC 4GOVA 3ZX7A 3VSFA 1BLDA 3WNXA 2FO1A 5FNXA 4I4UA 4I4QA 4Q1RA 3A0NA 3WG2A 5E89A 4EB2B 3BIWE 2A70A 4G6MA 1WD4A 2PELA 1FNYA 2K4AB 3IAGC 4K1YA 3WMUA 4XILA 1W6QB 1DQ6A 4LBQA 2BEAA 3W58A 2DVBA 4X3AA 2PHRA 1LHWA 2GMMA 4YFZA 2GO2A 1GZCA 1IHKA 3TAYA 3PJQA 3APBA 3FLPA 5IK8A 1BFCA 4I0YA 2JKBA 4XJZA 1MD6A 4J23B 3WVJA 1N3OA 2MC2A 4C1WA 1JBCA 1SLAA 1HWMB 2QN4A 1CPNA 1Z0HA 4M3CB 4X39A 3L2YA 1SFYA 2C5DA 3CRGA 1FATA 2JDZA 4YZ5A 3AH1A 1X50A 1GICA 4DQAA 1LULA 1JUIA 5IUQA 1LHOA 1JXNA 2JJ6A 1DZCA 3WLUA 3IKWA 4FPGA 2PHTA 2EXHA 2FGFA 2NM1A 4ATFA 5IT6A 4QBVA 3P53A 1W6QA 2CY6A 1KITA 1PUMB 4JKQA 1J1TA 3Q7WA 4WVVA 1S0IA 2CWSA 1AVBA 4X37A 1V6JA 2FHRA 3BA7A 1FN0A 3O4DA 1AVUA 4KEJA 5JOWA 1AXMA 2DURA 5KXCA 2Z49A 4F34A 2WQZC 2FDBM 1DZDA 4Y26A 1AJOA 2NYYA 4X38A 3OGGA 3LLPA 1GNHA 2R49A 3O4AA 5EYYA 1M2TB 5DZUA 1LOEA 1DQ1A 4FOWA 1QMJA 4GWMA 1A8DA 4ASMB 5JMCA 1V6OA 2OUJA 3AYEA 5T54A 9ILBA 1DGLA 1CN1A 5H9RA 3N36A 2E51A 3M3QA 3MW2A 4KEKA 3NV2A 4M3CF 3AKHA 1JLYA 3QCWA 1U0AA 3O4OA 1TWMA 2DU1A 5I1BA 3I2XA 2R1BA 1YI7A 3D7WB 4LO3C 1CESA 3PVOA 4XMIA 3VEQA 1N1SA 2AFGA 5T5JA 5GALA 2HZ9A 4FVVA 2AGSA 4L8QA 3CAHA 3T2TA 4M3CE 4DCKC 3FJBA 1VAMA 4ZFWB 2D6MA 3ENRA 4U2AA 4YZ2A 3I8TA 2ZABA 3FUOA 2UWBA 4LO3A 2XB6C 3ZC8A 2RG9B 1EV2A 4LO8B 5LK5A 3N7LA 4IZEA 4FPJA 2NZ9A 2WJSA 3V79C 1C1LA 2ZBJA 4D0TA 4OZXA 4HANA 5DXDA 1F31A 4I7IA 5F8YA 1EVTA 2YXSA 4SLIA 3NBCA 3RTJB 3QYDA 3AYAA 5F90A 1S0LA 2BEBA 4FPHA 1ONAA 1PC8B 3NBDA 4YZ3A 1FAYA 1HQWA 1FYUA 3ILNA 1S0GA 3C9ZA 1QKQA 4XBLA 1DHKB 3C2UA 3SH5A 1C4RA 4P0LA 4U36A 2JE7A 2Y9GA 2ZR1B 1DQOA 1LESA 3Q7YA 3BTAA 1WLWA 3QLQA 4UW6A 1Q8VA 2X2SA 2HWAA 4FP3A 3TC2A 2DUPA 2P39A 5JLVA 3I4IA 3HALA 1SLBA 4Q27A 1K5VA 3UD8A 1UZYA 3LSDA 4Q1PA 1Q8PA 3N7JA 3PVEA 4YG3A 1I3HA 1DBNA 1GNZA 1H30A 3B3QE 3FJCA 2D6NA 1UAIA 4YW1A 1W3FA 4Y20A 2Q5TA 2W08A 4JPZA 4XFTA 4QBCA 1SBFA 4I4OA 2WT1A 4AYUA 2L5XA 2OW4A 5B2HA 2VXRA 2GDFA 4HR6C 5D63A 1TIEA 3IN9A 2ZQNA 1VLNA 3F62B 3AYCA 2WKKA 3ZPYA 3SISA 3ZXGA 3VKMA 2VXTI 1ZM1A 4JAWA 1LGNA 1MZ6A 4XHXA 3ATGA 1HKDA 2D1ZA 2NP0A 3HMYA 1GSLA 2A7AA 2P34A 1ZA4A 1ABRB 3R4SA 1S1AA 3AP4A 3ZXEA 4ZLBB 4J2XA 3JU9A 2D22A 3BADA 3PVNA 2A75A 2XOAA 3O4CA 1QU0A 2W52A 3SNVA 4D8HA 1LENA 1G86A 4FGFA 1MC9A 4PQ9A 1FWVA 3A22A 3MW4A 4P0KA 1RY7A 3WO3A 1VAVA 1EYLA 1T9FA 5JOXA 2AREA 4HL0A 3POSA 3AKGA 3AZWA 1LECA 3FLRA 1JY0A 1JOJA 3M3EA 1QDOA 3V0AB 3ZVXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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