3SLIA

Leech intramolecular trans-sialidase complexed with 2,7-anhydro-neu5ac prepared by soaking with 3'-sialyllactose
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords INTRAMOLECULAR TRANS-SIALIDASE
publication title The 1.8 A structures of leech intramolecular trans-sialidase complexes: evidence of its enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Macrobdella decora
total genus 182
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1998-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 3sliA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3sliA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3sliA02
1AVBA 2P3KA 1WLDA 4MX0A 1IVCA 1LHOA 1O4YA 2WJSA 4MWRA 1KDKA 3BOPA 1MWEA 2B8HA 2OUHA 3AP4A 4M4VA 4XOGA 2EALA 4HL0A 2JJ6A 1JYIA 4Y20A 1SNTA 2VK5A 2ZGQA 3VV1A 3PVEA 2EXJA 5GZDA 5JOXA 4GZXA 2VK6A 3ZSKA 2GNBA 1LEMA 4M00A 4XJ9A 5HX0A 1Z4VA 2XZKA 1S0FA 2VW1A 3AFKA 3CL0A 2R0FA 4X6KA 3VKFC 4FQ4A 3OY8B 2ZHLA 3ALWA 3MEPA 4KS5A 5EXOA 1HQWA 4CZSA 5KXBA 3D11A 4XJWA 1V0FA 2D7FA 3M1HA 1LU1A 4JCKA 3WUCA 4BLIA 1IKQA 3I4IA 1LEDA 2XB6C 1Q8PA 3ZXFA 4YFZA 2QWJA 3WG1A 1JBCA 2VW2A 4R9AA 2QWAA 2W5NA 3BIWE 1Y7BA 1F5FA 1WCSA 1SLIA 1W6OB 3OYWB 1CQ9A 1HLCA 5T54A 5IUQA 4FZHA 5HUMA 5GLUA 4FVVA 3GVLA 3JUUA 4XJUA 2ZGPA 2LALA 2WSVA 1E8VA 3ILNA 2PHXA 4YG6A 1NMAN 4GB1A 1LENA 2YV8A 3AZYA 3W09A 4QN5A 2GN7A 2A7AA 4XYXA 1Z4ZA 2YZ4A 4K3YA 3NV2A 2C9AA 1BXHA 1S0CA 1G9FA 5DUXA 1LOBA 3AJYA 2QWCA 4YLZA 4Y1VA 1LULA 1B9VA 2ZA9A 4MWXA 1LOAA 1A4GA 2W52A 3NV4A 4JF7A 1IVDA 4XJRA 4XE9A 4DGRA 3ZSLA 1HDKA 3RMYA 2YROA 3TI8A 1W6QA 3PMEA 4CRQA 1V3CA 1YI7A 2ZHKA 4FPEA 2HTRA 2ZABA 1RINA 3TIBA 1NNBA 1LOEA 3A71A 1BJQA 2OUJA 1B9SA 3B69A 7NN9A 3B01A 2CNAA 1LGBA 1WBLA 3JU9A 4GKYA 2AR6A 3V0AA 2DVDA 3TAYA 2EXKA 2VK7A 2VW0A 1INFA 1SFYA 1FX5A 2YA7A 3POSA 1NCDN 4LBLA 1Z4YA 1SLTA 3POYA 4P14A 2NZ9A 4XXAA 1VIWB 1W8NA 1MS1A 1GLHA 2DUQA 3TB0A 1H9PA 4M3CB 3W59A 4AYUA 3D12A 3M3EA 1ULGA 3FFZA 1CONA 1QF3A 2W68A 1GANA 4BBWA 2UWBA 2D44A 3WDUA 4GZPA 2ZGOA 5IK8A 3USUB 1LECA 5H9RA 4Q1PA 5GLVA 1R1ZA 5SV8A 2AEPA 4CPLA 4FOQA 1LGCA 3ENRA 4YGBA 4MWUA 1QOSA 3WVJA 4XJ8A 5H9SA 4DS0A 1SLCA 4HZXA 4XJQA 3IPVA 1IVBA 1DQ4A 2EXHA 1AZDA 2ZMKA 3B3QE 1NCBN 2A71A 1WW7A 3AP9A 1W1XA 2ZGRA 4P9XA 4CPMA 2A3YA 2HU4A 1A14N 1QU0A 5GLWA 1MS5A 1V6MA 2ZACA 3N7JA 3N7KA 5E8AA 1KJRA 3AZVA 3ILFA 1WBFA 2WT1A 3GALA 3V64A 4M4UA 2YA8A 1BYHA 3WDTA 5DXDA 1IS6A 1UZZA 5T50A 3N7LA 4LBOA 1KQRA 2ZB5A 3V65A 2PHUA 4KBBA 2PHRA 3BTAA 1DILA 2D6OX 4KS3A 3TI6A 5EWSA 1IS3A 4WA3A 1LESA 3OY8A 5JLVA 1WW4A 2R1BA 4DPNA 1A78A 4R9DA 2YA4A 3AXDA 3M3QA 4K1YA 5GM0A 1O4ZA 3WUDA 1JHNA 2DV9A 4Q6KA 1OQ1A 4YW2A 3MW2A 2ZGKA 2AGSA 1V3DA 5IK5A 5GZGA 2WSUA 1MACA 2A6YA 3NSSA 3ZXEA 3TI4A 1XOGA 5JVVA 1Z50A 4WVVA 3ZYRA 5HUGA 2VUAA 3D5OA 4Y24A 1W6OA 3M3CA 3OYWA 1GSLA 1CPMA 1S1AA 1VALA 2HTQA 4AGGA 5GLZA 4BPZA 4GDIA 3RMXA 4FP2A 2DVGA 3O0WA 2PELA 3O5SA 4XMAA 4Q8KA 3INAA 1Z0HA 4HZYA 2C5DA 5CB7A 1PZ7A 4MWWA 4NN9A 4YW1A 3ASIA 4JC1A 3VKLA 1V6IA 1ENRA 2E51A 1NXD1 3OPZA 1SBEA 2ZAAA 4PCRA 4K1KA 4GKXA 2CYFA 4FJ6A 1HQLA 3AP6A 2GDFA 1ULCA 4MWJA 4XBQA 2YDPA 3WCRA 1ULEA 1LHUA 1NSBA 3T2TA 1NSDA 4U36A 2UU8A 2AREA 2V5YA 1ENSA 3R05A 1NSCA 4F83A 3ZXLA 3O12A 3KQRA 2BZDA 1V00A 5T5OA 2F27A 2E7TA 1CN1A 2E6VA 2P2KA 3CL2A 4GZQA 2P34A 2DYCA 2F24A 1SLBA 3RS6A 3O9KA 4M01A 3TICA 4XIKA 2GMPA 1S0GA 1QNWA 1UPSA 1XOEA 4YFWA 4HZWA 3N3HA 4DRVA 3PVOA 4FPKA 3SALA 2DVFA 3TI3A 5M1ZA 1APNA 1INGA 2D3PA 4YG0A 2W38A 1LHVA 2A75A 1LOGA 4PQ9A 4MWYA 3WLUA 1LTEA 3OBRA 4Q27A 1INYA 4M3CA 1DYKA 4KS1A 4GALA 2XCYA 4XHXA 5T52A 1NCAN 1INXA 3WDXA 2ZHNA 4IQPA 3WNXA 4Y1ZA 1QOTA 4B7RA 4WA4A 3USUA 3ZSJA 4TYSA 2F26A 2WKKA 1WW6A 1V6JA 4FPHA 3NV3A 1ONAA 3AYEA 3O0XA 1I3HA 4QN6A 4CTEA 1JXNA 3SANA 4Y22B 3AK0A 3LCPA 1MS9A 4YZ4A 1INVA 2JE7A 3R4UA 2NMOA 1INHA 2D6KA 2ERFA 4XHBA 1QOOA 1F8BA 2JDZA 2I2SA 1N1TA 1QDCA 2GMEA 1IKPA 1I1EA 2HT8A 2W39A 4B7JA 3SH3A 1CIWA 3LSEA 1FNZA 3FUQA 1LHWA 2ZGTA 2VSKA 1NN2A 2WT0A 2VH9A 2AH2A 2D3RA 1ULFA 1JW6A 1A4QA 4MYEA 3WOGA 4YZ1A 3PJQA 2CTVA 4XXPA 3FLRA 3AYAA 1OKQA 3KM5A 2A70A 2QWGA 2HT5A 3OGGA 5AVAA 5DG2A 1AXZA 1LOFA 5E89A 5B2CA 4YGCA 4CPNA 2YA5A 2CWMA 4UF7A 4FPCA 2YY1A 2KM2A 3DUIA 1MS8A 4FPJA 5T5PA 3K36A 1GZ9A 1UKGA 4YZ2A 4D8SA 2NP0A 3FBYA 1E8UA 4CPOA 3BODA 3M2MA 1NCCN 1YRZA 5LK5A 1Q8QA 4XJAA 4Y1XA 2VVZA 1LU2A 5GLTA 3MPPG 4FOWA 1CVNA 4UW6A 2QWHA 3FUOA 1NMCA 3ZPYA 1Q8OA 3H73A 1KITA 3O0VA 3H72A 1NLSA 2YMZA 2DURA 1AJOA 4WEGA 2PHTA 2JECA 2YA6A 4YM1A 1V6LA 1AX0A 3HN1A 5DZFA 2HU0A 1FAYA 1LHNA 1MS3A 1IVEA 2GNMA 3FLPA 5JYYA 5DUVA 1DIWA 2ZGLA 1IOAA 2A6ZA 3WDWA 4UW3A 1SLAA 2D6MA 1V6KA 4UW5A 4PBPA 5BYNA 1TEIA 1N1VA 5HUNA 2A3WA 3DGTA 4Q26A 5DUWA 4AGVA 2F12A 4MZAA 3V0BB 3IN9A 1UAIA 1W20A 1HKDA 2JE9A 1DQ2A 1N1YA 1L7GA 5IK7A 2R16A 2DUPA 4C1XA 3CYEA 2XZJA 2JD4A 1V2IA 1DQ6A 2AUYA 1AXYA 4R9CA 4GZSA 2HTVA 2HTYA 3K38A 1V6NA 2GALA 4XTPA 3SILA 3WZ1A 1LOCA 4YGDA 1BKZA 4PBOA 4RL7A 3R4SA 4Y1YA 4NO4A 1GZCA 3IKWA 4P9WA 4XJZA 2OVUA 5DZEA 3K3AA 4D69A 4AVSA 3I8TA 2HTWA 1ZA4A 1VCUA 1MR5A 3GVKA 3A72A 2SBAA 4OZXA 5DUUA 1D0HA 2D3SA 2QWKA 4DQAA 1B09A 5GZCA 1L7HA 3RRDA 3T1EA 5F5QA 4DRRA 2TEPA 5H9PA 4YW5A 2A6VA 3NV1A 1PZ9A 2R1DA 5CNAA 4ATFA 1C1FA 2ARBA 2NN8A 4SLIA 1WLCA 2GN3A 2EXIA 4XZPA 3HR9A 2W20A 1VLNA 1FATA 4WA5A 4Q8LA 2ES3A 3ATGA 3D4KA 2OW4A 1FV2A 1DYPA 4K21A 5GJ6A 3VKNA 1INWA 2ZGUA 2QWBA 5CA6A 2DVAA 4Y22A 2RKCA 3ALXA 3T1LA 1F8CA 3T1MA 4ASMB 4QN3A 1F8EA 1DQ0A 1LOFC 4K1JA 1WUVA 1WW5A 2VY0A 1UMZA 1F31A 1SLLA 2ZMLA 4YW4A 4FPGA 3SITA 1A8DA 1ZM1A 1JN2P 1IS5A 4MWLA 1G7YA 4WEFA 4HZZA 3UJQA 1BJIA 1EUSA 1AJKA 3GNEA 1WCQA 3AP5A 1QDOA 1GYKA 4K1IA 4GEZA 4NCSA 4Y26A 1N3PA 2F28A 3TIAA 1WLWA 4B7QA 3APBA 1DLLA 1GZWB 2BQPA 1MZ5A 5KXCA 4MWQA 4XIOA 3WHTA 4BMEA 3ZXKA 1NNCA 2P3JA 2SLIA 3JU4A 2VWDA 2B7YA 1WD4A 2W08A 2A6XA 5B2DA 3AJZA 2A5ZA 4LBQB 2A6WA 3AZXA 1CESA 3K37A 1N3OA 2UURA 2QWFA 4X4AA 2F10A 3O9JA 2AENA 5JOWA 4QNPA 1G86A 5E88A 1SBFA 4I00A 1RIRA 4MC7A 3INBA 4AWDA 1KJLA 1W0OA 1DIMA 4FOVA 4LBQD 1BZWA 3OBTA 5DG1A 5T55A 1C1LA 2BF6A 2CY6A 1Z78A 2ARXA 1LCLA 4K1ZA 2FMDA 2CMLA 3K39A 4H52A 1MZ6A 4NOTA 2WLQA 2D6NA 2QWIA 4KS2A 3SH5A 4H53A 4YZ3A 5CAZA 4X47A 2BATA 4XILA 2ZMNA 3FLTA 4R9BA 5EYYA 4GXLA 1LGNA 1DQ5A 3OJBA 2XG3A 3TI5A 4Q1RA 2YDTA 2F13A 1GNZA 1L7FA 5NN9A 2UWCA 3U4XA 3NWKA 3MW3A 3VKOA 4YGEA 4GJTA 4AVVA 3UJOA 1AXKA 2G4IA 1KRIA 5L73A 1GKBA 3V0BA 4LBJA 3AYDA 3W58A 2EAKA 4P9YA 1SCSA 4JRAA 1YIFA 2XZIA 4XMIA 1V0ZA 1XQNA 4YM3A 2Q5TA 4GZOA 6NN9A 4BMBA 4ZXKA 5GALA 3NN9A 1V0EA 1AX1A 4U2AA 3A0KA 1G9AA 4MJUA 2DVBA 4ZKTB 4XDQA 2ZKNA 2NYYA 2LTNA 4TZDA 3AXEA 1RITA 4DFSA 4YZ5A 2WT2A 2A3XA 1N47A 4XTMA 1W6MB 1B9TA 3HMYA 1JUIA 3VKMA 1U0AA 1V3EA 2R0HA 2NM1A 5HUKA 1S0JA 1N3QA 2F29A 1W6NB 1FV3A 2WQZC 3WDYA 2HTUA 2RHPA 3AX4A 5JDBA 1QKQA 1ENQA 4FP3A 2BERA 3L2YA 3BEQA 2HYKA 2R49A 3AZZA 2VU9A 3A0NA 2D6LX 1MS4A 1EUTA 4H55A 2F25A 4M4NA 1OFSA 3CKZA 1G8WA 4B7MA 3ZVXA 4GDJA 3AP7A 4GZWA 1UX6A 4BM8A 1C4RA 4Y20B 2PHFA 4Z8BA 2P37A 5JOZA 1GNHA 3AYCA 1DQ1A 3RQ0A 5IT6A 3H0OA 4X49A 3N36A 3MW4A 4BOWA 1Z4WA 1UN1A 3IM0A 2ZGSA 4FPOB 3LSDA 1Q56A 1YXWA 5T5LA 5DZGA 1VAMA 2GNDA 5FRAA 1QNYA 4FPFA 2C4LA 1FYUA 1EUUA 2DUOA 1Z4XA 1BQPA 4M3MA 1PZ8A 1AF9A 3RSJA 3UL2A 1H30A 2ENRA 2DTWA 3IMNA 4K20A 1W6PA 2C4AA 4J9TA 3WG2A 1G9BA 2ZHMA 2E53A 3WDVA 1Q8SA 1NMBN 3VUOA 1C57A 5GZFA 2YXSA 4HZVA 4W65A 2V73A 1DFQA 2ZBJA 2DU1A 1CR7A 4WV8A 1DBNA 1WD3A 3SH4A 2EIGA 3B00A 1GZWA 1A3KA 1S0DA 3H71A 1MVQA 2CWSA 4L8QA 2PHWA 1JOJA 3SLIA 3ZYPA 1X50A 3C2UA 2WNEA 1MS0A 2FHRA 1GV9A 3H6JA 2VSMA 3WCSA 1URXA 1IVFA 4ITCA 4CPZA 5HCAA 5GZEA 4MJVA 4XBLA 2DWRA 2D6PA 4LBQA 2HT7A 4CPYA 4Y1UA 4YG3A 2P3IA 4NC5A 4QN7A 1UL9A 4FPYA 1F9KA 1SBDA 2F0ZA 1YYNA 1YO8A 4RA0A 3ZSMA 4LBKA 1FNYA 1GICA 1DHKB 1E8TA 5JOYA 4FPLA 1DGLA 3A4UA 1VCJA 4MZEA 1SCRA 1IVGA 3QCWA 4YM2A 1EURA 1MVEA 4LBMA 4YW3A 1J1TA 1USRA 3Q9OA 1S0IA 3N7MA 1W6QB 4BLJA 4KS4A 2EF6A 1SACA 2AYHA 4UW4A 2GNTA 1AX2A 5F9TA 4AGRA 3CNAA 4ISQA 4M3CE 4MWVA 1W21A 1W8OA 1GBGA 1QGLA 4GWNA 4Q2FA 5FREA 3D6EA 3ZXJA 2CL2A 1F8DA 2D43A 3SISA 3WHUA 1D2SA 2GMMA 3V0AB 1QMJA 1UZYA 3GVJA 3UK9A 3PVNA 1W0PA 2UWAA 2W5OA 5EYXA 4FOYA 2Z42A 2AEQA 1SO7A 1H9WA 1ULDA 1V6OA 4HIZA 4GWMA 4YM0A 1Q8VA 4C1WA 4ISRA 1LODA 5CBLA 4PF5A 1NNAA 4GA9A 3SNMA 4QN4A 1CJPA 2ZB6A 2QWDA 1S0BA 2NMNA 1W6PB 1G9DA 4ATEA 3N35A 3B7EA 4WVWA 3WG3A 2VXRA 4I30A 2F11A 5H9QA 2E7QA 1S0EA 4B7NA 3POWA 1N1SA 2DTYA 1JYCA 3WV6A 4K1HA 5T5JA 2ZZJA 1USXA 4AVTA 1VAVA 4HANA 1IS4A 2DU0A 1CPNA 2SIMA 3RG0A 2JKBA 4LBNA 4GZTA 2QWEA 5JMCA 1V3BA 2X9MA 2H0BA 5KXDA 3IPVB 4WZFA 1LJ7A 5KXEA 1W6MA 5HCFA 5HCBA 3AZWA 2ZGMA 4XBNA 1G9CA 3B9CA 1DZQA 1EPWA 5IK4A 3M3OA 1W6NA 4M3CF 3WG4A 4FVKA 2ZGNA 4FQZA 3QLQA 3ILRA 1KDMA 2SILA 4BQ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TNFA 4YPJA 1PO22 1AVBA 2VL4A 1FPN2 4AH4A 2P3KA 5F5CA 5ANNA 1WLDA 1VBC3 1UY0A 1H6XA 1NUKA 2VTFA 4JX0A 4MX0A 4F7ZA 3MIHA 5C6CA 4C1YB 5FMOL 1X82A 1IVCA 5FY8A 1LHOA 3DN7A 3UESA 3J7HA 1O4YA 2WJSA 3OF1A 1XYOA 3U4SA 2PMWB 5I93A 3TEYA 3T0DA 4MWRA 1KDKA 1C5IA 3BOPA 4GH4A 4IV3A 1MWEA 3UGGA 2B8HA 2QQOA 2OUHA 3AP4A 2QQVA 4LJHA 4FO9A 4PI0A 1M06G 3FVZA 4IEOA 1X33A 4XOGA 3HBZA 4IE7A 2EALA 3NMBA 4COVA 1K42A 4M4VA 4RN5A 4HL0A 2JJ6A 1JYIA 5F1RA 1IZ3A 2Y34A 2VQ0A 3O7OA 2RDSA 4Y20A 4JGYB 1O6UA 1MEC1 1SNTA 5FNTA 1W28A 2VK5A 4B1LA 1TMF3 3WQ7A 2DCTA 2IXIA 2ZGQA 3DKWA 3VV1A 3LDBA 5LBFA 3PVEA 2EXJA 5GZDA 5JOXA 5FKCA 4GZXA 3V65B 2VK6A 1PM7A 3ZSKA 3Q8BA 4Z1VA 2GNBA 1LEMA 2XBO1 4IGPA 4LK7A 3KS7A 2WC2A 3NAPC 2RMU3 4KU8A 4M00A 4XC9A 4XJ9A 5JI7A 3ZMNA 1JYNA 5HX0A 2ZX3A 1Z4VA 5CADA 1O5UA 3AKSA 2Q1FA 2R043 4QKDA 5I8SA 1ZRFA 2ARCA 3LIGA 4LO8A 4B7NA 1S4CA 3VDDC 4XQWA 2VZUA 4KWLA 4A2UA 4Y5Z0 3O1RA 1PIV1 2XZKA 3ZIWA 2DCJA 2R062 1S0FA 4DIQA 2VW1A 3AFKA 2ZW9A 3CL0A 3J7LA 2R0FA 4X6KA 5KC6A 4AFCA 3VKFC 2Y26A 4FQ4A 3MIEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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