3V0A | Genus

Total Genus 408

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	408
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
molecule keywords	BoNT/A
publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium botulinum
total genus	408
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0aA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0aA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0aA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0aA01

3VKMA 4KEKA 1Z78A 5BP5C 3IM7A 2OUHA 3WDXA 4LO3C 4R9DA 3AZVA 2WKKA 2RSTA 2JJ6A 1N3OA 2HZ9A 4BPZA 1WD4A 2CTVA 1LEMA 3A4UA 1MS8A 3FIIA 4EFRA 1E0OA 2WT1A 1MVEA 4FPJA 3H6QA 1FATA 5DG2A 3TB0A 3ATGA 1XHBA 4BMBA 1IHKA 1MD6A 1Z4SA 4Y1VA 3W58A 3ZSKA 1CN1A 2D3PA 2Q9XA 4I30A 2UUSA 1K5VA 4Y1ZA 4ZA3B 2VSEA 4ZFUB 2ARBA 3CNAA 3VEQA 1HKDA 3M3EA 2ZHNA 1UMZA 3VT1A 1ZKWA 2FDBM 2FGFA 2VW2A 4I4RA 1W6NB 3O0XA 1Q8QA 4L4IA 3AXDA 2ZHKA 1DYPA 3BAHA 1V6XA 3VWCA 2NN8A 3CQAA 1FMZA 5T52A 2ZGSA 1II4A 3B01A 3WZ1A 1V6JA 1OQLB 4AGVA 4GKYA 2WJSA 2DRYA 1QMJA 1VCLA 1T9FA 2NMOA 2ZQOA 3T2TA 1CQ9A 4ZJXA 1LCLA 3PUBA 1TOOA 4XMIA 2A6WA 5CNAA 4YGCA 4XJ8A 2W2DA 3BAGA 1VLNA 5H9QA 4FP2A 3AYAA 1LOFA 1DHKB 2OVUA 4W65A 1PC8B 3FJIA 4M3CF 1IKPA 1G9BA 4X39A 1V6LA 2VH9A 5JDBA 4JQ0A 3AYEA 4BLIA 1HIBA 3IM0A 5GLTA 4PC4A 1GNHA 2P3JA 2D7IA 2ZGKA 1MS3A 1T3AA 1S0JA 2NP0A 1YI7A 4I1BA 4Q1PA 5GLUA 4XFSA 3QW5A 5BQUC 3OJVA 4YZ1A 5B2HA 4LO2A 2XOAA 5KXDA 1ENSA 3K1XA 1ENQA 2ILPA 2UURA 2XHLB 3AH2A 2VY0A 3AJ5A 4AVVA 4GALA 1MR5A 4XZPA 2Q5TA 4LBKA 5IK5A 4XDQA 3KM5A 4TLPA 4JP0A 1SLTA 1SR4A 1PZ7A 4YG3A 5DZEA 1HQWA 2ZGOA 3LSDA 4ZOTA 3OY8A 2WSUA 4XBQA 1XTFA 4LBJA 5FZZA 2HWMA 3Q9OA 1LHOA 3PG0A 2DVGA 4M00A 4I4UA 3BOKA 3ZUSA 1ULDA 2A6ZA 4ISRA 1V6KA 2LALA 3WVJA 1CESA 1QOOA 1S1AA 4FOWA 2A71A 3ZXJA 3VKFC 2VLCA 1I1BA 1GZCA 2D6PA 5JOZA 3HOMA 1PZ9A 4XILA 4JKQA 4P9XA 3OBRA 1N1YA 3FJFA 3I2XA 5F5QA 3T1LA 1G82A 3S8KA 3AJYA 3BAVA 1SCRA 4KEIA 4FPEA 2G4IA 5DG1A 2WQZC 5CBLA 1KQRA 5F8WA 2BEBA 1DIWA 1Q8VA 4C1WA 5BQMB 2VXTI 5KXBA 1ITBA 3C88A 4F83A 3N7KA 3FJCA 3DSEA 3O0VA 2JD4A 5E24E 1VAMA 2ZAAA 1UZYA 4KEJA 2DVAA 4WZFA 2CNAA 3ZVXA 1S0CA 4I37A 2CWMA 3BODA 2NYYA 1W0OA 4ATFA 5EHAA 1SFYA 4YW4A 3ILRA 1PZZA 4J2SA 1GZWB 1KJRA 2KI4A 3B9UA 3BADA 3HSMA 3POYA 3OPZA 4LO0C 3ZSMA 5T54A 3QYDA 4EEEB 1LOBA 4DRRA 3NV1A 3VKOA 3UJQA 4DQAA 5JOYA 1TFMB 1U0AA 4FPCA 3PVNA 1C57A 1V6UA 1V6NA 2ERMA 3OGGA 5EWSA 3BONA 2W2DB 2P3KA 1QGLA 1UPSA 2JE7A 4XTMA 3CRGA 1LOGA 4IY9A 1Q04A 1FWUA 1FWVA 3AJ6A 5DUXA 1WW5A 1AXZA 2RG9B 5EYXA 4Y1XA 4QD2C 1JYCA 1SBDA 4GXLA 2ENRA 2JDZA 3VSFA 1SLAA 4ITCA 2ZQNA 3WINA 4IZEA 1UX6A 2PELA 1ZA4A 3O4CA 4WV8A 1IS6A 4H9WA 3FJ8A 1QF3A 2Y9GA 3I4IA 3BB2A 4Z9WB 1G9AA 2AUYA 4EJ5A 2GMPA 3O12A 4U2AA 3DUIA 1DYKA 3N7JA 2IMAA 1LESA 3ENRA 3MEPA 3C8AA 2P39A 4D0TA 3UJ4A 2R16A 1QOTA 4JAWA 5T50A 1W3GA 1FN0A 1YTOA 1WBCA 4G6MA 2PHRA 1IRPA 5IK8A 1HWNB 1W6PA 3GNEA 4I2SA 5DUVA 1UL9A 5DZGA 1DQ1A 2UWCA 2EXIA 3M3OA 3LLPA 3O4DA 2P2KA 5GZDA 4AN7B 2FFUA 2JECA 3LSEA 3Q7XA 4J1LA 1AVBA 1SZ6B 4IY8A 3VKNA 4TYSA 1GLHA 3ZSJA 1AFCA 3D7WB 3F62B 4OEFA 2DU0A 2AYHA 2AREA 3ZXKA 4KC3A 2UWBA 1A78A 2AGSA 1HWMB 3BX1C 3I8TA 4HL0A 5JLVA 4NO4A 2A97A 2EXJA 3AKHA 3IM5A 2E4MC 3P6IA 5GJ6A 1LHWA 5HCAA 3WG2A 1I3HA 4XJUA 2DU1A 8I1BA 1DQGA 4EFQA 3ZYRA 2G7PA 1LJ7A 2AR6A 5GLWA 3A22A 1ISXA 2Z49A 2UWAA 5CB7A 3N3HA 1V00A 3FJEA 1Q56A 4BOWA 2D6NA 4HANA 3N7MA 5T55A 5GZGA 2ES3A 2KKIA 4CZSA 4P0JA 1QQKA 1CE7B 4XMAA 1CR7A 4BM8A 5F8YA 3PVEA 3V0AA 2VW1A 2LIQA 4A7ZA 1HLCA 4WVVA 2AAIB 2SLIA 4LBQA 1AVWB 1C4RA 4USOA 3WDUA 1GGPB 2LTNA 1JW6A 4P14A 2D44A 2D1ZA 2IHOA 1RY7A 3JU9A 1IS3A 3CA0A 1XQNA 4AVSA 4LO8B 3ZXDA 1ONAA 3O5SA 2D7FA 4GOYA 1GSLA 3VT2A 5BYNA 3ZUQA 4XHXA 1HDKA 1JT4A 1N3QA 3CRHA 4EKXB 4ZKTB 4UW6A 4J2XA 1NXD1 4G9MA 2E7TA 1DQ5A 2F8XC 1GNZA 4DENA 4LO1C 2R0FA 1K5UA 4XFUA 4Q8KA 4XBLA 3T1MA 4LO7B 1OFSA 5DUYA 5T5PA 1W6OA 4IONA 5JMCA 1MS4A 1F9KA 3BOOA 4QKRA 2ZA9A 2SBAA 4YLZA 5BQMA 1GKBA 3WO2A 1DQ4A 4M01A 2GNBA 4XFTA 4XJ9A 3DDBA 2EXKA 1ILR1 5D63A 4X37A 4TZDA 4P6AA 1EYLA 2ZHLA 2ZGNA 1UAIA 1GZWA 1T4QA 5BQUA 3AFKA 1XTGA 4JKXB 4GWMA 1VAVA 4IYBA 2B7YA 1N1VA 4QBVA 4YM3A 5GZFA 3VUOA 3BOPA 3ZXGA 1KNMA 2KLLA 1QNYA 1JT5A 3AZXA 1KJLA 2ZMKA 1YF8B 4M3CE 6I1BA 3BRFA 3FLPA 1W6QB 3POKA 3QIXA 1W6PB 3CAHA 3V79C 1H9PA 5I1BA 1LOCA 1WW6A 3CA5A 1AX0A 1GZ9A 4ZFYB 4ZLBB 3FUQA 5DSSB 2GO2A 4GKXA 3WMUA 3LCPA 1JT7A 2D6OX 1YVGA 2KI6B 1MS9A 1BXHA 3ASIA 2DVBA 3FLRA 1MZ5A 3O5WB 3IMNA 4YW1A 1EPWA 1W0PA 2XB6C 1QOSA 5BXTA 3OJBA 4I4PA 1CJPA 3RQ0A 1KITA 1JYIA 4FPGA 1MS5A 2HWAA 2Q3NB 3FJ9A 1ZKXA 4DS0A 1V6MA 4EFPA 3DEBA 4GAFA 3NV2A 4J2KA 3V0BA 4DEPA 3HALA 1CVSA 3BA7A 2A7AA 4EB2B 2BQPA 1UN1A 4YG0A 4OEEA 2Y9FA 5HCBA 4II0A 3A07A 3JUTA 3NV3A 1FQ9A 4ELCA 4OWKA 4PQ9A 4LBMA 3EF2A 1JTCA 1F82A 1WCSA 1TWEA 2K43A 2A75A 3MW4A 3OYWA 5DVHA 3QJ0A 2G7KA 1SBEA 1AX1A 1NUNA 1N3PA 3V0AB 1RITA 3JRRA 5AVAA 2ZGQA 1J0SA 1HCDA 4XTPA 5H9RA 4M3CA 4HA2A 3QLQA 4FPYA 4LBQB 1IRAX 4XJWA 1GANA 3H6SE 9ILBA 3CA1A 5GLZA 2D3RA 1LOFC 3V64A 2WRYA 2V5YA 3IPVA 2EIGA 3B00A 3NF3A 2F2FA 4CRQA 1GBGA 1ISZA 2IWTB 3ZURA 4XE9A 3RMXA 1BA7A 5D61A 2ET2A 3ILNA 1Z0HA 5GZCA 2TEPA 3AP6A 4YFWA 4P0LA 4D0ZA 4YZ3A 4LO0A 4Y20A 3VSZA 2EAKA 4G6JA 4YM2A 4XXAA 1H30A 1HQLA 1RINA 4UW5A 4CTEA 4ZGRB 2V73A 2GNTA 5H9SA 3R05A 2HW9A 1KDKA 2A8AA 1W6MB 2CL2A 3F1RA 1DBNA 4I0YA 2WNEA 3V65A 3VT0A 1CIWA 2ZGPA 1G9FA 2A6YA 2NZ9A 1W3AA 4LO2C 5DXDA 4YZ4A 1W6OB 4YFZA 1S0FA 2YXSA 3ZPYA 1Q8SA 1F31A 5EYYA 3VKLA 3AKIA 2A70A 2R9KB 4Y24A 3BAOA 3O4BA 4JRAA 3UL2A 5IK7A 2ETFA 2YY1A 2D20A 3WUDA 2ESUA 3UD7A 5E88A 2JKBA 4J23B 2BEAA 4I8MA 1V6VA 4I4YA 1S0GA 1LOEA 2YROA 1D0HA 1JQZA 3VV1A 2GZBA 3SNVA 1UZZA 3O44A 4F34A 5DZUA 1MACA 1KRIA 1RZOB 3SNMA 4PCRA 3KQRA 1N1SA 2W08A 4D69A 2JE9A 3WOGA 1BFGA 2PHXA 1EVTA 5GAQA 3O49A 3KMVA 3W9TA 3ILFA 2X2TA 5HCFA 4XJAA 5FREA 4G1RA 4QKSA 2DS0A 3B69A 1LODA 1TP0A 4GWNA 1AJOA 1TTUA 3S8JA 2GDFA 1G86A 5JOWA 5BXRA 1WW7A 1ZB7A 3HN1A 1WBAA 3N35A 4Q8LA 1SLIA 4K1YA 4FP3A 3OBTA 4R6UB 1LGCA 1L2HA 1ABRB 1HWOB 3A23A 2D6KA 4YM0A 3OJMA 3AP7A 3FIEA 2D3SA 2DURA 1FGAA 1IT0A 1WLCA 1AVAC 1BZWA 4YW5A 1O4YA 3UK9A 1WD3A 4FOQA 4XOGA 1LENA 3N0KA 1ENRA 1QDCA 3A0NA 5FRAA 2R49A 1JHNA 3ZXEA 3IM6A 4NOTA 2VW0A 5F9TA 2QN4A 1SLCA 1SBFA 4FOYA 3V0BB 3AYCA 4MYEA 3AP5A 2E4MA 2RHPA 1HKNA 1ZL6A 3DS9A 2DWRA 3C2UA 2K4AB 1V6WA 3WA1A 2W52A 1OKQA 1BASA 1S0EA 4Y26A 1AVXB 3JUUA 4BQ1A 3ZC8A 1V6OA 2DVFA 3WUCA 4I3NA 2VSAA 5GALA 1IJTA 3OYWB 2FHRA 4DPNA 2YV8A 3AZWA 2ZMLA 2DRZA 1W6QA 5EXOA 2OUJA 4ASMB 1ULEA 4DCKC 4M3CB 1FNYA 2ISGA 4ZBVB 4PBPA 3CRIA 3BA4A 4KS6A 3O0WA 4FGFA 4X3AA 3AH4A 4Q91A 3IPVB 1LHVA 4PBOA 2E7QA 3UJ0A 3QW6A 4HEVA 4Q1RA 4YGEA 1BKZA 4CJMA 5HPZA 4Y20B 1JOJA 3WDYA 3WINC 2AENA 3AP9A 3NBNA 1UKGA 1CVNA 5KXCA 4HR6C 4GP0A 4I4QA 1RMLA 4I6IA 4I4OA 3BAUA 4GP3A 2Z42A 5BP5A 4YW3A 2ZZJA 3FLTA 4G9NA 2A6VA 2P23A 4HJJA 4AWDA 3L2YA 4LO3A 4R9CA 1Z2VA 4D8HA 2BFHA 1BFFA 2AQZA 3WCRA 2ZGMA 2R1DA 3AJZA 3K3QB 2L5XA 4LO1A 2GALA 1IOAA 4QD2B 3A0KA 21BIA 3Q7WA 3MW3A 3D5OA 3O4OA 4RA0A 4ATEA 4IQPA 2E6VA 5F8SA 1JLXA 3NBEA 2DUPA 1HCEA 2PHTA 3QCWA 3BTAA 1EV2A 1N4KA 1LGNA 4I4SA 4A7YA 5H9PA 3C8BA 4OEGA 1DFQA 1SLBA 2D6LX 1LULA 5FZUA 4Q27A 5D62A 2MC2A 1G7YA 2E51A 3P53A 3WO3A 2P37A 5JVVA 1GYKA 5F90A 1WLWA 3NJ5A 1Y7BA 4IZXA 1AXMA 3CA6A 3NWKA 1URXA 4A7KA 2GMMA 1B09A 4AVTA 5GM0A 3MW2A 3FJAA 2ZR1B 2ZGRA 5FNXA 4ISQA 1WBFA 3ZXFA 1W6MA 4ZXKA 1GICA 1KDMA 4I96A 3M1HA 4DRVA 1DJSB 1WLDA 3BA5A 3HBWA 4R9AA 1JXNA 4X38A 2OW4A 4AGGA 3E8LC 5IUQA 4XJZA 1AXKA 4XHBA 2Z48A 3GALA 4LBOA 2QYIB 1YRZA 3FJJA 1ISYA 1ULGA 3WO4A 2ZBJA 5T5OA 2D22A 3IIRA 5BOWA 1F5FA 2D23A 2PHFA 3W59A 1S0IA 1AVUA 1AF9A 3ZSLA 3ZYPA 1NZKA 3UD8A 3NBDA 4Y1YA 1BFBA 2VU9A 5FNWA 3WG3A 1JY0A 1QNWA 2MIBA 3SITA 2W68A 4QBCA 2CY6A 3P6JA 2LIEA 3AZZA 1LHUA 2P3IA 4FVVA 3SLIA 4P0KA 1YIFA 3BRDA 3QIZA 3QW7A 3R4UA 2A5ZA 1P63A 4LBNA 4Y22A 3WG4A 3H6RB 2IMCA 1YYNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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